2QJHA

M. jannaschii adh synthase covalently bound to dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
270
structure length
264
Chain Sequence
ELFKDIKNLGKLVRLERIFNRESEKTVIVPMDHGVSNGPIKGLIDIRKTVNDVAEGGANAVLLHKGIVRHGDVGLIIHLSGGTAISPNPLKKVIVTTVEEAIRMGADAVSIHVNVGSDEDWEAYRDLGMIAETCEYWGMPLIAMMYPRGKHIQNERDPELVAHAARLGAELGADIVKTSYTGDIDSFRDVVKGCPAPVVVAGGPKTNTDEEFLQMIKDAMEAGAAGVAVGRNIFQHDDVVGITRAVCKIVHENADVEEALKEIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonic acid synthase, a catalyst in the archaeal pathway for the biosynthesis of aromatic amino acids.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative aldolase MJ0400
molecule tags Lyase
source organism Methanocaldococcus jannaschii
total genus 88
structure length 264
sequence length 270
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 2.2.1.10: 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase.
pdb deposition date 2007-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qjhA00
1JQXA 3BLFA 1VR6A 3TQKA 3G1DA 3C2VA 5FEWA 3W2LA 3H55A 1B57A 5KSWA 1J2WA 4N9DA 2JGQA 2DP3A 3LHWA 3W2MA 1LCOA 1B3OA 3NQEA 5LNSA 4GJ1A 4UR7A 1U83A 4Q4KA 4CNPA 4L4MA 5D37A 2CLOA 4MFDA 1RV8A 3U6WA 4QM1A 1OFEA 1KM3A 1TIMA 4AF0A 1OYCA 3C4UA 3NNTA 5D04C 1X8FA 1DKWA 3TW6A 4H4IA 3LERA 5EYWA 2V5BA 3LHUA 4ZVJA 3HGOA 3CWNA 3HPXA 1DL3A 1FQ0A 4O13A 5CSSA 4E2DA 5K3VA 2X30A 4TMCA 3GKFA 2F84A 1HG3A 4BFAA 3W7LA 3GB6A 3RU6A 3R5EA 4TU1A 3RK8A 3ABOA 1I2NA 1GQNA 1SO6A 1F7BA 2JK2A 1KM1A 4CCCA 1ZCOA 2G5WA 4FIQA 2CZEA 2VFFA 3GXTA 1XUUA 3L0NA 3NG3A 4RZ6A 1OFOA 2RFGA 2QUUA 4XUGA 1VCGA 2DZXA 1SQ7A 2CLFA 2H6RA 5EKYA 1YADA 2F7FA 4JTLA 1TREA 3MP4A 3GR8A 5KZDA 2V9DA 3W86A 2Y89A 1QPOA 3M41A 1SW0A 3LCXA 2GVGA 3MBDA 3CEPA 4OBTA 3UYCA 3A21A 2QUTA 1OX4B 2ZFAA 4NU7A 4WXZA 3UNDA 1WX0A 3TUUA 1XBYA 3LLDA 4NJGA 3RLUA 1VC4A 2BX7A 2HS6A 2E68A 4EF8A 3T55A 2Y62A 3TX9A 4RZ4A 2E77A 3BW4A 2VEPA 4AVFA 2QJIA 1BEUA 3UWVA 2AAMA 3KVLA 4R33A 3U2OA 3EWWA 2C15A 3G22A 4B5NA 3STGA 4FEZA 1BTMA 4UXDA 1BWKA 5I3KA 2ZRUA 4J9JA 1OX5A 1LOSA 3S1VA 4K8EA 3S1XA 1NFBA 1A5AA 1H61A 3DHDA 4LS0A 1YXYA 3Q58A 4C1KA 1Q45A 4ICNA 4XKYA 1YDVA 2CLLA 1A5BA 2YFOA 3USBA 5LSMA 3KOFA 1M5WA 1LORA 5F2LA 4DF1A 3EX6A 5HUOA 2QCLA 3LV6A 5DCDA 2NWSA 3LDVA 5FF2A 3O6DA 3MMTA 4UFJA 3HGRA 3RMJA 4MZ8A 4QSHA 3TSBA 4X9SA 1OYAA 2RHGA 3MYPA 1H63A 3NA8A 4Y8FA 2ZDRA 3BG5A 3T78A 4MJZA 3UQNA 5CZ0A 1JVNA 3M5ZA 3NAVA 3W7OA 3SGZA 4IXHA 1IGSA 3FJ6A 2JGYA 3EEGA 3K30A 5FEXA 2R94A 2ABAA 2C18A 4WOQA 1GT8A 5J5RA 1QR7A 3L68A 4CNNA 1R2SA 2ZTKA 3QEZA 3I7RA 1FX6A 3GKAA 1BKSA 3L5AA 3NPUA 4HPXA 3GR7A 3ELFA 3W7MA 5HWMA 3MYOA 3EB2A 3G1AA 1LLZA 2KZHA 1B9BA 3WFAA 3TKFA 5AHEA 2LLEA 3NPVA 3CU2A 1QFEA 2B7NA 3LHTA 1UUMA 3NL3A 3LM7A 4MIMA 1SR9A 1Y0EA 2J27A 3T4CA 3D0CA 2QR6A 3G1SA 4DELA 3C8FA 2BTMA 3SIZA 1P4CA 3LCHA 5AHMA 3TK7A 2WQPA 1SFJA 4CNOA 1OK6A 2DZPA 1D9EA 1DV7A 3LTPA 1KM0A 1KM4A 4O0ZA 4GC4A 4UTWC 3EXRA 3EWZA 5D2WA 1KTNA 4NQ1A 4S2BA 1Q6LA 1PIIA 2FQIA 3GDRA 3NZ1A 1XUZA 4D2JA 1TJPA 5I3GA 1FCVA 5I3IA 1TTIA 1W5PA 1WOAA 2Q3OA 4YCOA 1P0KA 4UTJA 3TA6A 1VS1A 1PVNA 1K3UA 1IXQA 4NJHA 1RZMA 1P0NA 5AHNA 4Z1DA 3W85A 1EUAA 1MO0A 2GUUA 4Z08A 1SO5A 2B7OA 1IXPA 4NX5A 5G4EA 4UMAA 3LRKA 3CC1A 1RD5A 3S5ZA 3JRKA 1YXCA 3TROA 1SW3A 3NO5A 1OX4A 5DLCA 2VXNA 2A21A 4LS2A 4NZFA 4WY0B 3FYPA 3W7CA 4TR9A 1T8XA 4K36A 2X16A 4DBDA 2Y63A 4O57A 3M7WA 2R91A 4ZZ9A 3RFAA 3LXCA 3P82A 4O0KA 4MZYA 5DELA 3M5VA 1PHWA 1YDNA 3TE9A 2ZZ7A 4O10A 1XDLA 5G1TA 4JX6A 4ZQNA 3DFTA 5D09A 3GVGA 5AHIA 3O1NA 2NX9A 2FDSA 1X1ZA 4AWSA 4UTWA 2GVLA 4N02A 4YMZA 3QF0A 1SO3A 3C6CA 3PBVA 4NXSA 4IWWA 3P62A 2B7QA 1I2RA 4IOTA 3V75A 5TIMA 3O63A 3P84A 3ABRA 5D32A 1N55A 2O7SA 4UFMA 5LHEA 4E38A 3UXDA 4FNTA 4O19A 1VCFA 3G1FA 4O1DA 4HT3A 1PL9A 1EX5A 4JR5A 1K8ZA 4LVBA 1W3NA 2W0UA 4Z1CA 1PS9A 3TCEA 1TPWA 4KFOA 4K38A 2OMAA 3M9YA 4OQVA 1LBFA 1DJQA 4LC6A 3PS7A 3FEMA 5F4SA 4AHPA 4N9BA 1GOXA 4MLRA 1ME7A 3P81A 1FCUA 2QF7A 1O60A 5F1VA 4FHAA 3FIGA 1M7OA 5HQEA 3PUDA 3C61A 2YW3A 4JTFA 3TQVA 2YSWA 3NOEA 1Q3NA 5U4NA 3WK2A 4GWEA 3A24A 1EA0A 1UJPA 1TPEA 1ME9A 1LP6A 2OX1A 2WJZA 1GPWA 1DVJA 3TSDA 1OABA 2HS8A 1JCYA 2WSQA 1ME8A 4ZQCA 5HULA 3MHUA 2VFIA 3UWZA 1I45A 1YTEA 5CPLA 1VRDA 1LTDA 4I7WA 4UUIA 3W88A 4EF9A 1SU5A 3TAKA 4UTHA 3LI1A 3B0VC 2OJPA 1ICSA 3F1QA 1F76A 3UPBA 1NF0A 4EWND 1JCLA 3DKLA 1H1YA 4FNUA 3W1QA 4CQAA 1AW2A 3STEA 3TMQA 3LCGA 2QJHA 3P5YA 2NV2A 3IIPA 4QNWA 1JULA 4UMBA 5F4XA 2EPHA 3FLUA 3FKKA 3IGSA 1YYAA 3NGJA 4JXCA 4GNJA 3DAQA 3N34A 4WZHA 5AHLA 3ATZA 4LY8A 4AHOA 3WJXA 2J24A 2YR1A 4N4QA 5AFDA 4FXSA 3STFA 3KAOA 1GVSA 2WSYA 3NXFA 4HN4A 4RKAA 1MEIA 4N4PA 1G6CA 4FNRA 3L21A 4DPQA 1YPFA 1EP1A 1K7FA 1PE1A 2QAPA 4O4WA 5HINA 1RQEA 3O6YX 3NL5A 3KRSA 5LGXA 3TXZA 3H54A 4TIMA 2J88A 1C9DA 1QDSA 3NEVA 3SZ8A 2R14A 3STCA 3SI9A 4ZQMA 3AO0A 7TIMA 1RQHA 1RR2A 1WV2A 3W1LA 2Y88A 4MYXA 5IBXA 1PCWA 4FO4A 4DO6A 1TPDA 4LRTA 1OFQA 4A21A 4ADTA 5KITA 3LB0A 1H62A 1O4UA 2A7PA 3TIMA 4MUZA 2A85A 3UWWA 1TPFA 3Q94A 3KX6A 1SUXA 4C1LA 3QYQA 5D2TA 1EB3A 2FIQA 4NVTA 4N6EA 1XL9A 2CLIA 2PE4A 3DFOA 1DQWA 3DH7A 1TB3A 4N9CA 5I3FA 4ADSA 3VFLA 1EP3A 3HBLA 2QDGA 4KFNA 5TBOA 1K03A 3FJLA 4S1FA 3CM4A 3N9RA 1FDYA 1IXOA 3CWOX 2YYTA 1TCDA 1TQJA 3GZ3A 4HNUA 4M6PA 3THAA 2ZBTA 4LVDA 3W1RA 3TJLA 3IVTA 1YTDA 4N9EA 1TV8A 5J5DA 2A6NA 3CEUA 4AH7A 1J5TA 2A5HA 2Q8LA 1EUNA 2OT1A 1OFRA 4NJIA 1EP2A 4O14A 2Y7EA 4JD4A 4IGHA 3M5XA 4O8RA 3LLFA 1EWEA 4HNNA 4YLWA 4JX5A 4Q32A 4BR1A 1B4EA 3W1MA 2E6AA 3HG3A 5E0KA 1VYRA 2A7RA 4UTUA 1KM2A 3TMLA 3RNDA 2VEMA 3RLVA 2BXVA 1F6PA 1AMKA 2QCMA 4QJ1A 1KM5A 3IGUA 5CZSA 5F1UA 3GK0A 1ZNNA 1I2PA 4UFLA 4ZQPA 4LNYA 3G3MA 3WK1A 3BPWA 5HR7A 4GUHA 3SFKA 1VYPX 1LBMA 4LT9A 4EIVA 1RQBA 4RCXA 3O15A 3PG9A 4QQ3A 2YZRA 4XBKA 4X22A 2A4AA 5I3HA 4Z1BA 3L5MA 1W1ZA 1CI1A 3DI0A 2BLEA 4POCA 4XTDA 3BLEA 1OF8A 2A6LA 2YGYA 1UASA 2FPTA 3TNOA 2I1OA 2ABBA 3OEXA 1WBHA 3MBFA 4DBEA 2X1RA 4IUOA 4BI5A 4JY9A 1A5SA 1MXSA 1TQXA 1HFBA 2NX3A 4UNLA 1Q6RA 3PB0A 3NQCA 2GOUA 2J9YA 4AXKA 4RR4A 4NX0A 3NQ8A 3MJYA 2PURA 4TO8A 4Y6GA 2ZZ4A 2G96A 4JDYA 1A5CA 2VENA 1JUKA 4JNMA 3T40A 3I68A 4ML9A 2YX0A 5FI8A 1Q6OA 3IV3A 2V8ZA 4M7SA 4OWGA 4RXFA 2BZNA 1TO3A 1WXJA 2X1SA 5K7JA 4K37A 2CU0A 2EKCA 1KFJA 2WPBA 4MOZA 3TU9A 4UFHA 1HTIA 2OT0A 4PC8A 2CW6A 4O53A 1TMHA 4QISA 4DF0A 2EGZA 1K8YA 1QWGA 3NM1A 4HNTA 5EBUA 2PRHA 3W1XA 1G7VA 3ZWSA 3UWUA 2WV8A 4CQ8A 5BRBA 2ISSA 3W7EA 3G0SA 1WDWA 3I65A 1X1OA 4ALDA 4PFMA 2GVJA 3O07A 1MZHA 1D3GA 3HMJG 3CPRA 1H50A 4PCFA 3UXAA 1IIHA 4GRSA 2ZRZA 4RLIA 1LRTA 2NXIA 1NF7A 3MUXA 4A22A 4QNEA 2Q8ZA 4ZL1A 2NUXA 2H90A 1XCFA 1JCXA 2A7NA 3YPIA 1YDOA 3OVQA 1W5QA 1DQXA 3OVRA 1XXXA 2VEIA 1Z42A 3L66A 3M6YA 3BW2A 2H8ZA 1JRCA 2RKXA 4NZJA 3PUOA 1SFLA 3PF3A 2PC4A 4FX6M 1AG1O 2YXGA 2VOMA 3DI1A 3W7KA 2GQ8A 2VFGA 2V2CA 2WSRA 4O12A 1OYBA 3DXIA 4CLMA 3PUEA 1OVDA 1QO5A 3L2IA 3QSRA 3HQ1A 5D05A 2ISWA 5F2MA 3CT7A 3W3OA 3LTSA 4MVAA 2ZZ1A 3G1HA 4ORMA 4JTUA 5DXXA 1SPQA 3PVFA 4UTTA 3PG8A 3GLCA 4JYDA 1N7KA 1DJNA 3PC0A 4N6FA 1X6UA 4BWLA 3NQMA 4K7VA 2FPYA 4KFPA 3C2FA 4AB4A 1VGAA 2V5LA 2ZRYA 4AHQA 3M44A 3EWXA 1FWTA 3S1UA 1H7PA 1NVMA 4LV4A 1G4EA 2NUWA 1O5KA 1YXDA 2TPSA 4O1CA 1KTCA 1LLWA 1HO1A 2Z1BA 1WOBA 1C8VA 3SR7A 3B0UX 5DCEA 4RX0A 3SSJA 3MP3A 4HNVA 4IX0A 3Q2DA 4O28A 3GIYA 6TIMA 4E0CA 2QCHA 2JKAA 3W7JA 4ZMGA 5FEPA 4RV8A 5D03A 3G8EA 4H3DA 1S3HA 2RDWA 3NDOA 3H53A 2D73A 4NNAA 5DY3A 4XWUA 5HR6A 4IMEA 2Y85A 5FEZA 1O5XA 2TYSA 3NM3A 5I3JA 1N8FA 4AMAA 3S5YA 4LVGA 3N14A 2YFNA 4LC8A 1XKYA 2GJNA 3P74A 2NV1A 2Y7DA 3PWAA 4JYFA 3UZ5A 2YYUA 3MP5A 1W8SA 2BSLA 3W1TA 1KLZA 2I14A 3PY2A 1AL7A 3GAKA 1ML1A 2PRMA 2DZUA 4FX8A 4CCEA 5DY2A 3TJXA 1KV8A 1W56A 3V1PA 4K8HA 4LRSA 4GBUA 1H7XA 1R30A 4LOCA 1ZHAA 4Z0JA 4R34A 4ZQRA 2V81A 1JUBA 1JQVA 3IIVA 1XBXA 5TQLA 2XFWA 3DZ1A 4OV4A 3JR2A 2ZRXA 2CLEA 3NR0A 4CCDA 4YWIA 3M1ZA 1U5JA 3LXAA 3S9YA 3A22A 3LCWA 4FIRA 5EMUA 2ZRWA 4KWVA 3QPYA 4MZ1A 3VI2A 1W5NA 3ABSA 1I4NA 4M6VA 5KMYA 4LVFA 3TQ0A 4O15A 2ISVA 2FPVA 3DBPA 5D33A 3FYOA 3TFCA 1T0OA 2Y61A 4JICA 1JCMP 4Z1AA 3WK0A 2EF9A 4KWWA 4QITA 2ZRVA 4EOUA 3HJZA 3IVUA 3PSWA 4JTEA 5G5IA 1WYIA 3TR2A 1VCVA 4JTSA 5FESA 4YCPA 3W7NA 3MI6A 3P80A 1AL8A 3NL2A 1TV7A 1O95A 3TXVA 3B05A 1P1XA 2V0TA 3P61A 4MKNA 2G95A 5HWNA 1T99A 3L67A 3ZR4A 3G18A 2DZWA 4YL2A 1W5OA 3ZFHA 4UR8A 4MYAA 1GYNA 2CLHA 2NWRA 3QMTA 1GG0A 2CZ5A 2FLIA 1GVFA 4FB7A 1H7NA 1CX9A 3TV8A 3LHYA 2C13A 3NQAA 1S5TA 1UUOA 5D2YA 1I8JA 4JY8A 3GDTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JQX A;  2PDJ A;  2BHU A;  3TQK A;  3G1D A;  4OFC A;  1B57 A;  3V0T A;  4QSF A;  3CQK A;  4N9D A;  2JGQ A;  4HA4 A;  2D2G A;  4UR7 A;  1W32 A;  4LYK A;  1WKD A;  3AYS A;  2HZG A;  3IGH X;  1TIM A;  2DDX A;  1M9H A;  2A3E A;  1OYC A;  3DGB A;  1X97 A;  3EPM A;  5IHR A;  2OO0 A;  3KTX A;  3LHU A;  4EPD C;  3HGO A;  1DL3 A;  3KTS A;  3CL7 A;  1FQ0 A;  3VMN A;  5K3V A;  1U1U A;  2X30 A;  4TMC A;  3GKF A;  4PCN A;  3W7L A;  2OXN A;  3GXM A;  4Y9O A;  2YBT A;  1SO6 A;  1F7B A;  3EMQ A;  3PUG A;  2NSX A;  1KM1 A;  1RY0 A;  1OCJ A;  4FIQ A;  3FK4 A;  2VFF A;  3C0Q A;  4P8X A;  3TP4 A;  4RZ6 A;  1OFO A;  2E8Y A;  2RFG A;  1MVY A;  1VCG A;  1E3Z A;  1H0G A;  1MUM A;  5FA5 A;  1SQ7 A;  4WF7 A;  2H6R A;  1NDV A;  5EKY A;  1BQG A;  1TVL A;  2Y89 A;  5JH1 A;  1NDW A;  5CH9 A;  3POC A;  4FR6 A;  6CGT A;  2QUT A;  3UND A;  3N2C A;  4KEZ A;  2RJG A;  4AC7 C;  6ENL A;  1C8Y A;  4HZ7 A;  4M0X A;  4XZM X;  3ZXW A;  4C7F A;  3TX9 A;  3UF9 A;  4ZO6 A;  3K46 A;  4AVF A;  1MW2 A;  1MNS A;  3UWE A;  2CER A;  3SCU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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