2Y7EA

Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from candidatus cloacamonas acidaminovorans (tetragonal form)
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
HEPLILTAAITGAETTRADQPNLPITPEEQAKEAKACFEAGARVIHLHIREDDGRPSQRLDRFQEAISAIREVVPEIIIQISTGGAVGESFDKRLAPLALKPEMATLNAGTLNFGDDIFINHPADIIRLAEAFKQYNVVPEVEVYESGMVDAVARLIKKGIITQNPLHIQFVLGVPGGMSGKPKNLMYMMEHLKEEIPTATWAVAGIGRWHIPTSLIAMVTGGHIRCGFEDNIFYHKGVIAESNAQLVARLARIAKEIGRPLATPEQAREILAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3-Keto-5-Aminohexanoate Cleavage Enzyme: A Common Fold for an Uncommon Claisen-Type Condensation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-KETO-5-AMINOHEXANOATE CLEAVAGE ENZYME
molecule tags Lyase
source organism Candidatus cloacamonas acidaminovorans
total genus 103
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.247: 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme.
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2y7eA00
1KM0A 1ZAHA 3LB0A 2B0MA 5DBUA 3KHJA 4Q33A 4N4PA 1H62A 3R2GA 1RV8A 3PVFA 4CCCA 3G1HA 4JTEA 2CW6A 4BFAA 1W54A 1DV7A 1VPXA 1F74A 1IXQA 2NUXA 5BNKA 2JKEA 4O4WA 3FA5A 3CB8A 4N9DA 4FHAA 3CWOX 2DP3A 5DCDA 3EKLA 4MYXA 1UASA 2YX0A 1C29A 4BI5A 5F2GA 3QYQA 1XCFA 1VCVA 2YGYA 3TMLA 3BARA 3T7VA 3QMTA 1LBMA 1FCQA 4UIOA 3W1AA 4D2JA 2EKCA 2E5CA 5MHBA 1GVFA 1DBTA 4R34A 4N9CA 3S6DA 2RKXA 3QQ1A 1NF7A 2Y7DA 2RDTA 4WJEA 2FIQA 4MVAA 3GXNA 2TSYA 4UFJA 3CEUA 1VC4A 3WFAA 5LGXA 3KAOA 2YW4A 5D2WA 5HULA 1IXNA 1M7PA 2YFNA 1AMKA 3QQ0A 4MFEA 3DI0A 1M5WA 3DFSA 4IPIA 1S5WA 3GNDA 4AEOA 3W2NA 2I14A 4MZ1A 2J9XA 5LKYA 4WOZA 4ICNA 3NZRA 2ZA3A 1SZFA 4NXKA 3B4UA 3I7RA 3G1AA 2Y6ZA 5D2VA 3HQ1A 1XL9A 4K39A 3LCHA 1L9WA 4GBUA 3NEVA 4WXZA 2VENA 5AC7A 5DXXA 3ABRA 1TTPA 1W5QA 2EHHA 3W88A 5I3KA 3OVPA 4JYFA 4UTWA 4JTUA 4QM1A 1T99A 2Y7GA 1X7FA 1EP2A 4FIRA 1HG3A 2YW3A 2ZA1A 1YTKA 1TO3A 2ZZ4A 4FB7A 3STGA 4FNPA 1PV8A 4Y90A 1LOSA 4CCEA 4XWUA 1L2UA 3TQ0A 5BW6A 4FO4A 3W83A 3NL2A 3GK0A 3FJLA 5E93A 5F2LA 2DJLA 2BX7A 3BLFA 5C5YA 3ZWTA 1KBJA 1Y0EA 1G69A 1VLIA 4LS1A 2OZ0A 3PUDA 4IMDA 3W2JA 1XDMA 3QPZA 1I2QA 2Y88A 3HJZA 2V0TA 1P4CA 4X9SA 4O52A 4OT7A 4Z0SA 4R33A 1H63A 3NOEA 1JUKA 2CLOA 3Q2DA 2RDUA 2FPVA 2VFIA 1GTHA 3FIGA 1FWWA 1RQBA 3LHYA 3BW2A 1KM5A 1S5VA 5F2IA 3LBCA 3NL6A 5CSSA 4DBEA 7TIMA 4CQ8A 4KWVA 1SR9A 4IXXA 1R2RA 3H54A 2GVJA 1JQVA 4B5NA 1JCLA 3FOKA 1FX6A 2CLIA 2E6FA 1JJKA 1RD5A 2V81A 5G2IA 3RLUA 1I2OA 4UTWC 3KVJA 4Y9AA 2C13A 4YCPA 1G7UA 3P5YA 1JCNA 4ZQOA 5D02A 3WJXA 1PCKA 1FCUA 3M7WA 4IMFA 3TW6A 3CTLA 4IPJA 4R53A 3TFCA 3OA3A 5K4ZA 3UY8A 3CC1A 2ZA2A 2PRLA 3NL5A 4L4MA 4O57A 4E38A 2FJKA 3S5OA 1F6PA 1IXOA 1LCOA 5A8GA 1MSSA 4MKNA 3RK8A 2G95A 4DF2A 1DORA 4NT0A 1FY6A 4JX5A 1OYAA 3P8IA 4AHOA 1WX0A 3STFA 4PL2A 2C0AA 4IQLA 4IJBA 4O8RA 1GYNA 3PBYA 1DQWA 3MI2A 1A50A 3LHWA 3ZR4A 1SUXA 3SW6A 1V5XA 3C8FA 3W07A 1TPUA 4PEKA 4MZYA 2XN2A 2AGKA 3C2VA 2WNQA 3LCFA 1JUBA 3LHZA 1H7RA 1ICSA 4NNAA 2R14A 1EPXA 2ZBTA 4GFSA 2VOMA 4UTIA 5HWNA 2G5WA 3GKFA 3C3NA 3TW7A 2Z6JA 4GWEA 4JTHA 1W1ZA 4N9BA 4PCFA 1JQXA 1GVRA 4JD4A 1KLYA 2Z2UA 3UWZA 2YXGA 3IGSA 2ZTJA 1DJQA 5EYWA 4MJZA 5H2ZA 4IOTA 4MY9A 1FQ0A 3MO7A 2VXNA 5LGZA 3W6YA 4H4IA 3AO0A 4FIQA 5I3GA 4O0KA 5AN7A 3QW4B 2WQPA 1LLZA 4RK8A 3QRHA 1BWLA 4XZ9A 1SW7A 1HO1A 4QAIA 4MFDA 1D9EA 3W7EA 1VS1A 2WOQA 4QNEA 1FWRA 1AL8A 2BTMA 1Z41A 3BW3A 3DFPA 4GRSA 5FI8A 5EPDA 3NQCA 2DZUA 3T55A 1Z44A 5CZTA 2D73A 2WNNA 3P7YA 2NX3A 1QPQA 3QEZA 3K30A 2A7PA 1JCXA 3Q94A 3NPWA 3WK0A 2EPHA 3VE9A 3MUXA 3A21A 3OHIA 4KWWA 1KFJA 1KW1A 4WOQA 3PY2A 4RZ5A 1JCYA 5AHLA 3P61A 4I7WA 5C54A 3DHFA 2VEKA 2ZDRA 3PM6A 3CWNA 3M9YA 3N2MA 1TIMA 3LRMA 1O95A 1UJPA 3A22A 2RDWA 1FBAA 4LTSA 3V1PA 1QOQA 2QUUA 3U8GA 5AFDA 4NZJA 1NVMA 3TC6A 5U4NA 1NFBA 5AB3A 3LTSA 3QFEA 1TV5A 1TRIA 3LM7A 1TPEA 3UPWA 3MHUA 5GVJA 1Q3NA 3B8DA 2HS6A 3LX9A 2ABAA 1T96A 3TCEA 3UWUA 5K2ZA 4WD0A 3BK0A 1YXCA 2VFHA 3OVRA 1XBVA 4W9TA 4HSOA 5D30A 2QCCA 3W86A 4AWTA 3V75A 3TR2A 5HWMA 3UZ5A 2ATMA 3DAQA 4HN4A 2TPSA 3E0IA 3N2XA 3O05A 2V5BA 3M47A 2DZPA 4O16A 1YXYA 2VFEA 4K8EA 3PBUA 2DZTA 3S1VA 2YYTA 4JEQA 3N34A 1J4EA 3W73A 4RV8A 1OABA 2NWSA 1OFBA 5KINA 4RX0A 3FEMA 3MYPA 4Z1CA 4CNOA 1TPFA 4N9EA 3TROA 4EWND 1XUZA 1TJPA 2AQWA 5EY5A 2WNZA 3S5YA 3GX9A 2A0NA 3TC7A 2H8ZA 1OFDA 3CQ0A 2HMCA 4IX2A 3TV8A 5C6MA 5IBXA 2ZYFA 1FWSA 3W76A 3LHVA 4JTGA 1LOQA 2ZZ7A 3LDVA 3ABQA 2BLEA 3W7MA 3HIJA 4JTJA 3LV6A 1W56A 2X1TA 3L65A 2QF7A 3G24A 4UTKA 2R91A 2WJZA 4QSHA 3GVGA 3W3OA 2ZRZA 4EIVA 4UMCA 1G4SA 1H7PA 3A5VA 5K3VA 4MPQA 4OGZA 3WJYA 1TMHA 3G1FA 3BVJA 2C16A 3G18A 3L0GA 2ZRVA 3W1PA 4E2BA 2Q8ZA 2VFFA 5FF0A 1YPIA 5AHFA 4R7JA 3OVQA 2B7OA 1PCWA 4H6KA 3B0PA 5FEZA 2E77A 1CX9A 1OX5A 5F2MA 3O06A 1ALDA 4O14A 4GUGA 4ORMA 2X2GA 1PHQA 1QWGA 4FEZA 3D0CA 3NZ1A 3U2OA 1TTJA 4WUIA 3S5NA 3USBA 2BZNA 1LROA 3EB2A 4UFLA 4HKPA 4UR8A 3IEBA 4UFHA 4YMZA 4NZFA 4K7YA 5EL1A 3ABOA 5I3IA 2XFWA 4K38A 4DO6A 1VCFA 1VHNA 5IBXC 4G1KA 1RPXA 5K9DA 4JS3A 3PBVA 1SO4A 3VCRA 3TSBA 2Y62A 2YYUA 2VEPA 2B7PA 4FNSA 3RLVA 3SI9A 1KM1A 3TQVA 4O13A 3B0UX 1ADOA 4K8HA 2QJGA 3A23A 1C8VA 1NAL1 1DQXA 1P0NA 4NU7A 5FF2A 5I3HA 3HG2A 3W75A 1GWJA 1HO4A 2HS8A 3FJ6A 4Z1DA 3DH7A 1XKYA 4J9JA 2Y7EA 1VCGA 3W7JA 3G1YA 2NV2A 4AVFA 4TMCA 4GUJA 4A3UA 3HBLA 2QR6A 4ZQPA 4OHQA 4AB4A 2OT0A 3BGGA 2ZRXA 3HF3A 3ZFHA 1EIXA 5L6UA 1TTIA 3W7CA 1BTMA 4YL2A 4K6AA 4LY8A 3DBPA 5EMUA 1G67A 3W72A 1CI1A 4S2BA 3T44A 1FDJA 2RH9A 3HB9A 4IXHA 2OCZA 2A7NA 3DFNA 2GQ8A 1T8XA 1FXQA 1DVJA 1KFBA 2R94A 1GVOA 5E0KA 2TMDA 1R2TA 5F1UA 1WXJA 1PL9A 2FTPA 2V30A 2QUVA 1BKSA 1VYSX 5HWJA 1B3OA 1X1ZA 4O1CA 4ZL1A 1SO3A 3FFSA 5D38A 3TSDA 3TNOA 1YYAA 3P67A 2DORA 1LTDA 3TUUA 1O5KA 4Q4KA 4O18A 3IGUA 1T0OA 1VLWA 4BWLA 4O17A 1DOSA 4XBKA 3HG3A 3KOFA 1OJXA 1Z42A 4BK9A 1Q45A 2W0UA 3NQ6A 3O8AA 3RU6A 4ZVJA 4YWIA 1KA9F 2GPTA 1TJRA 1I2PA 3MBDA 3O1NA 2NX1A 3UQNA 3QZEA 4PFMA 2ZRYA 2WSQA 4DF0A 1PVNA 1IIHA 5AC6A 3GYEA 1YPFA 3W7GA 2E6DA 2ZZ3A 4CCDA 3O15A 3G0SA 2H8XA 4XTDA 3W22A 4JICA 3FLUA 3TFXA 2Y85A 1ZHAA 4N6FA 4UCGA 1N55A 3O6DA 2X30A 1YADA 2ISVA 3UPBA 5KMYA 4O54A 4POCA 3GDRA 1LBLA 1X6UA 1WOAA 4TIMA 1CW2A 2DU2A 4TU1A 1LDCA 4TMBA 3CEPA 3SJ3A 4O10A 2Q8LA 3BGJA 4FNQA 1KM4A 3F1QA 5F4WA 4RJEA 2OJPA 5A5WA 1TV8A 2RHGA 3R13A 2C1HA 4UTTA 3PWAA 2PRMA 3HGRA 2HTMA 1H51A 4Z1BA 3TXVA 3P8JA 5F1VA 3WJWA 2BXVA 4FX7A 1XC4A 4I7VA 5D37A 4WX2A 3LTPA 4TX9A 3IVTA 4LVBA 3N9RA 3CM4A 5DY3A 1LOLA 2YR1A 1QFEA 1SO6A 4IWWA 1SZGA 4UFMA 4JX4A 4LRSA 3P82A 4LS2A 3LCGA 2H90A 1UUOA 4AWUA 2E5DA 5D32A 1KM2A 4RZ4A 3BPWA 3PR2A 1FWTA 1NEYA 4IUOA 3FKKA 3EEGA 3M44A 3CIXA 4MLRA 2C18A 5BMXA 3EWWA 4U4MA 3LV5A 3GIYA 4LRTA 3P62A 2ZZ6A 2CLKA 3TK7A 4GC4A 3KRUA 3G3MA 1GTEA 2HSAA 1GOXA 3W84A 4CNPA 1YDNA 3MI6A 3TXZA 4XTIA 4FNUA 3W7DA 1WYIA 3MYOA 3QH2A 4KKXA 3LERA 4CLMA 4NNCA 1B9BA 3YPIA 3T78A 5D09A 5D2TA 1EX5A 2PURA 2P0OA 4E2DA 5G4WA 4I7UA 1IIGA 1W3IA 1MEIA 3L9CA 3C2EA 1EUNA 4QITA 4GJ1A 3PB0A 1EWDA 1M6JA 2Q3OA 1F5ZA 1EP3A 2GOUA 4ZZ9A 3W7LA 4UTTC 4IGHA 1GYLA 2NXGA 3PAJA 3B05A 3DU0A 4O50A 1OFRA 2WO5A 5CG7A 5I3JA 2CFFA 2PE4A 4H3DA 4JY8A 3VE7A 5LHFA 2FPYA 1FDYA 4PTNA 1LLWA 1IF2A 2V2HA 3PS7A 4UR7A 2J9ZA 2NXHA 2ZFAA 4O0ZA 5FF4A 3TMQA 3L66A 1K8ZA 1RQEA 3BLEA 4LT9A 4UFKA 3TQKA 3EWXA 5D05A 3TIMA 3IIOA 1TB3A 3NM3A 5DY2A 1XDLA 3TE9A 4UTUA 1QNVA 3MP5A 1H50A 8TIMA 3NQDA 3WK3A 2V5LA 3EWBX 4WY0B 3NDOA 3W1UA 4YLWA 5EBUA 3VI2A 1R46A 1AW2A 4UNKA 3LLDA 4FXSA 5DCBA 4BF9A 5J5DA 2FB2A 3FYPA 1AL7A 3MHFA 1RQHA 3BG5A 4X2RA 4Y6GA 1MXSA 1OX4A 2CLMA 3CT7A 3W7IA 4PODA 3JS3A 4TO8A 3TJLA 2X1RA 2H3DA 4GNJA 5K9XA 1O94A 1S3HA 1PE1A 4A22A 1GT8A 4RCXA 1W5NA 4TR9A 3EWZA 1PS9A 2JKAA 3A9IA 3GR8A 2CU0A 4LVDA 4NJKA 1OK4A 3IIPA 2CZ5A 3SGZA 3W9ZA 1YTEA 5FF7A 2YSWA 4DPPA 4HIBA 3W7NA 2O7QA 2VFGA 1H7NA 1KTNA 2Y70A 1ICQA 1XFBA 5BOOA 3N14A 1H5YA 3W1QA 2GVGA 1OF8A 4EF8A 1TPVA 1ICPA 3EX4A 3CIWA 1KFEA 1SO5A 3NQGA 4ALDA 3LHTA 1I2NA 2E6AA 1IGSA 3W1NA 1GEQA 4DF1A 2YZRA 4RKAA 1NSJA 3C56A 3GDTA 2WSRA 1Q6LA 3M5YA 2CLFA 1LRNA 1O4UA 5KITA 2C15A 4XBSA 1JRCA 4UXDA 3TA6A 5LZLA 4IMCA 3SZ8A 4DQWA 5T26A 3RFAA 3OG3A 3PG9A 3HMJG 3I68A 3IVUA 2RFGA 4JN6A 2ATSA 1ME7A 4UTHA 1SU5A 3S1XA 4CQAA 3T40A 1SW3A 4NX5A 1WQ5A 1L6SA 1AK5A 2WV8A 2XN1A 1GZGA 4HT3A 1ZAIA 4L4LA 1QPOA 1XM3A 3M0ZA 6TIMA 3S1WA 3PF3A 4GUFA 2DZWA 3VKJA 3IGXA 1KLZA 4WY0A 1SPQA 5D2XA 1H7OA 2A85A 3UYCA 1AW5A 2ZZ2A 1HFBA 3KVLA 3NNTA 4CQ9A 4A29A 3NPUA 1F2JA 5AYXA 4HSNA 3GDLA 1F05A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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