2VX5A

Cellvibrio japonicus mannanase cjman26c mannose-bound form
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Cellvibrio Japonicus Mannanase Cjman26C Displays a Unique Exo-Mode of Action that is Conferred by Subtle Changes to the Distal Region of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLVIBRIO JAPONICUS MANNANASE CJMAN26C
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 143
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2008-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vx5A00
2HISA 4JCLA 2FHFA 3AYSA 3FAXA 1TE1A 1H09A 1WB0A 3CHCA 3GBDA 3DHPA 2CHOA 3ARSA 2A3BA 4U5KA 2JF7A 3VUPA 3ZJ6A 2VVSA 2D1ZA 3CMJA 1GONA 2VURA 2WK2A 4NRSA 4QLLA 1EOKA 1XH1A 4NI3A 3GDBA 3ARZA 2VI0A 4E4PA 5DT7A 4NRRA 3AS2A 1GOOA 1WCGA 1E70M 4W8LA 2C0HA 1C8YA 1CGYA 3W53A 1NP2A 1C93A 2YBUA 3WF1A 3KZSA 3MKKA 2XHYA 2PWEA 2D23A 5A6BD 3D3AA 1JIBA 4JZ5A 1XH2A 2WNWA 3FNDA 4HOWA 4Z2KA 1ODZA 2NW0A 1XGZA 2YL8A 2UY4A 5A2AA 4H8HA 3EDFA 3NSXA 2Q8XA 1JDAA 1RD6A 1GVYA 1MYRA 3GXIA 2XJ7A 3AMGA 3OLGA 4PCTA 8CGTA 2WHJA 1NWSA 2C8NA 1PZ3A 3RPMA 1W1VA 4WLCA 1MXGA 2ZXQA 4NF7A 4PTMA 4EAMA 1JYXA 2G41A 3CUJA 3OB8A 1OGGA 1UYQA 3AICA 1LWJA 4UCFA 2VX4A 4MB3A 1UKQA 2WVSA 4H7VA 3NJ3A 3VGHA 3VIGA 4AWEA 1IZJA 1QOXA 1Q6DA 4U2ZA 1J10A 3L2LA 2OYKA 1BAGA 3AHYA 2D2OA 2Z1SA 4B9YA 3W37A 1QHZA 5I24A 5A6LA 1CLXA 1K9FA 1DWHM 1R85A 5EB8A 4AISA 4R27A 4Q22A 3AS0A 1F4AA 2V3EA 3TTYA 2WMFA 4W88A 3VIMA 2F2HA 3BMWA 2WBKA 4CKQA 4P7QA 1FA2A 5HNNA 1UG6A 4QCFA 3O9NA 1MW0A 2DT1A 1BGAA 1UOKA 1MXDA 1SR0A 4AW7A 3ALFA 1E4NA 3PZTA 3PZIA 4AZCA 2VQUA 5LA1A 4PTVA 4AIOA 3RMEA 2VRJA 3DC0A 2J62A 3WD4A 4MNJA 1H0GA 3CHDA 4PMUA 3AMLA 1WNOA 4P7OA 5KEZA 1EIBA 1W1YA 2XM2A 3AMCA 5BXSA 1BG4A 1VB9A 2WZEA 1JZ8A 3VM7A 5GNZA 1V3IA 4PMZA 2XGIA 1CBGA 3U7BA 3EMCA 3ARTA 2WKGA 3A47A 1XSJA 5A1AA 2QMKA 4GO8A 1B31A 3MUAA 5A6MA 5DO8A 1W2VA 1EA9C 3MMWA 4NZCA 3SCVA 4YHEA 1HNYA 4PN2A 1EHNA 4ACYA 3W0KA 1QI2A 4J3SA 4PMNA 2E4TA 7CGTA 1UWTA 5FL1A 3GZAA 1ISZA 1UZ4A 1GJUA 1CGXA 2XM1A 4C7FA 1CYGA 4GINA 1QI3A 1B3WA 5BRQA 1FOBA 3MS8A 1OCQA 1ZU8A 4PMOA 5LYRA 3FAWA 1JG9A 2OLHA 1W9XA 2NT0A 4ZE4A 4LYPA 4MAZA 2FHCA 4H04A 2XFRA 4D6JA 4B3KA 4JKKA 3KWXA 1UWQA 3CHEA 1E4MM 3LMYA 2XWEA 4TUFA 3WDJA 3WF4A 1SFSA 5A2CA 1MQRA 2OYMA 3WL1A 3VD4A 4D6EA 3FN9A 2ZXAA 1TCMA 2D0FA 5C71A 2WBGA 3VOCA 4PBGA 4HZ6A 4Z2HA 3BAXA 4B15A 1HJVA 3CUGA 4J7RA 4MJ4A 1QPKA 2GDUA 1HJQA 4GZEA 5AC5A 1KB3A 1XD0A 5FD0A 2D20A 3G6LA 4HPGA 1WKYA 5A6KA 1XHGA 4DUXA 3VIIA 3GM8A 1C7TA 2YLAA 1MQQA 5I23A 4JHZA 3N1AA 4ACZB 2J25A 1KWGA 3L4ZA 2ZXDA 4V28A 4D71A 3B8SA 1PJ9A 2EO7A 4M29A 1J0JA 4GI8A 2E0PA 1FH7A 2WC3A 2DH2A 1FHDA 1V0KA 1GQJA 2VL4A 2X1IA 2WSKA 3AI0A 4GI6A 4MNMA 3CPUA 1UKTA 2WXDM 1TG7A 1B3YA 1XC6A 3AIWA 1GORA 4F9DA 2XVPA 3NSNA 2JE8A 1FFQA 3W28A 2ZOXA 2WC7A 4JIEA 1HL9A 4AXNA 4PMDA 3DECA 1QW8A 1J0IA 4A4AA 5I78A 3VINA 5TD4A 2UWFA 3OZOA 1EO5A 1UWIA 1QNRA 4TX8A 3RJXA 1JZ3A 3AXHA 2WLZA 4N42A 1FFRA 2FH8A 1V3LA 3CUFA 5IFTA 1QBBA 1V6XA 4YHGA 2XPKA 1E4LA 3CZLA 3K8KA 1KQZA 2XUCA 2GJRA 4Z2GA 3SCPA 4LYRA 3WY1A 5JUVA 2CNCA 2CKSA 3WNKA 3WNNA 3BAKA 4H2CA 1UWUA 3CUIA 4ATLA 2A3HA 1E1FA 3VD3A 4EK7A 2BFGA 3UCQA 1KR0A 5BXRA 3WQWA 2V3DA 3M6DA 3L4WA 5CLTA 4HMCA 1HJUA 2WMKA 3WELA 3L4VA 4DUVA 3F5KA 1KCLA 1DWJM 1MWOA 1GCYA 3AXXA 3VDBA 2E40A 5M17A 3WQ6A 4DWSC 1R7AA 2YL5A 4M24A 1JAEA 4UQCA 2J7EA 1CDGA 4GQRA 1JI1A 2W91A 1WZMA 1KXHA 5LA2A 1MW2A 2DH3A 1PX3A 1UR0A 2EPMX 3WUFA 1UR1A 3T09A 4AZ5A 3IJ7A 4KMQA 1KGUA 3PTQA 5D8ZA 1UQZA 2ZX9A 2BXZA 1UQYA 1E6RA 3PBGA 1X6NA 4TVCA 3B9EA 3NUKA 3CIVA 1W3HA 1PEZA 1W9VA 4UZUA 1PBGA 1WZAA 3ZMRA 2A3CA 4M56A 1UR9A 1KR1A 5CZKA 3AXIA 2XTKA 4AZ6A 4E8DA 3SCNA 4KGLA 3A6OA 2YL9A 1E43A 2A3AA 2DT3A 3VGFA 3WDIA 4M81A 3K8LA 3ZR5A 2VX6A 5EFFA 1QNPA 3VTRA 1E40A 3AHZA 3JUGA 1JD7A 2ZX7A 3HJEA 4UOJA 2ZIDA 4U3CA 2ZUMA 3L2MA 4M82A 3N18A 1J11A 5JIPA 4JCMA 1IV8A 2WMJA 3W81A 3E1F1 3AZSA 4A3HA 1CENA 1E55A 5IHSA 2VZVA 1JZ6A 1OBAA 3VX0A 1EDGA 2O92A 4KRTA 3WNMA 2WHLA 1EQPA 4J3VA 3SCQA 5C8BB 4UOQA 2V3GA 3ARQA 4P8WA 4E2OA 1KQYA 4AIEA 4UFMA 5M03A 3WD0A 1H0IA 1PX4A 3SCWA 1ZBKA 1HP5A 4CU8A 3ZR6A 1WZLA 3MANA 3K8MA 4GKLA 2E3ZA 2TAAA 3PZOA 3SCRA 3UR7A 1LG1A 2PBOA 4TTGA 4A3YA 4B3LA 3CLWA 1H49A 1DWIM 1ZBVA 4M8UA 4PSPA 4JFSA 2FHBA 1E1EA 1XSKA 3BLKA 1E5NA 1V6YA 4MB4A 1LQ0A 5BYWA 3K1DA 4L4PA 1BYAA 5CG0A 2G3IA 3ARXA 4EKJA 2W67A 4AMCA 4U2YA 4W84A 3WH9A 3J7HA 3W4RA 4CUCA 4CGTA 2J7HA 1AQMA 4XZBA 3F4VA 3U5YA 4AEFA 1SMDA 2CITA 3PZMA 3KL0A 1Q6GA 1V0LA 3GXDA 4LYQA 4MNLA 3S6TA 1OM0A 1LJYA 1UR2A 3QGVA 4WKHA 4ZFMA 2VQTA 2HVMA 4ZEPA 4S3KA 1VFUA 2GSJA 4D1IA 3PTKA 5A2BA 4D6HA 1QNOA 4B16A 2PI6A 3WEOA 2CBIA 1BQCA 5AYIA 4Y7EA 3MUIA 1X6LA 4BZYA 4W8AA 2JIEA 2PWDA 2ZUWA 3W38A 2DEPA 2PWGA 2AOSA 2AMGA 4TTUA 2XSBA 2NSXA 5FCZA 4OZOA 4W89A 1B3ZA 3W6MA 2JEQA 4XV0A 4CN4A 4BF7A 3SEPA 3WDHA 1BVNP 2JALA 5I2UA 2CETA 3U5UA 1JI2A 4AD2A 3N9KA 1EXPA 1OGSA 2WC4A 3WSUA 3ZO9A 2WVVB 5CSUA 3A4AA 1V3MA 1CWYA 1MFUA 1HJXA 3AISA 4HA4A 4J3UA 2Z1KA 2WANA 4XB3A 7A3HA 1JDDA 2D0HA 4ML4A 2O9RA 8A3HA 2QMJA 2Y5EA 1UD3A 3MMUA 3L4TA 1QNQA 1E3XA 2W92A 4BQ4A 1E6SM 4UFJA 2VTFA 1XCWA 4P7NA 4KWUA 4B9ZA 1DHKA 1B9ZA 1GJWA 2YL6A 3KL3A 2WAGA 1E6NA 5IXEA 2WW5A 4HMEA 4F79A 2F61A 5DF0A 3WBEA 3K46A 3MO4A 5GNXA 2FGLA 3SCUA 4GIAA 5D9OA 3EDDA 3EBVA 4AD4A 2G4FA 3F5LA 4FF5A 3M7SA 4UNIA 1ZL1A 2GJPA 1GOIA 1OWQA 4IISA 4P7RA 3U7VA 2RGLA 1UD4A 3WD1A 4HU8A 4AY1A 2FH6A 4HPHA 5D8WA 3IAPA 2PC8A 1R7OA 2PWFA 3WQ8A 2EBNA 1TA3B 2WKLA 4JFTA 3CMGA 1W3KA 3ZT6A 4AC1X 1U30A 4KGJA 2EJ1A 1UKOA 4UQAA 4PTXA 3MUZ1 1XYZA 1C7SA 3T0AA 4DUWA 5A95A 1LG2A 3VIJA 1V0MA 3CZ8A 4UQEA 1BF2A 3S2CA 3POCA 1CGUA 1J12A 3VM5A 3WF2A 1R8LA 5BCAA 5EMYA 5KZ6A 3U57A 2VUYA 3EDJA 3SUVA 4HOZA 1DEDA 4CD7A 3PZQA 5E6ZA 4UFIA 4AZHA 1V3KA 4CD6A 5GQBA 1V3HA 2ZXBA 1QBAA 4GZIA 4CCEA 4ACZA 1WO2A 4QCEA 1G1YA 1DWGM 2VMFA 1NWUA 3CBWA 1GQIA 4AD1A 4X0VA 3ZT7A 3FHQA 1ECEA 4W5UA 4UZSA 3VIHA 3THDA 1UWRA 1V6WA 2VRQA 5D4YA 2EPLX 4V2XA 1GHSA 4H8VA 3OA5A 3TP4A 2BS9A 3GXMA 5E9AA 3EYPA 1K6AA 5ABHA 4TVUA 2E8YA 4OBRA 3VGBA 3AYRA 2F8QA 5A69A 2J7DA 2Y24A 1L8NA 2J78A 2PBGA 3WQ5A 1RP8A 1GPFA 2J7GA 3N04A 3CZGA 2YA1A 2BHYA 3UR8A 5D9NA 2VRKA 5FKYA 1G9HA 1NOFA 1ZB5A 3MMDA 2W61A 3AIBA 2MANA 2XVGA 4FLOA 3TA9A 1SMAA 3AHXA 3WNLA 2PF0A 2Y2WA 4D6DA 2J79A 3SIMA 3CUHA 1J9YA 3A3HA 1US2A 1G5AA 2WB5A 3GH7A 5I79A 4GXPA 1E3ZA 4AD5A 2W63A 1SYTA 2VZSA 2VZUA 2W66A 9CGTA 1LLOA 3AMDA 2OWXA 5CGTA 3VU2A 1B0IA 4UQDA 1CIUA 2ZUTA 1B30A 3BAJA 4AD0A 1V02E 5C70A 4AYSA 5DT5A 5BXTA 1M53A 4P8XA 4AZ7A 1JL8A 2VX5A 1X1NA 1HJSA 1TR1A 3G6MA 2CYGA 1E6ZA 1HXJA 3M07A 3VIKA 3NCOA 1M7XA 2NT1A 3THCA 4CN1A 1P6WA 2CCRA 4LGXA 5A8NA 5JBFA 1KBBA 2GFTA 1B3XA 3N15A 1KXTA 3WEMA 2X2YA 3MSDA 1CXIA 2D3LA 2YLLA 4UFHA 1CLVA 3ARVA 4PYSA 3KE0A 4J28A 1HKIA 1CGWA 1OD0A 4AEEA 1KCKA 2J75A 2OSXA 5A8MA 2O9OA 6TAAA 1DTUA 5CQ1A 1VBUA 4P8VA 1L0PA 4HZ8A 1BHGA 1UKPA 2OYLA 1W9PA 1HL8A 2GK1A 5EBAA 4BQ3A 4D1JA 5GNYA 1VF8A 4AZGA 4KH2A 3GXFA 2YA0A 2V5DA 1KFWA 3AIVA 2G3MA 3LPGA 3B9AA 4FLSA 3WENA 1D2KA 2D3NA 1CNVA 2GUYA 3PZGA 2EPNA 2VOTA 4J3TA 1C91A 2XGBA 1QHOA 1DWAM 3QHMA 2ZWYA 1XH0A 4DM1A 1DP0A 4W86A 1JGIA 3ZJKA 4LPCA 1Q6CA 4PMQA 3AS1A 2XYLA 5ABEA 2EPOA 4URIA 4V27A 3GH5A 3HU7A 4W8BA 3TTSA 2VO5A 1JFHA 1E9LA 4BQ5A 3AZTA 4PMXA 2CXGA 4LQ1A 3N11A 3VIPA 1GOMA 3T08A 2J7FA 2Y4SA 1NOWA 1UWSA 2E9LA 4JAWA 1V03A 3OIHA 3RDKA 4J3WA 3AROA 3QOKA 1PZ2A 1WDRA 3TOPA 1VEMA 1W3LA 1J0HA 2CPUA 2E9MA 1C8XA 1BG9A 1MQPA 1ZS2A 3LPPA 3OZPA 2VNCA 4MTVA 4JFVA 4W85A 3BXWA 4CCDA 1H11A 1CZ1A 3ZQ9A 2JEPA 3O2LA 1GZJA 1MVYA 4R5EA 4MB1A 2XIIA 4JKLA 4BS0A 2ZUNA 4GI9A 2UY5A 2ZX6A 1GNXA 1AQ0A 4F66A 3DHUA 1YHTA 6A3HA 1ZBCA 3ALGA 3ZSSA 2VC9A 1VRXA 1O7AA 2XVLA 5CPTA 4DWSA 2WCGA 2VZTA 1MFVA 4OUEA 1JXJA 1Q6EA 3HN3A 4YN5A 1JAKA 1GVIA 1WP6A 4DM2A 1AQHA 1H41A 5CXPA 3ARWA 4CVUA 2RGMA 5JIWA 3AS3A 4CN6A 2CEQA 1Q6FA 1ODUA 4IPNB 2IXVA 3ARUA 3PTMA 4LX4A 1E4IA 3QHOA 3VO0A 3IJ8A 2VR5A 2GK1B 4AZIA 1H4PA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2HIS A;  4JCL A;  2FHF A;  3AYS A;  3FAX A;  1TE1 A;  1H09 A;  1WB0 A;  3CHC A;  3GBD A;  3DHP A;  2CHO A;  3ARS A;  2A3B A;  4U5K A;  2JF7 A;  3VUP A;  3ZJ6 A;  2VVS A;  2D1Z A;  3CMJ A;  1GON A;  2VUR A;  2WK2 A;  4NRS A;  4QLL A;  1EOK A;  1XH1 A;  4NI3 A;  3GDB A;  3ARZ A;  2VI0 A;  4E4P A;  5DT7 A;  4NRR A;  3AS2 A;  1GOO A;  1WCG A;  1E70 M;  4W8L A;  2C0H A;  1C8Y A;  1CGY A;  3W53 A;  1NP2 A;  1C93 A;  2YBU A;  3WF1 A;  3KZS A;  3MKK A;  2XHY A;  2PWE A;  2D23 A;  5A6B D;  3D3A A;  1JIB A;  4JZ5 A;  1XH2 A;  2WNW A;  3FND A;  4HOW A;  4Z2K A;  1ODZ A;  2NW0 A;  1XGZ A;  2YL8 A;  2UY4 A;  5A2A A;  4H8H A;  3EDF A;  3NSX A;  2Q8X A;  1JDA A;  1RD6 A;  1GVY A;  1MYR A;  3GXI A;  2XJ7 A;  3AMG A;  3OLG A;  4PCT A;  8CGT A;  2WHJ A;  1NWS A;  2C8N A;  1PZ3 A;  3RPM A;  1W1V A;  4WLC A;  1MXG A;  2ZXQ A;  4NF7 A;  4PTM A;  4EAM A;  1JYX A;  2G41 A;  3CUJ A;  3OB8 A;  1OGG A;  1UYQ A;  3AIC A;  1LWJ A;  4UCF A;  2VX4 A;  4MB3 A;  1UKQ A;  2WVS A;  4H7V A;  3NJ3 A;  3VGH A;  3VIG A;  4AWE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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