2QDHA

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from leishmania mexicana in complex with mannitol-1,6-bisphosphate, a competitive inhibitor
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDDASSSSLYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Leishmania mexicana
publication title Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
total genus 140
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qdhA00
5D2TA 1ZY9A 2PRHA 4Y8FA 4IXXA 1GG0A 1EP3A 4LV9A 4LTSA 2HSAA 4IWWA 4IOTA 1JR1A 4YMZA 1FWNA 4LRTA 1FXQA 4DXVA 1TIMA 2CLFA 3NQGA 1G4SA 4NQ1A 3L67A 3G24A 4PL2A 1XUZA 3W7DA 3SFKA 3RK8A 4O14A 4AF0B 5FEPA 1JQXA 4AWTA 3DFOA 3KVKA 1LLWA 4UC5A 3SR7A 3BARA 3LV5A 4RLIA 1GG1A 1G4EA 3NG3A 3PBVA 1GYNA 3NQVA 2B4GA 3MO7A 4WY0B 1XI3A 2P10A 1O60A 1TRDA 2PRLA 1UCWA 3RF9A 2NUXA 3ATYA 3B8DA 5AHIA 3LTSA 1ICSA 3ZR4A 3BGJA 4MYAA 3B04A 3KHJA 3W75A 5HUPA 3HGSA 3C2VA 3W1NA 3N9SA 2JKAA 4MYXA 5HR7A 4N4QA 3LHVA 4LVBA 1DORA 1VYPX 4ICNA 2TYSA 2ATSA 5LHEA 3UWQA 3QYQA 4ZL1A 1B3OA 4QSHA 1GWJA 5G2HA 1K02A 1TPUA 4DPQA 3CPRA 1SU5A 5D2VA 3NEVA 3WFAA 5D32A 5D09A 1Q45A 3NQCA 3G0XA 4UMAA 1KM4A 1K3UA 3W7KA 1DHPA 1DQWA 2E6AA 2XN0A 2TSYA 3TFCA 3PUDA 3E9AA 1A5AA 3RU6A 1PV8A 3E96A 5D37A 3G1VA 2A0NA 4UTHA 3LXCA 4HHPA 3MHGA 1KM5A 3UPWA 4AWSA 2DZWA 4EIVA 1XFBA 5D05A 4U4MA 2AAMA 3HMJG 3R8RA 1W0MA 2Y6ZA 5CSSA 3H54A 3F03K 2PRMA 3BW4A 3HG5A 4UUIA 3C52A 3DHDA 3ABSA 4DELA 2LLEA 2EHHA 5L6UA 3WJXA 4O17A 2EGZA 2YDAA 1GTEA 4AF0A 4HKPA 4NNCA 4O57A 5D30A 5FI8A 3KRUA 3N14A 3ABOA 5D2WA 2DORA 1O95A 1PVNA 3S42A 4IMCA 4JIQA 3B0VC 4MKNA 1TTQA 4CLMA 4GJ1A 4MJZA 1O4UA 4WY0A 2KZHA 3LHYA 3W7HA 1KFEA 2F84A 1UJPA 1W1ZA 3P5YA 4I7WA 4MY1A 1ALDA 3TJXA 4XZ9A 3VCRA 5KTLA 1XM3A 3W6YA 1U83A 3CIXA 3VNDA 2E77A 4ALDA 3DU0A 4OWGA 3IGXA 2P0OA 2Q3RA 1AW5A 2QCFA 1M6JA 1SZEA 3U2OA 2WJZA 3INPA 1LBFA 2ZRZA 4HSOA 5D02A 3S5OA 3GK0A 1QOQA 5K4XA 3I7QA 3IV3A 5CPMA 2Y63A 1F74A 1OJXA 3P74A 3QF0A 4O11A 2Y7FA 2ZTKA 4LWWA 4JTSA 1QMLA 5G4EA 1TB3A 1M7PA 3GAKA 1WAUA 1UBSA 3PULA 3TSMA 3GIYA 3C2OA 5CZJA 4JN6A 3I68A 3P67A 1EPXA 1IF2A 3GDKA 3W74A 2Q8LA 2O7SA 3G1FA 1VH7A 3PB2A 3TJLA 4IPIA 2PE4A 3CC1A 5DXXA 4MFEA 2B7NA 3QW4B 1G69A 5AC7A 1G4TA 3E49A 2FJKA 3GLCA 1TPEA 3GNNA 3JRKA 4E2BA 3G8RA 4OV9A 5GVJA 1KFKA 1V5XA 3W1PA 2ZTJA 3KRZA 4ADSA 2YSWA 4N6EA 4TMBA 1W5NA 3Q58A 3DXIA 5HWNA 3GZ3A 4UMCA 3H53A 5DCBA 3W9ZA 1GYLA 1SZNA 2QJIA 3N34A 3W1QA 4IPJA 5LNVA 1AW1A 1Q6LA 3S1VA 3HIJA 4IQLA 3A24A 3BPWA 4IX2A 5EYWA 5IBXA 3WK1A 4XTIA 1IXOA 3MJYA 2FDSA 3O07A 1OHLA 1ZAIA 2NXGA 3VKJA 1ZALA 1JUBA 2ATMA 4TX9A 2Z2UA 3W07A 4OHQA 4NUWA 5I3FA 3U6WA 1SSGA 3CT7A 1KFCA 3L66A 1ME7A 1JCMP 1LRNA 4PL1A 1JCXA 3GDMA 4ZQNA 2JKEA 3EWBX 1IXQA 2Y7DA 1RD5A 3A22A 1ML1A 2FQIA 4XWUA 2ZZ6A 3TR2A 3NOEA 5FEXA 4IMGA 1R46A 3QFEA 2NV1A 2ZRWA 1XXXA 1VQTA 1JCNA 5F1VA 1FX6A 4DO5A 1X1ZA 3W88A 5K2ZA 1WXJA 4QIUA 3Q94A 2GVJA 1X8FA 3QMSA 1JVNA 5F2IA 3QRHA 4OV4A 4NJHA 3P5ZA 4UTWA 2NV2A 3GXPA 4MUZA 3U8GA 3P82A 4E2DA 2JBMA 5AHMA 1TPC1 3P8JA 2FB3A 3OHIA 1EP1A 3THAA 4WY0F 1LTDA 4UTIA 1TPDA 2X1UA 4RCXA 3G3MA 4A29A 2VEIA 3W71A 4UR8A 3NQMA 2OT0A 4Z08A 2E5CA 4M6QA 1RR2A 1OK4A 1P5BA 4A22A 1K8YA 2QUUA 4KWWA 4O4WA 1LORA 5IM51 4UTJA 1ADOA 5DELA 1XC4A 2YXGA 3W2MA 3HG4A 4BFAA 1HO4A 3HPZA 3KFTA 4I9AA 3BLIA 4Z1CA 1H1ZA 5HQEA 3G1AA 1RQEA 2VFIA 3W83A 1C9DA 1OX5A 3NM3A 4DF2A 4A2RA 4JEQA 5LGZA 1OFOA 1QPNA 2WNNA 3PUOA 3R13A 4AMAA 3FYOA 3W1UA 3S1XA 3TSDA 4DO6A 3IVUA 2FTPA 2Z6JA 3I7RA 1I2RA 3M1ZA 4HSNA 1M5WA 4HNVA 4Z0SA 3PAJA 3LRKA 4EWND 3NZ1A 4J9JA 3NL3A 5D2YA 3NPVA 3N2XA 1H5YA 2XN2A 5CPOA 3NQFA 1Z42A 3KAOA 4HNTA 1KTNA 2G96A 1LM1A 3R5EA 4P61A 3S8HA 2NX3A 2QCLA 3N9RA 4XBKA 4UNKA 1IXNA 1T96A 3CB8A 3RMJA 2H3BA 1TJRA 4CQ8A 2RDUA 3S6DA 2GQ8A 3KRSA 2JGYA 3KOFA 3TNOA 1NF7A 3I65A 5AB3A 4GUJA 5AYYA 2BXVA 2V8ZA 2GPTA 1LOQA 4Z1DA 3LB0A 1YXCA 4ZQPA 3TXVA 1H7XA 1MEHA 1W3IA 5I3GA 3VE9A 3M41A 4ORMA 2NXIA 4FF7A 3UXAA 1L6WA 2WQPA 4YLWA 3EX6A 4DO4A 1WX0A 4I7UA 5J5RA 3TROA 3ANYA 1W37A 1RVGA 1YLVA 2YYTA 3C2EA 3GR8A 3SGZA 1EUAA 3B06A 1MEWA 5I3IA 4LRSA 4NJKA 1F2JA 3O6DA 3P8IA 4JYEA 3KVLA 3S9YA 3C2RA 4AHQA 1O94A 2ZZ5A 4FNTA 3CWNA 3DENA 4FEZA 2ZBTA 4XBSA 5AC8A 1G7UA 3PWAA 3QH2A 4XTDA 1TTJA 1ME8A 2R94A 3PUEA 4O1CA 3KVJA 4UFMA 2ISSA 4O54A 3MBFA 1H7PA 1KLYA 2V0TA 2PCQA 1ZCOA 2ZDRA 2B0MA 3QSTA 1FWRA 4RR4A 5G5IA 3W70A 3HPSA 1XUUA 2QEZA 3LCGA 5EPDA 5MHBA 1WV2A 4EF9A 3L9CA 4AWUA 3I6RA 1A53A 3W7GA 1SO5A 1W5QA 2WO5A 3MYPA 2TPSA 4O16A 1BKSA 3MHUA 3GB6A 2VFFA 2F7FA 2ZFAA 5LNSA 3B4UA 2CZDA 1FY6A 2QJGA 4JD4A 5SWUA 4LUJA 1F6PA 2WPBA 1QO2A 2J27A 1WQ5A 4AVFA 1EA0A 3M0ZA 4GC4A 2QAPA 5DBUA 3WJSA 2OZ0A 1B4KA 4XKYB 5C6MA 3NQ6A 5G2WA 5HWMA 1E51A 4UTTC 3GDTA 3E02A 3D0CA 1H50A 1QPRA 2DZSA 1I8JA 3HGJA 3LX9A 1DBTA 2EF9A 1X6UA 3IVSA 3LBCA 3ELFA 4MZ8A 3TQKA 4DEFA 2C16A 1YTKA 2CLMA 1WA3A 3BW2A 3IEBA 3MI3A 3VFLA 4GRSA 3QSRA 3QW3A 4JS3A 1RQHA 3TH6A 4PFMA 4R7JA 4RZ5A 3PY2A 3NVTA 4NZFA 3LTPA 2VEMA 1RPXA 4QQ3A 1N7KA 2GVLA 3IIXA 1THFD 4O0KA 4JTLA 1CW2A 4Z1BA 3G18A 3LM7A 4NJIA 5TBOA 2V30A 4JGDA 2W79A 3MUXA 4S1FA 1EWDA 1I45A 2ZRYA 1OYBA 1TMHA 1TTPA 5C54A 1HFBA 3IIPA 3R12A 4O19A 3PG9A 1HL2A 2QDGA 2VELA 3ABQA 1XBVA 5U7SA 1EUNA 4CCDA 4Q32A 3WJYA 1FDZA 2E68A 3W87A 4K36A 2V2HA 1VCFA 3GVGA 2VENA 1KFLA 1S5TA 3FYPA 1OVDA 3EB2A 1TPFA 3C6CA 4XUGA 1VZWA 2A7NA 3RFAA 3OBKA 2YGYA 1K7FA 1TTIA 2CLIA 5CZ0A 3SZ8A 1GT8A 4ZQCA 2R8WA 2NX1A 1FDYA 1H1YA 3NPXA 4TO8A 3EWUA 4JY9A 4K6AA 5LKYA 5T26A 1YXDA 1BWKA 4XKYA 4JNMA 2ABBA 3OIXA 5D2XA 3MWAA 4DF1A 1L2UA 3NQ2A 4QAIA 1GZGA 3SY5A 4LUIA 4KFNA 2BLEA 4UNLA 1I2QA 3HGOA 1XDLA 2WSYA 3QJAA 2TMDA 4BI6A 3WK0A 1XDMA 3FKRA 3HQ1A 3TUUA 1FBAA 3W22A 1D3GA 1SW0A 1W3NA 1KBIA 1XBZA 2WKJA 2QJHA 4G1KA 2X16A 3PG8A 4UFHA 1FXPA 4O18A 1B4EA 2YPIA 5H91A 4BI5A 3ATZA 4K38A 3A23A 4KFPA 5K9DA 1TCDA 2Q8ZA 3NL5A 2ZZ7A 3RLVA 5F2LA 4PTNA 1QAPA 4LS0A 3W7EA 4GWEA 3HG2A 5E93A 3DHFA 3OA3A 1G6CA 1I2NA 3FIGA 4FNUA 3P7YA 1TQXA 2QDHA 3WK2A 5F2GA 3E12A 3W7QA 3NGJA 2JGQA 5DCEA 1GVSA 2ZRXA 5TQLA 3VE7A 1F7BA 1AMKA 4PODA 4WOZA 1F6KA 1NVMA 3G1HA 4WUIA 4TIMA 1MEIA 2A7RA 2NZLA 2ZCGA 1V7YA 4TMCA 4LVDA 3HGRA 3W23A 1JUKA 3PM6A 5HUOA 1IIGA 4O28A 2QUTA 3QEZA 4JTEA 3UWYA 3NZRA 3W73A 3GR7A 4CNNA 1UUMA 2ZZ3A 4JTHA 3P62A 4GFSA 1UUOA 5G2IA 4QITA 3ZWTA 3F4NA 4IMDA 3P60A 4W9TA 4CNOA 2NX9A 2UV8G 3G8EA 3DZ1A 3LHZA 2CU0A 5DN1A 4UFLA 3NPWA 4PCFA 4RJEA 5HULA 1RQBA 5HWJA 3LCHA 2GVGA 2J9YA 1MZHA 3A5FA 1WOAA 4AB4A 1ZNNA 3LCIA 1NF0A 3DBPA 1JCYA 1K8ZA 2WNQA 1BTMA 5C55A 1TSIA 5FEWA 1TPB1 1K7EA 3TC7A 4DBEA 1P4CA 4OGZA 4FIRA 4AXKA 2QUVA 4DBDA 4E38A 4LC8A 3C61A 5KZMA 2CZFA 2ZRUA 4IX0A 4MIMA 1GVOA 5CZSA 5L9FA 4C1LA 3W7PA 2RDWA 5K7JA 5KITA 1AG1O 1D3HA 4Z0JA 3L0KA 4CCEA 4LVAA 3L65A 4O15A 4FO4A 3DFNA 2JKPA 3LRLA 5EMUA 3OVQA 1TO3A 3N73A 2ZYFA 1QNVA 2C18A 3CM4A 4M5PA 1EEPA 3MI2A 3OVRA 2FPTA 4UIOA 3N3MA 1U5JA 3IIZA 2GQ9A 1VS1A 1DV7A 1H7NA 2H3DA 4LU0A 3W76A 3L5MA 3G3DA 3S5YA 3W7CA 3THQA 2V9DA 4RX0A 1H51A 1W31A 1DL3A 3UZ5A 4UTLA 2XFWA 3LI1A 3GKFA 3Q37A 4HPJA 2C3ZA 1VHCA 2JK2A 2FB2A 2OX1A 3NQAA 3P61A 5F4XA 4UCGA 4N9CA 3SW6A 1F05A 3A5VA 3O06A 1LCOA 3O63A 5LSMA 4MLRA 3EWZA 3W72A 3B0UX 1UASA 3PSWA 4UXDA 1I4NA 3PBWA 4U28A 1YDOA 2AQWA 3G1DA 4O50A 2FPVA 2J9XA 2A2IA 5AYXA 3TA6A 1S5WA 5KZEA 1NEYA 3UWWA 5ABTA 3R89A 2J88A 4WOQA 3T55A 5U4NA 4UR7A 4UFKA 3T7VA 4UMBA 3M5XA 4LVFA 1L6YA 3W7IA 2QCHA 3F4WA 3OVPA 3LCFA 1TRIA 1TV7A 3P84A 1QFEA 2GQAA 3W7JA 5BOOA 1S3HA 1Q3NA 3UNDA 3A9IA 4NX5A 3IVTA 2QCGA 4OBTA 3LRMA 4QNWA 2CLHA 4QJ1A 1LLZA 4DQWA 4WXYA 2HS8A 2R14A 3EKLA 1OF6A 3FOKA 4JY8A 1FWTA 3BVJA 3GX9A 4O1AA 3UWUA 1H7OA 4GUGA 3L5LA 4OQVA 4ZZ9A 5F4WA 4UTMA 2X1RA 1PCKA 1TPWA 4NXKA 3P81A 3QPZA 1ME9A 4JDYA 1GVRA 1H61A 1JULA 3MP5A 5CPLA 2C13A 3BG9A 1P0KA 4MVAA 5BRBA 3JR2A 2WSRA 1VCGA 3NA8A 5DLCA 1W8SA 3BG3A 1KTCA 4R33A 5CPNA 4MFDA 4N9BA 4XQ6A 1MXSA 1A50A 4UTUA 5K9XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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