2VX5A

Cellvibrio japonicus mannanase cjman26c mannose-bound form
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Cellvibrio Japonicus Mannanase Cjman26C Displays a Unique Exo-Mode of Action that is Conferred by Subtle Changes to the Distal Region of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
molecule keywords CELLVIBRIO JAPONICUS MANNANASE CJMAN26C
total genus 143
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2008-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vx5A00
3TA9A 5IFPA 3AICA 4Z2GA 2E8ZA 1VEPA 1GUVA 2D24A 1C8YA 2EQDA 2RGLA 3VMNA 3VIOA 1W1YA 3QHOA 4P7NA 3VX1A 2O9RA 1A47A 2IXUA 1EO7A 4MNMA 1UWRA 1HP5A 3N04A 1CYGA 4S3KA 4XV0A 4AMCA 3QHNA 2Y8KA 2WZHA 1CXLA 1PAMA 4W8BA 1GOWA 3SCOA 3TONA 1LL6A 4R5EA 1QI2A 2CNCA 1NOFA 2XIIA 4E8CA 2FH6A 4U5IA 1BQCA 1KGUA 3RO8A 3UERA 1KCKA 4H2CA 2DSUA 2PBOA 3BAKA 3J7HA 4R27A 4PEEA 3PZOA 3NDYA 3WQ4A 5C8BB 1DTUA 1WNOA 2Q8XA 4W7VA 5DF0A 5CPQA 4M8UA 2ZX7A 1K9DA 4QLKA 3POCA 2WK2A 5CXPA 1DWAM 4NRSA 3SEPA 1DWIM 1E56A 1V08A 3KZSA 3WL0A 1QI3A 3VGFA 4TVCA 3G6LA 4U3AA 1IZKA 2FGZA 1K6AA 3PBGA 4F9DA 5I78A 2VRQA 4PTMA 1XSJA 2WW5A 4FMVA 3AIVA 5A6AA 1PJ9A 4WKAA 1G9HA 3QOMA 1HL8A 1JI2A 3WELA 3CUJA 1BG4A 3OGVA 2G3JA 2J25A 2WCSA 2PB1A 1XSKA 2BHZA 4X9YA 3VMOA 4Q22A 5CSUA 3M6DA 4GZJA 1BF2A 4J3SA 3WENA 2BY1A 4PUEA 2XHYA 1GNXA 4H7VA 5I6SA 4LQ1A 1TUXA 2CITA 1YQ2A 2UY5A 1AVAA 2VTFA 3ZSSA 4JFVA 1CXIA 1PZ2A 1I75A 3AHXA 3F5LA 2VZSA 3KEHA 2PWGA 2QPUA 2CBUA 2DT1A 4P8WA 2VOTA 1AMYA 3W29A 4UOZA 1I1XA 3SIMA 2YDSA 4UFIA 3N13A 1ISVA 4MB3A 5A8OA 1JZ2A 1OM0A 1V02A 1V3JA 4QDMA 4DM1A 1CXEA 2HVMA 7TAAA 1VB9A 2WC4A 4Y7EA 5A6SA 3AXXA 2WHJA 4NF7A 1E4MM 1ZBCA 1CLVA 4PTVA 1B30A 2GSJA 1LL4A 3WEOA 4BS0A 1HXJA 1XCWA 4CCDA 1GW1A 2BVTA 1K9EA 2Y2WA 2ZXQA 2YBTA 2XVPA 2ZUVA 2VURA 1UD4A 3CPUA 4QP0A 1OGGA 1CXHA 1H41A 3ECQA 1SMDA 4HZ7A 2OYKA 2J77A 3ARSA 3FHQA 2X09A 2XFFA 3OZPA 4U3CA 5ABFB 3VUPA 1VBUA 1JDCA 4ZXLA 1J0JA 1K9FA 1TG7A 4EAMA 4TVUA 1KXHA 2ZWZA 4J3VA 3L4UA 2EEXA 3EMZA 1NH6A 1QPKA 4BQ4A 1W91A 1UWIA 1JYNA 3BGAA 4GQRA 3FW6A 4W7UA 1QHZA 2W91A 3IJ7A 3ARPA 2W92A 1JI1A 3LPGA 3ZM8A 2WZIA 4V2XA 2JIWA 2X1IA 4L4PA 1KXTA 2XSAA 4TX6A 1ISXA 3VM5A 1E6ZA 1V02E 3RMEA 5IXEA 4KMQA 2V38A 2J7EA 1M7XA 1E1FA 1H49A 4M81A 1C93A 1QHPA 2GJRA 1ZBKA 1FP8A 5AYIA 4OBSA 3O6AA 1EO5A 4D6FA 2QLYA 3K46A 1W3JA 1ZU8A 2Y8VA 1E70M 2QF8A 2XIBA 4WF7A 4BZYA 1R7OA 3SUSA 3SCNA 1E43A 4PSPA 2WHMA 2OWWA 1J0HA 3DC0A 3L4YA 1V0MA 1B3VA 1G1YA 1R8LA 3QGVA 5I24A 3W37A 1E6RA 4M24A 2BXYA 1JZ4A 2WHLA 2VL4A 3CLWA 3GH7A 2E8YA 3MUY1 2TAAA 2WVVB 2CESA 1M01A 3IJ8A 1U2YA 5M5DA 2JEPA 1MVYA 1JYWA 1QBBA 1FH9A 5C71A 2XG9A 1JXKA 4TX8A 3CO4A 3AHYA 4OOUA 2QMKA 1WCGA 3TTQA 3EDDA 3HMCA 4CGTA 2WSKA 5EMYA 1FH7A 2UY2A 2XSBA 1R87A 1GQKA 4NI3A 6A3HA 5ABFA 1LWJA 2WYSA 2CPUA 1B90A 3U7VA 4C7GA 2WCGA 1LL7A 5I5RA 5IHSA 1QBAA 3BCFA 2VZTA 1VJSA 4BA0A 3BAXA 2X2YA 4HP5A 1GHRA 4M29A 1HF6A 4JIEA 3PZUA 1E9LA 2OYMA 3GM8A 4K68A 1PBGA 1D3CA 1MQRA 2NW0A 1KGXA 4YHGA 5FCZA 1EA9C 2EO7A 3ZR5A 5A94A 3AIQA 1HJXA 2QMJA 3AI0A 4AEEA 3ARQA 3ZJ6A 2YJQA 1FH8A 4YHEA 1TFVA 1NWUA 1MWOA 2XVLA 8CGTA 3II1A 1B3XA 1IV8A 1C8XA 3VDCA 2DH2A 4PMVA 3W6MA 3PTMA 4J3XA 1E1EA 1XHGA 4Z2LA 4ZE4A 5TD4A 1OGBA 5D8ZA 3UESA 1JF6A 1RP9A 5IDIA 1CWYA 6CGTA 3A4WA 2FGLA 4PBGA 1JDDA 2ZUWA 2VVNA 3AZSA 1H5VA 2XVNA 2WC7A 3W27A 2XJ7A 4KRTA 4UQDA 1VFOA 3WBEA 2ZWYA 2W67A 1V6VA 1W1PA 1NWRA 1UR2A 5I2UA 1E6QM 4QCFA 1WDQA 3WBAA 5FL0A 1W9PA 4HMCA 5KZ6A 2IXVA 7CGTA 3LPPA 2ZUUA 3T2QA 4W87A 2F2HA 4NSBA 2J78A 3ARZA 2C8NA 2D23A 2ZUSA 1Q6DA 2BXZA 1UKQA 3WUBA 2VQUA 3WY1A 1FA2A 1Q6FA 4D6GA 4X0NA 5A8NA 3WMSA 2WMJA 4KWUA 1V6WA 2CBJA 4UOJA 4UQCA 3PTQA 1NARA 1B3YA 3W81A 3CUHA 2ZUTA 1EQPA 2XWDA 1EXPA 1E73M 1W2PA 4EKJA 4AYSA 3FN9A 2VX7A 4HMDA 2J79A 1MQQA 2NSXA 4LPCA 2WCAA 2DT2A 1HX0A 1RPKA 3AHVA 3EDJA 2Z1KA 3OLGA 1KB3A 2RGMA 4JCLA 1WDPA 5A6BA 1V6YA 1X6LA 1ODUA 2V3GA 4CUCA 4CCEA 3ZJ7A 2VCCA 2AMGA 2A3BA 5JBEA 4HOWA 3K8MA 3AIEA 3WUGA 3VNZA 1BPLB 1GZJA 1VBRA 1J10A 1E3ZA 3SCQA 1MW2A 3VMPA 4OUEA 4FLSA 4A3YA 4CD5A 1U33A 1B3ZA 1CEOA 3U57A 1XC6A 3CHDA 1ITCA 4P7LA 3THDA 3ZT7A 3VD3A 2BY0A 5E09A 5EB8A 4HZ6A 3TTOA 5F7UA 1X1NA 2QPSA 2CBVA 2VZVA 3WNKA 3W24A 2ESCA 3HN3A 3FY1A 2GDVA 3RM8A 4BF7A 3MKKA 1FOBA 4WIWA 4OBRA 1J11A 1V3HA 4KRUA 1OSEA 2DSVA 1MXDA 4UQ9A 1NQ6A 3ARUA 5A69A 5AC5A 2WXDM 3RM4A 3K1DA 1UUQA 4U2YA 4YPJA 2V5DA 1FHLA 1XCXA 4F66A 2XPKA 3UEQA 5CPSA 2YIHA 2G3MA 3BMVA 4DWSC 3ARYA 3GXFA 3IANA 4ZE5A 3WD0A 1MYRA 3I3BA 4IM4A 3CIVA 4QLJA 1BG9A 2J8GA 4MPKA 1UR1A 1CIUA 4A3HA 4B3KA 2F61A 2CHOA 1HVXA 4BCEA 4QFUA 2DT3A 1SR0A 1E72M 3LPOA 4P7RA 1XD0A 4JZ5A 3PZGA 1US3A 3EDKA 5DT7A 4BQ2A 1KXQA 2D0FA 5FD0A 4H8UA 3AS3A 2G3IA 3T0AA 4W7WA 2ZICA 1TVNA 3HU7A 1X6NA 2XVKA 2HISA 2CIPA 3CTTA 4C7FA 1EIBA 2GUYA 1BYCA 1JXJA 3MV11 1OBAA 3MSDA 4AZ7A 4U33A 4GO8A 2J7FA 3WH5A 1E15A 5M3WA 3AMLA 4PMYA 1H0IA 4GI8A 1ECEA 3WQWA 2GJPA 2WLYA 2DSWA 1WO2A 1CBGA 1QNOA 1HNYA 1J9YA 1EHAA 4B16A 2ZX8A 5ABEA 3JUGA 4HMEA 4HOXA 3OA5A 3VM7A 2CHNA 4NRRA 3VNYA 5AY7A 3GXDA 1DWFM 1QOXA 1XYFA 4V27A 1BGGA 4UQAA 2VX4A 4HTYA 3ARWA 4XZWA 4UTFA 1UD2A 4MDPA 2XGBA 4W93A 3DHPA 4P8VA 1JGIA 4ACYA 3VILA 1JNEA 2WBKA 2DSKA 2BFGA 5CGMA 2G3NA 4L4OA 2VT0A 1CGUA 4AD2A 4D6IA 2DPEA 3WL1A 4OZOA 3M07A 3VD4A 4ZXOA 5JBDA 5A6LA 4PMOA 4CD8A 3N1AA 1JZ6A 3DECA 4WKFA 1WE5A 3NSXA 1K9TA 1OIFA 1US2A 1E6PA 3OLEA 1H09A 4JHZA 1E4IA 5LA1A 1LQ0A 2EPNA 2WB5A 2CYGA 2VC9A 1CNVA 2E9LA 3AIRA 1E40A 3EBVA 1E0XA 1VENA 2WMGA 3U5YA 1HJWA 1UA7A 3FAXA 2WMFA 2GFTA 4U31A 2ZXDA 1RD6A 1NP0A 3CGTA 1A3HA 3SCTA 1JDAA 2ZUMA 3PZMA 4D71A 3K8LA 1EGZA 3NSMA 3ZJKA 3CZGA 3LMYA 5AC4A 2PI6A 2WAGA 2X8RA 1R86A 2YDQA 1QI0A 4XUYA 1OT2A 2MANA 3F4VA 3QHMA 4PMRA 5DEZA 2D2OA 5I79A 3WN6A 4AW7A 1PEZA 1QNQA 1MW3A 1WP6A 1V3KA 1OGSA 3WQ5A 4OOZA 4QLLA 3UR7A 4TTUA 2QV4A 2X05A 3ZIZA 3WD3A 1UD6A 2CCRA 4CN1A 1HKMA 3WH8A 1UR4A 1W3HA 2A3HA 4LXFA 4PSRA 4PN2A 1XYZA 4J28A 2WKGA 1VEMA 3VIHA 1VEOA 4MB1A 5C70A 2A3CA 4MNJA 1QI4A 4PRWA 3KWXA 1BHGA 4B9YA 4Q7NA 4V28A 4MJ4A 3VKKA 3OBAA 3AZRA 2D0HA 2O9TA 1QNSA 1ZJBA 3GNPA 3AS1A 4GXPA 3A47A 4D72A 1KWGA 4DM2A 4J3UA 1DWHM 3TTYA 3B8SA 3WQ8A 3AFBA 4PMQA 3BC9A 3ALFA 1JNDA 1CXFA 3AIUA 2YL8A 2YOCA 4AD4A 2E9MA 4RE2A 5A8MA 1W9UA 4GPNA 1MFUA 2B31A 2BV9A 2WBGA 1W3LA 2A3EA 1LLOA 4ATWA 3MANA 1PX3A 1ZBVA 3OLDA 3KL3A 1JYVA 2WLZA 1C92A 1MQPA 3SCVA 2WWCA 3FNDA 3W25A 3VD7A 3VO0A 3WDPP 1V3MA 1WZMA 1U30A 1UZ4A 2BNJA 3L4ZA 3ALGA 5A8QA 4FLOA 1S46A 1XH1A 4H41A 1GQIA 2FHBA 1UOKA 1ZB5A 2UWFA 3QR3A 1FFRA 1E0WA 3WMBA 4JKKA 2E40A 4JFTA 1FHDA 3SUTA 4DUWA 4P7QA 4DUXA 1KFWA 2C7FA 4W88A 1HKIA 2JF7A 1W3KA 5LA0A 3WD1A 3PZTA 5A1AA 1XV8A 4U5KA 4X0VA 4PMUA 2YA1A 5HPCA 4M56A 1NWTA 3U7BA 1UHVA 3ARRA 2W61A 4TOQA 3S6TA 1LG2A 1G94A 5E0CA 2WVSA 1Q6CA 3VDBA 4CCCA 2EPLX 3GBEA 1M04A 3L4XA 2CEQA 4JFWA 4AZCB 1TA3B 1JAKA 3PN8A 3WFZA 1B3WA 1UWQA 3NJ3A 2ZX6A 1EDGA 1ISZA 4FLRA 4OIFA 1BGAA 1UH4A 1CECA 1KCLA 2WNWA 5M17A 5D9OA 2PWDA 1VFMA 3BCDA 1UD3A 5AYBA 1JD7A 1O7AA 4UOQA 3WD4A 1GHSA 3NUKA 2WHKA 5BXPA 5BXTA 1M53A 3ZT5A 3SUWA 3W28A 3AQUA 2E4TA 2CBIA 1EOMA 4KGLA 2J7CA 3EMCA 3RILA 1UKPA 2VI0A 3CUGA 4UQEA 4RE4A 3AYSA 4GZEA 2QHAA 4MB5A 1EH9A 4MAVA 4F79A 4JFSA 4CVWA 1KWKA 3AIWA 3WIJA 2JALA 3VGDA 4AWEA 1SFSA 3WNMA 1BFNA 3GTNA 2BHYA 1UKSA 2AAAA 3EDEA 5HBFA 1G5AA 3AJ7A 4JKMA 2FHFA 1G0CA 4M80A 2VJXA 3WF3A 5A6MA 3CUIA 5ABHA 2JFEX 1V03A 1LF1A 3VIMA 1V3LA 1C91A 2GDUA 4ML4A 2OYLA 5ECUA 3KL5A 3CH9A 1ESWA 1OINA 5GNYA 1UA3A 5BROA 1PIGA 1NP2A 1HJQA 4FK9A 4AZGA 1VF8A 1HL9A 1VIWA 2CXGA 4LX4A 3NDZA 3TTSA 1DEDA 4DWSB 3CZEA 1XD1A 1UQZA 4P7OA 2WMIB 4TVDA 3F5KA 4ACZB 1E55A 2ZX5A 1MXGA 2WMKA 2J75A 5D9MA 5GNXA 4WJXA 1I1WA 2YKKA 1J18A 1V0LA 4AZCA 3N12A 1BAGA 1TA3A 5EBAA 3N18A 5CLTA 4FF5A 4W85A 3T2OA 1OWQA 3ZR6A 3WF2A 3DHUA 1HP4A 3I3DA 3WH7A 1UD8A 3UETA 1H2JA 1J12A 1G01A 1KGWA 4QAWA 3PZIA 1E3XA 2VQTA 1GORA 3SCSA 5D4YA 4CN4A 3WH6A 5A6BD 2JIEA 2UY3A 1TR1A 1JZ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TA9 A;  5IFP A;  3AIC A;  4Z2G A;  2E8Z A;  1VEP A;  1GUV A;  2D24 A;  1C8Y A;  2EQD A;  2RGL A;  3VMN A;  3VIO A;  1W1Y A;  3QHO A;  4P7N A;  3VX1 A;  2O9R A;  1A47 A;  2IXU A;  1EO7 A;  4MNM A;  1UWR A;  1HP5 A;  3N04 A;  1CYG A;  4S3K A;  4XV0 A;  4AMC A;  3QHN A;  2Y8K A;  2WZH A;  1CXL A;  1PAM A;  4W8B A;  1GOW A;  3SCO A;  3TON A;  1LL6 A;  4R5E A;  1QI2 A;  2CNC A;  1NOF A;  2XII A;  4E8C A;  2FH6 A;  4U5I A;  1BQC A;  1KGU A;  3RO8 A;  3UER A;  1KCK A;  4H2C A;  2DSU A;  2PBO A;  3BAK A;  3J7H A;  4R27 A;  4PEE A;  3PZO A;  3NDY A;  3WQ4 A;  5C8B B;  1DTU A;  1WNO A;  2Q8X A;  4W7V A;  5DF0 A;  5CPQ A;  4M8U A;  2ZX7 A;  1K9D A;  4QLK A;  3POC A;  2WK2 A;  5CXP A;  1DWA M;  4NRS A;  3SEP A;  1DWI M;  1E56 A;  1V08 A;  3KZS A;  3WL0 A;  1QI3 A;  3VGF A;  4TVC A;  3G6L A;  4U3A A;  1IZK A;  2FGZ A;  1K6A A;  3PBG A;  4F9D A;  5I78 A;  2VRQ A;  4PTM A;  1XSJ A;  2WW5 A;  4FMV A;  3AIV A;  5A6A A;  1PJ9 A;  4WKA A;  1G9H A;  3QOM A;  1HL8 A;  1JI2 A;  3WEL A;  3CUJ A;  1BG4 A;  3OGV A; 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