2WSQA

Monotim mutant rmm0-1, dimeric form.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVAPSFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADGLASLKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQETHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Space Group Transition Driven by Temperature and Related to Monomer-Dimer Transition in Solution: The Case of Monomeric Tim of Trypanosoma Brucei Brucei
rcsb
molecule keywords TRIOSE PHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 85
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2wsqA00
1QOQA 2QUVA 5AFDA 1PS9A 4D2JA 4MLRA 1JRCA 2RDTA 4O8RA 3MHGA 1BEUA 3DI0A 4NZJA 2I1OA 4Z0JA 5FF7A 5F2GA 1JCMP 1GVRA 2ZTKA 2OX1A 4UTWC 1JVNA 3UPWA 3PUEA 5FEZA 1RVGA 2NV2A 4WOQA 1TV7A 4Y6GA 5CPMA 2GQ9A 2VFGA 3W7RA 5DBTA 1KM4A 4HHPA 2H90A 3P81A 3R89A 1M7OA 4O1BA 1LCOA 4NU7A 4JTUA 1F73A 3TROA 1JUBA 2EPHA 5TBOA 1F7BA 2YYTA 4UTWA 2C18A 3KHJA 5E93A 3BLEA 4BWLC 2C1HA 5BRBA 4FNSA 3O8AA 2BLEA 3QH2A 2QCCA 4WY0A 5D05A 3C2OA 4AWUA 3TMLA 1H7RA 2Y61A 3FKRA 2ZRYA 1TV8A 3HGJA 2ALDA 2FIQA 4JTTA 2B0MA 5F2MA 3L5MA 6ALDA 3W75A 3NL3A 3KOFA 4UMAA 2ABAA 2DZUA 3B0PA 1XL9A 4BWLA 3UZ5A 4I7WA 4PFMA 1U5JA 3G1AA 1EX5A 3MW7A 3G24A 3LCGA 3NVTA 4DEFA 1VZWA 3GAKA 3A22A 1YXCA 4OQVA 2B4GA 3EXRA 4O15A 1C9DA 1ZAIA 3LHZA 1UB3A 3L0GA 2GPTA 4WXYA 2VENA 4O17A 4E2BA 3S6DA 3Q94A 1VLWA 2FTPA 1G6CA 1PVNA 1RQBA 3NG3A 3O15A 1O95A 3OA3A 2DZPA 2GQAA 4N9EA 3DKJA 3DI1A 3GYEA 1SO4A 4O12A 3G1FA 4MJZA 3W84A 1ICSA 3M5XA 4IPJA 4NX5A 1DKWA 3W83A 2X1TA 3BGJA 5HUOA 1LRNA 4ZL1A 1I2OA 5KZEA 3BG3A 3W1QA 3L67A 3UD6A 3NL5A 4UIOA 2A2IA 4AHQA 2ZRVA 1QOPA 1ZENA 3MP4A 3W7JA 5K7JA 2LLEA 3A23A 1K8YA 2QCHA 1D3HA 4EF8A 2B7OA 3WK1A 2GVGA 1WV2A 1K7XA 2OCZA 3GAYA 4YMZA 4NUWA 5D37A 5FESA 4UTTC 1LROA 2RH9A 2YW3A 1QNVA 3ABSA 2YGYA 4GE8A 2NUXA 3TSMA 2V82A 1M5WA 1XBVA 1R2SA 1ZFJA 2ZRUA 1W5NA 3M43A 3NO5A 3PWAA 2PE4A 4LVFA 2E6AA 4JEQA 2H8XA 4JTKA 1FXQA 3W87A 1AK5A 4K8EA 1RQEA 3KXQA 3CT7A 4FIQA 1IXQA 4UTTA 4WZHA 3K30A 4NNBA 3DAQA 3NQAA 2F7FA 4QSHA 4PC8A 1OF6A 3O6CA 1WOBA 1A5BA 2J24A 1R46A 1VR6A 2Y85A 3QM3A 4CQAA 1TTIA 3GDMA 1QO5A 4JTGA 2VXNA 4M6PA 1B4KA 1GVOA 3W7LA 4CNOA 1Z41A 3HPSA 1WDWA 1TV5A 3W2MA 5D38A 2FQIA 5LNWA 1FBAA 1VHNA 1Z48A 5LZLA 4K7YA 3B0VC 2OZ0A 4JX6A 1GG0A 1SW3A 3G1VA 1OYCA 3O05A 1SW0A 3W7GA 3C6CA 1TRIA 4FNQA 3IGXA 1S5VA 2ZDRA 1RZMA 1BKSA 1LTDA 2RDUA 1DVJA 3LDVA 2AGKA 5FEWA 2YFNA 4NJHA 5A5WA 3TE9A 1SZFA 4JX5A 3I7QA 3LCFA 2AAMA 2ZZ6A 1D9EA 1TPC1 3LHYA 5HR6A 1SU5A 1HO4A 3IIXA 4Z08A 1GWJA 3I7RA 1YDNA 3MJYA 4TX9A 3AJXA 1JCXA 3LXAA 2QCLA 1FWWA 1H60A 3NQ7A 5HWMA 1TJPA 2VFEA 1I2RA 1Z44A 2YPIA 1GTHA 3RMJA 4AAJA 1S3HA 3PAJA 4IMDA 2QCFA 1XUZA 3L5LA 4UTIA 5I3IA 5C5YA 2Y7EA 3S5NA 2C14A 4UTHA 5G2IA 3PVFA 1TB3A 2ABBA 1WX0A 2C13A 1EPXA 2GJLA 1VC4A 2VFFA 3HB9A 1NEYA 1TPUA 4WOZA 2DJLA 3BW2A 4WXZA 5KZDA 5T26A 3GXTA 4H4IA 5DXYA 3I65A 4M7TA 3W7DA 1SQ7A 8TIMA 2Q8ZA 3EWBX 4FNPA 3YPIA 3LM7A 2E1DA 4O57A 2C0AA 5I3KA 1GYNA 1TPH1 4NZFA 2QCEA 2A21A 3FKKA 5LSMA 3TAKA 3TQVA 3DZ1A 1DBTA 1B9BA 1IXPA 1Q6OA 5AC8A 3H53A 4LUJA 4Z1AA 3KAOA 3S5OA 3R8RA 2ZRWA 3CWOX 4JDBA 4HT3A 3MWAA 3W86A 3BLFA 4E0CA 2GVJA 1R2TA 4IMCA 3L0KA 4I7VA 2O7QA 1WXJA 3W7HA 4N02A 1XBXA 2YFOA 3FYOA 1D3GA 1VQTA 2ZA1A 3STCA 1AL7A 1ZAJA 3W1TA 1G4TA 3ELFA 2E6YA 4IUOA 3IVTA 2ZZ2A 3QF0A 4QQ3A 3RU6A 3PBVA 1N55A 3DENA 2BWGA 1H5YA 4JTSA 1TPEA 4YCOA 4WX2A 2NXHA 4NJIA 4UMBA 2YZRA 1Q6RA 1UUOA 2F84A 3C52A 1W54A 1YADA 2ZZ7A 1IXNA 3IIOA 1RV8A 3W7IA 5D32A 1O5KA 4N4PA 3WFAA 5CZJA 3G8EA 1TRDA 3GB6A 4MY9A 2Y7DA 3NQCA 4O4WA 4JYFA 3W7NA 3QJAA 4FXRA 4JGDA 3WK0A 3CEPA 3IIPA 1DJQA 3SFKA 5DCDA 3IVSA 4MZ1A 4AF0B 1IGSA 3VI2A 4N4QA 1OABA 3DHDA 4NVTA 3SR7A 3L2IA 3C2EA 3PG8A 2OJPA 4GUHA 2GQ8A 4IPIA 3HG5A 4LT9A 4IWWA 3GLCA 3W70A 1VCVA 4QIUA 4BFAA 4DF1A 4U28A 1L6SA 1KM6A 3P61A 3W2NA 4AB4A 1KTCA 4OHQA 4RZ5A 4AMAA 4UFIA 3UWQA 2JGYA 3M7WA 3PSWA 2NUWA 4XKYA 2E09A 1PE1A 3CU2A 1LZOA 3BG9A 3KRUA 3SGUA 1MO0A 4IX2A 4AWSA 5FF4A 3W74A 5IBXC 1ME7A 3P74A 1THFD 2E5BA 3TR2A 4RJEA 4OGZA 3NGJA 2W0UA 1L9WA 1VS1A 1B3OA 1FWSA 4DO6A 3KRZA 5BOOA 4X9SA 3GX9A 3PUOA 4FXSA 1SSGA 4PEKA 1KW1A 1EEPA 3BG5A 1X8FA 2TRSA 4CCCA 1XI3A 2QJIA 2YSWA 3VE7A 1T99A 1VCGA 3HBLA 3L66A 4HN4A 2X1UA 3KVMA 1MEIA 1MEWA 2V30A 2NX9A 4JNMA 3JRKA 5IBXA 2I9EA 3HG4A 3T55A 1S5TA 1G7VA 5E0KA 1KV8A 3TAOA 1P0NA 5FF0A 4NJKA 1KM5A 5F1UA 1GJPA 1Q6QA 1TQJA 1J4EA 4LV4A 1SR9A 4IQLA 1YXDA 3S8HA 3MBFA 3R2GA 1W3TA 3P67A 3MI3A 2ZRZA 3G8RA 1GT8A 3U8GA 3C8FA 2D73A 3GR7A 3LXCA 1M6JA 2WJZA 5HULA 4G1KA 1ML1A 5EY5A 4HNTA 4ZQPA 4GUFA 5CSRA 1Q6LA 3HGSA 4N9CA 4DO4A 4MZ8A 4A2SA 1ZY9A 3DGRA 2UV8G 2OT1A 4WUIA 1GPWA 1DL3A 3HQ1A 5HR7A 3S1UA 2I14A 4CNPA 1SO6A 3M47A 3I68A 4NNAA 1EWEA 1LOLA 1FY6A 1VLIA 3L0NA 4GUGA 2JKEA 3NPVA 4P2VA 3QYQA 3UWZA 3NQGA 5F1VA 5KTLA 4RKAA 2CZ5A 3T78A 1OK6A 4YCPA 3NQDA 5DY3A 1I45A 1K8ZA 1VYRA 1OF8A 5G1TA 1QPNA 3CB8A 3THQA 2Z0IA 1OYBA 2DU2A 2YR1A 3M1ZA 5AC7A 1K7FA 3EWZA 2VC6A 3LBCA 1AW2A 3SW6A 1ZAHA 3P62A 4N9DA 2CLKA 3P8JA 1QDSA 3MI2A 3NEVA 3M5YA 3W7EA 3TA6A 1SFJA 2Y63A 1TTJA 1KFKA 5E1QA 4XTDA 4N9BA 3LTYA 4RXFA 4O1CA 4UXDA 1XKYA 4HPJA 3RLVA 4LRTA 2WSYA 4BI5A 3G3MA 5G2WA 5C6MA 1JULA 3EX4A 2DZTA 4BI7A 3HPXA 2RDWA 5KZMA 7TIMA 3LXBA 3P5ZA 2ZZ3A 3N19B 1S5WA 1TCDA 3T4CA 3C2VA 1XXXA 5AN7A 3NA8A 1SFLA 4OU1A 3TCEA 2Z1BA 4EOUA 3EWUA 3STEA 3SY5A 2FB2A 3B05A 4HSNA 2X2GA 1SO3A 3EWWA 1KA9F 1O94A 1OFPA 4I9AA 3NL6A 4O53A 2HS6A 3LCWA 1MZHA 1P0KA 5G1YA 4LRSA 3NAVA 2CLHA 4IJBA 4KKXA 4L4LA 1W5OA 2Y6ZA 1UASA 4UTUA 3S5YA 3GNDA 3QEZA 3S1XA 3C4UA 4UR8A 2A1YA 1F5ZA 2R8WA 1FXPA 1SPQA 2QCMA 3E9AA 1K8XA 4AHPA 6TIMA 1X1OA 3GK0A 2ZCGA 3E49A 1OX4B 1PCKA 5I3JA 2Y7GA 1L6WA 4EIVA 1EP1A 4A2RA 5F2IA 2ZZ4A 1TQXA 4DBEA 2H8ZA 5D2VA 4GJ1A 2ZFAA 4IOTA 1FWRA 3EB2A 3U6WA 4KFPA 1YDOA 5FEXA 3QMRA 1UBSA 4E38A 4GC4A 5SWUA 5D2WA 4EVZA 1QAPA 3SI9A 4QISA 2BX7A 1W1ZA 1OFAA 2H3DA 1KM2A 1YDVA 3VE9A 3NZRA 3O6DA 3INPA 3ZFHA 1G69A 4FNUA 3LLDA 4H6KA 1JUKA 3NXFA 5K2ZA 3EXSA 1TO3A 3AO0A 1OX4A 1NVMA 1E51A 1JR1A 3KX6A 3W07A 3QW4B 1LM1A 2BSLA 4A22A 1QPRA 4PTNA 4MIMA 5AHNA 4M5PA 4K7VA 5BW6A 5HWNA 3NQ8A 1DQXA 4KFNA 4O0ZA 2GJNA 1H7OA 1U83A 5I3GA 1DOSA 4TMCA 1TMHA 4S1FA 1OX6A 3TC6A 1H1YA 1HFBA 3T44A 4ZQCA 2JKAA 1L6YA 1W37A 2QDGA 1GZGA 3B0UX 2ZBTA 3PR2A 3PSVA 1VJIA 4RXGA 5H2ZA 1F2JA 3NOEA 2CZEA 3MYPA 2RKXA 3DFSA 4IXXA 3W1AA 3ZWSA 4Z1DA 2CU0A 1H7XA 4LC6A 5D02A 2V9DA 5HINA 4HKPA 1VGAA 1W8SA 1GVFA 2PC4A 2Z6IA 1SZGA 4GWEA 3UXAA 2NWSA 2OMAA 1BTMA 1GVSA 1LRQA 3ATYA 4N6EA 4JTIA 5AYZA 4UCGA 5K3VA 3EXTA 1ALDA 3LHWA 3O63A 3LRMA 3N14A 2JBMA 3UXDA 4ICNA 3ZS4A 3M9YA 3W1NA 4X22A 3ANYA 4JTFA 4PL2A 3GXNA 4J9JA 4R53A 3NPUA 1H61A 2HTMA 1TPVA 2BTMA 5BNKA 3BV4A 3G18A 3EX3A 3M5ZA 1KFBA 3GDLA 3I6RA 3QC3A 3QSTA 2C6QA 3OEXA 1P4CA 4GRSA 5CPLA 2NUYA 2A6NA 3GR8A 3O06A 4P61A 2X1SA 4UR7A 3UWWA 2Z2UA 4YXGA 4A29A 3FIGA 2CLEA 3CIWA 4LTSA 5DN1A 3OG3A 3FJ6A 3L9CA 4POCA 4XWUA 3HG2A 1W0MA 4GFSA 4DQWA 2FLIA 1XUUA 3P84A 3WK3A 3MBDA 1AL8A 1LORA 2W79A 4ORMA 2R91A 1I2NA 2WNZA 1F76A 1FX6A 4Z1CA 3T7VA 1XM3A 3NQ6A 3THAA 3A5FA 2V2DA 2DZWA 3NQ2A 3GDRA 5HUPA 4PCFA 1KM1A 5I3FA 2Y88A 5LKYA 3JS3A 4R34A 1EUAA 1PIIA 5AHEA 3W1UA 4GXMA 3V75A 2GOUA 1IIHA 3N9RA 4DBDA 2ZYFA 3HIJA 1KBIA 4H3DA 5G5IA 4Q33A 5D03A 3BLIA 3M0ZA 1AW5A 2NX3A 1WOAA 3FFSA 3W1XA 1FCUA 4FF7A 4A3UA 5FI8A 3CHVA 1HTIA 2EF9A 2WOQA 3CWNA 3STGA 3QFEA 1H51A 2GUUA 3MHUA 3LRLA 5MHBA 3GNNA 2QAFA 2VELA 3EEGA 1XDMA 3G0SA 2A7RA 3UQNA 3QZEA 4MFEA 3RFAA 3G1XA 4IMFA 1FCVA 5EKYA 4BF9A 3LX9A 5HWJA 3ABQA 1A5SA 3W7CA 5LGXA 4L4MA 3WJYA 4AHOA 3NNTA 4YL2A 4FX7A 4KWWA 4O11A 1DHPA 1EP3A 2CLFA 3G1YA 4UFMA 2QCNA 1HUVA 3LV5A 3TFXA 2Y89A 3O07A 2CFFA 1W3IA 1XDLA 3UWVA 3ABOA 2X30A 4RX0A 1WBJA 3GKFA 3SIZA 3I7SA 3RNDA 3CIXA 3IIZA 4RR4A 5KINA 1TTPA 3OIXA 2G5WA 2J27A 1ZNNA 3UYCA 2QCDB 4CQ8A 4O13A 5F4WA 4Y8FA 3UY8A 3TXVA 4BK9A 3TSBA 3UY7A 1MSSA 1L2UA 1LLZA 2J9ZA 3RK8A 3ATZA 3WJSA 2RFGA 4JTHA 5DELA 3ZR4A 5J5DA 1R2RA 3DKLA 1W56A 2Q3OA 3MP5A 3W1MA 4QNWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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