2RKXA

The 3d structure of chain d, cyclase subunit of imidazoleglycerol_evolvedcerolphosphate synthase
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
MLAKRIIAALIVKDGRVVKGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHGGAGKMEHFLEAFLAGADAAKANSVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Kemp elimination catalysts by computational enzyme design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclase subunit of imidazoleglycerol_evolvedcerolphosphate s
molecule tags Lyase
total genus 90
structure length 250
sequence length 250
ec nomenclature ec 4.1.3.-:
pdb deposition date 2007-10-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2rkxA00
3UWQA 3ZWTA 2QCCA 5F2GA 4O57A 1TMHA 4FO4A 4IPJA 3TW6A 1EIXA 3NZ1A 4OBTA 3IVSA 1H61A 2GOUA 2V9DA 5EL1A 4IMCA 3UZ5A 3IGUA 4CLMA 4MUZA 5H91A 1B4KA 5BRBA 3FFSA 1OYAA 4IXXA 2CZEA 4QIUA 5HINA 1NSJA 4MJMA 3LCWA 1GEQA 4HNNA 5FF0A 1WXJA 3S42A 1SO5A 4Q33A 2A1YA 1F6PA 5AHFA 2CLOA 3IRDA 4BF9A 1FUYA 1TREA 1OF8A 1BEUA 1JULA 2FQIA 2HTMA 1GG1A 1FCVA 3N3MA 3B0VC 2E77A 1KM2A 4BI6A 4U28A 4AMAA 5K9DA 5I3KA 1VLIA 4UFIA 3HPXA 5TBOA 1R2SA 2NX9A 3RF9A 4HHPA 4OV4A 1KFKA 3S0CA 1H63A 4R53A 4UR7A 4GNJA 3UXDA 3M16A 4NZFA 5HUPA 1RPXA 1LROA 3KFTA 2PE4A 5G4WA 3N19B 5HWMA 4FNRA 4KFNA 1WYIA 2V2DA 4UR8A 2TMDA 3LRKA 4R33A 4CCCA 1P5BA 2CLKA 5L6UA 3EXTA 1F73A 2C19A 4HN4A 4XKYA 1LLWA 3KVKA 2ZA2A 4Z08A 1OJXA 4PC8A 3WFAA 5HNRA 3QW4B 1ML1A 3QMRA 3DENA 3W6YA 2C18A 4JNMA 4RLIA 3L65A 4WX2A 1B57A 4BI5A 1QDSA 1Q45A 3A24A 3QZEA 5AOUA 4PODA 1YYAA 4GJ1A 1C29A 3W7OA 2JK2A 5BMWA 3B0PA 4A29A 1EP3A 1V5XA 3PUEA 3G8RA 4HSOA 2ZA1A 1R2RA 3R5EA 1HFBA 4U4MA 3W2JA 4K6AA 3VE7A 1DHPA 4S1FA 1SQ7A 4WZHA 4TO8A 2ZZ5A 5C54A 3LTSA 3HIJA 2AQWA 3M6YA 1LM1A 3NQ8A 2E6DA 4MKNA 1Z48A 5IBXA 4JR5A 4JTIA 1THFD 3HG2A 4LNYA 3LHTA 2RFGA 1QWGA 2CLMA 1TPEA 4JS3A 1GQNA 1JUEA 4YCOA 4RZ6A 2NWSA 4UTUA 2ABBA 4R7JA 1LRNA 2Z0IA 1TPB1 1D3GA 2V5BA 5F2MA 4M6VA 4UTJA 3Q94A 3LHZA 4IGHA 2VEIA 5K7JA 3PVFA 4O18A 5FEPA 3CU2A 3OHIA 4ZMGA 1KM1A 2NUYA 3B05A 3QMSA 3UWYA 3W7DA 4L4LA 4P2VA 5CPLA 1QO5A 3NVTA 3BGGA 2YZRA 2E5BA 2CLEA 1VJIA 3HG3A 3PSWA 2JKAA 2RDUA 3T4CA 5CZJA 3GX9A 2ZZ2A 3G1YA 4DXVA 4GXMA 4JIQA 3UXAA 1YLVA 3H54A 3W23A 4LC8A 1JR1A 5DCDA 1ZHAA 1I4NA 1PHQA 3W1PA 5G2IA 4OT7A 2CLLA 4CNNA 3CQ0A 3DI1A 4EIVA 4UMAA 1TRDA 3G0UA 5HR6A 3TU9A 3P5ZA 1JJKA 1VRDA 1XM3A 5LNSA 4BWLC 4Y90A 3M5VA 5D30A 3T55A 1FDZA 4O50A 3LBCA 3TSBA 3EXRA 3HQ1A 3O16A 4UIOA 4X3ZA 4ALDA 3GZ3A 3PB0A 2TYSA 5G1YA 1VYRA 3B06A 1YADA 3TFCA 1OF6A 4LC6A 1LOSA 3HOJA 3IIZA 3O05A 3G1XA 2V82A 1P4CA 3BG5A 1OX6A 2GQ8A 3I7RA 3TROA 3PULA 3T44A 3GDKA 2WNZA 4D2JA 5MHBA 3A21A 3HB9A 4UTWA 3P60A 1G4TA 1FCQA 3EEGA 5LHEA 1VS1A 3G24A 3FYPA 3KAOA 5HWNA 5D38A 3BW3A 5K9CA 3S9YA 4I7WA 4O1DA 2F7FA 4JTHA 2X2GA 1I2NA 3SECA 2JBMA 2A6LA 1YXCA 2TSYA 3N34A 5D05A 1W5MA 4LU0A 3C2EA 3MYPA 1SFJA 4QNWA 4MJZA 4IMGA 1AW1A 3LI1A 4NJJA 1XUZA 4O12A 3G0XA 4YLWA 4ZQMA 4AF0B 4UTMA 5GVJA 4KFOA 3G3DA 1ZNNA 1SUXA 2QCLA 3M41A 1QPQA 2HSAA 3P7YA 2AGKA 5DY3A 2Y70A 1JCXA 3M43A 1S5TA 4O11A 3CHVA 2EAWA 3W1TA 5HWJA 2JGQA 3S8HA 5C55A 4CNPA 5CKSA 2QCMA 3EWXA 2FIQA 3AO0A 4NNAA 3DZ1A 2ZRZA 4UFJA 3RLVA 2Y62A 3E9AA 2VEKA 3HG5A 5KSWA 5LHFA 1NEYA 3FS2A 3LRLA 3TR2A 3NQAA 3KHJA 3KXQA 5A8GA 3BLFA 5DN1A 1X1OA 4GBUA 1H7PA 2RH9A 4XTIA 1AW2A 4ML9A 2W0UA 4AAJA 5BNKA 3HGRA 1H7XA 5EMUA 5C5YA 2A4AA 4NXSA 3GLCA 1RD5A 1FQ0A 2QF7A 3BPWA 1LCOA 1MEHA 1EPXA 1LBMA 4NT0A 4LV9A 3LB0A 1SZGA 3PY2A 3H53A 5BMXA 4OV9A 3BK0A 1SW0A 5I3GA 5AB3A 1TV8A 4K7YA 3LXBA 1GTEA 1T99A 2ZZ7A 8TIMA 1OK4A 1TSIA 5K2ZA 4Z1AA 4AHPA 5SWUA 2GJNA 4JY9A 2NUWA 4XBKA 1UASA 1FCBA 1V7YA 3BARA 3U8GA 2Z2UA 3OIXA 1KTBA 5D32A 4K37A 2NXHA 2C16A 4MYAA 3IGXA 2WJZA 1F05A 3L0NA 4M7SA 3HJZA 1M7PA 1O60A 4NVTA 3TE9A 1YTEA 4AHQA 3IIXA 1VCFA 3TA6A 2OT0A 3KOFA 3UY7A 1YPIA 3C3NA 4LVDA 5EPDA 3E49A 4Z0JA 3F4WA 1EUNA 3LCFA 3DFOA 2QJIA 1IF2A 1HL2A 3MI2A 5J5RA 1JQXA 2DJLA 1W3IA 3LERA 3C2RA 5E1QA 3R12A 1A5AA 1SU5A 3G3MA 5CPOA 4UFMA 3KVLA 5CSSA 1VHCA 4C1KA 1B4EA 3GR7A 1HG3A 2QCFA 4NXKA 1UJPA 1GT8A 4NUWA 1XDMA 3O8AA 2I14A 2FFCA 3C0JA 1RV8A 2OCZA 3W88A 2DZPA 4IWWA 3A5VA 1LBLA 2BX7A 3P82A 3A23A 5D2VA 3NQGA 3CLMA 2Q8ZA 3QFEA 3WJXA 1HTIA 3IGSA 5D33A 4ZQCA 4UFLA 2TRSA 3KVMA 1K8ZA 1TPDA 1KBJA 4IX2A 2A0NA 2Q8LA 2J24A 1ICPA 2YW3A 2A7PA 3NQ7A 1ZJIA 2DORA 2CFFA 3QQ1A 5E0KA 4CQAA 2BTMA 4FNSA 2NX1A 4WXYA 3VKJA 3GKAA 2QCDB 2WOQA 3VE9A 3O6YX 3CC1A 1G7UA 1SFLA 2CLFA 3R13A 4JYDA 3V1PA 5AYYA 1T8XA 4RJEA 2VFEA 1LOQA 3I68A 4JD4A 1X1ZA 5AN7A 1SSDA 3STEA 1K02A 1DKWA 3LRMA 2CWNA 2V2HA 1JUBA 1WAUA 1TCDA 2WO5A 4LS2A 4K39A 4PCFA 1H7NA 1AL7A 4TMCA 3B04A 3IIOA 2XN0A 3QQ0A 3BGJA 1HO1A 2YXGA 3KRZA 4FNPA 3UPBA 1GJPA 3A9IA 1W5NA 1VLWA 3S1VA 4EVZA 2ZRXA 4WOQA 3GNNA 4FHAA 4FX7A 5HJLA 3IIPA 3UYCA 1S5VA 4EF8A 4KWWA 2XN2A 1KM5A 1L9WA 1TQXA 4Y9AA 4DBDA 1U83A 3PB2A 4JGDA 3TUUA 5HMSA 1GVRA 3NA8A 3P74A 2WQPA 1QOPA 1VC4A 4YL2A 2DZUA 4A21A 3W7HA 3N73A 3NG3A 1FDJA 1KA9F 3THAA 3NXFA 3LTPA 2C3ZA 5BW6A 1A5BA 1J4EA 2A85A 1OFOA 3S6DA 5KINA 1KFEA 3MUXA 4X9SA 1W5QA 5IM51 3OVRA 2ATMA 4NJIA 2NLIA 3O6CA 2WNNA 2JKEA 3PUDA 4R34A 2QJGA 3N2XA 1VQTA 3PF3A 1I2QA 3SGZA 5TQLA 4IUOA 4LV4A 2EGZA 1P0NA 3B8DA 3PG9A 2A7RA 1T0OA 2ZCGA 4PEKA 1QPNA 1H7WA 4XKYB 3P81A 4ORIA 3DKJA 3C52A 5LNWA 1Q6LA 2ZZ6A 4MZYA 3W72A 4MLJA 3SIZA 1NAL1 4RZ4A 2CLIA 4LUIA 4H4IA 2OJPA 1EP2A 4PH6A 1F76A 5I3FA 2Q3RA 1XBZA 1QR7A 1DORA 4K7VA 2ZZ3A 1H50A 5D2XA 2PRLA 1X6UA 3W22A 3TX9A 4HT3A 1TRIA 4LVFA 5LZLA 3C2OA 3ATYA 4JTTA 3S5NA 4ICNA 3EX3A 1FWNA 1ZY9A 4DBEA 5BOOA 1WQ5A 4AWTA 2FB2A 1QFEA 5AHMA 4GRSA 3MMTA 3I7QA 4CCDA 3ABQA 5K9XA 4JY8A 1J2WA 4JTFA 3MBFA 3R89A 4X2RA 1JRCA 2QUVA 3A5FA 3V75A 4UXDA 1IIGA 1TIMA 3C56A 1DQWA 2VELA 4M6PA 3WK0A 2A2IA 1XBVA 3TXVA 3IV3A 3BVJA 1EWDA 2PRHA 1JQVA 2ATSA 1FCUA 4KWVA 2NWRA 1Y0EA 1PS9A 5FEWA 1D3HA 4O0ZA 4JIPA 1KV8A 1JRBA 2VFIA 3HGSA 3UWVA 3W2NA 3GXPA 4YCPA 2DJXA 3MHFA 5AC6A 3FA5A 1ME8A 1VH7A 1ME7A 3EWZA 3ZWSA 1O95A 1O94A 4O1BA 3PBWA 3W7LA 1KTCA 1QOQA 3L2IA 1VPXA 4FNQA 4XWUA 1OHLA 3ABSA 3JS3A 2OMAA 1UBSA 2GVJA 4A22A 3HO8A 1F7BA 5KZDA 2X30A 1SSGA 2FTPA 4WD0A 2WNQA 2ZYFA 1YDOA 5EKYA 5D03A 5E93A 1O5KA 3DHFA 1KM0A 3OBKA 2NUXA 3TJLA 5F1UA 1OFEA 4LUJA 1CX9A 3CWNA 3M5YA 1A50A 4JDYA 4OQVA 1X8FA 1C9DA 1JCMP 3PR2A 3TMQA 5C2XA 2E6AA 3LBMA 5FI8A 3U2OA 5F4XA 3UQNA 1TPFA 4H3DA 4B5NA 2QUUA 2YDAA 4O53A 2W6RA 4E38A 1G67A 1KLYA 4FNTA 1WA3A 1AMKA 1GYNA 4IMEA 2A7NA 5F4WA 4LT9A 4GUIA 5DY2A 2J9XA 3TQVA 2XN1A 3FJ6A 3W74A 1WBHA 4JN6A 3VI2A 4OHQA 4RXGA 1OFQA 4Z0SA 5HUOA 2DZSA 1H7OA 4MYXA 3EX1A 4I7VA 1XBYA 4UTTA 4N6FA 2HS6A 1GPWA 1TPWA 1WX0A 3I7SA 4YWIA 4MY1A 3LGEA 4IMDA 2DP3A 1H1YA 2WV8A 1KFCA 3QH2A 2YSWA 4JXCA 1G69A 3F1QA 1KM3A 2GPTA 3BW4A 3LCGA 2Y88A 5AHEA 4O15A 2G97A 1EX5A 3SGUA 2YR1A 3FOKA 3B4UA 4QQ3A 2YW4A 2PURA 4JTLA 3W7MA 2G5WA 5DXYA 3KVJA 3GVGA 4HNTA 2R14A 5L9FA 1XL9A 3TSMA 3L9CA 3VCRA 4GC4A 1QPOA 5G4EA 3W7KA 3ZR4A 1EA0A 2VXNA 4NJHA 3W1QA 3CTLA 1FWTA 2ZA3A 1YDNA 3W1MA 1F2JA 1NF0A 3QSTA 3HPSA 3PAJA 2BZNA 5F1VA 3GAKA 3IEBA 4NNBA 3ELFA 3F03K 4CCEA 2H8XA 4O17A 2VC6A 3LX9A 4N4PA 1O4UA 1TV7A 1SO4A 1XKYA 3NM1A 3Q58A 1FWSA 3NGJA 3GR8A 4ADTA 3TFXA 4RR4A 1H62A 3BV4A 3L5MA 3S5OA 4DQWA 1XDLA 1CI1A 1OX4B 5HQEA 2O7QA 3DBPA 4Z1CA 3NR0A 4GUGA 3L0GA 2WSYA 4XQ6A 3G1SA 1W31A 4QSHA 1JCJA 4DO5A 3NL3A 1TPC1 2DZVA 1TPVA 1I2PA 3TKFA 3BG9A 1VYSX 3M0ZA 1R30A 4MVAA 1BWLA 3NQMA 2QUTA 1Q6RA 3GNDA 4GUHA 4O54A 2YYUA 4FXSA 4OGZA 1PHWA 2B7OA 3TDFA 3GDMA 1I2OA 4ZL1A 6TIMA 4I9AA 4JTUA 3NM3A 3P8JA 1L6WA 3CT7A 4P61A 4XUGA 1M6JA 1W8SA 4JTJA 1XC4A 4AVFA 3N2MA 3S1XA 1LRTA 1OYCA 1FX6A 3SFKA 5D02A 1PV8A 3P61A 1YXDA 1I2RA 3RU6A 5K4XA 3G22A 4FXRA 2VFHA 4IXHA 3T78A 3I6RA 4PL1A 1IXOA 3N9RA 3W75A 3O1NA 4JTGA 2YPIA 3LLDA 1N7KA 3L66A 1NF7A 3TMLA 3E12A 2UV8G 1TPUA 5C6MA 2FPVA 2ZZ4A 2CW6A 3INPA 1GWJA 3CB8A 4QM1A 5EA9A 1KFBA 1OFPA 4JTEA 1YXYA 1L6SA 2AAMA 3LI0A 4DELA 4LW7A 2X1TA 4WXZA 3A22A 3O06A 3Q2DA 3EXSA 3P5YA 1J5TA 4QITA 4GE8A 2JGYA 4HSNA 4RX0A 2Y7FA 3LV6A 4K8EA 1GVQA 3GB6A 1BWKA 4AWUA 1OFAA 3MP5A 1KBIA 4RCXA 4UNLA 1QCWA 4PA8A 5F2IA 3MYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5F2G A;  1UIO A;  3QTG A;  1TMH A;  1XII A;  3QY7 A;  5H8U A;  4A3R A;  4AY1 A;  2OZ3 A;  4B5U A;  3UZ5 A;  3IGU A;  1FWA C;  3ZJ7 A;  3MUY 1;  1XYB A;  4MUZ A;  5ABF A;  5EGR A;  1QI2 A;  3LQL A;  2CZE A;  3OQ8 A;  4QIU A;  3B8S A;  1NSJ A;  4P7L A;  2YLL A;  2AQV A;  5FF0 A;  2Y0F A;  2B81 A;  3IGH X;  2A1Y A;  3TWB A;  2OVL A;  4O8A A;  4GCA A;  3APT A;  5TF0 A;  2VX7 A;  1XIH A;  2E77 A;  2YA0 A;  4AMA A;  3WBX A;  1EO5 A;  2XVG A;  4B5S A;  1CGX A;  1HL9 A;  4AY7 A;  3S0C A;  4UR7 A;  2HK1 A;  1RPX A;  1LRO A;  3KFT A;  2PE4 A;  2Y4S A;  3HZ3 A;  4UQD A;  2PU0 A;  1ZGD A;  4UR8 A;  3KLK A;  4A4A A;  4R33 A;  1K77 A;  4F0H A;  1P5B A;  3T81 A;  3EXT A;  1F73 A;  1Q7Z A;  3AOF A;  4XKY A;  5A95 A;  4Z08 A;  3E0F A;  5FIP A;  3S9I A;  3WFA A;  3QW4 B;  4PB5 A;  4RLI A;  4GZI A;  1V3M A;  3SCU A;  2FZM A;  4EAY A;  4GJ1 A;  2HDJ A;  1C29 A;  3K8L A;  1O66 A;  1EP3 A;  1VJZ A;  3PUE A;  2INE A;  3G8R A;  4HSO A;  3U9I A;  4XUY A;  1R2R A;  1HFB A;  3W2J A;  1LJY A;  3ZIZ A;  3KS6 A;  1SQ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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