2WHKA

Structure of bacillus subtilis mannanase man26
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
336
structure length
332
Chain Sequence
HTVSPVNPNAQQTTKTVMNWLAHLPNRTENRVLSGAFGGYSHDTFSMAEADRIRSATGQSPAIYGCDYARGWLETANIEDSIDVSCNGDLMSYWKNGGIPQISLHLANPAFQSGHFKTPITNDQYKNILDSATAEGKRLNAMLSKIADGLQELENQGVPVLFRPLHEMNGEWFWWGLTSYNQKDNERISLYKQLYKKIYHYMTDTRGLDHLIWVYSPDANRDFKTDFYPGASYVDIVGLDAYFQDAYSINGYDQLTALNKPFAFTEVGPQTFDYSLFINAIKQKYPKTIYFLAWNDEWSAAVNKGASALYHDSWTLNKGEIWNGDSLTPIVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Understanding How Diverse -Mannanases Recognise Heterogeneous Substrates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MANNAN ENDO-1,4-BETA-MANNOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus subtilis
total genus 128
structure length 332
sequence length 336
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2whkA00
4ATLA 4DM2A 3AHXA 4PMQA 1JAKA 3AMCA 4JZ5A 2PWDA 3RILA 1E6NA 3KE0A 1GQJA 2G3NA 5JBEA 3N13A 7CGTA 1JNDA 2WSKA 3SCPA 1SR0A 2UY5A 4U33A 3PHAA 3FHAA 1AQMA 1E0WA 4CUCA 2XVPA 2D24A 2YKKA 2WHMA 2GK1B 1GOKA 1FA2A 1EO5A 1CYGA 1E0VA 2XVKA 3WQ5A 5A8QA 3WKZA 1D3CA 4H8HA 1HN1A 2E9BA 4DWSC 1TR1A 3W0KA 3VIFA 2VUYA 1QI4A 4D1JA 1CGXA 4QAWA 4HOWA 1PJ9A 3A6OA 1BYAA 4AZ7A 2G4FA 3HJEA 2WAGA 1V08A 3NUKA 3T0DA 3J7HA 2J7HA 3QOMA 5BRPA 1GUVA 1UR4A 4PTVA 1TZ7A 5D8WA 1BTCA 1Q6CA 1JI2A 3DECA 2QLYA 4TUFA 3ARYA 4D6JA 1AMYA 4F79A 3WD3A 3VX0A 3BAIA 4KMQA 4J27A 4QLLA 1WKYA 4MPKA 4GZIA 2J7DA 1IT0A 5A2BA 2ZUWA 1VEOA 1NQ6A 3KWXA 1TVPA 2BY3A 1JZ3A 1XSKA 1OIFA 2V3GA 1KGUA 3OGRA 3WBEA 2GFTA 3CO4A 1GCYA 3W27A 5TD4A 5A6KA 1QI3A 1CECA 1KR0A 1WZMA 2F2HA 2VCBA 3UESA 3VUPA 4J3TA 4DWSD 1OGBA 3CUIA 1EIBA 3W4RA 3ZSSA 1ZJAA 2FHBA 2CHOA 2CETA 1JZ7A 1V3JA 5E9AA 3WDQA 1EOKA 1EO7A 4ATDA 2OWWA 1DWIM 2VQUA 1OCQA 4MB1A 1CNVA 1FHLA 4UOZA 1UZ1A 1B2YA 4P7OA 4XB3A 3WUGA 3ZJ6A 4QLJA 2QHAA 4MB3A 3W38A 5C8BB 3AQUA 3BC9A 4LGXA 4A3YA 4JKLA 1E6XM 2PBGA 1XCXA 3QHMA 2WW5A 3OA5A 5CGMA 3AZTA 1J0JA 4UQEA 2ZX9A 3WL1A 1MXGA 5I6SA 1DWJM 2Y4SA 1MVYA 1LG1A 4AD0A 3AS0A 2YL9A 1RP9A 1UA3A 3VM7A 1UG6A 3OG2A 3KL3A 2PWFA 4AISA 4MAZA 4J3VA 2WB5A 3VMNA 5AC5A 3F5JA 4W7UA 1W1VA 3ARPA 1G0CA 4EAMA 1VB9A 1LQ0A 4AXNA 1MYRA 3EMCA 1OBAA 4UFIA 3VDBA 2YL8A 3DHPA 5GNXA 4UTFA 1ISXA 2JE8A 2BVDA 5D9PA 2WC4A 1N82A 1HJVA 1BHGA 1UH3A 4MDPA 3OGSA 1CDGA 2J79A 3CIVA 3VIOA 1ISVA 3SCTA 2G3JA 4AIEA 2IUZA 4GIAA 4MJ2A 5ABFA 3MKKA 1X6LA 1BYDA 1HL9A 1UKOA 3U7BA 1OIMA 3WFZA 1I75A 4J3SA 3W53A 2G41A 1JFHA 1UD5A 2EPOA 5ABHA 4PYSA 1M7XA 4AIOA 2VNCA 1GZJA 1LLOA 1UH4A 2DEPA 2O92A 5HDRA 3VNYA 1WO2A 5AY7A 2Y8KA 3MSGA 1WP6A 3LPGA 2VZTA 1HKIA 3I3DA 4S3JA 3WMCA 4CD5A 2HVMA 5I5RA 5A6SA 2NT0A 3OLGA 3NDZA 4PCSA 5KZ6A 4H8UA 2WHLA 4W86A 1CBGA 2OSYA 2Y2WA 5A6BD 1GORA 2MANA 1R8LA 1BGAA 1VBUA 1J11A 5CGTA 2JIEA 5BYWA 3ARWA 3IJ8A 3SCOA 1OGGA 2QMJA 1B3YA 3DYMA 4J28A 4LX4A 2EJ1A 5HBFA 2GDUA 3FAXA 3UG5A 1VBRA 2AAAA 3KL0A 4W7VA 5CPSA 1UWUA 4W89A 1ZL1A 2X1IA 3N15A 3AIUA 1UWSA 1LL6A 3WH7A 2VVSA 3HMCA 1ZBCA 3CZ8A 2JALA 3DC0A 4R27A 3T0AA 1GOQA 2YJQA 2WWDA 4IISA 2ZE0A 4PMOA 2CCRA 3W26A 4U3CA 4NI3A 3GXFA 1E4MM 1GJUA 2XUCA 3FXYA 1CLVA 4PSRA 1ODUA 3WMBA 2D2OA 3VIKA 5BCAA 2BVYA 1E6SM 4FLRA 5A6LA 5JIPA 2CERA 3S2CA 1ISYA 4MAVA 4P7NA 3F5KA 4ZXLA 2J25A 4LYPA 1V02A 3VX1A 4DUXA 1JD9A 1JYXA 1TG7A 2E8ZA 1ZJBA 3N11A 5LYRA 5FL1A 1KGXA 2FHFA 4LYRA 1QBAA 4GKLA 2W92A 3MSDA 4E8CA 1NM9A 2RGMA 3BMWA 1TUXA 4ZEPA 1WDSA 1XH1A 4BF7A 1PBGA 1QPKA 2WMHA 3GDBA 3BLPX 1MFVA 3ARXA 2XWEA 3NSNA 4KGJA 2VX5A 3VD4A 2W5FA 2ZUMA 3AHYA 1HJXA 2FH6A 1F4HA 4C7GA 2DIEA 9CGTA 5A95A 4MNMA 3CGTA 3BAYA 3VDCA 2C8NA 2WLYA 4JCLA 3PBGA 3CLWA 3U57A 1G01A 1UYQA 4J3WA 2DDXA 2GJXA 3T08A 2YLAA 1GONA 1V0LA 3POHA 2XVGA 5DFAA 4ACYA 3SCVA 1DWAM 3RPMA 3VDHA 5A2AA 2EPLX 2VZSA 3GH4A 3JUGA 1LL7A 1MQPA 3AJ7A 2G3IA 4M81A 2EPKX 4K68A 3I3EA 4AZ6A 5BXTA 5I0DA 3RO8A 4W87A 3TOPA 4BQ2A 5ABFB 1FHDA 2ZICA 2WVVA 3N1AA 5DEZA 5LA0A 3ZIZA 1UR0A 1JZ8A 4AD2A 1JZ2A 1FP9A 1PZ2A 1GHSA 4BS0A 1J0YA 4OUEA 4CCCA 2DT3A 2RGLA 3WF1A 3APGA 1R7AA 3ALFA 1E4IA 1QNQA 2G3MA 2JF6A 4RE2A 1AQ0A 1V0MA 2VX4A 3AICA 1H1NA 3BSGA 5FOOA 2XGIA 1ZBVA 2WNWA 1ITXA 3DHUA 2XJ7A 3VGEA 2VR4A 2Y8VA 1EDQA 3ARUA 2WYSA 1H0GA 4NSBA 3RDKA 1NH6A 3VINA 1J0KA 1KGWA 5A8MA 4ZE4A 2AOSA 3K8LA 3MU7A 1W9PA 1HL8A 3WEMA 5BXPA 3II1A 3WDIA 4HU8A 1OD8A 1Y7VA 4ZXOA 1EHAA 4AEFA 1JGIA 4V27A 2VCAA 3VGGA 3RM9A 4MB4A 1H2JA 5DT5A 4Z2KA 3VU2A 2J77A 2VRKA 3HN3A 3U7VA 1US2A 4HP5A 3WDHA 7A3HA 5A6BA 4HZ6A 1C3FA 1UD2A 2ZUSA 1KXQA 3PZIA 2YA2A 4HA1A 4AEEA 4XZWA 3NJ3A 4JL1A 2D1ZA 2VL4A 3LMYA 3RCNA 1GPFA 2VOTA 4PEEA 1FP8A 3WMSA 3WENA 2C7FA 2ZUUA 4TX8A 1VFMA 1OT1A 1R86A 2DT0A 5GNYA 3ZOAA 3AYSA 5A69A 3EDJA 5E09A 4B3LA 5M5DA 2CBJA 3GYCA 1ODZA 4UFKA 1BVZA 2IXVA 2ZOXA 2NW0A 3TP4A 3SUTA 4MADA 1GNXA 1ISZA 3A4WA 2W67A 1XYFA 2XVNA 2D0HA 3DYPA 3KZSA 1XV8A 4AD4A 4R5EA 4GI9A 1E70M 1KBBA 1S46A 3TTSA 4N42A 3WF0A 3DYOA 3I3BA 3AS1A 2YDSA 1HP5A 2VRQA 4UOJA 4JFTA 1ISWA 4HZ8A 2DH3A 2O9PA 2VRJA 1WNOA 3BGAA 2D0GA 2WC7A 1E55A 1XSJA 1DWGM 2VZOA 4UCFA 4AZIA 1E71M 5FD0A 6TAAA 2GJXB 2E0PA 3O9NA 1ITCA 1CEOA 3AI0A 1XC6A 1BVNP 1KCKA 6A3HA 1H09A 3MS8A 3MMWA 2Y24A 3VGFA 3IJ7A 2G8ZA 2OYMA 1XH0A 3IJ9A 3ZR5A 3CTTA 4PUDA 4CN4A 2J74A 1SYTA 2JIWA 2O9TA 2WVVB 1UA7A 2VMFA 3VGBA 1MWOA 2YDQA 3K1DA 1DWHM 3AS3A 3AISA 4YN5A 1Q6FA 3CHFA 2DSZA 4JHOA 4U2ZA 4HMCA 4IPNB 3ZT6A 1MW0A 2WZIA 3LPOA 3WY1A 3KL5A 3AHVA 2O9OA 2VZUA 3ZR6A 4WIWA 4PN2A 2QPSA 1GOOA 5A8PA 1QHPA 4ZENA 1QNSA 5BXSA 3ARZA 2BNJA 2F61A 4V2XA 2XIIA 2YLLA 1NOWA 3PZTA 1QHOA 2WSPA 1BSIA 3AMGA 3MUIA 5I2UA 1W1YA 1FH9A 2JFEX 5C70A 5CLTA 4DM1A 2X0YA 3CUHA 2DPEA 3EDFA 2CBVA 3IANA 2WVTA 2NT1A 1UKSA 3D3AA 3NIYA 4H7VA 5EMYA 4OBSA 5D8ZA 3B9DA 1BPLB 3AYRA 1FFQA 1KQYA 5CJ5A 4D6GA 2A3EA 4GINA 4P7RA 3WNOA 2J75A 1GVIA 1QNRA 3VDAA 4MDOA 4WKHA 1Q6DA 3OBAA 5D9NA 4Z2HA 1MW3A 1WZKA 4AW7A 2EPNA 2XIBA 1PX3A 1JZ4A 1V6VA 4ZE5A 1R85A 3VD3A 5CZKA 3SCWA 1KWKA 1E6PA 2WCGA 3F5LA 1Q4NX 3VMOA 4P8XA 2VI0A 1VFOA 1ECEA 4X0VA 4S3KA 1BAGA 1K9EA 3WH6A 2WMIA 4H8VA 4TVCA 1K9FA 4PMZA 1ZU8A 4J3XA 5FL0A 1NP2A 1HX0A 2BVTA 5FIPA 1A47A 1CGYA 3VMPA 2Z1KA 8A3HA 3W28A 4QCEA 3GZAA 3WBAA 5LA1A 3FNDA 2XG9A 4JFUA 4W8LA 1HXJA 4D72A 4UNIA 3U5YA 1R87A 2TAAA 2J7EA 3D5HA 1PX8A 4D6IA 3L2MA 2B31A 4M8UA 1CXFA 2XSAA 2CESA 1UKPA 4B15A 1W3KA 4AZ5A 1DP0A 1E0XA 2NSXA 1JYWA 4TVDA 1CPUA 1KWGA 1M04A 3BSHA 2ZWYA 3VIIA 3L2LA 2C0HA 3CZEA 3WH8A 1UD8A 4JL2A 4JHZA 5BROA 1E56A 3WH5A 1V0KA 2OLHA 3BLKA 4UQAA 4WSKA 3PZOA 4HZ7A 1UWTA 3WF2A 1SFSA 3BAWA 2IXUA 5EBAA 3RIKA 3ZJ8A 1W91A 1ZS2A 2ZX8A 4M1RA 4C7DA 5CPQA 1QW8A 1HIZA 1UQYA 2XVLA 3G6MA 3WUBA 3O6AA 3ARQA 1W2PA 1JD7A 1HVQA 1EHNA 5HXMA 2JEQA 4CVWA 2WVUA 4DUWA 1UR9A 1OM0A 3AROA 3ARSA 2PF0A 1ZB5A 4E8DA 3WDJA 3SEPA 2VZVA 1M03A 5A8NA 4YHGA 2QF8A 4M56A 4CD7A 4KRTA 3BAJA 4GO8A 2ZUNA 1K9DA 2EBNA 3WEZA 3VO0A 5AYBA 1B9ZA 1UUQA 4OOZA 3WUEA 3AZRA 1HKJA 2YOCA 1J0IA 1TA3A 4TX6A 5IFPA 4V28A 4CD4A 1NWUA 2X09A 4Z2LA 1G94A 2J47A 3THDA 4YPJA 3WN6A 2PB1A 4NF7A 3UR8A 1VF8A 2DSKA 1LG2A 4RE3A 1C8XA 4B16A 2QV4A 2DSWA 3L4UA 2A3AA 1G9HA 4M24A 1JFXA 4PMXA 1JDAA 2WANA 1JL8A 3A3HA 3TONA 5CPTA 2XGBA 5A6JA 1WB0A 3S6TA 1B31A 5AYIA 3QR3A 3PN8A 3AS2A 4E2OA 1XHGA 5A1AA 3VD5A 5JBDA 1E43A 3AIVA 5A6MA 1C8QA 4D6HA 3SURA 2YDRA 1JXKA 2WCSA 2BXYA 4UFLA 3VGHA 1W32A 1HVXA 4ACZA 4W84A 3NCOA 2BS9A 3N04A 5I23A 2J78A 4WJXA 4MNLA 2WMIB 3L4YA 4F8XA 4LXFA 1JF6A 2GJRA 1CXHA 4BQ4A 2DT2A 2J8GA 4CN1A 5EFDA 1XYZA 4WF7A 2E8YA 1V0NA 4UFJA 1B90A 3VKKA 1MXDA 1CGUA 3QOKA 4CU6A 2YIHA 1W1PA 2GSJA 1X6NA 3VILA 4FF5A 2X0HA 3WDRA 3K4AA 2UY2A 4KH2A 2WMGA 2WMJA 2V3DA 5JIWA 3OLDA 4HPGA 1EH9A 4NZCA 2E4TA 2BHZA 3NSMA 5DF0A 1I1XA 2CYGA 1VENA 3SCQA 1HNYA 5HOSA 2W66A 1L0PA 1E40A 1G1YA 2XFRA 1HF6A 1VFUA 2XYLA 3MMUA 2WK2A 3B8SA 3SCRA 1MW1A 1U33A 1E9LA 4RE4A 3BMVA 1UWRA 4FLOA 3M6DA 8CGTA 1B3XA 2X05A 1J0HA 1OD0A 3ZO9A 1W9BM 4GQRA 1B0IA 1E5NA 4UZSA 4AZGA 5C71A 1W9VA 2UY3A 2VX7A 1RD6A 3CZLA 3AFBA 4AMCA 5CSYA 3UR7A 4UQBA 2UWFA 1JXJA 3K4DA 1WDPA 3VIPA 2OWCA 1CWYA 4JFSA 4P8VA 2WHKA 3ZQ9A 1W2VA 3EMZA 3AIRA 3K8MA 3VTRA 3BH4A 3AMDA 2ZWZA 2D22A 2EPMX 4PCTA 3E1F1 1QVBA 4W93A 3CHEA 4ML4A 4B9ZA 1C7SA 4UOQA 1TA3B 2E40A 2PI6A 3WNKA 3WF3A 4AY1A 1GQLA 1BLIA 3AOFA 3WQVA 5A2CA 3A47A 3WD1A 3VIHA 1H0IA 3SUVA 1UKQA 2VQTA 2GUYA 4LQ1A 5IHSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ATL A;  4DM2 A;  3AHX A;  4PMQ A;  1JAK A;  3AMC A;  4JZ5 A;  2PWD A;  3RIL A;  1E6N A;  3KE0 A;  1GQJ A;  2G3N A;  5JBE A;  3N13 A;  7CGT A;  1JND A;  2WSK A;  3SCP A;  1SR0 A;  2UY5 A;  4U33 A;  3PHA A;  3FHA A;  1AQM A;  1E0W A;  4CUC A;  2XVP A;  2D24 A;  2YKK A;  2WHM A;  2GK1 B;  1GOK A;  1FA2 A;  1EO5 A;  1CYG A;  1E0V A;  2XVK A;  3WQ5 A;  5A8Q A;  3WKZ A;  1D3C A;  4H8H A;  1HN1 A;  2E9B A;  4DWS C;  1TR1 A;  3W0K A;  3VIF A;  2VUY A;  1QI4 A;  4D1J A;  1CGX A;  4QAW A;  4HOW A;  1PJ9 A;  3A6O A;  1BYA A;  4AZ7 A;  2G4F A;  3HJE A;  2WAG A;  1V08 A;  3NUK A;  3T0D A;  3J7H A;  2J7H A;  3QOM A;  5BRP A;  1GUV A;  1UR4 A;  4PTV A;  1TZ7 A;  5D8W A;  1BTC A;  1Q6C A;  1JI2 A;  3DEC A;  2QLY A;  4TUF A;  3ARY A;  4D6J A;  1AMY A;  4F79 A;  3WD3 A;  3VX0 A;  3BAI A;  4KMQ A;  4J27 A;  4QLL A;  1WKY A;  4MPK A;  4GZI A;  2J7D A;  1IT0 A;  5A2B A;  2ZUW A;  1VEO A;  1NQ6 A;  3KWX A;  1TVP A;  2BY3 A;  1JZ3 A;  1XSK A;  1OIF A;  2V3G A;  1KGU A;  3OGR A;  3WBE A;  2GFT A;  3CO4 A;  1GCY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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