2XVPA

Chia1 from aspergillus fumigatus, apostructure
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
FSNLAIYWGQGPNQLRLSHFCQETSLDIINIGFINYFPDMSPGHWPGSNFGNQCDGSVYVTNDGVVTKLLSGCHQIMEDIPICQAAGKKVLLSIGGAYPPDQSILSEDSAVAFATFLWGAFGPVAEGWEGPRPFGDVVVDGFDFDIEHNGGFGYATMVNTFRQYFNQVPERKFYLSAAPQCIIPDAQLSDAIFNAAFDFIWIQYYNTAACSAKSFIDTSLGTFNFDAWVTVLKASASKDAKLYVGLPASETAANQGYYLTPDEVESLVSTYMDRYPDTFGGIMLWEATASENNQIDGAPYADHMKDILLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Natural Product-Guided Discovery of a Fungal Chitinase Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CLASS III CHITINASE CHIA1
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 99
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xvpA00
1JYWA 2DDXA 2DEPA 3N9KA 1W2PA 5I79A 3QGVA 3WEMA 1W9VA 4CU6A 2BY3A 1J11A 1EGZA 3QR3A 3AMLA 3S2CA 1VJSA 4ATWA 1CXEA 1P6WA 3AHXA 4BQ5A 4C7FA 2BS9A 3MMDA 1MQQA 3MUAA 4MDOA 4AZCA 4JHZA 1JYXA 4ZXOA 5CGTA 1NWRA 3ZJ6A 3GYCA 1OBAA 3CUJA 4AW7A 4UZSA 1B3VA 2D22A 2J62A 1H3GA 2ZX9A 2D24A 3WQ6A 4P8VA 2VTFA 2VZVA 5A3HA 2G3JA 2J79A 1B90A 3E1F1 3WENA 3CMGA 3IAPA 3T08A 3GNPA 1OIFA 1BGAA 1ECEA 2VZUA 2C8NA 2YLAA 3QOMA 3CUHA 2JALA 3SCTA 3ZQ9A 3SCOA 1OINA 1NP2A 4BCEA 3WDHA 3N11A 1BAGA 3AXIA 3AIRA 1EDGA 2WZIA 4GZJA 2OLHA 3SCQA 1B3WA 1EHNA 5D9MA 4DWSB 1WZMA 2G41A 1VFMA 2J74A 4EK7A 3W28A 1XGZA 3WQWA 3MUIA 3EDFA 3BH4A 3RM8A 1JZ6A 4GZIA 5KZ6A 1K9DA 3TONA 5CPSA 3L4ZA 2WVTA 2XIBA 3ALGA 4WSJA 4PUEA 1J0IA 2VR4A 1EHAA 3VM5A 3CUGA 3UR8A 1TA3B 1V0MA 4E8CA 1NWTA 4CU8A 2WWCA 5I77A 4J7RA 3WQ5A 3W53A 3L4YA 5BXRA 1RP8A 1D2KA 2WNWA 4URIA 1KXTA 5AYBA 3BAIA 4AIUA 1C92A 1E0VA 4EANA 3L4WA 5GNXA 1E4NA 1CGYA 1OSEA 4RE2A 1VAHA 3GNOA 1NOWA 2VQUA 3W25A 3OGVA 3RPMA 1TG7A 4L4OA 4UQ9A 4W86A 2WLZA 3VD3A 1J12A 5IHSA 3EMQA 1XH0A 2TAAA 4W5ZA 4MB1A 2EJ1A 4PBGA 1R7OA 2VO5A 5D9OA 5FCZA 1JF6A 2BVDA 3IJ9A 1QNSA 3AYSA 1D3CA 3AHTA 4PMNA 2OYKA 1FFRA 2WMKA 3U7VA 1LQ0A 5I5RA 1UH4A 4BQ3A 2CEQA 2V3EA 1PPIA 1J01A 4J3XA 4P8XA 3VIOA 3M07A 1Q6GA 4H8HA 3AHZA 4UR9A 3WF3A 1WZLA 1BYDA 3MMWA 5BRQA 1GVYA 4MAVA 4QLJA 3ZT7A 3EMZA 4BA0A 3VX0A 2WMIA 1H0GA 4CUCA 3WF4A 1V0NA 2NSXA 2JIWA 3DC0A 2CNCA 5JBEA 3AIQA 2WHMA 2HISA 1E55A 4NI3A 3J7HA 1BG9A 2ZE0A 1XH2A 1AQMA 1JD7A 1PIFA 1HKIA 1VFUA 2GFTA 3IK2A 4HOWA 3LPPA 3POCA 1QPKA 1FH9A 2ZX5A 1UD2A 5A69A 1KGXA 2X0YA 3ARXA 1XRVA 4V27A 2PBOA 4AC1X 3GNRA 3WDJA 3CMJA 4TVDA 3FN9A 2YDSA 4L4PA 1XD0A 1FP9A 1YHTA 3WH8A 2JF7A 4GIAA 3GXDA 1EO5A 4Z2LA 3AFBA 1MXGA 4DUXA 4LQ1A 4HZ6A 3SCUA 4S3JA 1JAKA 3WH6A 3T2QA 4XUYA 2WVVA 1WP6A 1WZKA 2GJPA 2ZX7A 1E6NA 3VPLA 3FNDA 1MFVA 3N13A 4BQ2A 3UERA 1CLXA 4Q7NA 4GQRA 1DWIM 5ABFA 2E9BA 3BGAA 3CO4A 4W8LA 2VL4A 1MYRA 4HPGA 3SUTA 4R5EA 1UKQA 1Y7VA 5A2CA 4OBRA 1C8YA 1BTCA 4CD8A 2GVYA 1JZ4A 4D6GA 2D0FA 1K9TA 2ESCA 3QHMA 3PTQA 2VVNA 2FGZA 2WC4A 3UG5A 4HA4A 4HMCA 1E43A 1WCGA 4C7GA 1F4AA 3RILA 2WC7A 3UEQA 1J18A 1H0IA 4AD4A 3DYMA 1C93A 2EPNA 3KZSA 4ZE4A 4PMDA 3WUEA 4LYRA 2O92A 2FDMA 5A6KA 3ZSTA 3APGA 4F9DA 1V6XA 5CPTA 2CKSA 3RCNA 4M29A 3WNNA 1ZBVA 2XUCA 1NH6A 4EKJA 1J0HA 2ZUNA 4UCFA 4UFHA 1UWSA 4J3UA 5M5DA 1GVIA 1QNOA 1GHSA 1E6ZA 3VDCA 1BYBA 4AZBA 1B3XA 3K8MA 2JE8A 3THDA 4KWUA 2OSWA 1RD6A 4W89A 4MAZA 5A94A 1W3LA 4JL1A 1I1WA 4PCTA 4W7VA 2VQTA 1HN1A 2NT1A 1V3IA 4MJ2A 5HDRA 2EBNA 4ZXLA 4OBSA 4CCEA 5BCAA 1W9UA 7CGTA 4NRSA 3ARZA 1CGWA 4UFIA 1WAWA 4W88A 1KWGA 1N82A 2VT0A 2WWDA 1ZU8A 2VRKA 5A6BA 5F7UA 2VUYA 1D7FA 3U5YA 3CBWA 2QPUA 3BAJA 4HU0A 3WMSA 4AZ5A 2OWCA 4JKLA 4XV0A 3OLEA 1HF6A 2PWFA 2WZHA 3BSGA 1KWKA 1NWUA 3ARPA 3WH5A 1ISVA 3MANA 4CVUA 3GM8A 3MV11 2J78A 1SMAA 3N12A 4AMCA 2ZUWA 3KEHA 3CHCA 1DWGM 3D5HA 4AD2A 2W67A 1PIGA 1U2YA 1UR9A 2PWEA 3N18A 5A95A 4UOZA 3WBEA 2BY1A 1ZS2A 1NARA 1KQZA 3LPFA 3AISA 1AQ0A 5AY7A 4U31A 2YKKA 4JCMA 1FH8A 1UKOA 1GNXA 4KGLA 4QFUA 2YL6A 2E8ZA 3WUFA 4AD0A 5I0DA 3ZOAA 3DYOA 3AMKA 5KEZA 4W8AA 4AD1A 3SUVA 5CZKA 1HX0A 4F66A 1UR2A 3BC9A 2WANA 3WF2A 1SFSA 3OZPA 3HJEA 2XIIA 5D4YA 3VDHA 4ZEPA 1XC6A 2J77A 3WQVA 4FLRA 3WD2A 3VD5A 3IANA 5A1AA 3GXMA 4GKLA 5M17A 3PZGA 1GOQA 2V3DA 1EXPA 4ACZB 1GCYA 4XX6A 2DSZA 4PTMA 2W63A 3W6LA 3OLGA 5D8ZA 1JZ7A 4D6JA 4D6HA 1MW2A 3D3AA 1A3HA 5E0FA 4JHOA 2BXZA 2PC8A 4UFKA 1IZKA 1E40A 3GH7A 3SCVA 4CD6A 3CTTA 1AMYA 1TMQA 1EOMA 6TAAA 1VEMA 3EDJA 3AS2A 3ZJKA 2X1IA 3MKKA 2EPLX 2VR5A 2ZUTA 4P7QA 2E40A 3NSMA 3LMYA 5C70A 1JZ8A 3PZNA 5C8BB 3N17A 5A6JA 2V5DA 2WM0A 4OKDA 4W8BA 3WQ4A 2VX5A 1ZL1A 1E6RA 3GTNA 4CN6A 2DGAA 3OGSA 3VDBA 4E8DA 2YJQA 2WMGA 5CJ5A 3ZIZA 2ZX6A 2Y4SA 1EQCA 2YOCA 3EMCA 5ABEA 2FH8A 4J28A 3GZAA 2YLLA 2ZXAA 3WELA 4AEEA 3BCDA 2JIEA 5GPRA 1TFVA 2W5FA 2D3NA 3RIKA 1LWJA 2XVLA 4AZGA 3VILA 1J0YA 1CNVA 3WBAA 4IPNB 2J7FA 4PTXA 1E3ZA 2UY4A 2UY3A 3CZEA 1J0KA 4AZ6A 4W87A 5DF0A 3MSGA 3EBVA 1EIBA 2WBGA 4HOXA 2CESA 4B9ZA 2D0HA 1H11A 5IDIA 3OG2A 2WMHA 3SCNA 4PMQA 3NUKA 1Z32X 4UZUA 1XSIA 2QMKA 2VCAA 4GPNA 3ARWA 1W91A 4M8UA 3K8KA 3CZGA 1H1NA 1V0LA 2YA2A 4J3SA 3O9NA 5A6SA 1DWJM 3TA9A 3WF1A 1PZ3A 1OT2A 1XH1A 2PBGA 4PN2A 5JIWA 5A8OA 2CHNA 4PUDA 1OT1A 5TD4A 1KXVA 1DHKA 3BSHA 4JIEA 4PTVA 2Y2WA 1K9FA 4V28A 1W3JA 1FHDA 2O9OA 3WUGA 1DWHM 3I3EA 4AD5A 3AROA 5A8MA 1ITCA 3TTYA 1V6WA 3WN6A 1TVPA 1CEOA 1WKYA 3CHEA 1UWRA 2DT2A 2GK1A 3EDDA 5DO8A 3W24A 2BFGA 3WQ8A 4HU8A 3F5JA 1V3MA 1M7XA 2A3EA 4CU7A 5A8QA 2WCSA 1OB0A 1E1EA 1KGUA 3U57A 1MQPA 4HZ7A 4WKFA 2BNJA 3WD3A 4AIEA 1E15A 4FLOA 2X05A 2DQXA 2VVSA 2JEPA 3FHQA 5CPQA 3WMCA 4J27A 1LWHA 4U3AA 2E3ZA 1JGIA 4GXPA 3ALFA 3O6AA 1V02A 1CGXA 4UQDA 3BCFA 1EOKA 3FAXA 1IZJA 1O6IA 4YN5A 4TVCA 1CXHA 1VF8A 1UA7A 1KB3A 2EPKX 4AISA 1LL7A 1ZBKA 2VI0A 1C91A 4CD7A 2ZWZA 3AIBA 1BVNP 1PX3A 2OYMA 1VEPA 4PMOA 4W7WA 2VX4A 3MUZ1 3VMNA 2GJRA 1MW0A 3TTQA 3VIJA 3W82A 4OUEA 3WNPA 5CGMA 1NOUA 2G4FA 4PYSA 1ZB5A 3W6MA 1UWUA 5CSUA 3F4VA 1TUXA 5A6BD 3NSNA 4H8VA 1QI3A 1F4HA 3AQUA 5HPCA 4P7OA 3WFLA 1CPUA 2AOSA 4CN4A 4UQBA 5AYIA 2Y8KA 4CD4A 4P7RA 4B3KA 1Q4NX 2GJXB 5E0CA 1HKJA 1ODUA 2J7CA 2WXDM 4ATDA 4EE9A 3AZTA 1JYVA 2X09A 2WHLA 4WF7A 2OWWA 3ARVA 1HJSA 4WKAA 2WBKA 4JCLA 2W92A 4U5IA 4AZHA 2Z1KA 3U7BA 4U2ZA 5LYRA 1V6UA 3WD1A 4MADA 5ECUA 3ZO9A 1TVNA 1BYCA 4UQEA 4LPCA 4MNJA 1B31A 3CHFA 1QHPA 1FP8A 3I3BA 4E4PA 4AXNA 1G1YA 1W9PA 3VIGA 2BY0A 1GQLA 3AS3A 1E3XA 1GPFA 1WPCA 3QHNA 1NP0A 4ATLA 3PHAA 1CECA 6A3HA 4HZ8A 4JFTA 4CKQA 2FHCA 4QLLA 3ZM8A 3ZJ7A 3DHUA 1US3A 2WB5A 1GQIA 1W2VA 2BVTA 7TAAA 4UQCA 2XFYA 1KXHA 2XM2A 2X0HA 3WFZA 1LL4A 2DSWA 4AIOA 5M03A 1E1FA 1DWFM 1LLOA 1JDDA 2XYLA 3GBDA 1O7AA 1E6QM 2CHOA 3NDYA 1ITXA 5GNYA 2E9MA 1HJVA 1GJWA 4WJXA 1C90A 3UR7A 3WKZA 4W5UA 2V38A 4C7DA 1LL6A 4KGJA 3MSDA 3VM7A 1MFUA 2ZIDA 2UWFA 2CCRA 4V2XA 3ZMRA 1GOWA 2YL8A 5A2AA 1HP5A 4HA1A 4M24A 5EB8A 4B9YA 2WW5A 2DH3A 2DIJA 3AZSA 2CPUA 1CDGA 1LG2A 2E9LA 1CIUA 1CBGA 3SUSA 2CITA 4A3HA 4CGTA 5EMYA 3BLPX 1U30A 3PZ9A 1JZ2A 4HOZA 3OLIA 5FL1A 1DTUA 3HN3A 3BMVA 1MWOA 3N04A 5E70A 3CPUA 4RE3A 2CBVA 1E4IA 3FW6A 5LA0A 4W84A 4WKHA 1M03A 2Y8VA 5E6ZA 2DH2A 2W66A 2D20A 2A3BA 1W9BM 3ARUA 1I1XA 2JF6A 1CYGA 3MV01 3OB8A 3VO0A 2NT0A 2OSYA 2YBUA 3VTRA 1V03A 2DSKA 1GUVA 3THCA 2EEXA 3EDEA 2ZUMA 1K9EA 3WSUA 1XD1A 3BAWA 3VIPA 3KWXA 3RM4A 4W93A 1QNQA 1XSKA 2VZTA 1KGWA 3SCRA 3SUUA 9CGTA 4IPLA 2ZWYA 3GBEA 3ZSSA 1XV8A 2FGLA 1GOMA 2YIHA 3A6OA 3SCPA 1QHZA 1CXLA 5IXEA 3W26A 5I6SA 1KXQA 4KMQA 5A6MA 2F2HA 3L4UA 4AZCB 1OGGA 1WB0A 3FHAA 5HXMA 4KRUA 4DWSC 1C3FA 2VCBA 1GHRA 3KL0A 3QOKA 3OBAA 4TVUA 1UQYA 1PX8A 1ISXA 1PAMA 2Q8XA 4Q22A 1K6AA 1S46A 1UUQA 1BLIA 3ARSA 4TUFA 4RE4A 1Q6FA 2ZXQA 3RJYA 1J0JA 5FOOA 3SURA 3AHVA 2QHAA 3SEPA 4U33A 3VMOA 2VC9A 1VENA 1CLVA 1JFXA 1KBKA 3CH9A 7A3HA 4F8XA 3DHPA 2EQDA 1I75A 5JUVA 4DWSA 3AI0A 3OGRA 4H41A 1CXIA 2BXYA 1JNEA 3WDPP 1JDAA 2QLYA 2YDRA 3ARQA 3VX1A 1E5JA 8CGTA 4H7VA 2ZUUA 3WUBA 4HP5A 5CLWA 1H09A 4MB3A 2IUZA 1TA3A 4P7LA 1V3JA 3TP4A 4Z2HA 3W81A 3A4XA 3AHYA 1NWSA 4CD5A 4AZIA 1UD3A 5BRPA 4YHEA 3RDKA 3UESA 2PI6A 2DT1A 3M6DA 1C7TA 3F5LA 1NM9A 3L4TA 3CHDA 3WEOA 2J47A 1BYAA 1UWTA 3VU2A 2AMGA 1V08A 1TCMA 2ZUVA 1JAEA 3VIHA 3PZOA 4P7NA 1QVBA 2WCAA 4MNKA 2DSVA 1E6SM 1WDQA 1W32A 4QLKA 4NRRA 1H49A 4HPHA 2XWDA 3A4WA 1OGSA 1QBAA 4QDMA 4LX4A 3W4RA 3II1A 5FIPA 3OLDA 2WSPA 4ZE5A 3WH7A 4CCDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JYW A;  2DDX A;  2DEP A;  3N9K A;  1W2P A;  5I79 A;  3QGV A;  3WEM A;  1W9V A;  4CU6 A;  2BY3 A;  1J11 A;  1EGZ A;  3QR3 A;  3AML A;  3S2C A;  1VJS A;  4ATW A;  1CXE A;  1P6W A;  3AHX A;  4BQ5 A;  4C7F A;  2BS9 A;  3MMD A;  1MQQ A;  3MUA A;  4MDO A;  4AZC A;  4JHZ A;  1JYX A;  4ZXO A;  5CGT A;  1NWR A;  3ZJ6 A;  3GYC A;  1OBA A;  3CUJ A;  4AW7 A;  4UZS A;  1B3V A;  2D22 A;  2J62 A;  1H3G A;  2ZX9 A;  2D24 A;  3WQ6 A;  4P8V A;  2VTF A;  2VZV A;  5A3H A;  2G3J A;  2J79 A;  1B90 A;  3E1F 1;  3WEN A;  3CMG A;  3IAP A;  3T08 A;  3GNP A;  1OIF A;  1BGA A;  1ECE A;  2VZU A;  2C8N A;  2YLA A;  3QOM A;  3CUH A;  2JAL A;  3SCT A;  3ZQ9 A;  3SCO A;  1OIN A;  1NP2 A;  4BCE A;  3WDH A;  3N11 A;  1BAG A;  3AXI A;  3AIR A;  1EDG A;  2WZI A;  4GZJ A;  2OLH A;  3SCQ A;  1B3W A;  1EHN A;  5D9M A;  4DWS B;  1WZM A;  2G41 A;  1VFM A;  2J74 A;  4EK7 A;  3W28 A;  1XGZ A;  3WQW A;  3MUI A;  3EDF A;  3BH4 A;  3RM8 A;  1JZ6 A;  4GZI A;  5KZ6 A;  1K9D A;  3TON A;  5CPS A;  3L4Z A;  2WVT A;  2XIB A;  3ALG A;  4WSJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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