2VX7A

Cellvibrio japonicus mannanase cjman26c mannobiose-bound form
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTATGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
publication title The Cellvibrio Japonicus Mannanase Cjman26C Displays a Unique Exo-Mode of Action that is Conferred by Subtle Changes to the Distal Region of the Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELLVIBRIO JAPONICUS MANNANASE CJMAN26C
total genus 143
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.-:
pdb deposition date 2008-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vx7A00
1A3HA 3ZM8A 1G1YA 2BY2A 4CCEA 2W63A 1WZKA 3QR3A 2J7DA 5A6LA 1ODUA 2J7FA 4UOQA 5EMYA 3CZGA 4N0RA 4AZIA 2XVNA 5EBAA 2VCCA 3PTMA 4UZUA 3L2LA 1NOFA 4UTFA 4KGJA 2PWHA 3IANA 3AS3A 1JG9A 1JD7A 3VX1A 5TD4A 1E55A 1HJQA 2VX6A 3PZ9A 2WLYA 4YHEA 3W6MA 2F2HA 2Y2WA 3WUFA 1A47A 4CU7A 4MTVA 1JYWA 1JYNA 4L4PA 1XCWA 2XPKA 3CMGA 5JIWA 3UG5A 4GI8A 1UWRA 4MB1A 1QVBA 3UG3A 3UETA 3RM4A 1KR1A 5ECUA 3VIKA 4HU8A 1QI2A 1XV8A 1U30A 4L4OA 2XM1A 3SCPA 1UZ1A 4J3WA 5E6ZA 4F8XA 1VIWA 2WSKA 5EFFA 1G5AA 1GOMA 1KGXA 4U3AA 3AROA 5D8ZA 1JZ3A 3THCA 3CBWA 3N13A 3GH7A 1TUXA 1PJ9A 1ISXA 1LQ0A 3PN8A 2PBGA 3O6AA 5HPOA 1ZBWA 3GBEA 3KWXA 4CD8A 4QCFA 4H2CA 1UD6A 3F5LA 4J27A 4S3KA 1GQKA 2XYLA 4B3KA 1SMDA 3F5KA 2OYMA 5D9PA 2VX5A 4P7QA 1D2KA 3QOMA 4Q22A 3VMNA 2J7CA 1KFWA 4PCSA 3BXWA 3WBEA 2EXOA 3AJ7A 2WBGA 3U7BA 1QBAA 2QHAA 3BCFA 2XTKA 5A6JA 1HL8A 1E6ZA 3KL0A 4X0NA 3VILA 2VC9A 1QHZA 1H0IA 2E9BA 2QF8A 3AHXA 3GM8A 3QGVA 2XUCA 2FGLA 2A3HA 2GVYA 2WC3A 4AIUA 2A3EA 1E4MM 1D3CA 1R86A 3UEQA 1QI4A 1VF8A 3ZT7A 4AZCA 4D1IA 4OKDA 1R7OA 1B3VA 1JYVA 1MQPA 3WSUA 3GTNA 2J8FA 3EMCA 1C3FA 1HXJA 1M53A 3WQ5A 2D2OA 4W93A 1E0VA 4JHZA 2EO7A 4MPKA 3ARVA 5A2BA 1UD5A 5A6MA 4M1RA 1OIMA 2CXGA 5E9AA 1B90A 1OWQA 3GXDA 1VFOA 3VIHA 3CZJA 2ZUMA 1GUVA 3ZSTA 4TVCA 4LGXA 2VZVA 3CHCA 4CKQA 1KXVA 1M01A 5CGTA 4P7LA 3GYCA 2D24A 4WSJA 3W38A 1E6QM 3EYPA 1UKTA 1VJZA 3GXFA 3AXHA 2E40A 2ZXBA 3MSDA 2CPUA 3VD9A 4D1JA 1CXFA 3WFZA 2PWGA 1MW3A 4AY1A 3L4TA 2J4GA 5I2UA 1JD9A 1R8LA 1WDQA 2ZXQA 5FD0A 1CWYA 1JZ8A 5FL1A 2ZUVA 4IPNB 1JNEA 1LWJA 1V3IA 1TZ7A 3T0AA 3BC9A 4AZGA 1JFXA 1WZMA 2BY1A 2DGAA 4HZ6A 4KRUA 4ATDA 3UERA 5CZKA 4E8CA 5BCAA 1UR4A 1UR2A 1G01A 3POCA 1E70M 5CGMA 3WMCA 2VR5A 1SMAA 3W28A 1AQHA 3HMCA 3U7VA 3WD1A 1TG7A 3AIQA 2UY4A 3EMZA 4EKJA 1W1PA 1KBBA 4LQ1A 1ZS2A 2JFEX 1OM0A 4MB5A 3VGGA 2PBOA 4P7RA 1GOWA 3ZIZA 2ZX9A 3K1DA 3VPLA 4H8HA 5E09A 2OYKA 1MXDA 3MMDA 4UFKA 1CGXA 4UQEA 2OWXA 3PZQA 1W1YA 3N17A 4HZ8A 1EHNA 1HKKA 2DDXA 1K9FA 4RE2A 1ESWA 3WD4A 4W7WA 2WC4A 2WMIA 3MO4A 5A8NA 2X0YA 1V0NA 4TXEA 2CERA 2CHNA 3OG2A 1BSIA 3GXIA 1W32A 2ZOXA 3RIKA 2JALA 1V0LA 3RM9A 1SYTA 1WDSA 4BQ2A 1JL8A 3WDJA 1VEMA 3CUFA 4HMEA 3L4WA 1MWOA 2JEQA 3QHNA 4PMDA 2BV9A 3EBVA 5D9NA 3W27A 3WQ6A 1XD0A 1Q6DA 2J25A 2VZUA 1QPKA 1C8XA 3BAKA 3VVGA 1UHVA 2F8QA 1BTCA 2VCAA 5AYBA 3K8KA 3GDBA 3MU7A 5FIPA 5BXPA 3RM8A 3VKKA 1QW8A 4W86A 1K9DA 2YDSA 4HPGA 2CBUA 3NJ3A 1JI2A 1LWHA 4J3XA 3VIFA 1WZLA 2J79A 2Y8VA 3T08A 3AMDA 3MV01 3KL5A 1C8YA 4UFIA 3VDHA 4AZHA 4CN1A 3ZOAA 1MVYA 2G3MA 4M56A 3WNPA 5D9MA 4W7UA 2BNJA 2E4TA 3IJ8A 4OIFA 3N15A 3SUVA 1WZAA 4B3LA 1FH9A 3B9EA 6TAAA 3CUIA 1EGZA 4F9JA 3VDAA 1CIUA 1JF5A 1GOKA 5AC5A 2QMKA 3WL0A 4D71A 2F61A 1Y7VA 1UKPA 4DM2A 2E8YA 4FLRA 4GZIA 3SEPA 4JHOA 3UESA 5CQ1A 3WH5A 4RL3A 4HU0A 4W84A 1LL4A 1MW1A 1WDRA 1X6LA 1JFHA 2Z1KA 4MB3A 2W4XA 1NWTA 3AHZA 3I3DA 4M8UA 1ISVA 4PSPA 4CCDA 2VVSA 1CXIA 1ITCA 4TVUA 2EPLX 1CXHA 4XB3A 1JAEA 3CPUA 3W37A 2C0HA 2O92A 1E1FA 4AZ7A 5M03A 1J0IA 5FOOA 3OA5A 3NCOA 2J74A 1UG6A 1B30A 1I1WA 1XH0A 1C8QA 1X1NA 3WDQA 1GOOA 5LA2A 3M7SA 4GZEA 1Q4NX 4DWSC 1DHKA 4UOJA 2PWEA 2FHFA 3SCRA 2FH8A 3OGRA 1QI5A 1DTUA 3L4UA 2YL9A 2FH6A 5CLTA 4RE4A 1BVZA 4W87A 4GZJA 1WE5A 1QHPA 2D22A 2J77A 4M24A 2CNCA 4P8XA 4KMQA 1W1VA 2WAGA 2J7GA 3VDCA 3WNOA 1E56A 1NOUA 3PTQA 4M82A 4ZXLA 1HJWA 3EMQA 4AISA 2WHKA 2WWCA 4ZXOA 4B16A 4R5EA 4IISA 1JDDA 4WJXA 1Q6CA 3SCSA 3CH9A 2WLZA 4R27A 3MMUA 3CIVA 4D6FA 4UZSA 3WQWA 2JIEA 3OGVA 4HOWA 2J7EA 1J12A 1QNSA 4GIAA 2G4FA 2X1IA 3NDYA 2X2YA 5IXEA 1YHTA 2WKLA 3ALGA 1E6PA 1TVNA 1UWQA 2QMJA 3WUEA 1H0GA 2DT2A 4ML4A 3AYRA 1VFMA 2D0HA 3EDEA 2JE8A 1OINA 2CCRA 3MSGA 4D6HA 5CG0A 2E8ZA 1WAWA 2BHYA 2BHUA 4OJYA 4U5IA 1CGWA 3WDHA 1OIFA 1FOBA 1BAGA 1EO7A 2FHCA 4ATLA 5I0DA 4PMZA 4D6JA 5E6YA 1C90A 4PRWA 5ABHA 3AIWA 5I23A 4U31A 2GJPA 4B15A 1ISWA 1SR0A 4KWUA 1Q6EA 1EQPA 1OBAA 4Z2KA 5HOSA 4J3UA 3AFBA 2G8ZA 1ISYA 1J01A 1UH2A 1H11A 1XH2A 1KQZA 7A3HA 3GNPA 4LPCA 2PWFA 1W9UA 3N1AA 1NP0A 4UFLA 3SCNA 3W24A 3LMYA 1CZ1A 2WVVB 3D5HA 2BY0A 4Z2GA 3CLWA 3WF0A 1BFNA 3WDPP 2PWDA 1LF1A 1W2PA 2VCBA 4AIOA 3U57A 1NARA 1E73M 4N42A 4U2YA 1UUQA 2X09A 1C7TA 2W62A 1KCLA 3KEHA 4QLJA 2J78A 1BHGA 4J28A 1O6IA 4CU6A 4MJ4A 3WF4A 1UWTA 1ZBCA 4UNIA 3ZJ8A 3DYPA 4D6CA 4A3YA 2VVNA 4GO8A 4GO9A 3II1A 2DH3A 1U33A 1XH1A 3KL3A 4UFMA 3OLIA 2O9OA 3VTRA 4QP0A 5CPSA 3NSXA 2E9MA 8A3HA 3RMEA 4PMUA 1ISZA 1KGWA 2PI6A 4AMCA 4MB4A 1OT2A 1EOMA 3VUPA 2WWDA 3BLPX 1M04A 3LPOA 3SIMA 1JDCA 3PHAA 3TONA 3PZMA 2DT3A 4TTGA 1UD3A 2A3CA 1IZJA 2E9LA 2ZWZA 1E40A 4Q7NA 1UA7A 2YA1A 1H2JA 2W67A 3CHEA 2BXZA 1CDGA 3ZR6A 2V3GA 1HVQA 2FGZA 1O7AA 3ZMRA 3K4AA 1J9YA 4UQ9A 4FLSA 1V02A 4NI3A 5GQBA 2FHBA 3KE0A 3AI0A 2QV4A 4PMVA 3WELA 2WCGA 1EIBA 4BQ3A 5A2AA 3T2QA 2G41A 4QLLA 3WBAA 4XV0A 1V03A 2J62A 1JXJA 1DWGM 2DT0A 1CLVA 1WCGA 1ZBKA 2YBUA 3VIOA 3S2CA 4ZEPA 1NWRA 2A3AA 3AHVA 1Q6GA 2XIIA 2DQXA 4EAMA 2EPKX 4GPNA 1B9ZA 2XVPA 2YDRA 1EQCA 4M81A 1HJUA 4M29A 1BYBA 2WMKA 1KXQA 2WCSA 2Y8KA 1TA3B 4HA4A 2YKKA 5CJ5A 3VIMA 3CUGA 1CXLA 2OLHA 1TFVA 4H8UA 3E1F1 1R85A 3RCNA 1LL6A 3W26A 3AOFA 3ARXA 3UCQA 2V38A 2BS9A 4D6DA 4PN2A 3OB8A 5AY7A 2WHJA 1XC6A 3AIRA 4IM4A 1K6AA 3TTOA 1DP0A 4FK9A 1QNPA 4U2ZA 2WKGA 2EBNA 2YL8A 1GHRA 1W2VA 4NZCA 3PZVA 3G6LA 1QNOA 5A69A 4JFTA 1HT6A 1PZ2A 1ECEA 4MAZA 1B3XA 4PEEA 1K9EA 3CZKA 2J75A 2JF7A 3RJYA 3HN3A 5A6SA 2X8RA 1U2YA 4CD6A 1XCXA 1EHAA 3NYDA 3NIYA 3VIPA 1TVPA 4PCTA 2CKRA 2OWWA 1DWHM 1H5VA 5A3HA 4AEFA 2XJ7A 4E4PA 2WM0A 1CPUA 3CHDA 1N82A 3AS0A 1L0PA 2AOSA 3L4YA 4H04A 1CBGA 3QHOA 1EDGA 4F9DA 3RILA 4AW7A 4BS0A 3N9KA 4JAWA 3VX0A 1E3ZA 2G3JA 3VO0A 3ZT5A 1NM9A 4XZBA 1PX3A 5BRPA 1BLIA 1FP8A 5BXSA 1WP6A 1EO5A 3APGA 5M3WA 3WIJA 3F4VA 2ZICA 3AZSA 3AS1A 5CLWA 7CGTA 5E70A 4OZOA 3OBAA 3ECQA 4E8DA 4LXFA 3BSGA 2D0FA 3RO8A 4HMCA 4JCLA 4TOQA 2CETA 2ZWYA 2WHLA 3BMVA 4JIEA 2O9TA 4P8WA 4C7FA 2DPEA 3AXIA 4V28A 3O9NA 2WSPA 3T0DA 2YA2A 3WEOA 3CUJA 5DFAA 1UR9A 1E9LA 1GQJA 3WF1A 4Z2JA 3WNKA 2ZX7A 4PBGA 4MNMA 3AZTA 1KQYA 1GONA 2UY2A 2VR4A 4PTMA 2PC8A 4AZBA 1V6XA 3TTQA 2CESA 4MNKA 4MNLA 2DEPA 2NW0A 3DHUA 3IAPA 3EDJA 1BYDA 3WF3A 4QDMA 4WKFA 2JIWA 3TTYA 2DH2A 1JXKA 1RP8A 2YOCA 1VBUA 3MV11 1J0ZA 4DUVA 3OLGA 4W5ZA 3BSHA 1V3MA 1PEZA 3ALFA 5DMYA 1BG9A 3VGHA 1KWKA 1WO2A 2ESCA 4GKLA 1I1XA 1W3LA 1H4PA 3VNYA 3AMCA 1UR8A 3D3AA 4UCFA 1JIBA 2EQDA 4RE3A 1UOKA 5BROA 2WB5A 8CGTA 2XSBA 3SCWA 4V2XA 5EFDA 1UD2A 3RPMA 3WUGA 2W92A 1GORA 1FHLA 5E0CA 4NSBA 3VIJA 3WNLA 1H49A 3MUY1 5GNYA 4PMYA 4UQAA 2WMJA 1Z32X 2ZUWA 2VO5A 1TE1A 4PUDA 4C7GA 3VD4A 2ZXDA 3T2PA 2WC7A 5M17A 2GK1A 1NQ6A 1GPFA 2XVLA 4ZE4A 1M7XA 4U33A 2J7BA 1E6SM 3WENA 1V3HA 3L4ZA 4H8VA 5A8MA 3T09A 4CUCA 3QHMA 1CXKA 3WEMA 1UZ4A 2WHMA 2WVUA 1HF6A 1OT1A 5C70A 1B0IA 3N18A 2JEPA 3PZNA 1D7FA 3FNDA 4M80A 4JL1A 4JZ5A 2VQTA 4MADA 5D4YA 4JCMA 1VB9A 5FKYA 2XWDA 3DHPA 2OSWA 3VM7A 1UD8A 5ABFA 4QFUA 1G94A 4PTVA 5GNXA 1GOIA 5HNNA 4AZ6A 4ACZB 1GHSA 4OBSA 4A3HA 2ZIDA 4AIEA 2NSXA 1VRXA 3ARUA 1UD4A 1KGUA 5BYWA 1V6VA 2VMFA 3FXYA 1HIZA 2V5CA 3WH9A 5DT7A 3WNMA 4DWSB 5IFTA 3M46A 4AD4A 4U5KA 1ZB5A 5CXPA 2WVVA 2VZOA 4AD3A 2XSAA 4JKLA 3CZ8A 1GCYA 2ZX5A 3PZIA 1VJSA 5A6BA 3VGEA 3WQ4A 1E4IA 1IT0A 3A4AA 4LYRA 1JZ5A 4XZWA 3A3HA 2XFYA 1UWUA 4AD5A 1E6RA 3FN9A 4H41A 5LA1A 3UG4A 1FFQA 1W9BM 2AAAA 1W9PA 1VEPA 1H09A 3PZOA 2D3LA 1MYRA 1VBRA 3W29A 3K8MA 1GNXA 2WANA 3K4DA 3MUZ1 2X0HA 5A95A 4UFHA 2RGLA 3CHFA 3THDA 4MDOA 1SFSA 4CCCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1A3H A;  3ZM8 A;  1G1Y A;  2BY2 A;  4CCE A;  2W63 A;  1WZK A;  3QR3 A;  2J7D A;  5A6L A;  1ODU A;  2J7F A;  4UOQ A;  5EMY A;  3CZG A;  4N0R A;  4AZI A;  2XVN A;  5EBA A;  2VCC A;  3PTM A;  4UZU A;  3L2L A;  1NOF A;  4UTF A;  4KGJ A;  2PWH A;  3IAN A;  3AS3 A;  1JG9 A;  1JD7 A;  3VX1 A;  5TD4 A;  1E55 A;  1HJQ A;  2VX6 A;  3PZ9 A;  2WLY A;  4YHE A;  3W6M A;  2F2H A;  2Y2W A;  3WUF A;  1A47 A;  4CU7 A;  4MTV A;  1JYW A;  1JYN A;  4L4P A;  1XCW A;  2XPK A;  3CMG A;  5JIW A;  3UG5 A;  4GI8 A;  1UWR A;  4MB1 A;  1QVB A;  3UG3 A;  3UET A;  3RM4 A;  1KR1 A;  5ECU A;  3VIK A;  4HU8 A;  1QI2 A;  1XV8 A;  1U30 A;  4L4O A;  2XM1 A;  3SCP A;  1UZ1 A;  4J3W A;  5E6Z A;  4F8X A;  1VIW A;  2WSK A;  5EFF A;  1G5A A;  1GOM A;  1KGX A;  4U3A A;  3ARO A;  5D8Z A;  1JZ3 A;  3THC A;  3CBW A;  3N13 A;  3GH7 A;  1TUX A;  1PJ9 A;  1ISX A;  1LQ0 A;  3PN8 A;  2PBG A;  3O6A A;  5HPO A;  1ZBW A;  3GBE A;  3KWX A;  4CD8 A;  4QCF A;  4H2C A;  1UD6 A;  3F5L A;  4J27 A;  4S3K A;  1GQK A;  2XYL A;  4B3K A;  1SMD A;  3F5K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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