2QJHA

M. jannaschii adh synthase covalently bound to dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
270
structure length
264
Chain Sequence
ELFKDIKNLGKLVRLERIFNRESEKTVIVPMDHGVSNGPIKGLIDIRKTVNDVAEGGANAVLLHKGIVRHGDVGLIIHLSGGTAISPNPLKKVIVTTVEEAIRMGADAVSIHVNVGSDEDWEAYRDLGMIAETCEYWGMPLIAMMYPRGKHIQNERDPELVAHAARLGAELGADIVKTSYTGDIDSFRDVVKGCPAPVVVAGGPKTNTDEEFLQMIKDAMEAGAAGVAVGRNIFQHDDVVGITRAVCKIVHENADVEEALKEIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonic acid synthase, a catalyst in the archaeal pathway for the biosynthesis of aromatic amino acids.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative aldolase MJ0400
molecule tags Lyase
source organism Methanocaldococcus jannaschii
total genus 88
structure length 264
sequence length 270
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 2.2.1.10: 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase.
pdb deposition date 2007-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qjhA00
2QJGA 4JICA 4NU7A 5F2IA 3I6RA 4BWLC 1WAUA 2WNNA 3P5ZA 1BTMA 4OGZA 1SO5A 1CX9A 1YYAA 3F4WA 3G1VA 4NJKA 1TPDA 2W79A 1W5NA 1Z44A 3PS7A 1F6KA 4S2CA 4XTDA 3LX9A 4CNPA 1KM2A 3UWQA 3SECA 1VLWA 4YCPA 3QSTA 5EKYA 2A4AA 2R8WA 2AQWA 1GTEA 4DO6A 5BRBA 4K36A 1Z42A 1SW3A 3I65A 4N6FA 1W3IA 2E5CA 3L67A 4E38A 1W5QA 1TCDA 3L5LA 5CG7A 3PB0A 2Y61A 4GE8A 1Q6RA 1GJPA 3NL2A 3B8DA 1DV7A 1I45A 5CPLA 3O05A 4MZYA 1W5MA 3TQKA 3MBFA 3NPUA 1KM1A 1OFDA 3CIXA 1UUMA 2ZYFA 3OBKA 4PFMA 4OHQA 1C8VA 1G69A 2GJLA 2ZZ6A 3VI2A 1FX6A 4OU1A 3WFAA 2JK2A 1KA9F 1SZFA 3NPWA 4M6QA 1F05A 3LGEA 4LVAA 4MJMA 3S5ZA 1GYNA 3LCFA 3T4CA 3W71A 2TYSA 1OF8A 3MP5A 1H62A 3W7KA 2WNQA 3BVJA 3EWXA 4Z08A 3GAYA 1OX5A 5DCDA 4FHAA 2VFIA 3L0KA 2QUTA 3WJXA 5D38A 4YWIA 4LNYA 3TW7A 1SO3A 3NQFA 1ME7A 3HGRA 2VFEA 4QNEA 3MHFA 2G5WA 2DZWA 4GC4A 2V82A 1SPQA 1OF6A 3M44A 4AH7A 2E5DA 3IIOA 1Z41A 3UNDA 5T26A 2WQPA 5AHFA 4N9EA 3OHIA 3WK2A 5LNWA 4JYFA 2P10A 4C1KA 4JD4A 3W7JA 5D2XA 3KVJA 4OV9A 4JIPA 4KKXA 5BW6A 1K7FA 4XBKA 3S9YA 4RCXA 1XCFA 4IMGA 4HSNA 3W1PA 2CLLA 1V7YA 3QM3A 3L66A 3DFSA 3IEBA 1KLZA 4JTLA 3SI9A 3FOKA 4UCGA 5HUOA 3Q2DA 1ZHAA 5CPMA 5AC8A 2ZZ1A 5C5YA 5DXXA 3T44A 5K3VA 3N3MA 3W1AA 2X16A 4A29A 2ZZ7A 3P5YA 1XM3A 1XFBA 4DBEA 3E49A 2AAMA 3D0CA 2XN1A 3NQGA 5HULA 2ZCGA 1H7PA 1DJNA 2TRSA 2ABBA 2GVJA 3HO8A 3TA6A 2E5BA 5EA9A 3LB0A 2VFHA 4HKPA 2E6AA 2QR6A 3G1AA 5BNKA 3S42A 3P61A 5K4XA 2V5BA 4ICNA 5AYZA 5KITA 4IMDA 5CSRA 3V75A 4JGDA 1I4NA 6TIMA 3A21A 2YR1A 3HGJA 3UWWA 3W7IA 1NEYA 3G0XA 2B7PA 3WJWA 1ZENA 2NXHA 5FF3A 3WK0A 1IXNA 5G2WA 3MHUA 4O4WA 3G1DA 3W87A 3FEMA 1SZEA 4LW7A 4N6EA 3HJZA 3EXSA 1EPXA 1IXPA 3C2EA 5HR7A 5HWJA 1B3OA 1TTQA 2WSYA 4JR5A 3O06A 4EWND 3FLUA 1JVNA 1K8ZA 3EX1A 1OK6A 3HOJA 2BTMA 1OHLA 3S1VA 5I3JA 1OFAA 1R46A 5C54A 3DFTA 5AC6A 3MP3A 5DY2A 3NQAA 4JTKA 1KFCA 1LDCA 3P7YA 4EF9A 3OVPA 2DZVA 4RXFA 2XN0A 4GUIA 4HNTA 2C15A 4XUGA 1O5KA 3G8RA 4RK8A 3ATZA 2RHGA 1FWWA 2W0UA 3IRDA 4K38A 1FWRA 3PULA 3KVMA 1YADA 3CC1A 3W86A 1RV8A 1KFKA 4WXYA 4O15A 5AHLA 3W1UA 2R14A 4N4QA 3DBPA 3L5MA 5KZDA 4JN6A 2O7QA 1YTEA 4O28A 1T8XA 3BGGA 4FO4A 1FDYA 5F2MA 4FNRA 3G22A 4LS1A 2O7SA 3NQ6A 2PC4A 2X1RA 4NJJA 5J5RA 1XDMA 5FF7A 3QRHA 4UNLA 1BWLA 3QJAA 2HSAA 2I1OA 4ZZ9A 1H51A 5E93A 5I3IA 2ZQ0A 5HQEA 1OFBA 1C9DA 1IGSA 1VLIA 3TW6A 3SW6A 2CFFA 4NXKA 2V2HA 2ZTKA 3BW2A 1X1OA 3HG3A 4PL1A 3NPVA 3PUDA 5CKSA 3STGA 4DELA 4IUOA 3DKJA 3FFSA 1MXSA 3IV3A 1K03A 3G8EA 3LRLA 2FDSA 3QZEA 4BFAA 1J4EA 1UJPA 3MI6A 4WUIA 1ZAHA 1H7NA 1AW1A 2X1UA 4OWGA 4UTIA 4XKYA 3L9CA 1TPFA 4Q4KA 2PRLA 3L68A 4GUFA 3KAOA 3B4UA 3S0CA 4BI7A 2YDAA 1HO4A 1FY6A 4L4MA 1HTIA 1PS9A 3BARA 1HFBA 4NJHA 3T55A 1ALDA 2J9YA 4ZQPA 3HPXA 3TROA 4NQ1A 4NZJA 1L6WA 4ML9A 3WK3A 4BR1A 4OQVA 4FX8A 3CM4A 5HR6A 3C2OA 1WV2A 5DCEA 1W0MA 3IGSA 3S5YA 4XKYB 1LRNA 1ICSA 4ZQOA 4ADSA 4CLMA 4NNBA 4MPQA 2VFFA 1TPUA 3L0GA 5LHFA 3NZ1A 3DENA 2PRHA 3NGJA 4PH6A 1SFLA 3TMQA 3N2MA 1KTCA 2CLIA 4FIQA 5TQLA 4D2JA 4DF0A 1NVMA 1QNVA 2FJKA 3N9RA 3LCIA 5LNSA 5E0KA 1OFEA 1AMKA 1EX5A 2G95A 2OCZA 3AJXA 4OT7A 2BLEA 4M5PA 4K39A 1GYLA 2CWNA 2V8ZA 4QAIA 3S8HA 2IQTA 1K7XA 3EKZA 3LI0A 1SW7A 5DCBA 5DELA 4K8EA 2A6NA 2Y7GA 2VKZG 4X3ZA 2A7PA 3GX9A 4A21A 1TV8A 4PODA 5D30A 3CHVA 3NQ7A 3W7LA 3W2UA 3RFAA 1G7UA 4OE7A 4AAJA 1GQNA 4EIVA 3QQ1A 1ONRA 2J6XA 1A5CA 3N34A 3CPRA 3U6WA 4O54A 2VEMA 1QR7A 1XBZA 3DFQA 4FNTA 2H3DA 2ZA1A 1F7BA 1H7OA 3LOTA 4GXMA 4M19A 1O5XA 1F73A 4IWWA 1TPB1 1TPWA 1TRDA 4JX6A 2QCCA 3BLEA 4Y9AA 3G1XA 2FPTA 5LHEA 4IXXA 4LRTA 3HMJG 4LVDA 1XI3A 3QFEA 5A8GA 3EWZA 3LBCA 3ZWTA 4WOZA 2QDGA 2WV8A 3TXVA 1TPC1 3IVUA 4FB7A 1KM0A 2P1FA 2YPIA 3UPBA 4DF1A 2DZTA 2NV1A 1DBTA 1GG1A 1NF0A 1K02A 2GQ8A 3LXCA 7TIMA 3BV4A 5F2GA 1YDNA 3TQVA 4UFHA 4AWUA 2E77A 3W07A 2WNZA 2Y70A 4MVAA 2RDWA 4YMZA 3F03K 1ADOA 4UC5A 3LCWA 4IMFA 3NA8A 3GK0A 2Y85A 3GYEA 4MFDA 1LRTA 2YYUA 1LBFA 4UNKA 1N55A 3FKKA 4FIRA 4QIUA 1P1XA 1YDVA 1QOPA 4E2DA 4ZVJA 4O19A 4IPJA 2WSQA 3LTPA 4JTJA 5AHEA 2VC6A 3W7RA 1FCQA 3W1LA 5F1VA 4HNVA 3GVGA 2Z6IA 3SJ3A 2X2GA 2C16A 4XWUA 3EB2A 1FWNA 3RU6A 5LZLA 4NNCA 5CGQA 4P2VA 4AEOA 4O57A 4ZMGA 4BWLA 1AW2A 3C8FA 1I2RA 1OFPA 2BXVA 1WOAA 2JGYA 2HMCA 1XDLA 3LCHA 1EP1A 2ISWA 5DLCA 1OFOA 2DU2A 2ISVA 3GB6A 3M5VA 1U83A 1EUAA 2B7NA 3A5VA 3TIMA 3BW4A 1EP3A 3DHDA 4DBDA 4K7YA 3EX4A 1E51A 3G18A 5FF4A 2ZBTA 2OT1A 3TDFA 3ANYA 4ZQMA 4CCEA 2RKXA 2F84A 5FESA 4QSHA 2H8ZA 2OT0A 3BPWA 4WOQA 2WO5A 3W7QA 4N02A 3U8GA 1M6JA 3LTYA 3GDLA 1KM4A 3TK7A 3BG3A 2JGQA 1P0KA 5LNVA 3M47A 1TIMA 4MZ8A 1UCWA 1VH7A 3L65A 1MEIA 5D33A 1D9EA 3SZ8A 2TMDA 4FNPA 4DQWA 1H5YA 2BWGA 4IX2A 3VE7A 4WD0A 3WJYA 4JDYA 4KFPA 4UTKA 4Z1DA 3ABQA 1JCMP 4C1LA 1ICQA 1KW1A 2FTPA 4UTHA 4E0CA 5AFDA 2JKEA 4EOUA 3R13A 4DXVA 1OABA 1TREA 1W37A 3PUOA 3RK8A 4JTFA 2Q8LA 5I3FA 4DEFA 2JKPA 1Q6LA 2EF9A 5G2IA 4FNQA 2YW3A 1DVJA 3HG4A 3PB2A 5L9FA 3VFLA 1TRIA 2QJIA 5BOOA 5CZTA 1LM1A 3W7NA 3BO9A 4K6AA 3DHFA 2RDUA 3LV6A 4UUIA 1GZGA 4UTUA 1G67A 2CW6A 4IGHA 3W2KA 3G1FA 1TQXA 1Y0EA 3P8JA 4O16A 5F4SA 1A50A 3DFPA 5I3GA 1TMHA 3S1WA 1GG0A 1K7EA 1ICPA 3MW7A 3R2GA 3JRKA 4JTTA 3M5XA 3HF3A 1LOQA 1VHCA 3UWVA 3ATYA 3C2RA 4UXDA 3PF3A 3GNNA 3GXNA 4NXSA 3TH6A 4GWEA 5LGXA 1WOBA 5K9XA 3HG5A 1WDWA 1SFJA 3ZR4A 4DPQA 3TJLA 3W1TA 3MI3A 5F4XA 1X6UA 4NJIA 1EB3A 4JY8A 4O10A 1EA0A 2C14A 5G1YA 4JTEA 2GJNA 3A23A 1GOXA 3W72A 4G1KA 1XBVA 2YSWA 3A5FA 1O95A 4O17A 2NWRA 6ALDA 3STCA 2CU0A 5MHBA 1MSSA 2QCNA 4JTUA 1JCNA 1FCVA 2R94A 1G4EA 2Y7EA 4B5NA 3G3DA 3HGSA 2RDTA 4WJEA 5DBUA 3H55A 3SGUA 2B7OA 4O52A 2Y88A 4EVZA 3W7CA 3CT7A 1VC4A 2V0TA 5TBOA 1THFD 1ZNNA 3LHVA 5CZ0A 4N9CA 5KSWA 1HO1A 2ZRXA 2GQ9A 2WSRA 3N9SA 3THQA 1DQWA 4I9AA 5CZSA 1VQTA 4O53A 3IIXA 4DF2A 3IGXA 3SIZA 3DI0A 2NLIA 3NQCA 2BX7A 3EKLA 2E6YA 1TPVA 4XBSA 3NQ8A 3W85A 4IXHA 1NF7A 1K8YA 3LHWA 1R2SA 4H6KA 3VCRA 5HINA 1VPXA 1KBJA 4MIMA 4LS0A 1LOLA 1VS1A 3T7VA 4A22A 3W23A 2ZRZA 3OEXA 1TJPA 1YDOA 3O16A 1R47A 1UASA 1VHNA 3SR7A 3WJZA 4Z1AA 3QQ0A 2A85A 4FXRA 2QCMA 5FEWA 1T99A 2KZHA 4YL2A 1VCFA 3GDRA 3Q94A 1ME9A 3BLFA 2X1SA 5ABTA 3N19B 5I3KA 5D2VA 3K30A 2RH9A 3QSRA 4LUJA 4Z0SA 2TPSA 1XC4A 3ZS4A 3MYOA 2HTMA 4WY0A 4LS2A 2B4GA 1QPQA 2FFCA 4FF7A 4UTJA 3NVTA 4WX2A 1MZHA 3EX3A 5LSMA 4O8RA 4IOTA 2Z0IA 1L6SA 3TFCA 3P74A 3WK1A 1G4PA 1S3HA 1P0NA 1D3GA 4K8HA 3NQMA 4KWWA 4KWVA 4QM1A 4OV4A 4FNUA 1QPNA 5EMUA 1GVRA 3BG9A 3E9AA 4PTNA 4UTWC 2AGKA 3EEGA 4MYXA 3THAA 3BW3A 2NX1A 4UTLA 4IQLA 1SO6A 3DI1A 3S5NA 1K3UA 4WY0B 3PBVA 3O6YX 1O60A 1RQBA 3FS2A 1KFJA 3G24A 5AHIA 4PEKA 1PIIA 3PUEA 3UPWA 3FJLA 1W1ZA 1KTNA 3IIZA 1ME8A 2CZ5A 1HL2A 3GZ3A 1JJKA 1F2JA 1MO0A 3E02A 3R8RA 2A7NA 2FQIA 3MYPA 1H60A 5KZMA 1X1ZA 3C61A 3KVKA 3LHYA 4HIBA 3ZFHA 2JKAA 1S5VA 3F1QA 1J2WA 1T96A 1VCVA 1M7OA 1H50A 1KBIA 4LT9A 1G4TA 1GT8A 1P4CA 1WBJA 4R53A 3M6YA 3O63A 1LBMA 1KM6A 3I7RA 1JQXA 3G1SA 4GJ1A 5U7SA 4QISA 3IIPA 2C3ZA 3NPXA 5G1TA 2FIQA 4MYAA 2NV2A 3S5OA 3UQNA 3LDVA 4AHOA 3FIGA 4JXCA 2X1TA 1CI1A 1K8XA 4CQ8A 1RR2A 3TC7A 1XBXA 3IVSA 1LYXA 3DGRA 4UMCA 1OX6A 2QCHA 2DORA 2UV8G 1LOSA 3FYOA 3GNDA 5F2LA 2ZDRA 1TTPA 1W3TA 1DORA 4JX5A 4X22A 4IX0A 1DL3A 1KV5A 1RPXA 1UBSA 5K9DA 2H8XA 4JTSA 1AK5A 1A5AA 2V5LA 4LU0A 1WX0A 1EWEA 4M6PA 3LRMA 3G0UA 3GXTA 1JQVA 2QDHA 2OZ0A 3GR8A 2EPHA 4MKNA 3R5EA 4LTSA 1MEWA 2QCLA 2TSYA 5DN1A 3FA5A 1TB3A 3NL5A 4LWWA 5GVJA 1PHQA 4CCCA 1DOSA 1JUBA 1GPWA 4TMCA 3EWWA 3OG3A 5LNRA 3GLCA 3DZ1A 1HUVA 4UFIA 3O07A 4NX0A 5AYYA 3DKLA 2Q3OA 1GWJA 3VE9A 4E2BA 5A5WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4IPN B;  3GG0 A;  4KRZ A;  4MWA E;  1XLK A;  2QJG A;  4JIC A;  1BTM A;  4OGZ A;  1SO5 A;  1CX9 A;  1YYA A;  2H9A A;  3G1V A;  4AY7 A;  4F0K A;  1VIW A;  2W79 A;  5JUV A;  1B0I A;  1CXK A;  1Z44 A;  3WQO A;  1XGE A;  4S2C A;  3VD9 A;  1UA3 A;  4CNP A;  4FLS A;  3SEC A;  4K1G A;  5A3H A;  1VLW A;  4B9Z A;  4KEU A;  4YCP A;  3FGC B;  2R8W A;  1CB7 B;  1XSK A;  1Z42 A;  1HL9 A;  2FDM A;  2HRW A;  2G50 A;  2I17 A;  2QYG A;  3DYO A;  2W3Z A;  1MRA A;  4IIS A;  1GQK A;  1ZGD A;  1W2V A;  1GJP A;  3W82 A;  3KCL A;  3NL2 A;  5DML A;  2CBJ A;  5CAH A;  3TQK A;  2PD5 A;  3QV6 A;  1W2P A;  1IT7 A;  3OBK A;  5IFP A;  4PFM A;  3V3W A;  4OHQ A;  1G69 A;  2ISD A;  3VI2 A;  3WMC A;  1JDD A;  3UZW A;  3B9E A;  2JK2 A;  1KA9 F;  4Q8T A;  3KWS A;  3VAB A;  3AS2 A;  3KOX A;  1F3X A;  3MP5 A;  1EF2 A;  1UH4 A;  5BCA A;  5DFA A;  5BZA A;  4FK9 A;  1V08 A;  1D2K A;  2PDU A;  2XPK A;  5EBA A;  4IUG A;  1OX5 A;  4FHA A;  3LEN A;  3L0K A;  4J2P A;  3UET A;  3WUG A;  3WJX A;  1E4M M;  4LNY A;  1SO3 A;  3CO4 A;  1ME7 A; 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