2Y89A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase a (variant d11n)
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
244
structure length
240
Chain Sequence
MPLILLPAVNVVEGRAVRLVQGKAGSQTEYGSAVDAALGWQRDGAEWIHLVDLDAAFGRGSNHELLAEVVGKLDVQVELSGGIRDDESLAAALATGCARVNVGTAALENPQWCARVIGEHGDQVAVGLDVQIIDGEHRLRGRDGGDLWDVLERLDSEGCSRFVVTDITKDGTLGGPNLDLLAGVADRTDAPVIASGGVSSLDDLRAIATLTHRGVEGAIVGKALYARRFTLPQALAAVRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bisubstrate Specificity in Histidine/Tryptophan Biosynthesis Isomerase from Mycobacterium Tuberculosis by Active Site Metamorphosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHORIBOSYL ISOMERASE A
molecule tags Isomerase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 72
structure length 240
sequence length 244
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2y89A00
1QCWA 1H7PA 3EX1A 5DY3A 4N4QA 3TDFA 3LV6A 1DKWA 4UCGA 5D30A 1P1XA 5K4XA 1DJNA 3DHFA 4MLRA 3AO0A 3P84A 2F84A 1WXJA 1I8JA 3PULA 4LWWA 4ZQRA 1EA0A 4OHQA 4WOQA 3T55A 4XBSA 2YX0A 4UTJA 3WJYA 2ZZ1A 4NJKA 3S8HA 5LNSA 4MKNA 2FTPA 3WJWA 3LBCA 1VYSX 3EWUA 2FPVA 4QJ1A 2RKXA 4K8EA 4Z1CA 3GR7A 4NZFA 3NQ8A 1G4PA 4NJHA 2V82A 3GVGA 1S5TA 3NNTA 1X8FA 2GVGA 2A6LA 1WYIA 3W7RA 4O1AA 1K7FA 2J24A 2WV8A 1RVGA 4UFHA 5AN7A 2V5LA 1JUEA 1VRDA 2OJPA 4CCDA 3GXTA 3HGSA 4IXXA 1EWEA 3LHYA 3GR8A 2EAWA 2J9ZA 4KFPA 4BWLA 3FJLA 1JQVA 3NO5A 1TQJA 3ABRA 1DQXA 2DJXA 4YLWA 4NQ1A 1NVMA 1K02A 4Q33A 5D04C 3EX3A 3BK0A 1RQBA 4K8HA 2ABBA 1FCUA 3MBFA 4FX6M 1S5WA 3HG2A 2OMAA 3W2LA 2A7NA 1PS9A 1PE1A 3V75A 1I2NA 5KSWA 1JULA 3C2VA 3CIXA 5DBUA 5U7SA 3GXNA 2QEZA 3NL3A 1FWNA 1FCQA 3IGUA 3OG3A 4O1BA 5I3FA 2VEPA 5FEZA 4Z1AA 3M7WA 3W23A 4YCOA 1GTEA 5DXYA 4KWVA 2I14A 4PCFA 3NQAA 1SZNA 3LXCA 1IF2A 5KINA 3B8DA 2ZRXA 2ISWA 3HOJA 3ATYA 3P74A 2C14A 4UTTA 4W9TA 3LOTA 3DFSA 3LCIA 2DJLA 3W7KA 1TJRA 1L2UA 3TAOA 1YPIA 2NX3A 1LZOA 4UIOA 4UTLA 5IBXA 1S5VA 1G7UA 1VQTA 5BW6A 3NG3A 2TMDA 3W7IA 1THFD 3SZ8A 3M47A 1V7YA 3F4NA 4QNWA 1I2OA 5AHFA 3EWWA 3NQCA 1ZHAA 3L66A 3TKFA 4Z1BA 4FX8A 2CWNA 4MYAA 3OHIA 3M1ZA 3NPXA 2FQIA 1PCKA 4DXVA 4UNKA 2P0OA 4GE8A 4E38A 3S9YA 3NXFA 3GDLA 3UWYA 2Q8LA 3IGSA 3CT7A 1OX5A 2H8ZA 2ZZ3A 3LHWA 4JTJA 1LROA 1CW2A 2QCEA 1HO4A 3EXTA 2GPTA 4XZ9A 2EHHA 4AWSA 2B7PA 4X2RA 3W3OA 4FNSA 3FOKA 3MJYA 3SIZA 2YZRA 3K30A 5I3IA 2O7QA 2QKFA 1EP3A 4M6VA 4BR1A 3TCEA 1FDZA 2EKCA 4JS3A 3FS2A 3MUXA 3CM4A 5FF2A 3QC3A 4LOCA 3DFPA 1XUUA 1XKYA 3CQ0A 1H5YA 1NF7A 3T7VA 3TE9A 1HTIA 1VHCA 2QAFA 1KLYA 3GDTA 3TMLA 3UXDA 4FNRA 4O0ZA 1TV5A 3N2MA 1PHQA 3P61A 3NQ6A 3DFOA 4LUJA 1SFJA 2CLOA 2VFFA 4O11A 4TR9A 4OU1A 3BARA 1WA3A 3O8AA 3W74A 4ZQCA 1XBYA 3R89A 4RJEA 1FCBA 3LLDA 5BNKA 3GKAA 4I9AA 3SW6A 1X1ZA 1XXXA 5KITA 1SW7A 4Z08A 3QEZA 4WD0A 4XTIA 3W7LA 1VLWA 1LDCA 3NM1A 2BTMA 1YXYA 5EPDA 4FXRA 1GT8A 3M9YA 3C2OA 4UTIA 1TPDA 5EL1A 1SW3A 1L9WA 2Y62A 4GC4A 2VC6A 1AL7A 3W1MA 1NAL1 3BG5A 5AHMA 5EYWA 1FCVA 3QYQA 1KW1A 1TPUA 2CZEA 3BW3A 3G1DA 2JKEA 4JDBA 5T26A 1X7FA 3LRKA 2VELA 4BF9A 3CB8A 3T44A 1G4EA 3ZWSA 4PL1A 2X1TA 5D09A 1W3TA 3IVUA 4K6AA 2PE4A 3LCLA 4JX4A 4L4MA 3RLVA 1WOAA 3MI3A 3STCA 3UXAA 3PAJA 2C3ZA 1YXCA 4UC5A 4JYFA 2J6XA 3OA3A 3WK3A 1YTDA 4JXCA 1L6WA 1Z44A 1KFJA 1TMHA 4ZQNA 5DLCA 3ZFHA 3GB6A 3QPYA 4MOZA 3FA5A 1QPOA 1OJXA 1XM3A 3E02A 3LCGA 5D05A 3TSDA 3GZ3A 5GVJA 3DKJA 4PTNA 1TPB1 3B4UA 4FIQA 4JNMA 4XUGA 1K3UA 1BWKA 1W0MA 1DORA 3W7EA 4A29A 4A22A 3KXQA 5C5YA 3GDMA 4IOTA 1OYBA 3TUUA 5DBTA 5F2LA 3A9IA 1JCYA 4FEZA 1OF8A 1LYXA 2J9XA 4K36A 3UPWA 4RZ6A 1ZY9A 3LCWA 3W7MA 3L65A 4CNNA 5KZEA 1SUXA 3P80A 3LXBA 2ZA2A 3DU0A 3GIYA 4GBUA 4OGZA 5DELA 1MXSA 2J88A 4Y8FA 3W2UA 3S1XA 1Q45A 1TPFA 2J9YA 2BWGA 3C0JA 3DFQA 2B0MA 3MBDA 3E96A 2C19A 4DF1A 1KM1A 3H53A 3R2GA 1PVNA 4N4PA 3ATZA 1DHPA 3E49A 3U2OA 5G4WA 3NAVA 4DPQA 4K7YA 3QMSA 3QMRA 3W7HA 4MYXA 1H61A 3O15A 1MEHA 5LHFA 1YPFA 2G95A 3M41A 1XCFA 4DBEA 3F4WA 1B4KA 3N73A 5E1QA 3M5YA 1YLVA 5CGQA 4ADSA 5G2IA 4MY9A 3DH7A 4M6QA 2QJHA 2C13A 5C54A 4DO6A 1W31A 3EXSA 2R14A 4TX9A 5HJLA 3MP4A 1JQXA 3TSBA 1ICQA 1M6JA 4R34A 3OBKA 3EX6A 3PUOA 3MHGA 5AOUA 2NX9A 3CC1A 3S6DA 3R5EA 2GJNA 2NUYA 2HS8A 1H62A 3EWYA 1SO3A 4IMCA 1VCGA 1GVQA 1IXOA 3IIPA 1OHLA 3CIWA 3UWZA 5F2GA 2C15A 3QRHA 4XKYB 2TSYA 1TPEA 4CLMA 1P5BA 4X9SA 1W5MA 1W1ZA 3EXRA 3W73A 2D73A 1KV8A 1XI3A 1TPC1 3IGXA 4N9DA 2H3DA 5DY2A 1T96A 2W0UA 2DORA 3G22A 3MHUA 1OYAA 1YYAA 4R53A 4YMZA 3LBMA 1ME9A 3P62A 4NXSA 3TMQA 5AFDA 3LTSA 4DBDA 3W7PA 3VNDA 2NLIA 5AYYA 1W3NA 2ISVA 3HG4A 4HPJA 4QNEA 1ALDA 1XBZA 1JUKA 2TRSA 1YADA 4ZQMA 1I45A 1SR9A 4WX2A 2A7RA 2E6FA 1E51A 1I2RA 3PG8A 1T0OA 4WUIA 2BXVA 1H50A 4N6EA 3S1VA 3BW2A 2QR6A 4ONVA 1GJPA 3P82A 3GAKA 2CLKA 1JCMP 1W5PA 1JUBA 1YTKA 2Y85A 1TIMA 5FF3A 4IMDA 3THQA 1KBJA 5D2YA 3I68A 4CCCA 1SU5A 1V5XA 3P8IA 3KVLA 1X6UA 4NVTA 2H3BA 2CW6A 3A5FA 3SECA 4QAIA 2ATMA 2C18A 1ZALA 3EX4A 3C52A 1SO4A 4GJ1A 4QISA 5HUOA 1D9EA 3VI2A 3S42A 2Q3OA 2ZQ0A 2R94A 3KAOA 3EWXA 3R8RA 3W1RA 2JKAA 5HMSA 3T4CA 1XL9A 2Z6IA 1RPXA 1FUYA 3SGUA 4HPXA 2Y7FA 3KVMA 3NQDA 1H51A 4K39A 1VH7A 2QCNA 4IXHA 2R8WA 5DCBA 4JTIA 3O63A 3EX2A 1LBMA 5G1TA 2W6RA 2ZZ4A 2C6QA 3O1NA 4UTHA 4GFSA 4S2CA 3W84A 5CZJA 3C8FA 4LY8A 2QAPA 1NSJA 5D02A 2DZTA 4N02A 3U8GA 1QO2A 2Y6ZA 2A5HA 4AHQA 2QCGA 1OFRA 2E1DA 1GPWA 1B57A 1H60A 3O07A 1FXQA 1XFBA 3IVSA 1VPXA 3CHVA 1HL2A 2EPHA 1DQWA 1RQHA 1NF0A 4JGDA 3QQ1A 4QM1A 3FJ6A 3M44A 7TIMA 3MHFA 1U5JA 2QUVA 5CZSA 3RF9A 1FWWA 1GVRA 1X1OA 1OG0A 3JS3A 3QF0A 4ORMA 4O15A 1FDJA 3W87A 4MY8A 2DZWA 3M16A 1TO3A 4JYDA 1LOSA 4XBKA 4HT3A 3OVRA 2Z0IA 5EKYA 3H54A 5C2XA 4O52A 4HSNA 4XKYA 1ME7A 2FLIA 2C1HA 5HINA 3E9AA 2ZTJA 5HR6A 4JYEA 3W6YA 5D2WA 1LBLA 1YXDA 1ONRA 5FESA 5KZMA 1XBXA 4UFKA 1MO0A 3N14A 3W2MA 4HSOA 3N19B 1VYPX 1CX9A 5EA9A 2FIQA 3P67A 1R2TA 1W3IA 4WJEA 4IPIA 5K9CA 3ABSA 1XDLA 2PC4A 5LKYA 4JDYA 2VKZG 2FDSA 1GOXA 2NXHA 5K9XA 1VYRA 3EKZA 4N6FA 3SFKA 3NPWA 2ALDA 2V2DA 3LCHA 3L2IA 2ZZ2A 1KTBA 4IUOA 3G1XA 3W07A 3BG9A 1C8VA 1ZFJA 3HMJG 1EIXA 1GVOA 4NNAA 4ZQOA 2CZ5A 3PBYA 4MY1A 2VFIA 3AJXA 4MZYA 3THAA 5K3VA 2Y7EA 5CZTA 1OFQA 3EKLA 3NL6A 3OEXA 3C4UA 3DBPA 2FPYA 4QITA 1F05A 3C56A 1JCNA 1G4TA 3HPXA 1A5CA 1R2RA 1JR1A 3NQMA 1O95A 1OX4B 4ZQPA 5BOOA 3KX6A 3QSRA 3ZS4A 3W22A 1ML1A 1P0NA 4R7JA 4IMEA 1GEQA 3G1VA 1D3HA 1XC4A 2XN2A 2UV8G 1KLZA 4R33A 3CEUA 4Y96A 4O4WA 6TIMA 3W71A 1QFEA 3W1NA 5IM51 4ZVJA 4KFOA 5G5IA 3S5YA 1O60A 4PFMA 1FXPA 4YCPA 5D38A 3LB0A 4UXDA 2PRLA 1OFEA 3CWOX 4UFJA 2HTMA 2NWSA 2A7PA 2O7SA 1ADOA 4JTFA 3UWUA 4WXZA 4AVFA 4NJIA 3WJSA 5CPNA 1SPQA 3LM7A 3GXPA 4TMCA 4RZ4A 2ZDRA 1A50A 1KFBA 1QOQA 3MYPA 1ICSA 3DGRA 1RD5A 3PR2A 4ICNA 3DAQA 2B7QA 3W1QA 2CLMA 5HWJA 5EBUA 2YDAA 1PCWA 3GKFA 2JBMA 1G4SA 1FQ0A 4H4IA 4ZMGA 3FIGA 4RK8A 3O16A 2B7OA 4IQLA 2TYSA 4LC8A 3TXZA 1N55A 4IX0A 4WY0B 5F1UA 3UD6A 2OZ0A 2YW4A 2AQWA 3TH6A 1N7KA 4RKAA 2P1FA 3LX9A 3TC6A 4Y6GA 2ZZ5A 5F2MA 2V8ZA 2G97A 5KMYA 5D2TA 1PV8A 2A4AA 3CLMA 2GQAA 4WXYA 3B04A 5E93A 4O14A 2ZFAA 4KFNA 2V5BA 3LRLA 1Q6RA 5CPOA 2A6NA 2OCZA 4OV4A 2R91A 4C1KA 2QF7A 4DF2A 4UFMA 5G2HA 1J4EA 4UR7A 2GVJA 4O50A 2I1OA 4Z1DA 1WAUA 4TIMA 2DZVA 1TV7A 4Y90A 2VFGA 3PBVA 1EUNA 3SR7A 3LHZA 1WBJA 3P8JA 4JX6A 3V1PA 2NUXA 1LCOA 4JD4A 4RX0A 3JR2A 1Q6LA 3BLIA 3A21A 3E0IA 3WFAA 4FNQA 1SZFA 3G0UA 3MMTA 1L6YA 2V2HA 3WK2A 1ZENA 3G1HA 4FNPA 4WY0F 5FEWA 3ABQA 4O16A 5D2XA 1YTEA 2V30A 2AGKA 5AHNA 3W88A 5AHEA 2BX7A 5HUPA 3TV8A 4UTWA 1MSSA 4OBTA 2P10A 3EEGA 3VE9A 5J5RA 4JTGA 3DKLA 3MI6A 4O19A 1O94A 2ZA1A 4RXFA 2YCEA 3U6WA 3LERA 3SI9A 3WJXA 2KZHA 1SFLA 2QCDB 1D3GA 3O6YX 3CWNA 1RR2A 3CU2A 3G1SA 3SGZA 4KKXA 4A2RA 1OX4A 1JCJA 5HWNA 3NZRA 5AHIA 4CQ9A 2PRHA 4A3UA 4BWLC 4QIUA 4ORIA 2BSLA 4UNLA 3KVKA 3FEMA 1PIIA 2QCLA 1QR7A 1EB3A 2Z6JA 3NDOA 1TTPA 3Q37A 1DL3A 3C2RA 5FEXA 4AHPA 4BFAA 3DI0A 4IWWA 4NXKA 5U4NA 1UUMA 1K03A 5HULA 1F2JA 4DO5A 3RK8A 2YYTA 3KRZA 1F6PA 3DENA 3M0ZA 1H1ZA 2HMCA 2EF9A 4GUJA 3D0CA 4I7WA 3UPBA 5I3KA 2HSAA 4E0CA 3QW3A 2QDHA 3PG9A 3NQGA 3MO7A 1WDWA 3W2JA 3W9ZA 2A0NA 3P5ZA 1QNVA 1UB3A 1FDYA 2C0AA 5F4XA 1P0KA 3M43A 4AF0B 1AL8A 4YWIA 4O13A 3GX9A 2X30A 4JEQA 1TPWA 4U28A 3IIZA 1KM4A 4MUZA 5K2ZA 3OVPA 4ALDA 4DEFA 3S1WA 4LS0A 3FYPA 1RQEA 5I3JA 3L5MA 4NU7A 3NM3A 1G67A 1LRNA 3C2EA 3G3DA 2DZPA 3TFCA 4QQ3A 1UJPA 1TCDA 2WNZA 5IBXC 2Q3RA 4GUIA 3HG5A 3UWVA 3B05A 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 3TC7 A;  5A5W A;  4CQ8 A;  4EWN D;  4P2V A;  1YDO A;  1KA9 F;  3BLE A;  3GAY A;  1KTN A;  4XQ6 A;  3UZJ A;  1B4E A;  1PHW A;  4LS1 A;  1CI1 A;  2YR1 A;  2JGY A;  2Z2U A;  1EP2 A;  1R2S A;  4JTH A;  1J2W A;  1MEW A;  4IGH A;  4UTW C;  1QDS A;  3H55 A;  5AB3 A;  3TRO A;  1KFE A;  5SWU A;  5AC8 A;  3SSJ A;  1SZE A;  1UUO A;  3S1U A;  1UAS A;  3W7J A;  3MYO A;  2DZU A;  3PWA A;  1DBT A;  3DFT A;  1G7V A;  2H6R A;  3HPS A;  5FF7 A;  3DZ1 A;  1LOR A;  3B0U X;  4MJM A;  1EP1 A;  1S3H A;  2E6A A;  3SY5 A;  4IX2 A;  3Q94 A;  4B5N A;  4H6K A;  2G96 A;  4PEK A;  3F1Q A;  2WNQ A;  1F76 A;  3W1P A;  3BV4 A;  4O18 A;  1OK4 A;  3B03 A;  1M5W A;  4FNT A;  1NFB A;  5LGZ A;  2GVL A;  4UFI A;  1Z42 A;  3CTL A;  4POD A;  1F73 A;  3EB2 A;  3PBU A;  4UMC A;  2RDW A;  4GUG A;  2AAM A;  2I9E A;  4N2Y A;  5C55 A;  4LVD A;  4TU1 A;  4BI5 A;  2QUU A;  1GVS A;  4JTU A;  5CKS A;  1TRD A;  3N3M A;  3HGO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1H7P A;  5I78 A;  3KRB A;  3EX1 A;  3POH A;  3ONC A;  4N4Q A;  2X40 A;  3TDF A;  1RP9 A;  4JNZ A;  2QV4 A;  3W4R A;  3WH8 A;  4UCG A;  5D30 A;  4B2D D;  3OBE A;  3AYT A;  3A4W A;  4KET A;  2EPO A;  1HKW A;  2HK1 A;  1EX1 A;  4X60 A;  2F84 A;  1WXJ A;  3V4B A;  1QBB A;  4EX4 A;  1EL3 A;  3MDU A;  3UZX A;  1R3W A;  3KBN A;  5HMF A;  4H9V A;  4LWW A;  4OHQ A;  3T55 A;  4XBS A;  2ZXB A;  2ZZ1 A;  2C7F A;  3BZJ A;  3MUC A;  3LBC A;  1VYS X;  4BHY A;  3TZN A;  2GGE A;  3SQL A;  3VAV A;  1PZ1 A;  2PSN A;  5ECV A;  1E9Y B;  3F4C A;  3R10 A;  5H8P A;  4O1A A;  4UFH A;  1VRD A;  3LHY A;  2J9Z A;  4FXJ A;  2VI0 A;  4JCL A;  1RLC L;  3NO5 A;  4BWL A;  1TQJ A;  4B92 A;  3WQP A;  3ABR A;  3BSG A;  3CZG A;  4KEU A;  1XJB A;  3KW3 A;  3TYZ A;  1JI1 A;  1TZ9 A;  3IS4 A;  3WQ8 A;  4Q33 A;  1B5T A;  3BK0 A;  1M68 A;  2ABB A;  1H2J A;  2IQ0 A;  4FX6 M;  1BXB A;  2OMA A;  2AMG A;  2VCB A;  1I2N A;  4PMQ A;  5U7S A;  4QLK A;  1FCQ A;  4XZL X;  2HVM A;  3ARQ A;  5I3F A;  3N2T A;  2B31 A;  3W23 A;  1GTE A;  2X0Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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