2ZCGA

Structure and inhibition of orotidine 5'-phosphate decarboxylase from plasmodium falciparum
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
320
structure length
318
Chain Sequence
GFKVKLEKRRNAINTCLCIGLDPDEKDIENFMKNEKENNYNNIKKNLKEKYINNVSIKKDILLKAPDNIIRKSEEFFYFFNHFCFYIINETNKYALTFKMNFAFYIPYGSVGIDVLKNVFDYLYELNIPTILDMKINDIGNTVKNYRKFIFEYLKSDSCTVNIYMGTNMLKDICYDEEKNKYYSAFVLVKTTNPDSAIFQKNLSLDNKQAYVIMAQEALNMSSYLNLEQNNEFIGFVVGANSYDEMNYIRTYFPNCYILSPGIGAQNGDLHKTLTNGYHKSYEKILINIGRAITKNPYPQKAAQMYYDQINAILKQNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Inhibition of Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase from Plasmodium falciparum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 119
structure length 318
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2007-11-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zcgA00
2QCHA 1U5JA 4XBSA 2Z6IA 3ELFA 5KMYA 1MO0A 4JY9A 3W71A 3W1AA 3FA5A 5LHFA 1S5TA 3CWOX 3O6YX 3WJWA 3W2UA 2CLFA 2QCEA 4O15A 4UTTA 1VS1A 1O60A 1OFAA 3CC1A 4O13A 3G3DA 2VFFA 3E9AA 4O17A 3TAKA 3B4UA 1Q6RA 2WKJA 3MHUA 3A9IA 3GDTA 4GXMA 1W54A 1LYXA 2TSYA 3EB2A 2QDHA 3NO5A 3W1QA 3BVJA 3TAOA 3KAOA 4HPXA 4A21A 5K4ZA 3L66A 3UZ5A 4CCDA 1H62A 3M43A 4HT3A 1FCVA 4FNUA 1QWGA 1TB3A 5FF3A 4E38A 1K7XA 5K4XA 3W7HA 3TJXA 4UTWA 3HIJA 1RPXA 4GUHA 4ONVA 4UTMA 4IMCA 1ME7A 4UC5A 1RV8A 4WUIA 3LBMA 3BK0A 2EF9A 4FXRA 4LVDA 1O5XA 3HGJA 1K8YA 3FFSA 4GNJA 1SR9A 1XFBA 3UWZA 1YTKA 3O15A 4ZQNA 3G0SA 3DI0A 5AHNA 4HNVA 4OT7A 3ABSA 2VFEA 4O1AA 1QO5A 1VQTA 2EGZA 2RDTA 3DKLA 5LGXA 4O50A 2O7QA 2ZYFA 2FLIA 1Z41A 2GVJA 1WDWA 1T0OA 5CPLA 2ZRVA 4DO6A 3TIMA 4JS3A 5D2TA 5HULA 3QMSA 3HO8A 3JS3A 3V75A 4YMZA 3L5LA 3ZWSA 5TQLA 1PHWA 2QJHA 4JTFA 1IF2A 1KLZA 3G1VA 3B0UX 6TIMA 3QSTA 1Q6QA 5GVJA 1FWWA 1SO3A 1TQJA 3N2MA 2FQIA 3C2EA 4LU0A 4NNBA 4R53A 5D04C 3P80A 3AJXA 1JRBA 1KFEA 2YZRA 5F1VA 1G4SA 2Y70A 3CLMA 1LOSA 5A8GA 4TMCA 2DZVA 5HMSA 4AHQA 1G69A 3S1UA 4JYEA 5FF7A 2HS8A 2ZRWA 3W1LA 5G4WA 1KV8A 4GC4A 3W22A 5DXYA 5HUPA 3RFAA 5D2WA 1VYPX 3EX1A 5D02A 1EPXA 2P10A 1I2QA 3GAKA 2Y7FA 3KVMA 3LTSA 1H7PA 2VEPA 2Y89A 1J4EA 1QPQA 3QJAA 1A5AA 3N9SA 2E68A 1DOSA 3STEA 3EXRA 5DY3A 1QAPA 2NXIA 3SY5A 1H7WA 1LBLA 3O8AA 1TIMA 3OVPA 1KM0A 1W56A 4RV8A 4JR5A 1Z42A 2C13A 3PSWA 2DJLA 3C2FA 3EWUA 4N9BA 2QUTA 4A22A 1W37A 3ZFHA 1JUEA 2GQAA 3MI3A 4QJ1A 4GBUA 3W73A 3AO0A 2YCEA 4IQLA 5BNKA 1YYAA 5C55A 2OZ0A 3NQDA 1A53A 4RR4A 3E0IA 3CTLA 4NJJA 1WAUA 1F6PA 1S5WA 1LLWA 3M5XA 4LS2A 1QNVA 1H7OA 4GUFA 4UR8A 3CU2A 1VYRA 2Z6JA 4R33A 1JUKA 4MYAA 3TW6A 4RXFA 2VFIA 1ONRA 1SSGA 3C61A 2FDSA 3C2VA 4K6AA 5D38A 3W2LA 2WQPA 2AAMA 3NL2A 4O14A 3PY2A 4MZ1A 3SSJA 4BF9A 2QEZA 5J5DA 1H60A 1OFEA 2HMCA 3LHVA 3LRMA 1FX6A 4DF1A 3UQNA 3T78A 2TRSA 1G4PA 1G67A 1I2NA 2C14A 4FNPA 4O0ZA 3TH6A 3W2KA 1G6CA 1ZFJA 2H6RA 4O12A 3V1PA 2ATSA 4PA8A 2CZDA 4IOTA 4WJEA 4EIVA 2CLEA 3BGJA 2ATMA 4LVBA 1FWNA 2KZHA 2YX0A 2Y62A 1PVNA 3Q58A 2Y7GA 2R91A 3W76A 3DHFA 4LVAA 5G2WA 5G2IA 3QF0A 3ZWTA 3CM4A 3GDKA 1XL9A 1EWEA 3G18A 2A6NA 2WV8A 3G1FA 3M5ZA 1NVMA 3NR0A 5FF4A 1GWJA 4LRTA 4MFEA 3W7KA 3C4UA 2ZZ7A 4P61A 2EKCA 3NQ7A 4JNMA 5D05A 5LNWA 1ICPA 2YFOA 2WJZA 3BLFA 3N2XA 3HOJA 3GVGA 4ZQMA 5G5IA 4WOQA 3MJYA 5KSWA 3THAA 3PS7A 1WOAA 3HGRA 3RK8A 1ICQA 3DFNA 4G1KA 1W5QA 4AWSA 1KFBA 3T55A 3EWYA 1DORA 1X8FA 2ZZ3A 1GVOA 2FIQA 4UFKA 3F4NA 3L5AA 3WK3A 3TQ0A 2YYUA 2AQWA 2I1OA 3L67A 3L5MA 1MXSA 2CFFA 1TV7A 2QCGA 3TSMA 3VKJA 4N4PA 2WNZA 5AFDA 1LOLA 3HPZA 4KFOA 4GWEA 5IBXA 3EX2A 4ZVJA 1SU5A 3P8JA 3W1XA 2X30A 1OFQA 3Q94A 4IPIA 4MZYA 1K7EA 3NL3A 1QO2A 1IXNA 3N3MA 3LBCA 1KTBA 5LNSA 3T7VA 1Z44A 5K9CA 4HKPA 5D30A 3W1UA 3LHZA 3OG3A 2R8WA 3N14A 1ZCOA 1TYGA 2ZZ6A 2GVLA 5EA9A 4FNRA 4RZ5A 3W6YA 1XBZA 3KFTA 3W85A 1EA0A 1GEQA 4FNSA 3DZ1A 3TA6A 2P0OA 3P8IA 3BW2A 2QCNA 1TPDA 2PCQA 4XZ9A 1BTMA 2GOUA 4M19A 3T4CA 3UY7A 3BLIA 3EXSA 2NUWA 2X16A 2YW4A 2X1TA 5DELA 1W5MA 1GQNA 3BG5A 4QIUA 1V5XA 1R30A 1LRNA 1NAL1 2E6DA 4MOZA 3UWUA 3UWQA 1ICSA 2C19A 4M6VA 2NWSA 2Z1BA 3SECA 2DZTA 2V2DA 1OYAA 1PV8A 3TSDA 1GG1A 3IIPA 3SW6A 4HSOA 3MYPA 3R13A 3ZS4A 5BRBA 1H7XA 1N8FA 1ZJIA 5KINA 1LOQA 4IMFA 2V8ZA 1FXPA 3DU0A 1AW2A 2WNQA 1LDCA 1LM1A 5CSSA 3WFAA 2FJKA 2OT0A 2V81A 3FS2A 3NQGA 1K03A 1K8XA 3QEZA 1W5PA 1SZGA 3OHIA 1DJNA 1YTDA 4CLMA 1BWLA 5DY2A 3HBLA 3LCIA 3GR8A 1JR1A 2QDGA 4WY0B 4Y6GA 4GRSA 5G1TA 2V82A 3LV6A 4DBEA 1W3TA 4YCOA 3MMTA 2Y63A 1GOXA 3PVFA 2G95A 4JTGA 4AAJA 3QMTA 3TQKA 2I14A 4L4LA 1W31A 4ZZ9A 1I2RA 1WOBA 1S5VA 1X1ZA 1TPH1 4KFPA 3LHYA 5AYZA 4AB4A 4TIMA 2Y61A 4MY9A 4N9CA 3O6CA 3B0VC 3KRSA 2X1RA 1G7UA 1GVSA 3TK7A 3DFTA 5CSRA 1VZWA 3W88A 1RZMA 4XUGA 5D33A 2PC4A 1QPRA 3CHVA 3CWNA 4AH7A 1O4UA 4O19A 3LRLA 5KITA 1PS9A 4N6FA 3RMJA 3LCGA 4OGZA 2J9YA 3PAJA 1R46A 3P5YA 4Y90A 3LCHA 3RU6A 3PC0A 4CQ8A 2YGYA 4LOCA 4KWWA 5CKSA 1EIXA 5C54A 5F4SA 3BW3A 3PR2A 2WOQA 4DF2A 1I2OA 5BOOA 3NXFA 4O1CA 4A2SA 3B06A 2Q8ZA 3NPUA 4J9JA 4NZJA 4MJMA 2ISWA 1HL2A 1H50A 4M6QA 4O8RA 4NXSA 3KRZA 3I7RA 4O11A 4HN4A 1EP2A 5IBXC 1JQVA 3ATZA 4AF0A 3MYOA 3LCXA 3GX9A 5LNUA 5F2GA 4RZ4A 5E93A 1TTPA 4WY0F 2FPVA 1BKSA 4FIQA 3TXVA 3W1MA 1PCKA 1OX4A 1VCVA 1TV5A 1SZEA 1UCWA 2J9XA 2P1FA 2BWGA 1S3HA 4O4VA 4UTUA 1WBJA 3W7OA 1R2SA 1VLWA 5F2LA 3NM3A 3P81A 4WD0A 3C2RA 5L9FA 1WBHA 2AGKA 4OBTA 1H7NA 5EPDA 4X3ZA 1DV7A 2YSWA 4GE8A 5H2ZA 3P84A 2XFWA 1GG0A 2QKFA 2W79A 2W6RA 3GYEA 3I7QA 1Q6OA 4QM1A 3B0PA 3G1AA 4UFHA 1O94A 2V0TA 1OK6A 4DXVA 1VCFA 1O95A 1WXJA 3NQMA 3W1NA 4MYXA 3ZR4A 2V2CA 2A7PA 1C29A 3GZ3A 5HINA 4JTLA 5DCBA 2ZZ5A 1TTIA 5HWNA 1KTCA 4Q4KA 4K39A 1F05A 4Z1DA 5EBUA 1HO4A 4X9SA 4DF0A 5LGZA 3NZ1A 2ALDA 3M6YA 3W1PA 4O18A 4AHOA 3EWZA 4LRSA 5U4NA 2OJPA 4NU7A 3QM3A 4MLJA 4PODA 4JTEA 4LW7A 2NWRA 1F7BA 4KFNA 1FCBA 1KA9F 3KX6A 1XDLA 1C8VA 3PBVA 4M7TA 3W75A 1XBXA 4JTIA 2A21A 3JRKA 1CW2A 2YPIA 4BWLA 4NJIA 2NLIA 1LCOA 1A5BA 2FB2A 3G8RA 1R2RA 2GPTA 2ZCGA 5U7SA 1QFEA 3L68A 3HG5A 1T96A 4K38A 3FYPA 4A2RA 4CQ9A 2I9EA 2B4GA 2E77A 4ZQRA 1OG0A 4Z1BA 2DJXA 5CG7A 3WJXA 4CNNA 3HG3A 1UJPA 1Z48A 5KZDA 2V5BA 1OF8A 3BG3A 3RLVA 2D73A 4X2RA 3TUUA 2A85A 1TTJA 4FXSA 1ZHAA 1JCXA 5F2IA 4XKYA 1Q3NA 3OEXA 3EWWA 4O1BA 3HQ1A 1ME8A 3UY8A 2ZBTA 3QPYA 2QCDB 3MP5A 1GTHA 4UNKA 3MWAA 4O1DA 2VKZG 3ABQA 4Z0JA 2ISSA 3G1YA 3W7GA 2V5LA 5TBOA 4QSHA 1QMLA 5EYWA 2DZUA 3LLDA 2A1YA 2CWNA 3P60A 3LERA 4LVFA 1KM2A 1TSIA 1LP6A 4FX6M 1YLVA 5DXXA 5BMWA 5AC7A 3DFOA 3P7YA 3PB0A 4LT9A 3IV3A 2UV8G 4OQVA 2ZFAA 3Q2DA 1TJPA 4KKXA 1D9EA 4EVZA 3OVRA 1A50A 2V30A 3QSRA 4JTSA 1TPC1 1XM3A 1VC4A 3RLUA 3A5FA 4DO5A 4NZFA 1DQWA 1TV8A 1ZY9A 2RHGA 4I7UA 4PFMA 4CNOA 2NXGA 2HS6A 3FJ6A 3G24A 4ML9A 4UTKA 3IEBA 3SJ3A 4AXKA 2G97A 1H51A 2V9DA 1B9BA 5LNRA 3A22A 2JKAA 1G4EA 4UMBA 2RFGA 3NGJA 4A29A 1VHNA 5L6UA 3NQ6A 1H5YA 1N7KA 4WXYA 4YWIA 3O05A 3TC6A 2VFGA 1L6WA 5CPOA 4PEKA 3LHUA 3JR2A 2E5CA 3QYQA 3S1XA 2A4AA 4AHPA 1JCNA 2YFNA 3TMLA 4DEFA 2FPTA 3NQVA 1TPUA 3MHFA 5LZLA 1H1ZA 4RK8A 3W3OA 3W07A 4LV9A 1KM1A 2HSAA 1X1OA 2C0AA 2BXVA 1WA3A 3LB0A 3S5YA 4O16A 4LWWA 3S5ZA 4UFMA 1M6JA 3QMRA 2J9ZA 3M7WA 2CLLA 4UTTC 4MY1A 1ME9A 4IX0A 2DZPA 2EHHA 3W7EA 4TO8A 2FFCA 1A5CA 3BV4A 1L9WA 3DENA 2C16A 1OYBA 4NJGA 1C9DA 3IRDA 4RLIA 1LLZA 4S2BA 4BI7A 3UXDA 3W7CA 2E6FA 1I4NA 2E6AA 1KBIA 4AMAA 4DPQA 2DU2A 3E02A 3W2MA 3GAYA 1AW5A 1T8XA 4K8HA 3G1DA 5CZ0A 4LVGA 1QR7A 3M1ZA 3DFPA 4O28A 3FKKA 1DQXA 1GVFA 1MEHA 4LV4A 4E2BA 1VH7A 4UTWC 3LCWA 5F4WA 3LXAA 1VRDA 2GQ8A 4UTHA 3W7RA 3GKAA 4WOZA 3A24A 5HR6A 5K9XA 4UFIA 2GUUA 3NG3A 4U4MA 4FB7A 4Z1CA 2NX1A 5CZSA 1UUMA 5J5RA 1W0MA 3KRUA 1W5OA 1N55A 1MEIA 2DZWA 1CX9A 3E96A 3MP3A 1RD5A 3LM7A 4JTKA 1KFCA 4GUGA 3HJZA 3PSVA 3WJZA 1E51A 1KBJA 3U8GA 4LC8A 4JX6A 3LV5A 4K36A 1OX5A 3MW7A 4XTIA 2ISVA 2ZRXA 5F1UA 1JRCA 3GLCA 4NNAA 3TC7A 4IX2A 2GJLA 3M41A 1XUUA 3HG4A 1K3UA 4EOUA 3THQA 5TIMA 3MUXA 3TE9A 5AN7A 3UPWA 3K30A 5AC6A 1SW3A 1D3GA 3T40A 5K9DA 3IIZA 3OA3A 3F1QA 3E49A 2Q3OA 5AHIA 3R89A 1CI1A 4LS0A 5BMXA 2DP3A 2B7OA 1AL8A 4QITA 1K7FA 1PE1A 4O57A 4LS1A 3HPSA 2QAFA 3PBUA 1OABA 3UPBA 3PG8A 5I3HA 4XTDA 4JTTA 4M5PA 4M7SA 4UCGA 3VFLA 1JULA 5FEWA 1ZENA 5FEPA 5I3IA 2CZEA 2Y7EA 3KXQA 3NOEA 3LX9A 1VGAA 3EX4A 4JICA 3STGA 2C15A 4ORIA 4WZHA 3QC3A 4OWGA 2J88A 4LUJA 3TU9A 4E0CA 2WPBA 5AHEA 3BG9A 1M5WA 3PUEA 2NX3A 1XCFA 1W8SA 2ZZ2A 3TW7A 4JGDA 3F4WA 4HHPA 2QAPA 4C1LA 1GPWA 2OCZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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