2ZTKA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with homocitrate
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
320
structure length
312
Chain Sequence
MREWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTGRDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKRKLIIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Thermus thermophilus
publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Homocitrate synthase
total genus 117
structure length 312
sequence length 320
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2008-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ztkA01
3GNDA 4N9CA 5D33A 2JGYA 1I2PA 2C6QA 3WK2A 4PC8A 5HULA 1QMLA 1GVSA 3DHDA 1XCFA 3PBUA 3SY5A 1H7XA 2VFIA 3BG3A 2A2IA 1SW7A 1FQ0A 1KM4A 4BWLC 3STCA 2DU2A 2V82A 2BLEA 3MI2A 3SGUA 3ATZA 4JTTA 1AMKA 1YTDA 1R47A 3L65A 3MHUA 1OF6A 4C1LA 3H54A 4LVAA 2QJHA 3KVKA 4KFNA 4IJBA 4O15A 4BR1A 3LHZA 4UMCA 5D2TA 2WKJA 1KM5A 2WV8A 4WJEA 3THQA 4AB4A 2Y7DA 3FJ6A 1TPDA 4AMAA 4Z1CA 2QCFA 3PBWA 4O14A 4GUFA 3GXTA 5HR7A 1C29A 5KZMA 1VHCA 3PS7A 4OBTA 1W8SA 3P74A 3LX9A 1F6KA 1O5KA 1M7PA 3M5VA 1L6WA 3L2IA 1KFEA 1DHPA 3QW4B 3F03K 3PBYA 3S1WA 1LLZA 1H7PA 3R12A 3YPIA 3RLUA 1NF0A 3LCHA 3ZR4A 5D2XA 4UTTA 2XN2A 3C2EA 1ONRA 1G4SA 4IWWA 1LDCA 5HWJA 2VXNA 4LC8A 4LU0A 2A21A 1FDZA 5AC7A 3SECA 3NO5A 1W56A 1EP1A 1MEWA 4CCDA 2QAFA 5DELA 4JTSA 4YL2A 5AC8A 2J9ZA 4IMFA 1KFCA 3CEUA 3C6CA 4FEZA 2CW6A 4CLMA 3GAYA 3NQ6A 1QDSA 1TJRA 4UTWC 2VEPA 4XBSA 2GJLA 1HO4A 1JRBA 4QJ1A 1X8FA 4JIPA 1ZCOA 2TRSA 1SZNA 4O18A 5K4ZA 3KAOA 3DXIA 4MOZA 1QNVA 4X9SA 4NNBA 3UZ5A 4FNQA 3WFAA 3M1ZA 1K02A 2IQTA 3BVJA 1RR2A 2CLKA 2DZPA 6TIMA 3LERA 3LXBA 5J5RA 2DORA 2DZSA 1JR1A 3NPXA 2FDSA 3NPUA 4FXRA 3W07A 3MMTA 5CPNA 2GQ8A 1X6UA 2Y88A 4IGHA 2E77A 4JX6A 1OFEA 5J5DA 3OA3A 1FX6A 3DU0A 4UTHA 4LT9A 5F1UA 3EKZA 3TFXA 2GVGA 2YW4A 3HOJA 3C8FA 4OT7A 3FKKA 5IM51 4GXMA 3RNDA 4MZYA 5F1VA 4Z1AA 4O11A 5G4EA 3IVSA 3CWOX 2AAMA 2QJIA 4YCOA 2QCCA 5SWUA 2R8WA 1ALDA 1GJPA 1TTQA 3W7KA 5CSRA 4K7VA 1O60A 5HNRA 3LHUA 4NNAA 1XUUA 4IXXA 4MKNA 1LROA 2RDUA 3UWQA 4L4LA 4DXVA 3G3MA 1IXNA 3LOTA 2TSYA 2ABAA 2F7FA 5K7JA 5F4SA 5D2YA 3EXRA 3NZ1A 2ZA1A 1PL9A 2JGQA 1GEQA 1N7KA 3MYPA 2V2HA 4JTIA 4ADSA 4P61A 1N55A 1QPNA 2R94A 4WQ6A 3TMQA 1ME7A 3MI3A 1K8YA 3G24A 4JX5A 3MHFA 4NUWA 1OFQA 3S8HA 1P4CA 3N14A 4DF2A 4MFDA 4WD0A 4M5PA 2VELA 4PH6A 5KTLA 1DKWA 5CG7A 2KZHA 1KV8A 4O19A 1B57A 1UUOA 4DPQA 2W0UA 4FNRA 4LRTA 3G1YA 3HGOA 3ELFA 5G1YA 1GWJA 2EF9A 1B3OA 1ZNNA 2ISVA 3M9YA 4ZZ9A 3W7QA 4R7JA 2WPBA 1VJIA 3RF9A 1P1XA 4DO4A 1LBLA 2FLIA 1QFEA 3W7MA 1W37A 1Z44A 4K38A 4IMCA 4JYEA 4UXDA 2Y7GA 1QPRA 5CZ0A 3ZFHA 4IXHA 5AYYA 5LGXA 4XQ6A 1R46A 4QIUA 5K2ZA 3GR7A 3E96A 1BWLA 1I45A 4A29A 4O12A 5FI8A 4XKYB 1X7FA 2A5HA 1GVOA 3MHGA 3P61A 3N9RA 1ZENA 3NA8A 4I7VA 2X16A 1XBYA 1SO6A 4LC6A 3M5ZA 3BO9A 2GQAA 1JUEA 1KV5A 3G22A 5D37A 1EB3A 2DZVA 2V81A 4DELA 3HF3A 4GFSA 4O52A 1KTNA 2QCDB 1KA9F 4DF1A 1LYXA 3JS3A 4JY9A 3G1VA 1FWWA 2E6DA 3TDFA 2CU0A 5LGZA 3W73A 2X2GA 3I65A 4FIRA 3F1QA 3BV4A 1TV7A 2CLFA 3PR2A 1FDJA 3TW6A 4JTHA 2QUUA 4RLIA 4UFKA 3L5MA 3UWUA 4KFPA 1W5QA 5D2WA 2DJXA 1H50A 3QF0A 4RK8A 2A0NA 1JQVA 2P10A 3AO0A 2Y89A 2GVLA 4KWWA 1W5MA 4QITA 2ABBA 1EX5A 5CZTA 3TCEA 3L0GA 3GXNA 3B0PA 5I3JA 1C9DA 1D3GA 3FS2A 1JUKA 3T78A 1JCJA 3S0CA 4AWUA 4NXSA 3W23A 4AH7A 4ZQMA 4PCFA 1FCVA 4UTMA 1TTIA 5CPOA 3H55A 3P8JA 3LCIA 1I4NA 4NQ1A 3NQDA 1FCBA 1QAPA 1UBSA 5DXYA 4FIQA 3RK8A 3TUUA 1F7BA 2F84A 5DXXA 1IF2A 4MY8A 2BSLA 3W7OA 3QH2A 2YX0A 3ZWTA 3USBA 2CLLA 4R53A 3ABOA 5EY5A 3PUOA 3S1VA 4BF9A 3NAVA 4O4WA 1XBXA 4PL1A 4AHPA 4JY8A 2DP3A 2XN1A 2ZTJA 1CW2A 1UUMA 3PUEA 2EPHA 1HTIA 3VKJA 1E51A 4ORMA 4NU7A 3PG8A 2Y85A 3E9AA 3T7VA 3GR8A 4UIOA 4POCA 2D73A 1IGSA 3LDVA 3PSVA 3W7IA 2YZRA 3O06A 3N2XA 4O1BA 3HGSA 3IIPA 2NUXA 3O6YX 5DY2A 4UC5A 2WO5A 5D38A 4X22A 3FKRA 3N19B 4JICA 1T96A 2FB3A 2YR1A 1SZEA 4U4MA 2B7PA 3UPWA 2DZTA 4Q32A 4RV8A 2V5LA 1VLIA 2ZA2A 1PV8A 5EPDA 2QJGA 3O6CA 1DJNA 2CLMA 2CZ5A 1Q6LA 2BTMA 2C0AA 4MZ8A 3G1HA 4HPXA 3TQVA 2Y61A 3BLIA 4NX5A 3M6YA 1YDVA 3EXTA 4AF0B 4O0KA 3W7GA 5G2HA 3QQ1A 1BKSA 4IX2A 3W74A 4UTUA 2YPIA 4N9EA 5LHEA 3TJLA 4FNPA 4M7SA 4ICNA 3IGSA 1WAUA 3LXCA 4PTNA 4DPPA 4WY0B 3EEGA 3NQAA 4O13A 4X2RA 4O4VA 3BARA 4LV4A 5I3GA 5AHMA 3ABRA 1YYAA 5F4WA 3HG2A 1F2JA 1DV7A 4PODA 3B03A 3INPA 3GNNA 3GVGA 3KVJA 2VFEA 1SFLA 1UB3A 1DBTA 1WV2A 4GJ1A 1F6PA 1H5YA 3NQVA 3O16A 5LZLA 3KRZA 1ML1A 1ICSA 3W1XA 4EF9A 4HN4A 3LLDA 1NEYA 2B4GA 2BXVA 3C4UA 1THFD 2NUWA 2A7PA 4OQVA 2GUUA 5BOOA 3HJZA 3W2NA 2NWSA 2CLEA 5T26A 1D9EA 2YFNA 3NDOA 3P60A 3R5EA 4OWGA 4UNLA 3G1AA 3QFEA 1OYCA 2ZTKA 5D03A 2DJLA 1OFBA 3P81A 1EUNA 1F76A 3TMLA 1G7UA 4FX6M 2BWGA 2QKFA 1HG3A 3A22A 3CIXA 1NSJA 4MFEA 3OHIA 1R30A 4NT0A 3P5ZA 1WOAA 3P80A 2YCEA 1MZHA 4LS0A 1AW1A 1IIGA 3NPVA 1I2RA 1WXJA 2YYTA 3GKAA 1UASA 3O15A 2BX7A 2QUVA 1MXSA 3C2FA 1FWNA 1SO4A 4BK9A 4MLRA 7TIMA 5HWMA 1SUXA 3OEXA 2Z6JA 2ZRVA 3W88A 4D2JA 4LRSA 5LNRA 1Q6QA 1GTEA 3TQKA 4FO4A 5DBTA 2G96A 3MI6A 1KFKA 4K8HA 4I9AA 2Y6ZA 5E93A 4GRSA 3W2MA 5MHBA 5G2WA 2VEMA 3DFPA 4YWIA 1FBAA 1XDMA 2E5DA 3EX1A 4NZFA 2X1TA 2NLIA 3KRSA 4UUIA 1WOBA 2J9YA 3LLFA 5AYXA 5D2VA 3LRLA 2QCGA 3HPSA 1Z42A 2DZUA 4HNTA 5LKYA 3TFCA 2QCEA 3G1XA 3G3DA 4ML9A 2HTMA 1CX9A 1N8FA 3VI2A 3A5VA 1TPH1 3JR2A 2G5WA 4WOZA 5C55A 1TTPA 4BI5A 1AW5A 3W83A 4DEFA 4MJMA 3TAOA 2WNZA 3CM4A 1A53A 1YTKA 3P8IA 2PC4A 4FX7A 2OZ0A 2A85A 3D0CA 3W7NA 3S5YA 4Z1DA 4JTGA 1K7XA 4HNVA 4Y96A 4QQ3A 1LM1A 2WNQA 4UNKA 4QAIA 3W1TA 2ZDRA 3TX9A 4S2CA 1VRDA 3BPWA 4MYXA 4HHPA 1VPXA 5F4XA 3QZEA 4GUJA 1TQXA 4HIBA 1RPXA 3N34A 3LCGA 3I68A 1P0KA 5BMXA 3EWXA 1C8VA 2OX1A 1J4EA 4DQWA 5C54A 3GIYA 4JEQA 3C0JA 4WUIA 3OBKA 3RMJA 1MEHA 5C5YA 4RR4A 4ZQOA 2BZNA 4O17A 3LV6A 4UR7A 5AOUA 4UMBA 3MWAA 1DORA 4AHQA 4Y6GA 2YFOA 2WSQA 4ZMGA 1QWGA 3B4UA 4R34A 1KFBA 1HO1A 4XWUA 3TA6A 3W1UA 2G95A 4Z0SA 3L9CA 2A1YA 3NL2A 5KZEA 3U6WA 1LRTA 1IXQA 2X30A 3R2GA 2E6AA 3PULA 4LVBA 1VZWA 2CWNA 4I7UA 3O63A 5DCEA 4MJZA 1H7OA 1TPUA 2GOUA 1A5CA 4GUHA 4LWWA 3C56A 5AHLA 1KTCA 2YGYA 2NUYA 1Z48A 3BW4A 3STEA 5IBXC 5KSWA 4H3DA 4ZQCA 5BW6A 1A5SA 4Z1BA 2TMDA 3LCLA 3Q37A 2CLHA 4TIMA 3B0UX 3UWYA 5CPMA 1A5BA 1OFRA 3I7SA 3KVLA 5CZJA 2A4AA 1PCWA 4P2VA 1GT8A 3HG4A 1W31A 4LVGA 3MO7A 4O1DA 1PHQA 3UY7A 4R33A 4DBDA 3P67A 1S5VA 5FEXA 1AW2A 2ALDA 2ZBTA 4WX2A 1J2WA 3TKFA 3Q94A 3W87A 1G4PA 5D02A 1W5OA 3G0SA 1SO5A 3LM7A 3W84A 2ZFAA 1XC4A 3W3OA 1WX0A 3PUDA 4U28A 2R14A 5EA9A 2ZZ2A 3SZ8A 4NX0A 4NZJA 2VC6A 5BNKA 3DHFA 4MYAA 1YLVA 4OV9A 1M5WA 4J9JA 4BWLA 2Y7EA 3FYPA 3QSRA 1QPQA 5C6MA 1OHLA 4PL2A 3DKJA 4NJHA 4JYDA 4PFMA 2E5CA 3W7HA 3ZS4A 5C2XA 3BG9A 3O05A 5F2MA 2X1SA 3GX9A 1D3HA 1MO0A 3OVRA 3SI9A 3V1PA 2VEKA 5FEPA 3WK3A 1VS1A 3G1SA 3S5ZA 3A21A 3W1LA 2GPTA 3HBLA 3PSWA 4IMEA 4O53A 3UNDA 1JCNA 3THAA 3GKFA 1VYRA 1UCWA 3QW3A 3TIMA 3IVUA 3WJWA 2NX3A 3R89A 1FY6A 2CZEA 1ME8A 1VYSX 4KFOA 1H1YA 3RFAA 2V9DA 4Y9AA 4JDBA 2J27A 5F2LA 2GQ9A 1OK6A 3S5NA 5HWNA 5FEZA 4LV9A 1FWRA 1ME9A 4JTEA 1K03A 3PF3A 1TREA 2JKAA 1F05A 1FWTA 3L67A 1P0NA 1OFPA 2V8ZA 1LRQA 1KLYA 2TPSA 4O10A 1G7VA 4NXKA 2PRMA 1Q3NA 1AL7A 1EPXA 1ZHAA 4Z08A 3TNOA 2FB2A 4QNEA 3QPYA 2JKEA 5FF2A 5U4NA 3TAKA 4JYFA 3W85A 1TQJA 4A2SA 6ALDA 1TPFA 3H53A 2WNNA 2P1FA 4E2DA 3HGRA 2OT1A 3MUXA 4UTWA 3CHVA 3L5LA 3NNTA 1SPQA 2VFGA 2C14A 2FTPA 5IBXA 1YPIA 5A8GA 2WQPA 1K7FA 4IPJA 1SO3A 4TR9A 4G1KA 3G1FA 2ZRWA 3G0UA 3L66A 4PA8A 3BLFA 3PY2A 2Y63A 4WOQA 4JIQA 5AYZA 3SR7A 1G67A 3TE9A 3GLCA 4NJKA 4ADUA 4O8RA 3PAJA 4L4MA 3MBDA 1XUZA 3C61A 3EB2A 3W1NA 4JNMA 3W7RA 3NVTA 4WY0A 4MIMA 3IGXA 1HFBA 1GTHA 5TIMA 2QCMA 1GPWA 1MSSA 3CPRA 1KM2A 1EEPA 4N2YA 2NWRA 1XBVA 1L2UA 2DZXA 3UYCA 1TB3A 3OVQA 2HS8A 4A2RA 1VCVA 4ALDA 4LW7A 5DY3A 2ATSA 3NYZA 3GDKA 1PCKA 1KFLA 2DZWA 3P84A 2ISWA 3CU2A 3A5FA 1Q6OA 5EKYA 2ZYFA 5FF0A 2J24A 3W1AA 3E0IA 4RXFA 1ZALA 3NQ8A 4CNOA 5AHEA 1TPWA 2QCHA 5I3KA 2Z1BA 1B9BA 3DKLA 4YXGA 2OMAA 1K8ZA 1YTEA 4BI6A 1GQNA 2E6YA 4JTUA 2QAPA 4FX8A 1KM3A 1KBIA 2QF7A 1R2TA 3NQFA 3Q2DA 3EXSA 3CLMA 3GDLA 3M43A 1GVRA 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 1XL9 A;  1T8X A;  5HJL A;  3W22 A;  3SIZ A;  1SU5 A;  4UTT C;  4K8E A;  3MP5 A;  4PEK A;  3RU6 A;  3TSB A;  1LOS A;  4JTJ A;  3SW6 A;  2QR6 A;  4BI7 A;  1WYI A;  1AG1 O;  1TMH A;  2FPV A;  1F73 A;  3MP3 A;  2ZZ1 A;  5DCD A;  4E2B A;  5HUO A;  4JS3 A;  5HMS A;  1IIH A;  3T4C A;  3IGU A;  4MUZ A;  1B4K A;  1M7O A;  4GNJ A;  5K9D A;  3QYQ A;  4XTD A;  1TCD A;  1YDN A;  4N4P A;  1RD5 A;  1PE1 A;  2ZRX A;  3BG5 A;  2HSA A;  4WXY A;  1Q6R A;  3S6D A;  3E02 A;  2YXG A;  1TO3 A;  4JTF A;  1SZG A;  3LCX A;  1B4E A;  2X1U A;  1FCQ A;  3GDT A;  1SFJ A;  1QO5 A;  3C52 A;  3TV8 A;  3CWN A;  1DVJ A;  1VGA A;  5EBU A;  2Y62 A;  3WJY A;  2FQI A;  3NQC A;  4O16 A;  1H63 A;  2H90 A;  5D05 A;  4CQ8 A;  4GUI A;  4UFI A;  4E0C A;  2A7R A;  3LBC A;  3STF A;  1S5T A;  3TQ0 A;  3O07 A;  1OFA A;  4IOT A;  4UTK A;  3TC7 A;  1OX6 A;  3HPZ A;  1OF8 A;  3S1X A;  4RKA A;  3LGE A;  2W6R A;  1FXP A;  1DL3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WSJ A;  3FXG A;  3GO2 A;  3CL6 A;  2XU2 A;  4PC8 A;  1QML A;  2PSN A;  4TVD A;  3PBU A;  2NV9 A;  2BOG X;  1RK5 A;  3SY5 A;  3BG3 A;  4BCE A;  2A2I A;  1SW7 A;  4MAZ A;  1QNO A;  5A8P A;  4BWL C;  1SJD A;  1GJW A;  2BLE A;  1VIZ A;  1R47 A;  3DGB A;  1O7A A;  3MHU A;  3H54 A;  1POK A;  2QJH A;  3KVK A;  4KFN A;  6PTD A;  4IJB A;  5DFA A;  4FR6 A;  2FH6 A;  4O15 A;  1ISV A;  2VUR A;  5AC5 A;  3LHZ A;  1A5K C;  1PZ3 A;  3O2L A;  4WJE A;  3THQ A;  2PDY A;  4AB4 A;  1UPM B;  3AIU A;  4O14 A;  4UQA A;  3E6E A;  1OCJ A;  1TJ1 A;  3SCN A;  1EJX C;  1VHC A;  3P74 A;  3LX9 A;  4RDV A;  2PA6 A;  2XFR A;  3M5V A;  2IPG A;  3VIM A;  1Z7A A;  5AZ0 A;  1DHP A;  3F03 K;  1UP0 A;  3S1W A;  1LLZ A;  1H7P A;  1UH3 A;  3OW1 A;  3NYD A;  3RLU A;  1V0K A;  1GZ1 A;  1Y8B A;  3TOY A;  1NWR A;  3C2E A;  1EX1 A;  3L4W A;  3L4X A;  2VXN A;  5AC7 A;  1FDZ A;  2GUY A;  3BAW A;  3LSB A;  4GO9 A;  3NO5 A;  4F0M A;  1R3S A;  1W56 A;  1LUC A;  1ZB5 A;  3SCW A;  3HA1 A;  5AC8 A;  3AIV A;  4IMF A;  1WDD A;  2J8G A;  2G8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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