2V5BA

The monomerization of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
242
structure length
236
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAGNADALASLKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQAAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma Cruzi.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 84
structure length 236
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2008-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v5bA00
2ABAA 1NEYA 3F4NA 1TIMA 5AHLA 4FX7A 4FEZA 1KTCA 4AHQA 3TC7A 4OV4A 3B0PA 3GNNA 5DLCA 3SIZA 3V75A 1HUVA 3IV3A 3O15A 1O60A 3PY2A 4JD4A 1WDWA 4UR8A 2V9DA 2OCZA 2RHGA 2ZZ2A 3WJYA 4AVFA 5FEWA 2NXIA 3QW4B 3JRKA 3K30A 3W7PA 3W7HA 2BLEA 4RJEA 3IRDA 1W37A 5HUPA 1IGSA 3PB0A 3GXPA 1DJNA 1FX6A 4MJMA 4RKAA 3RNDA 3SFKA 3BLIA 1FBAA 3L5MA 1K7EA 3P7YA 1FY6A 3G0UA 1VPXA 4GUHA 3NM1A 4GNJA 3DFOA 2GOUA 3STEA 1WYIA 1L6YA 3O06A 3LXCA 4QISA 4ORMA 2VEIA 3O8AA 3WJXA 2QJHA 3DI1A 5HQEA 1G7UA 2EPHA 3LLFA 2DP3A 1MSSA 3HBLA 3BW3A 2QUTA 3LRLA 2DZSA 1H50A 5C5YA 1BKSA 5K4ZA 1TTIA 5E93A 4UMCA 1DVJA 3NQMA 4JTTA 1PCKA 2OJPA 1C9DA 1GYLA 3B03A 1IXOA 1OJXA 2QJGA 1KFCA 4PEKA 2C18A 4XTDA 2JGQA 3NQFA 5DBUA 1XDMA 1D3HA 1WBHA 3LV5A 4NZJA 3W7IA 5ABTA 4Y9AA 2A4AA 4L4LA 5TBOA 1ZALA 4S1FA 1W5MA 2TRSA 4M19A 3QZEA 4NNCA 1EB3A 3ZWTA 2R8WA 1NVMA 4E38A 3Q94A 3ZS4A 3TW6A 3PAJA 3UY8A 4DXVA 4O1AA 1XI3A 2V0TA 3VE9A 4XBKA 2YFOA 1O95A 1G7VA 4M7SA 3T55A 3DH7A 3PM6A 1VQTA 4MZ1A 3LI1A 3W7RA 3TE9A 4A3UA 1TPH1 2V2CA 4MYXA 5EA9A 4FNUA 1FWSA 2FB2A 2FPYA 3L67A 3C2VA 5F4SA 1OABA 3VNDA 4AF0A 2HMCA 1H7WA 3LLDA 3OA3A 1GG0A 5KTLA 1N55A 1I8JA 1LCOA 3WK1A 3YPIA 3C52A 2WO5A 4MZ8A 4N9DA 4IXHA 4S2BA 2H3BA 1TV7A 2C19A 3GZ3A 4FO4A 4HNUA 1QDSA 3SSJA 4JYEA 3FS2A 1VZWA 4RLIA 1OFQA 2YGYA 4O15A 2ZTKA 4XTIA 4UC5A 3HGOA 5DCBA 2W6RA 3NM3A 3TXVA 3L0KA 5AFDA 3I7SA 1I45A 3ZR4A 1DJQA 1GQNA 1OF6A 3DGRA 4O57A 4IMDA 3L0NA 5IBXC 3W2MA 2VFEA 5IM51 4UFLA 1KBIA 3GXNA 3OVRA 3IIPA 4I7WA 1VRDA 3BVJA 1DQWA 1M5WA 4JDBA 4MJZA 5DXXA 1S3HA 3UQNA 3DFNA 5AHNA 1LOQA 3W07A 2G95A 1CX9A 4CLMA 1SFLA 2QCGA 3LTPA 2FQIA 3CHVA 1SU5A 2QDHA 4YXGA 3TH6A 4GE8A 3D0CA 3I6RA 4M6QA 4TIMA 1DORA 2J24A 4UTMA 3CQ0A 3CEUA 1UJPA 4O17A 1DOSA 4Z08A 3QJAA 3HG5A 5KZEA 1Q6LA 2I9EA 1A5BA 5LNSA 4GBUA 4KFPA 4MYAA 5D05A 5FESA 3N9RA 1HFBA 4G1KA 2VC6A 1Z44A 1F74A 3TX9A 1Q3NA 5LHFA 1F7BA 3P74A 2PRHA 1Z41A 2GUUA 2VELA 5CPNA 2D73A 2G97A 2FPVA 1K02A 2I1OA 3N14A 1TTPA 4A2RA 3N2XA 2GQAA 2CU0A 1O5XA 3A24A 3HPZA 5AYZA 3UWUA 4MLJA 1ZFJA 4CQ9A 3LHWA 1X7FA 3QC3A 2AAMA 5D03A 2X1SA 1X8FA 3W74A 3BPWA 2H8XA 4Z1CA 3FA5A 2WNZA 4DBDA 2QF7A 3QW3A 3SW6A 4CNNA 3V1PA 4WY0B 5GVJA 2HS8A 1SUXA 2ZA1A 4I9AA 4IPJA 2YX0A 2ZQ0A 3PULA 1DBTA 4IGHA 1PVNA 3GB6A 1I2OA 2WJZA 1B4EA 4LUIA 1OFRA 1QO5A 2DJLA 3WJZA 5K9CA 1KFLA 3EX6A 3MYOA 4IUOA 1OYBA 7TIMA 2VFHA 3W1AA 2CLLA 3L2IA 2C3ZA 2ISWA 4R53A 3UZJA 2ISVA 4UR7A 2ZCGA 2J9YA 2TPSA 2V2HA 4DO4A 3TDFA 5DN1A 1A53A 3CC1A 3HMJG 3L5LA 4FNPA 1UB3A 3M41A 5G1TA 2DZVA 4EOUA 1XBVA 3GR7A 1Z42A 2B4GA 1F6KA 3ABOA 3GDLA 5CSSA 3TXZA 4HNNA 2RDTA 4C1KA 5BOOA 2E6YA 1ZAIA 2O7QA 4K6AA 2E6AA 4OGZA 4IMGA 1ME7A 3LHZA 4ORIA 3QQ0A 1EWDA 1ONRA 1PL9A 1Q6OA 3NQGA 3NL3A 1GT8A 2V2DA 2Y7FA 2VOMA 1W3NA 4BWLA 3WJSA 4NX0A 3NEVA 1VJIA 2DJXA 5D30A 3GYEA 1DL3A 1XBZA 4CCEA 5H2ZA 4WQ6A 3SZ8A 2C15A 5D2VA 2QCDB 5LHEA 1J2WA 4ZQCA 5F4WA 4WOZA 3THAA 2W79A 4QNEA 2GVLA 2Z0IA 1YTEA 1K7FA 3KHJA 4NJKA 5E0KA 1OK6A 5U4NA 3SI9A 5I3KA 3RFAA 3W73A 2X2GA 2WSYA 2CLOA 1KM2A 2H90A 1OFOA 5TIMA 4LUJA 1OFPA 3U6WA 3W7NA 1TREA 3C56A 4AHPA 3SGZA 2QCNA 4LC6A 3SR7A 3G3MA 4YCOA 1NAL1 3GNDA 3NVTA 4J9JA 1I2NA 5E1QA 4BFAA 1TYGA 1SW7A 3RMJA 4M7TA 1JJKA 1RR2A 3HGJA 3PS7A 1JUEA 5HULA 4IMCA 2H3DA 3I7RA 2X1UA 2WV8A 5AHFA 4LW7A 3BW2A 1OG0A 4IPIA 4N02A 1AL8A 4Q4KA 3ABRA 2YFNA 1TTJA 4BI5A 2RDUA 5HWJA 4X2RA 5D32A 3DENA 3P80A 3G1VA 3CWNA 3HJZA 3UXDA 1J5TA 1FDZA 4YMZA 1JQXA 3DFQA 1GTHA 3L5AA 4MPQA 4PL2A 5K9XA 2VEKA 1AW5A 5D2WA 2E1DA 4UTWA 1F05A 3UWVA 3FOKA 1WV2A 1FUYA 2A7NA 2Y7GA 3BLEA 1VLWA 2E6FA 2X16A 2QCHA 5CZ0A 2QDGA 2ABBA 3NAVA 2ZRUA 5FEPA 4CCDA 4BF9A 4UTJA 4MLRA 4MY9A 4LV4A 3LERA 2WQPA 3RF9A 2QUVA 2Y85A 3MI3A 2CLHA 2GVJA 4O14A 2NLIA 1TCDA 1B9BA 4UIOA 4JY8A 3TSDA 5F2GA 3QFEA 4Q32A 3R5EA 1Q45A 3FKKA 5LZLA 1K3UA 4NT0A 2C0AA 1K8XA 2WNNA 1FQ0A 4JTEA 2X1TA 2R91A 2VFFA 4N9CA 2WSQA 4K7YA 5BMWA 2Z1BA 1L6SA 5H91A 3M9YA 3BLFA 4WD0A 4WZHA 4DF0A 1TMHA 5BNKA 4PFMA 3STCA 4NZFA 5J5DA 3NPWA 3G1YA 1OVDA 1M7OA 1ML1A 1EP3A 3UWQA 1VCFA 4TO8A 3LRKA 2DZWA 4MIMA 3PG8A 3KRSA 5DCDA 4N2YA 3STFA 3KVKA 1SO5A 3M5XA 1YPIA 2QEZA 5F4XA 2FPTA 3PBVA 3EX3A 5AYXA 5LGZA 3C0JA 1HO1A 3GDMA 4JTFA 5FF3A 1O94A 1I2PA 2QCFA 2F84A 4LRTA 3W1TA 5AC8A 4DQWA 1ZAJA 1WOBA 3E49A 2VEPA 3A5FA 5F2IA 3G8RA 3C4UA 3TIMA 3DFPA 3W71A 2A7PA 3W85A 3OBKA 4QQ3A 1SR9A 2EGZA 1FCVA 3PUEA 2DZUA 2QCMA 3IIZA 4N6EA 1T8XA 1L6WA 4LS2A 4JTHA 4JXCA 3PUOA 1SW3A 3TUUA 5CZTA 1P1XA 3LCWA 4ONVA 1EP2A 3UZ5A 1T99A 2ZTJA 2ZZ4A 1QPOA 1LRTA 4IQLA 3SY5A 1W5QA 3F03K 2Y61A 3W2NA 1X6UA 4ZQPA 1GPWA 3TU9A 3CIXA 3W7EA 4LVBA 3S5NA 4K8HA 3HF3A 1R2TA 1OFAA 2Y63A 5CSRA 1YDNA 3BK0A 1R47A 3IIVA 3PC0A 3CTLA 3W7DA 2NWRA 2NXHA 4JDYA 2Z6JA 5FI8A 2VFIA 3PSVA 4H6KA 5HMSA 1TPVA 2C16A 5D37A 1X1ZA 4Z1DA 1JULA 2HTMA 4OWGA 3H53A 1TPB1 4UUIA 3GDKA 1EIXA 1RQHA 4ZZ9A 5MHBA 4UFKA 1W56A 3DFTA 2V30A 4UFHA 2VENA 3G1FA 1RV8A 2TYSA 2YCEA 4Z0JA 3NQEA 2P0OA 2OZ0A 1FWTA 2E6DA 4TX9A 3S5ZA 2EKCA 3A21A 2Y6ZA 3NR0A 2UV8G 2Q3OA 1ZHAA 4WX2A 3RLUA 3GK0A 1AW2A 4EWND 4ZQNA 1FCUA 2DU2A 1SQ7A 4H3DA 4JICA 1KV5A 2PC4A 3W86A 2FFCA 4LOCA 1JR1A 1D9EA 1TPUA 1QR7A 2CLMA 1KW1A 2WPBA 4Z1BA 1B57A 4NU7A 3EKZA 3O05A 1SZNA 1I2QA 3O6DA 3NQ2A 2GQ8A 2RFGA 4MFEA 3W2UA 1IXQA 4BWLC 3MHGA 1ICSA 2HSAA 3U8GA 1D3GA 3N34A 4Z1AA 1JRBA 3HIJA 5CGQA 2B7QA 1V7YA 5FF4A 3WK2A 4O19A 4AAJA 3C3NA 3DI0A 1N8FA 1H7OA 4DPQA 4O8RA 3T44A 1YADA 1HG3A 3B0VC 4UNLA 1U5JA 4S2CA 2DORA 2BX7A 1KTNA 1VH7A 1WXJA 2OT0A 3SGUA 3TK7A 2ISSA 3M1ZA 1ZAHA 5A8GA 3R13A 1YXCA 1AW1A 3PVFA 3NGJA 3NPXA 3W22A 3LDVA 4FNRA 1YYAA 1HL2A 2I14A 1KFBA 3O6CA 1QAPA 6TIMA 3HPSA 5HNRA 4ML9A 5EBUA 1FCBA 4X22A 5G4EA 5LNUA 3LGEA 1QWGA 4M6PA 4CQ8A 1H7XA 4FNQA 3DKJA 1TRIA 1IF2A 3VFLA 4RZ4A 4ADUA 3LOTA 5HR7A 3W2KA 2J9XA 1U83A 1YLVA 1KM4A 2RH9A 3LCIA 1M6JA 3P67A 1A5CA 3W76A 5KZDA 3R2GA 3MP3A 4UTWC 3C2EA 4M5PA 3P5YA 5C6MA 5D2XA 5HWMA 2XN2A 3LX9A 5DCEA 3CPRA 2AQWA 3GR8A 2BSLA 2WSRA 2YYUA 4CNPA 4N9BA 3G8EA 4CQAA 3KRZA 3M5ZA 3TMQA 3P61A 1SZEA 1TPEA 4A22A 2F7FA 2B7OA 1RQBA 3CWOX 1KM1A 1QOQA 1N7KA 3S5OA 1C29A 2E68A 1KLZA 4NQ1A 3UPWA 1JUKA 2FLIA 3ABSA 1KV8A 1P5BA 3NQ6A 4GXMA 3DZ1A 1KM5A 5K7JA 2CLEA 1R46A 3EXTA 2EF9A 1W54A 3S8HA 2B7PA 3NZRA 2W0UA 1XUUA 4JTJA 1H7RA 3A22A 3CB8A 2E09A 4O13A 1LRQA 3QEZA 1XUZA 3PF3A 4HPXA 2YW4A 5G2WA 1FDJA 2NV2A 2VFGA 1IIHA 4GUIA 3DFSA 1WX0A 1W8SA 1YTKA 5BRBA 3EXRA 2G5WA 3UWWA 3MJYA 1XDLA 4BR1A 1DQXA 1H1ZA 1SZGA 1XC4A 2FB3A 2RDWA 1H1YA 3EB2A 3M16A 1AL7A 5AYYA 1JCXA 1EEPA 1QNVA 1S5VA 2JK2A 4JTKA 2YPIA 4NJGA 4YWIA 1VHCA 3E02A 1LZOA 3QH2A 4QNWA 1W1ZA 1YDOA 2QKFA 3O07A 3L21A 5CZJA 3B04A 1TRDA 5C2XA 4LVAA 2JKEA 1JCYA 5EY5A 1QPQA 3P84A 1G4SA 1VYRA 1QCWA 1PIIA 3GAKA 3OG3A 1XBXA 2E77A 5K2ZA 5DBTA 2Y70A 1LBLA 1W3IA 3EWWA 2NV1A 1JCJA 3WK3A 5LKYA 1ME9A 1GJPA 1EWEA 4NVTA 4BI7A 3TJXA 4PODA 3G1DA 1YTDA 1KBJA 4CNOA 4O53A 2YZRA 1DV7A 3I7QA 4AHOA 4DO6A 1GVRA 3LHVA 1SW0A 2G96A 1RVGA 1XL9A 2EAWA 3UD6A 1KLYA 3CIWA 4H4IA 2YW3A 1LDCA 3ZFHA 2A2IA 4GRSA 1TTQA 3NPVA 2A7RA 4TMCA 4K8EA 1WBJA 1GVQA 4XUGA 1P4CA 3QMSA 4A2SA 2Z2UA 2ZRZA 3SECA 3G1XA 2NX1A 4E2DA 1E51A 4C1LA 3TSBA 3VCRA 1TO3A 4AEOA 5EYWA 3C6CA 1KTBA 3CLMA 4JYFA 1J4EA 1JCLA 1VCGA 3W7KA 1ZJIA 3S42A 3NDOA 3GAYA 1XXXA 3W2JA 1KM0A 4JGDA 3LCLA 1W31A 3UXAA 3T4CA 4TR9A 1S5TA 3P60A 3GKAA 1G69A 1QFEA 1OX6A 4HN4A 2ZZ3A 4Y90A 2CWNA 2A85A 1O4UA 4W9TA 3GKFA 1WAUA 3B06A 1LP6A 1GEQA 5F2MA 4DF2A 3RLVA 3W1RA 2BXVA 1I4NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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