2RHGA

Tryptophan synthase complexed with igp, ph 7.0, internal aldimine
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
267
structure length
250
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Tryptophan synthase complexed with IGP, pH 7.0, internal aldimine
rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 89
structure length 250
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2007-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2rhgA00
5L6UA 1KTBA 3CPRA 1DJNA 4YLWA 5D30A 1AL7A 3M5YA 2FJKA 3GDMA 1L6WA 2DZXA 1KFKA 1V5XA 2G97A 4FX6M 2A7NA 3N19B 3W2NA 3ATYA 4JDBA 3HBLA 3VNDA 4OBTA 4IPJA 3PBWA 3P8JA 4TU1A 1IXNA 4NU7A 3W74A 4Y9AA 1A53A 4RXGA 3EB2A 3M47A 2DZSA 3YPIA 2ZZ5A 2FPYA 3VI2A 2WSRA 3TC6A 3C8FA 2CFFA 3C4UA 2RDWA 1KTCA 1T96A 3A5FA 5G2WA 1C29A 3EWUA 2X30A 3Q58A 4N6EA 1X1ZA 3L9CA 4PODA 2QKFA 3LTYA 1OFPA 3G3MA 3HG5A 1A5BA 3B06A 4ZQPA 3S1XA 5BW6A 5D09A 1QAPA 3O6DA 4K38A 1N55A 1R30A 4LV4A 5CPLA 1DORA 4KFNA 3W7DA 4XZ9A 3HGJA 5J5DA 3EKLA 4IX0A 1YTDA 3N9SA 3W7QA 2DP3A 1PHWA 3EWYA 1CX9A 3NQ7A 3EX3A 5CSRA 1VCGA 1W5PA 4P2VA 3W72A 4AXKA 2ZA3A 4OQVA 2Y6ZA 1JRCA 5AFDA 2NUXA 4AWUA 1T8XA 3ZWSA 2NV2A 2QCMA 2C6QA 1L9WA 4UR8A 1G7VA 4O1CA 1FWSA 4M19A 3F03K 3DHDA 3TK7A 4FIRA 5T26A 1QCWA 3TKFA 1H7NA 4UFKA 5HUPA 3ABSA 4MY8A 1LBMA 2QJIA 2XN0A 3M6YA 1VR6A 3HIJA 3NQMA 1SW0A 2NXGA 4DO6A 3THAA 3CHVA 1AW2A 2V8ZA 3G0UA 2XN1A 5KZMA 5FF2A 1VHNA 5LKYA 1O5KA 4PFMA 3G8RA 3FYOA 3L0KA 2WNZA 3HB9A 3LDVA 4OE7A 3C0JA 2ZZ4A 3SIZA 3INPA 1V7YA 1N8FA 3AJXA 1D3GA 5MHBA 1TJPA 1TTQA 1H62A 4BI7A 2EKCA 3O05A 1EP1A 4CCEA 3G8EA 2J9XA 1YTEA 3PUDA 5AC6A 1W3NA 1VZWA 2G96A 1TPB1 4UTWA 3SW6A 3W22A 3WJYA 1VS1A 2Y88A 4QSHA 4UTWC 2EPHA 1OFQA 3LCWA 2P0OA 1JQVA 1VLWA 4QJ1A 2BXVA 2EF9A 1ME8A 2NWSA 3B0UX 3W71A 1R2TA 5LSMA 3W75A 1M5WA 4JD4A 3LXCA 3NQGA 1QO2A 3QMSA 1LZOA 3E02A 5FF4A 3WJSA 4DXVA 1SZNA 4NZJA 2RDTA 2PRHA 4O0KA 5IBXC 2FPVA 2ZZ2A 3TC7A 4JX6A 3M5XA 3S1WA 1TV5A 4MLRA 1VYPX 4RJEA 1H50A 4YWIA 1OK6A 1A5CA 3I6RA 5DN1A 3T7VA 3PG9A 2J24A 1WOBA 3W88A 2R8WA 2RKXA 3CEPA 1X8FA 4JTGA 3LRMA 5CG7A 3W7LA 4A22A 2VXNA 3MYOA 3GXTA 1AMKA 5ABTA 5EBUA 2DJXA 2Y7GA 4WQ6A 3G24A 3QPYA 1VGAA 5C2XA 1PCKA 3DI0A 3G1DA 3V75A 3W2JA 1JR1A 4HSOA 3M7WA 2B7PA 4DBEA 1VCVA 4XBKA 1KFLA 4LVDA 2YW4A 1SW7A 3GNDA 2HTMA 3OA3A 3W1LA 3TU9A 2A85A 1TIMA 4OU1A 1R46A 3BGJA 1I4NA 3NQ6A 4AF0B 3TSBA 3B03A 2ZA1A 2ZCGA 4AHOA 3ZR4A 4MFDA 2ZRWA 1SU5A 2DJLA 4MY1A 3TROA 4H4IA 1SFJA 4O8RA 3BG5A 3KAOA 3MI3A 5FEZA 5EPDA 5K4XA 3L65A 1B9BA 4KWWA 2ZRVA 1ZENA 3U2OA 3DXIA 1ZJIA 2QCNA 2ZFAA 4QIUA 1OYBA 1TMHA 4LRTA 4OT7A 4X9SA 1K3UA 5AHMA 4A21A 4ORMA 1FX6A 1G4SA 4QITA 3NEVA 5HUOA 1DQWA 5CZJA 4OWGA 1AK5A 3N3MA 3U6WA 5K7JA 1LOSA 3RK8A 4EVZA 4B5NA 1OFOA 5I3GA 3DGRA 1I2NA 3T40A 4MYAA 2ALDA 3P7YA 5HINA 1FWWA 3S6DA 5U7SA 2A5HA 3RFAA 4UTIA 4C1KA 4JTHA 4DF1A 2Y7DA 3I65A 1SSGA 1W54A 4UIOA 2CLHA 3CM4A 1QDSA 4Q32A 4FEZA 1XI3A 2E68A 4JY8A 2ZYFA 1J2WA 1KM0A 4LW7A 3W7HA 3DKJA 3G1SA 5D05A 3EX1A 4O4WA 4LU0A 3L21A 4K36A 1UUMA 2B7OA 1EP2A 5LHEA 1VLIA 4TMBA 4EWND 3W7OA 5I3FA 3W7CA 3W83A 3PB2A 3W1PA 1IF2A 5KZDA 4M6PA 3WJZA 1GYNA 2WPBA 2Y7EA 2NXIA 1FDJA 3MHGA 3W7IA 1G4EA 2YX0A 3UPWA 4O10A 2ZTJA 3HMJG 4CQ8A 5EYWA 3NA8A 2FIQA 5I3KA 2RFGA 3TFCA 3EWXA 3HG2A 4WXYA 2ZRYA 3LBMA 1N7KA 3UD6A 2VFGA 4WXZA 2PRLA 3L66A 1Y0EA 3TJXA 2BX7A 2V82A 1PHQA 1A5SA 3ABQA 4UMAA 4Z0SA 1XBXA 3SY5A 4MJMA 4EF9A 3P74A 1ZFJA 4GXMA 1TCDA 1F05A 3UWZA 3P82A 5DY2A 5F4XA 1F74A 2XFWA 2GQAA 3TQKA 2H90A 5AYYA 2FPTA 1H7PA 1HTIA 4O53A 1FXQA 1JJKA 2CZEA 1O60A 3VE9A 4LS0A 1BKSA 4K7YA 2ZRUA 4WX2A 2CLKA 4O1AA 4ZL1A 1F6PA 4UC5A 5DBTA 4QISA 1KLZA 3KVLA 2CW6A 1JCJA 3SI9A 3IVSA 3SZ8A 3TXVA 5L9FA 1RQEA 2C15A 3GX9A 1SO3A 2FB3A 3C61A 1LCOA 2Q8ZA 1TREA 3HJZA 1W56A 4N02A 5F4WA 1O94A 4FNPA 3VFLA 4PL1A 3LCLA 4E2DA 2A7RA 1SZFA 4M7SA 4N9BA 2VEIA 1BWKA 1PCWA 4FF7A 5LGZA 4A29A 1EB3A 4O13A 1QFEA 1U5JA 1Q6OA 2EGZA 1OFRA 2A6LA 4EF8A 3GAYA 1UJPA 1LRQA 3RLVA 4AWTA 1YADA 1S5TA 4RCXA 1B4EA 1OABA 5AYXA 3W1MA 5G1TA 4K39A 3NQEA 4MIMA 1W5MA 3HPSA 1DVJA 2G95A 3W2UA 1Z42A 3LTSA 2CZDA 3BGGA 3HQ1A 5BNKA 3I7SA 1WX0A 2JGYA 2C14A 2QCFA 5E0KA 4I7VA 5A5WA 3B4UA 2ISSA 3G22A 1L2UA 4X2RA 2GQ9A 1RQBA 5H91A 4TX9A 1O4UA 4RXFA 1RR2A 4FNTA 1GVOA 3GR7A 3W86A 5K9CA 1J5TA 2R91A 1GZGA 2Z1BA 3L5AA 2VELA 4U28A 3BLFA 5HULA 2QEZA 1E51A 2H6RA 3WJWA 3NGJA 1JCMP 1PE1A 2WSYA 2NV1A 1H1YA 3PY2A 4LVBA 5D04C 3ANYA 1ZAIA 1GEQA 4Q33A 3UZJA 1TRDA 4KWVA 2VFFA 3UZ5A 3W7MA 3T4CA 1F6KA 4K37A 3W2KA 5I3HA 3GDLA 1MO0A 2I9EA 3CTLA 3HOJA 1GVQA 1QWGA 1P4CA 5AYZA 3MMTA 5C55A 3MBFA 4ZVJA 4LUIA 3MUXA 3QMRA 4AEOA 1VQTA 1DQXA 1SPQA 1OFAA 3E0IA 3P60A 1UASA 2D73A 5F1UA 2QUUA 4ZQCA 3LHVA 3B05A 1EX5A 1ICQA 3L0NA 1VHCA 1LRNA 4N9EA 3TNOA 2A21A 2O7QA 3CQ0A 3G0XA 3JRKA 3USBA 3NPXA 3W9ZA 1H5YA 3SFKA 3TA6A 3S8HA 2YFOA 3CC1A 1HUVA 5AHNA 1TO3A 2WJZA 4WY0B 3N73A 3UWYA 1DHPA 1GOXA 5G2IA 3OG3A 3UWWA 3GB6A 3W1UA 3N34A 3BV4A 3DH7A 1SQ7A 2W79A 4TMCA 3W7RA 1JVNA 1ICSA 3W1TA 4AB4A 3OBKA 4DO4A 3Q94A 1P5BA 1H7XA 3G1FA 4O15A 4MOZA 3PM6A 2YYTA 1GVSA 4JEQA 1I8JA 1XDMA 2VFDA 2ISVA 1A5AA 3QW3A 1GJPA 1OVDA 1TYGA 4QNEA 3MHUA 5TIMA 3W7NA 4JTJA 1KBJA 3E49A 4FX7A 1QOPA 1FUYA 2OJPA 4ADUA 2X2GA 4JTUA 3MO7A 2NUWA 2TSYA 5TBOA 1X7FA 4K8EA 1KM6A 4N9CA 1TTPA 2JKEA 4NX5A 3MYPA 1VJIA 1TPC1 3DFTA 1JUKA 3PF3A 3NVTA 3DZ1A 4HT3A 3NQAA 3LHYA 3LXBA 2B0MA 3T55A 1HL2A 3S9YA 4LC6A 4YCPA 4PC8A 1FY6A 3NQVA 3R89A 3CEUA 4JTTA 4R33A 3TAOA 1B4KA 2C18A 3ATZA 1RQHA 2J9YA 4CCDA 3EEGA 1MSSA 4N2YA 2H8ZA 3NXFA 2YZRA 3K30A 4S2CA 3M1ZA 2QCHA 3PAJA 3N14A 1LTDA 4S2BA 3DHFA 1BEUA 4Z1CA 3A21A 2CLEA 2QUVA 3LV6A 3O6CA 3STGA 5D2YA 1VRDA 2CLIA 3L2IA 3TCEA 2G5WA 4K6AA 3TQVA 2FFCA 5F2GA 3O16A 3BG9A 4HNTA 3GKAA 3G0SA 2B7QA 3P62A 3FJLA 3G1VA 2QJGA 2QCCA 3EXTA 1P1XA 3W84A 4DPQA 4R53A 3MP3A 1OFDA 2X1UA 4DF0A 2E09A 2E5BA 3UPBA 1XFBA 4MZ1A 3WK1A 4TIMA 2NLIA 5HR6A 1YPIA 4EIVA 3S5OA 1YDOA 4JTFA 2HS8A 4H3DA 4O54A 1YXYA 5LGXA 4O52A 1YLVA 1L6SA 5DY3A 4W9TA 3BW3A 3H53A 3P80A 4UMCA 4UTKA 4CCCA 5CPNA 3M44A 3QZEA 4UTUA 1SW3A 3L68A 4UR7A 1TQJA 3PBUA 4GNJA 1P0NA 5AHFA 1OX4B 2FLIA 4HNNA 1AW5A 3PG8A 4R7JA 1IIHA 1FBAA 2E1DA 1B57A 4IPIA 2DZVA 1QOQA 5IBXA 3BLEA 4N4QA 3QJAA 5C6MA 3S5YA 2YYUA 5IM51 2PE4A 5FEWA 5D2TA 1KFEA 1OYAA 1QPNA 1FWRA 1WYIA 2NUYA 3A24A 3NQDA 4MUZA 2QF7A 3LCGA 2Y61A 1W31A 3WFAA 5LNVA 1ZALA 4M7TA 2QCDB 1LDCA 4UFJA 3H55A 1PVNA 3PSVA 2GVJA 2PRMA 4XQ6A 3QC3A 3W2LA 4O4VA 3NL3A 3DFQA 3NL6A 1W3TA 4GE8A 4UNKA 2R14A 2TYSA 1ICPA 4IXXA 2E5DA 2TRSA 1H51A 1HO1A 1YXDA 2YR1A 3LCIA 1D3HA 3TSDA 3DFPA 4NX0A 2CU0A 5HWMA 3QPZA 2E6AA 4LC8A 4PL2A 3PBVA 3W85A 3O1NA 4GBUA 2NZLA 3LOTA 2CLLA 3WK3A 2Y70A 4U4MA 1Z44A 3MJYA 1F76A 2V2CA 1IIGA 1GT8A 4C1LA 4NJKA 1K02A 2X16A 5LNRA 5FF0A 1H7WA 3O15A 1LOLA 1FQ0A 4BFAA 3TAKA 3IIZA 2V9DA 3STEA 4JTLA 4S1FA 1I2PA 3OVQA 1NFBA 2ZBTA 4BI6A 3FEMA 3M0ZA 2X1RA 2FQIA 4Y96A 1K8ZA 3CU2A 5AHIA 5LHFA 2WQPA 4NJJA 2OT0A 3QQ1A 3GIYA 4PH6A 4ADTA 5BOOA 3EX4A 1AW1A 4IOTA 3GDKA 4PA8A 4RZ4A 5EL1A 1K03A 1TJRA 5HR7A 1T99A 2ABAA 4JN6A 5D2XA 2BSLA 2NX3A 4MJZA 4XTDA 1RZMA 4O28A 3S42A 4NQ1A 4HSNA 4R34A 5EKYA 2GPTA 4JICA 3PBYA 2AQWA 4ML9A 5AC7A 3NDOA 4E0CA 3MI2A 4ONVA 1YTKA 3HO8A 3W23A 5D32A 2B7NA 4WY0F 1LP6A 3EXRA 2TPSA 4ZQMA 5CSSA 5GVJA 1SO5A 1F7BA 3UY8A 5J5RA 1JUBA 4Y6GA 2X1SA 3C56A 4MZYA 4ZMGA 2QCGA 3NYZA 4JY9A 1K7EA 3NQFA 3CLMA 4DQWA 4IMCA 2YFNA 3KVMA 4DBDA 3GAKA 3FKKA 4FXSA 1KLYA 3CB8A 1M7PA 4BWLC 1BTMA 3GLCA 4M6VA 4H6KA 1KFCA 4LOCA 3VE7A 5DCDA 1IXQA 1FCQA 3M5ZA 5FEXA 2P1FA 2A7PA 2CZ5A 4JTKA 4LVAA 1TQXA 3FS2A 5K4ZA 2JGQA 2QDGA 2RDUA 3CT7A 3I7QA 3LI1A 1PL9A 4J9JA 4UFMA 2ZA2A 1ALDA 4OV4A 1SZEA 1WBHA 4O17A 2E6DA 2WKJA 4DEFA 3P84A 1THFD 3L0GA 3LHZA 1J4EA 3HF3A 3GR8A 1TPWA 8TIMA 3TUUA 1SO6A 2C19A 4FX8A 2BTMA 3P5YA 4JIQA 3M5VA 4LT9A 2WSQA 2O7SA 3OHIA 2V2HA 4UNLA 4JNMA 1K7FA 3R8RA 1MEIA 2GOUA 3LX9A 3NR0A 1IGSA 1UCWA 3NQ8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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