2XHYA

Crystal structure of e.coli bgla
Total Genus 175
50100150200250300350400450050100150
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
476
structure length
470
Chain Sequence
KKLTLPKDFLWGGAVAAHQVEGGWNKGGKGPSICDVLTGGAHGVPREITKEVLPGKYYPNHEAVDFYGHYKEDIKLFAEMGFKCFRTSIAWTRIFPKGDEAQPNEEGLKFYDDMFDELLKYNIEPVITLSHFEMPLHLVQQYGSWTNRKVVDFFVRFAEVVFERYKHKVKYWMTFNEINNQRNWRAPLFGYCCSGVVYTEHENPEETMYQVLHHQFVASALAVKAARRINPEMKVGCMLAMVPLYPYSCNPDDVMFAQESMRERYVFTDVQLRGYYPSYVLNEWERRGFNIKMEDGDLDVLREGTCDYLGFSYYMTNAVKAEGGTFEGSVPNPYVKASDWGWQIDPVGLRYALCELYERYQRPLFIVENGFGAYDKVEEDGSINDDYRIDYLRAHIEEMKKAVTYDGVDLMGYTPWGCIDCVSFTTGQYSKRYGFIYVNKHDDGTGDMSRSRKKSFNWYKEVIASNGEKL
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Macro-to-Micro Structural Proteomics: Native Source Proteins for High-Throughput Crystallization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-GLUCOSIDASE BGLA
total genus 175
structure length 470
sequence length 476
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xhyA00
3K8KA 4AD3A 4H8VA 1JZ2A 2FDMA 4UNIA 1BYBA 4W85A 3W26A 3CMJA 4TVUA 1I1XA 3KEHA 4MNLA 4YHGA 3FAXA 4WKHA 1Z32X 2OYMA 1US2A 1PZ2A 1HF6A 2WLZA 3DYOA 4GI6A 4NSBA 1CXFA 2JEQA 2J7CA 4HOZA 3AIWA 2ZUTA 5CSYA 3GZAA 3GYCA 1GVYA 4OKDA 4W93A 2YKKA 5HBFA 2XVLA 2VI0A 1EIBA 1JL8A 1EXPA 3SCRA 4BQ4A 1WCGA 5CZKA 4JKMA 1ISXA 4P7QA 1PIFA 1W32A 3MSDA 3WEMA 4GZIA 1V0MA 4DUVA 3ARVA 1BFNA 3SCNA 3GBEA 1FFQA 2VZOA 3WSUA 1KBBA 4KGLA 3WF0A 4CU6A 4AZ7A 1GOWA 4F9JA 3BSHA 1Q6FA 1JYWA 4HTYA 2C7FA 2Q8XA 3CHCA 3O6AA 1QOXA 4C7DA 1E72M 1AQ0A 1H41A 2DSUA 2VL4A 5EFDA 1M03A 1W9UA 2J75A 3W29A 1VENA 1X6LA 3I3DA 1KGWA 2BVTA 1OD0A 3VKKA 3PN8A 5E0CA 3AIUA 1XGZA 4E8DA 4YHEA 5HDRA 3VVGA 1B2YA 3T0BA 1JF5A 1BQCA 3AZTA 2XVKA 2J7DA 3VNZA 4PMRA 2XFFA 1OIMA 1BGGA 2D2OA 3UCQA 1C90A 5A2BA 2PB1A 2Y8KA 2DT3A 5E0FA 4F8XA 3OIHA 2EQDA 2PF0A 1NOWA 4W5UA 2WVVA 1GORA 2J47A 5A6SA 1MW2A 3WIJA 1DWHM 4JHZA 2V5CA 3CZJA 4GZEA 5FD0A 3GH4A 1VJSA 1ECEA 4AZCB 1KBKA 3SCUA 4PCTA 4UCFA 1OD8A 3BXWA 2WLYA 3OZPA 2G8ZA 3BSGA 3WQ6A 1ZS2A 1EDTA 1TA3A 4Z2JA 4H04A 2XUCA 1EHAA 2X1IA 2VRJA 1D2KA 3LPOA 2WZIA 3OB8A 1GQLA 2O9OA 2WHLA 4CD8A 5DT7A 4S3KA 2OYLA 4LQ1A 4OBRA 3VDBA 5HXMA 4UR9A 1EQPA 2J7FA 3AOFA 1ESWA 4CCCA 1UKOA 5CJ5A 4J3VA 3RILA 3SCSA 5BYWA 1TFVA 1LLOA 2IXUA 3O9NA 1CXIA 3W4RA 4AZ6A 7TAAA 1JG9A 1MVYA 2PI6A 1J0JA 2CKRA 1XV8A 4D1IA 1GQIA 2VX6A 1OSEA 5BROA 1AQMA 1WKYA 4EK7A 3CZ8A 4X0VA 4U33A 1JNDA 1SMAA 2VO5A 1J12A 5CQ1A 3FW6A 1ISZA 3PZMA 2G3IA 4HMCA 4MPKA 4FLSA 2WCGA 2XTKA 3A4WA 3N17A 3WH8A 3CBWA 1HX0A 2YLLA 2PBOA 1JAEA 1GJUA 5D8ZA 1UHVA 3PHAA 1OM0A 1RPKA 3AIQA 4J3TA 3WFZA 3B9DA 4MB5A 3PZTA 2YA0A 2GK1A 2A3BA 2VURA 4WSKA 3K4DA 4EE9A 1WDPA 4HZ8A 1BYDA 1FH7A 1XD0A 2GJRA 3W6LA 1MQRA 2CHNA 2WMGA 1QHZA 2E0PA 2CBIA 4H41A 5BRPA 4DWSC 2XFYA 1D3CA 4JFUA 4JKLA 3SURA 5IXEA 4KWUA 3TTYA 2VQTA 2OWCA 1C3FA 1WZKA 1YQ2A 2Y5EA 4HU8A 2AAAA 4EANA 5AYBA 4E2OA 4AD2A 1J0IA 4QP0A 2A3AA 1MQPA 2WHJA 1V3JA 1QNOA 1TE1A 3LMYA 4QDMA 2WM0A 5JBFA 1VFMA 4XUYA 3ZT6A 3GXMA 8CGTA 5HPOA 5E6YA 5A8QA 5KZ6A 1UA3A 4PMVA 1XYZA 4XZBA 5FIPA 3WELA 3ZJ7A 2WZEA 4S3JA 3L4ZA 1X6NA 2DT0A 2Y24A 5M17A 1BYAA 4FLQA 5DEZA 2X05A 4PMNA 1K9EA 1ISVA 3CZEA 1GOOA 5D9MA 3U5YA 3AI0A 4UFLA 3EDFA 4MNKA 1HJXA 2ZUWA 3EMQA 1GQJA 2ZX9A 4D71A 3AXIA 4FK9A 3WNNA 1XHGA 3NIYA 1GZJA 3CUGA 3NUKA 3EDDA 1TA3B 5GNXA 3ZM8A 3BC9A 3SCOA 1WDSA 3VGFA 1E4IA 1QW8A 1UR4A 1LL7A 3AHVA 1G9HA 3AZRA 1V0LA 3W28A 1XH2A 5FKYA 3EMCA 2BHZA 4UQEA 3VIIA 1WPCA 1XSJA 1UUQA 1VF8A 3WF4A 2F2HA 3MUIA 1LWJA 3WEOA 4TOQA 1NARA 3E1F1 3ARPA 2J8FA 1GVIA 2DEPA 3ARXA 3VU2A 4PMQA 4MJ4A 3BMVA 3FN9A 4PUEA 1XSKA 3L4VA 1ZU8A 3GNPA 4CD6A 1H0GA 3SIMA 1J01A 3AMLA 5ECUA 4D72A 5I3DA 1E6NA 5A6MA 5LYRA 3ARRA 3SUWA 4W89A 3HU7A 1C93A 2BY0A 2JIEA 1GW1A 1LF1A 2GDVA 1I75A 2J74A 4DUXA 4X9YA 2YL5A 4D6JA 5LA1A 3EDEA 3VDHA 3UG5A 3OA5A 3NSNA 1TMQA 1BSIA 1B3YA 4HP5A 1JF6A 1WZAA 3U57A 3WH7A 4BQ2A 2VR4A 1M53A 5A8MA 2EPKX 4QCFA 3IJ7A 3NYDA 3QHNA 5C70A 1XH0A 1UH4A 3ZJ6A 4WLCA 4PTMA 4GI8A 4ZFMA 1BVNP 3APGA 4KMQA 4CCEA 2FGLA 2V3EA 1CGWA 4KH2A 4XZWA 5A95A 1G1YA 1KGXA 4P7LA 2D20A 5DO8A 5A8OA 2BVDA 1HKJA 1HKMA 3NDZA 1KQYA 2EJ1A 1GOKA 1UR8A 1ODUA 3A47A 2WVSA 1PX8A 1HNYA 3VD7A 1A47A 5AC4A 2V3FA 1KWGA 1VFOA 1R7AA 4AIEA 1EDGA 4UZUA 3KWXA 3VIMA 3W82A 4PCSA 1XH1A 1KR0A 4GQQA 3BLPX 1LL6A 1BVZA 1HT6A 1WE5A 4W84A 3VIPA 4U2YA 4AD0A 1NP0A 2JF6A 3CZKA 1HL8A 3VUPA 5FCZA 1BLIA 4M24A 4NI3A 4DM1A 3DHUA 4JAWA 4AZ5A 1ODZA 4LX4A 3PTMA 1ZBWA 1E1EA 5A8PA 1CGYA 2BY3A 1JD9A 1LJYA 1J18A 1UD6A 1OBAA 4PSPA 2VTFA 3T2QA 2VZVA 1VB9A 3N1AA 5E09A 4AZCA 1QBBA 3VMNA 5AC5A 1TZ7A 3U7VA 2WC7A 1NQ6A 4AZGA 2VZSA 2AMGA 5D9PA 4HMDA 3EBVA 1V3HA 3UR8A 1V08A 3D3AA 4GPNA 1UD4A 1V6XA 4U3CA 3W38A 2D24A 4JL2A 3ZMRA 1C7TA 1NWSA 5ABFB 2YJQA 2YA1A 3MKKA 3TTQA 4XV0A 4Z2IA 1MWOA 2J25A 1W2VA 4W8BA 2YL8A 1E3ZA 2BV9A 3OZOA 2OLHA 4J28A 5LA2A 2D23A 4D1JA 2DDXA 1V6WA 2E40A 2VUYA 4J3WA 5DFAA 4PMYA 3N13A 4PMZA 2VQUA 2XM2A 2YBTA 2D3NA 1JIBA 3T2PA 6TAAA 2PBGA 3W25A 5I2UA 2WYSA 2E8ZA 4DM2A 4W8AA 5A6JA 3BMWA 5I79A 2ZWYA 3MS8A 1BTCA 3BAIA 1CDGA 1Q6GA 4JZ5A 3W6MA 3RM9A 4U2ZA 1BYCA 4MADA 1UH2A 4J3SA 1C8YA 1NWRA 1QNRA 4QFUA 4Z2LA 3AYSA 5D9NA 4UZSA 3VILA 2XG9A 1UKTA 2UY2A 1TCMA 1WNOA 1BGAA 4LXFA 2FH8A 3MUZ1 5E9AA 2F61A 3K46A 1VFFA 1NOFA 3VGGA 4JIEA 1MW3A 4ZEPA 1CNVA 3RM4A 4CGTA 3KL5A 4DWSB 1HXJA 5I0DA 3CO4A 2BS9A 3BH4A 2ZUVA 4ZENA 4FLRA 3TOPA 1QVBA 4PMUA 4M1RA 2FHFA 3KZSA 2WSPA 1AMYA 2WCAA 5CGTA 3ZO9A 2NW0A 1DWFM 2BXYA 3WBEA 3BGAA 4P7OA 4MNJA 2PC8A 2CBJA 2QMJA 2WMIB 1KR1A 4B15A 3POCA 1NH6A 1E9LA 1BHGA 1E73M 3MMDA 3SEPA 1P6WA 1E6RA 5JUVA 1D7FA 1EGZA 1V3IA 3JUGA 3UG4A 3VGBA 1JDDA 3L2MA 2DQXA 1AVAA 3B8SA 1MFUA 3WENA 4BCEA 1MYRA 2YOCA 2WW5A 1HIZA 3U7BA 3AIBA 4HOXA 2VRKA 5A6BA 2VZTA 2X09A 4GKLA 4QCEA 5D4YA 3W0KA 2XGIA 3MMUA 4TTUA 3WDJA 5IHSA 3ARSA 3A6OA 1VBUA 3K8MA 1V3LA 1HVQA 1UWRA 3F5KA 5CPSA 1RP8A 1ISWA 1W2PA 1DWGM 2MANA 4A3HA 1QBAA 1K6AA 4L4OA 2G3NA 1OGSA 4B3KA 1W3HA 3AMKA 3WF3A 1GJWA 3ZOAA 4NZCA 3OGRA 3IANA 2ZX6A 3WEZA 1WO2A 4P8UA 3VGEA 4ZXLA 2BY2A 1W91A 5F7UA 2VJXA 2EXOA 3VIHA 2UY4A 4JCLA 1OB0A 1RP9A 4H7VA 1XCWA 2XYLA 4Q22A 3IJ8A 2NSXA 4HA4A 4A4AA 5C8BB 1JI2A 1QI3A 2V3DA 4OBSA 2WANA 3T0DA 3D5HA 1C91A 1W3JA 4MNMA 4YPJA 5GNYA 3GNRA 2E4TA 2DSWA 3SCWA 4LPCA 4MDPA 1OGGA 3LPGA 3WNKA 4M56A 5HPCA 3SUUA 8A3HA 3BAKA 3F5LA 1E15A 1JFHA 6A3HA 2WHKA 1PPIA 2WSKA 1CXKA 1N82A 1B3VA 2FGZA 2WK2A 3VINA 1PBGA 1XCXA 1JAKA 4CU8A 3FNDA 4UFHA 4BF7A 1CGXA 1G0CA 3S6TA 1JYXA 1VEMA 3WDPP 5IFPA 4PMXA 1LG1A 3ZT7A 2WZHA 1TUXA 3RMEA 1FOBA 5I78A 1VFUA 1FH9A 1OT1A 4TXEA 2VX4A 3UR7A 1B30A 4B16A 2FH6A 2AOSA 1NM9A 2C0HA 7A3HA 2WKLA 3WD3A 3QOMA 4GO8A 4C7GA 4PEEA 1DHKA 3VD9A 3QGVA 5C71A 2WBKA 2F8QA 4U5IA 2ZUUA 4MB1A 3UG3A 4Z2KA 2J78A 2XPKA 1HJWA 1H0IA 2D0GA 4PUDA 3SUSA 4AZBA 3B9AA 4TVDA 3AS2A 1E55A 3QOKA 4JHOA 3CHFA 1EO7A 1VIWA 1F4AA 1E5NA 1NWUA 3AMGA 3WF2A 2W5FA 1CXLA 4R5EA 3BAXA 4GI9A 2J79A 2EEXA 2ZXQA 4FLOA 1CGTA 3DYMA 1H5VA 2ZICA 3PZNA 2BY1A 1J10A 4CUCA 5CPTA 3UESA 4E4PA 1WDQA 3RM8A 5ABHA 1HL9A 3TP4A 4JCMA 4P7RA 5JBDA 3M07A 2OWXA 2WBGA 1UOKA 1IZJA 4OOZA 4ATWA 1M01A 4PYSA 3AROA 1WZLA 4Z2HA 2Y4SA 2ZUSA 3AMCA 3PBGA 4UQCA 1IT0A 3N18A 5CG0A 4IPNB 1GOQA 4X0NA 1YHTA 1JZ3A 3KL0A 3G6MA 1W3LA 1U33A 3M6DA 1B90A 1QI0A 3NCOA 3VPLA 1VJZA 1OWQA 1J11A 3AISA 4TVCA 2ZXBA 1V02A 4GQRA 4ATLA 1CPUA 1K9DA 2DPEA 4W7VA 1QW9A 1FFRA 1BG4A 3WKZA 4PSRA 5FL1A 4PTXA 1WP6A 4D6FA 1W9PA 4JFVA 5I5RA 4ATDA 1GHRA 3MANA 3QHMA 4JFTA 4AIOA 3PZIA 3WD2A 5ABFA 4W87A 1LL4A 3IK2A 4H8HA 2WMKA 1Q6CA 1NOUA 4UFMA 2X8RA 1HN1A 1B0IA 2HISA 4B3LA 4IM4A 3WMSA 3AS0A 1S46A 2W4XA 3S2CA 3WL1A 2BHYA 1E6PA 1UWQA 3LPFA 1QPKA 1BF2A 3TTSA 2E9LA 5EMYA 2G41A 4CN6A 2BHUA 3BAWA 1NP2A 2E3ZA 5DT5A 3WQ5A 1DWAM 2XJ7A 5M5DA 1E71M 1AQHA 4J27A 3FHAA 3PZVA 1XC6A 4P8XA 3CUFA 5HNNA 4TUFA 2D0FA 3OLDA 2FHCA 5EBAA 4JL1A 4FF5A 1XD1A 2YL6A 4PMDA 5A6AA 5I6SA 5LA0A 3ARQA 1XSIA 1HKKA 4UQDA 4AD5A 4GXPA 3MV11 1HVXA 4ZE5A 2IUZA 1FP9A 5JBEA 3M46A 2EBNA 2UY5A 3AJ7A 4MJ2A 1QNQA 5CLWA 2CIPA 1V6YA 3NDYA 2JIWA 1GOMA 1SMDA 4C7FA 3WUBA 2WC4A 4CCDA 1E5JA 3K1DA 2RGMA 4AMCA 4DWSA 4QLLA 3WDQA 4AIUA 4URIA 4MDOA 4HOWA 3BAYA 2O92A 2GUYA 5CGMA 2WVTA 3VIFA 1OT2A 2V3GA 4GIAA 2J62A 1KQZA 2Z1SA 1OGBA 4Y7EA 4TX8A 3THDA 3KE0A 4J3XA 2BVYA 3QR3A 3WD1A 5A1AA 1JZ5A 2QPSA 3CHEA 3BCDA 2DT2A 3VTRA 1PAMA 2W62A 3ARYA 4V27A 2ESCA 2XVGA 2YA2A 3TONA 2WMIA 3GXIA 1UQZA 2W63A 3L4WA 2CEQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K8K A;  4AD3 A;  4H8V A;  1JZ2 A;  2FDM A;  4UNI A;  1BYB A;  4W85 A;  3W26 A;  3CMJ A;  4TVU A;  1I1X A;  3KEH A;  4MNL A;  4YHG A;  3FAX A;  4WKH A;  1Z32 X;  2OYM A;  1US2 A;  1PZ2 A;  1HF6 A;  2WLZ A;  3DYO A;  4GI6 A;  4NSB A;  1CXF A;  2JEQ A;  2J7C A;  4HOZ A;  3AIW A;  2ZUT A;  5CSY A;  3GZA A;  3GYC A;  1GVY A;  4OKD A;  4W93 A;  2YKK A;  5HBF A;  2XVL A;  2VI0 A;  1EIB A;  1JL8 A;  1EXP A;  3SCR A;  4BQ4 A;  1WCG A;  5CZK A;  4JKM A;  1ISX A;  4P7Q A;  1PIF A;  1W32 A;  3MSD A;  3WEM A;  4GZI A;  1V0M A;  4DUV A;  3ARV A;  1BFN A;  3SCN A;  3GBE A;  1FFQ A;  2VZO A;  3WSU A;  1KBB A;  4KGL A;  3WF0 A;  4CU6 A;  4AZ7 A;  1GOW A;  4F9J A;  3BSH A;  1Q6F A;  1JYW A;  4HTY A;  2C7F A;  2Q8X A;  3CHC A;  3O6A A;  1QOX A;  4C7D A;  1E72 M;  1AQ0 A;  1H41 A;  2DSU A;  2VL4 A;  5EFD A;  1M03 A;  1W9U A;  2J75 A;  3W29 A;  1VEN A;  1X6L A;  3I3D A;  1KGW A;  2BVT A;  1OD0 A;  3VKK A;  3PN8 A;  5E0C A;  3AIU A;  1XGZ A;  4E8D A;  4YHE A;  5HDR A;  3VVG A;  1B2Y A;  3T0B A;  1JF5 A;  1BQC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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