2X1IA

Glycoside hydrolase family 77 4-alpha-glucanotransferase from thermus brockianus
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
PCAYGLLLHPTSLPGPWGVGVLGEEARGFLRFLKEAGARYWQVLPLGPTGYGDSPYQSFSAFAGNPYLIDLRPLVDRGFVRLEDPGFPEGRVDYGLLYAWKWPALRAAFQGFRQKASPEEKEDFARFQEEEAWWLRDYALFMTLKSHHGGLPWNAWPLALRTREERALKEAEASLAEEIAFHAFTQWLFFRQWGALKEEAEALGIAFIGDMPIFVAEDSAEVWAHPEWFHLDEEGRPTVVAGVPPDYFSETGQRWGNPLYRWEVLEEEGFSFWIARLRKALELFHLVRIDHFRGFEAYWEIPASCPTAVEGRWVKAPGEKLFARIQEAFGRIPILAEDLGVITPEVEALRDRFGLPGMKVLQFAFDNGMENPFLPHNYPEHGRVVVYTGTHDNDTTLGWYRTATPHERDFLKRYLADWGITFREEAEVPWALMRLGMASRARLAVYPVQDVLALGSEARMNYPGRPSGNWAWRLRPGEIKEEHGERLLSLAEATGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
publication title Structural and Functional Analysis of Substrate Recognition by the 250S Loop in Amylomaltase from Thermus Brockianus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-ALPHA-GLUCANOTRANSFERASE
total genus 170
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02446 Glyco_hydro_77 4-alpha-glucanotransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2x1iA00
3NDYA 1H3GA 2MANA 4QCEA 1E4LA 3WN6A 2E9BA 2WZEA 1W1VA 4M8UA 2YL6A 2Q8XA 3CHCA 3OGRA 5BWFA 3T2QA 1XD1A 4V28A 1CXHA 3LPOA 3OLEA 1E72M 3CHFA 2VT0A 3CUHA 1HKKA 3BMWA 1K9TA 1KR0A 2JFEX 1WDQA 5FL0A 1BG9A 1PAMA 2PI6A 4YN5A 8CGTA 3B9AA 4JKMA 4AD1A 2V5CA 3VU2A 1AQ0A 3TTQA 2WKGA 3U7BA 1CLVA 1V0LA 3UCQA 3K4DA 4DWSD 1V08A 1U2YA 1KR1A 2BS9A 1GQLA 1HJVA 1EOKA 3WBAA 4JKLA 1KQZA 4AYSA 4EAMA 2C7FA 2W92A 3RJXA 4E2OA 4IPLA 2DSZA 2VVNA 3WENA 4B9YA 3NDZA 4PSRA 1NWRA 7CGTA 1LWJA 4KGJA 1JI2A 1J0IA 2W63A 4U2ZA 3ZT7A 5C8BB 1G9HA 2VMFA 4HPGA 1MVYA 2C0HA 1TFVA 1ZBCA 4AIEA 4D6DA 3WEZA 2FGLA 4FLQA 1R7OA 4PMQA 4KH2A 3AHTA 2BHUA 4JL2A 2J7EA 2Z1SA 3GXIA 3MV01 3OG2A 2O9RA 3EDDA 1V0NA 2ZUVA 4MNJA 2X09A 4MNMA 1XSIA 5C71A 2PWGA 2YKKA 1MFVA 2GSJA 2W62A 2XPKA 1HJUA 4PMRA 1UKPA 4J7RA 1E0XA 4OUEA 1X6NA 5A2CA 2WNWA 3B9EA 1EIBA 2ZX5A 1CXKA 4GZJA 1OD8A 3AROA 3MUIA 5AC5A 3AISA 4TVDA 4BQ4A 4CU7A 2EBNA 1GPFA 3ARUA 1MW0A 3PZMA 5I2UA 1BGAA 1ESWA 3VD5A 3VPLA 4TXEA 3RO8A 3BAKA 4GQQA 4HA3A 4HMEA 1TR1A 1MQPA 3AJ7A 4OBSA 3MMWA 1QW9A 2CXGA 3VOCA 2A3AA 4CUCA 1XRVA 3SCVA 2A3BA 1PIFA 1OD0A 2WANA 3D5HA 1Q6FA 3UG5A 3N9KA 3A3HA 3WH7A 4Z2LA 1GOMA 2EJ1A 4AMCA 2WWDA 4TTUA 1V6XA 2VUYA 2E8ZA 2YDQA 1JD7A 1UD4A 1DHKA 4M80A 2VZSA 1DEDA 4MB4A 5D9NA 2D1ZA 4R27A 5EFFA 2GUYA 1B9ZA 3HJEA 1ZL1A 4D71A 3VINA 3NUKA 2WCSA 1O7AA 1UQYA 2E4TA 4BCEA 1JF5A 3WDPP 4NZCA 1W9DM 1UOKA 1CTNA 4P7RA 3FAXA 4R5EA 5CQ1A 4CN1A 3TA9A 4X0VA 2BVYA 1BPLB 4U5KA 1BGGA 3T0BA 1UWTA 2FHBA 3ZMRA 1SFSA 5I79A 2C8NA 2J7FA 3WL1A 3OBAA 3SEPA 3VIPA 4Y7EA 4AD5A 4IPNB 3TONA 2BY2A 1KWGA 3AYSA 1W1YA 2G3MA 5LA0A 1GVIA 3RJYA 5FIPA 3L4VA 3RM4A 4OOUA 4WKAA 1XYFA 3FXYA 1B90A 3VD7A 4A3YA 5A6KA 1E3ZA 1EDGA 2PC8A 4WKFA 3MKKA 1EH9A 1FH8A 4AD3A 1JNEA 4AIUA 4J28A 1EQPA 2G8ZA 3L2LA 4CU6A 3WNKA 1LLOA 6TAAA 4P7LA 1QNRA 4HU0A 3CHEA 3WFZA 1ZBVA 2BFGA 1WZKA 6CGTA 1J0YA 1E3XA 3LPPA 5A6MA 2ZX9A 3WDJA 4TVUA 1JYXA 3BH4A 1FHLA 1H4PA 3MMUA 4PCSA 4BQ5A 3SCSA 3M46A 4PMOA 1TMQA 1QNSA 1ZJBA 2EXOA 3ZT6A 1E15A 1V3MA 1KBKA 5ABFB 4MB5A 2WMGA 4MB3A 1V02E 4QLJA 1W2PA 4CGTA 2ZX8A 1UH4A 4JCLA 5I78A 1C91A 5FD0A 1CXEA 2YDSA 5JBEA 2YLLA 1BHGA 4D6JA 4B3KA 1E6PA 4W88A 2X05A 2ZWYA 1TUXA 4N0RA 3GDBA 2VO5A 2XM1A 4CCEA 5A6SA 4GI9A 3M07A 1VJSA 1VFMA 3KE0A 4WLCA 1K9DA 1WO2A 1MWOA 1M7XA 1UQZA 4JFTA 3WF1A 1QI0A 3TTYA 1BF2A 2VC9A 4M1RA 3CUJA 1EGZA 3CZJA 2YDRA 1MQQA 2XIBA 3DYPA 4D6EA 2YIHA 2WHMA 1NARA 1G0CA 1UZ1A 1B2YA 1LJYA 1OBAA 1LL6A 4BS0A 4D1JA 1XCWA 3AZTA 3AIUA 3CLWA 1OGGA 1UWUA 3BAXA 3PHAA 3CHDA 2E9LA 2XTKA 1E43A 1H2JA 1VEPA 4QFUA 2DSKA 3GZAA 1ITXA 1J0KA 3G6LA 1DWGM 3VDCA 1KXVA 1UR9A 3AOFA 3N04A 4L4PA 1MW1A 4NSBA 4D72A 1XSKA 5D4YA 4UOJA 4H2CA 3BCDA 1OT2A 2BHZA 2J7GA 2WMFA 2D20A 3OZPA 4ZENA 3SUUA 1JGIA 5M17A 2J79A 3PN8A 4CD7A 1E73M 3VKKA 2VI0A 1NWUA 1JZ5A 3GXDA 3W37A 1UR2A 1C93A 2YA2A 1B0IA 2J7CA 5ABFA 4UQCA 3WSUA 1JZ4A 1V6UA 2J77A 3RIKA 1OT1A 1W9PA 3NIYA 3QOKA 3WNOA 4ATDA 2GJPA 3WF2A 4B16A 5EBAA 1VFFA 5ABEA 4HOXA 4KGLA 1FP8A 4UFMA 2J74A 5DFAA 3WH5A 3ZQ9A 4HOWA 4RL3A 2ZUWA 1BAGA 1OIFA 3MO4A 1I1XA 3WD2A 5FCZA 5BCAA 2DT0A 1ZBKA 4M29A 3WKZA 4H7VA 3ARSA 2YBUA 5ABGA 3WBEA 1B3WA 2D22A 2DQXA 4F66A 2VCAA 1V02A 5A3HA 1J9YA 1E6NA 2EPOA 1PX3A 3L4YA 3VIIA 2BVTA 2XIIA 3L4WA 5A6LA 1HX0A 1H0GA 2ZUSA 1H5VA 4D6FA 3WEMA 3ZT5A 1F4AA 5JIPA 1JAEA 2D0HA 1NOWA 1KCLA 1XCXA 1BQCA 5HPOA 1JZ8A 4V2XA 4F8XA 2D24A 2XJ7A 4L4OA 1E6ZA 2XVNA 3CTTA 3W27A 1JYWA 1HJSA 3K8MA 1NM9A 1GOOA 4RE4A 2W5FA 1WE5A 1JF6A 1R85A 3OIHA 5CLTA 1HXJA 1G01A 3ARVA 2J62A 2EO7A 4GKLA 3WUEA 1J18A 2D0FA 4OZOA 5C70A 1X1NA 1NWTA 1PX8A 1UG6A 2XG9A 3AHYA 5BRQA 1XD0A 4FF5A 2EPNA 1F4HA 4W86A 3WH8A 1I1WA 1UD2A 4PRWA 1QOXA 2CBVA 2O92A 3RCNA 3FY1A 1FHDA 2CHNA 1ZS2A 2W67A 4JFUA 1V0KA 3MUZ1 2W66A 5IFTA 3WFLA 4RE3A 3BAIA 5M3WA 5M5DA 4HMCA 4PBGA 1CBGA 2GJXB 2G4FA 5GPRA 3RPMA 3KL5A 4UFIA 2Z1KA 1HNYA 3BLPX 2ZUTA 1CGYA 1SMDA 4V27A 3WH6A 4JCMA 2DT1A 3WY1A 5A8MA 4HOZA 3WELA 1S46A 1EO7A 2DSUA 2QV4A 1UR1A 1ITCA 2W4XA 2WBKA 3SCRA 2X1IA 4IISA 1VB9A 2WBGA 3WQ5A 1HIZA 1V6WA 3II1A 1PIGA 1MFUA 4ATWA 2FGZA 4S3JA 3GXMA 1J0ZA 2XHYA 1C90A 4FLRA 4S3KA 1ISYA 1TZ7A 3AMLA 3S2CA 1XSJA 5CGTA 2VCBA 4CD4A 4J3XA 3W26A 2X8RA 2W91A 1JZ2A 4C7DA 1E6RA 3SCQA 4UR9A 2CPUA 4JFSA 2FH8A 2F61A 3IANA 3VIMA 2VR4A 2RGLA 1CDGA 3MS8A 2G3JA 4JKKA 3VGEA 4U33A 1PBGA 1G94A 6A3HA 4JL1A 2QMKA 3ARZA 1H41A 2OSWA 1J10A 2DT2A 2VRKA 4OJYA 1H11A 1M03A 1FP9A 5EMYA 4BZYA 2D3NA 4M82A 2TAAA 5BXRA 4MDOA 1RP9A 1QI4A 3CUGA 4HZ8A 2EPMX 3ECQA 3ARWA 3O6AA 2ZX6A 3AIBA 3WEOA 3AS0A 4JFVA 4Z2GA 1P6WA 4E4PA 2VCCA 4UTFA 1Q6DA 2D23A 1UZ4A 3WF0A 4JIEA 4AWEA 3PZGA 3EDEA 1CGVA 1EXPA 4AZ7A 4MDPA 1Y7VA 3POHA 1ISWA 4A3HA 2FHFA 1W9VA 4YPJA 1WAWA 2GJXA 3VGFA 1XGZA 3A4AA 1UUQA 2WMHA 2CHOA 3PTKA 1W9UA 1QI3A 5BRPA 5CXPA 2VX4A 2O9OA 2Y2WA 5A8QA 4QLKA 3W24A 3WIJA 4MB1A 2E8YA 1MXDA 4PTVA 5HXMA 1QHOA 4TTGA 4PMXA 2WMJA 5CSUA 2DEPA 3THCA 1HJXA 1WKYA 1V3IA 2WC4A 1NP0A 5A6JA 4GO9A 5AY7A 1UKOA 4C7FA 2V38A 3LMYA 4GPNA 1MQRA 1KGWA 3ZJ6A 3OLDA 2GDUA 2VX7A 3U7VA 4BQ3A 1JXJA 3WUFA 3EYPA 2GFTA 1HL8A 4LXFA 1VEMA 3EMQA 1VBRA 3GNPA 2WCGA 5CG0A 3SCTA 2X0YA 1GOWA 3WF4A 4XUYA 4AZ5A 4AY1A 2YL9A 3VMOA 2BHYA 1FFQA 2GVYA 1KCKA 3CH9A 3FNDA 1E70M 1JDDA 4WSKA 4TUFA 3I3EA 3ALFA 4MADA 3IAQA 3VIOA 3EBVA 4HA4A 4FLSA 5GNXA 1KQYA 2ZXDA 3HMCA 4UQBA 1BYDA 3WQ6A 3BMVA 2A3HA 1VFUA 1ECEA 3AMCA 5A69A 1OINA 5AYIA 3ZJ8A 2DIJA 2VZOA 4H04A 2GK1B 4D6HA 5LA2A 4Z2IA 1BFNA 5I3DA 3IJ9A 1CLXA 1JL8A 1KFWA 1LF1A 1XYZA 2E0PA 3MMDA 4PEEA 3WMCA 1L8NA 2VJXA 2XVPA 1H0IA 3DHPA 2WKLA 3NSNA 2WZHA 3NJ3A 5A95A 4QP0A 5E6ZA 2DGAA 2OLHA 3WNNA 4MNLA 5DF0A 3OB8A 3AICA 3ZIZA 4HTYA 2Y8KA 3WD4A 2YLAA 1UHVA 3PZIA 5LYRA 2QPUA 1GJWA 3RM9A 2VRJA 3QHOA 5CPSA 2XWDA 3ZR6A 5E9AA 1KBBA 4P8XA 1JG9A 1MW2A 4ACZB 2YL5A 4B15A 1DWAM 1BSIA 3GBEA 4W8AA 1SR0A 3B8SA 3ZJKA 3BXWA 2WLYA 4HZ7A 3GNRA 1GOQA 4U3AA 1W3KA 3T2OA 1TA3B 3A4WA 4U31A 1NOUA 5CLWA 2XVLA 4DM1A 4AEFA 1V3HA 3CMGA 3NCOA 1A3HA 1QW8A 4W5ZA 1W9XA 2ZUMA 9CGTA 3GBDA 4F79A 2QF8A 5DO8A 3S6TA 1W3HA 2VL4A 4UCFA 2WK2A 1E4NA 2CCRA 1JZ7A 1XH1A 4M56A 4EK7A 1Q4NX 4BQ2A 1GQKA 2Y8VA 1KWKA 3VGDA 5DT7A 1US3A 3VMPA 1DWIM 2WXDM 4H8HA 4W8BA 1B3ZA 1BG4A 1UA3A 4LYRA 3TTOA 1LQ0A 3AIEA 2PWHA 1E4MM 4XZWA 4MAZA 4PMVA 3EDJA 3W6MA 4PUDA 2DDXA 1C8QA 2WVSA 5I0DA 1UD3A 1IZKA 3N15A 2VVSA 1C8XA 2WAGA 1JZ6A 4M81A 2XVKA 2BXZA 4MAVA 4X9YA 1R87A 3SCOA 1CXLA 4H41A 4QLLA 2XSBA 3TOPA 1E56A 2GK1A 3L2MA 4UQDA 4NRRA 1QI2A 2J7HA 3ARTA 4IUGA 1W3LA 1C8YA 3WD1A 3EDKA 4CD5A 1DWHM 5EB8A 1KGXA 3K1DA 4WF7A 3WDIA 3VMNA 1GONA 1LL7A 2EQDA 3AMDA 3UETA 1DTUA 3QGVA 3SCNA 3DYMA 4W5UA 2ZX7A 5BXPA 1WDSA 1E40A 2JEQA 2XYLA 1PPIA 4LQ1A 3K8LA 1V3JA 2YJQA 2OWWA 3WQ8A 3UESA 3GTNA 1EOMA 3VX1A 3VD3A 4ACZA 2BV9A 1B30A 1QI5A 3K4AA 4UFJA 3AMGA 1N82A 1YQ2A 3DC0A 3MUY1 5EFDA 2BY3A 2HISA 3MSDA 2QLYA 2WSPA 3WMBA 5LA1A 4PMUA 3T09A 2BY1A 1TA3A 2V5DA 1Z32X 1Q6CA 1BYAA 1HF6A 1QVBA 4JAWA 2V3EA 1LG2A 4C7GA 2QPSA 2ZIDA 5CGMA 1E6QM 5DMYA 3CZ8A 1BTCA 5DT5A 3WQ4A 1QNOA 4AW7A 4GZEA 3WF3A 5BXSA 1GUVA 1UWSA 4FK9A 2UY5A 5JIWA 1HKJA 1IV8A 4UOZA 4FLOA 2WHJA 2CBIA 4UFHA 3AHXA 2Y4SA 2DPEA 2X2YA 4NF7A 3RDKA 4PMDA 3VD9A 4PMYA 1W1TA 4U5IA 4Z2JA 1CWYA 5GNYA 1BLIA 4RE2A 3AQUA 2UWFA 1UKSA 1QHZA 1H1NA 4UFKA 1JI1A 1HVXA 2JE8A 1J0HA 2DH2A 3BSHA 4J3VA 1BYBA 3BC9A 4CN6A 5FOOA 1VFOA 5BYWA 2XWEA 3IJ7A 2PWFA 3WUGA 5HOSA 4AZIA 2VX5A 4AXNA 4MTVA 1NOFA 3MV11 2AOSA 2QHAA 2VR5A 4D6GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NDY A;  1H3G A;  2MAN A;  4QCE A;  1E4L A;  3WN6 A;  2E9B A;  2WZE A;  1W1V A;  4M8U A;  2YL6 A;  2Q8X A;  3CHC A;  3OGR A;  5BWF A;  3T2Q A;  1XD1 A;  4V28 A;  1CXH A;  3LPO A;  3OLE A;  1E72 M;  3CHF A;  2VT0 A;  3CUH A;  1HKK A;  3BMW A;  1K9T A;  1KR0 A;  2JFE X;  1WDQ A;  5FL0 A;  1BG9 A;  1PAM A;  2PI6 A;  4YN5 A;  8CGT A;  3B9A A;  4JKM A;  4AD1 A;  2V5C A;  3VU2 A;  1AQ0 A;  3TTQ A;  2WKG A;  3U7B A;  1CLV A;  1V0L A;  3UCQ A;  3K4D A;  4DWS D;  1V08 A;  1U2Y A;  1KR1 A;  2BS9 A;  1GQL A;  1HJV A;  1EOK A;  3WBA A;  4JKL A;  1KQZ A;  4AYS A;  4EAM A;  2C7F A;  2W92 A;  3RJX A;  4E2O A;  4IPL A;  2DSZ A;  2VVN A;  3WEN A;  4B9Y A;  3NDZ A;  4PSR A;  1NWR A;  7CGT A;  1LWJ A;  4KGJ A;  1JI2 A;  1J0I A;  2W63 A;  4U2Z A;  3ZT7 A;  5C8B B;  1G9H A;  2VMF A;  4HPG A;  1MVY A;  2C0H A;  1TFV A;  1ZBC A;  4AIE A;  4D6D A;  3WEZ A;  2FGL A;  4FLQ A;  1R7O A;  4PMQ A;  4KH2 A;  3AHT A;  2BHU A;  4JL2 A;  2J7E A;  2Z1S A;  3GXI A;  3MV0 1;  3OG2 A;  2O9R A;  3EDD A;  1V0N A;  2ZUV A;  4MNJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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