2XYLA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase complexed with 2-deoxy-2-fluoro-xylobiose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploring the cellulose/xylan specificity of the beta-1,4-glycanase cex from Cellulomonas fimi through crystallography and mutation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-GLYCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
total genus 124
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1997-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xylA00
2XJ7A 2VX6A 1BG9A 2DSKA 1E3XA 1E1EA 1G5AA 3ARTA 2XTKA 4B3KA 4HPGA 4F79A 4FK9A 1G01A 1CEOA 4AD0A 1EHNA 3BSHA 3IAQA 3VIPA 1NWUA 1NP0A 1JG9A 1VAHA 5A8OA 5ABGA 2Y8VA 1E5NA 1W2VA 2B31A 3WIJA 1HP5A 5C8BB 3IANA 2OWXA 1US3A 1J0HA 2VCBA 5JBFA 1U2YA 2W67A 2QPSA 1ISWA 2W61A 3DYMA 3WNMA 2V5CA 4E4PA 3VINA 2ZUNA 2YOCA 2JALA 5AY7A 4CD7A 4OJYA 1IZJA 4S3KA 2OWWA 1G94A 1VFMA 2VCAA 3RM8A 3PZ9A 3SCTA 5I79A 3AICA 1WZLA 1XD1A 1KGXA 3MMUA 5LYRA 2D0FA 4BF7A 4LYPA 2DH3A 4PUEA 3A6OA 1Q6DA 1E55A 2VMFA 5D9NA 4P8WA 2WM0A 4HMCA 3VM5A 1VIWA 3EDEA 2G3NA 2VR5A 1ISVA 3CH9A 1OD8A 1S46A 1QW9A 4UZSA 5BRPA 4XZBA 1VFOA 4LPCA 4Z2HA 3WNOA 1JYWA 3IJ7A 4PTMA 4WKHA 4UTFA 4H8VA 4PTXA 4JZ5A 2GDVA 1QHOA 2OYKA 5A6AA 3WFZA 2CBIA 4UFKA 5A95A 1CXHA 2WW5A 4K68A 5A8PA 1UWUA 8A3HA 3WUBA 3AIWA 1ECEA 2WHLA 3G6MA 2UY2A 1EH9A 2VVNA 3GBDA 1MQQA 1F4AA 2XVLA 5A8MA 5M3WA 3AHYA 1DTUA 3MV01 1PX8A 4KRTA 4ZENA 1O6IA 1VF8A 4F8XA 3PZNA 1FFQA 4GIAA 1QNPA 4J3XA 2YKKA 3CZKA 3CZ8A 5A2CA 2WVUA 2WC7A 4OIFA 3VIFA 2WZHA 4AISA 2WMFA 2QLYA 1AQMA 5A6MA 5E9AA 1UKQA 3LPFA 1BVZA 3WH6A 5ABFB 3NIYA 4HOWA 1TA3A 4DWSB 2XGBA 3CTTA 5ABFA 4RE2A 1RP8A 2ZUMA 1WE5A 1H4PA 4GKLA 1W91A 3T0DA 1FHLA 3L4XA 2J8FA 2O9PA 2DIEA 4U3CA 3FW6A 1GPFA 4CN4A 3ZT6A 1V3KA 1JXJA 1M01A 4J3TA 5FL0A 2V5DA 4DWSC 3ARSA 1B31A 1C8QA 3PZQA 3WH5A 2D2OA 2YIHA 7CGTA 3SUVA 3SCVA 3ARXA 1J0IA 3PTMA 4QDMA 3WDPP 1E72M 3N04A 2G41A 1E4MM 1HJUA 3T2OA 3MSGA 2ZX6A 2PB1A 2YBUA 3AXIA 2WVTA 4TUFA 1CWYA 3T0AA 6TAAA 2CEQA 1MFVA 4M8UA 1JYXA 3BAJA 1BPLB 5CZKA 2CHNA 2DT1A 5AYIA 4KGJA 3CPUA 3QHNA 3B9EA 4J7RA 2Z1KA 3O9NA 4NRSA 4UCFA 3VU2A 3RPMA 3AS3A 4JIEA 2FDMA 5JIWA 3RCNA 4Z2LA 4HMEA 2E3ZA 1R7AA 4D6DA 1JDDA 1JGIA 3WMCA 1WDQA 1RPKA 4B15A 3NDYA 4EK7A 1A47A 1CENA 1PZ3A 1VFFA 3WH8A 4WF7A 1SR0A 1B3XA 3AJ7A 3EDJA 2WMHA 2UWFA 1GQLA 2VJXA 1LWHA 3OLDA 4U33A 1OGGA 2JF7A 1EDQA 1UZ4A 2JEPA 4PMQA 1W1VA 1W1PA 5CLTA 2YL6A 4UR9A 5IDIA 3VIJA 1QI4A 2J47A 4HU0A 1WZAA 3OLIA 4JFTA 1TVPA 1EIBA 2WHMA 1XH2A 2O9TA 2WB5A 4JL2A 4IUGA 3AHZA 2V3FA 3OLGA 4ACZA 1BF2A 4MNLA 3ALFA 3B8SA 1XD0A 3MMDA 3CGTA 5A3HA 3BLPX 4HA3A 1J0JA 1Q6CA 5D9OA 4BZYA 1VBRA 2VI0A 3AXXA 5CJ5A 3CHCA 4MB5A 2XYLA 1KXTA 4JL1A 1UKTA 4KGLA 5BRQA 3GXDA 1U33A 3WQ6A 5E6ZA 4IPLA 1E70M 2PBOA 1LG2A 4UFIA 4HPHA 4M82A 2HISA 2V3GA 1VRXA 5A6SA 1DP0A 3EMZA 4JKKA 3HU7A 3SEPA 4R27A 1Z32X 2WANA 5AYBA 1C8YA 1H3GA 1HNYA 4W89A 4ZXOA 3APGA 2G3JA 1UWIA 3AHXA 2EBNA 3RILA 3ZJ8A 1JAEA 1HKJA 1UKSA 4MNKA 1QW8A 3WSUA 1MWOA 3CZGA 2FHFA 4GI8A 1K9FA 3TTSA 3VGEA 1E6QM 2EPNA 4UOJA 3WBAA 1EGZA 3W26A 2XVNA 2VZOA 5CGTA 2VUYA 2WBGA 1C93A 4PSRA 2D0GA 1E6ZA 1UQZA 2YA0A 1CXKA 1JNDA 1W3KA 4N42A 1HVXA 2WK2A 5A6BA 1TMQA 2EEXA 3UETA 5I6SA 4HZ7A 3WBEA 1H2JA 2D22A 1XSJA 1QNRA 4U2YA 4PBGA 5CSUA 4F66A 3CO4A 3OGSA 3MSDA 1EOKA 1MYRA 3SCWA 3W6LA 2JF6A 2WLYA 1KBKA 4PN2A 2GDUA 4P7RA 1EXPA 1OWQA 3WUGA 2VT0A 3EMCA 4AZCA 2XFFA 4MNJA 1U30A 2W62A 3EDKA 1FOBA 1XSIA 3WNLA 3MO4A 4TVDA 4HU8A 2CPUA 3BAYA 1X6NA 5HOSA 4GI9A 5DMYA 1CGVA 3VIHA 3VNZA 1D2KA 3ARPA 4AW7A 2ZUUA 1RH9A 4D6HA 1GOKA 1XV8A 3EDDA 1VEMA 2W4XA 1RP9A 2GFTA 1ZBCA 3G6LA 1NWRA 1KGWA 4KRUA 1J01A 1OGSA 2OSXA 3PHAA 3OGVA 1V6WA 2WNWA 1W3HA 3BH4A 2CBUA 3WL0A 2OSYA 3J7HA 1CGYA 2WMJA 3WNPA 1H0IA 3JUGA 2VNCA 3UERA 2J78A 3LPOA 2BXYA 1FA2A 3T0BA 3FY1A 1R86A 5M17A 4B9ZA 2WSPA 4FMVA 3BCFA 1BFNA 3VDAA 1B30A 4J3WA 5C71A 3N9KA 3PZVA 2GUYA 3SCUA 2QV4A 4M29A 5GPRA 3NJ3A 4BQ2A 3GXFA 2VX5A 4RE3A 1VEPA 2WMGA 4LX4A 3AMLA 3ZSSA 4IPNB 4OOZA 2X1IA 1WCGA 3IAPA 5A2BA 3VILA 4P8XA 1CYGA 3T2PA 2WAGA 1H11A 1OGBA 5GQBA 1I75A 8CGTA 2BV9A 4B3LA 1QVBA 1W9VA 2BY3A 1MQPA 2IXVA 2D24A 4M56A 5HDRA 4M80A 4AD2A 2VRKA 3GXIA 3I3EA 5E09A 4MDOA 2VZUA 1XGZA 1V3LA 1UD3A 2CNCA 4X9YA 1V6VA 3F5JA 3FN9A 4IISA 3PTQA 3CLWA 5TD4A 4AMCA 4WIWA 3DC0A 3E1F1 4PMRA 1KB3A 3WEMA 1NM9A 3N18A 3WQ8A 1UOKA 3IJ9A 4ZE4A 1ITCA 3MANA 3VDCA 3TA9A 4Y7EA 1PBGA 4W8BA 1ISYA 2DGAA 2BY0A 4U31A 4BQ3A 5C70A 1QBAA 3RMEA 2AMGA 4UFJA 1BYAA 3N15A 4YPJA 4E2OA 1H1NA 2E8YA 2NW0A 4ML4A 3MV11 3WD2A 4ATLA 1J0ZA 3CHFA 3BMVA 2GJPA 3F5LA 2DDXA 1V0NA 1UD5A 1HJQA 2VRJA 1PEZA 5DT5A 3AIVA 1PX3A 5IHSA 1AQHA 4ATDA 2BHYA 3SCOA 4C7GA 2XPKA 5BXRA 1B3ZA 1XSKA 3ECQA 1CNVA 4NSBA 2DEPA 3A3HA 4E8CA 5I23A 3RJXA 4Z2IA 4AZHA 2QMKA 2WHJA 1HJWA 3KEHA 1JIBA 3EYPA 3KL3A 4WK9A 1SMAA 2VVSA 1SYTA 3ARVA 4A4AA 1AQ0A 1V3IA 4QCFA 3SIMA 4HZ6A 1W9XA 2VC9A 5D9MA 1NQ6A 1DWFM 2Y4SA 1MW3A 4MPKA 1OCQA 1GOIA 3ZT5A 3W53A 1UZ1A 4UQEA 5FKYA 4GZJA 1W32A 3A47A 2GJRA 1UG6A 4P7LA 3PZIA 4EAMA 2XGIA 5JBDA 1JZ7A 3RDKA 3NYDA 3DYOA 1ZS2A 1R8LA 5ABEA 3PZUA 2G8ZA 3UR7A 3TOPA 3ARZA 2D3LA 2VTFA 3PBGA 2YLAA 4S3JA 2DSWA 3AS2A 1C7TA 4D72A 5EFDA 1J18A 5ABHA 1NP2A 5CPTA 1HXJA 5A8NA 3OG2A 4LYRA 1GOWA 4OKDA 1UD6A 3VDHA 1D3CA 1GVYA 1ODUA 3RIKA 3AIRA 2DT0A 4QAWA 3WY1A 5JIPA 3AS0A 4TOQA 3THDA 3GBEA 1JDAA 5GNZA 4H7VA 4AEFA 5HXMA 3W27A 3AHVA 1E3ZA 3WL1A 4M1RA 1OIFA 1VENA 1WB0A 1E15A 3WF0A 1E6XM 3WELA 4W88A 5BXPA 5A2AA 2XFYA 3WUEA 1V0KA 1K9TA 2WMIB 5FOOA 2WWDA 1BYBA 1UA3A 2YJQA 1KXQA 1WAWA 4M24A 3B9AA 2Y24A 2XIIA 2XM1A 4KWUA 2XSAA 3WDIA 2E9MA 1NARA 3ZM8A 2ZX7A 4P8VA 1JZ8A 3L2MA 1TCMA 2XHYA 3VD4A 3WF4A 1DWAM 2VX4A 1XH0A 1ZBKA 2CETA 1EA9C 2EQDA 5CXPA 1KCKA 1WDSA 4PCSA 1ZJBA 4W7VA 3AISA 4JKMA 4U3AA 1J0KA 1MXGA 1OIMA 4PMUA 3UESA 4JFVA 1OINA 1UA7A 4L4PA 3VM7A 2CKRA 1V3HA 2ZE0A 2WZIA 4PYSA 3VPLA 3QGVA 4MTVA 4AD1A 1JI2A 1HF6A 4D6CA 2BNJA 1HKMA 1B1YA 1OT2A 1UKPA 3AMCA 4DWSA 2BHUA 1GJUA 3M07A 2ZX9A 4JCLA 1SMDA 5D4YA 3UG3A 3W24A 5I77A 5FIPA 1JAKA 4W87A 2ZUTA 3WQ5A 1R7OA 2V3EA 2C8NA 1QHZA 1B2YA 2XIBA 4CU8A 3EBVA 2BVTA 1KXVA 2J74A 2JIEA 1CXFA 4OUEA 4C7FA 3B9DA 4AYSA 5I3DA 2CERA 3L4UA 3AZRA 4WLCA 1GVIA 4JCMA 2VX7A 4V27A 4V2XA 1IT0A 4D1IA 2VQUA 2O9OA 3VIGA 1WKYA 4BCEA 2AOSA 4NRRA 3VX0A 3WD4A 1Q6FA 1NOWA 1OT1A 4HTYA 1X1NA 1DEDA 1UD8A 3BAWA 1H41A 5KEZA 4QLLA 4PMNA 5CSYA 3VIKA 2WVVB 3AOFA 1Q4NX 1EDTA 2VO5A 1PZ2A 2Y2WA 5I0DA 2OLHA 4UNIA 3SUSA 4JFWA 3L4TA 4U5KA 1JFHA 5BROA 2ZXQA 2WXDM 3WF1A 4PMXA 3VIIA 1TE1A 3U7VA 3NSNA 1CGUA 3BCDA 3VGDA 1TR1A 1UD4A 2BS9A 3DECA 3VGGA 1HKIA 2PWEA 4A3HA 3M46A 3ZIZA 3ARQA 1IV8A 1FH9A 3U5UA 1K9EA 1ZB5A 3DHPA 2E4TA 3VGFA 1BSIA 5A6KA 4C7DA 5M03A 3TP4A 1GORA 4TXEA 2J25A 3QR3A 1JYVA 1KWKA 2ZUSA 4D6JA 4UQCA 1HIZA 4Z2JA 2BY2A 4GQQA 2ZWZA 3WENA 3W38A 3S6TA 1KQYA 1BQCA 5LA1A 2EJ1A 3UEQA 1L8NA 3AFBA 3AMGA 3SCPA 4CUCA 2OYLA 3AROA 1QI3A 4BQ4A 5CGMA 3VVGA 4H04A 4WJXA 2YA1A 1QNOA 1NH6A 3AYRA 3RM9A 2YLLA 4TVCA 1FFRA 3GNRA 1G1YA 4WSKA 4EE9A 5DEZA 1ODZA 1GJWA 5I5RA 1MQRA 3AS1A 3VD7A 1VFUA 2BFGA 2W63A 4L4OA 1HT6A 2OSWA 3WKZA 1XRVA 4LQ1A 3WD1A 4ZEPA 4W93A 1UWSA 3OGRA 1J12A 5CLWA 1P6WA 1HJSA 2G3MA 1G9HA 2QPUA 2NSXA 2V38A 2ZOXA 2F61A 2A3HA 1UHVA 1C91A 2E9BA 1FP8A 3FXYA 3KZSA 2X0HA 4J3UA 1I1XA 2MANA 2WHKA 3A4XA 1HL8A 1EO7A 3L4ZA 4QCEA 1J9YA 2WWCA 3NSXA 3GNOA 1B3VA 3MKKA 1W9BM 3SUTA 2J7BA 2WCAA 2DPEA 1UR2A 1ZBVA 4JKLA 3ARYA 3OZOA 3GZAA 4JHOA 1K6AA 1OB0A 4LGXA 4ZFMA 1HVQA 5BYWA 2D0HA 2FHCA 1OBAA 3WEOA 1ISXA 1QNSA 2ZXBA 3FAXA 2UY4A 4D71A 2CXGA 3MUY1 1SFSA 1QI0A 3L2LA 1W1YA 2EXOA 1UR9A 3W0KA 1W9DM 1JZ2A 3WQVA 2WPGA 4UQBA 4UQAA 1UD2A 3K46A 4W7UA 4CN1A 3VD9A 1EQCA 1ITXA 5CPSA 3DYPA 1EQPA 5EBAA 3MUAA 5M5DA 3WNKA 3CZLA 4URIA 5A8QA 1HX0A 3OBAA 4PMVA 4DUXA 4AY1A 4UFHA 3TONA 1W9UA 4CN6A 4CKQA 4WKAA 4WKFA 1Q6EA 4GXPA 2OYMA 2QF8A 3CUHA 1OD0A 1O7AA 4MJ4A 3OIHA 1CLVA 1FH7A 2GK1B 1NOUA 1A3HA 4LXFA 3VD3A 3TTQA 2YBTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XJ7 A;  2VX6 A;  1BG9 A;  2DSK A;  1E3X A;  1E1E A;  1G5A A;  3ART A;  2XTK A;  4B3K A;  4HPG A;  4F79 A;  4FK9 A;  1G01 A;  1CEO A;  4AD0 A;  1EHN A;  3BSH A;  3IAQ A;  3VIP A;  1NWU A;  1NP0 A;  1JG9 A;  1VAH A;  5A8O A;  5ABG A;  2Y8V A;  1E5N A;  1W2V A;  2B31 A;  3WIJ A;  1HP5 A;  5C8B B;  3IAN A;  2OWX A;  1US3 A;  1J0H A;  2VCB A;  5JBF A;  1U2Y A;  2W67 A;  2QPS A;  1ISW A;  2W61 A;  3DYM A;  3WNM A;  2V5C A;  4E4P A;  3VIN A;  2ZUN A;  2YOC A;  2JAL A;  5AY7 A;  4CD7 A;  4OJY A;  1IZJ A;  4S3K A;  2OWW A;  1G94 A;  1VFM A;  2VCA A;  3RM8 A;  3PZ9 A;  3SCT A;  5I79 A;  3AIC A;  1WZL A;  1XD1 A;  1KGX A;  3MMU A;  5LYR A;  2D0F A;  4BF7 A;  4LYP A;  2DH3 A;  4PUE A;  3A6O A;  1Q6D A;  1E55 A;  2VMF A;  5D9N A;  4P8W A;  2WM0 A;  4HMC A;  3VM5 A;  1VIW A;  3EDE A;  2G3N A;  2VR5 A;  1ISV A;  3CH9 A;  1OD8 A;  1S46 A;  1QW9 A;  4UZS A;  5BRP A;  4XZB A;  1VFO A;  4LPC A;  4Z2H A;  3WNO A;  1JYW A;  3IJ7 A;  4PTM A;  4WKH A;  4UTF A;  4H8V A;  4PTX A;  4JZ5 A;  2GDV A;  1QHO A;  2OYK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4XIM A;  1JL8 A;  2PF0 A;  3GU9 A;  2ZZ4 A;  2OR2 A;  3ZOA A;  1RUS A;  1RJQ A;  2OOD A;  3AAL A;  1R38 A;  3RXZ A;  4HU4 A;  1FWC C;  4UC5 A;  2CLM A;  2R1P A;  1DOS A;  3RO8 A;  1PKL A;  2ZXD A;  1MW1 A;  3UXL A;  4PB3 A;  3G1Y A;  1KFK A;  4LUS B;  3W7D A;  4GY7 A;  2BOE X;  3FSU A;  3GDB A;  3LHY A;  3MUX A;  1EF2 A;  3FKR A;  2V81 A;  5B80 A;  1MW0 A;  2CBV A;  5DAN A;  4O12 A;  1ZHA A;  2WVV A;  1XLB A;  4KMQ A;  3SCS A;  1V79 A;  3QM3 A;  2CYG A;  4TX8 A;  3GNN A;  4LOC A;  3M0L A;  4J3S A;  6ENL A;  1C29 A;  1TPU A;  1YTD A;  1YPX A;  4Z42 C;  4B9Y A;  1JUK A;  1MZH A;  3IK4 A;  3R79 A;  2NX1 A;  3VNM A;  4DM1 A;  3GU1 A;  1Q13 A;  1W9P A;  1RJR A;  4KKX A;  4I6K A;  2PI6 A;  4B5T A;  3F5K A;  3KE0 A;  1LZO A;  3GTN A;  3KCO A;  4C1K A;  3O8A A;  3WML A;  3W6M A;  4ORM A;  4OV4 A;  5I03 A;  7REQ B;  2NUX A;  4XAG A;  2IKJ A;  1VBU A;  2ZWY A;  2J7E A;  3AXM A;  5LGZ A;  2DH2 A;  4IFK A;  5HMS A;  3QVQ A;  4GGH A;  4US5 A;  4HA0 A;  1UUM A;  1CLK A;  4LC8 A;  1JI1 A;  1BLI A;  3Q45 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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