2VX6A

Cellvibrio japonicus mannanase cjman26c gal1man4-bound form
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Cellvibrio Japonicus Mannanase Cjman26C Displays a Unique Exo-Mode of Action that is Conferred by Subtle Changes to the Distal Region of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLVIBRIO JAPONICUS MANNANASE CJMAN26C
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 149
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2008-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vx6A00
1E43A 3EYPA 1GORA 1Q6FA 1JF5A 1R86A 1H41A 1HKIA 1JNDA 1GPFA 2GUYA 5CZKA 3T2OA 4HU8A 2DIJA 5CGMA 4R27A 1HJQA 3OBAA 1W9BM 1UH2A 4M81A 4WLCA 3PZGA 3T2QA 2PF0A 3WH8A 1PZ3A 1V0MA 5D8ZA 3APGA 1PIFA 2ZUNA 1E4MM 1US2A 1OGSA 2OWXA 3WENA 1XD1A 1ISYA 1J01A 4R5EA 2WCAA 2CETA 2CIPA 1TA3B 2E40A 5A3HA 1LF1A 1Y7VA 2EBNA 2VR5A 3UESA 3A4WA 4J28A 1VEOA 1VFUA 1HX0A 2VX5A 3GXFA 1IZJA 3I3EA 3BSGA 1M01A 2OSYA 1UD4A 3AHYA 3SCSA 1VJSA 4DWSB 2E9MA 2J4GA 4H7VA 1UWIA 3IJ7A 3L4ZA 1GQLA 2WVUA 4CCEA 4DUXA 1U30A 4MNJA 1A47A 4H04A 4QFUA 3GXDA 3VGBA 1VFMA 4A4AA 4W8AA 3VGEA 2CBUA 3E1F1 3ZR5A 3GBDA 3AJ7A 5E9AA 4OBSA 1JG9A 1VBRA 4QCEA 5C71A 4GIAA 3LPGA 1KBKA 2J8FA 1XSIA 1KGXA 4MADA 1GOOA 1ESWA 5ABFB 1JYNA 1E4IA 1HKMA 1J10A 7CGTA 2OWCA 1OBAA 3VNYA 1WDRA 1WZMA 1HKJA 2D24A 2YDRA 5JUVA 1LWJA 2E9LA 3O2LA 1ODUA 3RM9A 2HVMA 4HU0A 5A6MA 4W87A 4KGJA 3WFLA 4CD4A 2VJXA 2QPUA 1E71M 4F8XA 1G01A 4W7UA 1DEDA 1HJXA 4M56A 8CGTA 2DT0A 4LQ1A 2WMIA 5ABHA 4W7WA 3CIVA 4EK7A 1WPCA 4W8LA 4U5KA 2A3BA 1WZAA 5ABFA 4JKLA 1JAKA 5BXPA 1C8YA 1C8QA 3AIBA 2W61A 3MSDA 5A6LA 4PRWA 5LA2A 3MO4A 4DUWA 1ISXA 4HOWA 1SFSA 1XH1A 5LA0A 4JFUA 3EDFA 5CSYA 2XM2A 4D71A 1MXGA 5HDRA 1EA9C 1EHNA 2DDXA 1KXQA 1QNQA 1QI5A 4FK9A 1BHGA 3HU7A 1UKOA 3AFBA 3BLPX 1BSIA 1E6SM 4KRTA 4PMVA 1L0PA 3AZRA 4HA1A 1ODZA 1WZKA 3IANA 4QCFA 2NW0A 1R85A 1OT2A 3CTTA 2EEXA 3WQ4A 3PN8A 1F4AA 3AXHA 4XZBA 4CU8A 3ARZA 3ZJKA 3THCA 1H09A 2Y5EA 2A3CA 4FMVA 3NYDA 4WKHA 2VZOA 3AXXA 1X6LA 1M04A 4GINA 5I2UA 2QLYA 3EDEA 4RE2A 4Q22A 2VCCA 4MPKA 3WNMA 2BVDA 4MNMA 1XRVA 2FDMA 1U2YA 1K6AA 3VUPA 1UR1A 1UR9A 1W1TA 3WF1A 3WY1A 3WKZA 3VD7A 3TTOA 4CD7A 4YPJA 3CHFA 4JFVA 1NM9A 1OB0A 4A3HA 1CTNA 4P7OA 4U33A 4AIEA 2YL6A 1CENA 2WSPA 5IXEA 4C7GA 3BCDA 4GZIA 2G3NA 3ARVA 5D4YA 1H0GA 1A3HA 3GXMA 4RL3A 1WDSA 4M29A 3WUEA 1QNSA 1WE5A 2WB5A 4H2CA 3K1DA 2XVLA 3AHXA 3AIEA 9CGTA 3CHDA 3DYOA 4EE9A 1UD2A 3BLKA 5I78A 4JHZA 4AZ7A 2E8ZA 4UFKA 3AHVA 4EANA 2Y8KA 5I6SA 3AXIA 3SURA 1J0HA 1VFOA 3AOFA 4FLRA 3SUUA 1ZU8A 3OLEA 2XIIA 1E15A 3ZR6A 2W63A 1YHTA 1QOXA 3OA5A 3ZT5A 3VD3A 3PZOA 1X1NA 1B90A 4U2ZA 3AIRA 4P8WA 3W53A 1LG2A 1UR2A 2WVVB 4J7RA 4BCEA 1ZJBA 1DWHM 1F4HA 4CU7A 1BYAA 2XHYA 1PZ2A 1GOQA 2PBGA 1OGBA 4PMNA 3GTNA 3VD4A 2YLLA 3WDPP 2ZUUA 2MANA 4D72A 3T0BA 2QV4A 4GI9A 2DT3A 4JL1A 2ESCA 2PWEA 2UY4A 2OYMA 1XV8A 3SCTA 4BF7A 3L4VA 4P8UA 1WCGA 5A8PA 5IHSA 3ALFA 1MW3A 3ARUA 3EBVA 2ZX7A 3AI0A 2GK1A 1GVIA 2G8ZA 4OOZA 3DYMA 1AQMA 1KFWA 4V2XA 1BYDA 1NWTA 2J7CA 1LLOA 4QLJA 3ZT6A 3M6DA 2VNCA 2E4TA 3IK2A 4M8UA 5A2AA 1EIBA 4PBGA 2XG9A 5E0CA 2OSXA 1PX4A 3CZLA 2J74A 2CHOA 5A69A 3W0KA 1QI2A 2OSWA 1VEMA 1K9DA 2AMGA 2W5FA 3AIQA 3WNPA 1EOMA 3F5JA 2YLAA 4J3UA 1H49A 4D6IA 1E3ZA 3TTYA 2X2YA 2O9OA 2BY0A 2CNCA 2D2OA 3CPUA 2WCSA 3OGRA 5GPRA 3WDQA 5BXRA 1W32A 3CHCA 2HISA 4PTMA 3SUSA 4GZEA 2WYSA 4D6GA 2XVPA 3TA9A 1VEPA 4UFJA 5DT7A 4PCSA 4YN5A 3VDHA 3WQ6A 3A4XA 5KZ6A 2IXUA 2NSXA 4AXNA 2DEPA 4MNKA 1QNRA 5CLTA 1FOBA 3AROA 5CSUA 4JL2A 1OWQA 3RMEA 1D3CA 5A95A 4IPLA 3W4RA 1XD0A 1P6WA 1CZ1A 2WANA 4UQCA 4Z2GA 2NT1A 3BXWA 1KXHA 5FL0A 3VIMA 2WMGA 4WIWA 1E0XA 3BAWA 5HOSA 1VENA 1TZ7A 1BTCA 3U7BA 4MDOA 1UA3A 1QI0A 3FAXA 1BG4A 3WEZA 3VX0A 3AICA 1OIFA 1ZB5A 1LL4A 2EPOA 1FH7A 4JIEA 1H3GA 3CMGA 2J78A 4CN1A 4CGTA 5AYBA 3WQWA 1CNVA 2CBVA 4CN4A 4E4PA 2WC3A 1HVQA 5I77A 1UA7A 1JNEA 4FLOA 2BHZA 1GONA 2CHNA 1E6PA 4HTYA 4TTUA 4NI3A 2WW5A 1JXJA 3BAIA 2V5DA 4GPNA 1HN1A 3ALGA 2CCRA 3VO0A 4W7VA 1FH9A 1G9HA 1TVNA 3OLGA 1E5NA 4S3KA 1NP2A 5DO8A 2E8YA 1H5VA 4HOXA 2XVKA 1HJSA 4U5IA 3QHOA 1E55A 3VGFA 5EMYA 4PN2A 4F66A 1WKYA 1V6VA 2VL4A 1CGTA 2G3IA 1J12A 2VOTA 1BYCA 2CBIA 3CMJA 5IFTA 2GVYA 2BY2A 1V6XA 4HPHA 1UKQA 1J0ZA 1V08A 3EMZA 4F9DA 2FHFA 3N13A 1EGZA 2WAGA 1UWSA 1W3KA 1GOMA 1VBUA 3K8KA 2YA1A 3CUGA 3ARXA 2ZUWA 1QNPA 3AYRA 4JAWA 4WKFA 3N18A 2YA0A 3FAWA 2WHKA 5I24A 4P7LA 1HJWA 3AQUA 1V3HA 2XUCA 2J7EA 2BNJA 1LL7A 3N9KA 1ZS2A 3SCUA 4W5UA 4AISA 1JFXA 3CUJA 2PWDA 4V28A 2EXOA 4AZHA 1ITXA 3WUGA 1NQ6A 3VU2A 4P7RA 1BG9A 1D7FA 3WD2A 4PTVA 1EHAA 3W29A 2D3LA 2J77A 2XYLA 3UEQA 3WL1A 2J7BA 1IV8A 2CYGA 4W86A 3PTKA 2O9RA 3TONA 4BQ2A 2WNWA 5A6AA 4CKQA 1E0WA 2BS9A 1CBGA 2V38A 7TAAA 3NDYA 4AMCA 1HVXA 1JFHA 3ARYA 4F9JA 1TE1A 3ZT7A 1E6NA 4L4OA 3BMWA 1CLVA 1W3JA 1JD9A 2VX7A 3I3DA 3OG2A 5HPOA 3WN6A 4PMQA 3AMGA 1EDQA 4J3VA 5M03A 3AHZA 1ZBWA 1IT0A 4U2YA 4PMUA 5I23A 1DWIM 3RIKA 4AD2A 2JEPA 3HN3A 5GNYA 1M53A 4OJYA 1G94A 3SUWA 4CCDA 2EPNA 3AZTA 3VGDA 1W1VA 1W9VA 3T0DA 1SMAA 5TD4A 3VVGA 4D1JA 4AYSA 2CKRA 1D2KA 4C7FA 4FF5A 1UOKA 1W9XA 2ZX8A 1CGVA 3QOKA 1MFVA 2WPGA 3AMCA 2YL5A 1CDGA 4TX6A 4OIFA 1BQCA 3VMNA 5D9NA 1FFRA 4W5ZA 1E40A 2WMFA 1E72M 5I79A 5BRPA 3W25A 1UKPA 3MU7A 1UR0A 1BF2A 3WH5A 2UY5A 3KL0A 1GQIA 2V3FA 4UFLA 5ABEA 4ZENA 2WKGA 2D23A 4TOQA 3GDBA 2VVNA 2VRJA 4Q7NA 1BGGA 5CG0A 1H1NA 4MAZA 1UZ1A 4LYQA 4WF7A 1CXFA 3SCOA 5AC4A 3ZO9A 3FHAA 4CU6A 1BAGA 2WMIB 3I3BA 5FCZA 2DSVA 4E8CA 4HZ8A 1QBAA 4URIA 1VIWA 3II1A 3OGSA 2F61A 5LA1A 4B3LA 2W66A 4GI8A 2GJRA 3GZAA 3HMCA 1NARA 4ZE4A 1NH6A 2GFTA 1VRXA 5CXPA 1KB3A 4YHGA 4CCCA 4KH2A 2ZXBA 2WXDM 4PMXA 2DSWA 3QGVA 2Q8XA 4W93A 3AIVA 1W91A 1KCLA 3WQ5A 5JBDA 1W2VA 2D22A 5I3DA 1B3WA 1RPKA 1OCQA 2Z1KA 4W84A 1MW1A 3DECA 1JF6A 4K68A 1V3MA 2YJQA 2XGBA 4UFMA 3K46A 3WDJA 4KWUA 4AW7A 1EQPA 4D6DA 1DHKA 4ACZA 3GXIA 3WBEA 2WM0A 1V3JA 1RP8A 3IJ8A 6CGTA 5JIWA 4LYPA 1SYTA 1UKSA 4B3KA 4PTXA 2O92A 3N1AA 5ECUA 2CXGA 1C93A 3PTQA 1OD0A 5A8QA 1GZJA 2CITA 5LYRA 1MW0A 4UNIA 4ACYA 3N15A 4QLLA 1HF6A 1L8NA 5IDIA 3W37A 4TXEA 1J9YA 1HL8A 3AHTA 3NSXA 5E70A 3WDIA 3NDZA 1AVAA 2CBJA 2VRKA 3AMKA 1KGUA 3L2LA 1K9TA 4IM4A 4KGLA 4OKDA 1B1YA 2IXVA 3W27A 3ZJ6A 1OT1A 3S6TA 3WD1A 4CVUA 2C8NA 4PYSA 2ZUMA 5D9OA 1V02A 1GQJA 2WHMA 1QW8A 2WHJA 2WWCA 1M7XA 3MMDA 2ZIDA 4RE4A 1B0IA 2WVSA 1J11A 3RJYA 1EDTA 1W2PA 2BVTA 1VFFA 4H41A 4AD5A 4P8XA 2BXZA 4ZXOA 3L4YA 1J0KA 2ZOXA 2VZTA 1J18A 3L4XA 3VD9A 4N42A 3SUVA 3BGAA 3ZMRA 4A3YA 4M24A 1MQPA 3FN9A 1JZ5A 4XX6A 2QPSA 1W9DM 4DM2A 3KE0A 3AYSA 2YBUA 1VF8A 4HA3A 3VDCA 1BVZA 3W24A 4ZEPA 1E9LA 3WMSA 3A6OA 4EAMA 3WBAA 2ZXDA 1B3VA 3VIGA 2EQDA 2XSAA 3W6LA 3PZMA 4HMEA 3LPPA 4D6EA 4UZSA 1UHVA 3CUIA 5BYWA 2WKLA 2X8RA 2WMHA 4GQRA 1CXKA 1C92A 1NWRA 4DWSD 5FIPA 2DSKA 3CZKA 2OYKA 3AMLA 2W4XA 1V0NA 4PMZA 1XCXA 3PHAA 1WP6A 3WH9A 2ZX9A 3A4AA 4CD8A 1CGWA 3VM7A 5BXTA 1FP9A 4JFSA 1JZ6A 3IAQA 4WK9A 1GHRA 4GZJA 2EJ1A 1CLXA 4GO9A 4QP0A 1MWOA 1C90A 1WDPA 3VPLA 1YQ2A 1JDAA 1UQYA 4Z2LA 1PBGA 3RDKA 3FY1A 4D1IA 1FHLA 3PBGA 5CPTA 1SMDA 1US3A 2ZWZA 1QVBA 2X05A 1GQKA 2V5CA 2CESA 3F5LA 5C70A 1JZ2A 3S2CA 2GK1B 2QF8A 1E3XA 1UD3A 1B3XA 1XYZA 2PB1A 1GCYA 1E6QM 4DWSC 1O7AA 1B9ZA 2WZEA 3D5HA 3UG4A 1TG7A 2E9BA 1JIBA 1MW2A 1J0IA 1V6UA 2CPUA 2PI6A 5M3WA 3WUBA 2Y2WA 3WD4A 3M46A 4JFWA 4NZCA 3WH6A 3PZIA 2Z1SA 1FHDA 3MUIA 1E56A 2WZIA 3QR3A 1V0KA 2AAAA 4AEEA 1JGIA 4H8VA 4AIUA 5EBAA 1R7AA 2EO7A 3JUGA 4FLSA 5A6BD 3CZJA 3F4VA 2YDQA 2VZVA 4AD0A 2YOCA 1MYRA 2Y24A 1NOFA 1NOWA 4NRSA 4JCLA 2EPKX 2ZICA 4UCFA 4M80A 1HT6A 1ZL1A 1XGZA 3UR8A 1E0VA 4D6HA 3BAKA 1CXEA 2PBOA 1OM0A 1UWUA 5DF0A 2IUZA 3FXYA 4MJ4A 4UOZA 1E73M 3U5UA 3MS8A 1HP5A 2VX6A 6TAAA 3VGGA 3UG5A 3VGHA 5CJ5A 3TTQA 4TVCA 1V3IA 2UWFA 2W91A 5JBFA 1W1PA 2VQUA 4IPNB 1UWQA 5JIPA 2W92A 1QPKA 1GOIA 1JDCA 5BROA 2JALA 1TR1A 2G4FA 2OWWA 2FH8A 2VT0A 1CGUA 3W6MA 1PAMA 2VURA 4N0RA 1EXPA 2BVYA 2XGIA 4M82A 3RILA 1FH8A 3OZPA 4UFIA 4LYRA 4NF7A 5C8BB 4AEFA 1TVPA 2VCAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E43 A;  3EYP A;  1GOR A;  1Q6F A;  1JF5 A;  1R86 A;  1H41 A;  1HKI A;  1JND A;  1GPF A;  2GUY A;  5CZK A;  3T2O A;  4HU8 A;  2DIJ A;  5CGM A;  4R27 A;  1HJQ A;  3OBA A;  1W9B M;  1UH2 A;  4M81 A;  4WLC A;  3PZG A;  3T2Q A;  2PF0 A;  3WH8 A;  1PZ3 A;  1V0M A;  5D8Z A;  3APG A;  1PIF A;  2ZUN A;  1E4M M;  1US2 A;  1OGS A;  2OWX A;  3WEN A;  1XD1 A;  1ISY A;  1J01 A;  4R5E A;  2WCA A;  2CET A;  2CIP A;  1TA3 B;  2E40 A;  5A3H A;  1LF1 A;  1Y7V A;  2EBN A;  2VR5 A;  3UES A;  3A4W A;  4J28 A;  1VEO A;  1VFU A;  1HX0 A;  2VX5 A;  3GXF A;  1IZJ A;  3I3E A;  3BSG A;  1M01 A;  2OSY A;  1UD4 A;  3AHY A;  3SCS A;  1VJS A;  4DWS B;  2E9M A;  2J4G A;  4H7V A;  1UWI A;  3IJ7 A;  3L4Z A;  1GQL A;  2WVU A;  4CCE A;  4DUX A;  1U30 A;  4MNJ A;  1A47 A;  4H04 A;  4QFU A;  3GXD A;  3VGB A;  1VFM A;  4A4A A;  4W8A A;  3VGE A;  2CBU A;  3E1F 1;  3ZR5 A;  3GBD A;  3AJ7 A;  5E9A A;  4OBS A;  1JG9 A;  1VBR A;  4QCE A;  5C71 A;  4GIA A;  3LPG A;  1KBK A;  2J8F A;  1XSI A;  1KGX A;  4MAD A;  1GOO A;  1ESW A;  5ABF B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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