2YR1A

Crystal structure of 3-dehydroquinate dehydratase from geobacillus kaustophilus hta426
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MNISPKAIKVRNIWIGGTEPCICAPVVGEDDRKVLREAEEVCRKQPDLLEWRADFFRAIDDQERVLATANGLRNIAGEIPILFTIRSEREGGQPIPLNEAEVRRLIEAICRSGAIDLVDYELAYGERIADVRRMTEECSVWLVVSRHYFDGTPRKETLLADMRQAERYGADIAKVAVMPKSPEDVLVLLQATEEARRELAIPLITMAMGGLGAITRLAGWLFGSAVTFAVGNQSSAPGQIPIDDVRTVLSILQTYSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of 3-dehydroquinate dehydratase from Geobacillus kaustophilus HTA426
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Geobacillus kaustophilus
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 94
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2yr1A00
4FXSA 1C9DA 4Z1DA 3DFPA 1JCJA 5SWUA 3G1AA 3IIXA 3G0UA 4EF8A 1TPDA 1XBZA 1OFEA 5CSSA 3LCLA 4PODA 4IQLA 4GBUA 4DBDA 3BW3A 4FHAA 5AHIA 3RLUA 2GJLA 3W1RA 3R13A 2Z0IA 4MKNA 1FX6A 5HNRA 3VE7A 3LHWA 5D2TA 5I3KA 5F2LA 1K8ZA 3W71A 3Q2DA 3NAVA 2VFIA 3MJYA 3MMTA 4M7TA 1Y0EA 5F1VA 1H7OA 4IXHA 3W7OA 1UASA 5LNSA 2F7FA 3QMSA 1XDMA 1LOQA 2QAFA 4E2BA 3G22A 1L6WA 2QCLA 5AN7A 5EA9A 1N8FA 2QCGA 1RQEA 1S5VA 2ZA3A 3CEPA 3TH6A 2Y62A 4DEFA 3W7MA 2ZA2A 1VC4A 2X2GA 2Q8ZA 2ZCGA 2QCEA 3EX3A 5TQLA 3TR2A 4GXMA 2A0NA 2LLEA 1WOBA 1HG3A 1NF0A 4O0ZA 4JICA 4WJEA 1SZFA 3NR0A 3QMRA 4X2RA 3LCWA 3SY5A 4UFKA 4CNNA 2CZ5A 1QR7A 1J5TA 1HFBA 2GOUA 3WK1A 1A5CA 3UPBA 3RFAA 1YXCA 3OA3A 2X16A 3ABOA 1ALDA 2ZRVA 6TIMA 1KLZA 3TQ0A 4I7WA 4IMEA 2QJHA 3OVPA 2NWSA 4FNUA 4O1BA 4K6AA 3I7SA 1GTHA 1IXOA 1XL9A 1DHPA 1SO3A 2V81A 1ZNNA 3P67A 2QDGA 3M6YA 1L6SA 3HG3A 3MYOA 3QPYA 3FKRA 5KZEA 1B4EA 1K02A 3VNDA 4JDBA 2I1OA 2EKCA 5DLCA 1VYPX 1JRBA 5H91A 2YFNA 1HO4A 1FCVA 2YDAA 1KFBA 1QPRA 1GVSA 1VRDA 4E2DA 3QQ0A 5GVJA 2J9ZA 3IVTA 4HNUA 1QO5A 3NQEA 1SO5A 1FQ0A 4O28A 2CLKA 2NLIA 3LI0A 5AC7A 4IMDA 2TSYA 3W1MA 1VPXA 5FEZA 1TSIA 3LCHA 3W84A 2VEMA 4NQ1A 2X1TA 1TMHA 2YW4A 4N6FA 3GXTA 2GQ8A 1AL7A 1H60A 3D0CA 3IGUA 1QPQA 5AHLA 5EYWA 2DORA 2V30A 2CWNA 4UMAA 1LRTA 2GUUA 4RZ4A 3H54A 4CLMA 3F03K 2V0TA 4KFOA 3MHUA 2DZTA 1EEPA 3NQ8A 3INPA 1SSGA 1G7VA 4IMGA 3STFA 1T99A 1XM3A 4M6PA 3KRZA 4N9CA 3HIJA 2WO5A 2DJXA 2VENA 1P1XA 3G8EA 4YL2A 1XUZA 4LRSA 1JCXA 3PBUA 2OZ0A 1U5JA 4QAIA 1NVMA 1DJNA 3STCA 3W1TA 1XUUA 3UPWA 4O18A 2ZRXA 3EWYA 1SZEA 5CKSA 3HG2A 4O57A 3C6CA 3SGZA 3M5ZA 3G1XA 1JCLA 5J5DA 2F84A 3NM1A 3E49A 1X1OA 5CZTA 3ZWTA 3AO0A 3HF3A 1W0MA 4N4PA 1OFAA 2E6DA 4N2YA 4UR7A 3TXVA 5AYXA 1TV8A 2A85A 3C2OA 1KTNA 1SPQA 3A5FA 2BTMA 2Y88A 1YTEA 2ALDA 8TIMA 1GWJA 2QDHA 5IBXA 1I8JA 4R7JA 5G4WA 3TCEA 1JRCA 2H3DA 4Y90A 2Z6JA 4O13A 5EY5A 1KLYA 4AHPA 3IVUA 1BTMA 1Q6OA 1N55A 5HULA 2HS6A 2CLMA 3QQ1A 5G1YA 2TYSA 1W31A 3F1QA 2NX9A 4DPQA 1VLWA 5G1TA 1XFBA 1ZALA 3OBKA 3DHDA 2QKFA 1VHNA 4D2JA 4A29A 5G2HA 4AMAA 2E1DA 1PL9A 1RR2A 1VCFA 2JBMA 2WJZA 1B4KA 2FB3A 3N2XA 1HTIA 4O16A 2H6RA 1K8XA 3PULA 4AHOA 2ZRYA 2X1SA 5DY2A 3UNDA 3E9AA 4RXGA 3TMQA 1A5BA 3C52A 5LHFA 5D03A 2Q3RA 1TJPA 1KTBA 3W2JA 1EP1A 3LLFA 4NXKA 3NL3A 3UWQA 3LRMA 1THFD 3L67A 5AB3A 1KV5A 5LNWA 4AVFA 2B7QA 3P60A 2TMDA 2WOQA 1XKYA 4WUIA 3BLIA 4LU0A 5FI8A 1OYAA 1LBLA 1J4EA 1EIXA 1AW5A 5AHFA 2WNNA 1X1ZA 4MJMA 3MUXA 5K9XA 3I7QA 3CU2A 4RX0A 3MI6A 3HGRA 3TUUA 2Z2UA 1WDWA 3DZ1A 3G8RA 3P61A 4N9BA 4R53A 4S2CA 3TAOA 4YCOA 1G67A 4NZFA 4RR4A 4O12A 5KMYA 3W76A 1JUKA 2Y7GA 3V75A 4UTUA 4R33A 1SW7A 4M5PA 4TMBA 1LM1A 2QUTA 3W3OA 4FXRA 1TPFA 4NZJA 4CQAA 1O5XA 3PUDA 2B7PA 3DFTA 3G1YA 4BWLC 2EGZA 3PC0A 1DKWA 1I2PA 1MO0A 4LOCA 2C14A 1L2UA 4MZ8A 2R14A 3TV8A 4NNAA 5HINA 1KA9F 3QRHA 1HUVA 2I14A 2V82A 1UUOA 1SFJA 3O05A 1LORA 4L4MA 4J9JA 2KZHA 2DZSA 4C1LA 2IQTA 4FEZA 2E5BA 3H55A 5FF2A 1ZY9A 1BWKA 3DH7A 3T40A 2RH9A 4YCPA 1K8YA 2QR6A 5I3HA 3W1NA 4DQWA 3N14A 4WXYA 1SO6A 4LS0A 1YXYA 4JY8A 1TIMA 1TJRA 5C54A 1AMKA 3EX1A 2NUYA 1TPC1 5AHNA 1EPXA 4EF9A 3UXAA 5K3VA 3W7NA 3LV6A 2VFGA 3W7LA 3L68A 4BFAA 3HJZA 3GDKA 5LNVA 4OQVA 1IIGA 2CLHA 2HTMA 3HGSA 4WD0A 2PCQA 3MYPA 4DPPA 3MI2A 3UZ5A 4K36A 1G7UA 4GUGA 4LS1A 4ALDA 3BW4A 3HG5A 4ZQOA 5DCBA 3A9IA 3OIXA 3W85A 4ZL1A 3IIOA 3GKFA 1DQWA 4AWTA 2Y7FA 4IGHA 1OYCA 3LV5A 4UTTA 4O15A 2RDUA 3BG9A 4HN4A 1ZAHA 5DCEA 3I7RA 2NUWA 3W7DA 1B3OA 4Z0SA 3M5VA 4XWUA 1WQ5A 4UNLA 5KINA 2YGYA 1ML1A 1PVNA 2NUXA 3MWAA 3LRKA 5F4XA 4H6KA 1WV2A 3ATZA 5CPMA 4N6EA 2X30A 3H53A 3P82A 3SSJA 4TMCA 4Q32A 2ZRWA 4DELA 2HSAA 1R47A 1PS9A 4K38A 1EWDA 4IOTA 3WJSA 5K4XA 3WK0A 3ABQA 4IXXA 1R2RA 4NJIA 1LYXA 1AW2A 2EAWA 1OJXA 1F05A 1TPB1 3C2RA 3TW7A 1B57A 1VCGA 4DXVA 1RPXA 3BLFA 3S9YA 1TPVA 5D37A 1TO3A 4PA8A 3EXRA 2A6LA 4PTNA 3MBDA 4UTWA 1ONRA 5I3JA 1UCWA 4NX0A 2J6XA 2VFEA 1H7RA 4Q33A 3QZEA 3O15A 3QW3A 2ZZ7A 2YFOA 1XDLA 1G4PA 1JQXA 5DBTA 2VFDA 3G1HA 3KOFA 4MLRA 4FB7A 2JKAA 3C61A 1LRQA 2GVJA 4MOZA 5I3FA 4FNPA 1WXJA 2D73A 2QCFA 5D2YA 3UWWA 2A5HA 3SFKA 1AL8A 1WBJA 1TTJA 1OF6A 5DXYA 3EKZA 4KWWA 1MSSA 2PRLA 3T4CA 4UTIA 3TFCA 2J27A 4GUIA 1D3HA 3W83A 4JNMA 2QUVA 2FTPA 3M9YA 2BXVA 4WOQA 1WBHA 1X6UA 3QSTA 3W87A 1FWNA 1AW1A 4OE7A 3W6YA 3L65A 3NQ2A 3QYQA 2GVLA 1WOAA 4NNCA 4XUGA 2QAPA 1K03A 1Z41A 1LP6A 1GYNA 2E77A 4O10A 3ZR4A 3BO9A 4UFLA 3GDTA 5AHMA 4LV9A 1Z44A 2JKEA 1VGAA 4LW7A 5LNRA 3UY7A 3CC1A 1ICQA 2P0OA 2B7OA 3M5YA 1LDCA 3GXPA 4PL1A 4E0CA 1OX4A 3FYOA 4DBEA 4NNBA 2QCHA 3QJAA 3BG3A 4JX6A 2O7QA 3B06A 2TRSA 4U4MA 3GK0A 3LHUA 3P81A 2QCCA 3DFQA 3W7PA 3U6WA 4MIMA 1FY6A 1FDZA 3GVGA 3L5MA 2BSLA 3LCGA 4KKXA 1G4SA 3PUOA 1GVRA 5E0KA 3FA5A 4O1CA 3IV3A 1NEYA 4WY0A 2CZEA 4OWGA 1PIIA 3L0NA 4S2BA 3S6DA 3NYZA 1OFOA 2GVGA 4QQ3A 3P7YA 3KX6A 4POCA 1PCKA 5K2ZA 2ISVA 4UR8A 2E6AA 1TQXA 1FCUA 4TR9A 4YWIA 4ONVA 2CLFA 4FNSA 3G1DA 5ABTA 5BOOA 4Q4KA 3QSRA 3WJZA 3W7JA 3MP3A 1Q45A 4AAJA 5FEWA 1ME8A 4M7SA 1PHQA 4H3DA 3WJYA 1KM6A 4K37A 4AHQA 3UD6A 3MO7A 4XKYA 1DQXA 3M43A 4FO4A 4EWND 2P10A 3BVJA 4AH7A 3FS2A 1NAL1 3FIGA 4TIMA 1K7XA 1T0OA 3JRKA 1SW0A 3NZRA 1F2JA 3NL6A 3Q37A 5KZMA 4O1AA 3NO5A 3NL2A 3LHZA 3GR8A 3LTSA 3W72A 4HSOA 5LZLA 1QPOA 1W5OA 3M0ZA 3W74A 2NXIA 5EMUA 4HPXA 1OF8A 1KM0A 1OX4B 1VZWA 3QC3A 1QDSA 4L4LA 2V9DA 3NQAA 4LVFA 2ZZ2A 3IRDA 3UWYA 1IXNA 3P8IA 3QPZA 5EKYA 3N19B 5FESA 1QAPA 4WQ6A 3HG4A 2FIQA 3SIZA 3W7RA 3OG3A 2R91A 2VFHA 4LV4A 4BK9A 3KFTA 4UFIA 4GFSA 5AHEA 3W1UA 1OVDA 4JYDA 2NZLA 3CTLA 3EWWA 3L66A 3THAA 1ME9A 2ZYFA 4WY0B 2YZRA 5U7SA 3G24A 4RK8A 3DFOA 1PHWA 3W75A 3BLEA 5HQEA 3C0JA 4JIQA 3S8HA 3EWBX 3L2IA 1KFLA 2V2CA 4JEQA 4TX9A 2ATSA 3W9ZA 4OGZA 1TRIA 4AF0A 3TU9A 1TPWA 3HGJA 3JS3A 3HB9A 1BKSA 3W1QA 1CI1A 5LHEA 4FNRA 4XKYB 3BPWA 1VLIA 4KWVA 2WSRA 3WK3A 3KVJA 1QNVA 3YPIA 5K7JA 2C1HA 3E02A 5FF7A 2DZUA 3RNDA 1J2WA 1JCYA 3LXBA 1G6CA 4XBKA 3IEBA 3RLVA 2YPIA 5K9DA 3A24A 3G1SA 5D38A 2WNZA 3W7CA 4YXGA 2H3BA 4K7VA 5D32A 4HSNA 1O5KA 4YLWA 3HO8A 3P5ZA 3W2LA 3GYEA 1TQJA 1VYRA 3VCRA 2C15A 3PY2A 3KAOA 5T26A 1P0NA 2G95A 3BGGA 2NXGA 4QM1A 2B4GA 4P61A 1W1ZA 1FWWA 1XC4A 4ZZ9A 4LY8A 2XFWA 3NQMA 4CQ8A 4UTJA 1R30A 3M41A 5EBUA 1W5QA 5LGZA 4ORMA 3MHFA 3BV4A 3L21A 3DBPA 2C3ZA 1WAUA 1QO2A 3B04A 2FPTA 4UXDA 1Z42A 3O16A 5K4ZA 1P4CA 1TYGA 3NGJA 4AF0B 2OCZA 1S5WA 4QIUA 3EWXA 3PSWA 1R2SA 5FEXA 1EUAA 2CZFA 1OFPA 3S5OA 1H1YA 3PS7A 4XZ9A 3DU0A 3NA8A 4JXCA 1D3GA 4ADTA 1QOQA 1B9BA 2RDWA 2YX0A 4JTGA 1CW2A 1SZNA 2ISWA 3P84A 3DKJA 2J9XA 1OFQA 4LT9A 1QCWA 2QCMA 3PBYA 4RZ5A 3SGUA 1QMLA 3GB6A 1N7KA 2QJGA 1TCDA 2FPYA 2YSWA 3QFEA 4X22A 4YMZA 4AEOA 3GDLA 4UMBA 2B7NA 3IIVA 2R8WA 4A2SA 3B05A 4IJBA 5G5IA 1VCVA 1DVJA 3HPSA 1AG1O 1VH7A 2QCDA 4WX2A 4RJEA 3P8JA 2VELA 1XBVA 3LCFA 1P5BA 1KFJA 2Y61A 1W5PA 3PB2A 1O95A 2GJNA 3PF3A 1H7XA 2C13A 3ZS4A 5LKYA 2PC4A 2A6NA 3TXZA 1NSJA 1KM1A 3SECA 1BWLA 4O52A 3HQ1A 3TKFA 4PH6A 4Z1AA 4M6QA 1H61A 2EHHA 1A53A 1EX5A 2OMAA 4HPJA 3PG9A 3DKLA 4JN6A 3LHTA 3TW6A 1I2NA 3ABRA 4NUWA 5AC6A 3EWZA 1H51A 4ZVJA 3CIWA 4K8EA 1EP3A 4QNWA 3NDOA 3PVFA 2NX3A 4MFEA 3HPZA 1MXSA 1MZHA 3DFSA 1IXPA 1KFEA 3N3MA 1SQ7A 5H2ZA 1FXQA 1ZENA 3G1VA 1SUXA 5HUPA 3W70A 4IMCA 1W3NA 3EEGA 4GJ1A 1TB3A 2W0UA 4JR5A 2E09A 2YYUA 2V8ZA 2ZA1A 4UUIA 1YPIA 1ICPA 4OHQA 4JTEA 1GPWA 3PAJA 3CM4A 1ICSA 4JS3A 2DZWA 2XN1A 1FWSA 3HOJA 3LLDA 5F2MA 1S5TA 3NPXA 4JX4A 4I7VA 1A5SA 2PURA 3UY8A 4MUZA 4JTHA 2Q3OA 4HHPA 3LTPA 3W73A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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