2WHMA

Cellvibrio japonicus man26a e121a and e320g double mutant in complex with mannobiose
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
KPVTVKLVDSQATMETRSLFAFMQEQRRHSIMFGHQHETTQGLTITRTDGTQSDTFNAVGDFAAVYGWDTLSIVAPKAAGDIVAQVKKAYARGGIITVSSHFDNPKTDTQKGVWPVGTSWDQTPAVVDSLPGGAYNPVLNGYLDQVAEWANNLKDEQGRLIPVIFRLYHENTGSWFWWGDKQSTPEQYKQLFRYSVEYLRDVKGVRNFLYAYSPNNFWDVTEANYLERYPGDEWVDVLGFDTYGPVADNADWFRNVVANAALVARMAEARGKIPVISGIGIRAPDIEAGLYDNQWYRKLISGLKADPDAREIAFLLVWRNAPQGVPGQVPHYWVPANRPENINNGTLEDFQAFYADEFTAFNRDIEQVYQRPTLIVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Understanding How Diverse -Mannanases Recognise Heterogeneous Substrates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA MANNANASE, MAN26A
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 152
structure length 377
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2whmA00
3PZIA 4PMDA 2JEPA 2NT0A 2WWCA 3UG4A 5JBDA 5EB8A 3RIKA 1R7OA 1XSIA 2JFEX 1UH2A 1CGWA 3NDYA 1NWTA 2WAGA 1GJWA 3VMNA 1ESWA 2JF7A 2VZSA 4QLKA 1ITXA 1YHTA 1W1TA 3ZR6A 4XZBA 1FFQA 3WEMA 3NDZA 3CZ8A 5A8MA 1L8NA 3DHUA 1GQLA 4F9DA 3CUIA 3PZUA 2W91A 1OD0A 1G9HA 1OT1A 2BHUA 4J3TA 3W26A 1NP0A 4W7VA 2C8NA 3WD3A 4AIEA 3VILA 4PMQA 2D2OA 3WL0A 1Q6EA 4JZ5A 1CWYA 1TR1A 3OA5A 1WO2A 2OLHA 3WMSA 3DYMA 5A6KA 3UR8A 2VRJA 5BXRA 1NP2A 2XSBA 3FY1A 1C90A 1WZKA 3AHTA 1QNQA 2J78A 1E6PA 4D6DA 2CPUA 3VDHA 3IJ9A 1Q6CA 1OINA 4KWUA 4PTWA 1JF5A 3CIVA 4PUEA 4PYSA 4UZSA 1CGTA 4P7NA 1EA9C 2W92A 2Y8KA 2O9TA 1KQYA 3WL1A 4DWSD 2DSWA 4WIWA 1TE1A 1V3LA 2YL5A 4MDPA 3GNOA 2WC7A 4AD2A 1UA3A 5ECUA 4AY1A 2VO5A 1JDAA 1V03A 3SUUA 3B9AA 2CBIA 3WENA 1EDGA 1L0PA 3WEOA 5EFDA 1FFRA 2VZOA 1JZ8A 4L4PA 3CZEA 4HOZA 3FHQA 4EK7A 3UG5A 3SUSA 4AIUA 2O92A 3PZGA 1E40A 4IPNB 2MANA 3PZMA 4UQAA 5GQBA 1LJYA 4D1IA 3VO0A 1HF6A 1TVNA 4AZBA 3DYOA 2BY0A 1OB0A 2D0GA 1ISWA 3PZVA 3QOMA 4WKAA 1V6XA 5CZKA 3FW6A 1W9DM 3CLWA 2WYSA 4J7RA 3KL3A 5JIWA 1X6LA 1Z32X 5BXTA 4DWSC 5HPOA 5CLWA 2WCSA 1U33A 3WDHA 3CUJA 3BMWA 2BNJA 3WD1A 1V3JA 1W9UA 1PIFA 3IAQA 1WB0A 1HP5A 3WQVA 3ZJ6A 3SURA 2V3DA 1EXPA 3WDPP 1QHPA 2VMFA 2BFGA 4GZJA 3AXHA 3SCNA 2AOSA 2Y2WA 4UTFA 3OZPA 1V6WA 2X1IA 1ISZA 7CGTA 1KGXA 1AQMA 4HOWA 4W7WA 5BYWA 1E5JA 2ZXDA 3AQUA 4A3YA 2B31A 4UQEA 2W4XA 4W86A 3GDBA 5GNYA 3VIIA 1AQ0A 2NT1A 1HJSA 2XFFA 3I3DA 4DM2A 1B3WA 3BCDA 2WHJA 2YL9A 2X09A 3W25A 2J7DA 3GH4A 4V27A 4ZEPA 1X6NA 3PN8A 3HJEA 4JKKA 1JAEA 4HZ6A 2BY1A 3M07A 1X1NA 1K9FA 2D0HA 1GZJA 1JNEA 3KZSA 1U30A 3ZSTA 4OZOA 1GJUA 3POCA 3WQ8A 4CN6A 2GK1B 3SCPA 1GVYA 3WD4A 3WFZA 1K9DA 1B90A 3VGDA 3WF1A 2VQUA 1TFVA 1ISYA 1E4NA 1UWUA 1VJZA 4KRUA 5IFTA 3MMDA 3AHVA 4AZHA 4W84A 3OZOA 3VUPA 3MUY1 3SCSA 2YJQA 3QOKA 1WDPA 3W28A 1IZJA 3CUHA 4W87A 3VMOA 3KEHA 1FHDA 3DYPA 1QPKA 5GPRA 4E8CA 1FH7A 3A47A 3ZM8A 4NF7A 1J18A 5IHSA 3IK2A 3CBWA 2WHLA 2XWEA 1CGVA 4U3AA 2DH3A 4OJYA 3U5YA 1MW0A 3U7VA 1MW1A 3GZAA 3O9NA 4QAWA 1WZAA 1Q4NX 3KWXA 4JCLA 1CNVA 2V3EA 5E9AA 5D9OA 4L4OA 1QI5A 3SCQA 3LPPA 3FN9A 4JFVA 4URIA 3VDCA 3MMWA 2PBGA 4FF5A 1VJSA 2VX5A 1HKMA 4J3WA 1J0HA 4YHGA 1E0XA 2WMFA 1C3FA 1LL6A 4W8BA 1TA3A 2D20A 2E9MA 2GJRA 4UOJA 1RP9A 2CITA 2DT2A 3N13A 2J47A 2YA1A 3M7SA 2ZX8A 1H5VA 4JKMA 4AD3A 4MB5A 3GXDA 5FL0A 4JFSA 4JIEA 3IJ7A 4PUDA 3W4RA 4P7LA 1ZJBA 3WH8A 3TONA 1ZBCA 3ZOAA 4BQ5A 3WMBA 4E2OA 1H2JA 5D8ZA 3BAXA 1CXKA 3WKZA 4ZE5A 4M29A 1E6XM 1JZ6A 4FMVA 5HDRA 4UCFA 2X2YA 5DF0A 3MANA 1MXGA 3T2OA 2J62A 4U2ZA 3W38A 1GCYA 5A1AA 1QVBA 2VC9A 4OUEA 3SCWA 2A3CA 1B30A 3AYSA 5A94A 1E4IA 3WQ4A 1GNXA 4MNLA 3ARVA 4Y7EA 3T08A 1LG1A 2QPUA 1FP9A 3ARPA 1GPFA 2J7HA 1B3YA 1KR1A 4AD5A 2WVUA 5CJ5A 1RH9A 4AZ6A 2VUYA 4CCCA 3ZT6A 1UUQA 1EHAA 6CGTA 3BCFA 3F5KA 2OWCA 4NSBA 2J7EA 3T0BA 1RPKA 5A8OA 4CD6A 1SFSA 3MKKA 1CENA 3N17A 4CU8A 1KBBA 4WSJA 3ZR5A 3OGSA 1PJ9A 3VM5A 1TVPA 3J7HA 1V02A 1WAWA 1M7XA 4QCEA 5HBFA 1CXFA 3L4YA 5D9PA 4TXEA 4PMVA 1UD6A 1M01A 2IXVA 5ABFA 4PTXA 1HJXA 4M24A 2RGLA 1EDTA 3VNYA 2WZIA 2D3NA 2VR4A 3CTTA 3AIBA 4D6IA 5KEZA 4OBRA 2GJPA 3CHDA 1C8QA 4HPHA 2G8ZA 3AIWA 4C7GA 2PWDA 1B9ZA 1EH9A 1I1XA 1XH2A 2EPNA 1F4AA 3K8KA 4UFIA 4YPJA 1E9LA 1KQZA 1VENA 4C7DA 3MV11 4CKQA 1GORA 3OLEA 3WUFA 2G3JA 1KCKA 2XPKA 3AI0A 3VGGA 2WZEA 1PZ2A 2Z1SA 1MYRA 2NW0A 1H0GA 3OIHA 2WVTA 1CIUA 4UQBA 4RE4A 3B9DA 1JZ2A 1W1PA 1HJVA 1E0WA 3BAWA 2JE8A 4QFUA 5JUVA 4MPKA 2XGIA 1BYBA 2PI6A 4GIAA 4BZYA 3GH5A 3AOFA 5A6BA 1W1VA 1LF1A 5A2AA 5E70A 1I75A 1HKKA 2ZUMA 1VBRA 3WQWA 3QGVA 1O7AA 3ARXA 8A3HA 5CXPA 5ABFB 3AIQA 3WH5A 1V3IA 2OSXA 4AXNA 4Z2JA 2WMKA 4UR9A 5CPSA 5A2CA 2PBOA 1XH0A 1E4LA 4GI6A 3WBEA 5FL1A 3OLDA 4ATDA 4KGJA 4OIFA 3UG3A 3QHMA 1CPUA 2WB5A 1ITCA 1FA2A 1DWGM 4PMRA 1JXKA 2V3GA 3EMQA 4UOZA 3CO4A 2VVSA 3VIHA 4J3VA 4J3XA 4F66A 1E55A 2BXZA 4GO8A 1KXQA 4PCSA 2E4TA 3VIGA 1VFUA 5C71A 3JUGA 2J8FA 5CSYA 3WH9A 3VD4A 1E3ZA 1R8LA 4FLQA 3AYRA 2BVTA 4ATWA 2VX4A 3RM4A 1QOXA 5HPCA 4K68A 4D6JA 4S3JA 1XV8A 1M04A 3BSGA 1QW8A 1JYXA 4H7VA 1JFHA 2UWFA 2EPLX 5BCAA 2WNWA 1H3GA 1E6RA 5FOOA 1BYAA 2A3BA 1XH1A 2J75A 1ZU8A 4P8XA 5FKYA 1J0JA 5CSUA 1XCWA 2F61A 2OYLA 1UZ4A 4W89A 1BAGA 1H4PA 1ISXA 1BVZA 5LA1A 1QI3A 2WBKA 2O9PA 1ISVA 3EDDA 1C93A 4HU8A 1QI0A 3TTOA 4HA1A 4EAMA 4B3LA 3ZMRA 1GVIA 1UD4A 4NI3A 1TMQA 1UWIA 2CETA 4D6EA 3G6LA 3ZJ7A 2A3HA 3APGA 4B16A 2A3EA 2E40A 1HT6A 3DECA 5GNXA 3PHAA 2FDMA 4QLLA 4W7UA 1W9XA 4DM1A 2CIPA 1UR2A 3BH4A 3NSXA 1B3VA 4D6GA 4MNJA 5JIPA 5E0CA 5F7UA 4AW7A 5BXPA 3ARUA 2EO7A 3PTKA 2DSVA 5JBFA 4RE2A 2FGZA 2J4GA 5I3DA 1K6AA 3K4AA 5E6YA 5EFFA 4HZ7A 1JDCA 4TX8A 1HP4A 3BSHA 3WNLA 4NZCA 4CGTA 4TTUA 4OOUA 1G0CA 4BQ4A 1FHLA 2YOCA 1HL8A 3QHOA 2WC3A 4W85A 4LQ1A 4PMOA 1WDSA 5CGMA 3RJYA 3VNZA 2CNCA 2D22A 4U5IA 5HNNA 4D1JA 1CXEA 2WW5A 1W9BM 1WZLA 4ZFMA 3VVGA 2J7FA 2DSKA 4W5UA 1JYWA 4AEEA 1MWOA 4LPCA 4AZIA 4CD5A 3NCOA 1XHGA 1H11A 1UHVA 3NIYA 4UOQA 1E4MM 1UD2A 4UZUA 5BRPA 2G3NA 1E6QM 4DUWA 3WUEA 1UWTA 1VRXA 1V3HA 1E1FA 1E6NA 4DWSA 3FHAA 1J0IA 3MSGA 2VRKA 3RCNA 2VJXA 2JIWA 2GK1A 4R5EA 2AAAA 2G4FA 1QBAA 4CCEA 2YDQA 1QNRA 4AD1A 3CZJA 2ZUNA 4P7RA 3VDBA 3TA9A 4PSPA 1J0ZA 3L2MA 4CD8A 1B0IA 3S2CA 3W53A 3THCA 2DSUA 4U5KA 4AEFA 4H41A 3CZGA 1JFXA 4MNKA 2VOTA 4CUCA 1B31A 5I0DA 3A4XA 3CHCA 2WVSA 3K8LA 1LL7A 1V0LA 1BYCA 1V0MA 7TAAA 1DWIM 1WPCA 3ARZA 4V2XA 3K1DA 3CUFA 1JF6A 3AIRA 3FAWA 1NM9A 5BROA 4JAWA 2ZUTA 1MQPA 3WDJA 1QI2A 3PZQA 3AHZA 1YQ2A 3ZJ8A 1J0YA 1UWSA 3MU7A 5CQ1A 5C8BB 1WCGA 4J27A 1N82A 3UCQA 3BC9A 3N04A 4BF7A 1C7TA 2EJ1A 3EMZA 3CZKA 2YL8A 2V3FA 2VR5A 4DWSB 3VX0A 2QMJA 1EQPA 1PX8A 2EPMX 4J28A 1B3ZA 4H2CA 4XV0A 3OGRA 2ZX5A 4Z2KA 1J9YA 1VF8A 3L4VA 4JCMA 4FK9A 2XUCA 1QNPA 4WLCA 1GOOA 1LG2A 4UFMA 3AHXA 1VEMA 2WXDM 2ZX9A 1UR4A 2BVDA 3ARYA 5A8NA 3MMUA 5LA0A 3FAXA 3WDQA 3GBDA 5D8WA 2PWHA 2W62A 4CVWA 4PBGA 3QHNA 4MADA 4HMDA 4LXFA 2WMIB 2OSWA 1S46A 4N0RA 1MW2A 1DEDA 3A4AA 2CXGA 1G5AA 1MVYA 1BFNA 3L4WA 4H8HA 2GFTA 1M53A 1UG6A 3VKKA 1VIWA 4JFWA 3AMDA 4HMEA 1V6VA 4A3HA 4MNMA 3T0AA 2DIEA 2CHNA 2CKRA 1VFFA 3AZRA 3EYPA 3KL0A 1I1WA 4GQQA 4NRSA 3GYCA 1P6WA 2XHYA 3ZIZA 2CBVA 2J77A 1PPIA 1C92A 2XIBA 4LYQA 5AC5A 1CGXA 4F9JA 1SMAA 4OOZA 2WZHA 4U2YA 1H1NA 4S3KA 2QHAA 1AVAA 4WK9A 3L2LA 3WEZA 1RD6A 2D3LA 3SEPA 3RDKA 1OGBA 4YN5A 3LPOA 2YKKA 1K9TA 3N1AA 1QNSA 1BSIA 2EPOA 2F2HA 4XX6A 1IT0A 1DWAM 4P7OA 1E15A 3WMCA 3K8MA 4J3SA 3F5JA 1BQCA 5ABGA 4OKDA 2G41A 2ZIDA 2BY2A 2QMKA 3UEQA 3T2PA 3FNDA 4ZE4A 1W3JA 3LMYA 1PEZA 2YBTA 2Z1KA 3RO8A 2CKSA 2Y8VA 4GXPA 2VX6A 3ARWA 5I77A 3ZT7A 2WCGA 4ACYA 1KXVA 2WHMA 1FOBA 1KWKA 3VGFA 3GNRA 3D5HA 3PZTA 3WN6A 1DP0A 3MO4A 2Y4SA 3WF2A 4D71A 2VURA 5KZ6A 1W3KA 3F4VA 5DFAA 3AZSA 4CD4A 2ESCA 3OLIA 1BVNP 4M80A 1OCQA 3BGAA 3MSDA 1UWQA 1XD0A 1A3HA 3ALFA 1LWJA 4MB3A 1UD8A 1JD9A 1XCXA 1OM0A 3AS2A 3ARTA 3N18A 1ZB5A 3VOCA 4ACZA 4DUXA 1BTCA 1GOIA 3TTYA 2D24A 1QHOA 5I24A 2XIIA 1UKSA 2VI0A 1JIBA 4CD7A 2EBNA 3II1A 3N11A 4AZ5A 4CN4A 1XGZA 3LPFA 4F79A 1CGUA 1MXDA 4PCTA 1WDRA 2GJXB 2CEQA 2YLAA 1VBUA 1HX0A 2NSXA 1PX3A 1UD3A 1NWUA 3WH6A 4AIOA 3WNOA 3TOPA 3W81A 3WQ5A 1JGIA 3FXYA 4MDOA 1NARA 2WMGA 4UQDA 3TTSA 1ECEA 2ZUSA 1XC6A 2VZTA 4MB4A 4Z2HA 1EO7A 1Y7VA 3NYDA 4AC1X 2YLLA 4GQRA 1XYZA 2JIEA 1EQCA 3W0KA 3ZO9A 4ATLA 1JYNA 3F5LA 1B3XA 1B2YA 2FGLA 2OWWA 4D72A 1UZ1A 1WKYA 2E3ZA 4P8UA 1BGGA 4HP5A 5A8QA 1UKQA 1VEPA 1W9VA 4XB3A 1BF2A 2DEPA 4M81A 1D3CA 4W5ZA 4MJ4A 3RM9A 5M3WA 4D6HA 5I23A 3U5UA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PZI A;  4PMD A;  2JEP A;  2NT0 A;  2WWC A;  3UG4 A;  5JBD A;  5EB8 A;  3RIK A;  1R7O A;  1XSI A;  2JFE X;  1UH2 A;  1CGW A;  3NDY A;  1NWT A;  2WAG A;  1GJW A;  3VMN A;  1ESW A;  2JF7 A;  2VZS A;  4QLK A;  1ITX A;  1YHT A;  1W1T A;  3ZR6 A;  4XZB A;  1FFQ A;  3WEM A;  3NDZ A;  3CZ8 A;  5A8M A;  1L8N A;  3DHU A;  1GQL A;  4F9D A;  3CUI A;  3PZU A;  2W91 A;  1OD0 A;  1G9H A;  1OT1 A;  2BHU A;  4J3T A;  3W26 A;  1NP0 A;  4W7V A;  2C8N A;  3WD3 A;  4AIE A;  3VIL A;  4PMQ A;  2D2O A;  3WL0 A;  1Q6E A;  4JZ5 A;  1CWY A;  1TR1 A;  3OA5 A;  1WO2 A;  2OLH A;  3WMS A;  3DYM A;  5A6K A;  3UR8 A;  2VRJ A;  5BXR A;  1NP2 A;  2XSB A;  3FY1 A;  1C90 A;  1WZK A;  3AHT A;  1QNQ A;  2J78 A;  1E6P A;  4D6D A;  2CPU A;  3VDH A;  3IJ9 A;  1Q6C A;  1OIN A;  4KWU A;  4PTW A;  1JF5 A;  3CIV A;  4PUE A;  4PYS A;  4UZS A;  1CGT A;  4P7N A;  1EA9 C;  2W92 A;  2Y8K A;  2O9T A;  1KQY A;  3WL1 A;  4DWS D;  2DSW A;  4WIW A;  1TE1 A;  1V3L A;  2YL5 A;  4MDP A;  3GNO A;  2WC7 A;  4AD2 A;  1UA3 A;  5ECU A;  4AY1 A;  2VO5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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