The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
100
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sequence length |
271
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structure length |
271
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Chain Sequence |
GLVPRGSHMFIMIGERINGMFKDIREAILNKDPRPIQEWARRQAEKGAHYLDVNTGPTADDPVRVMEWLVKTIQEVVDLPCCLDSTNPDAIEAGLKVHRGHAMINSTSADQWKMDIFFPMAKKYEAAIIGLTMNEKGVPKDANDRSQLAMELVANADAHGIPMTELYIDPLILPVNVAQEHAVEVLETIRQIKLMANPAPRTVLGLSNVSQKCPDRPLINRTYLVMAMTAGLDAAIMDVDDDALVDAAATAHILLNKEIYCDSYLKTFRQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structural Basis for Electron and Methyl-Group Transfer in a Methyltransferase System Operating in the Reductive Acetyl-Coa Pathway
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Transferase
|
source organism |
Carboxydothermus hydrogenoformans
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molecule keywords |
5-METHYLTETRAHYDROFOLATE CORRINOID/IRON SULFUR PROTEIN METHY
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total genus |
100
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structure length |
271
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sequence length |
271
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2011-03-16 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00809 | Pterin_bind | Pterin binding enzyme |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Alpha-Beta Barrel | TIM Barrel | Dihydropteroate synthase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DJF A; 3H2C A; 3TYB A; 3TZN A; 4DJD D; 1Q7Q A; 1AJ2 A; 1Q7Z A; 3H2N A; 4MWA C; 3MCM A; 2YCL B; 2Y0F A; 1AD4 A; 3H24 A; 2OGY A; 5JQ9 A; 3MCN A; 4G9P A; 3TYC A; 4O0Q A; 2Y5J A; 4DJD A; 2VEF A; 3TYE A; 4D8A A; 4DJE C; 1TWZ A; 3H2F A; 4S3B A; 4S23 A; 1AJZ A; 3MCO A; 3H22 A; 3TYD A; 4D8Z A; 4NL1 A; 4S38 A; 4MWA D; 2H9A B; 3H2O A; 3H26 A; 4DJE A; 2DZB A; 3H2M A; 3BOL A; 1TWW A; 2H9A A; 3H21 A; 2YCI X; 3V5O A; 2Y5S A; 3BOF A; 3TYA A; 1TWS A; 4DJE D; 4MWA A; 4D9P A; 3H23 A; 3TR9 A; 3K13 A; 4S3F A; 1AD1 A; 4O1E A; 4DJF C; 3H2E A; 1Q85 A; 3TZF A; 4DB7 A; 1TX0 A; 2BMB A; 1Q7M A; 4O1F A; 2DQW A; 4MWA B; 3H2A A; 1TX2 A; 4S3C A; 4C1N A; 4DAF A; 1AJ0 A; 4S3D A; 4NIR A; 2YCK X; 2E7F A; 4S3E A; 4S3A A; 4DJD C; 4DAI A; 2YCJ A; 4S39 A; 4CCZ A; 4DJF D; 4NIL A; 1Q8J A; 1F6Y A; 1EYE A; 1Q8A A; 2VP8 A; 2DZA A; 2VEG A; 2YCL A; 4PZV A; 3NOY A; 4C1N B; 4NHV A; 3TYU A; 4MWA E; 3TYZ A; 4HB7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y8B A; 1EC8 A; 1H7R A; 1H50 A; 1NFP A; 2VFG A; 5FEX A; 1VFU A; 2JGY A; 5DEZ A; 3WKZ A; 2GVY A; 3E5B A; 5FF2 A; 2CLP A; 4ZFC A; 2G8Z A; 2D3L A; 1V03 A; 1XKY A; 4WXZ A; 5LA1 A; 3R11 A; 4NL1 A; 2ZZ3 A; 3GTH A; 3KL0 A; 2X41 A; 4HPJ A; 1LQ2 A; 4AZC B; 1UD2 A; 4GVG A; 4UQC A; 3SCR A; 1YMY A; 3PTK A; 3B05 A; 4QLJ A; 2G4F A; 3BOF A; 4D1J A; 3T44 A; 3P8J A; 3IWP A; 4XSM A; 4QE5 A; 4TMC A; 2YL9 A; 4B5T A; 1W1Z A; 4LBS A; 4ZZ9 A; 3NQ7 A; 1KFK A; 3R4I A; 2P8B A; 4ILS A; 3SRK A; 3M5X A; 3E2S A; 4IXX A; 2YXO A; 1QXL A; 1UJP A; 1POK A; 4LUS A; 2OZ3 A; 1XYZ A; 4O1F A; 4GIN A; 1THF D; 1XHG A; 2ZRV A; 4IID A; 1AJ0 A; 4CN4 A; 1OY0 A; 4GKT A; 3MUY 1; 4OTK A; 2Y6Z A; 4H7V A; 1E56 A; 3P67 A; 4CCE A; 2V6A A; 4IGM A; 4AZ7 A; 1GOI A; 2FTP A; 1GYN A; 1X6L A; 3AYV A; 3RM4 A; 2YCL A; 1ITU A; 3K1G A; 3ZWS A; 3FHA A; 4G1K A; 3SDO A; 3CH9 A; 1KV8 A; 3CYJ A; 1KM4 A; 1SZR A; 1YYA A; 1YHT A; 4K3Z A; 2DSU A; 4M7T A; 4WY0 A; 4B5U A; 3VKC A; 5C9X A; 4Q4P A; 3MTW A; 2R24 A; 1DIO A; 3R10 A; 1UMY A; 1J0Y A; 3UER A; 5E9X A; 5HA7 A; 1K7E A; 1ZAH A; 3LB0 A; 1C9W A; 3H4W A; 4K2S A; 3UJS A; 2WM0 A; 5FD0 A; 2HIS A; 3E0V A; 1KCK A; 3UA3 A; 1R3Q A; 1DJG A; 4G5D A; 3UW6 A; 4OOZ A; 3WJW A; 3SB0 A; 1DJW A; 4HA4 A; 4QE1 A; 2CNC A; 1FWR A; 4X0V A; 4AWT A; 5LIX X; 3LZ5 A; 7A3H A; 3W2L A; 3DFT A; 3URQ A; 1YE4 A; 1CDG A; 3EGJ A; 1ZTV A; 4TR9 A; 1QFE A; 3LGG A; 3TFX A; 4JTL A; 1VEP A; 3DBP A; 5CZK A; 3OVP A; 2I9U A; 1D8W A; 4HVX A; 4PMD A; 2E8Z A; 4GX8 A; 3UY7 A; 4LVD A; 1KWG A; 1J0Z A; 1YDN A; 1XCX A; 2QUV A; 4FMV A; 3PJX A; 2BDQ A; 4NRR A; 3AS3 A; 4UR7 A; 3EWU A; 1E5N A; 3TJI A; 3AIW A; 2RAG A; 3EA2 A; 1GKR A; 3EYP A; 4CCZ A; 5M1T A; 4XO6 A; 2P10 A; 4NI8 A; 3KL5 A; 5A8Q A; 1PUD A; 2D2J A; 4GNV A; 3CYV A; 2J25 A; 2I14 A; 2A3C A; 4XX6 A; 5FKY A; 4XZW A; 3AYR A; 1ENU A; 1QPK A; 3TV8 A; 4TOQ A; 3BWW A; 1MQQ A; 1XLM A; 1JCM P; 4BI5 A; 2F7F A; 1XYB A; 3UWZ A; 4QLL A; 3VNJ A; 1BYA A; 3BAI A; 4WKH A; 2AMG A; 1I1X A; 2VC6 A; 3GG0 A; 1UPM B; 3VDH A; 3F4D A; 4PA8 A; 3RRA A; 2Z00 A; 1OGB A; 1EDT A; 4NJH A; 5D2T A; 3APT A; 1W3H A; 3VC6 A; 1HL2 A; 1XUZ A; 4WSH A; 2WAN A; 3ART A; 1E71 M; 5I2U A; 3PAO A; 4F4R A; 1E0W A; 3P80 A; 5ABT A; 2FZ8 A; 4IJC A; 1BG4 A; 3NZP A; 3G0U A; 2E9M A; 4PMY A; 4W4Q A; 3GTF A; 5M17 A; 5DCE A; 3LXC A; 3TIM A; 4IH3 A; 1PO9 A; 4NJG A; 2Y1H A; 1CT5 A; 4P2V A; 2V2D A; 2XIJ A; 1M7X A; 3HO8 A; 4XAG A; 1V0L A; 4UNK A; 5A8N A; 2DY3 A; 4JQ4 A; 5JMU A; 1E9I A; 1ICS A; 3C2O A; 5D30 A; 4R9X A; 1PWM A; 1FWD C; 3ARX A; 4C6J A; 3WFL A; 5D04 C; 4YS1 A; 7CGT A; 1OFA A; 1M7O A; 2YFN A; 1Y7V A; 4D2J A; 4D6J A; 5A6J A; 2DIJ A; 1W8G A; 4FR1 A; 2FH6 A; 1VBG A; 3PZG A; 1H5V A; 3BW4 A; 5FJI A; 2CXE A; 2ACS A; 3I3E A; 3MAN A; 4CEX C; 3OZP A; 3PP7 A; 1KCL A; 4JNY A; 4IPI A; 5F2M A; 2HK0 A; 3NWR A; 3W1P A; 3LZ3 A; 5BXT A; 4UIO A; 2G96 A; 1OM0 A; 1PKY A; 4O52 A; 3GM8 A; 4B2D A; 3GTI A; 3T0A A; 3GBD A; 1DXF A; 3SEC A; 2J7H A; 4GAC A; 3HUR A; 3R8G A; 1KFW A; 3RR4 A; 3WUB A; 8RUC A; 4DQW A; 1QW7 A; 2WC3 A; 4RE4 A; 3BAY A; 4J35 A; 1I75 A; 2V38 A; 3B97 A; 4KT2 A; 3MBD A; 3PVF A; 1G6C A; 3EKG A; 3MI6 A; 3P5Z A; 2NQJ A; 1KR1 A; 1W5M A; 4UTW A; 3NXL A; 1E15 A; 1E72 M; 3PPF A; 4P7O A; 4ZO9 A; 4H6K A; 1JAK A; 3AU2 A; 2CHR A; 5F1V A; 4GGH A; 3FND A; 1K7F A; 3DBN A; 3T0C A; 5TD4 A; 1B3W A; 1G4P A; 2Z1X A; 1CXH A; 3LEN A; 2PRH A; 1GVY A; 2OMA A; 3DI0 A; 1PBG A; 3UR8 A; 4GD0 A; 1A5S A; 5FF4 A; 3GR7 A; 1NQ6 A; 3E49 A; 3WG6 A; 4MZY A; 1EL3 A; 4UQ9 A; 5CC7 A; 3A64 A; 5EML A; 1Q3N A; 2WSY A; 4LFY A; 4Y96 A; 1BTC A; 4NZF A; 4L65 A; 4D1I A; 2Z1S A; 4GYP A; 3UWU A; 4L56 A; 3NVD A; 4NY2 A; 3RO8 A; 4HTB A; 3TSB A; 4OE7 A; 1DQU A; 1REQ A; 3MKC A; 3TLQ A; 4Y9A A; 3FA3 A; 1W3T A; 3OGR A; 3BJF A; 3HPS A; 2EG8 A; 1RQH A; 1OT2 A; 5CZT A; 3W37 A; 3TYE A; 2BB0 A; 2CEQ A; 2QV4 A; 4S23 A; 1FWC C; 4MJ2 A; 3LEP A; 3LV6 A; 5C2C A; 5K9X A; 5D9P A; 1H3G A; 4Y6G A; 3NPX A; 4CCC A; 2G50 A; 4GXM A; 1FCV A; 2CBJ A; 1EGZ A; 1A5K C; 4PUD A; 1V7A A; 1WV2 A; 2QUT A; 4DJE D; 4EAC A; 4C7F A; 5E0K A; 4GY1 A; 3N17 A; 4Q8O A; 2J13 A; 1J01 A; 2DUX A; 3AOF A; 1QO5 A; 3ECQ A; 4Q8T A; 4OQV A; 4NKC A; 2XH0 A; 3EX6 A; 3ZLH A; 3W29 A; 2GJP A; 2WOQ A; 3RK8 A; 1NP2 A; 4P7L A; 2QGH A; 3ITL A; 1V77 A; 3QV8 A; 4ROQ A; 5DN1 A; 1E5J A; 2XWE A; 1AL8 A; 3GB6 A; 3MSD A; 3SUW A; 3BAW A; 1FY6 A; 2PZN A; 4UTJ A; 4G7F A; 1CXE A; 4RNJ A; 1TUF A; 4LYQ A; 1U1U A; 4F2B A; 1RBL A; 3GXF A; 1AK5 A; 1AFS A; 3U2C A; 1EUN A; 2CU0 A; 1L6F A; 3C6C A; 4DYJ A; 3WBX A; 4GUG A; 4IG2 A; 4P8X A; 1S46 A; 1GW9 A; 3CWN A; 1XYC A; 4C6E A; 1C3F A; 1DYS A; 4H41 A; 1E73 M; 5CAH A; 2ZRW A; 3GR4 A; 2OGY A; 4G9P A; 3TYC A; 1JL8 A; 1OIM A; 4MAZ A; 1FH7 A; 4HZ8 A; 2WVV A; 1KM2 A; 1QT1 A; 4G56 A; 4QG9 A; 1JCN A; 2FHF A; 4B90 A; 3NA8 A; 1XD1 A; 2BY2 A; 1L6Y A; 1Z42 A; 2C13 A; 2WMF A; 5CZJ A; 4FNP A; 4RCX A; 4UOQ A; 3DX5 A; 2VO5 A; 1ZPT A; 3CAK A; 4XO7 A; 3TWA A; 4AZ6 A; 3NQE A; 3GNP A; 3CK5 A; 3VZZ A; 2HPM A; 3N34 A; 2D20 A; 4WDW A; 3T81 A; 3G1R A; 3GBE A; 1P1M A; 4FHA A; 1J12 A; 1SW7 A; 1XLH A; 3QYS A; 6PTD A; 2PDI A; 4FAM A; 1TPV A; 2WSQ A; 1C7S A; 1VBJ A; 1V3K A; 3DEN A; 4IMG A; 1WYI A; 4MYA A; 1S3H A; 4L6O A; 4DJD C; 1AH3 A; 4DI8 A; 4TV6 A; 2C3Z A; 1EYW A; 2DU2 A; 3O0K A; 3ONC A; 3MJM A; 2OG9 A; 5KZD A; 3WNN A; 1CEC A; 4CD6 A; 1XC6 A; 3KS6 A; 3AAL A; 2D22 A; 2PGE A; 1MDL A; 4AC7 C; 3W7H A; 4Q8W A; 1G4S A; 3KVJ A; 2O7S A; 1QPO A; 3ITT A; 3N6H A; 2J78 A; 3CQ0 A; 3GE7 A; 3TTO A; 4CLM A; 3M5V A; 3EB2 A; 3T40 A; 4DM2 A; 4QAI A; 1WA3 A; 1A4L A; 4ZOD A; 2P1F A; 2PWG A; 3BQ5 A; 4O0Q A; 5G2W A; 1J79 A; 1GOR A; 1SO5 A; 4DWD A; 1E0U A; 3ATZ A; 3RCY A; 1KBL A; 1EZW A; 1BWL A; 1MFU A; 4JTD A; 4CCD A; 1R9Z A; 1B31 A; 5AYX A; 3RCM A; 1T5A A; 4FIQ A; 4O10 A; 1PL9 A; 4FX8 A; 1FBA A; 4V1Y A; 2ZXA A; 4O28 A; 2YIH A; 1VP5 A; 3H21 A; 3HJE A; 4MKV A; 3AHX A; 4YL2 A; 2WC7 A; 1KB3 A; 3VNI A; 3WQF A; 3SCO A; 1B9Z A; 4IQJ A; 2XYL A; 3M7W A; 4JS3 A; 2I17 A; 3VND A; 2A3B A; 1U5V A; 1CPU A; 1IEX A; 1UBS A; 2TRS A; 1E9Z B; 4UQA A; 3CO4 A; 3WL1 A; 4DM1 A; 4QE4 A; 3C3N A; 4DEL A; 2FYM A; 4IQD A; 3WD2 A; 5ENL A; 3W22 A; 3VNM A; 5AHE A; 3S42 A; 3Q58 A; 1W3L A; 3QTG A; 4GIS A; 1KNW A; 4O16 A; 4CD8 A; 2CZD A; 1XLA A; 3P5Y A; 4R33 A; 3WMB A; 3L5M A; 3IK2 A; 3QMS A; 3R79 A; 4Q3M A; 1U2Y A; 3GFX A; 3PM6 A; 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