2RGLA

Rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
publication title Structural Insights into Rice BGlu1 beta-Glucosidase Oligosaccharide Hydrolysis and Transglycosylation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 196
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2rglA00
2G3MA 3BAIA 5JBFA 1GJWA 3CIVA 4KRUA 1E0XA 1UHVA 3BXWA 3BLPX 1H4PA 4IISA 1EOKA 4W88A 3BAJA 1E15A 3AZRA 5DT5A 3GNOA 1BQCA 2WC3A 3ZO9A 3AMKA 2ZUUA 2D3NA 3WMSA 1JNDA 3I3DA 1QOXA 2XGIA 3EMQA 3EDKA 2ZUSA 4ZENA 1SR0A 5IHSA 3VMPA 3QR3A 2WLYA 1B3WA 4D6HA 1XRVA 1HJWA 4WLCA 3T08A 1KXVA 4QAWA 1V3KA 4EANA 3O9NA 2WMIA 1R86A 3F5LA 1SYTA 4X9YA 2CKSA 3AHXA 4CGTA 3SCSA 1MWOA 2C7FA 1ZJBA 4MNMA 1J0HA 4ATWA 1B31A 4OUEA 4AZ7A 5LA0A 5AYIA 3WEMA 2ZE0A 3BSGA 1CGUA 1KWKA 1DHKA 1DTUA 1U2YA 1XH2A 2C0HA 3CHCA 5HNNA 2OSWA 2DEPA 3SCVA 4R27A 1CNVA 1W9VA 2G3NA 3WD1A 2ZX8A 3VIJA 5HPOA 2PB1A 2XTKA 3PZQA 2YL6A 5HDRA 1QI0A 1GUVA 2GJXA 1ISYA 4WF7A 1GONA 1HX0A 1E72M 1M03A 1OSEA 3BAYA 5JBDA 2YBTA 3K4DA 4URIA 1E6NA 4AYSA 4P8WA 3ZJ8A 4HMDA 3POCA 3WBEA 2AAAA 1K6AA 1TR1A 1V3IA 5DO8A 3WDIA 1V0LA 5I3DA 4AZCB 2OYKA 1FFRA 3NSNA 1JYXA 5A6MA 1GORA 1E6XM 1UWRA 2W91A 3VMOA 3OG2A 3EDFA 1XD0A 1LL6A 4QDMA 3QGVA 1W2PA 4D6DA 4D71A 1AMYA 5LA2A 4FLSA 3AS1A 1CXEA 1H0GA 2UY2A 2VR4A 4XZWA 3EDDA 1ZBKA 1UA3A 2EPMX 3VU2A 2WC4A 4HA3A 5C70A 1E0WA 4PMZA 1AQMA 3VDAA 1UWTA 4JHZA 4NZCA 1C8YA 3W29A 2CEQA 2BVTA 1KR1A 2A3BA 2J7FA 4GIAA 4PCTA 3W81A 2W66A 1GW1A 4P7LA 2PBOA 1OGSA 5A2BA 1E43A 2WW5A 3OZPA 4Z2JA 2D1ZA 4D6JA 1ZJAA 1HJQA 2J75A 4H7VA 1NH6A 1WCGA 3W28A 5A6JA 4UFJA 3WFZA 3WDJA 5CSUA 1I1XA 1WKYA 4BQ2A 5I5RA 4A3YA 3OB8A 3BAKA 5EFFA 2J7HA 4ATLA 4NRSA 3EMCA 1CXKA 3WN6A 3VD4A 3KL5A 1HT6A 5A2AA 1QBBA 1NARA 4LYRA 4L4OA 5C71A 1XH0A 1GHRA 3W25A 2B31A 1MQRA 2XGBA 5I78A 1JZ2A 3VNZA 3U57A 5KZ6A 2XFRA 3AJ7A 5A94A 4CUCA 4MAVA 3LMYA 1VJSA 5CPSA 2OLHA 2VVNA 3U5UA 1CGWA 1JZ4A 1VFUA 1UD5A 4W93A 1HJVA 3WF1A 5I79A 4PTXA 1LLOA 3RJYA 1VRXA 3HN3A 3WD3A 1PX3A 5A8QA 2WMIB 4CU6A 1XSKA 4GO8A 3VTRA 5I2UA 3MV01 3DYMA 4Q22A 2GJPA 3VIOA 1PX4A 1UKQA 2BHZA 1GOIA 3F5JA 1E1FA 3ARZA 1V03A 2ZUNA 4YN5A 1DWGM 5ECUA 3WL1A 3VD3A 2YDRA 5M3WA 4NSBA 5FOOA 2Y2WA 2J74A 4QCEA 1CEOA 4N42A 3MSDA 1TFVA 2VCCA 4D6FA 1ISWA 3SUUA 2XVLA 4TTUA 1HF6A 3K46A 1PZ3A 3EYPA 4UR9A 3WEOA 4CVWA 1QI5A 2XJ7A 3BAWA 2IXUA 1LJYA 3CHEA 1EXPA 5A69A 3TTQA 3ZT7A 3OGSA 1QHOA 1GQLA 1GCYA 2O9TA 1CWYA 1H11A 5A95A 2Y5EA 1BF2A 3CH9A 1UD2A 3E1F1 4GI6A 4B3KA 1WZAA 3BH4A 2YLAA 4MB4A 1UD6A 4B9ZA 4AIUA 1BAGA 2DT3A 3PN8A 4AZBA 1J0YA 2JF7A 3MANA 4U31A 4UQ9A 1J01A 5E0FA 1R85A 2WHKA 3RILA 1KQZA 1M53A 2VZOA 2W63A 1B3ZA 2PBGA 4E2OA 1S46A 3ZJKA 2DSWA 2V3GA 2BS9A 1BYCA 1HN1A 2VNCA 3KL3A 5AYBA 4GZJA 3MUY1 4AIEA 4IM4A 3PHAA 4MTVA 1G1YA 3A3HA 1IZKA 1JZ5A 1H41A 5FIPA 2HVMA 4PUDA 4TUFA 3FW6A 2GFTA 1QNQA 5D9PA 1WDPA 4D6GA 1JG9A 5D8ZA 2A3HA 1W9UA 5ABGA 3M6DA 1GNXA 1XYZA 3FAWA 1EA9C 1FP9A 4PMXA 1J18A 3AROA 3IANA 2YA2A 1ODUA 1UR2A 5I24A 3MV11 4JCMA 4UNIA 1WZKA 3ZJ7A 1E4NA 3BMVA 2BHYA 4H8VA 4BQ4A 3VO0A 3ZJ6A 3UCQA 1XSJA 3IAQA 1C8XA 1GOOA 1GPFA 1WPCA 5GNZA 1JYVA 4WKAA 2QMJA 4XZBA 5I0DA 1E6SM 4HOWA 3W26A 2GDVA 4M8UA 4MNLA 1OINA 3RM9A 2F8QA 1Q6FA 4BZYA 3WNPA 1BYAA 1M7XA 3AICA 1C92A 1UH4A 2IUZA 3VIMA 1EIBA 1KBKA 1M01A 1WDRA 2CNCA 1PPIA 2WHLA 1ISXA 2PI6A 4YPJA 2XVGA 1LL4A 4PTMA 3WH8A 4EKJA 4PSPA 2WCGA 1E4IA 3FNDA 2DIEA 1PIFA 4TVUA 1O6IA 1EDGA 1EO7A 1FFQA 4HP5A 4A4AA 4BF7A 2EPLX 3OGVA 2E9LA 4GXPA 3WDQA 1E40A 4LXFA 4MJ4A 2DDXA 4TTGA 1JAEA 1Q6GA 2CKRA 1OWQA 1K9TA 1CGVA 2BY0A 2FH8A 1W9DM 2W67A 2EPKX 4ZFMA 4HU8A 3APGA 1NOFA 4B16A 2DSVA 1RP9A 4ACZA 4V27A 1UKOA 1V6WA 2YBUA 4GQQA 4XUYA 1NOWA 3LPFA 3KZSA 2QPUA 3THCA 1QI4A 3KE0A 1UR0A 1VENA 2IXVA 2PC8A 3LPPA 3W37A 2OSXA 1E6QM 4JKMA 4GI9A 3A4XA 1M04A 3U5YA 2CERA 3B8SA 4MADA 3AIEA 3NYDA 5I6SA 4J27A 1I75A 5E0CA 3M07A 5A6BD 3OBAA 1XC6A 1E5NA 4AZIA 2XFFA 1KXHA 3T2OA 2CPUA 1PJ9A 1TUXA 3IK2A 4QCFA 3ZSTA 3MO4A 2WM0A 1UKTA 2E0PA 3VX1A 6CGTA 3PTMA 4PBGA 4D72A 2WYSA 2DH2A 2JALA 4JAWA 4TX8A 2FHCA 1OCQA 3SURA 2AOSA 2XVKA 2FHBA 5D8WA 1D2KA 3EDEA 2W61A 1US3A 1UWQA 1V0NA 4AD4A 4PMRA 1MW2A 4V28A 3UR7A 2WVUA 1MQQA 3IJ7A 1VFMA 1VEPA 3L4TA 4W84A 3T0DA 2Z1SA 4MDOA 4AISA 2UY5A 1BPLB 1UH2A 1EHNA 3L4UA 1TE1A 1UWUA 1UG6A 1X6NA 4BQ5A 3SCOA 3AMCA 4W89A 3WMBA 3WNKA 4FF5A 4TVCA 4AZGA 3CBWA 4PTVA 3UETA 3WDPP 2DIJA 3AFBA 4Z2KA 2D23A 1LWJA 1E3XA 1C91A 1TZ7A 1B90A 8A3HA 1ZBVA 3II1A 1XV8A 3OGRA 5DT7A 1MVYA 2CXGA 2J7BA 2VMFA 1LWHA 2WVTA 1HKIA 4BS0A 4CVUA 3TONA 3VINA 1UKSA 3TA9A 4W5ZA 2BY2A 2XVPA 4C7FA 6TAAA 1OGBA 1CPUA 1E71M 3ZOAA 3N04A 4QP0A 4BQ3A 1G01A 4JHOA 4HU0A 1OM0A 2BVYA 3THDA 3AMDA 1V02A 2J47A 2WMJA 2FGLA 3AXXA 2XPKA 5JBEA 1B30A 4OZOA 1KCLA 2VZSA 3S2CA 1NWRA 4Q7NA 3T2QA 5GPRA 3QOKA 3PZOA 5CJ5A 1BLIA 1Q6DA 3ZT5A 1KXTA 1BSIA 5GQBA 2VQTA 4UFLA 2GK1A 4D6EA 6A3HA 2ZWYA 3CUHA 3FXYA 3SUTA 5CGMA 4W5UA 4ACZB 1MYRA 2WVSA 3VIKA 2DT1A 2CETA 1PAMA 1UKPA 2J62A 2ZUTA 1DP0A 4PMNA 4N0RA 3L4YA 4WKHA 3VD9A 1ISZA 1GQKA 2QMKA 1E56A 3FHQA 4CD7A 4R5EA 1ZS2A 3GM8A 4JKLA 3M46A 1UUQA 4AWEA 3N18A 3MUZ1 3OLIA 4M24A 1FOBA 3RM8A 2YL8A 4AXNA 1RPKA 4MDPA 4E8CA 4CD5A 1UD8A 3VVGA 1TMQA 3HJEA 1OB0A 4YHGA 1E3ZA 2YDSA 1HKJA 1UQYA 3QHNA 3AHZA 2CBVA 4IUGA 5JUVA 1MW1A 3O6AA 1UOKA 5FL0A 2J7CA 1CZ1A 5E09A 2VUYA 1CGYA 3D5HA 1JDAA 1ITCA 3AIVA 3L2LA 4AZ5A 1C7TA 2FDMA 2ZIDA 3N12A 1GOKA 3VMNA 2DSKA 1D3CA 4V2XA 3WUEA 2WMFA 3BCFA 3K8LA 2WHMA 4PMDA 4AIOA 1R87A 3A4WA 4F9JA 1NWUA 4K68A 3AS3A 3WUFA 1BGAA 2D24A 3NJ3A 4J3XA 3K1DA 3CPUA 2FGZA 1ZU8A 9CGTA 2VZVA 1KFWA 2BFGA 3SCPA 5DFAA 3WQ6A 1V02E 4NRRA 2D3LA 4ACYA 1BVNP 5CG0A 1OIFA 2W5FA 4BA0A 3VNYA 1W9BM 4DWSD 3BAXA 4XB3A 3AHTA 4DM2A 1Q6EA 4MJ2A 4E8DA 3ALGA 3VOCA 1HKKA 1UR4A 5BYWA 4WKFA 3O2LA 3GYCA 4CD8A 2FH6A 4CD4A 3AIWA 3VIFA 3ARQA 5LA1A 3OA5A 4HOZA 4P7RA 2VZTA 1WDQA 4RE4A 1CECA 1XCXA 1C90A 2AMGA 1JFHA 3WUBA 2E8ZA 1AQ0A 5IXEA 4QLJA 4TXEA 3AHVA 1HP4A 5CSYA 1GHSA 2CHNA 5BCAA 4S3KA 4J28A 1E0VA 1YQ2A 3UG4A 3W82A 2PF0A 5LYRA 1BGGA 2XIIA 3CMJA 1C3FA 4Z2GA 4LQ1A 2G4FA 4F9DA 4AD3A 1DWAM 1DWFM 4HMCA 1ODZA 1GQJA 3CZLA 5ABEA 1VEOA 1HIZA 4P8UA 5A3HA 1VEMA 3N1AA 4KRTA 3ZSSA 4JFUA 3DECA 2GK1B 2WZIA 5M17A 3WENA 2Y8VA 4XX6A 4QLKA 4ML4A 3AHYA 5I77A 4ZE5A 3EMZA 2OSYA 1JGIA 1B2YA 2E9MA 1OD8A 3ZIZA 2DSUA 3L4WA 3K4AA 1HXJA 4Y7EA 2XM2A 3FHAA 3KEHA 5HPCA 3VGBA 3WF0A 4IPLA 1QHPA 4F79A 3GXDA 2EEXA 1QNOA 4KGLA 1W3JA 4AD5A 4MNKA 2DQXA 4XV0A 3BLKA 2UWFA 3F5KA 1ISVA 1E4MM 3AS0A 4ATDA 2XSBA 2OYLA 1V3JA 2D20A 4PMUA 3N15A 3NUKA 2WWDA 3WMCA 2G41A 3CUJA 3RIKA 1UR1A 2F61A 1OT2A 2WSPA 1JZ3A 1BVZA 3GH4A 3PTKA 1A3HA 2EO7A 1PEZA 3GZAA 5AC5A 1VIWA 4CU7A 1V6XA 3WH9A 1ZBWA 3T0BA 1V6UA 3QHOA 3WQ4A 1HJXA 3W27A 1B0IA 5BROA 3K8MA 1VB9A 3CZ8A 4HMEA 3N13A 3WH6A 4P7OA 1LQ0A 2DT2A 3CZGA 3BGAA 3WQVA 5JIPA 4QFUA 1IZJA 2ZX7A 1NP0A 1WE5A 1QNSA 4W85A 1DEDA 2X09A 1OBAA 4P8VA 1JDCA 3CUGA 4HTYA 1UYQA 1BTCA 4ZEPA 4PYSA 5EFDA 3N17A 1EOMA 3QHMA 5E6YA 4OIFA 5A8NA 3PZ9A 3IJ9A 1JAKA 5A1AA 1W9PA 1CBGA 4GO9A 2WVVA 4WIWA 1WB0A 4FK9A 3TOPA 4C7DA 1UD3A 4PMQA 4TX6A 2WZEA 5BXPA 1MXDA 2G3JA 2NT0A 2CBIA 2D0HA 1V08A 2A3CA 2WB5A 4C7GA 1W1VA 1V3HA 3VGFA 3W24A 3CHDA 1BYBA 3DHPA 1JD7A 4WJXA 2CBUA 2JIWA 1XCWA 1JZ8A 3MUAA 1A47A 3GTNA 5IDIA 2XG9A 1WZLA 1J9YA 2O92A 2V5DA 3SUSA 3VIHA 3ZT6A 4LPCA 5ABHA 3I3BA 1UR9A 2V5CA 2X8RA 4GZEA 1EDTA 1YHTA 5CLTA 4TVDA 3AS2A 2ESCA 4DUVA 2BXZA 2E40A 5A6BA 2PWGA 4U3AA 3MKKA 1NP2A 2VRKA 5A6KA 1NOUA 2J79A 2D2OA 5FKYA 2DGAA 1X6LA 2WMKA 7TAAA 4PN2A 5CZKA 3BMWA 2X05A 3GDBA 3A6OA 4P7NA 1FH7A 4HA1A 3WD4A 1UR8A 2CITA 1OGGA 3NDZA 4AD2A 4W7UA 2J7DA 5A6SA 4X0NA 5C8BB 4LYPA 4AEEA 4F8XA 1QI3A 4OKDA 4UOQA 4OOZA 4J3VA 1KCKA 4UOJA 2VX4A 1LF1A 2J4GA 1B1YA 1ZBCA 5M03A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2G3M A;  3BAI A;  5JBF A;  1GJW A;  3CIV A;  4KRU A;  1E0X A;  1UHV A;  3BXW A;  3BLP X;  1H4P A;  4IIS A;  1EOK A;  4W88 A;  3BAJ A;  1E15 A;  3AZR A;  5DT5 A;  3GNO A;  1BQC A;  2WC3 A;  3ZO9 A;  3AMK A;  2ZUU A;  2D3N A;  3WMS A;  1JND A;  3I3D A;  1QOX A;  2XGI A;  3EMQ A;  3EDK A;  2ZUS A;  4ZEN A;  1SR0 A;  5IHS A;  3VMP A;  3QR3 A;  2WLY A;  1B3W A;  4D6H A;  1XRV A;  1HJW A;  4WLC A;  3T08 A;  1KXV A;  4QAW A;  1V3K A;  4EAN A;  3O9N A;  2WMI A;  1R86 A;  3F5L A;  1SYT A;  4X9Y A;  2CKS A;  3AHX A;  4CGT A;  3SCS A;  1MWO A;  2C7F A;  1ZJB A;  4MNM A;  1J0H A;  4ATW A;  1B31 A;  4OUE A;  4AZ7 A;  5LA0 A;  5AYI A;  3WEM A;  2ZE0 A;  3BSG A;  1CGU A;  1KWK A;  1DHK A;  1DTU A;  1U2Y A;  1XH2 A;  2C0H A;  3CHC A;  5HNN A;  2OSW A;  2DEP A;  3SCV A;  4R27 A;  1CNV A;  1W9V A;  2G3N A;  3WD1 A;  2ZX8 A;  3VIJ A;  5HPO A;  2PB1 A;  2XTK A;  3PZQ A;  2YL6 A;  5HDR A;  1QI0 A;  1GUV A;  2GJX A;  1ISY A;  4WF7 A;  1GON A;  1HX0 A;  1E72 M;  1M03 A;  1OSE A;  3BAY A;  5JBD A;  2YBT A;  3K4D A;  4URI A;  1E6N A;  4AYS A;  4P8W A;  3ZJ8 A;  4HMD A;  3POC A;  3WBE A;  2AAA A;  1K6A A;  1TR1 A;  1V3I A;  5DO8 A;  3WDI A;  1V0L A;  5I3D A;  4AZC B;  2OYK A;  1FFR A;  3NSN A;  1JYX A;  5A6M A;  1GOR A;  1E6X M;  1UWR A;  2W91 A;  3VMO A;  3OG2 A;  3EDF A;  1XD0 A;  1LL6 A;  4QDM A;  3QGV A;  1W2P A;  4D6D A;  4D71 A;  1AMY A;  5LA2 A;  4FLS A;  3AS1 A;  1CXE A;  1H0G A;  2UY2 A;  2VR4 A;  4XZW A;  3EDD A;  1ZBK A;  1UA3 A;  2EPM X;  3VU2 A;  2WC4 A;  4HA3 A;  5C70 A;  1E0W A;  4PMZ A;  1AQM A;  3VDA A;  1UWT A;  4JHZ A;  4NZC A;  1C8Y A;  3W29 A;  2CEQ A;  2BVT A;  1KR1 A;  2A3B A;  2J7F A;  4GIA A;  4PCT A;  3W81 A;  2W66 A;  1GW1 A;  4P7L A;  2PBO A;  1OGS A;  5A2B A;  1E43 A;  2WW5 A;  3OZP A;  4Z2J A;  2D1Z A;  4D6J A;  1ZJA A;  1HJQ A;  2J75 A;  4H7V A;  1NH6 A;  1WCG A;  3W28 A;  5A6J A;  4UFJ A;  3WFZ A;  3WDJ A;  5CSU A;  1I1X A;  1WKY A;  4BQ2 A;  5I5R A;  4A3Y A;  3OB8 A;  3BAK A;  5EFF A;  2J7H A;  4ATL A;  4NRS A;  3EMC A;  1CXK A;  3WN6 A;  3VD4 A;  3KL5 A;  1HT6 A;  5A2A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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