2R94A

Crystal structure of kd(p)ga from t.tenax
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
286
structure length
286
Chain Sequence
MEIVAPVITTFRGGRLDPELFANHVKNITSKGVDVVFVAGTTGLGPALSLQEKMELTDAATSAARRVIVQVASLNADEAIALAKYAESRGAEAVASLPPYYFPRLSERQIAKYFRDLCSAVSIPVFLYNYPAAVGRDVDARAAKELGCIRGVKDTNESLAHTLAYKRYLPQARVYNGSDSLVFASFAVRLDGVVASSANYLPELLAGIRDAVAAGDIERARSLQFLLDEIVESARHIGYAAAVYELVEIFQGYEAGEPRGPVYPLDPEEKAWLRAAVAKAKSQLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure and stereochemical studies of KD(P)G aldolase from Thermoproteus tenax.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-Keto-3-deoxy-(6-phospho-)gluconate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Thermoproteus tenax
total genus 111
structure length 286
sequence length 286
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2007-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2r94A00
2TRSA 3L5AA 2HSAA 4QNEA 3UWVA 3LRLA 2JBMA 3W7DA 1BKSA 1LOLA 3DFQA 4WOQA 1W5QA 3T40A 3MWAA 3W7PA 1O5KA 2PURA 1D9EA 5FI8A 4IXXA 1LDCA 4X9SA 1KTNA 4HPJA 2WOQA 2A2IA 3W2LA 3QPYA 3HB9A 1B4EA 3NQFA 1SR9A 1QOQA 1W5OA 5D38A 2FJKA 4CNPA 7TIMA 3IVTA 1XUZA 3IIPA 1Q45A 3W1UA 5EY5A 1WAUA 1VZWA 4OU1A 3W1NA 4DBDA 4JTUA 4TO8A 4PL1A 5K4XA 3PG9A 3N2XA 3W1RA 1TPWA 4FXRA 1K7XA 4X3ZA 1QMLA 1X6UA 2RHGA 3HGOA 5LNSA 1KV5A 1VHCA 3CTLA 3G24A 3NQEA 1FCBA 3BPWA 2DZXA 2DZUA 4GXMA 3STFA 1ZAIA 1YADA 4O1AA 2NXIA 3EX1A 4UMAA 2ZRYA 2QF7A 4UFKA 3HQ1A 1WQ5A 1GG1A 1J2WA 4M5PA 3TR2A 4L4MA 3S5ZA 3G1XA 2EKCA 2Z1BA 1FCUA 5IM51 2ZRVA 3F4NA 5HUOA 2FPVA 1PVNA 3LCFA 4JTHA 1I2OA 4UTTC 4JD4A 4Q4KA 1KM3A 5KMYA 4AB4A 5FF2A 2X1RA 2ZFAA 3UNDA 2ZRWA 1TRDA 4JYFA 3C2FA 4FXSA 3VE9A 4UTLA 3KVLA 3T55A 3TK7A 1Y0EA 2C0AA 4CQAA 5CPLA 1LBFA 3SR7A 5K3VA 3S1WA 1QOPA 3CC1A 4YXGA 1H1YA 3EKLA 1XCFA 1VJIA 1N55A 5D04C 2DJLA 5DBUA 4OWGA 4A29A 4TMCA 3TH6A 4LT9A 3MHGA 1MEWA 2GQ8A 1VYPX 1SZNA 3KHJA 1TQXA 3A5FA 4H4IA 3MBDA 3R5EA 3W07A 1H7NA 1FCVA 1ME8A 1JJKA 3OVPA 4E0CA 4EOUA 1DVJA 3NA8A 3EXTA 3TMQA 4HHPA 3W1LA 1SZEA 1VQTA 1UCWA 5U7SA 3L5LA 1JCLA 3UQNA 3W7KA 2Z6JA 3LTPA 1SU5A 2B7QA 3TQKA 1G4TA 4DEFA 1RQEA 4QJ1A 1JR1A 1NVMA 3S42A 5CG7A 3L65A 3WJSA 1HTIA 3O16A 1Z42A 4CLMA 1ZJIA 2Y88A 5L6UA 4ZQRA 3M5ZA 3P7YA 3EX3A 4NJKA 3IEBA 3UWUA 1W3TA 2BZNA 2Q8ZA 3DI0A 3DFSA 3LERA 4O10A 1Q6QA 3B05A 3OG3A 1FXQA 3A5VA 3W1AA 1KBJA 5BW6A 2B7OA 1QCWA 5A8GA 1SFJA 3ANYA 3M5VA 5BRBA 3KRZA 5HWJA 3NQGA 2NV1A 2NUXA 4K6AA 1GVRA 4MKNA 1YTKA 2ZZ5A 4MY8A 4KFPA 4K7VA 5FF4A 1RR2A 2Y61A 1KM2A 3JRKA 4O0KA 3A24A 1OFOA 4ADUA 3ABQA 4X2RA 3P8JA 3PSWA 3M1ZA 4N9EA 4O14A 1H7WA 1R47A 4MY9A 4RCXA 3IIOA 1G7UA 1XBYA 3N73A 1OG0A 2I14A 2OCZA 1OVDA 2C16A 3BW3A 5D2VA 1LCOA 3PUOA 4HSNA 3L68A 4PC8A 4PL2A 1PL9A 5D30A 1CX9A 4YMZA 4MLRA 3M44A 1BEUA 5AOUA 1THFD 5K4ZA 2DZSA 3FJ6A 5EMUA 4A21A 3W86A 4JY8A 4DO5A 3NNTA 1IGSA 1QPNA 4ONVA 1IF2A 1H7XA 3WJZA 4DF0A 3UWWA 4WY0F 1Q6RA 2FDSA 3MP3A 1OK6A 4AWTA 4KFNA 1TTIA 2XN1A 2FQIA 3AO0A 4BI5A 2GVLA 3HO8A 2QCDA 2C14A 5DN1A 3TW6A 3AJXA 2WSQA 4MVAA 1LORA 2GJLA 2NZLA 4WY0A 3G0UA 3UD6A 1ZALA 1GOXA 4NX5A 3LM7A 3CIWA 5D03A 4U4MA 5D33A 3FEMA 4IUOA 4R34A 2FLIA 5AC8A 1R46A 1TTJA 3TA6A 2C19A 1XXXA 2TMDA 2YR1A 3O6CA 5CZJA 5AYZA 4MFEA 1GTEA 3CT7A 4NXKA 5D32A 6TIMA 4XBKA 4HNTA 3R89A 1QNVA 1TCDA 1EUNA 1ADOA 2ZCGA 1AG1O 4E2BA 4AAJA 3C4UA 4JTLA 4LY8A 3BG9A 2ZRZA 2V8ZA 4IMGA 2GUUA 2ZDRA 1K3UA 4LS2A 3P8IA 3P5ZA 3EWXA 3P5YA 3W22A 3P82A 5AB3A 2ZTJA 1EA0A 1BWLA 2XN0A 3OA3A 5LHFA 2JKEA 4I9AA 3NXFA 5D2TA 4N9CA 5CPOA 2TSYA 3PUDA 4RK8A 2DJXA 3PB0A 1XDLA 1FWSA 3YPIA 3W7GA 4NUWA 2QCGA 3QFEA 1QPOA 3ZS4A 1MO0A 3W2NA 4FHAA 4QM1A 4EF8A 3G1VA 4MJZA 4ZQCA 3QQ1A 1F2JA 5D37A 4FX6M 5U4NA 3S5OA 1XDMA 3PBVA 1VHNA 2B7PA 2ZZ4A 3H55A 4K36A 5G1TA 3LHWA 2V9DA 3E96A 3B0VC 1HUVA 1I2NA 5AHMA 3W7EA 2ZA3A 3FJLA 2QCNA 5G2WA 5K9XA 5IBXA 1QPRA 3W84A 3VI2A 2GQ9A 3QMTA 3W23A 4GUHA 3N3MA 1H5YA 3W76A 1JQXA 3WK3A 4YCPA 5F2MA 1EB3A 1KBIA 4RXGA 3BW2A 3CEUA 3MW7A 5TIMA 4AVFA 3A21A 3UWQA 1JUBA 3GR8A 1GTHA 3C52A 1TQJA 2Y7DA 1TMHA 4XZ9A 5CSSA 3G1FA 1OFAA 1O94A 3ATYA 2GPTA 4Y6GA 2A85A 2QUTA 3LXCA 1OF8A 1WV2A 4L4LA 1FBAA 2JGYA 5HMSA 1IXPA 2A7RA 3W2UA 3MBFA 3DAQA 3HOJA 1PCKA 3B03A 3BLEA 3GX9A 2YYUA 4O53A 2VOMA 4NT0A 2P0OA 3LRKA 2XN2A 4YL2A 3T78A 1QPQA 3SECA 4I7WA 1AW5A 1OYCA 4MZYA 5C2XA 2NV2A 3EX4A 3SW6A 1D3HA 3TKFA 2DZVA 2BLEA 1M7PA 3QMRA 1GQNA 1SZGA 3BLIA 1WX0A 4A2RA 4QAIA 3M47A 4KWVA 3ZWTA 3W87A 4IMEA 3GLCA 1FWNA 4Z08A 3RF9A 4UMBA 1TO3A 1W1ZA 1J4EA 1GG0A 5EBUA 4JTEA 3ZWSA 3NQ8A 2NXHA 4NQ1A 3DZ1A 4LTSA 4LRTA 1O5XA 3TXVA 1UUMA 1VCGA 1Q3NA 1Z41A 2E68A 1CW2A 2FB3A 2HS8A 3BARA 3NAVA 3C61A 3NOEA 5I3GA 2Q8LA 5I3KA 2W79A 4UTWC 4OE7A 3MMTA 4O8RA 2OX1A 3LLDA 3NL2A 1TPVA 1JUEA 3BG3A 3G8RA 2QCCA 3MJYA 4QQ3A 5GVJA 3LRMA 1ZNNA 3HJZA 1A5SA 4AHOA 1KFLA 4JYEA 3U6WA 3C56A 4N4PA 2Z0IA 4JIQA 3LB0A 4UXDA 2VENA 5F2GA 4PA8A 3IGXA 3QW3A 3M6YA 3MI3A 2GVJA 3EXSA 4UFHA 1FDYA 3MYPA 3KVJA 3P62A 4UNKA 2VFGA 1PHWA 4WY0B 4OBTA 3NPVA 4EIVA 2DZWA 3W72A 3L66A 1L6SA 1I8JA 1P0NA 3WK0A 3ABOA 3KVMA 2PRHA 1X1OA 3W7OA 3LCXA 3VCRA 3S1XA 2E5CA 5FESA 1TREA 2A21A 2C15A 5J5DA 5BOOA 1P4CA 1K8XA 3KRUA 3S5YA 4UC5A 1QO2A 3M5YA 3O6DA 4PTNA 3RU6A 4RLIA 3C8FA 4O17A 1JVNA 4JEQA 2E6AA 3HPZA 3PR2A 3MUXA 2H6RA 5D05A 1AW2A 3GAKA 4RR4A 1CI1A 2F7FA 4BWLA 4GC4A 3HG3A 4HIBA 3EWWA 3W2JA 3KAOA 2W0UA 3PSVA 4GUGA 3IIZA 1BTMA 5A5WA 3STCA 1JCMP 2Y89A 1UBSA 2FIQA 5CGQA 4O50A 4FX7A 3CHVA 3DENA 4JTJA 4UFIA 2ZQ0A 1KA9F 4H6KA 2QJIA 3TMLA 2B4GA 3N9RA 3LHTA 2YYTA 1EX5A 5AHLA 3STGA 3EB2A 1U5JA 5T26A 3UZ5A 4BF9A 4WQ6A 2X16A 5F4WA 3W7CA 1S5TA 2BXVA 5ABTA 3THQA 1GVQA 2PCQA 3EXRA 4O4VA 5H91A 2ZTKA 5G2IA 1GZGA 4M6QA 3I7QA 2AGKA 1K8YA 2VEKA 2A7PA 2J9ZA 2QCLA 2A0NA 4O1DA 5C5YA 2Y6ZA 2Y63A 3I65A 1KM1A 1W56A 4WXZA 4QNWA 5G5IA 3ZFHA 4FNSA 2H8XA 1C8VA 3TAOA 2B7NA 3LCGA 4LW7A 1B57A 3MP4A 2CLEA 1G67A 1ZAJA 1HO1A 2BSLA 1W5MA 4CNOA 1IXNA 2QCHA 3B04A 4IQLA 2A6LA 1JQVA 1R30A 1H61A 4O1CA 3V75A 1LP6A 4WXYA 3E9AA 1H7RA 5LNWA 3BW4A 1J5TA 4O16A 1L6WA 1TYGA 4HT3A 3G0SA 4EF9A 2E1DA 3IRDA 4QISA 3L0GA 2A5HA 4FNTA 5D2XA 3DFOA 1I4NA 5F4XA 5I3IA 3UPWA 4NXSA 1OFRA 5LKYA 2OT1A 2OMAA 4JY9A 2YDAA 4MLJA 1B3OA 3IVSA 4ZMGA 3O05A 4O28A 1PHQA 1OX5A 3CQ0A 3DKLA 3FYOA 5LSMA 3NZRA 1U83A 1G69A 3G3DA 2V82A 1AL8A 1VC4A 4IXHA 3IGUA 2CZ5A 3G0XA 1F74A 1F5ZA 3RLVA 3DFPA 1ONRA 1TV8A 1DHPA 1JCXA 1YYAA 4POCA 4YWIA 3WK1A 3NG3A 4AXKA 5AHNA 1FQ0A 4O0ZA 3CWNA 1K03A 3UZJA 1UUOA 2VXNA 4Y90A 4UFMA 4PODA 1ZHAA 2WQPA 4JGDA 4ZVJA 3LCWA 1NF7A 3C0JA 3GXTA 4N02A 4HNVA 3LXAA 4JR5A 1V5XA 3F4WA 3GYEA 3BV4A 5H2ZA 4FIRA 3W1QA 3BK0A 1Q6LA 2EF9A 5I3HA 3IGSA 1WXJA 1TPDA 3TV8A 1R2TA 3P80A 4JIPA 1OHLA 2X2GA 4UR7A 2ZA2A 4UTTA 4N9BA 1XBVA 1DBTA 4KWWA 5AYYA 3EKZA 4AF0A 5DY3A 1IIHA 3UY7A 5C6MA 1W8SA 2TYSA 1KLYA 3GXNA 2WO5A 4UNLA 2QAPA 2ZZ7A 1W54A 3KXQA 4XKYB 4HN4A 3TUUA 1TPUA 3SI9A 2YFNA 2ZZ2A 3BG5A 4QSHA 4LWWA 2QR6A 3W1TA 2CLKA 2WJZA 1TV5A 1W0MA 4UFLA 3G1SA 3LV6A 4MYAA 3GDMA 4FO4A 1W5PA 2J27A 3G8EA 1G7VA 4FF7A 1ICQA 3S1VA 3TU9A 5AHEA 1G4PA 4GNJA 1WOAA 3I7RA 1MEIA 3GKFA 1O4UA 3LXBA 1DQXA 2H3BA 3NO5A 1EP2A 3T44A 1ICPA 1EEPA 5FEXA 1FWTA 2EGZA 4Y9AA 1AL7A 4AHPA 3TC6A 1W3NA 1VLWA 1H60A 1A5BA 5HJLA 4IOTA 3FFSA 2QDGA 3W7IA 2H8ZA 3NR0A 2DZPA 4IJBA 5F4SA 3LHUA 3OIXA 3A22A 2WNQA 1ZENA 1YPFA 5G2HA 4QIUA 3QH2A 5DCEA 3RFAA 1LOQA 3HGJA 3OVRA 2RFGA 2NUYA 1KM5A 1C29A 2PE4A 3NDOA 1F6PA 2ZZ6A 3Q94A 4NNBA 4JN6A 1SW3A 4GUIA 1DJNA 1TV7A 1FY6A 2BX7A 5F2IA 5FF7A 5HUPA 5K9CA 1NEYA 4LU0A 1H62A 3P74A 1OYAA 1DORA 3QEZA 4QITA 1FUYA 3DFTA 4DELA 3HBLA 2E77A 3S1UA 3HIJA 5IBXC 2FB2A 1A50A 1L9WA 4GUFA 1K8ZA 2Q3RA 2R94A 3UXDA 3EWZA 3EWBX 4DXVA 4O12A 3PVFA 3PF3A 2FPYA 1H7PA 2AAMA 2A7NA 2GJNA 4UTKA 5DLCA 4WD0A 5LNUA 2DZTA 4DF1A 3BLFA 3G1YA 3O07A 2WPBA 3V1PA 2RDUA 1YDOA 4ORMA 4R53A 3PY2A 3W83A 4JICA 1G4EA 4NNCA 3ZR4A 1F6KA 4JX4A 3QQ0A 2YFOA 3NL6A 2CW6A 3UWZA 3CWOX 4MZ1A 2ABBA 4TIMA 2QCEA 1KM0A 4AHQA 5K2ZA 2VFEA 3T7VA 3LLFA 1UJPA 1P0KA 3LBMA 1OX4A 3NL5A 1OJXA 8TIMA 4AWUA 4JXCA 4MUZA 4MIMA 5HWNA 2V2DA 4AEOA 4JTFA 5CZ0A 2UV8G 1S3HA 2QCFA 4DPQA 2V0TA 1WBJA 3CPRA 4M7SA 1WA3A 4Z1BA 3LTSA 4DO6A 4Z1DA 3KRSA 2G96A 3MYOA 3DI1A 3SGZA 1W3IA 3R2GA 1MEHA 3M5XA 2VEIA 1KTBA 3M7WA 3C6CA 2ISSA 5AYXA 1WDWA 4UIOA 3RLUA 2NX3A 2TPSA 4UTHA 5KINA 2RH9A 1LM1A 2E6YA 5TQLA 2C1HA 4JS3A 1PE1A 3LHZA 4IX0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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