2RHGA

Tryptophan synthase complexed with igp, ph 7.0, internal aldimine
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
267
structure length
250
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tryptophan synthase complexed with IGP, pH 7.0, internal aldimine
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 89
structure length 250
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2007-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2rhgA00
4RR4A 3GDRA 4HHPA 2NX1A 6ALDA 3W86A 1SFJA 2ZZ7A 4K6AA 2Y7EA 2DZXA 5LSMA 3GB6A 3C52A 1GPWA 3KFTA 2B7QA 3A22A 3TQ0A 5FF2A 5AHEA 4K7VA 4JTIA 2JGYA 3I7SA 4Z1BA 1VYSX 2EKCA 3MBFA 3WJYA 2CLFA 4BWLA 3HG5A 1R2TA 4MFDA 1TPUA 3C2VA 3HG2A 3NL6A 1SQ7A 2XN0A 5AFDA 1W31A 3M43A 3U6WA 3NQCA 1JUEA 5G4WA 3UPBA 3MWAA 5F1VA 2DZTA 3MHUA 4LC8A 1Q6RA 2AGKA 5T26A 3WJXA 5K9DA 1DV7A 2CZ5A 2C16A 5LGZA 4LUIA 3U2OA 4N6EA 4ICNA 3DXIA 1M7OA 1TPB1 1XDMA 1LORA 1FY6A 4XWUA 1GG0A 2A7RA 4QITA 2A4AA 4KWWA 4LS1A 1ZCOA 2C13A 4N9EA 1GWJA 3B4UA 1S3HA 4PCFA 4GBUA 3P61A 2QJHA 4TO8A 4LVDA 5HMSA 4GUFA 1GJPA 3FYOA 4O17A 3CPRA 2KZHA 1K8YA 2GQ9A 5F4XA 1J4EA 4UNKA 1FCUA 3V1PA 3ZWSA 1ICPA 1EA0A 1HL2A 3GX9A 3HG3A 2QDGA 2ISSA 4OGZA 5D09A 1RQHA 2FFCA 4OWGA 4NZJA 1QCWA 1RPXA 4NJIA 3UXDA 4XTIA 1KM5A 1TREA 3LXCA 3C2RA 5G2HA 4UTLA 1TO3A 4LW7A 2I14A 3NZRA 1MEIA 1PHWA 3S1VA 4FEZA 2NLIA 2ZTJA 3EX3A 3I6RA 4CCEA 1KA9F 1C9DA 2CWNA 3W7MA 4A2SA 1Q45A 2WV8A 2WSYA 1QDSA 5KSWA 2YYUA 1QOPA 5D30A 1SZGA 5DCEA 2B7PA 1FX6A 3TV8A 3BV4A 4DF2A 1O5KA 3OG3A 3LCFA 3QFEA 3AO0A 4MUZA 4WUIA 1LP6A 3A24A 3TIMA 2C19A 2Z6JA 5D2VA 3T7VA 1DOSA 1B57A 2QEZA 4O0ZA 3EKZA 4GXMA 2YYTA 3EWZA 3CM4A 4DF1A 3WJWA 4WXZA 2ATSA 3W7GA 4DBEA 3P5YA 4J9JA 1L9WA 2J9XA 2YZRA 4W9TA 3QPZA 1KTBA 4O16A 2OX1A 3GYEA 2TSYA 3PB2A 3N9SA 3F03K 2RFGA 2DJXA 1W8SA 1KM1A 3DBPA 4UIOA 2Y6ZA 1A5AA 3KRZA 3G1DA 5G2WA 2G5WA 1EUNA 1VLIA 3QQ1A 4RJEA 3W83A 3MP4A 2VEKA 2F84A 3SY5A 1OHLA 4UMAA 2QR6A 1MXSA 3DENA 3E12A 1ZAIA 2VOMA 3HB9A 3NQFA 1OFPA 4CNOA 5FEWA 1EP3A 2C3ZA 3UD6A 3PS7A 3W74A 1YYAA 3PC0A 3KVMA 3M5XA 1T8XA 3MI6A 1L6WA 2JKPA 3W2NA 3TR2A 3A5VA 2TRSA 1LYXA 3L66A 2XN1A 1KBJA 2VFDA 3WK0A 3S5NA 4MKNA 1KM4A 4UR7A 1SSDA 1UASA 1TPH1 1MO0A 5BMWA 4NJKA 4DF0A 1I2PA 1RD5A 3DFSA 3NO5A 2EPHA 5L6UA 4HNVA 4JN6A 3W7DA 3DFNA 3BO9A 3NEVA 1GYNA 5KZEA 4LC6A 2RDTA 3IVTA 1TIMA 1JQXA 2V8ZA 2ZCGA 2TYSA 2E1DA 3NNTA 1MEWA 1GEQA 2QCLA 2QJIA 1AG1O 2V5BA 2F7FA 2FJKA 4AHQA 3LCXA 4U4MA 4JIPA 4ZQCA 1W3IA 2ZQ0A 1SZNA 2EHHA 3B03A 6TIMA 4ALDA 1OX4B 2E6FA 1B4KA 1H60A 1SW3A 1KLYA 2A5HA 1H7OA 5AN7A 4QQ3A 5HR6A 3W2KA 3E02A 1GVQA 2V9DA 2W0UA 1R2SA 3GDMA 3ANYA 3M16A 1B9BA 3I65A 3T40A 1DBTA 4RX0A 4LY8A 3W7JA 4IQLA 2Y61A 4GRSA 2YCEA 3HGOA 4MLJA 1X1OA 3KX6A 1EIXA 4UTTA 3W7IA 1Q6LA 4O19A 3BPWA 4Y6GA 2DZUA 3RMJA 1XUUA 2E6AA 5FI8A 3T55A 3MHGA 3DGRA 4H6KA 1H7WA 5CPOA 4UR8A 2E68A 3LI0A 4A2RA 3OBKA 3BARA 3GAKA 2X16A 3HGRA 2Q8ZA 3PSWA 1V7YA 3L5LA 4JTFA 3IIXA 3LCGA 1EB3A 1I2NA 3LXAA 3T44A 2V2DA 2OMAA 3O6CA 3CU2A 3N14A 2H90A 3IEBA 5DY2A 1G4SA 4C1KA 1YADA 3PUDA 3PUEA 4MYXA 3W1NA 3W7LA 3G0SA 2Q8LA 1R47A 2YR1A 3W2LA 3NPUA 3IIVA 3CEPA 3STEA 3R5EA 1M7PA 1XFBA 3A9IA 3P67A 5G5IA 4UC5A 4ZZ9A 2V82A 4UUIA 2OZ0A 3LCLA 1G6CA 3NQ6A 4WD0A 1CW2A 2H8XA 3HPSA 3USBA 3PULA 4QNEA 1SO6A 5CPLA 3LCIA 3TQKA 2BTMA 5AHMA 3W73A 1O95A 3CHVA 3G0XA 1TPFA 1OFQA 3KVJA 3SECA 3GXTA 3BLFA 3NQ8A 3W07A 1WX0A 2E09A 3TW6A 1N55A 2RHGA 4FNTA 3W7HA 3NQDA 3TFXA 3MHFA 4OV9A 4LV9A 3THAA 4CNNA 2J9YA 2DU2A 4N9CA 3LHWA 3DI0A 1FCBA 2VFEA 2NX3A 3O6DA 4BR1A 3DFQA 4Z1DA 1YDOA 4N6FA 4FNQA 1FWNA 3G1HA 4CNPA 1FWSA 2VFGA 2YW4A 5D2WA 1RQEA 3KAOA 4MFEA 1KFCA 2ZZ1A 1KBIA 3UYCA 3P82A 3QSRA 4RZ6A 4NT0A 4NJGA 5F4WA 2GJNA 2YXGA 4IMGA 5KITA 4AF0B 3KXQA 5DELA 3TX9A 1TCDA 4UXDA 5FEPA 3TK7A 4MJMA 5KMYA 3W85A 1HFBA 4S1FA 4FNPA 5AC6A 4NNCA 2QCDB 2JKEA 2JK2A 4EIVA 1G67A 1SW7A 1LCOA 3VNDA 1X7FA 2CLKA 1JCNA 2NWSA 3UWYA 4FB7A 4X3ZA 1D3GA 2VFIA 3MMTA 2HMCA 4YMZA 1F76A 2CLHA 4O1DA 1YPIA 3BW4A 3SR7A 3DFTA 5EL1A 1PE1A 4YCOA 4IGHA 4S2BA 3PF3A 5E1QA 2VELA 5BRBA 3IGSA 3MUXA 3W7EA 1W54A 4IWWA 3S1UA 1VCVA 4ORMA 1LOLA 1QPRA 1JULA 2X1UA 5CZSA 5CGQA 1EP1A 4LT9A 1SFLA 2ABAA 3UPWA 1ONRA 4OT7A 3IV3A 1TTJA 3S6DA 4K39A 2W6RA 3W84A 3BG5A 2FTPA 1NSJA 1UB3A 4AAJA 2QCCA 4IMFA 2QCEA 2HS8A 5LHEA 2WNNA 3P81A 4PL2A 1YXCA 5LNVA 3QMRA 1TRDA 1F73A 1DORA 4JYFA 1WBHA 2JKAA 1XC4A 2YPIA 4NJJA 3DKJA 2WSRA 4ADSA 5EPDA 2FPTA 4QSHA 3W87A 3GDTA 3TCEA 1FWTA 4LUJA 4AB4A 3VFLA 2E77A 1GZGA 4ZMGA 1GVRA 2VEIA 1H51A 3NAVA 4EWND 1K03A 1HO4A 3QW4B 1JUKA 3B0VC 4CQAA 4GJ1A 2RDWA 2QUVA 3R89A 4BI5A 1I2OA 3TXZA 1NAL1 4LVAA 4NNAA 3SJ3A 7TIMA 3TAOA 3EXRA 1OFBA 1VHCA 3TJLA 4N9BA 1ME7A 4RXFA 1OFRA 4LWWA 4JNMA 4NX0A 4XKYB 1R46A 3P80A 3FKRA 1ME9A 2A2IA 3MYPA 3W75A 1BEUA 3BLIA 3O15A 1XL9A 4M7TA 3SI9A 3N19B 1AMKA 5F4SA 1PHQA 3GZ3A 1JRBA 4QM1A 2FLIA 3MW7A 4JTJA 3G3DA 3G8RA 1ICSA 3M5ZA 4RZ5A 1P5BA 5KTLA 5LGXA 3NQMA 1D3HA 2HS6A 4RK8A 4XTDA 3UWQA 3VI2A 2ZZ4A 4NQ1A 3YPIA 4ZQOA 3Q94A 3FLUA 1FQ0A 1LDCA 4LS0A 4NZFA 5AHFA 2J27A 4IXXA 1LTDA 4LV4A 1TRIA 3NA8A 4MOZA 1BWKA 1GVOA 3L65A 3S9YA 1TV5A 2R91A 3P5ZA 4Z1CA 1ALDA 2TMDA 3SW6A 3L5MA 4UTWA 1WBJA 1FUYA 2ZRXA 4AHOA 3SFKA 2V30A 2FB3A 2HTMA 3LCHA 2ZRYA 4N02A 3QEZA 2GJLA 3GR8A 3BVJA 3CIXA 1KFLA 4Y9AA 3F4NA 1W5PA 4XQ6A 1G4EA 3C8FA 1I4NA 4UNLA 3EWXA 5GVJA 5I3JA 3IGXA 4FO4A 2BXVA 4O8RA 4IX0A 4M5PA 1W56A 3W1TA 2VFFA 3PVFA 4ZQPA 3L2IA 1MSSA 1VR6A 1FWRA 3M1ZA 1ZENA 5G1TA 3OVRA 3NQGA 2CLOA 4H3DA 2H8ZA 3E9AA 4BI7A 1H5YA 3M5VA 2QKFA 3INPA 4Q33A 4DELA 4TR9A 1VJIA 4NXKA 3IIZA 3TNOA 5FEZA 1TPDA 2X1SA 4WY0B 4YCPA 4PC8A 4NUWA 3LHTA 1VYRA 4DPQA 4JXCA 1H61A 2H3BA 3TH6A 4NXSA 2ZRZA 4OBTA 5L9FA 5IM51 4FX8A 3DI1A 5E93A 4JICA 2V5LA 1YPFA 1F05A 1G69A 5LNWA 1JVNA 4I9AA 4GWEA 5LNRA 3DHDA 5D05A 4FIRA 3G1XA 5I3GA 3RFAA 1P0KA 3C0JA 4O0KA 3QH2A 4ORIA 1JCMP 5K4XA 4IX2A 5J5RA 5ABTA 3O63A 3HF3A 3GNDA 2BSLA 3S0CA 2OT0A 1QPOA 1Q6OA 1GT8A 1UBSA 1ZFJA 1TYGA 3IVUA 3I7QA 3O05A 1D9EA 1K7EA 3LERA 1SSGA 1OK6A 1RZMA 4FXSA 1JQVA 1IXPA 2Y70A 4AHPA 1ZJIA 3MBDA 3PBYA 3W22A 3W7KA 1DHPA 1LLZA 3B04A 3BW2A 4M7SA 3HOJA 5A8GA 3SZ8A 1KLZA 4O4VA 1F6PA 1G4TA 2B7NA 4CCCA 1AK5A 3NQEA 5DN1A 1Q3NA 1QR7A 4WY0F 3I68A 3A5FA 3N73A 1H63A 2CLEA 4O57A 5D2XA 4GFSA 3JRKA 3S5YA 2NWRA 5D04C 3CC1A 2QF7A 1K02A 3EX6A 3NR0A 4M6PA 1B3OA 2C6QA 3CTLA 3RU6A 3VCRA 4K7YA 5LZLA 2I9EA 1V5XA 1A53A 4GUIA 4KWVA 5TBOA 3S42A 3TC6A 4FF7A 3VE7A 4IPIA 4UTKA 2VFHA 1QO5A 4IPJA 5CZ0A 4KFNA 3CIWA 3KOFA 4XBSA 4BF9A 3TFCA 2PURA 4ONVA 1PCWA 1F7BA 5DLCA 4YL2A 1VRDA 3FJ6A 3HGSA 3TMLA 4FNSA 1OFOA 4O4WA 4UFJA 3W2JA 1F6KA 4QISA 1W5QA 1TTPA 1O94A 1VHNA 3ABOA 3HG4A 1W5OA 3LLDA 2O7QA 2Y88A 2WSQA 4ZL1A 4QAIA 3HIJA 1K8ZA 1S5VA 4O13A 2WOQA 3BLEA 3V75A 3GXNA 4LNYA 4M6VA 2C18A 4PH6A 2PC4A 4I7WA 3NQVA 1PVNA 3C6CA 1OYCA 3W7NA 3CT7A 1OYBA 1IIHA 2CLIA 3PR2A 5AHLA 1OFEA 4RKAA 3DFOA 3BGJA 3HMJG 3FFSA 2CZEA 5LKYA 3P60A 2VC6A 1HUVA 2QUUA 4O10A 2WQPA 1YTEA 3S5OA 4AMAA 3S8HA 5HUPA 5G1YA 3NQAA 1JR1A 4Z0SA 3KHJA 3LHUA 4Y90A 1VCGA 3M9YA 2X30A 4UTMA 4WOZA 5K7JA 1TB3A 3KVKA 3ABQA 2DZSA 1P1XA 2BLEA 3GR7A 4YWIA 4IUOA 4JDYA 3W7PA 3W76A 4JYDA 5HJLA 5KZDA 4U28A 2ZBTA 4O53A 3STGA 4JTLA 2R8WA 5F2LA 1X6UA 2Q3RA 3CWNA 4Q4KA 5K9CA 1IF2A 4G1KA 1YLVA 4M6QA 1Z41A 3LX9A 3NZ1A 3QPYA 2NZLA 1T96A 5CG7A 3IIPA 5D32A 4JY9A 4R7JA 3NQ2A 4YLWA 2J9ZA 3TUUA 5DCDA 4ML9A 1WYIA 1DQWA 5D33A 1QPNA 3MP5A 4AWUA 2P1FA 1C8VA 4AEOA 3GKFA 3P62A 4RLIA 3UWVA 3RK8A 3LXBA 1LOQA 4JS3A 1R2RA 1PV8A 2JBMA 4A21A 3TA6A 1DJQA 3LBMA 3UNDA 2DJLA 3HQ1A 4R53A 2Z0IA 4PL1A 8TIMA 4O1CA 3B06A 4JTKA 4WY0A 1TTIA 3W7OA 3N9RA 3W3OA 1JRCA 2VXNA 2YX0A 5U7SA 3UWZA 4NVTA 1TPC1 3C3NA 2P0OA 1TJPA 5K2ZA 1WAUA 2Y7DA 1I45A 2Y7GA 3G24A 1RV8A 1SZEA 2E5CA 1TQXA 4MZ8A 4JTUA 2J24A 1W3NA 1H7PA 2Q3OA 4I7VA 4IMCA 2ZZ5A 4L4MA 3S5ZA 2G96A 2Y89A 3LDVA 5LHFA 3M7WA 3R12A 2WNQA 3LGEA 1P4CA 4DPPA 4LVBA 3QRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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