2TRSA

Crystal structures of mutant (betak87t) tryptophan synthase alpha2 beta2 complex with ligands bound to the active sites of the alpha and beta subunits reveal ligand-induced conformational changes
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
268
structure length
262
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a mutant (betaK87T) tryptophan synthase alpha2beta2 complex with ligands bound to the active sites of the alpha- and beta-subunits reveal ligand-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 93
structure length 262
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1997-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2trsA00
3CT7A 1TQJA 5FEWA 1ZAJA 3VCRA 4IMGA 3PR2A 4A22A 3DBPA 2CLEA 1KFJA 1TPEA 4JNMA 2CLHA 1P4CA 1PVNA 5IM51 5IBXA 4S2BA 3FLUA 2W0UA 4UXDA 5DBTA 2OZ0A 3NQ8A 4E38A 1AMKA 3W2LA 2YGYA 3F1QA 5LGZA 1LOLA 2E6FA 3P60A 4CQ9A 3C3NA 3G3MA 3S0CA 2Y70A 3DZ1A 1PE1A 3BW2A 5TIMA 3P80A 2J24A 1W54A 2BTMA 5T26A 1DOSA 3IGXA 1WBJA 2E1DA 5C54A 1SZNA 1OFAA 3GZ3A 4EVZA 3NL2A 3MBDA 3DXIA 1W1ZA 1SSGA 4DF2A 4ZQRA 3OA3A 4OV9A 4ADSA 1B9BA 3HQ1A 1TREA 2TRSA 2C3ZA 3E9AA 4FIQA 1XBYA 2ZRWA 2H6RA 3G1YA 3B03A 4WZHA 3EXSA 1K8XA 1XBVA 1LDCA 2UV8G 2VEMA 4GUHA 3GKAA 2FPYA 4ZQPA 1W5QA 4FNUA 5FF2A 3L0GA 3QMTA 1NVMA 1D3GA 4GFSA 2X1UA 3RNDA 1LOQA 1I2NA 3NGJA 2JK2A 4A21A 1OVDA 3PULA 5CZSA 3P74A 1S5WA 2FPVA 2R91A 2ZZ3A 3W7JA 5I3FA 3LXBA 1TTIA 3NM3A 3W7MA 1JULA 3CM4A 3LM7A 4CCDA 3F03K 4JD4A 4OBTA 2QCGA 4NJGA 1Q6OA 3W7NA 1IIHA 4MZ1A 3BG9A 1I8JA 2CLMA 3TAKA 2GJLA 4UNKA 2JKEA 1QO5A 5LHEA 3DKLA 1GVQA 1A5BA 5CZTA 1F74A 3NQCA 3W1UA 4Y8FA 1W3IA 1JRCA 4AHPA 2RHGA 2WV8A 2I9EA 1KA9F 4WY0A 5G1YA 3P8JA 2GVJA 4MLRA 4JY9A 3FYPA 3M5VA 2E68A 4AVFA 4AWUA 4MUZA 5F1UA 5U4NA 1UB3A 2QCDB 3E96A 2Q3RA 4O54A 3TMQA 3FOKA 3P62A 3LCGA 1OF6A 4NNAA 4FNRA 1TRDA 2G5WA 2E5BA 3PC0A 5HR7A 3CWNA 5AHLA 5KZEA 4ORMA 3NXFA 3NPXA 1K03A 1YXYA 3HOJA 4GC4A 3F4WA 4RLIA 1XM3A 4ORIA 5HUPA 3KHJA 1PV8A 1H60A 1MO0A 3TJXA 3M41A 4YLWA 2CFFA 4O13A 1HL2A 1EB3A 4O11A 1QCWA 1NF7A 3T78A 3TSDA 4GWEA 3FKKA 1W5NA 1FCVA 3W6YA 1LP6A 3BK0A 1SO4A 1TPDA 1N8FA 2PRHA 1OK6A 2O7SA 4UTIA 2A85A 1BWKA 2A7RA 4TMCA 3FS2A 3L5LA 3NQFA 3QQ1A 3DU0A 1EIXA 2EAWA 4UFMA 3OEXA 5F2IA 3DGRA 1F73A 3HO8A 3MJYA 4ICNA 3O15A 4IWWA 3CWOX 5ABTA 3HPZA 4WXZA 3LGEA 2TYSA 2Q3OA 1DVJA 3L5MA 4JY8A 4DO4A 4Q33A 1RQEA 3GVGA 4QIUA 1C8VA 3KVLA 1G4TA 2DZTA 4E2BA 2A7NA 3W7RA 1J5TA 2WJZA 1HTIA 5D37A 1QR7A 1FWNA 5KZDA 3NQ6A 2HS8A 1TPUA 4O1BA 2QDHA 4WD0A 2FLIA 2QDGA 1EWEA 4NNBA 4N4QA 3GXTA 2JGQA 3K30A 1OX6A 1SW3A 3W1PA 2I1OA 2B0MA 1FDYA 4NU7A 3I7QA 3NNTA 1IGSA 2E6DA 3E02A 1WOAA 3H53A 4QITA 4N9CA 3W2UA 3N2MA 2B7PA 3QSTA 4M19A 3W73A 4EWND 2JKAA 5C6MA 2NUWA 1IXNA 3MWAA 2ISVA 3GAYA 3QRHA 4D2JA 4AXKA 3UPWA 2RDTA 5BMXA 1YDNA 2VXNA 3OG3A 4IX0A 4HIBA 2C13A 3MYOA 1L6WA 1T0OA 3KXQA 1X1OA 3S5YA 1NAL1 3DH7A 2CZ5A 5CZ0A 3C52A 1TV7A 3T40A 4AEOA 1A5SA 3CTLA 5F4SA 3ABOA 2CLLA 1EA0A 1T8XA 3W7OA 1W5MA 1PHQA 4UTMA 3SW6A 5FF0A 1AL8A 2J9YA 4JIQA 5DXXA 4U28A 2OT0A 2FB2A 4JTHA 5CG7A 1Q6RA 3GK0A 2BX7A 4UTUA 3L67A 4ZVJA 3GYEA 1T96A 4X2RA 5C2XA 1ZFJA 4AWTA 4H6KA 1SU5A 7TIMA 1LTDA 3G1AA 2VFEA 3EWXA 2Y63A 1E51A 4AB4A 1JR1A 3B0UX 2YPIA 3MHGA 1W5PA 4NJIA 5HQEA 1ZENA 3L0NA 2AQWA 2ZA2A 4Z1AA 3LRKA 5LNWA 2A6NA 4DXVA 1VLWA 1F05A 3HJZA 2G95A 3PUEA 3C8FA 4WY0B 1LRNA 1W3NA 2CU0A 1O5XA 2BWGA 3W1MA 3SR7A 4K39A 1TV5A 3TR2A 1HG3A 1TO3A 2RKXA 3W7DA 4FX8A 3FFSA 1KM5A 3C2FA 1GG0A 3ABSA 3HGOA 1FCQA 3BLEA 4JX5A 1G69A 1JCJA 1QPOA 3M5XA 4YL2A 1AW5A 1KV8A 3IIZA 5GVJA 4MY1A 1VC4A 2YXGA 4G1KA 2Y62A 3NL5A 3EWUA 4FEZA 3FJLA 2WSRA 1AG1O 4WJEA 1ICQA 4JTLA 1QNVA 2X30A 3DHDA 5A5WA 4BF9A 4O17A 2BXVA 5AOUA 3CEPA 5AHFA 1TYGA 1FWRA 5KSWA 1G7VA 4IJBA 1L2UA 3UWZA 3I6RA 1LORA 3SSJA 3S5OA 3VE9A 4Y6GA 3LCLA 3U6WA 5AC8A 3TC6A 1M5WA 3ANYA 1Y0EA 4QNEA 2EHHA 1OFBA 3CLMA 1Q3NA 1R30A 3Q2DA 2Q8ZA 3WJZA 4RXGA 3A22A 2C18A 1GJPA 3L68A 4GUIA 4PEKA 3U2OA 3LERA 5K9CA 3EWBX 1TPFA 1G7UA 4O1DA 1TCDA 4NT0A 3PBWA 3G1XA 2Y7FA 4U4MA 5SWUA 2NX3A 3S5ZA 3PM6A 3GKFA 3OVRA 1Z48A 3KX6A 2FDSA 3MP3A 6TIMA 3W87A 3W1TA 4RXFA 2GQ9A 4JR5A 3CIXA 3W9ZA 3BPWA 2FPTA 1KBJA 1XFBA 4OGZA 4N9BA 2DZSA 3KVJA 4OT7A 4RCXA 1ZAHA 1DKWA 3HF3A 3NAVA 1UUOA 1WV2A 4DELA 1H7PA 1OFEA 1ZHAA 2YDAA 3BLIA 2YW4A 3UXAA 2NZLA 1QOPA 1H62A 5C55A 1LLWA 3OVQA 3G1SA 1H1ZA 3L2IA 2DZXA 3HGRA 2RFGA 3UPBA 3E0IA 4A2RA 3W1LA 1TTPA 1TJPA 3MMTA 4DBDA 5D03A 1GYLA 1OF8A 1JUKA 4IMDA 4QAIA 4JTUA 5CSRA 1FCUA 3NPWA 2YR1A 4MYAA 3P7YA 1VJIA 1Z44A 5KTLA 4TIMA 1GWJA 1H7RA 1SO3A 1KW1A 3G24A 1FXQA 3O63A 4HPXA 5DBUA 2W6RA 3C56A 1W3TA 4CQAA 3O16A 1UBSA 5AB3A 2ZTKA 3SGUA 3DI1A 4JX4A 3THQA 2A21A 3N19B 1SO6A 1G4SA 3T44A 4M6PA 5D02A 2V2HA 1S3HA 2YZRA 1B57A 3NQMA 1WA3A 1GTHA 3DENA 3SI9A 1R2TA 2KZHA 3HPSA 3NVTA 2ZA3A 1O94A 3BW3A 2ZFAA 2FTPA 2PURA 4FXSA 5FI8A 1XI3A 3IGSA 2Y61A 3NQDA 1YXCA 1TMHA 4KFPA 1IXQA 1I4NA 4ADUA 2OT1A 2XN0A 4TU1A 3G18A 3NA8A 3OBKA 4QISA 3DFTA 4O50A 5EBUA 2W79A 2B7NA 1C9DA 3RF9A 3ZWSA 4MY8A 3W88A 5HINA 1S5VA 4IGHA 1SFLA 3WJSA 2X1TA 1PHWA 5AN7A 1YPIA 2NXHA 3RK8A 3PUOA 1Q45A 4NZJA 3RLUA 1SPQA 1HFBA 1TSIA 2CWNA 1MEWA 4BI7A 3G1VA 1AK5A 3GDRA 3EX6A 4YWIA 3C2RA 4EIVA 1M6JA 4LVFA 4QSHA 1KM1A 3BGGA 2NUXA 1EP2A 3FA5A 3S1VA 5BRBA 3PBVA 4IPIA 3T4CA 2V8ZA 3MYPA 3NZ1A 1SW7A 3JR2A 3SFKA 4DPQA 2OX1A 3R12A 3ZS4A 4NXSA 3TQKA 3C2EA 2V9DA 2I14A 3B06A 4I7VA 3CHVA 3G1FA 1KTNA 4FNQA 4BR1A 1ME9A 3MI2A 2E5CA 4HNTA 3HG2A 1G4EA 3EKZA 4YCPA 3GLCA 1EEPA 2GPTA 5J5DA 1SR9A 2XFWA 3PF3A 2HSAA 4WXYA 3C61A 3L0KA 3Q37A 3L9CA 2A1YA 3HIJA 2TMDA 3G8EA 1OX5A 4CQ8A 4O52A 2ALDA 5K4XA 1K8ZA 5AHNA 1XCFA 1PS9A 4DO5A 1BWLA 4O8RA 1EX5A 1P0KA 5KITA 3P8IA 3ATYA 1P0NA 3EX2A 1SO5A 3QFEA 3QQ0A 3IVSA 1VR6A 2VEKA 2ZRZA 1WQ5A 4HSOA 3EWZA 3STGA 3NPVA 3FEMA 3LXAA 1Z42A 1J2WA 1GVOA 2WNNA 3IEBA 3LV6A 3NOEA 3NL6A 2C0AA 1DQXA 3TSBA 2B4GA 1H7XA 3O6DA 3LHZA 2ZCGA 4O4WA 3GNDA 3NYZA 1A5CA 3KVMA 4JICA 1SZGA 4LY8A 4UC5A 4MPQA 3GDMA 4CNPA 4MFEA 4XWUA 4ZQNA 3ABQA 3BV4A 3QM3A 4UNLA 4O12A 3C2VA 1F6PA 5BW6A 4HPJA 5G4WA 1K7EA 4Z0SA 4BI5A 3QF0A 3NQ2A 1H7OA 2WSYA 3PSVA 5HULA 1H61A 3TXZA 1ZALA 3LBMA 3PB0A 2VFHA 5A8GA 3SECA 3NZRA 2DZWA 5D38A 4N4PA 4Y9AA 3DFSA 1JRBA 3TW7A 3LLDA 5CZJA 3S1UA 2NLIA 1VHCA 1NF0A 2A2IA 2Y7DA 2Z1BA 5H91A 3USBA 1VQTA 3W1AA 1R2SA 4C1LA 4R33A 1UASA 2QCFA 4MIMA 3W23A 3ZR4A 5HNRA 3B8DA 3STEA 4JTFA 3I65A 4UTWC 1GOXA 3W86A 3UWVA 5K9DA 1LBLA 1XDLA 2Y6ZA 3TROA 4O18A 3W7KA 4M7SA 3TXVA 1ALDA 3WK3A 4K38A 3CIWA 4ONVA 5G2HA 1W8SA 3N34A 2ISSA 1B4KA 1EPXA 1BEUA 4ZQMA 4Z0JA 3MHUA 1LBMA 4UIOA 4K37A 1TTJA 1NFBA 2GVLA 5J5RA 2DJXA 1B4EA 5FEZA 1H63A 1GG1A 3G3DA 1VYSX 3LCFA 5CPOA 1K7XA 1S5TA 2WSQA 3TU9A 3NEVA 1KTCA 2ZRYA 5CSSA 4K7VA 1RV8A 1OFRA 3M44A 4OWGA 3ZFHA 3NDOA 2WO5A 3IIXA 5HJLA 1EWDA 5G4EA 3M7WA 1KFCA 3NQ7A 4PA8A 2YYUA 3TIMA 2FB3A 4NJHA 1W0MA 1D3HA 3GB6A 3W84A 3TUUA 2PC4A 2E5DA 4JDYA 3TC7A 1J4EA 3MUXA 4JYFA 3UWWA 1A53A 3SZ8A 1G6CA 1H51A 3P5ZA 1CI1A 4QQ3A 5TBOA 3G0XA 1KM4A 2ZZ2A 1H1YA 3EXTA 2ZRXA 5FEPA 4GBUA 3HPXA 2VFIA 3DKJA 2QUTA 1R47A 3CEUA 1JCXA 4JTIA 3RLVA 1X6UA 3E49A 1I2PA 1VZWA 1P5BA 3EWWA 1DQWA 1OYAA 2P0OA 3OIXA 1BTMA 5FF7A 3TDFA 3IVUA 4OU1A 4HSNA 4LC8A 1VYRA 4P61A 1XKYA 4FB7A 3TMLA 3WFAA 2R14A 2VFFA 1TTQA 5AHIA 3BG3A 1GVSA 4JEQA 3PBUA 6ALDA 2FFCA 1SQ7A 3LBCA 2ZRVA 3QYQA 3VFLA 1H50A 1YPFA 1GPWA 3LHWA 3GXPA 4LOCA 1YADA 3LTPA 5CPLA 4KFNA 4RZ5A 1AW1A 4NX5A 4FNTA 5D2WA 1D9EA 1N55A 1GT8A 1Z41A 1UCWA 3A9IA 4MVAA 3Q58A 1K8YA 3O07A 4LVAA 2GOUA 4GRSA 1KLZA 3TFXA 3G22A 5LZLA 1PCWA 2WNQA 2EF9A 2VEPA 3W2NA 4EF8A 5DXYA 3VE7A 2V2CA 4K8EA 4PTNA 2V5BA 4E0CA 4K36A 3UY7A 5LNRA 3UZ5A 1B3OA 3MP5A 4KWVA 1A5AA 5LSMA 4LS0A 1JQXA 4GNJA 3LXCA 4QM1A 2ZZ7A 1KLYA 2V0TA 3BVJA 4O1AA 3TK7A 1DJNA 2J88A 1JJKA 3A21A 1RQHA 3TQ0A 3N2XA 3LCWA 3UZJA 2VC6A 2ZA1A 2G96A 4HN4A 3W85A 3MW7A 4WQ6A 3VI2A 1KV5A 2BSLA 5D09A 3PS7A 4KFOA 4JYDA 4AMAA 1Q6LA 2ATSA 3UYCA 3G8RA 3EWYA 1K02A 1KTBA 1ZAIA 4LRSA 4UTHA 3MI6A 1FBAA 1ZJIA 2GVGA 1GQNA 1G67A 4WX2A 4UTWA 2VFDA 4JTKA 4OE7A 4YCOA 5D04C 4FNSA 2CZDA 2TPSA 1MEIA 2NV2A 3TKFA 2H3BA 3GAKA 3W7HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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