2RGLA

Rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into Rice BGlu1 beta-Glucosidase Oligosaccharide Hydrolysis and Transglycosylation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2rglA00
1E6NA 2ZUMA 4LYRA 3CHFA 5HNNA 5JUVA 1CGVA 2YDRA 1XD1A 3W6MA 5I0DA 4HMCA 1QHOA 1UR0A 3ARTA 3RM9A 3THCA 1E6XM 3T08A 3VX0A 4GZJA 1VIWA 1UR2A 3GXFA 5DO8A 2VRJA 4AZIA 1VRXA 4GQRA 3F5JA 1VFOA 1V3JA 3BGAA 5DT7A 1CENA 1JD9A 1EGZA 4P7RA 3WENA 1L0PA 3WDPP 1E1EA 2WMHA 2CHOA 4JFTA 1O7AA 5A2BA 5A95A 4AZCB 1BHGA 1ISWA 1R7AA 1Z32X 5A6KA 2V3GA 1W1TA 1WE5A 1VEPA 5IDIA 1QNQA 4IISA 1KWKA 3GXMA 4MDOA 1EQPA 1OIMA 3OLDA 4XB3A 6A3HA 3D5HA 4AW7A 1FP9A 1MYRA 2W62A 2ZUUA 3AOFA 3AICA 4UQBA 3FNDA 4D6GA 2A3CA 4HOXA 4KH2A 4Z2JA 3W37A 1V6VA 3GBDA 2Y8VA 3N12A 1W3KA 3AMLA 4JL2A 2WCSA 5E0FA 4MNJA 3CTTA 4WJXA 2VUYA 2A3EA 2WAGA 2JIEA 2QF8A 3VD5A 3WF1A 2WKLA 3GDBA 2WANA 2J4GA 5GNZA 1PZ3A 5KZ6A 3NDZA 1VFFA 2CKSA 3CBWA 2D23A 3CUJA 1ISXA 3FN9A 1JXJA 1FH7A 1PIFA 2WZEA 3QHMA 3WF0A 1SFSA 3U57A 2BVTA 1TE1A 2GJRA 1JFXA 3WNNA 2BY2A 4PMDA 3NUKA 4ATWA 4AD0A 1W9XA 4ZXOA 1ISZA 2OWCA 1V03A 4B3LA 3BAWA 4M81A 3EMCA 2G3IA 2YDQA 4QAWA 3GH4A 1I1WA 2WSPA 4AC1X 3BSHA 1VF8A 3W4RA 2CPUA 1AMYA 1X6LA 2D20A 3UERA 1CBGA 4FF5A 3MUZ1 5CGTA 1LG2A 3DC0A 2HISA 3T2QA 4AD4A 1AQMA 1PX4A 2CETA 4EKJA 3RMEA 1KR1A 4W85A 1G5AA 2DT1A 4F66A 1UWSA 4OOZA 4UZSA 2WHMA 1YHTA 2XIBA 4JKKA 4UQDA 3WF3A 2WVTA 4YHEA 3ZJ7A 3ZT5A 4BQ3A 3DYPA 1K9TA 4ZXLA 2UY4A 2EEXA 4IPNB 3A6OA 1E1FA 5IXEA 2XVPA 1CWYA 1HKJA 2V38A 2YA0A 4TTGA 4PCSA 2BS9A 1IT0A 3ZT7A 1CGUA 2VNCA 3WD4A 3IAQA 1MWOA 5C8BB 5A6AA 3AIVA 4UFJA 1J0IA 4TX8A 4HPGA 4R5EA 5E9AA 3AFBA 3SCRA 3PZMA 4U3AA 5E6ZA 2ZICA 4GKLA 1J0ZA 1BG9A 5BRQA 3OBAA 4PEEA 2NSXA 4GO9A 3WEMA 4U31A 2J7HA 1D2KA 2XG9A 4AISA 1C92A 3CZLA 4WK9A 3FAWA 1GVIA 1I1XA 1GZJA 5HDRA 3M07A 1E55A 2GJPA 3WH9A 5AY7A 3PTMA 4N42A 5BXSA 2D22A 4JZ5A 1JZ8A 4GPNA 3WDQA 1QI2A 1JDCA 1UD6A 3MKKA 3RJXA 1WDSA 1V6UA 1JYXA 1E3XA 1E0XA 3N13A 4F9JA 3N9KA 4JHOA 1JNDA 1H5VA 3GXDA 2VX5A 5DF0A 4JKLA 1KFWA 3CZKA 3BXWA 3NSXA 1DHKA 1WZMA 5A8MA 2DQXA 4W87A 1B31A 3L4YA 1XSJA 1M53A 3ZT6A 3UR8A 1ISVA 5BXRA 2VURA 1V08A 1MW0A 1FH9A 1EIBA 2XSBA 1XCXA 2VT0A 4B16A 3NJ3A 1W2VA 2ZUSA 2EPLX 5E6YA 1DP0A 2CERA 4J3SA 3WF4A 2W5FA 1GOWA 5CGMA 3KL0A 1QBBA 1UD4A 1KXQA 1F4HA 1ZJBA 1UWRA 5F7UA 2VCBA 3GTNA 4P8WA 3N04A 3VDBA 4WKHA 1Q6EA 2ZXQA 3BMVA 1IZJA 4FLRA 3FAXA 3RCNA 5BXTA 1QI5A 3MSGA 1OSEA 1HJXA 2RGLA 4JKMA 2XIIA 1KQYA 1WDRA 4AZ5A 3ARXA 1JZ6A 4PMXA 3M7SA 3L2MA 4UQAA 1W9PA 4Z2LA 3THDA 1XYZA 3OZOA 3W81A 1NP0A 1OGBA 1PAMA 3IAPA 1NOWA 3NCOA 6CGTA 3WQ6A 2XVGA 3ZO9A 1EH9A 1UWQA 2ZUTA 1E4NA 1HKMA 2A3HA 4JCLA 2YIHA 5I79A 2VCCA 4NI3A 1B9ZA 1MQPA 1W91A 5CZKA 3MO4A 1E4IA 1FH8A 4CUCA 1H09A 3MU7A 5CQ1A 2J47A 2XHYA 3EBVA 1LWJA 3RJYA 3PZIA 3VINA 5M03A 5A8OA 1SYTA 1WZAA 4CU7A 4HOZA 3WD1A 2GK1B 1V3IA 2EXOA 3ARWA 4A3HA 1W1VA 1J12A 2BY0A 3WBAA 4Z2IA 3TTYA 2WHJA 4D6FA 3AS2A 3ARVA 1EQCA 5I3DA 3AS1A 3WMSA 2XVNA 4WIWA 1WDPA 1KB3A 4MB3A 4X0NA 1WP6A 1E9LA 1OBAA 3FHQA 4D6DA 4LGXA 3VNZA 1A47A 3SCWA 1UKTA 4WKAA 3RO8A 1V02E 3VU2A 5D9OA 4IUGA 1JYNA 5A94A 5TD4A 3EDKA 3VIGA 3RPMA 1OT2A 1HP4A 2Y8KA 4GZEA 2XTKA 2WC3A 1JXKA 4HOWA 3OLIA 4Z2HA 4CVWA 4AD3A 2FDMA 5ABFA 3SURA 2J8FA 1V6XA 1CXIA 2J7FA 3NSNA 1WCGA 5FL0A 3SCTA 3TTQA 1TFVA 5A6BA 4OUEA 3F5KA 1C90A 3WN6A 3AYSA 3PZTA 1WPCA 4PN2A 4M24A 2WWCA 1W3LA 1BF2A 3B8SA 1C3FA 1UD2A 2JEPA 1JD7A 5JBEA 2ZIDA 1TCMA 1W3JA 1XV8A 1HXJA 1B2YA 1EDGA 2XWDA 2Y2WA 3KZSA 4YHGA 2G41A 3HMCA 2PWGA 4TTUA 3VVGA 1OM0A 1RP8A 3ZOAA 3WF2A 9CGTA 1HP5A 2W61A 4H04A 4WKFA 3ZJ8A 4J3VA 3K8MA 3EDEA 2IXUA 1CXHA 1BTCA 4JL1A 4C7GA 1WKYA 2WMGA 2BV9A 4OBSA 3ZJ6A 1LQ0A 1FFRA 1UD5A 3CHCA 4W89A 2CBJA 4ACYA 3MANA 3PBGA 1G0CA 2V3DA 2BXYA 2CKRA 1NM9A 2VMFA 5I24A 5I78A 5I23A 3OZPA 3MV11 4UQEA 1BFNA 1CLVA 3AMKA 1B3WA 3ZSSA 1B90A 5FL1A 3VNYA 2W67A 4ACZB 3WQVA 2V5DA 1CTNA 4AIOA 2ESCA 1GHRA 3ARSA 3VGDA 2WMIB 3CUGA 4LYPA 1XHGA 2PI6A 1JI2A 1Q6GA 2V3EA 4UQCA 3BCDA 4MB5A 1BYAA 1HL9A 2J7CA 3TA9A 3AIBA 3B9AA 2OSXA 4URIA 1CLXA 4OKDA 2WB5A 5LA0A 1NWUA 1XH0A 4BZYA 2G3MA 2XVLA 1GJUA 1J0JA 5FCZA 1LL6A 2VZVA 2AMGA 2D24A 3PZOA 1M7XA 2C8NA 4HMDA 1TG7A 3BMWA 3UESA 5M3WA 2DT0A 3RM4A 2VR4A 5ABEA 2ZUVA 4JFVA 3A4WA 2Z1KA 3KWXA 1DTUA 1CXFA 2G4FA 2W63A 4CD7A 5A2AA 2XFYA 3WL0A 3T2OA 2D1ZA 4D71A 3IJ8A 1QOXA 4C7DA 4DWSD 3CGTA 4V27A 4W84A 4B9YA 3N1AA 4GXPA 1BYCA 2O9TA 4W8AA 3HJEA 3NYDA 1BVZA 1UWUA 3KEHA 3UR7A 2JALA 1J0KA 1SR0A 2DH3A 4NRSA 1E72M 3PN8A 1DWIM 2J74A 3APGA 3GYCA 3A47A 1P6WA 2CBIA 4W5UA 3VM7A 4JCMA 3PTQA 1EXPA 2C7FA 3ARZA 4TX6A 3VGBA 1GPFA 2JIWA 2VO5A 3VGEA 4HA1A 3CMJA 1ECEA 2VZOA 3BAKA 4CCCA 4D6EA 1NOFA 1E15A 1HF6A 4CU6A 3LPFA 4PMVA 3VMPA 4CN6A 3D3AA 5A1AA 2XVKA 3AIQA 4M1RA 3S6TA 1Q4NX 3AJ7A 2G3NA 2BHZA 1UH4A 3ARUA 1HIZA 2ZE0A 3VDHA 4AEEA 5EB8A 3QR3A 1PZ2A 1C8XA 5IFTA 1DWGM 3OLEA 4UOQA 4E8CA 7TAAA 2YBTA 3WH5A 4KGJA 3MUAA 4FLQA 4H41A 3SCQA 4J7RA 2GDVA 5CPTA 5BWFA 1GJWA 2E8ZA 2EPKX 3BH4A 1V0MA 1W9VA 4S3JA 1NQ6A 3ZMRA 2WZHA 4OIFA 4FLSA 3L4WA 1J11A 1EHNA 3EDDA 1JNEA 1TVPA 1SMAA 1CGYA 3ZM8A 1UWIA 3WH8A 2BVYA 1JAKA 4M82A 1MXGA 4AXNA 3AROA 2TAAA 4BQ2A 4ZENA 4EK7A 1BQCA 1KCLA 1ZS2A 4ATLA 3GXIA 5A6MA 5CJ5A 5JBDA 3QOKA 1B3YA 4NZCA 1MFUA 4W7WA 1V3HA 2O9OA 3UEQA 5JBFA 1CPUA 1BAGA 2WBKA 4PYSA 1PX3A 2YL5A 1TA3B 3L4UA 3DYOA 2ZUWA 3RIKA 3SUTA 2WLYA 4TVCA 2OYKA 3VO0A 1BG4A 1Q6FA 1AQ0A 4F9DA 2FGLA 1CXEA 3EMQA 1DWHM 5HPOA 4YPJA 3W25A 1JF6A 3VTRA 4P8XA 1I75A 3W28A 3MMUA 1W2PA 1UZ1A 3VIJA 1G94A 4IM4A 3VGGA 5D9MA 2XSAA 3AXHA 2UY3A 4DUVA 1UKQA 2VL4A 2YA1A 4HTYA 5A8NA 3SUUA 1H11A 1IZKA 3WQ5A 1JYWA 3QOMA 1GUVA 4QLJA 3FW6A 3CH9A 1CNVA 1HJWA 1KXHA 2OSYA 4QLLA 2W92A 4XZBA 1Y7VA 4QDMA 3ZR6A 1WZLA 3BSGA 4X9YA 1UR4A 4HPHA 3POHA 3EDJA 2DSVA 3CZGA 1EO5A 1GOQA 4HZ8A 4B3KA 1UWTA 3U5YA 1KR0A 4HP5A 2E9BA 3VUPA 5EFDA 4QFUA 3ARYA 4PMUA 5HBFA 2GJXB 1XD0A 4H8UA 4BF7A 4W7UA 2NT1A 3WELA 4LPCA 1UKPA 1H49A 1R86A 1C8YA 2ZX9A 3W27A 1KWGA 1LL4A 3T0BA 3AS0A 3GM8A 2WMFA 2ZWZA 1EOMA 4N0RA 4D72A 2FH8A 5HXMA 1UOKA 4P7NA 2O92A 4CU8A 5D8WA 1H0IA 3MSDA 1TMQA 4CGTA 2VQUA 2W91A 1K9EA 3PZNA 4P8VA 4AZCA 5DFAA 2DGAA 3WEOA 3L2LA 3O6AA 2QV4A 2QPSA 3OA5A 3ZQ9A 4MNLA 3J7HA 3W29A 2EJ1A 4H8VA 5CXPA 3L4VA 2VZSA 4ML4A 3ZR5A 3BAYA 2OSWA 4DWSB 3UG5A 2WVVA 1QPKA 5BCAA 1OD0A 3SCUA 2DDXA 3UCQA 3A4XA 3WIJA 4DWSC 3BLPX 3VOCA 4QP0A 4Y7EA 5CPQA 3UG4A 5A8QA 4M56A 4D1JA 1A3HA 1ITXA 1NWRA 1E5NA 4XZWA 2CIPA 1B0IA 3UG3A 2EPMX 4EAMA 1W32A 1ODUA 3K4DA 3MV01 4J28A 2VRQA 2NW0A 4UFLA 4UZUA 3HN3A 2B31A 4U33A 5E09A 4D6CA 3BAXA 4PMOA 1W1PA 5GQBA 1VFUA 3AZSA 2BVDA 4CCDA 4AZHA 1CYGA 4AZ6A 2JFEX 1BGGA 3FHAA 1JFHA 4E8DA 1US3A 2CEQA 4MNMA 1KQZA 1MFVA 1OIFA 2Z1SA 4RE3A 1CGXA 2CESA 3F5LA 1HN1A 5A6JA 2WC4A 2D2OA 3WEZA 3MUIA 5CPSA 3SCVA 4RE2A 1H0GA 1KGXA 1C7TA 3O2LA 2DSZA 4U2YA 3AXIA 4X0VA 1E71M 1KCKA 1W3HA 2YA2A 1OD8A 2DSUA 2WHLA 1UG6A 2WSKA 2CYGA 2ZX6A 4AIUA 5I5RA 3L4XA 2IUZA 4HZ7A 1CXLA 1MQRA 5GPRA 1VEOA 3WUGA 1O6IA 3BAIA 2GDUA 1J0HA 2NT0A 3WMBA 2VI0A 3AHVA 1MVYA 4ZFMA 4CD8A 1VJZA 3CO4A 4BA0A 1LLOA 3K46A 2FHFA 1AVAA 4HMEA 4AY1A 3CPUA 2EO7A 3U5UA 1HT6A 3AZTA 2WW5A 4CD4A 3VIKA 2VJXA 2XM1A 1ODZA 4W86A 1WZKA 1QNPA 4U2ZA 3VIIA 2X0HA 3WD0A 1OB0A 4V28A 4PSPA 1HVXA 1XSKA 3LPGA 3G6LA 1DWAM 1PJ9A 1QVBA 3OGRA 3OLGA 4K68A 1V02A 3HU7A 1MW1A 2ZXDA 4LX4A 2PF0A 3CHDA 3GNPA 1GQJA 4GZIA 1Q6DA 1F4AA 3TTSA 3SIMA 2WZIA 5AYIA 1XH2A 4TVDA 1EOKA 3VD9A 1KBKA 4Q22A 4UTFA 1HKIA 4M29A 1BGAA 4UQ9A 5D9NA 3T0AA 1V3LA 5I2UA 2XUCA 3W6LA 1FA2A 1M01A 3WDRA 3WFLA 3G6MA 1ZBKA 1OGGA 3SUSA 1ISYA 5M17A 3BAJA 1GQKA 1FFQA 4MAVA 3W82A 3WL1A 1LF1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E6N A;  2ZUM A;  4LYR A;  3CHF A;  5HNN A;  5JUV A;  1CGV A;  2YDR A;  1XD1 A;  3W6M A;  5I0D A;  4HMC A;  1QHO A;  1UR0 A;  3ART A;  3RM9 A;  3THC A;  1E6X M;  3T08 A;  3VX0 A;  4GZJ A;  1VIW A;  1UR2 A;  3GXF A;  5DO8 A;  2VRJ A;  4AZI A;  1VRX A;  4GQR A;  3F5J A;  1VFO A;  1V3J A;  3BGA A;  5DT7 A;  1CEN A;  1JD9 A;  1EGZ A;  4P7R A;  3WEN A;  1L0P A;  3WDP P;  1E1E A;  2WMH A;  2CHO A;  4JFT A;  1O7A A;  5A2B A;  5A95 A;  4AZC B;  1BHG A;  1ISW A;  1R7A A;  1Z32 X;  5A6K A;  2V3G A;  1W1T A;  1WE5 A;  1VEP A;  5IDI A;  1QNQ A;  4IIS A;  1KWK A;  3GXM A;  4MDO A;  1EQP A;  1OIM A;  3OLD A;  4XB3 A;  6A3H A;  3D5H A;  4AW7 A;  1FP9 A;  1MYR A;  2W62 A;  2ZUU A;  3AOF A;  3AIC A;  4UQB A;  3FND A;  4D6G A;  2A3C A;  4HOX A;  4KH2 A;  4Z2J A;  3W37 A;  1V6V A;  3GBD A;  2Y8V A;  3N12 A;  1W3K A;  3AML A;  4JL2 A;  2WCS A;  5E0F A;  4MNJ A;  3CTT A;  4WJX A;  2VUY A;  2A3E A;  2WAG A;  2JIE A;  2QF8 A;  3VD5 A;  3WF1 A;  2WKL A;  3GDB A;  2WAN A;  2J4G A;  5GNZ A;  1PZ3 A;  5KZ6 A;  3NDZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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