2V5BA

The monomerization of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
242
structure length
236
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAGNADALASLKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQAAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma Cruzi.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 84
structure length 236
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2008-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v5bA00
4O16A 4CCDA 1AL7A 3MHGA 3W2NA 3QF0A 5CZTA 2ZRZA 2JGYA 3DXIA 1TIMA 1H60A 1KTBA 1YPIA 4MUZA 2NV1A 2CW6A 3TA6A 4NXSA 2X1TA 3Q37A 4GUGA 3W23A 3GXTA 3CHVA 4O19A 4NJJA 3QQ1A 1W5OA 2QCDA 1JCJA 5FF3A 3BV4A 3FIGA 4I7UA 1AW5A 4YMZA 5G4EA 2E5CA 3BW3A 4N6EA 2CWNA 1HG3A 3R12A 1JQVA 1W3NA 2NZLA 4N4PA 4HNVA 5KSWA 1ZCOA 3CIXA 1PE1A 3UXDA 3P62A 4JDYA 3PB0A 5HUOA 2CU0A 1CI1A 2ZZ1A 2EHHA 3BW2A 3S5OA 3NPVA 4O13A 4WX2A 1TREA 3NM1A 3DGRA 4CQ9A 3A5FA 3LDVA 3M7WA 1GJPA 4TMCA 1VLWA 3EX2A 3G22A 3V1PA 1JJKA 2FTPA 4ORMA 4IXHA 1NF0A 3IVTA 3TR2A 5ABTA 4ZZ9A 5BMXA 2J6XA 3FS2A 2VC6A 2DU2A 5CSRA 1M7OA 3W73A 4Q4KA 4GNJA 3DKLA 4BI7A 1QPRA 3L2IA 1W5MA 3RU6A 3S1VA 4AWTA 2XFWA 3O8AA 3M16A 2AQWA 1FCBA 3AO0A 4UR8A 2GVJA 2RKXA 5CPOA 1IXNA 4CNNA 4Y96A 4A2RA 2A0NA 3MJYA 1VCVA 4MLRA 1SU5A 5H91A 2YSWA 4EF8A 3MWAA 1G4TA 2JKPA 3NQVA 3HG5A 3UPBA 1WBJA 3M1ZA 2E6DA 5D37A 3UWZA 1G7UA 5TQLA 2Y70A 4N02A 1E51A 2TPSA 2YX0A 3EWBX 3T40A 5D32A 3E0IA 1QAPA 4R53A 2G96A 4S2CA 2OJPA 1DL3A 3SGZA 4BWLC 2NX9A 1OX4A 3LCGA 3LTSA 3VE9A 5G1YA 3O16A 4IMEA 1OFAA 4UTMA 1GG1A 4ZQMA 2QCHA 1LTDA 1GT8A 1QDSA 2EKCA 1JR1A 3LRLA 2FB2A 3W1NA 3L5AA 1W5PA 1SUXA 1L9WA 2A6LA 1K7EA 4UTKA 4R7JA 5F4XA 1TO3A 3TKFA 3GDRA 4P61A 1O94A 2ZZ4A 2J27A 5LKYA 3B05A 3PB2A 3QMTA 1WQ5A 3LI0A 4JD4A 1PCWA 1XBYA 2C18A 5DBTA 3W22A 1XKYA 4NJIA 4EVZA 4JTIA 1PHQA 4UFJA 4O54A 1FDJA 3B4UA 4UNKA 1F6PA 1EUNA 1DJQA 2A7RA 2R94A 5J5DA 3TAOA 1H7RA 2RH9A 1JVNA 5AC8A 3M9YA 2OX1A 3B0PA 1P4CA 1TCDA 3NQGA 4J9JA 4Z1DA 1AK5A 2RFGA 1S5WA 3W7EA 5LHFA 1KA9F 3C2OA 4C1KA 5L9FA 4YWIA 1C29A 3N9RA 3ATZA 1TTQA 4BF9A 2E6YA 3UY8A 2DJLA 4NUWA 3HGSA 4U28A 1G7VA 3QC3A 4BI5A 3HG3A 5CKSA 3EXSA 4WXZA 4YXGA 3PM6A 4DPQA 3W86A 1X7FA 1ZFJA 2E68A 3TFCA 4IPIA 5A5WA 4O8RA 4UTUA 4NXKA 1SZEA 2QDHA 2KZHA 1F2JA 1MEHA 3P60A 4QSHA 3W88A 3P8JA 6TIMA 4ORIA 5K4ZA 1A50A 4WJEA 1H62A 4LNYA 2A5HA 2DORA 3L9CA 1MEWA 1LLZA 4OV4A 3ABRA 3OHIA 5D2XA 3UZJA 2HTMA 4O28A 1KM4A 3DI0A 1PS9A 3TUUA 2CLLA 4YCOA 1O95A 4FNSA 1L2UA 3A21A 3DHFA 4JY9A 5EMUA 3UD6A 5AHFA 4NNCA 2A7NA 1ICPA 3NL6A 4FF7A 3L5MA 2Y62A 5U7SA 1BKSA 3I7QA 3TAKA 3K30A 3C52A 1F5ZA 1T99A 3LX9A 1M7PA 3LGEA 4Y6GA 3KOFA 2H90A 3GVGA 3SFKA 2Z0IA 1T0OA 3LCHA 1TPB1 4HN4A 3GB6A 3OG3A 4IMGA 3UPWA 3HG2A 1TQJA 3NA8A 3NQAA 4JTEA 2BLEA 1UBSA 3W1XA 2CLOA 2C13A 4KWVA 2Y63A 4O52A 3S5NA 2X1SA 4K38A 1LZOA 3OBKA 3NQCA 4G1KA 3U6WA 4PEKA 2VFFA 2V2HA 1LOQA 3KXQA 1XUUA 5HUPA 3L67A 2VEIA 4QJ1A 3R8RA 3I68A 1KFKA 4QAIA 4KFNA 4DO5A 1W37A 3IIPA 1FDZA 5CZ0A 4M7SA 3NXFA 1FWSA 3KAOA 4I9AA 3FYPA 1QPQA 2W0UA 2X30A 1FWRA 1YTDA 1WV2A 2O7QA 3BLEA 5HNRA 2YYUA 3VE7A 4HIBA 2PRHA 5TIMA 1W1ZA 6ALDA 3WFAA 3TW6A 4JTKA 2OT1A 1OK4A 2V81A 4DXVA 4MJZA 1ZAJA 3MP4A 5F2MA 5LZLA 3PUOA 2FPYA 1HL2A 5KMYA 1IIHA 1QNVA 3B0VC 4XTIA 2EF9A 1IXQA 2NLIA 3LHWA 3P5ZA 1DV7A 3G1FA 5G2IA 3DFSA 4MOZA 2FJKA 2VXNA 2WSYA 5AN7A 1Q6LA 3GLCA 5F4WA 4S1FA 3HPXA 3W1QA 1KM3A 3IGUA 1I2OA 5DXXA 1XL9A 3QFEA 1NFBA 4M6PA 1KFCA 4X2RA 2AGKA 1YTKA 2WSQA 5AHNA 1KTNA 3UZ5A 3JRKA 4DELA 1GEQA 2VFEA 5EPDA 4FNQA 1P5BA 3W6YA 5LNRA 3A9IA 4M5PA 3EB2A 4WY0A 3P84A 4DO6A 4N4QA 3NG3A 4CNPA 3U2OA 3PC0A 3KFTA 3O05A 4MPQA 2R91A 3WJYA 4TX9A 1WBHA 4AVFA 2BWGA 3CLMA 3P7YA 3ZR4A 3W7DA 4MKNA 2JKEA 1SZNA 4OQVA 3FYOA 4MYXA 3P8IA 3NL5A 4P2VA 3HF3A 3G8RA 1LORA 3DZ1A 1DQWA 3HO8A 4FX8A 1LBMA 1TRIA 3STCA 3KRSA 2OT0A 4WZHA 2QCMA 5C5YA 1BTMA 4IXXA 5D09A 4LUJA 4WY0F 4JDBA 1S5TA 1VLIA 3HGOA 1KM5A 3TC7A 1F74A 4DPPA 3FEMA 3FKKA 4DBEA 4XQ6A 3W1PA 3W76A 2Y89A 5KTLA 5G2WA 1VS1A 4YL2A 3OEXA 1TPVA 1S3HA 1LYXA 1GVQA 1A5AA 4N9EA 2D73A 1K8YA 4LVFA 3IEBA 4LC8A 4MLJA 2WKJA 3F4NA 4IX2A 3GZ3A 1M5WA 3F03K 5HR7A 3PG8A 1OFQA 3U8GA 2R14A 3S5YA 3LERA 1R2SA 3AJXA 3SY5A 2Z1BA 3LXBA 3C3NA 4O50A 4RKAA 2P1FA 3EWXA 4ICNA 1LP6A 4RK8A 2YFOA 3DHDA 3I7RA 3HGJA 1FDYA 7TIMA 3FFSA 3TMQA 3ABOA 3O6DA 2YR1A 4RZ5A 4FIQA 1W3IA 3EWZA 2Y85A 2CZ5A 4H4IA 3LCFA 2QCLA 3E96A 3PY2A 4E2DA 3LHTA 3KHJA 1HUVA 3W9ZA 1EWDA 4IQLA 4JX5A 4LVDA 2JKAA 5E0KA 3QMRA 5J5RA 1XC4A 3S1WA 5AHIA 1KM1A 2WO5A 4AAJA 4L4LA 5K4XA 3BG9A 5FF2A 3UWWA 3W7HA 1UUMA 1IXPA 1JRCA 2V0TA 2RHGA 2Q8LA 5AYYA 2B0MA 3C8FA 3UWVA 1I2RA 1KM2A 2ZZ7A 4DQWA 5LNUA 4GUHA 4UFMA 1FCUA 1V5XA 3B06A 2Z2UA 3HJZA 1BEUA 1G67A 3IVUA 3W71A 3GDKA 3W7NA 4UTLA 4E2BA 1R47A 3TH6A 4IWWA 2VEMA 4XKYB 1VQTA 1H1YA 5H2ZA 1N8FA 1OVDA 1X6UA 3TU9A 2J9YA 4ZQNA 1TYGA 4ALDA 3LXCA 4TU1A 5G2HA 1EP1A 4Z1BA 1RVGA 3W3OA 3LI1A 2B7OA 1TV8A 4RJEA 1I2PA 3KVLA 4HPJA 2WOQA 4N2YA 1NAL1 1GVSA 2DZXA 2QCDB 1G6CA 2HS8A 2GQ9A 4CCEA 4GXMA 1F7BA 1GOXA 1OYAA 1W31A 4UTWC 2YGYA 4MYAA 3G1VA 2QEZA 4NT0A 3NR0A 4EF9A 1SZGA 2WNQA 2FDSA 4DF1A 5IM51 2QF7A 1QFEA 3V75A 5FEWA 2GJNA 1UJPA 5BNKA 4E0CA 3HGRA 1GVFA 2VENA 1U5JA 2W6RA 3MI2A 2CLKA 1EIXA 2YDAA 1XDLA 1TB3A 2EPHA 5HMSA 3W7QA 1LRTA 1QOPA 3QW3A 4JTLA 3TXVA 4JICA 3PSWA 4AB4A 5K7JA 2ISVA 3W87A 5CPNA 1XDMA 2WNZA 2DZTA 4A22A 2TRSA 2A6NA 3R5EA 1K7FA 3HPZA 1VGAA 5D04C 4AH7A 5AC7A 4AF0B 1LLWA 5K3VA 4K6AA 2Z6JA 1ICSA 3PWAA 2ISSA 3EX3A 3MBDA 5BMWA 5T26A 3O07A 3IIOA 3NL3A 3UWYA 2E09A 3NQ8A 1DQXA 2ZCGA 3GNDA 1WOAA 3L65A 3E9AA 4XBKA 3BARA 2ZFAA 4H3DA 4TR9A 1Y0EA 2VEPA 1NVMA 2ZDRA 3NAVA 4M6QA 1Q45A 5D33A 1OABA 4UTTC 2QJHA 4WD0A 4AHQA 4O4VA 2A7PA 4K8EA 4GUJA 1I45A 3LHYA 1SPQA 5F1UA 1BWKA 2R8WA 3VI2A 3W7GA 2XN2A 3IIVA 5LGZA 3GYEA 2DJXA 1ML1A 1AL8A 3N3MA 2I9EA 4ADSA 3EXTA 4UTIA 1SW3A 1I2QA 4AXKA 4GE8A 3C6CA 1K02A 3NPXA 1GVRA 2BX7A 4UXDA 3G3MA 4Y9AA 3PUEA 3STFA 3LOTA 2HMCA 1DORA 3SR7A 4JYFA 4RR4A 3GDLA 1FQ0A 3MBFA 4PL2A 1IF2A 4AWUA 2NX1A 5U4NA 1X1OA 2NV2A 3S9YA 1LRNA 4TMBA 4UMCA 2V5BA 4HPXA 4LWWA 2X1RA 2CZFA 2ATMA 3TV8A 4C1LA 4LV9A 1FY6A 4FO4A 4UMBA 3TJLA 4BK9A 5HQEA 1VC4A 4OV9A 3DENA 5CSSA 4Z1AA 2A1YA 1V7YA 1SSGA 2YFNA 1DVJA 1TTPA 2YW3A 3QPZA 4M6VA 5D2YA 1K03A 1WYIA 5C2XA 1W8SA 3OIXA 3HMJG 3KVJA 3P80A 3P81A 5DY3A 2QCEA 2V8ZA 1WDWA 3O1NA 3EEGA 4O14A 2YCEA 3QMSA 3THQA 2H8ZA 3RLVA 2F7FA 4NX0A 5K9CA 1RPXA 4BFAA 4O0KA 3TFXA 3JR2A 3NM3A 2FLIA 5HJLA 1MZHA 1KFLA 3FJ6A 1XBZA 1F76A 3O6YX 5K2ZA 1OX6A 3N2XA 1JRBA 3QJAA 4A3UA 5DCBA 1HFBA 4UCGA 1GTEA 3E49A 3W1LA 1I4NA 1O60A 1YXYA 3M0ZA 2PRMA 1Z42A 5FF7A 3LBCA 4X9SA 1J4EA 5EA9A 1HO1A 1KFJA 5L6UA 2UV8G 2C0AA 2V2CA 1QCWA 1JCLA 3NOEA 3W7PA 3G1HA 2QR6A 4IGHA 4O1DA 4O17A 3WJWA 1G4EA 3W7MA 5HWMA 1F05A 3RMJA 1DKWA 1JQXA 4A21A 1N7KA 3PVFA 3BVJA 5D2TA 4IMDA 3ZS4A 3P67A 2E5BA 4O12A 1AW2A 4JIPA 3LHVA 4HNTA 2OCZA 3PS7A 3LHUA 1FBAA 1A5BA 3C2EA 3FA5A 1YDNA 4JEQA 3NQ7A 3UWUA 3LRKA 3KRZA 3KVMA 4WOZA 3H55A 1GWJA 1GG0A 5BOOA 1TQXA 5BW6A 3TQ0A 3GXPA 4ML9A 3G24A 8TIMA 2XN0A 1ZENA 3A23A 4PC8A 4MZ8A 3CC1A 5CZSA 4EOUA 2JBMA 3QRHA 1TV5A 4MVAA 3BW4A 1NEYA 3PBUA 1X1ZA 3NPUA 1ICQA 1F73A 3STGA 1D3HA 1AW1A 3TQKA 3PULA 1Z48A 5GVJA 3S1XA 1ADOA 3PUDA 3N73A 1MO0A 3C2RA 2QAFA 5MHBA 4IMFA 5EYWA 3E12A 1FCQA 4LY8A 4FB7A 1SSDA 2C6QA 1KM0A 1QMLA 2VFIA 1K8ZA 5CPMA 3USBA 1K3UA 5AYXA 3TW7A 3L0KA 3THAA 1IGSA 5D05A 3NQ2A 4XUGA 4MZ1A 1SO6A 1SQ7A 2WQPA 4AHPA 3TNOA 3QSRA 4CNOA 5I3IA 2FPVA 4R34A 1P0KA 4Q33A 4O53A 3ZWTA 3KX6A 3N2MA 4UC5A 3NO5A 4O1AA 3HG4A 1TRDA 1KFBA 1QPNA 4GUIA 4LRTA 1L6WA 5HINA 1NSJA 2ZYFA 3ZWSA 1SO5A 4N9CA 3BG5A 1W56A 3IRDA 3BK0A 1TPDA 3GDTA 3W7CA 4PCFA 5HWJA 5D38A 3EWWA 4O18A 4QM1A 3LCWA 2QJGA 1OFDA 1RQHA 2Q3OA 3BO9A 3IVSA 1EX5A 2NWSA 4ADTA 4LTSA 1ME7A 3GIYA 2F84A 3FLUA 1SW7A 4HHPA 2VFDA 1A53A 3CEUA 2GOUA 2Q8ZA 3W1UA 1DJNA 1W54A 2BZNA 3C2VA 5AC6A 4JTSA 4K36A 3PG9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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