2Z0I | Genus

Total Genus 78

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	78
sequence length	323
structure length	283
Chain Sequence	VLHSGYFHPLLRSWQTAASTVSASNLIYPIFVTDVPDDVQPIASLPGVARYGVNQLEEMLRPLVEAGLRCVLIFGVPSREDSPTIEAVRLLRKTFPSLLVACDVCLLSEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKAALLKHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQYQLPPGARGLALRAVARDIQEGADMLMVKPGLPYLDMVREVKDKHPELPLAVYQVSGEFAMLWHGAQAGAFDLRTAVLETMTAFRRAGADIIITYFAPQLLKWLK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Mus musculus
publication title	Crystal Structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase (ALAD) from Mus musculus rcsb
molecule keywords	Delta-aminolevulinic acid dehydratase
total genus	78
structure length	283
sequence length	323
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date	2007-05-07

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00490	ALAD	Delta-aminolevulinic acid dehydratase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2z0iA00

2ZZ7A 3W7CA 3N19B 5K9XA 3W1PA 3UPBA 4A2SA 3HG3A 4S1FA 1VPXA 1YLVA 3F4NA 5CZSA 5CSRA 2E5BA 3E49A 3G8RA 4KFNA 3TK7A 2JK2A 1ME9A 2Z2UA 4LS2A 3WK3A 5E93A 3RU6A 4K7VA 3CT7A 1C8VA 3L2IA 4TIMA 2RH9A 1D3GA 1IIGA 2QJIA 3R12A 4IGHA 1WBHA 3L21A 2ZCGA 3B05A 3PAJA 2QJGA 3LGEA 2Y7EA 4ZQMA 2NXHA 3P74A 1TREA 5D32A 4M5PA 1KLYA 3NA8A 4XTDA 3LERA 4E0CA 3LHVA 4M6VA 2I14A 3DI0A 3TA6A 1MEHA 4RJEA 3OIXA 1D9EA 4FX6M 4BK9A 1NFBA 4R33A 2GQ8A 1DKWA 3CC1A 3W76A 4LTSA 1ZAJA 4LVDA 2ZTKA 5DELA 3W7RA 1P5BA 1VZWA 1HO4A 1KM6A 3MP3A 5CPOA 3EEGA 3IIVA 3OG3A 5KMYA 2PRHA 5BW6A 1SZFA 4NZFA 1LP6A 2XN0A 3OHIA 5BRBA 4N6EA 1R2TA 2GVLA 3UWZA 2ZZ5A 1G4PA 4AB4A 3C4UA 3HJZA 3FIGA 1O4UA 1GVRA 1NSJA 4LT9A 2Y70A 1XBVA 1X6UA 3QQ0A 2C18A 4WXZA 1RPXA 5HWMA 3GR7A 3OA3A 1CI1A 3IRDA 2CLFA 1FWTA 2C1HA 4DBEA 4PA8A 2E77A 3L0NA 4GUHA 3IIZA 2CZ5A 1QCWA 4WJEA 4BI7A 1GYNA 4Z0JA 1WOAA 1FWWA 1GEQA 3BLIA 1KFBA 2AQWA 1JCNA 5FEXA 2B7QA 3P5YA 3SR7A 2VEMA 2YGYA 1H62A 1LLWA 1SZEA 3M1ZA 1H60A 1GTHA 3EX6A 3FOKA 4BI6A 4ADUA 2NX1A 5DCBA 2QCCA 3U2OA 1UUOA 1TO3A 5D38A 1TPH1 2R91A 1VYSX 2FPVA 4HNTA 1HFBA 3ABOA 3E96A 1G67A 1K02A 4IOTA 4QISA 4XUGA 3WJYA 1F6PA 2ATSA 4I7VA 3W7MA 1T0OA 2HS6A 3U6WA 3HF3A 4FNTA 2CW6A 1TTQA 2DU2A 3D0CA 3S5ZA 1VR6A 3AJXA 2FPTA 1DBTA 4KFOA 4DF2A 1TPVA 3NQEA 4QIUA 1V7YA 2A4AA 1W5MA 2O7QA 3NL3A 4M6PA 4AWSA 1WDWA 1QO2A 2PURA 4IMEA 4NJHA 3TQKA 1MZHA 4O10A 5G4EA 2CLMA 1H51A 3GVGA 3NL2A 1PVNA 5CPLA 1CX9A 2YPIA 5U4NA 1THFD 4WX2A 4P61A 2QDHA 4MPQA 4CQ9A 4Y96A 4RKAA 1GG1A 1IXNA 5KZMA 3EWUA 2OZ0A 4YWIA 4AEOA 2XFWA 4O14A 3ATZA 3Q37A 4UFLA 5HINA 4W9TA 4GJ1A 5F1UA 4K8EA 5HR7A 1EPXA 4I9AA 2Y6ZA 3KFTA 2P1FA 5SWUA 2X1TA 2ZDRA 3WFAA 3LI0A 3NNTA 1GT8A 1W5PA 1BEUA 4HIBA 1Z48A 3THAA 3PSWA 3O06A 2ZRVA 3DHDA 3M43A 3Q2DA 2PCQA 4HN4A 4ZQPA 5FF2A 2P10A 4JXCA 2DZXA 1I2PA 2DJXA 2ZA1A 1WV2A 2YSWA 4NT0A 2X30A 4WY0B 2EPHA 4FNRA 3G1XA 4MZ1A 5K4ZA 1S5WA 1W5OA 1JVNA 1LBFA 1QOQA 1TSIA 3CHVA 1TV7A 1K8ZA 5F2LA 2C15A 2P0OA 3L0GA 3QQ1A 3W74A 3ABQA 4O4VA 1HO1A 3O1NA 4IUOA 1O94A 3ZR4A 3UPWA 6TIMA 3NQAA 3NPXA 1H63A 5KTLA 2QCNA 4JTEA 4UTHA 4CNPA 3QSRA 3EXRA 1H7XA 2NV1A 4UTLA 2GPTA 5FI8A 2B7OA 1PS9A 4EF9A 5EKYA 1P0NA 4OHQA 3W71A 1XUUA 1GQNA 1ICPA 1PCKA 2J9ZA 1KTBA 3C2RA 4AHPA 1YTEA 1TQXA 4O15A 5C5YA 4ZZ9A 3HGJA 2WSQA 1IIHA 2GQAA 3N2XA 1XKYA 3A5VA 1VYRA 3CEUA 5AHFA 4NXKA 3TCEA 3SI9A 1B4KA 1LCOA 1YXCA 3TSDA 3WJSA 3ANYA 4CCCA 3HG2A 2NLIA 1EX5A 2QCMA 1SO3A 2R94A 3P80A 1KM5A 3GIYA 2DJLA 4NXSA 5DCEA 5DBTA 1LDCA 3G0XA 3P84A 1KFLA 3LLFA 5KITA 4MYAA 2YZRA 4NJIA 5DY2A 2C0AA 3E02A 1DOSA 4XKYB 3W1TA 2BX7A 2CFFA 5FEZA 2J9YA 4UTTA 4PH6A 4JTLA 1OYBA 5A8GA 5F4WA 4PL1A 1TPWA 3H53A 1FX6A 3PUEA 4NQ1A 2GUUA 4MKNA 2X1UA 1LOSA 5AC6A 2ZRYA 3TMQA 2YW3A 3O6DA 3P62A 3MBDA 4FNPA 4M7SA 5LHEA 3CLMA 3WJWA 1ADOA 3TU9A 4LOCA 1ALDA 3W7GA 4FNUA 3P61A 1WOBA 3G0SA 4MYXA 4TR9A 4H3DA 4OT7A 1NAL1 2YW4A 5AOUA 5CZJA 1RD5A 2UV8G 3W7IA 3N2MA 3S5YA 3KVMA 4PEKA 2QUTA 2VKZG 2WV8A 3MI2A 3TR2A 4OWGA 3GZ3A 2V2HA 3FKKA 4IMDA 4O52A 4RLIA 3A23A 3PUDA 2RDUA 2WNNA 3NXFA 4RX0A 2RFGA 1Q6QA 3TE9A 2ABBA 3NYZA 3TXZA 1VLWA 4DXVA 3MYOA 3QJAA 4UTTC 4PL2A 1W31A 3NL5A 1JCJA 2BTMA 4UTJA 3W1UA 4ALDA 5J5DA 4ZQCA 3L5AA 4JX6A 1ML1A 2V2DA 3W84A 4DF0A 5K3VA 3S1WA 1QWGA 1G7UA 4TO8A 1P1XA 5G2HA 1ICQA 2GVJA 5FEPA 3NZ1A 3T44A 2Y62A 3G22A 3CPRA 1JUKA 1EP2A 1JUEA 2EGZA 3PC0A 4GC4A 1FQ0A 4YLWA 3ABSA 3IVTA 1KFKA 2PRMA 4BF9A 4JY8A 3KHJA 1KM0A 3KRSA 2ZTJA 5E1QA 1HL2A 4DQWA 4JICA 3S42A 3GXPA 4KWWA 1H5YA 3O8AA 1QPNA 1HG3A 2EF9A 5H91A 1V5XA 4N02A 1OX4A 2ISVA 2VFFA 2Y85A 3L0KA 4RK8A 1IXQA 3NQGA 3SW6A 1ZHAA 3W2JA 4IXXA 4LW7A 3C2VA 3BLEA 1JUBA 4ZQRA 2PC4A 2I1OA 3HB9A 1KFCA 2QCLA 1OK6A 2B7NA 3O16A 2ISSA 5EY5A 1EUNA 1F6KA 3BGGA 4O28A 4JGDA 5D2WA 2B7PA 2AGKA 5K2ZA 4X22A 3LLDA 2ZRZA 3UZ5A 3L9CA 4MVAA 1H7NA 1LLZA 4RCXA 3DKJA 1XDLA 4GUIA 5CPMA 3NQMA 3TKFA 2G5WA 2BWGA 2DP3A 3GKAA 2TMDA 3NQ2A 5HULA 3GDLA 3LRLA 4ORMA 4JYEA 3EWWA 3B04A 5EA9A 1GVQA 3BG9A 3QF0A 3QW3A 5D03A 3MO7A 1MXSA 1A5AA 1LM1A 2QCEA 4YCPA 1OFBA 3KOFA 1YXYA 3MHFA 1D3HA 4IXHA 5KZDA 1H7RA 1A5CA 2ABAA 1AL8A 3NM1A 4H4IA 3DKLA 1F05A 3DI1A 1UCWA 4O13A 4GUJA 3B4UA 5DXXA 4FB7A 2CLLA 3LDVA 3PM6A 3MI3A 1ONRA 2FPYA 3W1QA 2QCHA 1XBYA 4EIVA 3M41A 3TROA 3HPZA 3O15A 4A21A 2V0TA 4XWUA 5AC8A 2R8WA 3L66A 4MIMA 2H3DA 3P82A 1JCLA 1K7FA 2YYTA 4MY9A 2EAWA 3DAQA 4YXGA 1DJNA 3PSVA 2TPSA 3C61A 3UZJA 4O1BA 2ATMA 1KM3A 1QFEA 4JDYA 3B0UX 3M5XA 2FB2A 4MLJA 2BXVA 3IVSA 3N9SA 1B4EA 3C0JA 1H50A 1WX0A 3B06A 1N55A 4HKPA 3MI6A 3EWYA 4JN6A 1L6SA 3GR8A 1DJQA 3LHTA 1Q6LA 3W83A 1SU5A 5F2MA 2QCDA 2V5LA 2C19A 1PCWA 2RDWA 4UNKA 1SZGA 3EWBX 2V5BA 3F4WA 4EWND 4AWUA 4N9EA 1W3NA 4POCA 1OX6A 5K9CA 3LI1A 3HMJG 2J24A 4UTKA 4UMBA 2V2CA 1G7VA 1VJIA 4ZVJA 4HT3A 3BW2A 2YR1A 3W07A 5BNKA 4Z1CA 3UWVA 1TTIA 1Z44A 2WQPA 4O1AA 1TRDA 2A0NA 3QMTA 1WA3A 4OBTA 2FDSA 3TJXA 3OVPA 3JR2A 5U7SA 4M6QA 5D09A 1BTMA 1KFEA 1XUZA 1KBJA 1JRBA 5FF4A 2C3ZA 2E1DA 3O6CA 1X1OA 3MW7A 4A29A 1T96A 1RVGA 2CLKA 1VCFA 2BLEA 4HSOA 5EL1A 4ICNA 1F5ZA 2GJLA 1FDYA 2H3BA 2RKXA 5I3GA 4UTUA 4ML9A 1OX5A 1F7BA 5AHMA 2R14A 2OX1A 3HPXA 1L6YA 2JGYA 2NUYA 5HR6A 3P5ZA 5J5RA 3EX1A 1YADA 4MJMA 5L9FA 3TV8A 2Y7GA 4UCGA 2NXGA 3CWNA 1FWRA 1SO4A 1LOQA 1VRDA 4DPQA 3SIZA 6ALDA 3TH6A 5CZ0A 1GVOA 1LROA 3KVLA 3W1LA 5IBXA 5C2XA 1DL3A 5G2IA 4O53A 3BPWA 3LTYA 2E6DA 1P4CA 1GYLA 3TX9A 5LSMA 2PRLA 3TW6A 4M7TA 1YDNA 1VCGA 4GXMA 1JR1A 4O0ZA 3B0VC 2CLEA 3HGOA 3W1XA 4DO4A 3MYPA 5G4WA 4E38A 4H6KA 4OV4A 2ZZ4A 1L9WA 4HPXA 4Z1DA 1RQHA 3NOEA 2J27A 1G4TA 3HQ1A 3UD6A 1H1YA 2QR6A 1S3HA 3EX2A 1LORA 3M7WA 1YDVA 1YTDA 3SGZA 1A53A 5CG7A 2E6YA 4UTMA 3S5NA 1L6WA 1KV8A 3S1XA 3L5LA 8TIMA 4NNAA 1TPDA 3HGSA 2NX3A 3MMTA 3TNOA 3R8RA 4MFDA 4D2JA 4LVAA 5AC7A 3LXAA 4ZQNA 1OABA 2WOQA 5LNSA 1I2QA 5HQEA 4ADTA 3NG3A 1KA9F 1FCVA 1NF7A 3B0PA 1ME7A 1TPB1 1XM3A 4CQAA 3MBFA 1I45A 4GFSA 2V81A 1UB3A 3C56A 2DZSA 3P8IA 5AB3A 3N14A 4IQLA 4N2YA 1EWEA 3KRUA 4FNSA 3W72A 3PG9A 3MP4A 3C2EA 5I3HA 3EWZA 5D33A 1OFDA 3NR0A 2XN2A 4PCFA 3G1YA 1SW7A 4JEQA 3O63A 3NEVA 2FB3A 2EKCA 5DY3A 5LNRA 2YCEA 4AH7A 3W7NA 1OF8A 3ZS4A 2VFDA 1LTDA 3RNDA 3KVJA 1FDZA 2X1RA 3FYPA 3PB0A 3CTLA 4DEFA 1LRNA 4JD4A 3M44A 5K7JA 2C6QA 2JKPA 4IMCA 5CKSA 2ZZ6A 1DORA 3RF9A 1UASA 4PC8A 1RZMA 1H7WA 4TX9A 4UTIA 3W75A 3GB6A 3P8JA 5I3KA 4AHOA 3VNDA 4JS3A 4C1KA 4UIOA 1G6CA 4JIQA 5LZLA 1ZJIA 3EB2A 2TYSA 4JNMA 1GZGA 5EMUA 4I7UA 5ABTA 4RZ4A 4NX5A 2WJZA 4JX4A 1KBIA 1Q6RA 4EF8A 3LTPA 1SUXA 5EPDA 4NNCA 2A6NA 3N3MA 3ATYA 3G8EA 4GE8A 1GVFA 4HNVA 2F84A 4CCEA 3LV6A 4GBUA 2OJPA 2QJHA 4MUZA 4AF0A 3GXNA 2W6RA 3K30A 3QPZA 2HMCA 1H7OA 1AW1A 1LBMA 3I68A 4XTIA 4O4WA 2B0MA 3QM3A 5LNVA 4IWWA 1N7KA 2F7FA 4X9SA 3IIXA 4BI5A 5HWJA 3NQFA 2A7RA 4AVFA 2RHGA 3SJ3A 2J9XA 3ABRA 3U8GA 4NU7A 4XZ9A 3CWOX 1W3IA 1DV7A 4O18A 4FIRA 3BVJA 1OJXA 3VE7A 3QC3A 1B57A 1FUYA 1FXQA 1QR7A 1BWKA 4QNWA 2CZFA 3A5FA 3P7YA 4QSHA 1A5BA 1XXXA 5F1VA 3O07A 3W1NA 2Q3RA 4UFHA 3WK1A 1I2NA 1SFLA 2D73A 4WUIA 1I8JA 3GNNA 4P2VA 4UXDA 4ZMGA 3A21A 3EX3A 4LNYA 3GYEA 2VFEA 1T8XA 3F03K 2VFIA 4A2RA 1TB3A 2NUXA 1A5SA 5LGXA 3SGUA 2FQIA 4Q33A 2ZQ0A 4LS1A 3NPWA 1KTCA 1U83A 4UR8A 3CM4A 3W2UA 1TYGA 3G1AA 1M5WA 5A5WA 1O95A 1XI3A 3SECA 4FX7A 2ZFAA 2NWRA 1OG0A 1B3OA 1KTNA 3M9YA 4O0KA 5D02A 1ZNNA 3EKZA 2HSAA 5LHFA 1VCVA 4R53A 2CZEA 4C1LA 3TFCA 3G0UA 4PFMA 3S6DA 1FY6A 3UY7A 5HWNA 3QEZA 3BG5A 2E6AA 3OVQA 3UWWA 4FF7A 4JTJA 1MSSA 3NZRA 3I65A 4N4PA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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