2Y7EA

Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from candidatus cloacamonas acidaminovorans (tetragonal form)
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
HEPLILTAAITGAETTRADQPNLPITPEEQAKEAKACFEAGARVIHLHIREDDGRPSQRLDRFQEAISAIREVVPEIIIQISTGGAVGESFDKRLAPLALKPEMATLNAGTLNFGDDIFINHPADIIRLAEAFKQYNVVPEVEVYESGMVDAVARLIKKGIITQNPLHIQFVLGVPGGMSGKPKNLMYMMEHLKEEIPTATWAVAGIGRWHIPTSLIAMVTGGHIRCGFEDNIFYHKGVIAESNAQLVARLARIAKEIGRPLATPEQAREILAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title 3-Keto-5-Aminohexanoate Cleavage Enzyme: A Common Fold for an Uncommon Claisen-Type Condensation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-KETO-5-AMINOHEXANOATE CLEAVAGE ENZYME
molecule tags Lyase
source organism Candidatus cloacamonas acidaminovorans
total genus 103
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.247: 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme.
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2y7eA00
3PUOA 1DQXA 3NAVA 1TPFA 3LB0A 2Q3OA 3W7PA 1J2WA 1WX0A 5A8GA 2NWRA 4LC8A 3NL5A 4HPXA 4ZQPA 5F4XA 4ZZ9A 2VELA 1TB3A 3LHWA 1VYSX 1A50A 3I6RA 4FO4A 4QNEA 5LNWA 2ISSA 3TMQA 1H1YA 3NZ1A 2QCLA 5AC8A 2FPYA 3L5MA 4ZVJA 4OU1A 4P2VA 5HINA 1S5VA 1VQTA 2C0AA 2CW6A 3EKLA 3DAQA 2YGYA 2DZVA 4UR8A 3JRKA 2ZZ5A 3W1NA 3W7OA 3N9SA 3O6DA 5KSWA 4OV9A 3I7QA 1TQJA 2FIQA 3P84A 5HNRA 1I2OA 3PUEA 4Z1AA 3DXIA 1VLWA 1FWSA 4O8RA 4DXVA 2DZPA 4U28A 1G7VA 4GXMA 2B4GA 2DJLA 1DQWA 3W1RA 2WNZA 1X1OA 1TV7A 3MI2A 3W1AA 4N4QA 2YFNA 4UTIA 4JTKA 1FBAA 5AN7A 4UFJA 2NXGA 3GB6A 4GUHA 2ZZ1A 3MHUA 3QW3A 1ZCOA 2PRLA 3TROA 3ABQA 5GVJA 3SZ8A 5FF7A 3RLVA 1G4EA 1UASA 4XWUA 1Q6LA 3NA8A 1M5WA 2AQWA 3IRDA 3F4WA 3S8HA 4N6FA 5FF0A 1GYLA 1B4KA 2BXVA 2WOQA 4OGZA 2BZNA 3EKZA 3EX4A 4ZQMA 1VS1A 3DFQA 4PFMA 3HG4A 2BLEA 3PUDA 4M7SA 5D30A 2WKJA 3EWWA 4E2DA 3TSDA 3HGJA 1SW0A 5LHEA 4X2RA 3VCRA 1K8XA 4ICNA 1JRBA 1Z42A 5HMSA 5FEPA 1YDNA 4FNTA 2VEKA 3NVTA 1F2JA 1EB3A 5AHEA 4A2RA 1TJPA 3TAKA 3R2GA 5EMUA 4Y90A 2R14A 3RK8A 1L6WA 3E0IA 3HF3A 5G2WA 3KVJA 1OFDA 3VI2A 4CNPA 2ZQ0A 5DCBA 4PA8A 3M47A 3M5ZA 4IOTA 5CPOA 3G1DA 4O4VA 4S2BA 3LCIA 3T40A 1O95A 1SO4A 2ZDRA 3MP4A 3W1QA 3ATYA 2J9XA 4HSOA 4IWWA 4PEKA 4YL2A 3P7YA 1C9DA 3P8JA 2W79A 3NGJA 4WX2A 3B8DA 1N7KA 3ABOA 4B5NA 4XZ9A 4HSNA 3U8GA 3T7VA 1XCFA 1W37A 1W5PA 2A7RA 3O06A 1EIXA 5DY2A 3R89A 3TW6A 1UCWA 3PG9A 1LP6A 3QW4B 4E2BA 4JGDA 4BFAA 1PCWA 5FEXA 3MYOA 4MJZA 4A29A 5DBTA 1ZFJA 3T78A 3QC3A 4UXDA 3L68A 2O7QA 3NQFA 3BVJA 3NL2A 3IV3A 3C61A 2ZRUA 1V5XA 3P67A 1I45A 3MBFA 1UBSA 2Y62A 1KFJA 4IQLA 1THFD 4GFSA 1DORA 3I65A 4BI5A 4O52A 1KM6A 3O6CA 3EXSA 2V9DA 5EPDA 4FXRA 3TX9A 3G0SA 4NJIA 3W1UA 3NQMA 1T0OA 4IX2A 1T99A 3N3MA 2PC4A 4M19A 4LW7A 3T44A 3QPYA 3IIOA 3RNDA 3MI6A 1MEWA 1ALDA 1PE1A 4M6QA 2RKXA 1XDMA 1WYIA 1TREA 4JIQA 5K9CA 1ME7A 3C2FA 4LUJA 3TH6A 5AHLA 1Z41A 3C3NA 4HPJA 3NQAA 1NVMA 1TTQA 1WAUA 3ZFHA 3P5ZA 3W7JA 1VH7A 3M5YA 1TPH1 2Y63A 5E93A 5AYZA 1WBHA 2V2HA 4GWEA 4N9CA 2WSYA 1OX5A 3B05A 4EF8A 4BWLA 4DBDA 3IVTA 4MZYA 2BTMA 2A1YA 2OJPA 4R34A 2RDUA 5AHNA 1LLWA 1YPIA 3OHIA 4UNKA 1LM1A 2NWSA 2TYSA 3L2IA 4XKYA 1VCGA 3L0NA 1G67A 5KMYA 1XM3A 5EBUA 3W1TA 2Y61A 3F1QA 4PODA 4O0ZA 1AL7A 3L5LA 1JUBA 5K9DA 5D33A 3LHVA 3NQCA 2QCHA 1W5OA 2RFGA 2VENA 1DV7A 4UMCA 4LNYA 3S6DA 3NM1A 4YLWA 3E02A 3MHFA 4WUIA 4Q32A 2NX1A 3HJZA 3SI9A 3T55A 3O6YX 5KITA 2X16A 3CC1A 1W54A 3Q2DA 1L6YA 3W7NA 4PL2A 2AGKA 3STCA 3HIJA 3C2VA 1H1ZA 3BPWA 5L6UA 1H7OA 4E38A 1NEYA 4HNVA 5J5RA 1LBLA 2OCZA 1TPC1 4EWND 1SO5A 4GUJA 2E77A 4JDBA 3UWVA 1LBMA 3G8RA 3DFOA 3GNNA 5BMWA 3M43A 5F2GA 3QMSA 4K39A 3ABSA 2E1DA 4BK9A 1TPEA 2DZWA 1KFKA 2GQ8A 2TPSA 5G4WA 1TTPA 4K6AA 1KW1A 5DCEA 2JBMA 5FF4A 3M5VA 1XBZA 3BLFA 1YLVA 3CQ0A 1EEPA 2ZTJA 3OIXA 3TMLA 3UXDA 3ANYA 2YZRA 2NXIA 3RMJA 4ZQOA 4UC5A 5AHMA 4ML9A 3W3OA 1UJPA 5AC7A 4FNPA 4UFLA 3W83A 1ML1A 4N9BA 3UZ5A 3PB2A 1V7YA 2QDGA 3EWUA 3E9AA 3NDOA 3NQ7A 3GK0A 1KTBA 4DF1A 3CT7A 4O18A 2XN1A 3TK7A 1KLYA 2NUXA 3N34A 4QSHA 1VGAA 2Y7FA 2H8XA 3G3DA 1W5NA 3GDMA 2A4AA 1O5XA 4O50A 4ONVA 1K7FA 3WK0A 1JVNA 4ADSA 3DBPA 1TMHA 4BWLC 3GLCA 2Y70A 3KVKA 3G1HA 1TPB1 2VFEA 1KM3A 3W7RA 4JTUA 1FWTA 3G8EA 3TCEA 3A22A 2GVJA 2GQAA 1R47A 3F4NA 3DFPA 4CQAA 5C54A 3GDTA 3BGJA 3DH7A 1K3UA 2VEIA 3GXTA 1QPQA 1RD5A 3HGOA 3IIVA 4HNUA 5EYWA 1X1ZA 4Z08A 3PSVA 3W1LA 1DJNA 1OHLA 2EF9A 2P0OA 4P61A 5FEZA 3TXZA 3FFSA 4XKYB 3SECA 2CLFA 4MZ8A 1S5TA 1P0NA 3DU0A 2E5DA 5DXYA 1KM5A 2F7FA 3WJZA 1FWWA 1GVSA 1JQVA 4TMBA 3FYPA 4UTJA 5CZ0A 1X6UA 3QM3A 1S3HA 5DBUA 1UUOA 4TO8A 4JNMA 5T26A 2OZ0A 1HUVA 2QEZA 3SGZA 3GVGA 3W1XA 1GZGA 4Z0SA 3MJYA 4RZ5A 1ZY9A 1XDLA 3CM4A 3C8FA 2QCMA 3HG3A 3INPA 3FJLA 3L67A 4AF0A 4A3UA 1G4TA 3W9ZA 1OABA 3KVMA 1GTEA 4Z1CA 3C2EA 3KRSA 1RV8A 1HFBA 3G3MA 3THQA 1B9BA 3NR0A 2ZRXA 5K4ZA 3B06A 3GDRA 1JCJA 3SIZA 2ZZ7A 4ADUA 4ORIA 1KM4A 1QCWA 3KRZA 3O8AA 1R46A 1D3HA 1KV8A 3S1WA 3EX6A 4Z1DA 1GPWA 3V1PA 4POCA 2Z0IA 1QFEA 2QCEA 1AW2A 2A0NA 2ISWA 2W0UA 5G5IA 4YCOA 2AAMA 3TSMA 3W76A 4YMZA 3N14A 2OT1A 4IGHA 5HJLA 4ORMA 1VPXA 3I7SA 2CFFA 4XTIA 1K02A 2E5CA 4MFEA 5I3HA 3TDFA 3LI1A 4E0CA 4JX4A 3M6YA 1SW7A 2DU2A 3G0XA 1I8JA 4A21A 3LERA 3QEZA 4JR5A 5E0KA 3G24A 3UXAA 5LSMA 4AB4A 2HTMA 3CIXA 4O1AA 4LWWA 1IXOA 3LCXA 4KFOA 3CHVA 1OF6A 4IMCA 4GNJA 4MYXA 2QUVA 4DF2A 1U5JA 4UFMA 4LS0A 3BG3A 3UWWA 4JX5A 3CU2A 1KFEA 4OV4A 2A6LA 4GRSA 4NJGA 4O14A 4JTLA 3WFAA 3LTSA 5CPMA 4WY0F 4QISA 2ZZ4A 3DKJA 2PCQA 3OEXA 1VCFA 3B4UA 1P5BA 4YCPA 1YXDA 1JQXA 3KXQA 1KBJA 3SR7A 4AHOA 1MEIA 1RQHA 1O94A 3BO9A 4K8HA 3UWQA 1PHWA 4XTDA 3TFXA 2H3DA 4NNBA 4PTNA 4I7WA 3H53A 4I7UA 4RK8A 2A7PA 4UIOA 3UYCA 5FEWA 4AWTA 5D2VA 2CZ5A 3R5EA 1GYNA 5D2WA 4H4IA 3L5AA 3UQNA 1FCVA 4LVFA 1QR7A 4LU0A 5F2MA 1ZNNA 1ICQA 3S42A 3LCGA 1XBVA 2B0MA 1EX5A 3SFKA 3P8IA 2GVLA 1SFJA 4MJMA 4PH6A 3OA3A 3O16A 4AF0B 3ATZA 2ZRVA 2FQIA 4N6EA 4GUGA 4GUIA 2GQ9A 1M7OA 3N19B 4X9SA 4ADTA 4WY0A 2YR1A 1F6PA 4M6VA 1ZAJA 5F4WA 4NJJA 1KA9F 1H51A 1KFLA 1LCOA 2QUUA 5D09A 1H60A 3RF9A 4DPQA 5IBXA 1J4EA 2TSYA 4WXYA 3MI3A 2QAPA 4O15A 4MKNA 1QAPA 5EA9A 3VKJA 1E51A 3VNDA 2OMAA 2RDTA 2WO5A 3S5ZA 4O0KA 2H3BA 1LBFA 4GJ1A 5H91A 3AJXA 2WJZA 1AMKA 4I9AA 1W5QA 1SW3A 3QPZA 3DFTA 4O1CA 3M9YA 3CPRA 3NL6A 3ZWTA 1SPQA 3SSJA 3PB0A 2QCCA 4KFPA 1QOPA 1NAL1 4NXKA 4Q33A 5BW6A 4FX6M 1LOSA 3RLUA 1GVQA 4JIPA 4HT3A 1X8FA 2V0TA 5K7JA 2FDSA 1NSJA 4GBUA 1A53A 1F73A 2E6YA 4DBEA 4GE8A 1TTJA 5FF2A 4C1KA 5FESA 4LTSA 3W2MA 4W9TA 4EOUA 4NX0A 1OX4A 3NG3A 1IXPA 3IVSA 1OK4A 2YW3A 4XBKA 1FDJA 3P62A 1Q6OA 1W5MA 2YW4A 1G4SA 3DGRA 2EKCA 3WK2A 3BLEA 5LHFA 2VFFA 1TPDA 1P0KA 1ZALA 1TO3A 1VYPX 3TSBA 1SU5A 3W88A 1WQ5A 4AMAA 4CQ8A 3W7IA 1RZMA 4JTHA 1KFBA 1I2NA 4RXGA 1A5CA 3N73A 5C5YA 3LXAA 3GZ3A 3KAOA 3PG8A 1F74A 1EP2A 4O16A 5KINA 1B3OA 2YCEA 3PBYA 1RPXA 3HG5A 1FWRA 2E6DA 2E68A 2VFHA 2GOUA 3WJSA 4JTJA 3O1NA 2QJGA 1GTHA 3NPXA 1YDOA 2J88A 5CKSA 3B04A 3UWYA 4BF9A 3LHTA 1PV8A 2QJHA 2QR6A 2GPTA 3PAJA 4RLIA 2YX0A 3MYPA 3W70A 4D2JA 1UUMA 3HPZA 4H6KA 4UCGA 3IIXA 1JCMP 3CWNA 2ATMA 3OVRA 5IBXC 2Y88A 2ZA1A 5DLCA 4LV9A 3GAKA 4MVAA 3L21A 5I3GA 1L2UA 4FIQA 1LRQA 1BEUA 1IXNA 3W22A 4CNNA 3EWYA 3S1XA 5G2HA 1XXXA 5DELA 3TQ0A 4BI6A 5L9FA 3S0CA 4WY0B 4UTKA 4LVAA 1TRDA 2EPHA 1FCQA 3EEGA 1P1XA 2CZFA 2ZFAA 3LOTA 1YTEA 5D2YA 4NU7A 3LI0A 3FKRA 1H63A 4BI7A 1F05A 4O4WA 4IMEA 1VYRA 2YDAA 3IEBA 1YDVA 4O54A 3U2OA 2A85A 1SQ7A 2X1SA 2Y6ZA 1JR1A 3LV5A 3GYEA 4MOZA 1MXSA 1N55A 1QMLA 1K7EA 5TQLA 3M16A 4K7YA 1MEHA 1GEQA 3W1PA 4CCDA 1YTDA 4RKAA 3BG5A 4WOZA 2Y89A 2FJKA 3ABRA 3CEUA 1ZHAA 3R8RA 2DZTA 3BG9A 5IM51 1G6CA 1QO5A 3NQEA 4DELA 1FDYA 1QOQA 3GIYA 3PY2A 1HO1A 5TIMA 3LRKA 3RU6A 4AWUA 5D32A 1L9WA 2Q3RA 4CNOA 4N02A 4OE7A 1P4CA 7TIMA 5AYXA 3LXBA 3C6CA 2ZYFA 5I3FA 3E12A 2V8ZA 1OX4B 4L4MA 3QSTA 4MYAA 1D3GA 5G1TA 3MMTA 1Q6RA 4LS1A 3L0GA 3U6WA 4FIRA 1A5AA 3TFCA 3S5YA 3MUXA 4GUFA 4N2YA 5E1QA 3NZRA 2I14A 3H54A 4TX9A 2EGZA 3S1VA 2JKAA 1OFOA 1ICSA 1NF7A 3HGRA 4K38A 3C52A 1JULA 4JICA 4O19A 2QCFA 4LVBA 1SZFA 4N9EA 1LRTA 4OBTA 4CQ9A 4TIMA 3PS7A 1VLIA 2I9EA 4ZQCA 4NQ1A 1SSDA 1OFPA 1W1ZA 2BWGA 1YADA 4LVDA 4AWSA 2ZZ3A 4JTIA 3L0KA 3R12A 1TTIA 4U4MA 1XL9A 3M44A 1XBYA 4ZQNA 4Y6GA 1KM2A 3DFSA 1K8ZA 3EXTA 3G0UA 1VHCA 4N4PA 3B0PA 1OG0A 4JY8A 2C19A 1PVNA 3GDLA 3LXCA 1OFBA 8TIMA 3EX1A 3LHYA 3NEVA 2Y7DA 1Z48A 2FTPA 3AO0A 1Q45A 3LGEA 4HIBA 4NUWA 4AH7A 3B03A 5CZJA 2RH9A 2RDWA 2OT0A 3GKAA 3QMRA 5F4SA 4NX5A 5D02A 2PRMA 1H62A 3VE9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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