2Y8V | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	280
structure length	280
Chain Sequence	PEHRRVICYHQTLCPNRGDYVSVLPLVKNNTGVTHIIIAAFHLNEDPGHITLNDDPPDHEMYNPLWAEVPVLKRSGVKVMGMLGGAAQGSYRCLDGDQEKFERYYQPLLAMVRRHQLDGLDLDVEEEMSLPGIIRLIDRLKLDLGDDFIITLAPVAAALLGIGNLSGFDYRQLEQQRGSKISWYNAQFYNGWGLAEDPRMYAAIVAQGWSPQRVVYGLLTNPGNGSQGYVPRERIGPVLAVLVEQFPNFGGVMGWEYFNSIPGEQQSPWQWAAEMSLSMH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Aspergillus fumigatus
publication title	Structure of Chitinase, Chic, from Aspergillus Fumigatus. rcsb
molecule keywords	CLASS III CHITINASE, PUTATIVE
total genus	93
structure length	280
sequence length	280
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date	2011-02-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2y8vA01

1TVNA 1EQPA 5A8NA 4KGLA 1JAKA 3AHZA 4UQEA 2BY1A 2OYMA 5CLTA 4F9DA 2CBUA 1D7FA 1UQYA 1CXEA 3PZNA 2J7EA 1UD6A 4MADA 4X9YA 4QLKA 2CETA 5C70A 4FLQA 5A6MA 5D9PA 3VGDA 3SCOA 1W1PA 1B3ZA 3VMNA 3PTKA 1GZJA 4J3TA 5FD0A 2WZEA 3WNMA 5I78A 1QHZA 1A3HA 2EQDA 1XSJA 2ZUSA 3ZIZA 2JE8A 4AZCB 2WC3A 1AQMA 1PAMA 1JZ8A 4PCSA 4HZ6A 1KWGA 1JZ4A 3WEMA 3AS0A 1D3CA 4TTGA 5ABFB 1E73M 2V3DA 5DMYA 1KCKA 1K9EA 1FFRA 1UWRA 4P7LA 1GNXA 2OLHA 3QOMA 3I3BA 1HJVA 3E1F1 1Y7VA 1CGTA 4WSKA 3VDAA 2DIJA 3RO8A 3WENA 1LL7A 1E1EA 2IUZA 1QI2A 3ARYA 3U57A 2C0HA 1WE5A 3U7VA 2DSVA 1NWRA 2XHYA 2YBTA 4OBRA 3VX1A 3ZT7A 4UFLA 4KRUA 4V2XA 1ITXA 1E6PA 4PMUA 3N04A 3WBAA 2G41A 2V3GA 3G6LA 1W32A 5BCAA 1JFHA 2DDXA 5DFAA 2FH8A 3ARSA 1RP9A 5JBDA 2OWWA 1HJQA 3VIKA 1L8NA 5E09A 3SCRA 5CJ5A 2QPUA 4AIUA 4M81A 3AMDA 1UWUA 3M46A 1CBGA 3MV11 1E6SM 3BAXA 2G3MA 3CZEA 5IFPA 2EJ1A 2JIWA 1HKKA 2WMJA 4CU7A 3WEOA 1Q6GA 2W92A 1U30A 5HBFA 1W3JA 1C8YA 2OYLA 3IJ9A 4C7FA 1VAHA 5A94A 2JIEA 4E8CA 3W37A 3CH9A 1W2VA 3CMJA 2CEQA 4MB4A 4X0NA 1KQYA 2J74A 3WEZA 5M5DA 1FH9A 4B16A 1KXVA 2XSBA 1DWIM 4CGTA 1W9VA 4JL1A 1PZ3A 5I3DA 4V27A 1JYVA 3A3HA 1XD0A 3VIOA 1B0IA 2DT0A 1BQCA 1GQKA 1E4LA 2FHBA 3AHXA 5ECUA 1CDGA 3MO4A 1QVBA 3ZJ6A 2W4XA 4NI3A 1OGSA 4J27A 3POCA 3UG5A 1E4IA 1XSIA 2WBGA 4YHGA 3GNRA 3RILA 1QBBA 4UFIA 1E4MM 2BVYA 3WF3A 1SYTA 1CXKA 1OT2A 3NCOA 4GO9A 1BGAA 2WK2A 5CGMA 4ZFMA 5LA2A 3MSDA 1Q6EA 4JKLA 1HJWA 1VEPA 3ARTA 2NSXA 4JKMA 4M29A 1H41A 1VEMA 5FL1A 1B3YA 4F9JA 4W8BA 2D3NA 3UR7A 4M8UA 2WHKA 2JEQA 4W88A 2BVTA 5A3HA 4PTWA 4Z2GA 3VINA 2D0FA 5IFTA 3L4WA 1V3JA 3VPLA 1JD9A 3WQ5A 4LGXA 1J9YA 2J4GA 3HN3A 3UETA 5I6SA 3A4XA 5DT5A 1BYAA 2WCAA 5D9NA 4U3CA 2D22A 4BF7A 2BFGA 2VRKA 1CTNA 3BC9A 1DP0A 3ZR5A 2YL6A 1QI3A 3TTOA 1LJYA 1E1FA 3WUBA 1JGIA 4CCDA 4FLSA 3SUTA 3VD5A 4S3JA 1BSIA 1QW8A 1J11A 3M07A 2YIHA 2EXOA 5A6LA 4MDOA 5EFFA 3VIHA 1Q6FA 4JFVA 2JEPA 1UD5A 4W5ZA 4AZGA 4ACZB 2VCAA 1E56A 3AJ7A 1CLVA 4YPJA 1QHPA 1K6AA 2D20A 2CCRA 3EDEA 1MW2A 3AHVA 5CSUA 1JI1A 2YL5A 1DWJM 4C7GA 3AZRA 4WK9A 2DT2A 4PBGA 2A3HA 3MANA 3ARVA 7A3HA 3PZUA 1KBKA 1QW9A 1ZBCA 2PBOA 1HVQA 3AQUA 2WAGA 2G3NA 4HP5A 2DQXA 3F5KA 4UFMA 1E5NA 3HJEA 5ABGA 4CD7A 3T2QA 3ZM8A 5A6BA 4H2CA 4AZHA 3GBEA 4W87A 3WIJA 1HL9A 4NF7A 2WW5A 3CPUA 1SFSA 3CUFA 4PYSA 4OKDA 2XIBA 3DYMA 4NSBA 1XCXA 3WBEA 3O6AA 3DYPA 4E4PA 1B3VA 4P8VA 3OLDA 4J7RA 1R8LA 5BXTA 5A8QA 2GSJA 5HPOA 1OGBA 3DHPA 3WQVA 2OYKA 5KEZA 1CXFA 1W3KA 2W66A 3AXXA 4OUEA 1US3A 3IAQA 1W9BM 1VFFA 4JCMA 4AWEA 2CIPA 4K68A 3I3EA 4JKKA 4W5UA 2PF0A 5CSYA 2FHFA 4DUXA 4WF7A 1UWIA 1LF1A 3WQ8A 5A8MA 3ZMRA 3DECA 5HOSA 3L4VA 4OOZA 1BGGA 2X0HA 1UR2A 3AXHA 1ZJAA 5M17A 1SR0A 2PWEA 2J7HA 1GOKA 4J3WA 2W5FA 2X0YA 3CZLA 2VTFA 3WDRA 3W27A 1F4HA 1KQZA 2DH2A 4BS0A 1CNVA 2ZIDA 4M82A 2WCSA 2Y5EA 1VBRA 3ZQ9A 1VJSA 4PUEA 1O7AA 1H09A 1XV8A 1MW1A 3WDIA 2XVPA 5F7UA 3N9KA 4WLCA 2FDMA 1JG9A 4CN6A 3CTTA 1E43A 1UD4A 4EE9A 1WZKA 3EDJA 2E0PA 1E9LA 2J7BA 4MTVA 1V6VA 2CHOA 3ARQA 4QAWA 1E15A 4WKAA 1CXHA 1M04A 2W61A 2YOCA 4W7VA 4TTUA 5E6ZA 1BLIA 1G0CA 1HJSA 1JAEA 1C90A 4W8LA 3M7SA 1H11A 1Q6DA 3VDBA 2EPKX 1V3IA 3AIVA 2Y8KA 4H41A 3N17A 1G94A 1WDRA 4D6GA 2WYSA 1OIMA 4AD0A 5EMYA 2BNJA 1KCLA 1DTUA 3NDYA 2ZUTA 2J7GA 1M03A 4UOJA 3PZGA 3CZGA 4QLJA 1GQIA 3AIUA 1NM9A 3ALGA 1HL8A 2WZHA 1I1WA 3LPGA 5A95A 3WQ4A 4CKQA 1PJ9A 1UH3A 4CU8A 1EHNA 4MB3A 4AW7A 1FP9A 2XWEA 3FW6A 4GZIA 2E4TA 1LQ0A 2XTKA 1C8QA 2A3BA 4J28A 1QOXA 4W89A 1GJUA 3B9DA 1KXQA 3ARPA 3QHMA 1LG2A 2JALA 4AD4A 1PPIA 2GK1A 2PB1A 1V0LA 4Z2JA 2WHMA 4HOXA 2YA2A 4D71A 4AZBA 4U3AA 4CD4A 3AS2A 1JZ2A 1UWTA 4UFJA 1MW0A 2XFYA 2AOSA 1QPKA 1VFOA 3WF2A 2RGLA 5D9MA 4U5IA 3OA5A 4IUGA 1VF8A 1ZBWA 2YL9A 1XD1A 1IT0A 4WIWA 3GYCA 4TVCA 1VRXA 2ZX6A 4D72A 3GXFA 1B1YA 1JZ5A 2J77A 3FHQA 3W82A 4PRWA 4TUFA 4MNLA 4M56A 5JBEA 5E70A 1MVYA 1KGWA 2GJPA 2J8FA 3WN6A 5HPCA 1EDTA 2XPKA 2FHCA 1V3KA 4P7OA 1E6QM 3VGEA 4UR9A 3VD3A 3CHEA 1ISZA 3N13A 1ZJBA 4AD1A 1VFMA 2PI6A 3DHUA 2WMIB 4XX6A 2DT1A 1FFQA 3RM8A 3ZT6A 1GPFA 2WBKA 3F5JA 4UQCA 2CNCA 2W91A 3AMKA 3D3AA 4CN4A 2DIEA 2F8QA 4MNMA 2YBUA 4RL3A 4HOZA 4DWSD 3RM9A 4BZYA 3WF1A 5D4YA 3MUY1 1JF5A 3WMSA 4GI8A 5E9AA 1US2A 2EPLX 3W26A 1NWSA 2YLAA 4LQ1A 1JYXA 1CXLA 3AZTA 1LWJA 4PMOA 2X05A 2GJRA 3WELA 2HVMA 2WMFA 1OM0A 7TAAA 3ARUA 2VR5A 1JFXA 3CHCA 3DYOA 5JIPA 2VR4A 1J18A 2E8YA 1GOIA 3AMCA 1BG4A 1EQCA 1CWYA 5CG0A 2Q8XA 1WO2A 2IXUA 5I77A 5I0DA 1CPUA 3HU7A 3OGRA 2YJQA 1W2PA 2VQUA 2WMKA 4CCCA 4NRRA 2V38A 1GORA 4LYQA 2WXDM 1VB9A 2FH6A 2XSAA 2GJXA 4Z2LA 1X1NA 1HKIA 3CZKA 3AIBA 1YQ2A 2XIIA 4NRSA 3QHNA 4GQRA 4ML4A 1CECA 3AROA 3VIJA 4D6HA 5M3WA 4UOQA 3IJ7A 4W7UA 4PMRA 2JF7A 1EDQA 1WKYA 4PSRA 3WKZA 1PX4A 4ZEPA 1MWOA 5A6BD 3PZVA 3BMWA 3U5UA 1JIBA 1UWSA 3K1DA 3WDQA 2WVUA 1F4AA 2XFRA 4LYPA 4Q7NA 2YDSA 5A2BA 4PMVA 5IHSA 4FMVA 5DT7A 3VIFA 1UR0A 2VO5A 1K9FA 2WVVB 4UZSA 2PBGA 4JHZA 3EMQA 3B8SA 2J25A 2PWGA 1BHGA 4X0VA 2GFTA 3WQ6A 4DWSC 3OGVA 4OOUA 4CU6A 3CHDA 5A6JA 5E6YA 4TOQA 3B9AA 1JXKA 1BVNP 4V28A 3WH9A 5BXRA 1V3MA 4B3LA 1XGZA 1HP4A 3KL5A 1WZMA 3SUWA 1IZJA 1JYWA 1J01A 1J0YA 1WP6A 4QFUA 3MMWA 4OBSA 5E0CA 3T08A 1UD2A 4HZ8A 1GHSA 1UYQA 4AC1X 1BAGA 1GVIA 1JYNA 4XZWA 5I79A 4EKJA 4RE4A 1QHOA 1OSEA 4PMZA 3K4DA 1XH2A 2NT1A 1CXIA 3ZSTA 3GH5A 4WJXA 5DF0A 1UZ4A 3MUAA 2BV9A 2WPGA 2XVGA 1J10A 3BLKA 1C91A 1GOMA 5JBFA 2BY0A 2BVDA 1N82A 3BLPX 2AMGA 1V0KA 2F2HA 2Y4SA 4BQ5A 3BAJA 4TVUA 1NP2A 1GONA 1MXGA 1HN1A 3FN9A 4HA3A 4ZE4A 1BYBA 1V03A 2VRJA 3AHTA 5CPTA 1QNRA 1UKSA 2WVTA 3WNOA 3WD2A 3PTQA 3WL1A 3PHAA 2OSYA 3A6OA 2AAAA 4OJYA 4GIAA 4LPCA 2BXZA 2WLYA 1E0WA 3LPOA 5FCZA 5BRPA 3CUJA 4H8VA 1ISWA 1K9DA 2EBNA 3SCSA 5E0FA 3F5LA 2VCCA 3FNDA 3RJXA 2ZX8A 2XFFA 4WKFA 5I5RA 4HOWA 4QDMA 1VFUA 1RPKA 2B31A 2JF6A 3SUVA 4MB1A 4WKHA 3KEHA 3RDKA 3WD0A 1GOWA 3OBAA 3A4AA 4PMXA 3W28A 1BFNA 4KGJA 3W0KA 1UH2A 2G3IA 1QNPA 2WHJA 2YDRA 6CGTA 4ACZA 1EH9A 3WUEA 3AYRA 3GXDA 1E72M 5BWFA 3BAKA 5D8WA 1HJUA 3UG3A 4A3YA 2VZOA 1OCQA 2ZICA 1J12A 5D8ZA 4F8XA 5I24A 1W3LA 3FY1A 3VD9A 1V0MA 4D6FA 3OLEA 4HU8A 1FHLA 5HDRA 2ZWZA 3THDA 3O9NA 1UR4A 3G6MA 5GQBA 1JZ7A 3QR3A 1CGVA 2XVNA 1XH1A 4KH2A 5I2UA 1H2JA 2WMGA 2WMHA 3SEPA 2FGZA 3EBVA 1E3ZA 2VZUA 4DWSA 4FLRA 5D9OA 1CGXA 4M80A 4Q22A 4ZENA 4U2ZA 4PUDA 2CBIA 2CBVA 3A47A 3EMCA 1PIFA 4MDPA 4MAZA 1KR0A 1WDQA 2HISA 3GNOA 2VUYA 4UQAA 1NQ6A 2EPNA 3AS3A 3DC0A 3W4RA 2C7FA 3BSHA 3WMCA 2ZE0A 4U2YA 4UFKA 1HXJA 3CLWA 2E9LA 1AQHA 1HP5A 2VZSA 3K8MA 1JDCA 1VBUA 3WDPP 2YA1A 1UQZA 1CZ1A 1V02E 2DT3A 3BH4A 3MMDA 5AYIA 3VGBA 3ARZA 2D0HA 4JZ5A 1UHVA 1S46A 3RCNA 4BQ3A 2NW0A 3K8LA 4AZ7A 3WL0A 8A3HA 2DSWA 3ZOAA 1H49A 2WWDA 2Y2WA 4TVDA 1H1NA 2ZXAA 4P8WA 4DM2A 4JCLA 3RMEA 3B9EA 1DWAM 2J75A 3ARWA 3RJYA 5EB8A 3AS1A 3N12A 4U5KA 1HKJA 4Z2IA 1MXDA 1ESWA 1XRVA 3OZPA 1B3WA 4CVWA 1H0GA 3TTYA 1C7SA 1MW3A 3CBWA 1GUVA 4WSJA 1DEDA 4PMYA 4UFHA 4AEEA 1MFUA 2ZUVA 1GOOA 1AQ0A 3MSGA 5CXPA 5I23A 3EDKA 3VKKA 4AIEA 3AICA 4GPNA 4AD2A 5A6AA 1C92A 3M6DA 5M03A 1Z32X 1WB0A 1J0IA 1TE1A 3AI0A 3BCFA 3WF0A 4QLLA 1R86A 1TA3A 1HIZA 1E71M 3GZAA 4HMCA 1UUQA 3O2LA 3OZOA 4OIFA 2X1IA 1M01A 1W3HA 1CEOA 1UOKA 1XC6A 2JFEX 1ODUA 2DPEA 1JDAA 4CD6A 1BTCA 3SCQA 4QP0A 5IDIA 4RE2A 3VNZA 4MB5A 2XVKA 4XZBA 4JIEA 2WCGA 2XM1A 1GCYA 1E4NA 3T2OA 4E2OA 2J62A 3ZJ7A 2OSWA 2MANA 1MQPA 4C7DA 3PZMA 3NYDA 3AHYA 1E0XA 1JDDA 2WKLA 4HTYA 2GDVA 2X09A 2CXGA 1ITCA 1PZ2A 1EOMA 2A3AA 2VZVA 5JUVA 3TTSA 1UR9A 3I3DA 1R87A 3IAPA 3GXIA 2PC8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KXH A;  1LG1 A;  1B90 A;  4TX8 A;  1M7X A;  2QMJ A;  1OIF A;  1ZB5 A;  4TXE A;  3CO4 A;  1UWQ A;  2XVL A;  4W93 A;  3VIL A;  3POH A;  3VOC A;  1GOQ A;  4U31 A;  3ARR A;  1WDS A;  1UR1 A;  1WCG A;  2QV4 A;  1PBG A;  1CGW A;  3L2L A;  3KE0 A;  2GDU A;  1LL6 A;  1BG9 A;  3EDF A;  3WF4 A;  1RP8 A;  1ISX A;  3KL3 A;  8CGT A;  1E6X M;  5A2A A;  2WMI A;  1FOB A;  3BAY A;  3PN8 A;  2ZUU A;  2ZXD A;  1O6I A;  2WWC A;  4B9Y A;  4M1R A;  4B3K A;  5GNY A;  2ZX7 A;  4JL2 A;  1BF2 A;  3QGV A;  2EPO A;  4M24 A;  3ZO9 A;  2V3E A;  4D6I A;  3RPM A;  1TA3 B;  1PEZ A;  9CGT A;  3BGA A;  3WY1 A;  4R5E A;  5DO8 A;  4E8D A;  5AC5 A;  2PWD A;  5FKY A;  1W9U A;  2UY3 A;  1EO7 A;  2G8Z A;  3SCN A;  3MU7 A;  4UQB A;  4F79 A;  3N1A A;  4HA1 A;  1RH9 A;  5C8B B;  5EBA A;  2VVS A;  4GQQ A;  3VGH A;  3PZ9 A;  1V0N A;  4EK7 A;  4RE3 A;  2YKK A;  5HNN A;  2WC7 A;  3SCV A;  4JAW A;  1EA9 C;  3VMP A;  4EAN A;  1BYD A;  3LMY A;  2G4F A;  3NIY A;  5A8O A;  2YLL A;  1EO5 A;  1PX3 A;  1H5V A;  3ZT5 A;  1NOW A;  4BA0 A;  1TG7 A;  5CPQ A;  2DH3 A;  5FL0 A;  4DUV A;  1W91 A;  4UTF A;  1FP8 A;  5A69 A;  2ZXB A;  3WFL A;  2QHA A;  2CKS A;  1R7A A;  3L4T A;  4GKL A;  1SMA A;  2ZXQ A;  2VRQ A;  2D2O A;  1KR1 A;  3WH8 A;  1W9X A;  1V6U A;  1WDP A;  3VGF A;  4Z2H A;  3W38 A;  2PWF A;  1V3H A;  5GPR A;  1QNO A;  1E70 M;  4D1J A;  2GVY A;  5BRO A;  1AMY A;  3OIH A;  1OD8 A;  3K46 A;  3F4V A;  3WQW A;  1CYG A;  3T09 A;  2CKR A;  2D1Z A;  1H3G A;  4JFS A;  5C71 A;  3ZJK A;  2CES A;  3TP4 A;  3AFB A;  2WVV A;  2VX6 A;  1JL8 A;  1VIW A;  1ODZ A;  1C8X A;  2E9M A;  3SCW A;  1ISV A;  4H7V A;  1E5J A;  3QHO A;  1MQQ A;  5BXP A;  4AD5 A;  1EHA A;  3WMB A;  4ZE5 A;  3VDC A;  3WNL A;  2YA0 A;  4AZI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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2Y8VA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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