2R91A

Crystal structure of kd(p)ga from t.tenax
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
286
structure length
286
Chain Sequence
MEIVAPVITTFRGGRLDPELFANHVKNITSKGVDVVFVAGTTGLGPALSLQEKMELTDAATSAARRVIVQVASLNADEAIALAKYAESRGAEAVASLPPYYFPRLSERQIAKYFRDLCSAVSIPVFLYNYPAAVGRDVDARAAKELGCIRGVKDTNESLAHTLAYKRYLPQARVYNGSDSLVFASFAVRLDGVVASSANYLPELLAGIRDAVAAGDIERARSLQFLLDEIVESARHIGYAAAVYELVEIFQGYEAGEPRGPVYPLDPEEKAWLRAAVAKAKSQLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Thermoproteus tenax
publication title Crystal structure and stereochemical studies of KD(P)G aldolase from Thermoproteus tenax.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-Keto-3-deoxy-(6-phospho-)gluconate aldolase
total genus 115
structure length 286
sequence length 286
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2007-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2r91A00
3W7DA 4Z1AA 3EKZA 4S2CA 2WQPA 3W88A 3L0GA 2GJNA 3GXPA 4UFKA 2Z6IA 2E77A 3QC3A 1GPWA 1OFPA 3FOKA 1QFEA 3PVFA 1WA3A 3PULA 1G6CA 3M5ZA 3BLEA 5CZ0A 4C1KA 1THFD 1FWTA 1OX4B 4RKAA 3LHZA 2NUYA 1OFQA 3LBMA 2P10A 3WK3A 3W22A 4HSOA 2JGQA 4JTJA 4TX9A 4M5PA 4DBEA 4JTTA 1KLZA 3W2JA 4GC4A 4NJIA 5LGZA 1E51A 1KM5A 2ZRXA 3NM3A 2FPVA 3G3DA 2YYTA 3G1XA 5HJLA 4NJKA 1NEYA 3QH2A 2QCDA 2QKFA 1UCWA 4Y90A 1DQXA 2X2GA 3W75A 3EX2A 4LT9A 4K39A 2VFGA 1EIXA 4UMAA 2C13A 4DPPA 1B4EA 1LRQA 5CPOA 5LSMA 2ZZ7A 4M19A 4O4WA 4JY9A 5DXXA 1LRTA 2Y88A 2XN1A 1UB3A 3O15A 1I2OA 4JGDA 1PE1A 1U83A 2O7SA 2QCGA 1O60A 3I7SA 3GDRA 2IQTA 3GDMA 4N9EA 4POCA 3M1ZA 5U4NA 4JX4A 3RMJA 3TQVA 1W5OA 3NGJA 1OX6A 4NUWA 2ZA3A 2WKJA 4Y8FA 4LV4A 5I3IA 3E96A 4IMCA 4FNUA 1KFBA 1PIIA 3LGEA 3ABOA 3DXIA 4R53A 3BO9A 3TSBA 3W87A 3G8RA 1G7VA 1P1XA 2YW4A 4GUIA 4ZQMA 3W1XA 3LTSA 1KM6A 2Y6ZA 3LLDA 1WBHA 2V0TA 3L5AA 1J2WA 3EX4A 4TIMA 1VYSX 1XXXA 1TYGA 4X22A 4Y96A 3SW6A 3P81A 3HBLA 1YTEA 1LBMA 2GVLA 1F7BA 3W1NA 5TIMA 1F76A 2V5BA 4YMZA 4NX5A 1SFJA 2CWNA 5D04C 2V82A 1P4CA 4NU7A 3TDFA 1W0MA 2NX9A 4FHAA 3FIGA 4BI6A 1XDLA 3G0SA 3HGOA 3LTPA 1OABA 1GG1A 1EP1A 4ZL1A 1OK6A 3F4NA 5LHFA 3W71A 5C55A 5I3GA 3W7KA 5LNSA 2CZFA 3PS7A 3G1AA 1LYXA 2Y89A 3BLFA 3BG5A 4MJZA 4ZMGA 1XCFA 1AL7A 4O14A 2A7PA 3NL5A 3CQ0A 5DELA 2C3ZA 3HPSA 5AOUA 2ZZ2A 1M6JA 3W3OA 2CZEA 2Y62A 3TQ0A 2DORA 4JIQA 3ATZA 3CTLA 1SO3A 3MHFA 2E6FA 3NQVA 3R13A 4NXKA 5AYYA 1YPFA 1ZCOA 3S5NA 3GKFA 1EB3A 1ADOA 3P82A 1TJRA 1SW0A 4MUZA 3W86A 1KFEA 3LCIA 4GNJA 3UD6A 2CLKA 2Y61A 1XKYA 3LHTA 4N02A 4OGZA 3S5OA 2NWSA 1F6KA 1RQHA 4NVTA 3WFAA 3DFTA 1FXPA 4JIPA 1SZNA 3A5FA 1TQXA 3S1WA 3NNTA 3TNOA 1B57A 2RFGA 4UTMA 3B4UA 3C3NA 1V7YA 4CNNA 1GQNA 4X3ZA 1LOQA 4WY0A 4DXVA 4ADTA 3NQFA 5DY3A 1SW7A 1XBZA 5EBUA 1XBXA 1F6PA 4R33A 4FO4A 1ME7A 1G4SA 4MZ1A 3OHIA 4ZQNA 4GUJA 1VH7A 3PBWA 1ME9A 4GE8A 2FB3A 3KVKA 3A9IA 3B8DA 3GNDA 3MHGA 2AQWA 4MLRA 3ZWSA 3UY7A 3N3MA 4N2YA 3W7MA 2LLEA 1H7PA 2NXGA 5HNRA 5D2VA 3KOFA 3TSDA 3P8IA 5CSRA 1KV8A 3MUXA 4N9DA 1TPC1 5CPMA 1TTQA 3DFQA 3QFEA 1WXJA 2QEZA 4A22A 2CFFA 4LVBA 3HJZA 3TKFA 1SSGA 4YWIA 3LOTA 3W9ZA 4FXRA 3KVLA 1DOSA 3HO8A 1K03A 2DZPA 3GVGA 1FUYA 1XC4A 1A50A 3HPZA 1LRNA 3W7IA 5LGXA 4I7VA 3GNNA 3L9CA 4HN4A 5D2YA 1VR6A 4UCGA 2TPSA 4UFHA 4WOQA 1WX0A 3PG9A 3MHUA 5LNRA 3KVJA 3V1PA 1VHNA 5GVJA 3FJ6A 2WSYA 1HG3A 4JTGA 2OX1A 4HNVA 1QAPA 1XUZA 1IIGA 4WY0F 3N19B 3LHYA 1RZMA 5KITA 1R2TA 3TU9A 4XBKA 3HGRA 4XKYB 3EWZA 5K4XA 2GQ8A 4ZQOA 3TAKA 1MO0A 5CPLA 2ZZ3A 5D38A 4IJBA 2E6AA 1DJNA 3KVMA 1W37A 5I3JA 3FKRA 5L6UA 1Q6OA 1N8FA 1BWKA 3LERA 3MBDA 3SR7A 2FB2A 4ADSA 3MP3A 5LNUA 2Q8LA 4HKPA 3W85A 4J9JA 1DVJA 3BV4A 4IMGA 2VFHA 3QSRA 3TJXA 2NV1A 1L2UA 1MZHA 3EXTA 5DCEA 3SZ8A 1B3OA 3IVSA 5KMYA 1KFLA 3A21A 4YCOA 4JTSA 1F73A 3DFNA 2CLHA 5AHMA 3B05A 3TIMA 2RKXA 1U5JA 4XQ6A 2C15A 3PB0A 1H61A 3S6DA 1SO4A 1FDJA 2A4AA 3PBUA 4PTNA 3PBVA 1LCOA 1IXOA 1K8XA 1CW2A 1DV7A 1K7EA 4CQ9A 4N6FA 3W2UA 5AFDA 4UTTC 2Z0IA 3UYCA 3W7LA 5AHNA 1A5AA 1VHCA 3GDLA 1Q6LA 1SO5A 2NXIA 3OVPA 4WOZA 5T26A 4AHQA 4BWLA 4FNSA 3STEA 1TTIA 5C6MA 3IGSA 3W7QA 4QAIA 3C2FA 3HPXA 2NX1A 4LOCA 4M7SA 4QM1A 3G0UA 3L2IA 4FNRA 2RHGA 3NPXA 4QSHA 1GOXA 2E5BA 1J5TA 3IIXA 3PUOA 1Q6QA 3W2KA 3QEZA 3SECA 4B5NA 5FESA 1KM1A 1PS9A 3NPUA 1KFKA 3O63A 1VRDA 3NQMA 4LS2A 2E5CA 5HR7A 4CNPA 2Y63A 4ZQPA 1YXYA 1JUEA 2JKPA 4MLJA 1TB3A 1T0OA 4A21A 4C1LA 1H7WA 1X1ZA 3INPA 1NAL1 1VZWA 3LCWA 1G4EA 2PRLA 5AHIA 4YLWA 1RQBA 1NVMA 3C52A 4UTWA 2TYSA 1ONRA 7TIMA 2VEMA 5CPNA 4NT0A 5KZMA 3QSTA 1QPNA 1W3NA 3ABSA 1JQVA 3A5VA 2DZUA 3DFSA 2XFWA 3PSVA 4AHPA 3MO7A 1GZGA 1YLVA 4IMEA 1S3HA 4LRTA 4RLIA 1GVOA 4X9SA 4QITA 3OEXA 4HNTA 2X1TA 4S2BA 3GR8A 4L4MA 3NM1A 3UZ5A 5I3KA 5J5DA 3NO5A 3TC7A 1W54A 3SIZA 4K6AA 2A7NA 1SU5A 3FS2A 4O17A 1SO6A 5DY2A 1VQTA 2Z6JA 4MZYA 2QCLA 3QF0A 3B04A 2YYUA 4UFIA 3LHVA 3W7PA 4EOUA 4M6QA 3JS3A 4NX0A 5G2IA 3K30A 2QJHA 3T78A 1OK4A 3EX6A 1F2JA 5BW6A 3GAKA 3JR2A 4YXGA 3PR2A 1O5XA 1UBSA 1TO3A 3LX9A 3NQAA 3WJSA 3QM3A 5DCDA 3W1MA 1G4TA 3H54A 4OT7A 2R14A 3W2NA 5HWMA 3UPBA 3L0NA 3CIXA 2BSLA 4BI5A 3B06A 4WQ6A 3E12A 2HS6A 2ABAA 3UY8A 2BX7A 4Z08A 3STFA 4RZ4A 3MI2A 3JRKA 3F03K 1ZAIA 1FCBA 5G4WA 1ZY9A 3CB8A 1BTMA 2C19A 2GPTA 3T55A 3W7JA 2QR6A 3UXAA 4TO8A 5HR6A 1TQJA 3T7VA 5U7SA 1M7OA 3WJZA 3VI2A 2X1UA 5KZDA 4NNBA 3NQEA 4GWEA 3THAA 2E6YA 2HSAA 4OE7A 1KBIA 3CPRA 3UZJA 5CSSA 2C6QA 2Y85A 3QMSA 5L9FA 1HUVA 1KM3A 1YTDA 3Q94A 1SZEA 3U2OA 2NUWA 1TRIA 5F4WA 1MEIA 4KWVA 4HNNA 1WAUA 4UNLA 1H7RA 3N73A 3P67A 3IRDA 2QUUA 3NAVA 4O0ZA 3GAYA 2RDWA 4RR4A 5CZSA 3E9AA 1KTNA 1AK5A 1SFLA 3UWWA 3VFLA 3S8HA 2KZHA 1R47A 3Q37A 1NSJA 3W6YA 1SZGA 4IOTA 3KHJA 1YDOA 3R2GA 4YL2A 1YDVA 2V2CA 2G5WA 3BW2A 4K7YA 4A2SA 3L21A 2ISSA 4WXZA 1K8YA 5F4SA 4N4QA 1ZJIA 4UTUA 1JCMP 3P84A 4UIOA 2V2DA 3O05A 3P5YA 4LV9A 3TH6A 3O6DA 1HO4A 3DI1A 5FEWA 2YDAA 3W7CA 2X16A 1K7FA 2ZZ4A 3LRLA 1GVSA 3G1SA 1TIMA 4WY0B 2OJPA 4Y9AA 1VC4A 5LZLA 1EP3A 3GYEA 3NQ7A 5DN1A 1X7FA 5DCBA 1RVGA 1OHLA 4O28A 3L0KA 1W1ZA 3CC1A 4MY8A 5CKSA 4A3UA 4NNCA 1H5YA 3GLCA 3EKLA 4Z1CA 3SJ3A 4WZHA 3EWXA 3LHUA 2HMCA 3ANYA 5FEZA 5C5YA 2YW3A 2ZRVA 4LS1A 1BKSA 3M5XA 1K02A 3QMTA 5BOOA 4LTSA 4Q33A 2CLOA 3RNDA 5HMSA 3FJLA 1QOPA 3DH7A 2A1YA 3EXRA 5AC6A 4ADUA 1N7KA 4RCXA 3VCRA 4FIRA 3W1AA 1H1ZA 5K4ZA 4JDYA 1H50A 4AEOA 5LNVA 3W76A 3NQDA 3TROA 3KXQA 1QMLA 3PG8A 1JQXA 3EB2A 2XN2A 3GK0A 1ICPA 2YCEA 5C2XA 2YFNA 3E02A 2PE4A 2B7NA 1ME8A 2QUVA 2E09A 1YTKA 5DBUA 3LXCA 1IXNA 3GX9A 3LDVA 1JULA 3NEVA 4EF9A 1B9BA 2Z2UA 4JTEA 3WJXA 4N9BA 3W83A 2CLLA 2JKAA 3VKJA 2B7QA 5HUPA 4O10A 4Z1DA 3NL3A 3W1QA 2PRMA 1M7PA 3PWAA 2W0UA 2EF9A 4MY9A 3IV3A 3USBA 1GJPA 1Z44A 5SWUA 3EEGA 1PL9A 2QCCA 3M44A 3C61A 2GQ9A 3TX9A 4JICA 1OYBA 5BMWA 6ALDA 5K9CA 4FX6M 2GOUA 1KA9F 4AVFA 4GBUA 2QAPA 4XWUA 4FX7A 4E2DA 1LBLA 3W1RA 4MOZA 1O4UA 3PF3A 1Y0EA 2HS8A 2OT0A 2J9XA 1ZAHA 1VPXA 2GQAA 1WDWA 1C29A 1OYAA 4D2JA 2W6RA 4IGHA 4O54A 1H60A 3P5ZA 1W5MA 4LU0A 4I9AA 3S1UA 1SZFA 1H7XA 3N9RA 2E68A 1SUXA 3H55A 4TMBA 1L6YA 1QOQA 3KFTA 1GYLA 3OVQA 4JTFA 1YXDA 1FDZA 3P61A 3WK2A 3BW4A 2EGZA 3QPYA 2CLIA 2TRSA 4RV8A 1FY6A 2X30A 2OMAA 3VNDA 3PSWA 3HMJG 2A7RA 2E1DA 4IMDA 1LOLA 1EEPA 3RK8A 1GVRA 1MSSA 5FEXA 3L68A 1DL3A 3RLVA 1TPDA 3QQ1A 2VELA 4OV4A 3ZFHA 4DPQA 1TJPA 4ZQCA 5D37A 5D02A 3G24A 4JTUA 3W84A 4GJ1A 4AWUA 5EL1A 5AC8A 2CLMA 1GTHA 2VEKA 2VOMA 1LROA 4E2BA 3OBKA 3ABQA 1OFBA 1OVDA 4LS0A 2Q3OA 3TUUA 3FLUA 5IBXC 4YCPA 4JNMA 3W07A 1CX9A 5BRBA 3LI0A 3SSJA 3ZS4A 2ZA2A 1FCVA 4LW7A 3TSMA 1A5CA 4L4LA 2DU2A 4PCFA 1TPB1 3W73A 3S1VA 1JCLA 2Y7FA 4H4IA 4FNQA 2DJXA 5KSWA 3DGRA 5F2GA 1J4EA 2WV8A 2DZWA 1FWRA 3TC6A 1P0NA 2NLIA 2Y7GA 4GRSA 4LNYA 3FFSA 1P0KA 2NV2A 2RDUA 1A5BA 3BG3A 2TMDA 2NZLA 4ZQRA 4RXGA 1ML1A 3SGZA 2ZZ5A 4JS3A 5H91A 2ZRWA 2VKZG 5FI8A 1HO1A 2WJZA 1C8VA 1ZALA 1L9WA 3BARA 4CLMA 3PY2A 1RQEA 3S9YA 1G67A 2ABBA 3GZ3A 4IX0A 4Z0SA 5D2XA 2VFDA 3G22A 2RDTA 3UWUA 4EIVA 5G1YA 1QPQA 4K7VA 3CIWA 4AXKA 1LLWA 4BI7A 3GIYA 3UWVA 2H90A 2WPBA 3TXVA 1JVNA 3AO0A 2ZRUA 3IGXA 2ATSA 2ZBTA 1VCGA 1W8SA 3VE9A 1GT8A 3TW6A 1D9EA 3M5VA 3IIPA 1QWGA 2X1SA 2A5HA 1OFRA 2GJLA 1S5WA 2J9YA 5LKYA 1TTJA 3O07A 3EX3A 5AHLA 1HTIA 2BTMA 1H1YA 4ML9A 2ZDRA 4TR9A 1LOSA 3FEMA 3W1PA 2GVGA 2ZCGA 5F2LA 2QJIA 1IGSA 4DF1A 3NA8A 3W7HA 4XUGA 3NXFA 5D2TA 4AB4A 3DBPA 4U4MA 1JCNA 4DO6A 5KZEA 1W3TA 4ZVJA 2AAMA 4DEFA 1FQ0A 2V9DA 1K8ZA 3G1FA 3YPIA 3NOEA 2A0NA 3GXNA 3WJYA 5CG7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1PYM A;  1IR1 A;  2WQP A;  3OZM A;  4H04 A;  3L0G A;  4UFK A;  2XUC A;  4C7D A;  1Z32 X;  4M8U A;  1FHV A;  3U3H A;  4ZTX A;  2YCJ A;  2FVL A;  2F8Q A;  1G6C A;  3ZVH B;  5HMF A;  4TXE A;  4W86 A;  3I6T A;  5CZ0 A;  4FS9 A;  1R3Q A;  4AX7 A;  1HP5 A;  4FOK A;  4D6G A;  3RX2 A;  1OFQ A;  3O9N A;  4C6E A;  1W9D M;  2JGQ A;  1KCZ A;  4M5P A;  1LT7 A;  1KLZ A;  2VCA A;  3BIC A;  5BWF A;  4NJI A;  4LBU A;  4O1F A;  3N6J A;  3NM3 A;  2FPV A;  2YYT A;  5HJL A;  4O8A A;  2QCD A;  2QKF A;  1F4A A;  3N6Q A;  1DQX A;  3VA8 A;  8XIM A;  1I6N A;  1P0B A;  4K39 A;  1DJY A;  3KM8 A;  4FR1 A;  1BQG A;  2C13 A;  3OU8 A;  1IT8 A;  4DPP A;  3FX4 A;  2ADA A;  5CPO A;  4GKL A;  4M19 A;  4JY9 A;  1XDJ A;  2D24 A;  2Y88 A;  4UQB A;  4J2M A;  1UB3 A;  3K2G A;  5LIK X;  1U83 A;  1WZM A;  3I7S A;  2WMI A;  1VBR A;  3NGJ A;  1NDW A;  1EBG A;  2WKJ A;  4JEJ A;  1BSI A;  4LV4 A;  4Y8F A;  3XIS A;  2DIJ A;  2V3D A;  4IMC A;  4FNU A;  3LGE A;  4R53 A;  1GVI A;  2DGA A;  3TSB A;  1R3W A;  4K3Z A;  5XIM A;  4PGL A;  3W1X A; 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