2Z6J | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	320
structure length	307
Chain Sequence	MKTRITELLKIDYPIFQGGMAWVADGDLAGAVSKAGGLGIIGGGNAPKEVVKANIDKIKSLTDKPFGVNIMLLSPFVEDIVDLVIEEGVKVVTTGAGNPSKYMERFHEAGIIVIPVVPSVALAKRMEKIGADAVIAEGMEAGGHIGKLTTMTLVRQVATAISIPVIAAGGIADGEGAAAGFMLGAEAVQVGTRFVVAKESNAHPNYKEKILKARDIDTTISAQHAVRAIKNQLTRDFELAEKDAFEQMGAGALAKAVVHGDVDGGSVMAGQIAGLVSKEETAEEILKDLYYGAAKKIQEEASRWTGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__559050995630332__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__559050995630332__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2Z6J/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__559050995630332__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"559050995630332","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2Z6J/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__559050995630332__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Streptococcus pneumoniae
publication title	Crystal structure of enoyl-acyl carrier protein reductase (FabK) from Streptococcus pneumoniae reveals the binding mode of an inhibitor. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Trans-2-enoyl-ACP reductase II
total genus	112
structure length	307
sequence length	320
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-08-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2z6jA00

1H7WA 2GVLA 2ZZ2A 1TO3A 2B0MA 3WK1A 4FXSA 4DBEA 1Z42A 1TREA 1SSGA 2V30A 3W7HA 3CT7A 4MFDA 4XTDA 5G2WA 1NF0A 3WJXA 3LGEA 3LTYA 3CIXA 3EWYA 5J5DA 5K7JA 2Y89A 2VFDA 3BW4A 3NPUA 3PF3A 3UWWA 3UY8A 4GJ1A 1OX6A 3B0UX 4I9AA 5F4SA 3W7KA 3HBLA 1YPIA 4M19A 3E49A 3MYPA 3CU2A 3NQCA 4K8EA 4RK8A 6ALDA 2A7NA 5CZTA 2A85A 2TSYA 1TPB1 4IX2A 4NNAA 1VH7A 3HPSA 4BFAA 4LV9A 3UQNA 3TROA 1LDCA 2J6XA 3PAJA 1QNVA 5K3VA 2HS8A 2CU0A 3UWUA 1YTDA 3EX4A 4BI5A 4QITA 5D2WA 4UNLA 3N9SA 1V5XA 2OZ0A 3NGJA 3DAQA 4O28A 3DBPA 1M7OA 5E1QA 3LTSA 2NX3A 2G96A 2NV1A 5BRBA 3DENA 1LRQA 1EP3A 4IQLA 4TMBA 3QRHA 1GPWA 2RDTA 3QJAA 4OU1A 1VHNA 2QCGA 3W2MA 4NX0A 2DZVA 4DF0A 1OX4B 3HG3A 2Y63A 5DCEA 1W5NA 2H6RA 4IJBA 4DF1A 5BOOA 3TSMA 5HWNA 3W7NA 3WFAA 3HMJG 4JDBA 1VR6A 4RZ5A 4A21A 5GVJA 2E5CA 3PBUA 2VELA 4S2CA 3LI1A 4O19A 4Y6GA 3GZ3A 3C2RA 1FWNA 4GWEA 4NNBA 3W7QA 1EA0A 2BLEA 4HKPA 3KVJA 4MVAA 2YW4A 2GJLA 4MY8A 2DZSA 4O53A 4O1DA 4DEFA 3W7RA 3IRDA 3LLDA 3UWQA 4IOTA 1UUOA 1SW7A 3R8RA 3LCWA 4WX2A 5C55A 1YPFA 4HSNA 1SO6A 2E77A 3O6CA 1Q3NA 5LNSA 1I2QA 2B7QA 4GNJA 4PODA 5K4ZA 3GAKA 4ZQNA 4RKAA 1W37A 2FDSA 4GUJA 1L2UA 3TQKA 3TAOA 1D3HA 3TA6A 3PG9A 3EWUA 2YR1A 4LUIA 5BNKA 2ATMA 3BLIA 2X1SA 1QOPA 1DQWA 1Q6RA 2O7SA 1M6JA 1ME7A 2Z1BA 1JCLA 1W5QA 1GVRA 3CHVA 2J9ZA 2ISWA 4JS3A 1EB3A 4XTIA 3S1VA 1D9EA 1WBHA 1SO4A 2NUYA 2Y7GA 1ME9A 3PG8A 3M6YA 1GOXA 3W22A 4LV4A 1O5KA 3QW4B 2BWGA 2H8ZA 1AK5A 1VJIA 5LNRA 4WXZA 2ZFAA 3V1PA 3O15A 1B4KA 4KWVA 4CNPA 5HR6A 3ABOA 2VEKA 4ORIA 3P8JA 4JYEA 3U2OA 1KV5A 4U28A 3O6YX 3ABSA 5HJLA 3W70A 1R2RA 2ZZ7A 1JCJA 3GKAA 2Y70A 1F2JA 4HT3A 1VGAA 2HS6A 2DP3A 4JTLA 4RZ6A 2ZRUA 4PTNA 3L9CA 5EY5A 5I3KA 2CLOA 4JICA 4KWWA 4CQ8A 4ZMGA 3BGJA 3SFKA 2QR6A 3I7RA 4FO4A 2V2HA 1XUUA 1OFPA 1OFAA 1KFJA 1VYPX 2Q8ZA 3NPVA 1VYSX 4O16A 1YYAA 2AQWA 3FJ6A 4NJGA 1E51A 4LC8A 3YPIA 3NOEA 4DBDA 1F7BA 1GVQA 1OABA 3GDTA 2PRLA 3TK7A 1ZALA 4D2JA 1G4EA 4JEQA 2A2IA 1N7KA 5D09A 4A2SA 3UXDA 5AYYA 2YYUA 4MKNA 4O10A 4UIOA 4S2BA 4N9DA 3GDMA 1FY6A 3UWYA 4C1KA 4O1AA 3W7IA 5L6UA 2QCDB 3E0IA 1DJNA 3BO9A 3NM3A 3GR7A 1YTKA 3CWNA 3EEGA 2J88A 1VYRA 3EWZA 1O60A 1GWJA 2TRSA 2B7NA 4UR7A 4CCEA 1YLVA 1M5WA 1H7RA 1OYBA 3W1XA 5LGZA 1ZFJA 4NXSA 3NL2A 4OV9A 1G4SA 4HNNA 3THAA 3MHGA 4M5PA 4NQ1A 4A2RA 2QCHA 4GE8A 1TPH1 3MP4A 1MZHA 3N2XA 3IV3A 4M6QA 1SR9A 2DZUA 3NQVA 5I3IA 1F5ZA 5G4WA 4HIBA 4Y96A 4O50A 4RX0A 3W1TA 3MO7A 4CNOA 3Q58A 4Z1DA 4LVGA 4TO8A 5BMWA 2Y88A 1UUMA 2OT1A 3SR7A 3M43A 4JR5A 4EVZA 1RV8A 1WX0A 1S5TA 3GX9A 3N2MA 4DO4A 3IIXA 2OCZA 1HO1A 1BKSA 1DJQA 3DHFA 1W5OA 1CI1A 1FCVA 4LW7A 2WQPA 2E5BA 5AB3A 1KM5A 4N9EA 3EXTA 3LHTA 2C16A 1H1YA 4LC6A 4QAIA 5I3GA 4LT9A 1GTHA 1PCKA 2V2DA 2X30A 3KRSA 1FCUA 1TQJA 3WK2A 3GDKA 2NV2A 4FNPA 3SW6A 3TFCA 2AGKA 2CLFA 4P2VA 1WBJA 5K9DA 1TB3A 4JTSA 5HUOA 3RK8A 2YSWA 4JDYA 1P0NA 2QCEA 1C9DA 3PS7A 3NQ8A 2YFOA 1KW1A 2TYSA 1FXQA 2RDWA 3W1RA 1Y0EA 2JBMA 1ZCOA 3I65A 4MYAA 4UFIA 2RHGA 4YMZA 5HWJA 3UY7A 3KFTA 4PFMA 6TIMA 1SO3A 2ATSA 1G69A 2E09A 3USBA 3W7GA 4DQWA 2V8ZA 5K9XA 1LORA 1VCVA 2Y62A 4G1KA 3A23A 2EHHA 2QDGA 3LBMA 3PY2A 3NNTA 1KA9F 4PA8A 4Z1AA 4M6PA 2NUWA 2E6FA 4ADSA 4DPQA 3UD6A 1K7EA 4CCCA 4IMGA 1OYAA 1G7UA 1F05A 2C1HA 3C4UA 2ZRXA 5EBUA 5C54A 4RR4A 2CZDA 1QWGA 3VNDA 4ADTA 3NYZA 2QF7A 1OF6A 1XXXA 3G1VA 3HGJA 3D0CA 1TTPA 5HUPA 3TE9A 4MFEA 4MZ8A 3OIXA 1R2SA 4AMAA 3LV5A 1A5BA 1FUYA 1RPXA 3R12A 5F4XA 5BW6A 3V75A 2JGYA 3DKLA 3EWXA 3LCHA 4KFPA 1IIGA 3MBFA 1RZMA 1T96A 3A22A 3T44A 5F1UA 1QDSA 3DFNA 2CLLA 3QF0A 3LHZA 1AL7A 3W1QA 4IMEA 2VXNA 5F1VA 3W3OA 5CZJA 1IXOA 4AB4A 5EA9A 3BW3A 3MJYA 5G4EA 1FQ0A 3IIVA 1CX9A 1H7OA 3TDFA 3LX9A 3W87A 3L65A 1LOSA 3P5ZA 2ZRVA 3E02A 3QC3A 1RD5A 4O17A 3FLUA 4JX4A 1W5PA 3TR2A 1GVFA 4LS2A 5E0KA 3W7DA 3GXPA 1FBAA 1LOQA 2W79A 1R30A 4UFHA 2I9EA 5AHIA 1RR2A 3W84A 1TPUA 2O7QA 3P60A 3CB8A 2OT0A 3KRUA 2YGYA 1FWWA 3T7VA 4L4LA 1TPVA 4JTHA 5AC7A 3P82A 4UR8A 4RJEA 2ZYFA 3IIOA 3NQMA 4NZFA 4XZ9A 1VRDA 3LCXA 2NWRA 5CSRA 2QCCA 5AHNA 4ZQRA 3BW2A 5D2YA 3N19B 4RXGA 1P0KA 4CQ9A 1YXCA 4N9BA 2KZHA 1HFBA 1T8XA 3RNDA 3NA8A 1W56A 2E6AA 2J24A 5F2IA 2C3ZA 5CSSA 2QJHA 3TQ0A 1PS9A 3G1DA 2R14A 2ZQ0A 2FFCA 3OHIA 1ICSA 1ZAHA 5AC6A 2HTMA 3FYOA 4CNNA 4MYXA 3QQ1A 4QSHA 1FXPA 4MJMA 4MJZA 4FEZA 1OFRA 2CLEA 1JUEA 3ZWTA 2IQTA 1AMKA 2QCLA 2YDAA 1XKYA 1YDNA 2NXIA 3MP3A 5KSWA 1GZGA 2DJLA 3C2OA 3W7MA 4JTIA 3PC0A 2D73A 3W7PA 1NVMA 1F76A 1JRCA 2QUVA 1EP2A 2VFEA 4LRTA 3EKLA 3F4NA 1YXDA 3S5YA 3L67A 3S1UA 3LTPA 1H7NA 3QSTA 4JXCA 1XUZA 4WD0A 1UCWA 1W3IA 4UCGA 3GK0A 1OFEA 3A24A 1F73A 3DFTA 3QH2A 2FB2A 4O12A 3FIGA 3OVQA 1OX5A 1HG3A 1U83A 3NQDA 5HULA 3RLUA 4POCA 1Q6LA 3N73A 1LTDA 5DXYA 1BEUA 3EX3A 5U7SA 2CLHA 3W85A 4JIQA 1HTIA 2F84A 3WJWA 1I4NA 1LLZA 2JKPA 3HPXA 1WV2A 4HNTA 3ANYA 3M9YA 2VFHA 3PUEA 1K3UA 3FKRA 3NL5A 4CQAA 4N4PA 2GPTA 4YCOA 2I14A 4X3ZA 3W7LA 4XKYB 3IIPA 3BG3A 1AW2A 2CW6A 1LCOA 4GFSA 1HUVA 1Q6OA 3CQ0A 2B7OA 4O0ZA 4AWSA 1DVJA 4OHQA 4BI7A 1HL2A 3BPWA 4Q4KA 2Y61A 4MY1A 3JR2A 3E12A 3B04A 4I7UA 1X8FA 2I1OA 2CZFA 1B3OA 1IXQA 5CZ0A 1NEYA 1MEHA 3FJLA 4HPXA 3L68A 1H51A 4O11A 3O63A 3W1PA 3GXNA 5FEWA 3QZEA 1Q6QA 1RQHA 1C29A 3C2FA 3R89A 3CPRA 2BSLA 1G67A 3LCIA 3B03A 4ZQCA 3GNDA 4WXYA 3STGA 4UFLA 5LZLA 4ICNA 4WY0B 1QPOA 1OFOA 4TIMA 3L5LA 2CLIA 1XL9A 4MY9A 5K2ZA 3TCEA 3UPBA 4WOZA 3L2IA 2NXGA 4BF9A 2PRMA 3ZWSA 3T40A 3P80A 1GG1A 1B57A 3C2EA 2C6QA 3F03K 4O18A 3LLFA 3G3MA 3G3DA 3NPXA 4HHPA 5FF4A 4OWGA 2VFFA 4LVFA 4O0KA 5KZEA 4A3UA 1N55A 3VFLA 3L0NA 3W07A 1SQ7A 1WQ5A 4HSOA 1QMLA 3F4WA 3GDLA 4JTJA 4RCXA 4CCDA 2XN0A 4GRSA 4RV8A 4AAJA 2ZDRA 4MIMA 1H60A 1OVDA 3C61A 2WSRA 4WY0F 2E6DA 4N6EA 2WNNA 3W72A 4RZ4A 3CEUA 1LP6A 1FX6A 3QMSA 3PSVA 3RU6A 3QFEA 4JD4A 2ISSA 2A21A 3QPZA 1CW2A 1TV5A 1K8XA 4QNWA 1L6YA 1N8FA 2FIQA 1BTMA 3HGOA 2XN2A 2H3BA 3IIZA 5A5WA 4LNYA 3M5VA 3CTLA 4NJJA 2FPVA 1KM3A 1KFCA 2GOUA 5FF0A 3QYQA 1ZJIA 2V0TA 5G2HA 5KMYA 1QPNA 3OBKA 2YPIA 4PL2A 3LBCA 2JKAA 1YXYA 1FCQA 4IMCA 4OGZA 3T4CA 1TQXA 1MEIA 2QAPA 1SFJA 5IM51 3B8DA 3MMTA 1OX4A 3S5NA 5H2ZA 7TIMA 2Y7DA 4A22A 3HIJA 5C5YA 3W2UA 1SZNA 4LTSA 1LM1A 4FNTA 3DGRA 1VPXA 1K7FA 1VCGA 4AWUA 5D30A 3ABRA 1XDMA 4ORMA 2WO5A 3NZ1A 3EKZA 1OFDA 1TSIA 3S0CA 1KM2A 4JY8A 1TMHA 2A6NA 1WA3A 1X6UA 2QJGA 3M5ZA 4A29A 3G0SA 4KFNA 3ATYA 1XCFA 2ZA3A 3N3MA 1H61A 2GVGA 3CEPA 1DOSA 1OFQA 3ZS4A 4MUZA 3QMTA 5F2GA 2A4AA 3C52A 3EXRA 5D04C 3HG5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3W24 A;  1EH9 A;  1GJW A;  2QCM A;  3KOF A;  1A5M C;  2RDU A;  3PBW A;  4J27 A;  4M24 A;  4D8Z A;  2PA6 A;  4HK6 A;  5G1Y A;  1EXB A;  3SCO A;  3S5Z A;  1QTW A;  5FD0 A;  3OA3 A;  1MFU A;  3ABX A;  3TJX A;  1EZW A;  3DI1 A;  2W91 A;  4OBR A;  2EPN A;  1H7X A;  3R25 A;  2V3G A;  5HNR A;  3H22 A;  4TQT A;  3WZ0 E;  2G8Z A;  2OSX A;  3QV9 A;  5FJO A;  1XWY A;  3WCZ A;  2DVT A;  1XBY A;  3C2V A;  4JNM A;  1Q5M A;  4Q4O A;  1QI5 A;  1KKO A;  3RO8 A;  1SW0 A;  3PZU A;  4K7Y A;  4IWW A;  2ZXB A;  4ICC X;  4KWS A;  4UC5 A;  1FWS A;  3DZ1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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2Z6JA

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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