2VI0A

Lichenase ctlic26 in complex with a thio-oligosaccharide
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
GLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPGALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the beta-1,3:1,4 glucanase, CtLic26A, with a thio-oligosaccharide and enzyme variants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase H
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 111
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2007-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vi0A00
2Y24A 3B8SA 4DWSC 4J3VA 2EO7A 5BWFA 1E0XA 2WBGA 4ZE4A 3W24A 3T0DA 1VRXA 3LPFA 3GXMA 5GQBA 4UZSA 3AOFA 1I1XA 2WMGA 3WQVA 3RM9A 1UD3A 2QF8A 2CKSA 1HKJA 3GDBA 1FP8A 4W87A 2XVNA 3VMPA 4UQ9A 1J9YA 3VDCA 4E8DA 4ZEPA 5JUVA 1NM9A 3T09A 3CHCA 3VD9A 4L4PA 2DT0A 4DUWA 3VIKA 3VGBA 4BF7A 1C93A 2FH6A 3CZ8A 1GORA 3CHEA 4GI9A 2G3IA 3FW6A 1E55A 1JDCA 1KBKA 2BNJA 2VZUA 3TOPA 3L4XA 1OWQA 4CD4A 2VC9A 3FNDA 3WY1A 1TG7A 2V38A 1WDRA 1JI2A 1GW1A 1CLVA 2V3EA 2BVYA 2E8ZA 1J0YA 2WW5A 4EAMA 4UOZA 3F4VA 3WD0A 4PN2A 2VT0A 1W9DM 3AIUA 2OWCA 2WBKA 5I78A 7TAAA 2JF6A 3CGTA 4XZWA 2UWFA 2CESA 1NP0A 3RIKA 4H7VA 1LWHA 2ZOXA 2QHAA 3N12A 4MNJA 2WHJA 1W1PA 1ISWA 2JEQA 5ECUA 1QI4A 4WJXA 5A6BA 3T0AA 1DWJM 3VDHA 3T2QA 1LL6A 4JCMA 4AD0A 1VFOA 4JFUA 4B16A 1B3WA 4CU8A 2DSKA 3TONA 2IUZA 3MMWA 1B3VA 2D3LA 3KZSA 4FLQA 1NH6A 1I1WA 3ZOAA 2VCBA 3ZR5A 3HU7A 3SCVA 5A8NA 1GZJA 7CGTA 4KGJA 1WE5A 3EDDA 3ALGA 1BGGA 2MANA 3PZNA 3WELA 3UCQA 3ZO9A 1MWOA 1UWRA 2E9MA 2J74A 3AYSA 4JFSA 1R87A 1CXFA 1GOQA 3CMGA 1UYQA 1HJQA 3SCSA 3O6AA 4JHOA 1RPKA 4CKQA 2GFTA 4PCTA 3BGAA 3W6LA 1JYXA 4H8VA 1QHOA 3UR7A 3AS1A 2D3NA 4P7LA 3VINA 4J3TA 1W9UA 3IK2A 3CTTA 3FN9A 5C8BB 3IJ8A 3GZAA 1CXLA 2JF7A 3FAXA 1UKOA 1BPLB 2WVSA 1QI0A 1EHNA 1V02A 3GTNA 1QVBA 1JDAA 1NQ6A 2J7CA 3VO0A 3WNKA 3GH5A 2OWXA 2XGIA 1HJUA 5DMYA 2QPSA 3BXWA 5HOSA 2DDXA 1W3LA 3KEHA 4MNMA 3VIJA 4LX4A 1GQLA 1H3GA 3PZQA 4XUYA 4D71A 3EDFA 5BROA 5DFAA 2XJ7A 1M7XA 2WCGA 5JIPA 2E4TA 1SMDA 2ZUTA 1XSJA 1D2KA 5E6ZA 3PHAA 1Q6EA 1H41A 3J7HA 1BTCA 1UG6A 4HZ6A 4TVUA 1XRVA 1LJYA 2AMGA 1F4AA 2XTKA 3AS2A 1BG9A 1E56A 1NARA 5HPCA 2WZHA 1VENA 2JALA 2XM2A 1OGBA 4TOQA 3POHA 2OYMA 4U3AA 3AS0A 4X0VA 4MB3A 1R86A 2WXDM 3OGSA 2X2YA 1JZ3A 4CD6A 1ZL1A 8CGTA 4GINA 2G3NA 2ZUSA 1NOFA 4J3UA 1OSEA 2BVDA 1VEMA 1HL8A 2ZXBA 1JNEA 2TAAA 1V0MA 1R85A 1P6WA 4W86A 2GJXA 3A6OA 1UA3A 2WWCA 5IHSA 3AXXA 4W7UA 3ZT5A 1E40A 2X8RA 3AHXA 1VIWA 5CXPA 1WO2A 3M7SA 3K8KA 1DWHM 1LWJA 1WP6A 4U5KA 1B1YA 2WKGA 2YBTA 1BAGA 1VBRA 4BQ2A 5I77A 1CXHA 3ARRA 4MTVA 2ZUNA 3B9DA 1GJWA 4YHEA 3VM5A 1C8XA 3QHMA 2EPLX 3U5UA 1EHAA 1JD9A 3ZJ6A 4E2OA 4DUVA 4HMDA 1IZJA 5DEZA 3O9NA 5LA1A 2C0HA 2JE8A 2XHYA 3W53A 5TD4A 3I3EA 4F66A 5HNNA 4JL2A 3EBVA 3VU2A 4M80A 1KGUA 3AZRA 4P7QA 2PF0A 3QHNA 5D4YA 1TVPA 1E3ZA 3AXHA 5IDIA 1G1YA 3ZJ7A 1MFVA 2Y4SA 4FLOA 1KXVA 2O92A 1UR8A 2J8GA 1ZBWA 3CZGA 3I3DA 4RE2A 4AD1A 2YJQA 1R7AA 4UR9A 1BVZA 2WK2A 1X6LA 3PTMA 4J7RA 2OSXA 1GPFA 3ALFA 2EPNA 4U31A 1UOKA 2WSPA 5FD0A 4MAVA 5DO8A 2Y8VA 1CGVA 2VZSA 3WMCA 1NWTA 4OBSA 4KMQA 4WKHA 1HVXA 4HZ8A 3VIPA 2PBGA 1E73M 2CBUA 2F2HA 1Q6CA 2YOCA 2YIHA 1VJZA 3ZR6A 4QFUA 1H49A 1K6AA 4GXPA 2XWDA 1QI3A 2E9BA 4PSPA 3WF1A 2WPGA 3K8LA 1CXIA 1E5NA 3TTOA 1EOKA 5AC4A 2UY4A 3WD3A 2OYLA 1UKTA 1HKIA 2WB5A 2F8QA 3BLKA 3THDA 1PAMA 1C90A 4OIFA 1LLOA 3GXIA 1GONA 3NDYA 1WKYA 3DC0A 1JI1A 4PMDA 2J7FA 3G6MA 3WDHA 4H8HA 2VR4A 2DSZA 3PZMA 3U7BA 2CBIA 3F5JA 3OLGA 1JAKA 3WH7A 2BXZA 5FIPA 1WZAA 3BCDA 3KWXA 1B3ZA 1UD5A 2B31A 2WM0A 2EEXA 3WDQA 1K9FA 2WMFA 3SEPA 1PIFA 4HA4A 4HA1A 3T2OA 1QI5A 1WCGA 2QV4A 3FHQA 4H41A 5I0DA 4CU7A 5E6YA 1EDTA 2NW0A 5M5DA 1E43A 2X0YA 3CMJA 4Q7NA 4AMCA 4S3JA 4HU0A 4H8UA 2ZXAA 1Z32X 2VZTA 2DT3A 1XGZA 1V03A 4TX8A 1JD7A 3N18A 2FH8A 1UR4A 2J7HA 3ARXA 1V02E 2D1ZA 3WEZA 1CEOA 3UG3A 1G01A 4PMVA 3VM7A 4C7GA 1SYTA 4YPJA 4HOWA 3DHPA 3NJ3A 2EXOA 1XYZA 5ABFB 2E40A 1HKKA 4Y7EA 4BA0A 3WL0A 5I23A 2J25A 3SUSA 2OWWA 4TUFA 3VNZA 1EDQA 1KQZA 1GOIA 1KXQA 4U2YA 4J3SA 3WN6A 1CGTA 2ZE0A 3BMWA 1OGSA 4V2XA 5A6MA 4XX6A 1E1FA 2DH2A 2CNCA 1EO7A 1GCYA 2YLAA 1CYGA 3LPGA 4AIEA 4AZHA 4W89A 3AI0A 3N13A 1JZ2A 4CN6A 1G94A 4CD8A 5KZ6A 2WVTA 3BAIA 3W29A 1BSIA 1L0PA 1BYCA 4TVDA 3WFLA 2WVVA 3VKKA 2DSUA 2A3AA 1KFWA 4UQEA 4AZ5A 3AHTA 1TA3B 3PZTA 3VMOA 5CSUA 3WDPP 2BY2A 1J0JA 1I75A 3KE0A 4M82A 4K68A 1VFFA 1CWYA 1H09A 2O9PA 1U33A 2EPMX 4QLLA 1CPUA 1U30A 3AIEA 5AC5A 1Q6GA 5D9MA 4MJ4A 2WZEA 4R27A 4ML4A 4UFJA 3ZSSA 3GBDA 4MNLA 1G5AA 4WKAA 4JZ5A 4WKFA 5A6JA 2VTFA 3GNPA 2DQXA 2O9TA 1CLXA 3IANA 1US2A 1W91A 1AQMA 3G6LA 4MDPA 2VZVA 2VVNA 4M81A 3SUWA 8A3HA 2J4GA 5DF0A 4Z2KA 4ACYA 3N15A 4J3XA 4W88A 4LYQA 1XCXA 2DGAA 2JEPA 3CO4A 1QNSA 1SMAA 1QBBA 3NSXA 1GQJA 1QW8A 2YDSA 4C7FA 3WF4A 1IZKA 3GH4A 4WLCA 5CGTA 3WH6A 3NUKA 3CZEA 3SCUA 4JKMA 4PYSA 3RDKA 3QHOA 4TX6A 1JYWA 5BXSA 1WNOA 3EMQA 2NSXA 5GNYA 1UD4A 1E6XM 3AZTA 4DM2A 1BFNA 3W81A 4X0NA 1EGZA 1OD8A 4D72A 5AY7A 2W91A 4PMOA 3NSMA 5E0FA 4UFHA 1V08A 3CZLA 4P8VA 3PZIA 2QLYA 1HN1A 3CUIA 4PTWA 2V3GA 1XYFA 5CPSA 3ARSA 4U33A 1KR1A 3WIJA 3AMGA 3TA9A 4AIUA 3WQ4A 1L8NA 3PZ9A 1E1EA 3WUEA 1KQYA 3I3BA 1FH8A 1J11A 2RGLA 5GNXA 5A6AA 2UY5A 1NWUA 1G0CA 2CCRA 2Y5EA 4EE9A 3MV11 4S3KA 2WCAA 3WUFA 1OM0A 4MAZA 1EDGA 2E8YA 2XM1A 4P7OA 4PUDA 3VGDA 3D5HA 2E0PA 3DYPA 4AZCA 1GHRA 3CZJA 1PX4A 1CNVA 3AIVA 1WZKA 1W9BM 5A8OA 4D6GA 2HISA 4EK7A 3K46A 2EPKX 1E4LA 3MKKA 3EDEA 4HZ7A 3SUVA 3W27A 2D0GA 2DIEA 2XFRA 1YHTA 4N0RA 4OJYA 5IFTA 1WZMA 4M8UA 5JIWA 3RJYA 2VURA 3WQWA 1ZJAA 2DH3A 2YA0A 1E6RA 3VIMA 3CHFA 3RILA 4Q22A 3MMUA 4GPNA 3M07A 4KGLA 1JF6A 3OGRA 4UFKA 1WDSA 3ARUA 1JXKA 1CGUA 1TVNA 5FCZA 3SCRA 2D24A 1X6NA 2VRKA 1JNDA 2WKLA 3OLIA 2V3DA 5D9OA 2JIEA 1WZLA 3ECQA 3WBAA 4JIEA 1JL8A 2ZX6A 5HBFA 3AICA 1HVQA 1UQZA 1R7OA 4XV0A 3TP4A 1J01A 4ATDA 2XSAA 1JZ8A 2GDUA 4M56A 1QNRA 1KWGA 1XSIA 1JDDA 3WH5A 1UUQA 4TVCA 3ARYA 3UR8A 4AD5A 2UY2A 4ZXOA 3WF2A 2W61A 3CIVA 4Z2HA 1B30A 2FGZA 4B15A 1K9EA 1JGIA 1MVYA 3MUIA 3BAKA 4W8LA 2WSKA 4NI3A 2YBUA 4CU6A 5BCAA 1A3HA 1QI2A 3VIOA 1OT1A 2RGMA 1J18A 4H2CA 4LXFA 1E6SM 1UH3A 1H11A 1CIUA 4D6CA 1OD0A 2CBVA 2BHYA 1LL4A 1ZB5A 2GUYA 1W32A 3WMSA 4M24A 4W8BA 1JF5A 2FHCA 1B3YA 4F9JA 1GQKA 5JBDA 2G8ZA 3WDRA 1W9PA 1ECEA 5E09A 3B9AA 3VILA 5A69A 4M1RA 2ESCA 1FA2A 1PX3A 2EJ1A 2F61A 2G3MA 1UR9A 5A6SA 3PZVA 3WUBA 4OUEA 4ZENA 1ITXA 5BXTA 4OBRA 4NRRA 1W1TA 1O7AA 3A3HA 3PZGA 2PB1A 1RP9A 3AIQA 1F4HA 1UZ1A 1RH9A 1XH0A 1TR1A 2XYLA 4BCEA 3MS8A 2ZX7A 2WMJA 3HMCA 1E3XA 3NYDA 1V3IA 2WNWA 1FHDA 1BHGA 4LYRA 1DTUA 3GBEA 5KEZA 4AD3A 3BAJA 5M17A 1UH2A 2CPUA 1M04A 2PC8A 1GUVA 4PMXA 4XZBA 4UFMA 2WWDA 5E70A 5CZKA 1C8QA 1AQHA 4N42A 2Z1KA 4A4AA 1MW0A 4MJ2A 4AXNA 3L4YA 1LQ0A 4AD4A 3AMCA 1QNPA 2WC4A 3L4ZA 5FL1A 1W3JA 3W38A 2WYSA 3SIMA 4MB4A 2GJXB 2ZUVA 4H04A 3BAWA 3NIYA 2FHBA 4DWSA 3WQ5A 3O2LA 4D6IA 2VZOA 3A4WA 1E70M 4GZIA 2YL6A 4FK9A 2J75A 5BYWA 1QPKA 3PTQA 5M03A 2YA2A 1EIBA 2Y8KA 4NF7A 5HXMA 3L4TA 5ABGA 4CUCA 3SUUA 1V6UA 1E15A 2YKKA 1H0IA 4QAWA 2CIPA 4CD7A 3AXIA 1JYNA 1E6NA 4PMYA 1QOXA 4UQCA 4WF7A 3WL1A 1FH7A 1GOOA 5CQ1A 3WH9A 3WNNA 1VEOA 3BSHA 5M3WA 4JKKA 1C3FA 1UWQA 3W82A 2G4FA 1VAHA 5D9NA 3EMZA 4ACZA 4PMUA 4QLKA 1KGWA 1J0ZA 2BVTA 1EQPA 2NT1A 4KRTA 4BQ4A 4HTYA 5JBEA 3N11A 3WNLA 4B3KA 4V28A 4V27A 2WANA 3T08A 1JZ4A 3OIHA 4A3HA 4ATWA 3RMEA 5A95A 5ABHA 3ZM8A 1J0IA 2BV9A 2WHLA 1V3MA 1E4MM 3W25A 4JKLA 2YDQA 4GQRA 1KCKA 1CECA 1C7SA 3VUPA 2XIBA 4E8CA 1XV8A 2BXYA 5IXEA 4FF5A 1FOBA 4IUGA 1ODUA 4KWUA 2WMIA 4LPCA 1KWKA 1XD0A 3M46A 2XUCA 1HJXA 5CGMA 5I3DA 4ACZB 1E9LA 2CKRA 3E1F1 1ITCA 3WBEA 3ZQ9A 3EDJA 3WNPA 2J62A 2BY0A 3GNOA 1CDGA 4W7VA 1ISXA 1HP5A 1WDPA 5AYIA 1EXPA 5BRQA 1B9ZA 4B9YA 2VRQA 2FGLA 3VIHA 5A6BD 1V3JA 3HN3A 1TE1A 4LYPA 3VGFA 2ZX5A 4UCFA 5A8PA 1O6IA 3BAYA 4P8UA 1MFUA 1VJSA 1PJ9A 4U2ZA 3F5KA 1QBAA 9CGTA 1UWUA 4HMCA 2X09A 3AIBA 5IFPA 3OB8A 5HPOA 3OA5A 1K9DA 3EYPA 4R5EA 3OLDA 3CLWA 3RPMA 4PEEA 2XG9A 2YA1A 4WK9A 3GYCA 3TTQA 3SCOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Y24 A;  3B8S A;  4DWS C;  4J3V A;  2EO7 A;  5BWF A;  1E0X A;  2WBG A;  4ZE4 A;  3W24 A;  3T0D A;  1VRX A;  3LPF A;  3GXM A;  5GQB A;  4UZS A;  3AOF A;  1I1X A;  2WMG A;  3WQV A;  3RM9 A;  1UD3 A;  2QF8 A;  2CKS A;  1HKJ A;  3GDB A;  1FP8 A;  4W87 A;  2XVN A;  3VMP A;  4UQ9 A;  1J9Y A;  3VDC A;  4E8D A;  4ZEP A;  5JUV A;  1NM9 A;  3T09 A;  3CHC A;  3VD9 A;  4L4P A;  2DT0 A;  4DUW A;  3VIK A;  3VGB A;  4BF7 A;  1C93 A;  2FH6 A;  3CZ8 A;  1GOR A;  3CHE A;  4GI9 A;  2G3I A;  3FW6 A;  1E55 A;  1JDC A;  1KBK A;  2BNJ A;  2VZU A;  3TOP A;  3L4X A;  1OWQ A;  4CD4 A;  2VC9 A;  3FND A;  3WY1 A;  1TG7 A;  2V38 A;  1WDR A;  1JI2 A;  1GW1 A;  1CLV A;  2V3E A;  2BVY A;  2E8Z A;  1J0Y A;  2WW5 A;  4EAM A;  4UOZ A;  3F4V A;  3WD0 A;  4PN2 A;  2VT0 A;  1W9D M;  3AIU A;  2OWC A;  2WBK A;  5I78 A;  7TAA A;  2JF6 A;  3CGT A;  4XZW A;  2UWF A;  2CES A;  1NP0 A;  3RIK A;  4H7V A;  1LWH A;  2ZOX A;  2QHA A;  3N12 A;  4MNJ A;  2WHJ A;  1W1P A;  1ISW A;  2JEQ A;  5ECU A;  1QI4 A;  4WJX A;  5A6B A;  3T0A A;  1DWJ M;  3VDH A;  3T2Q A;  1LL6 A;  4JCM A;  4AD0 A;  1VFO A;  4JFU A;  4B16 A;  1B3W A;  4CU8 A;  2DSK A;  3TON A;  2IUZ A;  3MMW A;  1B3V A;  2D3L A;  3KZS A;  4FLQ A;  1NH6 A;  1I1W A;  3ZOA A;  2VCB A;  3ZR5 A;  3HU7 A;  3SCV A;  5A8N A;  1GZJ A;  7CGT A;  4KGJ A;  1WE5 A;  3EDD A;  3ALG A;  1BGG A;  2MAN A;  3PZN A;  3WEL A;  3UCQ A;  3ZO9 A;  1MWO A;  1UWR A;  2E9M A;  2J74 A;  3AYS A;  4JFS A;  1R87 A;  1CXF A;  1GOQ A;  3CMG A;  1UYQ A;  1HJQ A;  3SCS A;  3O6A A;  4JHO A;  1RPK A;  4CKQ A;  2GFT A;  4PCT A;  3BGA A;  3W6L A;  1JYX A;  4H8V A;  1QHO A;  3UR7 A;  3AS1 A;  2D3N A;  4P7L A;  3VIN A;  4J3T A;  1W9U A;  3IK2 A;  3CTT A;  3FN9 A;  5C8B B;  3IJ8 A;  3GZA A;  1CXL A;  2JF7 A;  3FAX A;  1UKO A;  1BPL B;  2WVS A;  1QI0 A;  1EHN A;  1V02 A;  3GTN A;  1QVB A;  1JDA A;  1NQ6 A;  2J7C A;  3VO0 A;  3WNK A;  3GH5 A;  2OWX A;  2XGI A;  1HJU A;  5DMY A;  2QPS A;  3BXW A;  5HOS A;  2DDX A;  1W3L A;  3KEH A;  4MNM A;  3VIJ A;  4LX4 A;  1GQL A;  1H3G A;  3PZQ A;  4XUY A;  4D71 A;  3EDF A;  5BRO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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