2XG9A

Crystal structure of barley beta-amylase complexed with 4-o-alpha-d- glucopyranosylmoranoline
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
VNVKGNYVQVYVMLPLDAVSVNNRFEKGDELRAQLRKLVEAGVDGVMVDVWWGLVEGKGPKAYDWSAYKQLFELVQKAGLKLQAIMSFHQCGGNVGDAVNIPIPQWVRDVGTRDPDIFYTDGHGTRNIEYLTLGVDNQPLFHGRSAVQMYADYMTSFRENMKEFLDAGVIVDIEVGLGPAGEMRYPSYPQSHGWSFPGIGEFICYDKYLQADFKAAAAAVGHPEWEFPNDVGQYNDTPERTQFFRDNGTYLSEKGRFFLAWYSNNLIKHGDRILDEANKVFLGYKVQLAIKISGIHWWYKVPSHAAELTAGYYNLHDRDGYRTIARMLKRHRASINFTCAEMRDSEQSSQAMSAPEELVQQVLSAGWREGLNVACENALPRYDPTAYNTILRNARPHGINQSGPPEHKLFGFTYLRLSNQLVEGQNYANFKTFVDRMHANLPRDPYVDPMAPLPRSGPEISIEMILQAAQPKLQPFPFQEHTDLPVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Chemical Genetics and Cereal Starch Metabolism: Structural Basis of the Non-Covalent and Covalent Inhibition of Barley Beta-Amylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-AMYLASE
molecule tags Hydrolase
total genus 191
structure length 487
sequence length 487
ec nomenclature ec 3.2.1.2: Beta-amylase.
pdb deposition date 2010-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01373 Glyco_hydro_14 Glycosyl hydrolase family 14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xg9A00
1W1YA 3PHAA 4D6IA 3ARWA 1WP6A 4B3LA 1BSIA 4PCSA 2JEPA 3U7VA 1UKQA 3AHZA 3WF2A 3II1A 1SMDA 5E9AA 2EJ1A 2PB1A 2GDUA 4UR9A 1WAWA 1KGXA 2RGLA 1EHAA 3VINA 2ZIDA 2OWXA 3HU7A 4W8LA 3TOPA 2D23A 1CXLA 1SMAA 3WDQA 5JBFA 1VBRA 3GTNA 3ZSSA 1JAEA 1AMYA 3K4DA 5IHRA 2BXYA 2F61A 2EPLX 2EO7A 4F8XA 3AHTA 3D5HA 1IZJA 1W3LA 5E6YA 2WKGA 1KQYA 1JZ3A 1UR9A 1DWHM 2HISA 2YA1A 2XVPA 3SCSA 4GKLA 1UD5A 2OLHA 4KRUA 1FHLA 4GZIA 4AMCA 4AD1A 5D4YA 1GHRA 3K8LA 1XC6A 4GZEA 1Q6FA 1JNEA 3W27A 1TA3A 1CXEA 3CUJA 1R7OA 1XD0A 3ARYA 1I1WA 2O9RA 1XYZA 2CETA 4V2XA 3U5YA 1M01A 3VIKA 4HMCA 2WC7A 4TX6A 4AY1A 2YKKA 3ZQ9A 4LX4A 2J7CA 2CKRA 1NWSA 1HJXA 1UD2A 3VIJA 1XH1A 2BY2A 1WDRA 1ZBKA 3LPFA 1G01A 1K9DA 1ZS2A 2VNCA 3DHPA 2MANA 3WNMA 3FN9A 1M7XA 4W88A 1EH9A 5I23A 2VR5A 3WNLA 1E1EA 1JDDA 4IPLA 3WH7A 4AIEA 1VEMA 3AIWA 3RCNA 3I3DA 5AYIA 1L0PA 1UQYA 3WNKA 5CSUA 1EQCA 3FAXA 5E0CA 4FMVA 2VCCA 3POCA 3K8MA 2J77A 4D6GA 3A6OA 1NM9A 4Z2KA 3AZRA 4R27A 4J3XA 1MW2A 3FY1A 1C8QA 1IT0A 1SR0A 4JKKA 1K9TA 2XHYA 4QCFA 3IANA 3RPMA 2BFGA 1H2JA 1VF8A 3VM7A 1E43A 3T0AA 4HA4A 4X9YA 3MMWA 1GHSA 4PTVA 3EDFA 2XVGA 2DT2A 4MJ4A 2EEXA 4JHOA 5I0DA 3AMGA 1UWTA 5BCAA 3LMYA 2G3NA 3O6AA 2YLAA 4D6EA 1ZL1A 2XVLA 3AISA 3AHXA 1BGGA 3MMDA 1E40A 1BTCA 3W53A 1OWQA 1HP4A 3D3AA 5DO8A 4QLLA 2WPGA 2F2HA 4GINA 1V08A 1AQ0A 2OWCA 3ZMRA 9CGTA 5JUVA 4Z2HA 4W7UA 3L2MA 3HN3A 3WUEA 1BVZA 2V3FA 3KEHA 1JFXA 3VIGA 1W9UA 2Z1SA 3AS2A 2WNWA 4EE9A 2PF0A 1PIFA 4M80A 1JD7A 2GJXA 1QNPA 1E55A 2CHOA 4UQDA 3WUFA 2FH6A 1V6YA 2G3JA 2O92A 5AC4A 1VJSA 3B9EA 5E6ZA 1CIUA 1RD6A 4S3KA 4ZXLA 3SURA 4F9JA 5BYWA 1GQKA 3A4AA 3IJ8A 3AIUA 2YL9A 4GQQA 1E0XA 4N42A 5AY7A 4U2ZA 4D1IA 1ISYA 1C92A 2OYLA 1NWTA 2D0FA 3WQVA 1DP0A 3OGVA 3N1AA 3QHOA 1B9ZA 2D1ZA 1J0HA 3T2OA 2XGIA 1HP5A 4XZBA 3RJYA 1PZ2A 3GM8A 1FH9A 1LL4A 3VU2A 4UQCA 3BAJA 1E3XA 1KXQA 3POHA 4J3UA 5ABHA 3BAIA 2V3DA 2YL5A 3WBEA 2DH3A 2Y4SA 3QHMA 4TUFA 3WD1A 2XSAA 2VOTA 3EMZA 1V3JA 2WZHA 5E09A 5A8NA 3NDZA 1TE1A 2GJRA 3QHNA 4UNIA 4XUYA 2VL4A 4TTUA 2G4FA 3OA5A 1GCYA 5A8PA 3IK2A 1NOFA 3ARRA 4HZ7A 2E0PA 4TVUA 5I24A 4LYPA 3QGVA 2UY4A 4QDMA 4UFIA 1Y7VA 3CH9A 3G6LA 2ZWYA 5DMYA 3WMCA 5I78A 1UR2A 1HN1A 3CZGA 3CLWA 1UD6A 2VZSA 3AIBA 1E6RA 3PZ9A 4PSRA 3U7BA 3WKZA 2CEQA 1E6PA 3QOMA 5CPTA 3PBGA 1H41A 4W7VA 3U57A 3MSDA 1B1YA 1ITCA 2XUCA 1B90A 4MJ2A 4U5IA 4CD6A 3T2QA 1BPLB 1JFHA 1CGVA 5LA1A 5A69A 1VIWA 4QLJA 2VX5A 4UFJA 4BF7A 2Y8VA 3BLPX 1QVBA 4JHZA 3N18A 5CGMA 4TTGA 2WVUA 2EQDA 1WDSA 4ATWA 2GJPA 1TUXA 1QHPA 4D6DA 1V6XA 3U5UA 4PSPA 4X0VA 1NWUA 2BHYA 4E8DA 4OBSA 2JIWA 4D71A 2DPEA 1Q6CA 4YHEA 3VMPA 3BAWA 4J28A 2FHCA 5IFTA 3A3HA 1UUQA 1E15A 1V3KA 4WK9A 4OKDA 4M56A 1QHZA 1PJ9A 2Y8KA 3I3BA 1K9FA 1JZ4A 2X09A 3N04A 1OSEA 4FLQA 1U33A 3SUUA 1JD9A 3AMKA 2VT0A 1PBGA 4NRRA 3SCPA 3TTQA 3WN6A 2VJXA 2CBJA 5ABEA 3ALFA 5GNYA 1O6IA 5I2UA 5F7UA 4U3CA 3AHYA 1EOMA 4UFMA 2DSZA 2XM1A 5E0FA 1EDQA 3MUZ1 3WFLA 1E6NA 1OIMA 1OT2A 4C7GA 5AC5A 5HBFA 2ZUTA 4EANA 3CIVA 2VVSA 4CCEA 3AZTA 1OINA 4LYQA 3W24A 3NDYA 4Z2GA 4E8CA 2D3NA 1EO5A 2WK2A 3WENA 3GNOA 1AQMA 3VMOA 1R7AA 3RM8A 1E3ZA 2YA2A 3VD4A 2VX4A 3OGRA 4B15A 4UZSA 3T09A 2W61A 1BAGA 1CLXA 4MNMA 2QHAA 3SEPA 1ZJBA 3EMQA 3M07A 3CZKA 4KWUA 2OSWA 3N15A 1MFVA 3BAYA 5A95A 2YBUA 1V0NA 1TG7A 1JYWA 2VZOA 4J3VA 3VILA 1J0KA 3MMUA 3BSHA 3HJEA 4Z2LA 1FOBA 2JF6A 3VIIA 2W5FA 4A3HA 1LWHA 1V3MA 1WDPA 4TVCA 5FOOA 2PI6A 2DQXA 5HNNA 2DT3A 3SUVA 1W9PA 2CIPA 1GQLA 1UD3A 4OZOA 1HT6A 2WM0A 3W28A 3CZ8A 3OLIA 1E6XM 1BYBA 3SUSA 5DFAA 1KXHA 3TTSA 2WBKA 4BQ3A 5A6LA 2WANA 5JIWA 4ZE4A 3CHEA 3UR7A 1EIBA 1IV8A 1JIBA 1HF6A 3S2CA 4IPNB 1QNSA 4RL3A 4PCTA 3THCA 1XCWA 2VZVA 2ZUMA 3TONA 1CEOA 3WD0A 5DT7A 5CGTA 3CZEA 1KBKA 4CUCA 5EMYA 4W93A 3SCNA 1LG2A 2VURA 2V38A 3I3EA 2CBUA 1PX8A 1E4MM 5CXPA 1GONA 4QAWA 3WL1A 1PZ3A 2WMFA 3GXFA 1W9VA 4AD3A 1KBBA 1WZMA 2YDQA 1KQZA 2YDSA 4UOJA 1KXTA 3VDCA 3AJ7A 1W9BM 4DWSC 5GPRA 5I79A 4GO9A 2O9TA 2W91A 1QHOA 3TTOA 5C71A 1LWJA 1HJQA 4ZENA 1J11A 1H0GA 2XJ7A 4HOXA 4URIA 1UKTA 1TCMA 2PBOA 5CLTA 4W87A 4OOUA 1B3VA 3VOCA 5A2BA 3GXMA 3PZGA 3VGGA 3WEMA 3OZOA 3BGAA 2DEPA 2YA0A 4TXEA 5A1AA 2WCSA 5DEZA 2VQUA 3BAXA 3UCQA 4W5ZA 4QLKA 1RP8A 4XZWA 4Z2JA 5JIPA 1CBGA 2ZXAA 2W4XA 2WSPA 2G8ZA 1BYDA 1S46A 1HVXA 2WCAA 3WDRA 4HA1A 1E4LA 1PEZA 4PMRA 3OZPA 4Q7NA 1JG9A 1Q6DA 1QNOA 2ZXDA 1UR1A 1DTUA 3N17A 2WVTA 2VC9A 4CU7A 3CHFA 2EPMX 1GVYA 3WL0A 3ZJ6A 1ZBVA 2IXUA 1GOWA 2YOCA 1VFUA 2UY2A 4CGTA 2WZEA 3GBEA 1EDGA 1W9XA 4DWSD 3WEZA 1XRVA 2WC4A 4PTMA 2WMGA 3MUY1 1GJWA 2W62A 2WSKA 1GPFA 3O9NA 1JZ2A 1UWSA 3NUKA 4PN2A 1QW9A 5I6SA 3S6TA 4Z2IA 4PMUA 4K68A 3AMCA 3IAQA 2E9BA 1BLIA 3CMJA 3SCUA 3GH5A 2WC3A 1WPCA 3WNOA 2G3MA 2VR4A 1J01A 1BYCA 1CXHA 1UWQA 2QLYA 2ZX8A 4RE3A 4UZUA 4GI9A 6CGTA 3AOFA 4MAVA 1KFWA 2C8NA 1VAHA 3T08A 4P8VA 2NW0A 1DEDA 5FD0A 1CTNA 2WWDA 2AOSA 2OWWA 2D22A 3G6MA 4LPCA 3W6MA 3UEQA 4OBRA 2A3HA 3AMDA 4MAZA 3B8SA 1BG4A 2DGAA 2EPNA 2Y2WA 2PBGA 1B31A 4ACZB 3AIRA 1JL8A 2RGMA 2GSJA 1FFRA 2GFTA 1WNOA 4AZBA 1BG9A 5IXEA 1TVPA 2VX6A 3AZSA 4Q22A 3IJ9A 2FDMA 1W3HA 2WLYA 3OG2A 1K6AA 4JKLA 5GQBA 1EA9C 1DWIM 2XFYA 3KL0A 5IDIA 4DWSB 1HKMA 3THDA 4JFWA 1W3KA 2BV9A 1VRXA 1JF6A 3RJXA 6A3HA 3AYSA 3UG4A 5C8BB 1LG1A 4CU8A 4HU8A 1UZ4A 2DIJA 2ZXBA 1MQRA 1WKYA 3RIKA 3CBWA 4D6FA 3RILA 3SCQA 2XPKA 3VO0A 5BXPA 1E0WA 4WKAA 2W63A 2BS9A 1H11A 3OLGA 3CGTA 3PZIA 1EHNA 1XGZA 1JI1A 1XCXA 1NWRA 3VIHA 5HDRA 1RP9A 2Z1KA 3VGEA 2WAGA 1V0KA 1I75A 3MSGA 2WWCA 2YDRA 1HIZA 4CVUA 2ZOXA 1H3GA 2XVKA 1JYNA 2VRQA 5A2CA 1C7SA 4WKFA 4H7VA 3WQ6A 3CUFA 1TMQA 4WJXA 4D6CA 2J8FA 4JZ5A 4BA0A 1H1NA 3MKKA 4AZCB 2WCGA 2ESCA 3VVGA 2ZICA 4X0NA 1EO7A 4M8UA 3WH9A 4B3KA 1OD0A 4KRTA 2D0HA 1I1XA 1QOXA 1MWOA 3ZT6A 4P7OA 1IZKA 1FHDA 4OIFA 1B3WA 2J4GA 2XM2A 5D9MA 2JIEA 4P8WA 1D7FA 3VD3A 4MPKA 3F5LA 2VI0A 3DHUA 4D6JA 1HJWA 1UWUA 4W8BA 3VD7A 4MB4A 4HTYA 3FXYA 1X1NA 2VQTA 4P7RA 2VUYA 1QNRA 3WDJA 4PYSA 1XH0A 3FNDA 3CPUA 5LA2A 1HNYA 3VIPA 1VFOA 3TP4A 4A4AA 4WF7A 2J25A 3PTMA 1QI0A 1Q6GA 3ARZA 4AYSA 5C70A 4QP0A 5JBEA 2EXOA 3J7HA 1SFSA 4PMZA 3UETA 1JYVA 1NP2A 2J62A 1W3JA 2UWFA 1PX4A 4HA3A 1OGBA 3FHQA 3ARTA 1UR4A 5DF0A 1GNXA 2A3BA 3NSMA 1D2KA 2WMKA 2FHFA 3VIOA 2WVSA 2AAAA 2C7FA 1WB0A 4B9ZA 1OBAA 1KB3A 2OYMA 2VTFA 1H0IA 2E9LA 1CENA 1DHKA 4MB5A 3L4XA 5FCZA 2QV4A 4NZCA 1P6WA 1RH9A 1LL7A 5CG0A 3NIYA 3VIMA 1KXVA 1JNDA 3SUTA 1KCLA 3AYRA 4W85A 3N12A 3NCOA 3VMNA 5CLWA 2CBVA 1C91A 3WUBA 4HOWA 3PZTA 4PUDA 4HU0A 5A8OA 3GXIA 4ATLA 4HP5A 4QFUA 3AIEA 4U2YA 1JAKA 1U30A 1AVAA 1V3LA 3ARUA 1W1PA 2WYSA 2DSUA 2ZE0A 1LL6A 1VFMA 3NJ3A 2YL8A 3OBAA 1C8XA 1ZBWA 3VGDA 3AS1A 1E4IA 1TFVA 3AS0A 4DM1A 5FIPA 1V6WA 4H2CA 4JCLA 1KWGA 1ODUA 3SCVA 5A6JA 1FA2A 4W5UA 2XIIA 4FLOA 2BVYA 2OSYA 3ARPA 4UOQA 4ZE5A 2CESA 4UTFA 3ZR6A 1X6NA 4CD4A 1NOWA 5DT5A 3OIHA 2Q8XA 4PTXA 3IAPA 2UY3A 1JXJA 2NT1A 2J7BA 4JIEA 5ABFB 4PMYA 4WKHA 2Y24A 1ZBCA 2D3LA 4NRSA 4PMXA 1CGUA 2X05A 1VJZA 3AICA 5EB8A 4B16A 3ZOAA 1C3FA 4D72A 1JI2A 4D1JA 2PWEA 1US2A 3VGFA 4LYRA 4XV0A 5TD4A 5CSYA 1MQQA 1C90A 3W37A 1TVNA 4V27A 3ALGA 2O9OA 4F66A 1WO2A 1R8LA 2FGLA 4MNLA 8CGTA 2WHJA 3FW6A 2QF8A 1OGGA 4IM4A 3BSGA 4OUEA 1MFUA 4OOZA 4U5KA 2GUYA 1FH8A 3SCOA 5A2AA 5D8ZA 1UH3A 1OB0A 4JFSA 3ARSA 3WDHA 1OIFA 1UH2A 2CERA 1R85A 1HVQA 3BLKA 5GNXA 5ABFA 1MW1A 1GOOA 1M04A 2XTKA 4P8UA 3MANA 2CYGA 1B0IA 3CUGA 3WF4A 4AD5A 3EBVA 4C7FA 4U31A 1CWYA 1GQJA 1PIGA 1WZLA 1A3HA 2V3GA 3E1F1 2IXVA 3L4ZA 1OT1A 4JFTA 1GORA 3N11A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W1Y A;  3PHA A;  4D6I A;  3ARW A;  1WP6 A;  4B3L A;  1BSI A;  4PCS A;  2JEP A;  3U7V A;  1UKQ A;  3AHZ A;  3WF2 A;  3II1 A;  1SMD A;  5E9A A;  2EJ1 A;  2PB1 A;  2GDU A;  4UR9 A;  1WAW A;  1KGX A;  2RGL A;  1EHA A;  3VIN A;  2ZID A;  2OWX A;  3HU7 A;  4W8L A;  3TOP A;  2D23 A;  1CXL A;  1SMA A;  3WDQ A;  5JBF A;  1VBR A;  3GTN A;  3ZSS A;  1JAE A;  1AMY A;  3K4D A;  5IHR A;  2BXY A;  2F61 A;  2EPL X;  2EO7 A;  4F8X A;  3AHT A;  3D5H A;  1IZJ A;  1W3L A;  5E6Y A;  2WKG A;  1KQY A;  1JZ3 A;  1UR9 A;  1DWH M;  2HIS A;  2YA1 A;  2XVP A;  3SCS A;  4GKL A;  1UD5 A;  2OLH A;  4KRU A;  1FHL A;  4GZI A;  4AMC A;  4AD1 A;  5D4Y A;  1GHR A;  3K8L A;  1XC6 A;  4GZE A;  1Q6F A;  1JNE A;  3W27 A;  1TA3 A;  1CXE A;  3CUJ A;  1R7O A;  1XD0 A;  3ARY A;  1I1W A;  2O9R A;  1XYZ A;  2CET A;  4V2X A;  3U5Y A;  1M01 A;  3VIK A;  4HMC A;  2WC7 A;  4TX6 A;  4AY1 A;  2YKK A;  3ZQ9 A;  4LX4 A;  2J7C A;  2CKR A;  1NWS A;  1HJX A;  1UD2 A;  3VIJ A;  1XH1 A;  2BY2 A;  1WDR A;  1ZBK A;  3LPF A;  1G01 A;  1K9D A;  1ZS2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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