2XYLA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase complexed with 2-deoxy-2-fluoro-xylobiose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploring the cellulose/xylan specificity of the beta-1,4-glycanase cex from Cellulomonas fimi through crystallography and mutation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-GLYCANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
total genus 124
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1997-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xylA00
2DT0A 4KGLA 3W81A 4MAZA 3UETA 3VD4A 4V2XA 2GFTA 5FD0A 2WVVA 2XUCA 4PTXA 3B9AA 4X0VA 1HP4A 5ECUA 1V6VA 3BC9A 6TAAA 3ECQA 3PTKA 3TP4A 4S3KA 1CBGA 1EHAA 2WWDA 4GI6A 1CPUA 2XVKA 4IUGA 1BYDA 3WQ8A 3M07A 4UFKA 1E56A 2X09A 1QOXA 1G0CA 1OGGA 2QMJA 2E9MA 5DT7A 3CZKA 3K4AA 1XSJA 4M8UA 2J8GA 3CZEA 5E9AA 1HIZA 1VBRA 1V6XA 2ZXQA 3ARQA 1UD6A 4RE2A 3GNPA 3ALGA 2O9RA 1VJZA 3SURA 1NM9A 1OT1A 4R5EA 3N15A 2W5FA 3WH6A 3ZSTA 3VOCA 4CCDA 2JIWA 4PCTA 3F4VA 5EFFA 2QHAA 4JIEA 1UD5A 2O9OA 4PCSA 2YIHA 3SEPA 3VU2A 2OWWA 1GQJA 2CBVA 1PEZA 2XFFA 4KMQA 1LJYA 3OGSA 1OIFA 2NW0A 1VENA 1KGXA 4KH2A 3L4WA 4AIEA 3IANA 4H04A 1J0JA 2ZUMA 3EDDA 1BYAA 4OBRA 5I77A 3NSXA 3L4XA 4B15A 1H2JA 3UESA 5HBFA 4XUYA 4JFVA 4B16A 3PZVA 2J7EA 4RE3A 2CBUA 3AXIA 4PMZA 1R87A 3PZQA 4OOUA 1E71M 1JGIA 1I1XA 4QCEA 2BNJA 5HXMA 2XIBA 4JHOA 3A6OA 2J7GA 3WMSA 3CHDA 3BMWA 1W3JA 3BAXA 5DEZA 1UZ4A 1C93A 4AXNA 2FDMA 2VJXA 1B90A 3WF0A 3U7VA 3L4UA 4PBGA 3SCQA 2WKGA 3MU7A 5C8BB 3GBDA 2WZEA 1EQPA 1ZB5A 2ESCA 2XYLA 2J79A 2UY3A 4GIAA 4YHEA 4D6EA 2D1ZA 2D3NA 3WUFA 1SFSA 2E3ZA 2XJ7A 1XD0A 5BCAA 2VVSA 1WDPA 1ZBVA 3E1F1 1UH4A 1UWRA 1HX0A 3W24A 1XRVA 3SCNA 4U5IA 1V03A 1PIGA 3OLDA 3OG2A 4UFIA 3WQ4A 3AMDA 4MAVA 2XWEA 1UD3A 1WDSA 4PMYA 2CNCA 2ZOXA 2AMGA 3WL1A 3ZJKA 5CQ1A 4KWUA 1JXJA 1SR0A 5D9PA 1ISWA 2CXGA 1V02A 3PZMA 3L4ZA 1YHTA 3O2LA 4B3LA 1HVXA 3W38A 4ZE4A 1NOFA 1B3VA 2PWHA 4AZBA 1RP8A 1VFUA 1C7TA 1ECEA 2BXYA 3VO0A 5I2UA 4CN4A 4JL1A 1VEMA 5IHSA 2WC4A 5CPSA 1BHGA 3WD2A 4CN6A 3TTSA 3WQVA 1UWIA 1JDAA 1NWSA 4D1JA 3VGDA 2GJXA 1ZJAA 2GVYA 3RIKA 1BVNP 2GUYA 3W27A 1ITCA 1W3LA 1QW9A 4RE4A 2YKKA 4WIWA 1HJVA 2XVNA 2D20A 3WD4A 1OD0A 5A3HA 3VMNA 2A3AA 5IDIA 3O6AA 2Z1KA 1WNOA 5IFTA 4AEFA 1HJUA 4BCEA 3GXFA 3AIEA 2B31A 2WK2A 1LQ0A 3CZGA 2D3LA 1FH8A 1ODUA 5BROA 5M5DA 1ZU8A 2VOTA 1IT0A 2XHYA 4D6DA 2ZX8A 1XV8A 3VDHA 1M7XA 1JZ7A 3OZPA 2VNCA 3B9EA 2CEQA 1BQCA 4PMNA 3PZOA 1GOOA 3CZLA 2WMGA 2XVLA 5LA0A 4H2CA 4D71A 3N1AA 2WMFA 2PC8A 2WMJA 2ZXDA 4LQ1A 3OBAA 2EPNA 4XZBA 1CLXA 1EHNA 2BVDA 3WDQA 4A3YA 3IJ9A 1HP5A 5D8ZA 1E4NA 2JF7A 5I0DA 4D6FA 4UR9A 3SUSA 3VUPA 1OD8A 1WP6A 1W9UA 2WB5A 4TTUA 1B3ZA 1UR0A 2XSAA 3GXDA 1TCMA 2XGBA 1HKMA 4PMVA 3L4YA 4PTMA 4UZSA 3PZGA 2WMIA 1KQYA 2FGZA 4LXFA 3A47A 3WY1A 2WHJA 4E8DA 5C70A 5A6LA 1J01A 1E0XA 4PUDA 3ZM8A 4P7LA 4QDMA 2BHZA 2RGMA 4MJ4A 4AZ7A 4ZENA 1XSKA 3MANA 2VX5A 3NSNA 2VI0A 2D2OA 3AMKA 2FH6A 4P8UA 3I3EA 4ACYA 1U2YA 1CTNA 3WF2A 3NYDA 3AYSA 4U2ZA 4DWSC 1KXHA 2BVTA 3G6LA 1QNSA 4W8BA 5BXRA 4U33A 3FY1A 4CU7A 3PTQA 3LPFA 3EDFA 2EPKX 1MFVA 3T2OA 2VUYA 2YA2A 5BXSA 3AOFA 3GTNA 3WKZA 1VF8A 1CWYA 3WNMA 2WANA 2XIIA 1VFFA 4PTWA 3EMQA 3VIIA 5JBEA 3RM8A 5CXPA 3WF3A 2DEPA 2WPGA 1RH9A 2BY2A 2CYGA 2Y8VA 1MQRA 1J0KA 3IJ8A 4Q22A 1FP9A 7A3HA 3BH4A 2W4XA 5A6MA 3WFZA 3VGFA 4UTFA 1W9VA 3KL5A 1OGBA 2J8FA 1W91A 5EBAA 5CGMA 2VR4A 4U3CA 4E4PA 3SUVA 1F4HA 1UKSA 1VJSA 2X1IA 4P7NA 1JI2A 2BS9A 3GH4A 1UR1A 4HU0A 4CVUA 1J18A 3T0DA 4W84A 4C7FA 2J7BA 1EDGA 3L2MA 1V6YA 1YQ2A 2DT3A 4AD1A 4WJXA 4MDOA 2C0HA 3AI0A 3KEHA 3AFBA 2GSJA 4MJ2A 4UFHA 2VRKA 5A8PA 5A8NA 5FOOA 2A3EA 3ARVA 3T2QA 5ABFB 3AHXA 3RILA 3U7BA 1JXKA 4EKJA 1OB0A 4DWSD 4MNJA 1J0YA 2YOCA 1DWJM 5AC4A 1B1YA 3NJ3A 1KR0A 3CHEA 1MW2A 2XTKA 1HNYA 1JF5A 3KWXA 2XFRA 1G94A 3ZQ9A 1FHDA 2XM2A 4J27A 5GQBA 4KGJA 1UA3A 1HL8A 2VCCA 4W87A 1HL9A 1UOKA 1TVNA 1RP9A 4UQDA 1G01A 1CYGA 4PEEA 1QI2A 1UD2A 2DQXA 3BCDA 1B3WA 3AHYA 1E3ZA 4EAMA 4CU8A 1GOWA 3EDEA 1WPCA 1WO2A 4YPJA 4TVCA 4CD7A 2WMHA 1EQCA 3GNOA 3WUBA 5I6SA 1JIBA 3ZR6A 3SCPA 1D7FA 1QHOA 3HN3A 4DUXA 2XGIA 3GXIA 5DT5A 4D6HA 1R7AA 1JNEA 4UQAA 2CITA 3VGGA 4WKAA 4WKFA 3TTYA 4QFUA 2IXVA 1FOBA 4ACZB 1NP0A 3OLEA 3HJEA 1XH2A 4MNMA 3ARUA 3N18A 2DSKA 3W29A 5EMYA 1UWUA 3VKKA 1AQHA 3VIKA 3ZJ7A 1Y7VA 4U3AA 1V6UA 2J25A 3N04A 1I75A 3AIQA 8A3HA 1J11A 3W0KA 3AS2A 4JCMA 4JKMA 5GNYA 1H1NA 2F2HA 4V27A 5A94A 2NT0A 2ZWZA 5LA1A 2CPUA 4AZHA 3OIHA 1FH9A 4GO9A 5M03A 3UEQA 1WDRA 4H8UA 2CKRA 3RJXA 1E6ZA 3GXMA 3MUIA 3D5HA 5KEZA 4PMRA 2V3DA 4E8CA 1E4IA 5KZ6A 5CGTA 4PMUA 1GVIA 3RO8A 1GQIA 3EBVA 4F9JA 1J0IA 4UOZA 3A3HA 4B3KA 2E9LA 2EEXA 2XPKA 3W6LA 2YBUA 3GNRA 4MTVA 3N13A 3AIUA 5I23A 4WLCA 2WHKA 3RM4A 1PJ9A 1J10A 1K9DA 3M46A 2CHNA 4PMQA 3GZAA 1UKTA 1J9YA 1KCKA 2DIJA 2VCBA 2E9BA 1CLVA 1GOMA 2V5CA 3L4TA 3W28A 1X6NA 1XHGA 2ZIDA 3AIRA 1NWTA 3EDKA 5CG0A 1G9HA 1R86A 1OSEA 6CGTA 5GNZA 3PN8A 3UR7A 4GQRA 3W4RA 3WNPA 4AIOA 4MNLA 2VCAA 1JI1A 2QV4A 1O7AA 4ZXOA 5A2BA 4GI9A 4R27A 4TX6A 1M01A 3WQWA 1CXKA 4DM2A 1O6IA 3ARRA 3WL0A 1FFQA 1W2VA 3W25A 4ZFMA 1JDDA 1V3LA 4GPNA 2DGAA 1LF1A 2YA0A 3II1A 1VBUA 4M56A 5E6ZA 3QHMA 4D1IA 5E0FA 2QPUA 4QP0A 2AOSA 1F4AA 1JNDA 5E0CA 4AD0A 1E0WA 2G8ZA 1QW8A 2F8QA 4CCCA 1E55A 4DUVA 3L4VA 3AS3A 2D22A 3BSGA 4MB1A 2BHYA 3GH7A 5D8WA 4GZJA 2E8ZA 2C7FA 1KXQA 2W92A 3D3AA 2QF8A 3PTMA 3A4WA 2YL8A 3W37A 9CGTA 2WM0A 3WFLA 1H5VA 1GPFA 2ZX7A 3SCWA 1V3MA 2WSPA 5I5RA 4CKQA 1AQMA 3U5UA 1HJXA 2BY1A 1GCYA 3CPUA 1MVYA 5CZKA 2PI6A 2EXOA 3SUUA 1U33A 4D72A 2J75A 3WELA 1CXEA 2J78A 3K4DA 4QAWA 4TUFA 2NT1A 1DWHM 3BAKA 3N9KA 4A3HA 2Y5EA 3AYRA 1CXIA 2WBKA 4ML4A 1R7OA 1ESWA 3WDRA 3NUKA 1V02E 2WSKA 3VD3A 3HU7A 3SCUA 1NOWA 4AMCA 1EDQA 4AD3A 1E70M 4TVUA 1WE5A 3K8LA 1D2KA 1VFMA 3WQ6A 3MS8A 3LPGA 3WIJA 1QHPA 3CUFA 3VIOA 2FGLA 5A2AA 1TUXA 2VTFA 4BQ4A 1R8LA 1UH2A 5LYRA 7CGTA 4HZ7A 3W26A 4TVDA 2WCSA 4L4PA 3QHOA 1GJUA 3NSMA 1JZ2A 3VIJA 3MMWA 1E1FA 2ZUTA 1VRXA 1BFNA 2V3FA 4GI8A 1GHRA 4ATLA 2ZUNA 2EPOA 4S3JA 5A2CA 3I3DA 4K68A 2E8YA 1VFOA 5ABGA 4AEEA 1GJWA 2WMKA 3DHPA 4P8WA 3ZIZA 3VM7A 4UOJA 2WZIA 1VEOA 1W1VA 2EBNA 2ZE0A 4HMDA 1EA9C 2V3EA 3TTOA 3CUIA 3APGA 1HVQA 1VIWA 3N11A 4DWSA 5HPOA 2JIEA 2Y4SA 2WCAA 4J3UA 1MXGA 2VO5A 1Q6CA 4Z2KA 3BXWA 4W8AA 3ZJ6A 4MB3A 1IZJA 5D9OA 1E15A 3BMVA 2O92A 3AXHA 1LL6A 4NRRA 1Z32X 1E9LA 2J47A 1C90A 1KXTA 1M53A 1HJQA 3FW6A 1FHLA 2RGLA 1PZ2A 2Y24A 3SCOA 3UCQA 3POCA 2Z1SA 4AZ5A 4HOZA 3FAWA 2CKSA 1K9FA 1C8XA 1GZJA 1BG4A 1GW1A 3AHTA 1BTCA 1CGXA 4AIUA 1E6NA 1R85A 2CHOA 1LG2A 4D6JA 1PIFA 2XVGA 2WWCA 2OLHA 5FIPA 1WZKA 2G4FA 4M80A 3OGRA 2J74A 4M29A 4UQBA 4W93A 3ARTA 5DO8A 4EK7A 3VPLA 4AD2A 1QNPA 3OZOA 5IFPA 3T08A 4JKLA 4GZIA 2WZHA 3MSDA 4AISA 2D23A 3OA5A 1UD4A 2ZICA 3OLGA 3MO4A 3S6TA 4E2OA 3IAPA 3VNZA 4OBSA 4N0RA 4QLLA 2PBGA 3AISA 4F9DA 5D9MA 4W88A 1UA7A 1UKPA 4X0NA 1JF6A 4DM1A 2PF0A 1HJSA 2ZX6A 4HA3A 2PWEA 3ZT5A 1FH7A 2DSZA 5BRPA 1UG6A 2WC3A 1JYXA 1US2A 4JFWA 1DWGM 3SCSA 3G6MA 3TONA 3WF1A 2EPLX 3WD0A 2GDUA 3BSHA 4M1RA 3VIHA 4F66A 2VRJA 4Z2JA 2GDVA 1AVAA 1CZ1A 1H09A 2D24A 4PSRA 2V5DA 5DMYA 4KRTA 4UOQA 1RD6A 3DECA 1CIUA 2VZVA 3VMOA 1ISYA 4OZOA 5AC5A 2CETA 1V08A 2DH2A 3EDJA 1NH6A 3WUEA 1AMYA 4IPNB 4JFUA 1FA2A 1KBKA 4W8LA 3OGVA 5ABFA 1W32A 3MMUA 3TTQA 2FHFA 4JCLA 4PYSA 4BS0A 4Z2IA 1VEPA 1CGUA 5CLWA 3K46A 1CDGA 2VRQA 2J62A 2JEPA 2DDXA 5A6BD 4QLKA 2Q8XA 4GO8A 4AYSA 3RMEA 3VX1A 1BPLB 1JYWA 4JL2A 1MQPA 1UHVA 3PZUA 3F5JA 2VQUA 1V3HA 3VVGA 4AWEA 1ZS2A 2DPEA 3MSGA 2YLAA 4AD4A 3WH5A 1A3HA 4A4AA 2V3GA 1LL4A 2JFEX 1V3KA 3DYOA 3VX0A 1BSIA 4FLRA 3QOMA 3UG4A 5A8OA 2WXDM 5A95A 1GQLA 2OYLA 1E4MM 2F61A 5A8MA 4P8XA 3SUTA 3VDBA 5E6YA 2WHLA 1GOIA 1ISZA 4OOZA 3VD9A 2GK1B 1U30A 2DIEA 4FLSA 4JAWA 4C7DA 3W53A 3WENA 2UY5A 2YL5A 3CZJA 3SIMA 1QI0A 1JYVA 1W1PA 5I78A 1DHKA 2E0PA 2WLYA 4UQCA 1C8YA 5I24A 2ZUSA 3VILA 2Y2WA 1QNOA 4EANA 4C7GA 1JD9A 5FKYA 1MW3A 2ZUUA 2YDRA 3ZR5A 3U5YA 5FL1A 1WB0A 4P7QA 4BQ3A 2XM1A 1HT6A 3F5KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DT0 A;  4KGL A;  3W81 A;  4MAZ A;  3UET A;  3VD4 A;  4V2X A;  2GFT A;  5FD0 A;  2WVV A;  2XUC A;  4PTX A;  3B9A A;  4X0V A;  1HP4 A;  5ECU A;  1V6V A;  3BC9 A;  6TAA A;  3ECQ A;  3PTK A;  3TP4 A;  4S3K A;  1CBG A;  1EHA A;  2WWD A;  4GI6 A;  1CPU A;  2XVK A;  4IUG A;  1BYD A;  3WQ8 A;  3M07 A;  4UFK A;  1E56 A;  2X09 A;  1QOX A;  1G0C A;  1OGG A;  2QMJ A;  2E9M A;  5DT7 A;  3CZK A;  3K4A A;  1XSJ A;  4M8U A;  2J8G A;  3CZE A;  5E9A A;  1HIZ A;  1VBR A;  1V6X A;  2ZXQ A;  3ARQ A;  1UD6 A;  4RE2 A;  3GNP A;  3ALG A;  2O9R A;  1VJZ A;  3SUR A;  1NM9 A;  1OT1 A;  4R5E A;  3N15 A;  2W5F A;  3WH6 A;  3ZST A;  3VOC A;  4CCD A;  2JIW A;  4PCT A;  3F4V A;  5EFF A;  2QHA A;  4JIE A;  1UD5 A;  2O9O A;  4PCS A;  2YIH A;  3SEP A;  3VU2 A;  2OWW A;  1GQJ A;  2CBV A;  1PEZ A;  2XFF A;  4KMQ A;  1LJY A;  3OGS A;  1OIF A;  2NW0 A;  1VEN A;  1KGX A;  4KH2 A;  3L4W A;  4AIE A;  3IAN A;  4H04 A;  1J0J A;  2ZUM A;  3EDD A;  1BYA A;  4OBR A;  5I77 A;  3NSX A;  3L4X A;  4B15 A;  1H2J A;  3UES A;  5HBF A;  4XUY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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