2WSY | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	268
structure length	237
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLIEKLKEYHAAPALQGGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPMLAELRSFVSAMKAASRA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
publication title	Loop closure and intersubunit communication in tryptophan synthase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRYPTOPHAN SYNTHASE
total genus	79
structure length	237
sequence length	268
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	1998-02-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2wsyA00

3I7RA 1GQNA 2ABBA 2QDGA 1O5KA 3LV5A 1F76A 1JRCA 1LBFA 5D2VA 3ATZA 4UTLA 4BI5A 1R2SA 2OJPA 5L9FA 3HGSA 3S5NA 5BOOA 2C15A 3USBA 1F74A 3FLUA 5CKSA 3O05A 3N3MA 3QQ1A 2E1DA 2WNZA 4DEFA 2Y7GA 3QJAA 4WQ6A 4Y9AA 3P60A 3BG3A 1W31A 1OFDA 1FBAA 1GG0A 1TO3A 1JQVA 1TPVA 4JIQA 4M7SA 3GR7A 3B8DA 3GIYA 4IMEA 1NF0A 3BLIA 2ISVA 4LT9A 3DFOA 3B06A 3GDMA 1W0MA 5FF4A 4S2BA 1JCNA 1YDVA 4NNBA 2HS6A 1S5WA 3TU9A 1H7OA 3WK3A 4FNQA 3UWWA 3IIOA 3P5ZA 4AF0B 2F84A 3EWZA 1JCMP 1ZENA 3GX9A 4XKYB 1NEYA 3HIJA 3HG4A 1DVJA 4CCDA 1QR7A 1G69A 3O15A 2R91A 1TRIA 4AF0A 3VNDA 1FWWA 2R14A 4WOZA 4XKYA 1YXCA 1EEPA 3MHGA 4WXYA 3B0PA 3SY5A 4K7VA 3A22A 3NGJA 3N19B 3TDFA 1C9DA 5AHIA 4DQWA 4JTLA 1OYCA 2FDSA 4ZL1A 3NVTA 6ALDA 3LRKA 4YL2A 1F6KA 3G1XA 1DHPA 2DZWA 4QIUA 3Q94A 2EPHA 3BARA 1K7FA 1KM6A 2YFOA 1H50A 3THQA 5HWNA 1O94A 3GKFA 3W6YA 1X6UA 3NZ1A 4NZJA 1E51A 2NZLA 3LLFA 1MZHA 2ZZ3A 3TMQA 2CZFA 3EWWA 5IM51 3LI0A 1TREA 2PURA 3NEVA 3R89A 3GB6A 2TMDA 5HINA 3FJLA 3MHFA 3WJZA 1ICSA 2DZPA 2ZA1A 4ZQCA 2FIQA 2Y85A 3TW7A 3HGOA 3NL3A 3INPA 3L9CA 3RU6A 4Z1AA 1GT8A 2I1OA 5FF2A 5C54A 1Z41A 4W9TA 1TV8A 4PODA 3C2OA 5ABTA 5AC6A 1G4EA 3GKAA 3UWZA 4WUIA 3O16A 3F4WA 3DFNA 1K02A 2J9YA 4E38A 4J9JA 3TQ0A 3BW3A 4MJZA 3N9RA 2DJLA 4I7VA 2DZXA 4LVFA 1FCQA 3EX3A 3GDTA 2FTPA 3LCHA 3AJXA 1P4CA 5CSRA 1H60A 1VCGA 1PCKA 3DU0A 1ICPA 1J5TA 4LVBA 2E6FA 4K8HA 1W5PA 4O19A 3BLFA 1ALDA 3WJYA 4JY9A 5F4SA 2G95A 4UR7A 2ZTJA 3GLCA 1C29A 1L6YA 1ONRA 3R13A 3G1HA 4KFPA 1I4NA 3EX6A 5D37A 3FS2A 1WXJA 1GVQA 3LTPA 3STGA 2QCFA 3NPVA 1BTMA 1JUEA 4O28A 2I9EA 1FWRA 1D3HA 1KBIA 2B4GA 3GDKA 4N2YA 3L68A 4EF9A 5LGZA 3P74A 2NWSA 3HMJG 1AW1A 2TSYA 4FNTA 1XUUA 4FNRA 4OQVA 2Z1BA 4UXDA 3UNDA 1ME7A 1G6CA 3UD6A 1EUAA 2E09A 4G1KA 4JDYA 4UTMA 4FX8A 2ZRYA 4NNCA 2I14A 1AMKA 3PAJA 3SI9A 4PFMA 3PC0A 3C2RA 5F1VA 3MP3A 1L6WA 2R8WA 4ZQPA 1SFLA 3KFTA 4UR8A 1LRTA 3TC7A 3TKFA 3L66A 4OT7A 4ZQNA 4M6QA 1B57A 4O53A 5G1YA 4RJEA 1S3HA 2O7SA 3C2VA 1YXDA 3W2NA 2QCGA 3EWXA 5G2HA 1ZAHA 4RXGA 3G24A 5CZJA 4UIOA 1H61A 5HWMA 3NL5A 1OFEA 5J5DA 3W1NA 3RF9A 2JKEA 2Q3OA 3MUXA 3NQVA 1KM1A 2OZ0A 1NAL1 1W3TA 5AYXA 4ADUA 2VEKA 3ZR4A 4RLIA 2JK2A 4GFSA 3W7JA 4M6PA 2GVLA 3W2KA 2A2IA 4K7YA 3N2MA 2C1HA 5FEPA 3VI2A 4UMAA 2E6YA 1WV2A 1LOSA 5LHEA 2NXHA 2GQ8A 2CLKA 2X2GA 2NLIA 5EA9A 3WJXA 5LSMA 1K8XA 4IMDA 1GTHA 3MWAA 4O1AA 3F1QA 3TX9A 1OF6A 3GZ3A 4R34A 3EX1A 4TMBA 3T78A 2C3ZA 4HNNA 2F7FA 1I2PA 1VGAA 3DHFA 3L65A 1HTIA 4JXCA 2JBMA 3N9SA 4O15A 3HBLA 3CU2A 1GOXA 3PSWA 1FWSA 3W87A 1KV8A 4Z0JA 4MKNA 4O17A 3NQGA 3TR2A 2VENA 2FPVA 1FX6A 1TPDA 2DZSA 2A6LA 2XN1A 1WOBA 3MP5A 1UASA 4E0CA 4HNUA 1DBTA 4DXVA 1FDYA 4M19A 2YXGA 1SW3A 4HIBA 3TCEA 3W7GA 3LCFA 3KRSA 1QPOA 4OBTA 4ADSA 3OA3A 5DBUA 2JGYA 3A23A 1TRDA 3UXDA 1MEWA 5K4ZA 3WFAA 1BEUA 1V7YA 3W70A 3BK0A 3VKJA 3NOEA 4Z08A 1EX5A 1YDNA 3ABRA 4MLRA 4GNJA 3C61A 4AHQA 4N02A 3TE9A 1ZY9A 3B0VC 4RCXA 1GVSA 1B4KA 1SO5A 3W07A 2Z0IA 4UFIA 1QMLA 4RKAA 5LHFA 5EYWA 1VH7A 1XDMA 3UWVA 1TMHA 4L4MA 2RHGA 2V82A 2H6RA 4U28A 4WOQA 5HJLA 1JCJA 4B5NA 1TTPA 3JR2A 4O57A 3P81A 3C8FA 2BWGA 1WBHA 3HF3A 4ZQOA 2E5BA 3W2UA 4BK9A 4MUZA 2ABAA 2B0MA 1KV5A 1ZHAA 3PUDA 1DV7A 1IXPA 1K03A 1PS9A 2VFFA 4A29A 2PCQA 4IMFA 2E5CA 5G4WA 2G97A 3W3OA 1VCVA 4HHPA 5KTLA 1EWDA 4O52A 1VR6A 1P5BA 3SR7A 3G22A 3MI3A 3P61A 2V5LA 4TO8A 2AAMA 2WJZA 1AW2A 4QISA 1S5VA 3NR0A 4O1BA 2NXIA 2ZA2A 3G3MA 5AHNA 5CGQA 2ZRUA 3P80A 3E02A 4NT0A 1Q6LA 2C13A 4O4WA 4KFNA 1H63A 4BFAA 3NXFA 3UWYA 2GVGA 5FI8A 3QMSA 3OIXA 4HNTA 3NQDA 2DORA 3A9IA 4NJKA 4UNLA 5EL1A 4IX2A 2CFFA 2CW6A 4NXKA 1JJKA 1GTEA 4PTNA 3RFAA 1FXPA 2WSYA 3F03K 3MBFA 3NL2A 1T8XA 3N34A 5EY5A 4Z1CA 1LOQA 1SZFA 3S1UA 3IGUA 1M6JA 3CLMA 3G18A 3HOJA 3STFA 2YPIA 2QCNA 3LHWA 3UZ5A 4UUIA 5C5YA 2PE4A 2X1TA 3LERA 4AB4A 4FNUA 2B7NA 3IIPA 1GG1A 4DBEA 4TIMA 1IIHA 3HGRA 4OGZA 3TIMA 1A5BA 3I7SA 3GNDA 3R8RA 3FIGA 4UTHA 2CLEA 2E77A 2QCDB 4K6AA 3TXVA 1I2OA 4XBSA 5DXXA 2Y7DA 1X1OA 4JD4A 3ANYA 1LP6A 3C2EA 3W7HA 5AYZA 1NVMA 2CZEA 4Q33A 2QCDA 3MBDA 1FWNA 4EF8A 2ZCGA 1VZWA 2NX9A 4IOTA 3W1MA 4NJGA 2QJHA 5DLCA 3V75A 1Q6RA 1EUNA 1KBJA 3PSVA 3QMTA 3EX2A 2XN0A 4XBKA 1T99A 3EWUA 4O16A 3W85A 2B7OA 3EEGA 2RKXA 4MIMA 3GK0A 3LLDA 4ZVJA 3BPWA 3VFLA 4RXFA 1L9WA 2QCHA 3LCGA 4UFMA 4EOUA 2DU2A 3C2FA 2G5WA 3UZJA 3TJXA 1FCVA 3SGUA 2CZDA 5CZTA 2NV1A 1D9EA 2CLOA 1A50A 5AB3A 1P0NA 4RK8A 3PS7A 1GYLA 3TSBA 3S9YA 1AK5A 2BX7A 3LI1A 4ORIA 3W73A 3KXQA 3WK1A 4TR9A 1QOQA 1J2WA 4IMCA 2CU0A 3I65A 3TQVA 3W7KA 3O6DA 1RVGA 3ATYA 3NQEA 4A21A 4O54A 2GJNA 2QUUA 3W84A 5LNVA 4MLJA 3FA5A 1HFBA 1M7PA 4LV9A 4K36A 3OEXA 3LX9A 3UYCA 1PE1A 4Y6GA 5AC8A 3AO0A 4NNAA 1OFQA 1YADA 4ONVA 1DORA 4I7UA 5LNRA 3R12A 5CPNA 5GVJA 4IJBA 4I7WA 3TSMA 4A2RA 4RZ4A 1P1XA 1DQWA 1WYIA 3IGXA 3QYQA 4DO6A 1GPWA 2C18A 3NG3A 2DZUA 1FQ0A 3CB8A 4S1FA 3C56A 3FKKA 3W1QA 4AVFA 4PCFA 3IIVA 4GUGA 3RNDA 1PIIA 3P62A 3LB0A 1H7WA 3BO9A 4ICNA 5AHFA 3WK2A 3W1UA 4HPJA 4K8EA 1H1ZA 5DXYA 3RLUA 2NX1A 3S6DA 3IIXA 5FESA 4A2SA 3LHZA 1CX9A 2VFEA 4UNKA 3R2GA 1CW2A 1GYNA 3DFSA 1RQEA 4O10A 3BVJA 5FEXA 4MPQA 4O50A 3M7WA 3W71A 3QC3A 4JYEA 5K3VA 2GQ9A 4GBUA 3QQ0A 2V2HA 3G1YA 3NQAA 5LNUA 4O0KA 5DBTA 4LUJA 4X9SA 1P0KA 3W75A 3M43A 5CPLA 1DQXA 1VHNA 3CEUA 3PF3A 4GJ1A 3W7QA 4X2RA 1FY6A 3MO7A 3UPBA 1H7NA 4OHQA 3M47A 1JULA 4Q4KA 2EF9A 1GJPA 5C2XA 2D73A 1XXXA 3UY8A 4DELA 5AOUA 3O1NA 3T7VA 3TC6A 3DKLA 3LHTA 4JS3A 1H7PA 2NXGA 4MYXA 4IPIA 5FF0A 3W83A 4GXMA 1OFBA 3L5AA 2X30A 3LXBA 3M6YA 5K9CA 1ZCOA 4R53A 1IXNA 4LV4A 3GVGA 3VE7A 3M44A 4K38A 4FXSA 4CLMA 2Y63A 2A1YA 5LZLA 1W5MA 1FDJA 1F5ZA 3VCRA 3PULA 4IX0A 4TU1A 3CC1A 3LHVA 5E1QA 3HB9A 3TJLA 1TV7A 3I68A 4NJHA 3FEMA 1UB3A 4PC8A 1TYGA 3NPWA 4XTIA 4AEOA 6TIMA 4O1CA 2TYSA 3Q58A 1VC4A 3HGJA 1GVOA 1RQBA 4OWGA 4UCGA 3K30A 4MVAA 4JTHA 4OV4A 2B7PA 3G0SA 4KKXA 1F6PA 4MFDA 3LTSA 3W1LA 3NQ8A 4LTSA 3RLVA 3ABSA 4O8RA 3U6WA 1AL8A 1I2RA 1KFCA 1N8FA 2P0OA 5D05A 1RD5A 1UJPA 4JTSA 4UTUA 4BI6A 3MYPA 4UTTA 1C8VA 1RQHA 2YSWA 5CZ0A 2BLEA 3EXSA 2C16A 5LKYA 3WK0A 4JYDA 5I3IA 1AG1O 4DF1A 5F2LA 4RX0A 1XUZA 4TX9A 1LCOA 3PB2A 1A5AA 3L21A 4M7TA 4RZ6A 5DELA 5AHMA 3KVLA 5CPMA 3M5VA 3GR8A 1UUMA 5EPDA 4OU1A 1TQXA 1OYBA 2EHHA 1QFEA 4HKPA 1OX6A 3T40A 4PH6A 1Z44A 1EWEA 4P2VA 2V5BA 4GRSA 2WPBA 1R46A 1FDZA 2E6DA 3EB2A 3ELFA 2Z6IA 2ISSA 4JX5A 1NF7A 4FIQA 5AC7A 3W23A 1YPFA 1OVDA 5D2TA 4UMBA 3O06A 2CWNA 2PRMA 4LRSA 4UTTC 5D33A 1SPQA 2Y61A 3A5VA 2OT1A 4Y96A 1LRQA 4LW7A 3G3DA 3N73A 1W3NA 1OFPA 1A5SA 5KITA 1UCWA 5D2YA 4JTJA 3M1ZA 2XN2A 3NNTA 1DKWA 1X1ZA 3B4UA 3ZWSA 4JYFA 4LOCA 1JCLA 4LRTA 1R2RA 1QO2A 1JQXA 1ML1A 1SW7A 2DZTA 4JTFA 4NX0A 4N4QA 1JCXA 1LDCA 5HR7A 3FFSA 5CPOA 4YCPA 1F73A 3QW4B 2RDWA 2A6NA 4R33A 4QJ1A 4LVAA 4AHOA 4AMAA 3N14A 2ZZ1A 1VQTA 3O8AA 2YR1A 5KSWA 1PV8A 1A5CA 5EBUA 1VS1A 4HSOA 3KX6A 1OG0A 3C52A 3DZ1A 3GDRA 3NQMA 1TSIA 7TIMA 1QCWA 1KLZA 1HG3A 3W9ZA 1LOLA 3P84A 5F2GA 2FFCA 1O4UA 3W1AA 2Q8LA 1S5TA 5C55A 1LLWA 2ZZ6A 3PUOA 3OHIA 3CHVA 3QRHA 1JVNA 3HO8A 2A4AA 3CWNA 2FB3A 3OBKA 2R94A 1ZAIA 3U2OA 3P8JA 2Y6ZA 1KFLA 3NQCA 3TV8A 3W2JA 3C6CA 1W37A 1LBLA 1B3OA 1VYSX 4JN6A 4OV9A 3RMJA 2BXVA 1TTJA 5D30A 4I9AA 4CCEA 5EMUA 5D32A 2CLHA 3P8IA 2QF7A 3CIWA 1NFBA 3G1AA 1AW5A 2J27A 3LRLA 2C0AA 1X7FA 5AYYA 1F7BA 3DGRA 1I2NA 1LORA 1QAPA 3MP4A 4YCOA 5KINA 3SZ8A 3CQ0A 1SU5A 3HJZA 2VKZG 1FCBA 1RPXA 1OK6A 1G7UA 3W2MA 4N6EA 5AFDA 3LCIA 2Y70A 4MOZA 3W1RA 2VFHA 4NX5A 3EWBX 3G1VA 5HULA 3LOTA 1DJQA 4QM1A 5DCEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2WSYA

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Chord Diagram

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