2R94 | Genus

Total Genus 111

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	111
sequence length	286
structure length	286
Chain Sequence	MEIVAPVITTFRGGRLDPELFANHVKNITSKGVDVVFVAGTTGLGPALSLQEKMELTDAATSAARRVIVQVASLNADEAIALAKYAESRGAEAVASLPPYYFPRLSERQIAKYFRDLCSAVSIPVFLYNYPAAVGRDVDARAAKELGCIRGVKDTNESLAHTLAYKRYLPQARVYNGSDSLVFASFAVRLDGVVASSANYLPELLAGIRDAVAAGDIERARSLQFLLDEIVESARHIGYAAAVYELVEIFQGYEAGEPRGPVYPLDPEEKAWLRAAVAKAKSQLRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure and stereochemical studies of KD(P)G aldolase from Thermoproteus tenax. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-Keto-3-deoxy-(6-phospho-)gluconate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Thermoproteus tenax
total genus	111
structure length	286
sequence length	286
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date	2007-09-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2r94A00

4AWUA 3UPWA 1JCNA 3IV3A 3PUDA 5EPDA 4FNTA 3I6RA 3FLUA 4FNUA 1EIXA 1GTHA 2J27A 3C8FA 1VS1A 2BZNA 2Y63A 4A2RA 2HS6A 4NXKA 3KHJA 1TPDA 1TMHA 3C2RA 1FCUA 1SZNA 3BPWA 1W3TA 1X7FA 2QDGA 1VCFA 2Y6ZA 3GKFA 5HMSA 2QUUA 1Z48A 5L6UA 1EP2A 4ZZ9A 5SWUA 3LLDA 1LYXA 1ALDA 1P1XA 3E49A 3C56A 1TPH1 1SO3A 3G0SA 3QPZA 4JYEA 2BX7A 1ME8A 3MBFA 4IMGA 3I7QA 3W7DA 3USBA 5LKYA 4Q33A 3DXIA 3QSRA 4J9JA 1X8FA 4HNTA 4Y9AA 3LHVA 1IXPA 4H3DA 1YLVA 1EP3A 4KFNA 4JIPA 3LTPA 1H51A 5IBXA 3HG3A 3I68A 4PODA 4RX0A 3DHDA 3V1PA 2V2HA 1XXXA 1OFBA 3B06A 1G7VA 3NQCA 4GNJA 3FYOA 2PRMA 3W1MA 4PH6A 2PRLA 5F2LA 1VYPX 5AYZA 3W23A 3P8IA 4DO4A 1W0MA 1IIGA 2A7RA 2ZQ0A 5KZMA 5D2TA 1V7YA 1THFD 2NUWA 3M5VA 3GDRA 4JDBA 3E12A 3VNDA 1F73A 3GLCA 4IOTA 4FXRA 3QH2A 3VE7A 3W2UA 3O6YX 5AFDA 3P84A 2H8XA 3NPWA 5ABTA 4AVFA 4KFPA 2JGQA 1FCQA 3IIPA 3H55A 4M7TA 4QITA 5HULA 4GJ1A 3W7KA 3QW4B 3STGA 3TR2A 5HR7A 2WSRA 1TO3A 1RQHA 3P7YA 4O11A 3W1QA 4MFEA 3Q37A 1B4EA 3TU9A 1ICPA 4UTWA 4RR4A 3FEMA 1TPEA 1D3GA 3TW7A 1QWGA 3PSVA 1VH7A 2Z1BA 1VLIA 1TYGA 1A50A 5L9FA 1YXDA 5DELA 3NYZA 5BMWA 3L5LA 1VCGA 3TE9A 4DF2A 4ZQOA 1DQWA 3KRUA 1R2TA 3W2NA 1IF2A 3PG9A 1XM3A 3M5YA 1TCDA 4UC5A 4ML9A 3UZ5A 3KVLA 3O1NA 5G1TA 4O28A 4PC8A 2YX0A 4O10A 1KLZA 3DENA 4UFLA 4WJEA 2Z6JA 1MEIA 3EWZA 4XKYB 4Z08A 3W1LA 4PCFA 1ZY9A 5K9CA 5D30A 5FF4A 3PUEA 1ICSA 1ZAHA 4HNNA 5LZLA 4ZQCA 3TSDA 4WOZA 1OYCA 3LRKA 4D2JA 1OX6A 4XQ6A 3GXTA 3RLVA 5LNRA 1KV8A 2NXIA 2PCQA 4H6KA 2NXGA 1F76A 1W37A 3NEVA 3LRLA 5CSSA 4BWLC 4FXSA 2C15A 2QUTA 4M19A 4O1AA 4PEKA 4Z1DA 3WJSA 3S42A 3WK1A 1YDNA 3TA6A 1JQVA 1TPWA 5G1YA 1G4SA 3O16A 2NUXA 3ANYA 3BG3A 1WBHA 5CPNA 1QFEA 3RFAA 1O5KA 4KKXA 3A5VA 3G0XA 3KVJA 4LVDA 3PR2A 1H61A 3MP5A 2ZZ5A 3IGXA 4Y6GA 1XKYA 1FDYA 3NL2A 1UBSA 2ZZ3A 2DZTA 2ZTKA 3IRDA 3A21A 4LV4A 4QNWA 3JS3A 3AJXA 1VQTA 2OT0A 5GVJA 1W5PA 4JTTA 3UPBA 3N3MA 4M6QA 2E6AA 3L0NA 4MIMA 1OFQA 3GVGA 3TXVA 1LOQA 2ZZ7A 4O12A 3W7PA 3ZWSA 5FESA 3NQMA 2OT1A 3LHWA 1GZGA 1P0NA 4AWSA 3HG4A 2VEKA 3RK8A 2GQ9A 5C6MA 1KM6A 3GZ3A 4MZ8A 1UUMA 4TU1A 4RXGA 1FDJA 1EUNA 2ABBA 3G0UA 1PL9A 2XN0A 3IIVA 4BI7A 2DZPA 4NJGA 2YR1A 2QCDB 3MBDA 3MI6A 2DZVA 3CIWA 4N6EA 4IWWA 4MYAA 4ONVA 2YFOA 4GUIA 1D3HA 1K8ZA 4IJBA 2GOUA 2D73A 3QQ0A 3IEBA 1EX5A 3VI2A 3KVMA 3B05A 3TQKA 2VEMA 1GG0A 1S5TA 2RHGA 1DORA 4UNKA 4AHQA 5AHIA 1Q45A 4JTUA 1KLYA 3CEUA 3E9AA 3U8GA 3N73A 2CFFA 4IUOA 3MI3A 2QDHA 1IIHA 1WOAA 3NL3A 4K8HA 2V9DA 5AN7A 3HQ1A 1OFDA 1VYSX 5AB3A 2PE4A 1NSJA 1OFEA 4LV9A 1FWRA 3CHVA 4N9BA 4X2RA 1AL8A 4YWIA 1X1OA 5DCDA 1RZMA 3LCHA 3PC0A 3LI1A 4A29A 3P62A 3WK2A 3S1WA 4XUGA 1H7NA 3ABRA 5EMUA 1TJRA 3MYPA 3DFQA 2Y88A 1UASA 3NAVA 1HG3A 3UD6A 3O6DA 3MP4A 5E93A 1WOBA 1JCLA 4FB7A 4MPQA 4BWLA 1S3HA 1LDCA 4ORIA 2B7PA 4N9EA 3MYOA 1K3UA 1OFPA 1SZEA 4TIMA 4O53A 3P61A 1H50A 2FFCA 1B4KA 3LV6A 3T40A 3L65A 3W2JA 4GXMA 4A3UA 4I9AA 4LRTA 3UZJA 1HTIA 4UFHA 5C5YA 3T7VA 3NVTA 5AHEA 3TQVA 1KFLA 4DPQA 4MYXA 4N2YA 3RU6A 4LS2A 1UJPA 5KZEA 3D0CA 2H6RA 1WBJA 1RR2A 3S5OA 2I1OA 2QEZA 3QF0A 4RXFA 4HT3A 1GQNA 2GQAA 1JR1A 2E6FA 3U6WA 1UCWA 1K7FA 1KBIA 1RPXA 1N55A 3HIJA 3LCLA 4FHAA 5U4NA 1HL2A 2E1DA 4ADTA 1Q6QA 3Q94A 3W7JA 2E5DA 2PRHA 5BRBA 1JQXA 5AC8A 4JTLA 3T55A 2X30A 3BW4A 5DY2A 4JX4A 5EYWA 1JULA 4DO6A 3G1FA 4FO4A 3ZR4A 4ADSA 4K7VA 3WJWA 5D04C 4H4IA 4CNPA 3TJLA 1HUVA 3GAKA 1C8VA 1AW5A 3C2VA 3TMLA 3W74A 5D33A 2O7SA 2B7OA 3UWUA 2GUUA 3TFXA 3W84A 1TV8A 3M43A 1KA9F 4MZYA 1R46A 5D2XA 4JIQA 5LNSA 4LC8A 1GEQA 2H8ZA 2CLIA 2P0OA 3NQ2A 4N4QA 4FIQA 3TC6A 3S6DA 3TAOA 1OG0A 4NXSA 5AHLA 2TYSA 1LBMA 1SR9A 3B0PA 1OK6A 5AC6A 3C52A 3L66A 3R89A 3W6YA 2DP3A 4IPIA 1Q6RA 4ADUA 1G4EA 3BLEA 2FB3A 1QO2A 2VKZG 1CW2A 3NM3A 1KTBA 2X2GA 5CPOA 1NFBA 1TTPA 3SGZA 3PM6A 4HN4A 4Q32A 5TIMA 3LV5A 4JTGA 2CZEA 3PBVA 3WJZA 3B0UX 5CZ0A 3LXCA 3OVRA 4DPPA 1OF8A 4CQ8A 1ZAIA 1ADOA 1QMLA 2NLIA 1L6WA 4AHPA 2V5BA 2HTMA 4JNMA 1LRNA 1SO5A 4JTSA 5FEPA 3M9YA 4OHQA 3KRSA 1LBLA 3M5XA 4O1BA 1IGSA 4NZJA 3A22A 4E38A 1OHLA 2OX1A 3PAJA 4JTKA 1LP6A 1TSIA 2AQWA 1TV5A 5G2WA 4LWWA 3P5ZA 3HGOA 1YDVA 1TRIA 1KM5A 3MHFA 1U5JA 4X22A 5AYXA 5K4XA 3HF3A 3NQ8A 5DY3A 3C4UA 1VHNA 4EIVA 5J5RA 3LI0A 4YXGA 4HNVA 2ZBTA 5D03A 1HFBA 4MY9A 2V2DA 1QNVA 4IPJA 2YGYA 3EWWA 1XFBA 1G4PA 1F05A 3DGRA 4I7VA 4UNLA 3GDMA 4FEZA 3SFKA 1O5XA 2DZUA 3CLMA 3IIOA 4MOZA 1ZJIA 3ZWTA 1EWEA 5F4WA 3IGSA 1PCWA 2J88A 4OU1A 4Z0JA 4UTWC 2WNNA 3ELFA 1I8JA 4NNAA 1F5ZA 5HR6A 3P67A 4RJEA 4BF9A 4MLJA 2XFWA 2I14A 3HGJA 4WXYA 2B7NA 4LNYA 5I3GA 2EF9A 4UR8A 4WD0A 3ZS4A 3LB0A 2CZ5A 3OEXA 1KM4A 2GJLA 3BVJA 1SO4A 5DXXA 1JUEA 4N6FA 2ATSA 3OVPA 1Q6LA 1A53A 1B3OA 1MO0A 1TPUA 1YADA 2CLKA 2JKAA 2EAWA 3O63A 4BR1A 1N8FA 1I4NA 4WZHA 1VHCA 4JTHA 3BV4A 2QCLA 3BW3A 3S1XA 3W3OA 1F7BA 3QYQA 4UCGA 3INPA 2CZFA 3GB6A 1D9EA 3HB9A 3NPUA 4AF0A 3M44A 4FIRA 4JX5A 3IVSA 2C13A 4A22A 1I45A 5TBOA 3CWNA 2QCCA 3B4UA 1GVQA 2A6LA 1ML1A 1H7OA 1H7WA 1XL9A 3W7EA 3FJLA 4IXHA 3FKKA 4OE7A 3EXSA 3G1VA 2JK2A 5DLCA 4CQAA 2V2CA 1QR7A 1K8YA 3A23A 3CM4A 1YXCA 1SZFA 3DHFA 4A21A 1TPB1 3OA3A 4P2VA 4LTSA 3NQVA 5CPMA 1T8XA 4AMAA 4N9CA 2GVJA 4JXCA 3UXDA 3LXBA 1GPWA 3W9ZA 4PTNA 5G5IA 5FEWA 1AK5A 4WOQA 2DU2A 1QOQA 3O07A 2OCZA 4IGHA 1N7KA 3L0KA 4Y8FA 2DZXA 4WY0A 3LCWA 2ZTJA 1FXPA 1XBZA 2AGKA 3MJYA 1ZHAA 4GUFA 2Y85A 2QR6A 3TXZA 4O19A 5F2GA 5BNKA 1ZCOA 5LGZA 4S2BA 2H3BA 5G4EA 2J24A 3W72A 1NEYA 3IIZA 4GFSA 3G3DA 3HPXA 4UUIA 4ZMGA 1QAPA 3SGUA 1KM1A 4A2SA 2B4GA 5EBUA 2ZRZA 1VJIA 3LXAA 3NL6A 1NF7A 2C16A 2EKCA 2FB2A 4HPXA 1BWKA 2RFGA 1TQJA 3S1UA 5F4XA 4LC6A 1YPIA 4RCXA 4JICA 1RD5A 3P80A 2QCMA 2VEPA 1Q6OA 4TMBA 3O8AA 4GUJA 3NR0A 5H91A 3BARA 5CG7A 1KW1A 5BMXA 5D2WA 3S0CA 1QPRA 2QCNA 1LRTA 4RZ5A 4R34A 2X1SA 3ATZA 1SQ7A 3PBYA 4M6VA 1SSGA 4ZVJA 1NVMA 3MHUA 1WDWA 1SW7A 4JDYA 4N4PA 3DFSA 2V8ZA 4NQ1A 4HNUA 3G22A 2ISWA 3HG2A 3TUUA 4UMCA 2CWNA 1VC4A 4QQ3A 5LGXA 3NQFA 4AXKA 4O8RA 4TX9A 3TJXA 4X9SA 4XBKA 2C0AA 1O4UA 4LUJA 3MUXA 5HQEA 5LNUA 2OMAA 2YZRA 2WSQA 1DHPA 5LHEA 4OBTA 3W86A 3QMSA 3SJ3A 3A5FA 2BLEA 5F4SA 1W1ZA 4S1FA 3QPYA 3LHTA 3P8JA 1I2OA 4B5NA 3TV8A 2A6NA 4O15A 1QPNA 1XCFA 3UY7A 4FNQA 3LBMA 3W1PA 1H63A 2E5CA 4LVGA 3NQEA 4DF0A 1FWNA 2VFIA 4HPJA 1KFBA 1NAL1 5KINA 4KWWA 1SUXA 2R91A 3R13A 4DXVA 3L21A 1W31A 4M7SA 2CZDA 3C2FA 2UV8G 1G69A 3DI1A 3W7CA 2A1YA 3OBKA 4MFDA 2QF7A 1F74A 3S5NA 3M5ZA 4K39A 4JR5A 4N9DA 4O18A 4ZQNA 1ZAJA 3GXNA 3L2IA 1DOSA 5D38A 1KM2A 4GUGA 3NA8A 4UFJA 3EX4A 3CC1A 4NJKA 1SFJA 3W7QA 1G6CA 3S5YA 2Z6IA 3HMJG 3WJXA 5A5WA 1F6PA 1KFCA 5FI8A 1DKWA 1ICQA 4MJZA 3G8EA 2CLHA 4GBUA 4HSOA 1DBTA 3BLFA 4GUHA 4JTJA 4DEFA 2QJHA 2YW3A 1KBJA 2YCEA 2V82A 2X1TA 1SFLA 4NVTA 4FNPA 4UTIA 1J4EA 5FEXA 1F6KA 4WX2A 3PSWA 2C3ZA 1KFEA 2Y7GA 3H53A 3ZFHA 2B7QA 3VCRA 4JYDA 3CTLA 3FA5A 1B9BA 1SO6A 3NXFA 5D32A 1J2WA 2P10A 4UTJA 4RKAA 5CKSA 3TW6A 3LOTA 3PS7A 2BWGA 3KRZA 1W5NA 4LT9A 3NQAA 5D09A 2ZZ6A 3EKZA 3STEA 2E09A 1L6SA 3GKAA 5KZDA 3WJYA 2WJZA 2NX1A 3G18A 4UMAA 3W73A 4CCDA 3DKLA 4YCPA 1JUBA 2ZRVA 4IMCA 2C18A 3SIZA 1IXQA 4TO8A 1GVSA 4O17A 3CQ0A 2JGYA 8TIMA 4HIBA 1JRBA 3N9RA 1X6UA 1UUOA 3IGUA 4P61A 1VYRA 2XN2A 4LRSA 3G8RA 2VOMA 2A7NA 1AMKA 3W76A 1RVGA 3EKLA 4LUIA 2Q8LA 4CCCA 2TPSA 4LVBA 2G96A 3IVUA 3GK0A 4I7UA 2NX9A 3GR7A 1O94A 5D2VA 2NXHA 4I7WA 3DBPA 1R30A 1XDLA 3W1RA 4RLIA 1JCXA 3QRHA 2Y7DA 1GJPA 3ABOA 4QIUA 1OJXA 3G1HA 1TPC1 2WKJA 4IMFA 4C1LA 1OX5A 3K30A 2ZYFA 2J9YA 1YXYA 2YYUA 4JS3A 5FF7A 1GVOA 4AF0B 4QISA 2QAPA 1RV8A 2JKPA 1YTKA 3W7HA 1RQBA 4O0KA 4CCEA 2ZRWA 3TX9A 4YCOA 3LHYA 3OHIA 3OVQA 5U7SA 3SECA 1W54A 2Z2UA 4AWTA 4NT0A 3G1SA 2VEIA 3PBUA 3R2GA 2VFHA 1OVDA 3RF9A 3TC7A 3ABSA 3PB2A 2FJKA 3BLIA 3E96A 1EA0A 2V0TA 4YMZA 2I9EA 1OX4A 3V75A 1QCWA 1DJNA 1WXJA 3NOEA 4JY8A 1TQXA 5FF3A 3W1XA 3G1YA 3TFCA 3BGGA 5C54A 4OGZA 3L68A 5F2MA 3CB8A 3O15A 2NUYA 1K7XA 2H90A 1Y0EA 4CNNA 4WY0B 1SU5A 3MI2A 1ONRA 3KX6A 2FIQA 4NJHA 3TQ0A 4ALDA 1I2PA 3QW3A 5HINA 3G1DA 3BK0A 2KZHA 1MEWA 3W7OA 1ZENA 2EGZA 1LORA 2ISSA 3TH6A 4XTIA 4AAJA 1FWWA 5CSRA 3QJAA 4U4MA 2Y7EA 1EPXA 3UY8A 2A2IA 3F4NA 4CNOA 3SZ8A 3EXTA 3M6YA 1GG1A 1H62A 1VLWA 3W1UA 4UTTC 3UWWA 2J6XA 1RQEA 2W0UA 4POCA 3FJ6A 2RH9A 2YYTA 3UQNA 1LZOA 2F7FA 3N14A 2ZRUA 1TTIA 1LM1A 4OT7A 1LBFA 1K8XA 3W2LA 1M5WA 3PULA 3GX9A 4YLWA 3GXPA 4IMDA 5KITA 4O13A 2HS8A 2QKFA 3W7IA 4TMCA 5K9XA 1VRDA 4NJJA 3L9CA 3EXRA 5AOUA 5CGQA 3I7SA 3HBLA 4E2DA 4FNSA 1AW2A 2GQ8A 2H3DA 4O4VA 1JUKA 2X16A 1XBYA 3E0IA 3DI0A 2W79A 1DVJA 3HGSA 2XN1A 4FF7A 3P74A 2G97A 3M7WA 2NWRA 3G24A 4K6AA 3C2OA 4CQ9A 3BW2A 3IVTA 3MO7A 4XWUA 1LROA 4O54A 3LBCA 1XI3A 1FBAA 3L5MA 5EL1A 3JRKA 3W7LA 1PHWA 3THAA 2CU0A 2FDSA 4OV9A 2G95A 2YPIA 2ATMA 3W07A 1XDMA 1Q3NA 1H1YA 2VENA 4EVZA 4RV8A 3VKJA 2ZRYA 4UTKA 1WYIA 3G3MA 3U2OA 4OQVA 3H54A 1V5XA 5I3FA 2Y70A 3FKRA 1VCVA 4QM1A 2PURA 2ABAA 3S5ZA 5KTLA 5FF2A 3DZ1A 3BO9A 5G4WA 1LTDA 5HWJA 1E51A 1L6YA 4XBSA 1BEUA 1GWJA 1Z44A 4ZL1A 4U28A 1JVNA 4O50A 4MUZA 4ZQMA 4UTLA 2FQIA 5HJLA 2WSYA 3KOFA 2VFGA 1SW0A 3C61A 3MW7A 1BTMA 2DJLA 4BK9A 3GYEA 1U83A 3P82A 3LGEA 1JJKA 3L0GA 1FDZA 1JCYA 2CLMA 3EWXA 2FPVA 3EB2A 5CPLA 4DO5A 3FS2A 2VFDA 5A8GA 2GPTA 1PE1A 4Q4KA 1YTDA 4JGDA 4AEOA 2X1UA 3DFPA 3MWAA 5DCEA 5K9DA 2JBMA 4IMEA 4K38A 4UTTA 4YL2A 5G2HA 1OK4A 4O1DA 4S2CA 1CI1A 1VPXA 3PB0A 4UFKA 2ZFAA 3EX1A 5AYYA 1W5QA 2VC6A 3M16A 3QSTA 4DBEA 4MLRA 1GVRA 5IM51 1CX9A 5AC7A 4AHOA 1L9WA 4GRSA 4M5PA 5D05A 3UXAA 1XC4A 4RZ4A 5LNVA 5T26A 2VXNA 5I3HA 3N2XA 2AAMA 2ZA1A 3BG9A 3LDVA 1OFRA 4NU7A 2JKEA 3A9IA 5CZJA 1QO5A 4PL1A 3KVKA 4BFAA 1DL3A 2LLEA 2V81A 2ZRXA 3LTSA 2YW4A 2Q3OA 4IQLA 1GYNA 2E5BA 2CLFA 4K36A 3BGJA 5D37A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2R94A

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