2WXDM

A micromolar o-sulfated thiohydroximate inhibitor bound to plant myrosinase
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title A Micromolar O-Sulfated Thiohydroximate Inhibitor Bound to Plant Myrosinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords MYROSINASE
total genus 192
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2009-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wxdM00
3VOCA 1HJSA 4WSJA 4W7WA 1HJUA 3A6OA 1LLOA 3WFLA 1UH4A 4PTVA 1AQ0A 5I0DA 3DYMA 3N11A 1CGUA 1UR0A 1QI0A 2V38A 3F4VA 4D71A 2CESA 1YHTA 4AC1X 1QW8A 1E1EA 1W3JA 5E9AA 3T0AA 4HA4A 4BS0A 3UEQA 5HOSA 2XVKA 1E5NA 1RD6A 1L0PA 4HP5A 4JCMA 3RPMA 1CLVA 2XM1A 1HP4A 1RP8A 1W91A 1I1XA 1JAEA 2YL8A 4P8WA 3WD4A 4PMUA 2VVSA 2PBOA 3T2PA 4HU8A 3AYSA 4MPKA 2JALA 3GYCA 1JGIA 3NSMA 3WH6A 4IPNB 4CCDA 3WMCA 5BRQA 1H49A 2XIBA 4PCTA 4IM4A 1NARA 4N42A 3BMVA 1KGXA 2HISA 4MB5A 4U3AA 3WENA 1NOUA 1RH9A 5ABHA 4P8VA 4GI9A 1KXHA 3VGFA 2ZUTA 5DEZA 1W2PA 1JZ8A 1E6RA 3VD4A 3MV11 3GNPA 5BRPA 1CGWA 3CHDA 2YL9A 3POCA 1TVNA 3ARZA 1IZJA 1W3HA 4UCFA 5E0FA 2CBJA 3MSDA 1X6NA 1UR8A 1XH1A 3O6AA 1DTUA 1C3FA 3WMBA 2O9TA 5I6SA 2VRKA 1OGBA 4CU6A 2EPOA 2IXUA 1Q6EA 2XSBA 5A94A 3KL0A 4MTVA 2ZOXA 2CIPA 2J79A 1CGVA 3AXHA 3EMZA 4M8UA 3VTRA 5LA1A 3NYDA 1E6ZA 5KEZA 3CIVA 1GORA 3DHPA 1V6UA 4YN5A 3A4WA 2X05A 2EJ1A 3ZOAA 1C7SA 1HT6A 2W5FA 3J7HA 1ISYA 3W28A 3WH8A 4FLQA 1WPCA 3T0DA 1O7AA 3DYPA 2VRQA 1ISVA 4J28A 4D6HA 1PZ2A 2XVNA 3VIGA 2J7BA 3PTMA 3W25A 2QV4A 1FFRA 4DWSC 1OB0A 2PC8A 2X1IA 3WELA 1KCLA 5LA2A 5I24A 4V2XA 2VQUA 5EB8A 2CNCA 1W9PA 2FGZA 1BTCA 1IZKA 2DEPA 4UFLA 2CEQA 3WBEA 4ZEPA 2J8FA 3GH5A 5D8WA 3L4WA 4XZBA 2WMIA 3ARRA 1UKTA 1JXKA 1CNVA 3UR8A 1ZS2A 3W6LA 1E71M 3PZTA 1C8YA 5AYBA 3ZJ8A 4J3WA 1JF5A 4U2ZA 1H1NA 3U5UA 1UZ1A 1PJ9A 4CN1A 1EQPA 1B9ZA 3SCQA 2ZX5A 6A3HA 3AJ7A 4H7VA 1Q4NX 2Q8XA 3M07A 3TP4A 4QAWA 2XVPA 1CXIA 1M03A 3WEMA 1G94A 1K9DA 1ITCA 4U2YA 4TVCA 4JL1A 4HU0A 5CSUA 4XB3A 4J7RA 4R5EA 1C7TA 3WD0A 1H41A 2J8GA 4QLJA 2WZEA 1MW3A 3IJ9A 4ACZB 4ATDA 4HZ6A 3EDEA 2DGAA 2YBTA 1KWGA 2WMJA 3WNOA 4DM2A 4HOXA 2VT0A 4KRTA 4FLSA 1NH6A 1M04A 1R87A 2WWDA 2A3CA 4FLOA 1ZBVA 3RM9A 4W93A 4KH2A 3AIVA 2WVVA 4EKJA 3VGDA 3PZ9A 1DWAM 4ATLA 2DIJA 2C7FA 3OG2A 5ABGA 5JBFA 2F2HA 1ISZA 2GDVA 2O92A 5A6MA 4DUXA 1NP2A 2Y8KA 4DWSD 1Q6GA 5HNNA 4HZ7A 2PWGA 4QDMA 5CGMA 1JD7A 5I79A 2VZOA 1H3GA 3MU7A 1J12A 4TOQA 1B3XA 2J7EA 2BV9A 4UOZA 2GJXA 2YL6A 3QOMA 1J10A 3EDFA 3KEHA 2EEXA 3BSGA 2PB1A 8CGTA 3PZOA 1GQKA 3L2MA 2J7CA 2WNWA 2D23A 1J0KA 3WQ4A 2V3DA 4JAWA 1W1VA 5BWFA 2A3AA 3GXDA 3ZT7A 1CXKA 3CPUA 4W5UA 5LA0A 2DH3A 3OGSA 3NCOA 5D8ZA 1KR0A 4UQEA 1P6WA 2J47A 3NUKA 3VM7A 2Z1KA 5HXMA 4U31A 2WCSA 1TCMA 3FY1A 2W67A 4B9YA 4PTMA 1V6XA 1E6NA 1GVYA 3PTKA 2VCAA 1JNEA 2WMHA 5A2BA 4B3KA 2GK1A 2BY2A 1JIBA 2ZIDA 3OGRA 3RM4A 3WF0A 3N15A 4LPCA 3W4RA 4ZENA 3VIKA 1HF6A 4WJXA 1TZ7A 5JBDA 4M82A 4CGTA 2XWEA 5A8NA 1W9BM 1NOFA 2VMFA 3MUZ1 3OBAA 1HNYA 1TVPA 1ISWA 4WIWA 4P7NA 4M56A 5HPCA 2VVNA 1XD1A 1QHPA 5E09A 5M17A 5JIPA 1W9DM 4H8UA 3D5HA 3THDA 1LWJA 5M3WA 2BY0A 1WNOA 1E5JA 1PIFA 3AHYA 5EMYA 1B3ZA 1UH3A 1V6WA 2X0YA 4PMNA 5GNYA 4KMQA 3VMOA 4UZUA 5E0CA 1Q6FA 1VJZA 1KCKA 4LQ1A 1QNRA 2YL5A 4W8AA 2ZX7A 2A3HA 1KXTA 3RCNA 3AXIA 1UWUA 3I3DA 5TD4A 2W61A 3AXXA 3CUHA 4OBRA 2NW0A 3UCQA 2YDSA 2CYGA 1PX4A 1CPUA 4UQ9A 1FFQA 2QMKA 4AISA 1DWJM 4KRUA 1E6XM 3ZSSA 4E4PA 1W9VA 3AMDA 3VIHA 4WF7A 3EDDA 3T09A 1EXPA 4UZSA 3WUGA 4GI6A 3A47A 4AD3A 1XYFA 3VD7A 3WDJA 4XUYA 1E4NA 1KGWA 2DSVA 3AIWA 1G9HA 2D24A 3ARPA 3CGTA 5A95A 5A6AA 1SR0A 5D9OA 5HDRA 1ZU8A 1LG2A 1B3VA 2XUCA 4CVWA 3FHAA 3UERA 2GDUA 3TTQA 3AHZA 3AHTA 1OGSA 3GH7A 1CWYA 1EH9A 4PTWA 3SUTA 3T0BA 2WB5A 4W86A 1JXJA 1CZ1A 4GQQA 5ABFA 1HKIA 4DM1A 3ZM8A 1C92A 3WL0A 4BCEA 1CIUA 4QFUA 2UY2A 1CXFA 4Y7EA 3PN8A 3NJ3A 2VQTA 4GKLA 4N0RA 3VMNA 1EA9C 4JIEA 4PUDA 4BQ5A 2BVYA 1U2YA 4C7GA 3K8LA 2D2OA 4UOJA 1UKSA 2DPEA 1E4MM 4CU8A 3WDPP 3WQ6A 3CUFA 2BXYA 2JF7A 2DT2A 5EBAA 5FOOA 1V03A 3GXFA 4J27A 1NOWA 1GQLA 2BS9A 5A8MA 2G3JA 1OD0A 1ISXA 1VRXA 4HMEA 2EXOA 2XVGA 1E9LA 3HJEA 2DT1A 2DSUA 4GIAA 1TFVA 4QLLA 2Y24A 4U33A 3N13A 1KFWA 4MDPA 3ZO9A 1R8LA 5A6KA 4M24A 2YBUA 3BAKA 4LYPA 4AZCB 4M80A 3WF2A 4W5ZA 2Y5EA 3SCWA 1V0NA 1N82A 2J74A 1NQ6A 1OM0A 2A3EA 3ECQA 3PZNA 1NWRA 2O9OA 3SIMA 4C7FA 1UWIA 1E73M 1OINA 1VENA 1WDSA 3LPFA 2B31A 5GQBA 5CJ5A 1B0IA 3WL1A 4MAVA 2AAAA 3KE0A 1G01A 1E3ZA 5AYIA 1FP8A 4C7DA 1XCWA 1H09A 4FMVA 2BY3A 1UKPA 1E40A 3SUSA 4Q7NA 3SUUA 5DFAA 3WQVA 3KL3A 1JDAA 4V28A 3CBWA 1SYTA 3TA9A 1VFUA 8A3HA 4D6FA 1GOWA 2G3IA 4CD7A 4BQ3A 4UTFA 3GNOA 1CECA 1QI3A 3N9KA 4UFHA 4UOQA 1GONA 3L4UA 1JZ6A 5DF0A 4B16A 1OIFA 5JUVA 3U57A 3II1A 5KZ6A 1BQCA 1PEZA 1BLIA 3VPLA 4Z2GA 1K9EA 1JZ7A 4NF7A 1JI2A 1X6LA 2EQDA 2ZWZA 2EPLX 1V0MA 2VR4A 1EQCA 2WMGA 4W7UA 3VIOA 3CZJA 1B3YA 1V3LA 3WEZA 4BF7A 1XSKA 3DC0A 2OSXA 2XIIA 3ZMRA 1HJVA 1EHAA 3AMKA 3VD9A 4PSPA 3CZLA 4WKAA 3L4VA 3RIKA 1UKOA 1UR1A 1WP6A 3VIJA 3W24A 2CHNA 3PBGA 2D0FA 4MB4A 1EOMA 3WBAA 3WH5A 2GVYA 5FKYA 4MDOA 1DWIM 2VO5A 2GJPA 2WWCA 4V27A 3T2QA 4A4AA 4QCEA 2VRJA 1W1TA 1J11A 3MO4A 4H04A 1US3A 3OLDA 2YKKA 1XH2A 1D2KA 3AS1A 2BVDA 4D72A 4XX6A 1XD0A 2WHKA 3VDCA 3CH9A 1GCYA 4D6EA 3F5LA 4L4OA 3VDBA 1RPKA 2DT3A 4GINA 3K4AA 1HKKA 4OZOA 3WIJA 4NZCA 4UFMA 1ZB5A 3ZQ9A 3MSGA 3AZSA 2RGLA 3CUJA 2J4GA 2JEQA 1B31A 5CLWA 3WUFA 1QHOA 1OSEA 3BSHA 1UD6A 2DIEA 2MANA 4FK9A 4RL3A 3EMCA 2V3FA 4HOZA 1DEDA 4NSBA 1ZJAA 3RJYA 4CN4A 3SUVA 4LGXA 1B2YA 1D3CA 4GXPA 1CBGA 3TTOA 1XH0A 3BC9A 1K9TA 2BY1A 2WW5A 1U33A 1JF6A 1KBKA 2OSYA 3ARUA 2FDMA 3UETA 3ARVA 4CN6A 3VIFA 4IPLA 4BA0A 2WANA 4TVDA 4S3JA 3IJ7A 3A3HA 3CLWA 2WVUA 1KWKA 4QCFA 2W4XA 4KWUA 4OOUA 2OLHA 1PX8A 1H5VA 1MQPA 3BCFA 1JYWA 4TUFA 1WE5A 1NWSA 2NT0A 2E9BA 2YDQA 4F66A 5DMYA 1GUVA 5FL1A 1HN1A 3UG4A 1LL4A 1Z32X 2E40A 3GXMA 4PRWA 1M7XA 1UD8A 3WD2A 4HPHA 1BG4A 1UZ4A 4EAMA 5BXPA 5ECUA 1IV8A 1JL8A 5GNXA 2UY3A 4J3XA 2ESCA 1HJQA 2PWDA 2WVTA 1GOKA 3G6LA 4PMXA 1C8XA 4W88A 2DDXA 5A6LA 3VIIA 1JDCA 3QHOA 3QGVA 2OWCA 4W8LA 4JHZA 1VFMA 3NSXA 4MJ2A 3VIPA 1OCQA 1WDRA 1VB9A 2WMIB 3SCUA 3WUBA 1PBGA 2ZUUA 4AMCA 4ATWA 3MANA 2VUYA 1W1PA 1GOIA 1E15A 4P8XA 5BXSA 3N1AA 3MS8A 1XSJA 2RGMA 5A6SA 4OKDA 3IAPA 1QW9A 4H2CA 1E0XA 1A3HA 3OB8A 4X0VA 5A6BD 4J3SA 2BFGA 2WMFA 2XFYA 3CZKA 3K8KA 3OA5A 3WQ8A 1JYVA 3B9EA 1V08A 2VX4A 4PBGA 3I3BA 1EDQA 2WLYA 2EPNA 2E3ZA 2VURA 1C8QA 2D22A 2QF8A 4AD2A 2WC3A 3AIQA 3CHCA 1LL6A 1UQYA 1WZLA 1E6SM 4Z2LA 3VX1A 2GJRA 3M7SA 3VO0A 3K1DA 1HP5A 1M53A 3U7VA 1AMYA 3WN6A 3B9DA 2QLYA 2FH6A 1DWGM 2WVVB 3W81A 5BROA 2CKSA 2EBNA 3TTYA 4CD5A 4JFVA 3SCRA 2UY5A 3KL5A 4W84A 2PWEA 2YA1A 1I75A 4H8VA 1BYBA 4JFUA 1UQZA 4J3TA 1EGZA 1HVQA 2BHYA 4CCCA 1E55A 2JIWA 4RE4A 1VAHA 4CUCA 3FXYA 4D6IA 3OLGA 3MUAA 1JFXA 2EPMX 2GJXB 3WD1A 1CGTA 5GPRA 1TA3A 2J7GA 4Z2IA 2ZXDA 2CERA 7A3HA 3HN3A 2V5CA 1C93A 4AZGA 3GZAA 4NRRA 4MNMA 1UWRA 4LX4A 2WLZA 1UOKA 4B15A 5BXTA 3A4AA 1QNSA 4JKKA 4PN2A 3CUGA 4UQAA 4WKFA 1UWSA 3N18A 3N17A 3NIYA 3IANA 1V3HA 3BH4A 4F79A 1UWQA 1XCXA 5CG0A 3QHMA 1WZKA 2VZTA 1H2JA 1MW0A 3AS3A 2VL4A 2YIHA 2BHZA 2VNCA 2GK1B 3ZR6A 1ESWA 4D6JA 1E1FA 1J0YA 2XFRA 2GUYA 3PZUA 3WMSA 1BVZA 4YPJA 1UR4A 2VCBA 3MMDA 1PZ3A 4Z2JA 3TTSA 3FAXA 3L4TA 4ZE4A 1W9XA 3CZEA 4LYQA 3NSNA 1R85A 4RE3A 1HL9A 1WDQA 3OZOA 5FL0A 4YHEA 2OWXA 2J77A 1FA2A 3LPGA 5A8PA 2WM0A 4HA1A 1V0LA 2Y2WA 1H0IA 3JUGA 1Q6CA 2E9MA 4GZIA 1JZ4A 4CVUA 2C0HA 5IHSA 1JAKA 3VGHA 1G5AA 5BCAA 1MQQA 2ZX9A 1WZMA 1J0IA 3VNYA 1V3KA 2BHUA 4FF5A 1ODUA 1PX3A 4DWSA 1EOKA 4MNJA 3UESA 3WNLA 5A6JA 5DT7A 3UG5A 3VUPA 3RDKA 3WDRA 1JZ5A 5AC5A 4R27A 5FD0A 2VZUA 1KQYA 6TAAA 2WZIA 1ZBKA 5EFDA 4GI8A 3CTTA 1I1WA 3BAJA 4AZIA 2O9PA 4PMRA 3AFBA 1UG6A 4D1IA 1Q6DA 1VBRA 3DECA 1KGUA 1BSIA 3WF1A 2PI6A 1J0JA 1R7OA 3AISA 1OT2A 1FP9A 4JL2A 2VC9A 3N04A 3WQ5A 2ZUVA 1US2A 3GDBA 2IXVA 1XRVA 4PEEA 4PUEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VOC A;  1HJS A;  4WSJ A;  4W7W A;  1HJU A;  3A6O A;  1LLO A;  3WFL A;  1UH4 A;  4PTV A;  1AQ0 A;  5I0D A;  3DYM A;  3N11 A;  1CGU A;  1UR0 A;  1QI0 A;  2V38 A;  3F4V A;  4D71 A;  2CES A;  1YHT A;  4AC1 X;  1QW8 A;  1E1E A;  1W3J A;  5E9A A;  3T0A A;  4HA4 A;  4BS0 A;  3UEQ A;  5HOS A;  2XVK A;  1E5N A;  1RD6 A;  1L0P A;  4HP5 A;  4JCM A;  3RPM A;  1CLV A;  2XM1 A;  1HP4 A;  1RP8 A;  1W91 A;  1I1X A;  1JAE A;  2YL8 A;  4P8W A;  3WD4 A;  4PMU A;  2VVS A;  2PBO A;  3T2P A;  4HU8 A;  3AYS A;  4MPK A;  2JAL A;  3GYC A;  1JGI A;  3NSM A;  3WH6 A;  4IPN B;  4CCD A;  3WMC A;  5BRQ A;  1H49 A;  2XIB A;  4PCT A;  4IM4 A;  1NAR A;  4N42 A;  3BMV A;  1KGX A;  2HIS A;  4MB5 A;  4U3A A;  3WEN A;  1NOU A;  1RH9 A;  5ABH A;  4P8V A;  4GI9 A;  1KXH A;  3VGF A;  2ZUT A;  5DEZ A;  1W2P A;  1JZ8 A;  1E6R A;  3VD4 A;  3MV1 1;  3GNP A;  5BRP A;  1CGW A;  3CHD A;  2YL9 A;  3POC A;  1TVN A;  3ARZ A;  1IZJ A;  1W3H A;  4UCF A;  5E0F A;  2CBJ A;  3MSD A;  1X6N A;  1UR8 A;  1XH1 A;  3O6A A;  1DTU A;  1C3F A;  3WMB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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