2YCEA

Structure of an archaeal fructose-1,6-bisphosphate aldolase with the catalytic lys covalently bound to the carbinolamine intermediate of the substrate.
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSFPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGSDAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanism of the Schiff Base Forming Fructose-1,6-Bisphosphate Aldolase: Structural Analysis of Reaction Intermediates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS 1
molecule tags Lyase
source organism Thermoproteus tenax
total genus 92
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2yceA00
1FDZA 5KMYA 3GR8A 3TX9A 3E0IA 4M6PA 1VYSX 4O15A 4A29A 3P60A 4MJMA 1IIHA 1W5MA 4Z0SA 5E0KA 1G7UA 3TUUA 2V9DA 2VFFA 2JKEA 3LOTA 1AW1A 3O6DA 5LNVA 2A0NA 1WBHA 1OFAA 2CLMA 2GQ8A 3A5VA 1W54A 1ADOA 2CLKA 1VQTA 4FF7A 2VEKA 1W5PA 2YDAA 3KRZA 4DF0A 5HWJA 1G69A 4PL2A 1WQ5A 4HHPA 3B0PA 5K9DA 3EB2A 4AWUA 1G6CA 1LBFA 1YPFA 2C6QA 2Z6IA 1H5YA 3A5FA 2C14A 4AHPA 4QITA 4NJJA 1OVDA 3NQAA 3MYPA 4UC5A 5IM51 1KBIA 4FNRA 3MJYA 5HUOA 4LRTA 1YTKA 4M19A 3W7IA 1PCKA 3W1XA 5FF7A 1JCLA 4R33A 1FX6A 1SSDA 3S1UA 1KM3A 4GXMA 4GC4A 3THQA 4JEQA 1G4SA 2ISWA 1LBMA 2V0TA 1VGAA 1ME9A 3UY7A 1QOQA 4O4WA 3HMJG 3HOJA 3FS2A 2OMAA 1KFCA 1IIGA 2WQPA 1JJKA 2E6YA 3SR7A 5F2MA 4LUJA 1HFBA 3PUDA 4O13A 3C2EA 2J24A 1KLZA 3R13A 1H7PA 2YFNA 4IWWA 2WPBA 3N34A 3LRMA 4JXCA 1TTJA 2B4GA 2H3BA 1I2NA 5LHEA 5EBUA 1TSIA 3JR2A 1TPH1 4O10A 3PB2A 5HULA 1WA3A 2ZRZA 1TQXA 3PY2A 3SGZA 1VPXA 3CIWA 1LRTA 3G1DA 3Q94A 2QDGA 2WV8A 4YCOA 3QC3A 3L2IA 3R2GA 4GUFA 3O1NA 3MP4A 1GTEA 5BNKA 1XFBA 1SPQA 1K8ZA 4HKPA 1W56A 1WOBA 5FI8A 1HUVA 4AB4A 2DZWA 3M6YA 1SW3A 3W7PA 3M5ZA 2ZA3A 1PHQA 3FLUA 1GVQA 1TJRA 3UWZA 2NWRA 5AC6A 4GJ1A 1GG1A 4K7VA 4RK8A 1XDMA 4CQ9A 5BW6A 5AFDA 3S5NA 2AAMA 2WNNA 5D37A 1DKWA 3W76A 4WUIA 4MLRA 3EXRA 1YYAA 1Z42A 4C1KA 1ZFJA 1GOXA 4FNSA 4NJHA 3B8DA 4XBSA 1EEPA 2YSWA 1OFQA 3NYZA 1R30A 2B7NA 2ZA1A 4O57A 3H54A 3M44A 3C61A 5C2XA 5L9FA 5FF4A 3L0KA 1PV8A 3OVRA 5DCDA 2TMDA 1YXCA 2QEZA 4DPPA 4FIQA 4Q4KA 3G24A 1XUZA 4MYAA 2J88A 1AMKA 5KINA 1KFKA 2ATSA 3UZ5A 3FYPA 1TV8A 3TJXA 2VEIA 3OHIA 5DN1A 4AVFA 3PM6A 2CU0A 2C18A 2VFDA 1C8VA 1OFBA 4DBEA 1Q6OA 5AC8A 2JGYA 4UFIA 3M5VA 3E02A 1W5NA 4WY0B 3LB0A 2J9YA 3LGEA 3QQ1A 1TMHA 1MEWA 2A21A 2PURA 4IJBA 2X30A 3E49A 3KRSA 4DO6A 5HR6A 3OA3A 2O7QA 1OX4A 4O50A 1RPXA 3LCIA 4ZQCA 4LVGA 1N55A 2RH9A 1TPB1 3GKAA 1TCDA 5CZTA 4R53A 4LY8A 3OVPA 3NPXA 5LNSA 4JD4A 4L4LA 4O1DA 1IXOA 3OEXA 5HQEA 1KM1A 4EF8A 1ALDA 3IIZA 1A53A 3A22A 4FNQA 2ISSA 4MLJA 1LBLA 2WNQA 3TQKA 2Y89A 3PUEA 3TMLA 2ISVA 3S1XA 2V8ZA 3AO0A 4WOQA 4YXGA 1TTIA 4FIRA 5D05A 5LHFA 3C2VA 3WK3A 3NQEA 4TR9A 1F2JA 3LM7A 3W2NA 3EX2A 3ATZA 3L66A 5LNWA 3K30A 5FF0A 2GVJA 5J5DA 5CZSA 3TE9A 4N4PA 1K02A 1KFJA 3IRDA 2WO5A 1FWSA 1I8JA 4UFJA 1LROA 4HNTA 1B57A 3R5EA 1FCVA 3UWUA 4O18A 1I2QA 4DF1A 3MI2A 3NQ6A 3LHWA 2V5BA 2BXVA 1KM5A 3IIVA 5F4WA 2CLIA 1EP3A 4AWSA 1L2UA 5CGQA 1FXQA 3LBCA 4LS0A 3HGSA 3LDVA 3BLEA 1ZCOA 4CNPA 2ABAA 2A7RA 1I2RA 3C2OA 1TQJA 3TU9A 3WJSA 4UTTC 3SECA 3HPSA 3TR2A 2GVGA 3MP5A 4JGDA 4JN6A 4R7JA 3TKFA 4EOUA 3SSJA 3TDFA 2DZTA 3VE9A 1Z44A 1TPWA 2PRHA 3UY8A 5AOUA 2ZQ0A 1DOSA 2E6AA 1XBYA 1YLVA 2E68A 1LOLA 4BK9A 1GWJA 3QMSA 3ABQA 1JQXA 4A2RA 2QUVA 1JR1A 5EY5A 3G3MA 3GXNA 4GUHA 4XBKA 4UCGA 2W6RA 3G1FA 3W7GA 3PBUA 2G97A 1ML1A 2RHGA 3MP3A 3HQ1A 1WXJA 3QYQA 4P61A 4ZMGA 1K8XA 1YTEA 1TREA 3NL5A 1V5XA 3GDMA 5E1QA 5D2XA 5EPDA 4N9DA 4NU7A 1MEIA 3SY5A 1GTHA 4AF0A 4RR4A 4MFEA 1LDCA 4ALDA 1T99A 3PAJA 2Y61A 4WQ6A 3W1PA 2V2HA 3L0GA 3HGJA 5C54A 4WJEA 1LYXA 2HSAA 1FWWA 3FKKA 1ICSA 1GYNA 4IUOA 3CEUA 1LOQA 3W74A 2WOQA 3S6DA 1DBTA 4C1LA 2G96A 1SQ7A 3L21A 5G2HA 3PG9A 1XDLA 4BI5A 1KBJA 3NQ2A 4Y96A 3CWOX 1M7OA 4Z08A 5EKYA 3L68A 3N19B 3P8IA 1JUEA 1Z48A 2E6DA 1FCQA 2YX0A 3I6RA 1GQNA 5BMWA 2B0MA 2R8WA 3V75A 3KVMA 2E5DA 1JRBA 1E51A 1UUMA 1WDWA 2FFCA 3HJZA 1THFD 2Z1BA 2C16A 5AHFA 2XN1A 4N6FA 4A21A 5KTLA 2VFGA 1H7WA 2DZPA 4OBTA 4YLWA 4N9BA 5DY3A 1VLWA 3M43A 1NF7A 5DCEA 1N8FA 3S1WA 2ZRYA 1C9DA 3LHZA 1ICPA 5AC7A 2A4AA 3ZWSA 1OFEA 2ZTKA 1PL9A 4PCFA 1G4TA 4LVBA 4JY8A 2ZZ1A 4QQ3A 3G0XA 4E0CA 3DFNA 2Y62A 1I4NA 4HNUA 5F2LA 2GVLA 4IPIA 3BLFA 3IGSA 4MJZA 2FPTA 2GQ9A 4B5NA 3VE7A 1XBXA 4M6VA 2IQTA 4E2DA 1A5AA 3B03A 4I7WA 4ORIA 3KFTA 2YR1A 1MXSA 1GG0A 3ABRA 1HO1A 1GT8A 1VRDA 1VZWA 5GVJA 2VFEA 4RV8A 4TIMA 1PS9A 4XQ6A 2RFGA 2CWNA 1FQ0A 4RJEA 3W7JA 2RDTA 4S2CA 2BSLA 1TJPA 4K38A 5LNRA 2EAWA 5D09A 3DFPA 1H60A 4Z0JA 2C1HA 3CB8A 3GKFA 4JTJA 3W73A 3PR2A 2HMCA 2A1YA 3DKJA 1KLYA 4KFNA 3OBKA 2VEPA 3W7MA 4Z1DA 3UD6A 3TIMA 1JULA 5D38A 4JTIA 3QW4B 4K37A 4O14A 3V1PA 4WXYA 2BX7A 3MBFA 3T7VA 3CQ0A 1RQBA 1S5WA 2QCDA 5CPOA 4ZQNA 4ZQOA 1OFPA 3DGRA 1JCNA 1KM2A 5D30A 2Q3RA 4FX7A 1QNVA 5C5YA 2TRSA 3W2LA 2E5CA 4P2VA 3G3DA 3DH7A 4MY1A 4QISA 1KTCA 5F1VA 3TW7A 4LV4A 2CW6A 2QCEA 3C8FA 1F05A 3QZEA 5K9XA 4N02A 3T55A 4K36A 1GVFA 3TH6A 4XKYB 3DFTA 1K3UA 4JR5A 3EWYA 1ZALA 3G1XA 3HIJA 2XN2A 1W5QA 2VOMA 2Y7GA 3H53A 3DI0A 3W1LA 2X1RA 4KWVA 2R14A 3BW4A 1RQHA 1W1ZA 4L4MA 4BFAA 1EWEA 1GVSA 1LRNA 5AB3A 3TAOA 3W2JA 2G95A 3GK0A 3BLIA 3CTLA 4QM1A 1TPDA 1U5JA 1OK6A 1OFRA 4MPQA 3DU0A 5EL1A 3B4UA 1NAL1 4JTSA 3TA6A 3H55A 4K8EA 1UASA 4JTFA 5LSMA 1BWKA 2Y63A 3P82A 4O4VA 4O16A 1K8YA 1LM1A 3NAVA 4HPJA 3FJLA 3YPIA 2CLHA 2UV8G 3M41A 5K7JA 3RFAA 4DELA 3BGGA 1TRIA 4TMCA 2RDWA 1O95A 3W70A 1ZAHA 1LZOA 4DEFA 1IXPA 4GRSA 2ZZ7A 3ZS4A 5ABTA 3HF3A 3P84A 1P0NA 3LV6A 3W71A 1TO3A 1BWLA 1OFOA 2RDUA 1TYGA 3MI6A 4H6KA 1QFEA 4HSOA 2JKPA 2ZRUA 2Z2UA 2DZSA 1R47A 5D2VA 1VH7A 1VHNA 3LHTA 3ATYA 3C2FA 3OVQA 4NX5A 3DENA 4A2SA 3NPVA 2F7FA 4S2BA 3FIGA 1XXXA 3NL6A 4O0KA 1ME8A 4IX2A 4MZ1A 3M1ZA 3W1MA 4WOZA 1DQWA 3IIPA 3N3MA 3EKLA 1F5ZA 1A5CA 1OYAA 3C6CA 4EF9A 2NZLA 3KHJA 3NPWA 1SFLA 2ZA2A 3T78A 4UXDA 5I3JA 3HGRA 3BG9A 2QCGA 2CLFA 1K7EA 5U7SA 1UB3A 1W37A 3KOFA 1PVNA 1OFDA 3E96A 2I14A 1EWDA 3HBLA 5G4WA 4JICA 4ZL1A 2WSQA 4LVFA 2E77A 4ZQMA 5G2IA 5MHBA 3NNTA 2B7PA 3W88A 1EUNA 3TW6A 4I7UA 1KM6A 2DZUA 1O94A 4JIPA 2E1DA 2GQAA 1CW2A 5AN7A 2ZRWA 1N7KA 3NZRA 3U2OA 1GVOA 5D03A 2V5LA 2TPSA 1S5TA 2ZZ5A 4R34A 4O11A 4NJKA 1KV5A 3GXPA 3LERA 4Z1CA 4I9AA 1MZHA 3LXAA 3TQ0A 3U8GA 3PBWA 3M5XA 4FX6M 2FJKA 4KFPA 2V2DA 4ONVA 2D73A 3LLFA 2ALDA 4NXSA 2P0OA 1ICQA 2QCNA 2E09A 1EB3A 3GLCA 1VLIA 1WYIA 4OGZA 2EKCA 1SO3A 3QQ0A 2YZRA 1WBJA 4O1BA 4H3DA 1M5WA 1JRCA 4CCEA 1Q6RA 3L9CA 3W7RA 4U28A 3WK2A 6ALDA 1Y0EA 5CKSA 1H61A 1PE1A 1TV7A 3W3OA 5HNRA 5C55A 3NR0A 2NV1A 2YXGA 1HTIA 4WXZA 1KA9F 5BRBA 4TO8A 4IPJA 5A5WA 3LV5A 1KV8A 1SZNA 4BI6A 2Y88A 1RR2A 2ZYFA 3EX4A 3W1UA 4UNKA 1OX4B 3A24A 3CT7A 2ZTJA 4N9CA 2Q8LA 3NA8A 3BGJA 2A7NA 3W7DA 1ME7A 3F1QA 1FDYA 1SO6A 3LRLA 3MMTA 3TC6A 4UTMA 1KTBA 3C4UA 5F4SA 2G5WA 1Q6QA 1H50A 1JCYA 3BPWA 2E5BA 3C0JA 1UJPA 4EVZA 3NG3A 2JKAA 4FNPA 3CPRA 1K7XA 4RKAA 4LV9A 3W1AA 3QMRA 1GJPA 2NWSA 1QPQA 3GB6A 3NEVA 2ZZ2A 4JS3A 1W3NA 2R94A 3CHVA 3F03K 1KFEA 1OYBA 1F76A 3TCEA 2KZHA 3CEPA 3IV3A 3OG3A 3LCFA 3GXTA 2DJLA 1ZNNA 1AW2A 1TPUA 3VFLA 3VCRA 2QCFA 1O4UA 4BWLC 4YWIA 5AHMA 4MIMA 2VEMA 2OZ0A 4PL1A 4PH6A 3WJWA 1LLZA 2LLEA 3M16A 4NJIA 3TSMA 2QJIA 3W7OA 3GDKA 1IXQA 3O06A 4JDBA 1L6WA 2Y7EA 3F4NA 3PBYA 4CQ8A 2RKXA 3IVUA 5AHIA 4IGHA 3SFKA 2ZZ4A 2NXGA 1DVJA 1MEHA 4WY0A 4CNOA 1A5SA 3G1AA 2OX1A 2DORA 2DZVA 4JX6A 4E2BA 3HG4A 3QM3A 4LW7A 3B05A 5KZEA 2Y85A 2CZFA 4JTTA 3S5OA 1WV2A 5C6MA 5FEWA 4LWWA 3M7WA 4NJGA 3C56A 4CCDA 3JRKA 3A9IA 1XKYA 5HWNA 4PODA 1TV5A 1KW1A 3NPUA 4HN4A 4LVDA 2C0AA 3I68A 3GR7A 4RCXA 3G1VA 2DJXA 3IVTA 4XTIA 2AGKA 1ZJIA 1H7RA 3IGUA 5H2ZA 2FPVA 3P80A 3N73A 2ZRXA 3RK8A 4OV4A 2FB3A 4WX2A 3OIXA 5D32A 3W23A 3TSDA 3EXSA 1OX6A 1DQXA 2I9EA 1VC4A 1ZENA 4JIQA 5EMUA 2C3ZA 4MKNA 2WKJA 4QJ1A 5CSRA 1VHCA 4MZYA 1HL2A 4LT9A 1NF0A 3NL2A 5G2WA 5FEZA 1DV7A 3BO9A 3GDLA 1L6YA 2YW4A 1OABA 5LNUA 3S5ZA 4UIOA 3TAKA 3TJLA 4O54A 2NV2A 4K8HA 2NUXA 3O15A 4O19A 1YPIA 5FEXA 3L67A 3QJAA 2V2CA 4QIUA 3QSRA 3GNNA 3P5YA 4FHAA 3ZR4A 3LRKA 1OX5A 2B7QA 5K2ZA 2CFFA 1XL9A 1XM3A 4JTEA 4BWLA 2H8XA 1VYPX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FGB A;  3GR8 A;  5IXE A;  4ZR8 A;  3E0I A;  3P60 A;  1E70 M;  3ABZ A;  4MJM A;  3VIF A;  3HFT A;  1W5M A;  5E0K A;  2AL2 A;  3TUU A;  2VFF A;  2JKE A;  3BGA A;  1L2Q A;  2A0N A;  1IGW A;  1V0M A;  3U7V A;  1OFA A;  2CLM A;  4HYV A;  2INF A;  3VOJ A;  2OEM A;  1W5P A;  2YDA A;  4DF0 A;  2GUY A;  1G69 A;  4KEV A;  4PL2 A;  2WZI A;  3M0I A;  1WQ5 A;  3B0P A;  1OD0 A;  3EB2 A;  4AWU A;  3OYX A;  2VC5 A;  1LBF A;  5FJT A;  1B0I A;  2IKH A;  3W82 A;  1YPF A;  3AHY A;  2C6Q A;  1J2B A;  4QIT A;  4Z2L A;  4UC5 A;  1M41 A;  1NH6 A;  2XDF A;  4LRT A;  1PCK A;  1FX6 A;  2Z7K A;  2W66 A;  4HNO A;  4JEQ A;  1G4S A;  2F2K A;  3UY7 A;  4JOM A;  3SR7 A;  1JJK A;  1JCT A;  5F2M A;  4LUJ A;  3PUD A;  3QR1 A;  4O13 A;  1BXN A;  4YHE A;  4HOW A;  3VIK A;  3QFW A;  2CC0 A;  3ART A;  2C91 A;  3LRM A;  2C71 A;  1I2N A;  2YBV A;  3GBE A;  3JR2 A;  1DJW A;  1TPH 1;  3KBJ A;  4O10 A;  3AMG A;  1Q66 A;  3BSH A;  4S3A A;  4TVU A;  4EKJ A;  3PY2 A;  3WNM A;  3CIW A;  1LRT A;  4V28 A;  3DDM A;  2GDQ A;  3CLW A;  2WV8 A; 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