2V3G | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	273
structure length	273
Chain Sequence	GLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	D-Glucosylated Derivatives of Isofagomine and Noeuromycin and Their Potential as Inhibitors of Beta-Glycoside Hydrolases rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE H
molecule tags	Hydrolase
source organism	Clostridium thermocellum
total genus	110
structure length	273
sequence length	273
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2007-06-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02156	Glyco_hydro_26	Glycosyl hydrolase family 26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2v3gA00

1QBAA 4QFUA 2D0HA 3WDPP 4JFUA 4J3TA 1DWJM 3AIBA 4PMRA 1H11A 4D6FA 5DEZA 1LLOA 3A47A 2EPLX 4AC1X 4L4PA 1VIWA 2CEQA 1WDQA 3KEHA 1M03A 2V3EA 4AD1A 4QCFA 5CGMA 4OIFA 2GFTA 5EBAA 3VM5A 2X0HA 1IV8A 1HJXA 2J79A 1BTCA 1ISWA 5D8ZA 1CIUA 2E9BA 2VZVA 5DT7A 2ZUWA 1Y7VA 1GJWA 1RPKA 3K4AA 4P7RA 2J7FA 1JYXA 4ACYA 1H41A 5BROA 1OIFA 2E3ZA 4MNMA 3MSGA 3AZSA 2ZIDA 3ARWA 3MKKA 3W38A 1JGIA 2CNCA 1ITXA 2ZXAA 3OIHA 3WEMA 2DGAA 3AFBA 1BG9A 3ARSA 4JHZA 3VOCA 1WB0A 1ZL1A 4UQ9A 1XRVA 4KWUA 4WLCA 1NWRA 2WNWA 5FL1A 3W37A 2NT0A 2X05A 2J7DA 3AIWA 1TCMA 3VD9A 3WD4A 4AD2A 2X09A 2VQTA 5M17A 3D5HA 1V6XA 4UQEA 3T0BA 4NZCA 4B16A 2D0GA 2WZEA 4B15A 3MMDA 2JF7A 2GK1B 3T2PA 1BPLB 2W61A 1CDGA 2E4TA 4D6IA 3WF4A 4PRWA 4PEEA 2FDMA 1UR4A 1DWHM 1NWTA 1VFFA 3L4TA 1C91A 1GOIA 3AMKA 2BHUA 3THDA 4F79A 3ARUA 1TVPA 5KEZA 5A2CA 5E09A 2WWCA 4C7DA 2ZX7A 5FCZA 5EFFA 4S3KA 4AZCB 2YL5A 4FK9A 5D9PA 1UKQA 5A2BA 1FP9A 4PMDA 2PWFA 2ZUVA 1W91A 3SIMA 1VRXA 1CZ1A 3RMEA 4M24A 2QPUA 3GYCA 2OSXA 4UFIA 4M80A 4ZEPA 5HPOA 1E43A 3UR7A 1E40A 1J12A 2X1IA 3SCSA 3KWXA 2WB5A 4W8BA 1A47A 2G3MA 3W26A 2DSVA 1VENA 1HJVA 2ZUSA 4NRSA 1TVNA 1HJUA 1BF2A 1UD8A 2Y24A 4MADA 4LXFA 2WVVA 2VZTA 4GO9A 3G6LA 4OZOA 4HTYA 3SUVA 1JIBA 4UOJA 1ECEA 1C7TA 2BY0A 1G0CA 5CLTA 5BRPA 9CGTA 3AHYA 2XGBA 3WH8A 1NQ6A 3VTRA 1JYWA 1JAEA 5CZKA 4JIEA 1J11A 5ABGA 4B9ZA 4MJ2A 3TOPA 1UD6A 1BYCA 1UH4A 1W9VA 3K46A 3NDYA 3BSGA 2CIPA 1TR1A 2YIHA 2BS9A 2DIEA 5D4YA 1V3IA 4PMNA 4AISA 3A4XA 3WNKA 3WN6A 2XTKA 3B9DA 2PWEA 1QW8A 4UFLA 1MW3A 4JCMA 3VIFA 5HPCA 1JYVA 1UKSA 2WHJA 1DTUA 2JEQA 4W88A 1BSIA 4N0RA 5A6KA 4W5ZA 3OG2A 1X1NA 4DUXA 1W1YA 3AHTA 3CZ8A 1V6WA 1E6XM 1ISZA 1CGYA 3GXFA 1YQ2A 3T2OA 4XV0A 3J7HA 3SCOA 5DFAA 5M5DA 1KQZA 3S2CA 1MW1A 3WDJA 4P7LA 2EQDA 2WLYA 1HF6A 2VMFA 4OOUA 2YDQA 4UQBA 3QHOA 5FKYA 4P8VA 1JI1A 4W7VA 2TAAA 3W81A 5ABEA 2GVYA 1B9ZA 1Q6EA 1Q4NX 1EQPA 1HX0A 4V2XA 2V3FA 3UEQA 3GH4A 4CCEA 4CCCA 1MXDA 4Q22A 3BGAA 2VR4A 2CETA 3A6OA 1J0YA 4MPKA 3WD1A 3OGVA 2J7CA 2DSKA 4HA3A 1A3HA 1E6PA 3VIMA 3WKZA 4R5EA 4JAWA 2VVNA 3BXWA 3GM8A 4F8XA 5JIPA 3GNOA 2XUCA 2XVKA 2WYSA 3OA5A 3VIGA 2YJQA 1TA3B 2GJPA 1UR8A 3ECQA 1WZMA 3HJEA 1LWHA 3W29A 3EDJA 2DSWA 4IM4A 2V38A 2A3AA 1H4PA 1EGZA 4FLQA 4Q7NA 4M29A 3WH6A 1QNOA 2VZUA 3QHMA 1GVYA 4D6EA 2ESCA 3MMUA 2WC4A 3FNDA 4KRUA 1E4MM 1QW9A 1CXIA 8CGTA 1MWOA 5JBEA 1KBBA 2DIJA 3W28A 3AZRA 1UR2A 1UWRA 3WL1A 3ZJ8A 1RD6A 4M81A 4MB5A 5FIPA 4HU8A 1Q6DA 2F61A 1KGXA 1ZJAA 4UZUA 1GOQA 1BAGA 1MYRA 3BAIA 3O9NA 5JUVA 1CTNA 3MV11 4OBSA 3ARYA 5IHSA 4PN2A 3WH7A 3B9AA 4J28A 4BZYA 4ZXOA 4MAVA 3CZGA 2WXDM 1FFRA 3SUSA 4UCFA 2J8FA 4LPCA 1V02A 1UZ1A 5I2UA 3NCOA 4GIAA 5EMYA 1QOXA 1HP5A 1L0PA 3N18A 1EHAA 4U2YA 5AC5A 3NSNA 4E8DA 1BYBA 2G41A 2VQUA 1W1PA 3RILA 4YHGA 4OJYA 4LQ1A 1CECA 5E70A 3U57A 3EDEA 3N11A 3AQUA 2XWEA 2VX6A 3OGSA 2WCGA 4QDMA 2XFYA 2PB1A 4M8UA 4GZEA 1EDGA 3ZJ6A 1Q6CA 1W9DM 3IK2A 1OINA 2XM1A 1XD1A 3ARRA 1MXGA 1C8XA 2XPKA 4PTMA 2IXVA 1UKOA 2BHYA 1JF5A 2E9MA 1WZLA 4HMDA 4WKFA 1ZS2A 2XIIA 4F66A 1GOMA 3AMLA 1G01A 4UZSA 2Y4SA 2ZX5A 4KGJA 2W91A 2CKRA 2XYLA 3WQ4A 5A94A 1BHGA 2FHBA 1XCWA 1HKKA 1K6AA 5JBFA 1SMDA 1UD2A 4AMCA 3K8LA 2WK2A 4MDPA 1EOMA 2YLLA 1JZ6A 5I24A 3RM8A 4AWEA 4BQ4A 1C3FA 1HN1A 3DC0A 4JFSA 1OB0A 3KL0A 1BGAA 1V3KA 1W1VA 2QF8A 3IANA 3KL5A 4JZ5A 2VRKA 4PUEA 3I3EA 2ZX9A 1F4HA 3O2LA 4BQ3A 3RM4A 2BY2A 3WDQA 4MTVA 1L8NA 1DWAM 4HP5A 3UR8A 4PCSA 2J25A 2VX4A 1IT0A 5GNYA 1GNXA 2J47A 4QLLA 4BS0A 1BVZA 1DWGM 3IAQA 4HOWA 4HZ8A 3T0AA 2GJXA 4TXEA 4W86A 1KGUA 4TOQA 3SCUA 2CBIA 1OGGA 3VIOA 4J3SA 2V3GA 1GVIA 3PZNA 2XWDA 4J7RA 1WCGA 1OGSA 4YHEA 4ZE4A 3POHA 2WHKA 2VCCA 3F5LA 1D3CA 2XGIA 1FHDA 1C7SA 4GZJA 3PZGA 1EDTA 3VGHA 1OGBA 1BYAA 3BCFA 1W9XA 1J01A 4CN1A 3AHXA 1CWYA 2XFFA 2W62A 1J10A 3BLPX 3VM7A 3VMNA 1OT1A 1KCLA 2D0FA 2YDRA 3CLWA 4V28A 3ALGA 1WP6A 5CSUA 4MB1A 1QI2A 1VFMA 1AQ0A 3L2LA 5CQ1A 3PBGA 1HJWA 3W6LA 3GZAA 1QBBA 1I75A 1XSJA 4IPLA 3MS8A 3VKKA 1XSIA 2EJ1A 4J3XA 1FH8A 2ZXQA 3TP4A 3A4AA 1GOOA 4B3LA 2DQXA 1OD8A 3MANA 4W5UA 3ARPA 1HJSA 1QNPA 4CVUA 1CEOA 1M7XA 4JL2A 5A6LA 1KR1A 2DT2A 1HXJA 3ARZA 1V6VA 4AZ7A 5KZ6A 2D2OA 1V3MA 1E6QM 4AIOA 1ISYA 2YDSA 4D1JA 5IXEA 3WUGA 3CUIA 4H8VA 3WD0A 1CGUA 4ACZA 3PZMA 2Y8VA 3GDBA 4CU6A 4D72A 4W84A 4D6DA 3RJYA 3ARQA 2O9OA 1E1EA 2DPEA 4H7VA 3QR3A 3WF0A 1ZJBA 3RJXA 2WC7A 1VFOA 1PX8A 2ZUNA 5M03A 4NRRA 3AYRA 3AXHA 2VTFA 2XSBA 3U7BA 2QMKA 2VCAA 3ZQ9A 4U5KA 3N04A 2WANA 1BVNP 2VURA 1H3GA 4GXPA 3ZIZA 2IUZA 1XSKA 5AY7A 1G94A 3VNZA 4FLSA 5GNZA 4A3YA 4CN6A 2UY5A 2WW5A 3VD4A 2O9TA 5F7UA 1UWQA 3RPMA 5AYBA 2WCSA 4LYQA 2OWCA 1TUXA 1MVYA 4AIEA 4TVDA 1VEPA 1JZ3A 4TUFA 3DHUA 4DWSA 1XD0A 2YL8A 1JZ4A 1QI3A 5JBDA 2BHZA 2Y2WA 1E1FA 3IJ8A 1GORA 4Z2HA 3N9KA 4AEFA 2ZXDA 3AIUA 1WAWA 2AMGA 2ZOXA 5I0DA 3ZMRA 2HVMA 4JKMA 2XJ7A 2YL9A 2QLYA 5CPQA 1US3A 1D2KA 1NOWA 2WKGA 1UQYA 3T2QA 1BGGA 3T0DA 2OWXA 3ZM8A 2OWWA 4WF7A 1W1TA 3W82A 1V0NA 2XHYA 1MW2A 3PN8A 1ZBWA 3BMVA 1MFUA 4ATDA 4CD4A 3CPUA 2QV4A 4F9DA 3SCVA 4P7NA 1LL7A 1R7AA 1HIZA 1GZJA 1UWIA 3IJ9A 4AIUA 2O92A 2G3JA 1SR0A 4MB3A 2PBOA 1WZAA 2ZWZA 1ZU8A 2UY4A 5GPRA 4X9YA 3WF1A 4M1RA 1HKMA 1E56A 2EPNA 4J3VA 3AXXA 1B3ZA 1JFXA 2CBJA 1QNRA 2F8QA 5EB8A 1CBGA 3NUKA 4Z2IA 2IXUA 4LGXA 2VC9A 4EKJA 6TAAA 3QOMA 5I5RA 2XVPA 1B3WA 1VFUA 5C8BB 5DMYA 4A3HA 1GCYA 1BFNA 1QHZA 2VRJA 1XYZA 3CMGA 3WMSA 1E6ZA 3NSMA 1QVBA 5CJ5A 3I3DA 1OT2A 1OM0A 5A6BA 1KWKA 1W3JA 4JKKA 2PBGA 4HMCA 1JZ2A 8A3HA 4PYSA 1Z32X 1H5VA 1IZKA 2J74A 4F9JA 2PWGA 4CKQA 5I79A 4PSRA 1G9HA 2WPGA 1QI0A 1H09A 1JXJA 4UOQA 3WEZA 3WSUA 5HNNA 1UWSA 2VR5A 3EMQA 3TTYA 4PMVA 4QP0A 3FXYA 2E0PA 3JUGA 3AOFA 3RM9A 2AOSA 2YKKA 3OZOA 3SCRA 3LPPA 3VGBA 4P7OA 1E4IA 4QCEA 1DP0A 3VVGA 4CCDA 2W92A 1UWTA 2JALA 4J3UA 3WBEA 2WM0A 4PMUA 4WSKA 3AHZA 5A8PA 1WPCA 1QNQA 5A8QA 1VF8A 3CZLA 3OLDA 3TA9A 2FHFA 3VINA 2HISA 1LJYA 4XUYA 3AS0A 2BXZA 2WSPA 3B8SA 1K9EA 1MFVA 5D9NA 1EH9A 5AYIA 4UR9A 3WD2A 1ISVA 4KH2A 4AD5A 1JZ7A 1V0KA 2JIEA 4YN5A 1E0WA 1E71M 4BQ2A 3A4WA 3T08A 2VOTA 4GI8A 1PEZA 1DWIM 2ZWYA 4UQCA 3ZSTA 1K9TA 3M07A 1V0MA 4U3AA 4XX6A 3IJ7A 1E55A 2G3NA 3VGFA 3OBAA 4W7WA 4PMXA 3L4WA 1HKIA 3I3BA 3WFZA 3MU7A 4OUEA 1QNSA 2DH3A 3EDDA 3CUFA 5DT5A 1I1XA 4X0NA 4M56A 2A3CA 3W6MA 2V5CA 2J75A 1M01A 1CXKA 4U3CA 3AIRA 1Q6FA 5FOOA 3WDRA 1WDPA 4AZGA 3F4VA 4HMEA 2WVVB 1CXFA 1LL4A 1ZBKA 3CGTA 3PZOA 1AVAA 1NWSA 1ITCA 3O6AA 1GW1A 1UH2A 3ZJ7A 1J0JA 5HXMA 2X2YA 1TG7A 1E6SM 1TMQA 4ATWA 4LX4A 3SURA 4NF7A 4TVUA 4W93A 1E72M 5A6AA 2XSAA 4B9YA 2MANA 3WELA 2J4GA 4Z2KA 4CN4A 2BNJA 2WMIA 2YBTA 2XFRA 1XYFA 4AZ5A 3N12A 1UR9A 1UG6A 3PZ9A 3SCQA 3W4RA 2F2HA 1CLVA 3IAPA 5BRQA 1HJQA 1V6YA 3GNRA 4WIWA 4EK7A 3MV01 3CBWA 3AISA 2OYLA 4P8WA 2JEPA 1UQZA 3FAXA 4H8HA 1PZ2A 1M53A 1XV8A 4WSJA 3N15A 3HN3A 3BLKA 1VEOA 1XHGA 4CVWA 1O6IA 1ZBCA 1JG9A 4PTWA 1GOKA 2WMKA 4EAMA 5CGTA 1UA7A 1E0VA 1E6RA 4GI9A 1HP4A 3BAJA 3L4XA 5A8OA 3THCA 3CZEA 1W9BM 1GOWA 1H0IA 3DHPA 1OWQA 3VDCA 5TD4A 1J0ZA 2UWFA 1BG4A 1XGZA 3DYMA 1U2YA 5ABFA 1HVXA 1UD4A 3AROA 1P6WA 1CGWA 1LWJA 3SCPA 3K1DA 4FF5A 4GQRA 3SCNA 5IFPA 3AS1A 3LMYA 3A3HA 4YPJA 6A3HA 1GQKA 2EO7A 3ZJKA 4U31A 4NSBA 4W85A 5E6ZA 3MMWA 3VX1A 2J7EA 2BVDA 1E0XA 1WZKA 1HKJA 1KFWA 5CLWA 1B90A 3UG4A 4E2OA 4PMOA 2PF0A 2WVUA 3KZSA 4P7QA 5HOSA 2CKSA 4M82A 3EMZA 3NJ3A 2Z1KA 3VGEA 5FD0A 4C7GA 1PPIA 1FP8A 3EDKA 1JYNA 1U30A 4UFHA 2NW0A 3EDFA 2WWDA 3VIJA 3UCQA 3VD5A 2VO5A 1B3XA 2VT0A 1HT6A 2A3BA 3PZTA 1E15A 3L4ZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1J9Y A;  2WMF A;  3WNP A;  1XC6 A;  2E9L A;  3AMD A;  3QGV A;  1PIG A;  3NYD A;  1JZ5 A;  4GIN A;  3D3A A;  2C0H A;  1VAH A;  3CIV A;  1VJZ A;  2ZE0 A;  3CUH A;  4Y7E A;  4KMQ A;  3CTT A;  4LYP A;  5I78 A;  2XVL A;  4XB3 A;  3M46 A;  1V3L A;  2EBN A;  4OKD A;  3WBA A;  1KB3 A;  4AXN A;  5ABF B;  1JDD A;  2CHO A;  1VJS A;  3E1F 1;  5M3W A;  2ZUM A;  1VEM A;  4RE4 A;  1LL6 A;  5A69 A;  1H2J A;  4UQA A;  1KGW A;  1W9U A;  3WQ8 A;  1PBG A;  3VU2 A;  2V3D A;  1R8L A;  3WDI A;  3W25 A;  3LPG A;  4P8U A;  1R87 A;  1LG1 A;  3NSX A;  2WZI A;  1KWG A;  1AMY A;  1FOB A;  2AAA A;  3ALF A;  4E8C A;  1OCQ A;  3VUP A;  3TON A;  3CUJ A;  3VD3 A;  3WUE A;  4XZB A;  1BLI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2V3GA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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