The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
102
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sequence length |
260
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structure length |
260
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Chain Sequence |
AIPTVTLNDDNTLPVVGIGVGELSDSEAERSVSAALEAGYRLIDTAAAYGNEAAVGRAIAASGIPRDEIYVTTKLATPDQGFTSSQAAARASLERLGLDYVDLYLIHWPGGDTSKYVDSWGGLMKVKEDGIARSIGVCNFGAEDLETIVSLTYFTPAVNQIELHPLLNQAALREVNAGYNIVTEAYGPLGVGRLLDHPAVTAIAEAHGRTAAQVLLRWSIQLGNVVISRSANPERIASNLDVFGFELTADEMETLNGLDD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal Structure and Comparative Functional Analyses of a Mycobacterium Aldo-Keto Reductase.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Oxidoreductase
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source organism |
Mycobacterium smegmatis
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molecule keywords |
ALDO-KETO REDUCTASE
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total genus |
102
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structure length |
260
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sequence length |
260
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chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature |
ec
1.1.1.218: Morphine 6-dehydrogenase. |
pdb deposition date | 2009-12-03 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00248 | Aldo_ket_red | Aldo/keto reductase family |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Alpha-Beta Barrel | TIM Barrel | NADP-dependent oxidoreductase domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3Q65 A; 3DOP A; 4AUB A; 2PDM A; 2DUZ A; 5JH1 A; 3UZX A; 4XZM X; 1S2A A; 2HEJ A; 1PWL A; 2PDP A; 4PUU A; 4WDT A; 1S1R A; 2FGB A; 3B3D A; 4GAC A; 4XO7 A; 4QBX A; 1AZ2 A; 1IEI A; 5KET A; 3M4H A; 3O0K A; 3DN5 A; 2PDG A; 4GA8 A; 3S3G A; 1Z9A A; 1IHI A; 4GCA A; 1M9H A; 4WGH A; 1AH0 A; 3G5E A; 3EB3 A; 4PR4 A; 3UWE A; 3LQG A; 4GIE A; 3GUG A; 3V35 A; 1RAL A; 3F7J A; 3V0S A; 4PRR A; 1R38 A; 4YS1 A; 1Q5M A; 5JH2 A; 2PDJ A; 1VBJ A; 3Q67 A; 3RX4 A; 2PDU A; 5AZ1 A; 2BGQ A; 2HDJ A; 1EKO A; 2IKH A; 3LUT A; 3O3R A; 2P5N A; 4FAL A; 1ZUA X; 4XZI A; 2PDK A; 2PFH A; 4ICC X; 2PD9 A; 2BGS A; 2PZN A; 4H7C A; 1UR3 M; 4LB3 A; 1C9W A; 1XJB A; 3GHS A; 3N6Q A; 5HNU A; 4EXB A; 2INE A; 4DBW A; 4LBS A; 4H8N A; 4Q7B A; 2IPG A; 1SM9 A; 4QX4 A; 4JQ2 A; 3UP8 A; 3R8H A; 4WDU A; 4LAU A; 4JQ1 A; 4YVV A; 4AST A; 2PDF A; 3UZW A; 4PRT A; 3MC5 A; 1J96 A; 1US0 A; 4GAB A; 3UG8 A; 3LBO A; 2PDW A; 1S2C A; 1ZQ5 A; 3KRB A; 1OG6 A; 4YVP A; 1EF3 A; 3CAS A; 3GHT A; 3MB9 A; 2VDG A; 2IKJ A; 3R94 A; 4G5D A; 4IJR A; 3CAQ A; 1PYF A; 4DBU A; 3H4G A; 3N2T A; 4GQ0 A; 2PDN A; 1ZGD A; 4LBR A; 4JTR A; 1XF0 A; 2F38 A; 2J8T A; 3BCJ A; 1AH3 A; 3CV6 A; 4LAZ A; 1RY0 A; 1JEZ A; 3WBX A; 2IPF A; 5LIY X; 2PDB A; 2PDQ A; 1AFS A; 2PDL A; 4JII X; 1LWI A; 1ZSX A; 3EB4 A; 4FZI A; 4F40 A; 3NTY A; 1MI3 A; 4DZ5 A; 2C91 A; 3H7U A; 1YE4 A; 1Z89 A; 2ACU A; 1X98 A; 3R7M A; 2ACR A; 1MZR A; 4WEV X; 4YU1 A; 1HQT A; 4XAP A; 2BP1 A; 4PUW A; 3COT A; 1YNQ A; 4JIR A; 4L1W A; 4R9O A; 2I16 A; 2IKG A; 4WDX A; 4XK2 A; 3FJN A; 5C7H A; 1S1P A; 1T41 A; 4HBK A; 2ACS A; 3R8G A; 5LIX X; 3RX2 A; 1K8C A; 4XO6 A; 2WZT A; 3WBW A; 2A79 A; 4FA3 A; 1T40 A; 2AGT A; 3R6I A; 4XZN X; 3V36 A; 3EAU A; 1YNP A; 1RY8 A; 2HVN A; 4WRH A; 3LD5 A; 2FVL A; 4JTC A; 4XVE A; 4NKC A; 2PDC A; 3RX3 A; 1X97 A; 3BUV A; 2PDI A; 3UYI A; 3D3F A; 3CV7 A; 3UZZ A; 3QKZ A; 3LZ3 A; 3LNM A; 3R43 A; 3U2C A; 1PZ1 A; 3P2V A; 2QXW A; 2WZM A; 5AZ0 A; 1Z8A A; 1GVE A; 3GHR A; 4JTQ A; 2R9R A; 3M64 A; 3WG6 A; 4IJC A; 3C3U A; 1AH4 A; 2IKI A; 3CAV A; 3LQL A; 4EXA A; 4JIH A; 2R24 A; 4I5X A; 5HA7 A; 1QRQ A; 3UGR A; 2CLP A; 2ALR A; 1EXB A; 3LEP A; 3FX4 A; 2FZB A; 4RPQ A; 2IS7 A; 1QWK A; 3VXG A; 1PZ0 A; 2DV0 A; 1EL3 A; 3BV7 A; 4OTK A; 2NVC A; 1ADS A; 2FZ9 A; 3V0U A; 2HV5 A; 3LN3 A; 1HW6 A; 4HMN A; 3LEN A; 2NVD A; 3CMF A; 1MRQ A; 4IGS A; 2HE5 A; 3H7R A; 2PDY A; 4XZH A; 2IPW A; 2PDH A; 3ONC A; 4GQG A; 1AZ1 A; 2IPJ A; 2IQ0 A; 1PWM A; 2PDX A; 2DUX A; 4LB4 A; 2PF8 A; 3BUR A; 4JTD A; 3LZ5 A; 1XGD A; 4QXI A; 4Q3M A; 3V0T A; 4WDW A; 2I17 A; 3UZY A; 5LIU X; 5M2F X; 3ERP A; 4JQ4 A; 5HNT A; 4XZL X; 4MHB A; 1A80 A; 3WBY A; 5LIW X; 4FAM A; 4XVD A; 4PMJ A; 2ISF A; 3WCZ A; 1FRB A; 2INZ A; 2HE8 A; 3ONB A; 1LQA A; 2PEV A; 1X96 A; 3G1R A; 5LIK X; 4JQA A; 2ACQ A; 4YVX A; 2PD5 A; 3GHU A; 3R58 A; 2F2K A; 4JQ3 A; 4ZFC A; 2IQD A; 1Z3N A; 2FZ8 A; 4QR6 A; 2FZD A; 3T42 A; 4DBS A; 1Q13 A; 1YE6 A; 3M0I A; 4JTA A; 1VP5 A; 3UFY A; 4L1X A; 2HVO A; 5DAN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RXG A; 4N2Y A; 3VGE A; 2VOT A; 3PJU A; 3E02 A; 4POC A; 2TRS A; 4MWA E; 1FWT A; 2PBO A; 1LT8 A; 5G2I A; 1K03 A; 2HK1 A; 1ONX A; 1YXD A; 3NQM A; 3CC1 A; 2PDP A; 3TOY A; 5XIM A; 3NM1 A; 1US2 A; 3SO7 A; 2G3M A; 4LAM A; 1AZ2 A; 1EHN A; 5KET A; 1E6P A; 3VO0 A; 1SGJ A; 1OCB A; 4JIP A; 4XTD A; 4A3H A; 4BI5 A; 3V5F A; 1C90 A; 1X6L A; 3LLD A; 5I0D A; 4JNZ A; 3NDO A; 2ATM A; 4PRR A; 3VGH A; 7CGT A; 4JTJ A; 2XZ7 A; 4BY3 A; 2AAA A; 3VVG A; 1O6I A; 3CIV A; 3Q2D A; 3SB0 A; 1KKO A; 1XIC A; 1H49 A; 1TTJ A; 3KVM A; 6TIM A; 5C7V A; 3PPG A; 1XIS A; 2H9A B; 4QJ1 A; 3UU0 A; 3S2N A; 4CKQ A; 1V08 A; 8RUC A; 1GOI A; 2Z7K A; 1MW3 A; 4A3U A; 1L0P A; 2X41 A; 2Z1S A; 3ZST A; 1EA9 C; 1FOB A; 5GNX A; 4LB3 A; 3PBW A; 1U83 A; 2QQ6 A; 4MAZ A; 3V16 A; 1GOQ A; 1Z32 X; 2RDU A; 4MWA B; 4JTK A; 3S6T A; 1ZBK A; 1HL8 A; 5CBI A; 2GK1 B; 3TTY A; 3LG3 A; 5LNW A; 1NDV A; 3MWA A; 4J27 A; 1TIW A; 3SIZ A; 4LBU A; 4MZ8 A; 2YXG A; 4RCX A; 3EKL A; 4M81 A; 4ZB5 A; 4UXD A; 4B3Z A; 1KXV A; 4YWS A; 4AZ5 A; 1JCN A; 1OF8 A; 1WZA A; 3UR8 A; 3GW0 A; 4AD2 A; 1XKY A; 3BSM A; 3N4E A; 3IJQ A; 1LL6 A; 1SZF A; 4PSP A; 4BS0 A; 2EBN A; 2VOM A; 3VDG A; 2ZUT A; 5K9D A; 3P6L A; 4PCF A; 4PUE A; 2Z1K A; 4AEF A; 1VYS X; 3WK0 A; 1R5Y A; 3QVQ A; 4W8L A; 2GDV A; 1B30 A; 1IZK A; 4MAD A; 1UWI A; 1B9B A; 4IJR A; 4NJH A; 4A6G A; 1EXP A; 1J6P A; 4KGL A; 1B54 A; 3UJ2 A; 2D23 A; 2PUR A; 3B8T A; 4RLI A; 1JXK A; 1VCV A; 1KB3 A; 1ZGD A; 1FHL A; 4ROQ A; 5KIT A; 1EF2 A; 1DWF M; 1U5J A; 1N82 A; 1W1A 1; 3GXN A; 2QAP A; 1EIB A; 1G69 A; 4JKK A; 1IT8 A; 5LIY X; 1I2R A; 4HP5 A; 4WIW A; 2NX1 A; 1PKM A; 4UFL A; 2NQH A; 1NDY A; 2E28 A; 3R25 A; 1EDT A; 1LLW A; 4P7L A; 4HPG A; 4KFO A; 1R9Z A; 2OWC A; 2DZV A; 3V5O A; 3EDE A; 1TJ1 A; 2O4M A; 3ZR6 A; 4F0H A; 3B0P A; 3NGJ A; 3XIM A; 4MFE A; 1IT0 A; 2HPM A; 2FZM A; 1YNQ A; 1V02 A; 1Y5V A; 3UZ5 A; 1TV3 A; 1QPO A; 1JQV A; 4BQ4 A; 1KCK A; 4GI4 A; 4XBK A; 2JE8 A; 4S3G A; 2QCD A; 1BYA A; 5LIX X; 4H00 A; 2XZ9 A; 3MKV A; 2E5D A; 3F5J A; 1RD6 A; 4D71 A; 4M6P A; 3MO7 A; 3MY9 A; 2J75 A; 3ID7 A; 2BY0 A; 1T8X A; 3ECQ A; 2J8F A; 3EAU A; 3HPZ A; 4Z2G A; 2E25 A; 4M7S A; 2OZT A; 4W85 A; 2X40 A; 4ATL A; 4B5V A; 1ZB5 A; 3A23 A; 2QAF A; 1M7O A; 5DMY A; 2BB0 A; 4Y9M A; 3A3H A; 4XD3 A; 4GY0 A; 3MYO A; 2V2H A; 4MNL A; 5J5R A; 5BRP A; 3D5H A; 3S83 A; 3WLJ A; 3TJL A; 1M1B A; 1GVE A; 2NT0 A; 1IXO A; 4HHL A; 2V68 A; 2I5I A; 3BLE A; 4WXZ A; 2W4X A; 3W6Y A; 1XDJ A; 3M64 A; 3AIV A; 2GQA A; 1REQ B; 4Q8W A; 2V3F A; 5BXS A; 3RR1 A; 3OOQ A; 4K6A A; 2WKL A; 4Z2L A; 3BLL A; 5ABT A; 4GVG A; 3WF0 A; 5F2M A; 5E9X A; 2BFG A; 3BH4 A; 2DZU A; 3THQ A; 1FWE C; 3Q94 A; 2ZDS A; 4LH8 A; 4YYC A; 2EPL X; 4XSM A; 2PGR A; 3OZY A; 4LUI A; 1E0W A; 2RFG A; 2J7C A; 3AC0 A; 2V3E A; 2B7Q A; 4LYP A; 3AZS A; 3T40 A; 2XVN A; 2IPW A; 2W62 A; 1DYS A; 2BX7 A; 1JAK A; 1DIO A; 4J28 A; 2VX5 A; 4CCC A; 3W2U A; 2PGW A; 5CJM A; 2G3N A; 1Q7M A; 4JNM A; 3B0X A; 2NX3 A; 2QDE A; 4DI8 A; 2DFA A; 3O06 A; 2NT1 A; 4G2D A; 2RDT A; 2GL5 A; 4E4F A; 4PCS A; 1JYV A; 3S1V A; 1LLO A; 4GOA A; 4XVD A; 3PZG A; 3CHV A; 3SRH A; 3HG2 A; 3WH8 A; 5TF0 A; 4L4O A; 4JXC A; 3STC A; 2V5C A; 4B15 A; 1JND A; 3HPA A; 2V8Z A; 4FXR A; 4B4H A; 4D8L A; 1Q6G A; 4LAO A; 5BXT A; 3UYC A; 5D03 A; 4S3A A; 1QK0 A; 4KWS A; 1NQK A; 3K4W A; 3T78 A; 5E6Z A; 1OIF A; 4CQC A; 2XVK A; 5FF7 A; 4CVW A; 1XYC A; 2J9Y A; 2J13 A; 1S2U A; 1L6G A; 2A3L A; 4EOU A; 3LK6 A; 3LCL A; 2FHF A; 4UMA A; 1EX5 A; 3OLD A; 4LCS A; 1HKM A; 1BEU A; 4XZM X; 1HL9 A; 4TMC A; 1IEQ A; 1TRD A; 4PUN A; 3E6E A; 5D32 A; 1O60 A; 4C6B A; 3KCL A; 4PUU A; 4ICM A; 1YRR A; 3E5P A; 3IVT A; 1KFB A; 4N9B A; 3BSH A; 3GVW A; 4KFP A; 4QHR A; 1JF6 A; 1QO5 A; 3DFH A; 3STF A; 3LXC A; 3A3W A; 3GX9 A; 4DJD A; 1E40 A; 2X1I A; 4GCA A; 3MI3 A; 3EWD A; 2WAN A; 2OCZ A; 3EB3 A; 4P5U A; 1H4P A; 3LQG A; 4X3Z A; 3GR8 A; 5U4N A; 4LUT B; 3S2C A; 3GNN A; 1GVQ A; 2QCL A; 1PIG A; 3HMC A; 3TN5 A; 2X7V A; 3GG8 A; 4AW7 A; 3WD4 A; 3SY8 A; 3KTC A; 1P0K A; 2Y62 A; 3THC A; 1F3E A; 2BGQ A; 1R7A A; 1TE1 A; 5GNY A; 2XII A; 4YTQ A; 1UIP A; 4E8G A; 1KKR A; 1JYX A; 2VEK A; 1XG3 A; 1PYM A; 3PZO A; 3G6M A; 1TPC 1; 1R3R A; 4W84 A; 4QAI A; 5TNV A; 4DAF A; 3CLW A; 5D37 A; 4KEM A; 1UR3 M; 3MT1 A; 3V75 A; 3BW4 A; 1XLI A; 3QGV A; 2CIP A; 3G6L A; 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