2ZZ2A

Orotidine monophosphate decarboxylase k72a mutant from m. thermoautotrophicum complexed with 6-cyano-ump
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 82
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz2A00
1BKSA 3FFSA 4WXYA 3NO5A 4RZ5A 2NV2A 4JYFA 3N2MA 3R13A 5D05A 3S1VA 3LRLA 3PG9A 3P8JA 3UPBA 1H50A 1QPNA 4E2BA 2DZVA 4ZQRA 3WK3A 3EX1A 5HNRA 1PVNA 2YYUA 3ANYA 4HSNA 3GNNA 3FKRA 4QITA 2H8XA 3UY8A 3G1YA 4TR9A 1L6WA 3C61A 2J6XA 2X2GA 4GJ1A 4JTIA 4MOZA 3G3DA 1TV5A 2Y62A 2DZPA 4JDYA 1FDZA 2YZRA 3O6CA 5AHEA 1FCBA 3CC1A 2WOQA 3W83A 3QC3A 3NA8A 1W3NA 3DXIA 5F2LA 2V5BA 3LRMA 4JR5A 4XKYB 1P0KA 2TMDA 3DFQA 1R2RA 1W8SA 4RKAA 3G0XA 3W86A 4N9BA 3I6RA 5BMXA 2QAPA 5HMSA 4UTWA 3TMLA 3MP3A 4BI6A 5LNWA 1WBHA 8TIMA 3IV3A 2V2DA 4AHQA 3QH2A 1GG0A 3TCEA 2ZDRA 4DO6A 1GT8A 4GE8A 1CX9A 4EVZA 1FWSA 2QCCA 2E1DA 2Q8ZA 3IVSA 3NXFA 5AHIA 3C2OA 2I14A 4I9AA 4MZYA 4KWVA 1EUAA 4R7JA 4WOZA 3DKJA 4KFPA 2DU2A 4EOUA 4MLJA 4YXGA 1GQNA 1PHWA 3LLFA 2OT1A 1MSSA 4UMBA 3ATZA 5ABTA 3LHYA 1P5BA 2F7FA 2FTPA 3VKJA 5HWMA 3W7EA 1G6CA 2WKJA 4M6QA 2CW6A 3NL5A 5HWJA 1UBSA 1KFKA 1T99A 3IIPA 1FWNA 1VGAA 2YSWA 1KTBA 4AHOA 3GIYA 2VFHA 1XXXA 3IVTA 5KSWA 4UFJA 4S2CA 5HQEA 4O15A 4YCOA 2FJKA 3LB0A 4K8EA 3HGOA 4M5PA 3WK1A 4Q4KA 3IIXA 3NNTA 3KFTA 2X1UA 3W85A 5BW6A 3EWUA 4O18A 1FDJA 3W1XA 3QQ0A 1W56A 4MJZA 3S5ZA 5AYZA 1SO4A 4UNKA 2H8ZA 3NQFA 3LCHA 2NUXA 1AW5A 3FIGA 2VFDA 5K9XA 3GXTA 3W2UA 3NZRA 1Q6RA 3BO9A 3MBFA 1ME9A 2ZZ1A 4TMCA 4A29A 3WJZA 2C13A 2A7PA 2QEZA 3NPXA 2GJNA 2NXGA 2W0UA 3LCLA 1KM5A 3INPA 1JRBA 1TCDA 4UTHA 1TPUA 1FCUA 2GVLA 3TC7A 1TTPA 4JTTA 4O17A 2C16A 1NFBA 3PB0A 2ZRUA 4C1KA 2QCHA 2J24A 4P61A 3M44A 2BWGA 5AHNA 4RR4A 1VLWA 3Q94A 1T8XA 3BV4A 3H53A 4C1LA 1OFQA 4Y6GA 3E02A 3E12A 1GPWA 4FNRA 3V1PA 2ZCGA 5AC8A 2V81A 5I3HA 1YDNA 3PUDA 3VI2A 2E5CA 3UQNA 2VEKA 3NQCA 2B7OA 1LLZA 1O94A 3MHUA 1F6PA 4WY0A 2E09A 5K4XA 3L21A 5D04C 3IGXA 3A9IA 1B4KA 4BK9A 3TU9A 2FLIA 1TREA 4QISA 4JX6A 5D09A 1D9EA 3HPZA 2QCEA 1FCVA 4HT3A 2ZA2A 4N9DA 3SW6A 3TE9A 4GUFA 3EX2A 3W72A 4HNTA 1HUVA 1QOQA 2Z6IA 1GG1A 3VNDA 1UJPA 2LLEA 4DO4A 4K38A 2EGZA 3B4UA 3DENA 4WZHA 3LCFA 1TV7A 2FB3A 1Q45A 1LCOA 4ORIA 5L6UA 1HL2A 1YDOA 3LI0A 1MXSA 1RQHA 1MEWA 2G95A 3UNDA 4YMZA 5K4ZA 4JIQA 2FIQA 1VYPX 1OHLA 3DI0A 1FWRA 2ALDA 3N73A 3H55A 3O6YX 3UWQA 2Y63A 2C3ZA 2UV8G 3E49A 3KVKA 3NQAA 3C2RA 1TJPA 2V30A 3CWOX 3W71A 2V0TA 1L2UA 5C6MA 1V7YA 4ZZ9A 3EWYA 3QMTA 1PV8A 2FPTA 2NX1A 5FI8A 3A22A 4FNUA 3STEA 1UB3A 3TXVA 3G1HA 1TIMA 2JKAA 4UR8A 5CPOA 5MHBA 4IMCA 2NWSA 4IMGA 4GUIA 3PB2A 4UTLA 3C6CA 3MMTA 4KKXA 4YL2A 3ZR4A 3N19B 2J88A 1EEPA 4PEKA 1FX6A 2ZRZA 3LCGA 3BGGA 3RFAA 3B0VC 5D38A 5EYWA 4M6PA 3ABQA 1QWGA 2IQTA 3UWUA 1RQEA 5C5YA 3NPVA 4JY8A 5FESA 2ATSA 2BZNA 2BSLA 2B7NA 2QUUA 3WFAA 3MI6A 2QUVA 2YFOA 5D32A 1G67A 2DZTA 5CZSA 3ABRA 3THAA 1SZGA 4NNCA 3DFSA 1ZAIA 2J27A 3PM6A 1LTDA 2JBMA 7TIMA 3GKFA 3IIOA 2VEPA 1R30A 1S5TA 1PL9A 3LHUA 1DJNA 2PRHA 4QM1A 4O53A 3W76A 1XBYA 4Z08A 3BGJA 1JCMP 2WNNA 5G2HA 1DORA 4AXKA 3STFA 4NNBA 1XUUA 2EAWA 3NGJA 1S3HA 3KVJA 1QOPA 1XDMA 4FNQA 3LV5A 1OYAA 4MLRA 1WOBA 2H6RA 1K03A 4IX0A 5L9FA 4O8RA 1AL8A 3I7RA 2VELA 3P61A 2GQ8A 2GVGA 4UC5A 4CQ9A 3UD6A 2V9DA 1XKYA 3BG5A 1KM4A 1TYGA 4O12A 3RF9A 4PL1A 1DQXA 1KV8A 5K7JA 1JRCA 4M7SA 4JIPA 1JCJA 2CLIA 4UMCA 3UYCA 1OK4A 4XTIA 2VFGA 3CT7A 1TRDA 2YX0A 1XBXA 2X16A 3KVLA 1GWJA 1K7XA 4FB7A 1VPXA 1FWTA 4BWLA 3O8AA 4JNMA 4BI7A 3IRDA 4J9JA 1ONRA 1ZJIA 1RQBA 4MFEA 1SUXA 4OBTA 2ISSA 2BLEA 4IOTA 4WX2A 1QFEA 3TW7A 1A5SA 2RDWA 3W9ZA 5AN7A 3BPWA 2RFGA 4RV8A 3W1PA 1MEHA 1OX6A 3R8RA 1KM1A 3MYOA 1LRQA 3QF0A 1XBZA 2A1YA 2C1HA 3T40A 2RH9A 4UTWC 3W7HA 4N9EA 5DY2A 2TRSA 1H60A 5DLCA 3BLFA 5GVJA 2ZYFA 4O1BA 3W1TA 4O13A 3BARA 1TPEA 1WAUA 3NL3A 4NJIA 2HTMA 4JEQA 3LHTA 2WSRA 1F5ZA 3QMRA 2G96A 2X1RA 1QPRA 4O1CA 3NDOA 3L0NA 1T96A 3O1NA 1P4CA 3CB8A 5D2WA 4RCXA 4L4MA 4RZ4A 2V2HA 3NQVA 4HNUA 1OG0A 2VFFA 2ZRYA 3SECA 3IIVA 1LBFA 4IJBA 1U5JA 2A0NA 2A85A 4YLWA 5FEZA 5LHEA 4DQWA 4QQ3A 4TIMA 1MEIA 5FF7A 1JCYA 1Q6QA 4NNAA 2QCGA 3S5NA 5FEWA 3DFNA 3EXRA 2DZUA 1EWDA 3TNOA 5D2YA 3C2VA 1FXPA 4NXKA 4PCFA 4MY1A 3P60A 2ATMA 3S5OA 1O5XA 3SGUA 4AHPA 5KITA 1TPWA 3FA5A 2YW4A 4JTKA 3MI2A 3DBPA 4MIMA 1W5PA 4CNPA 1DJQA 4K7YA 4FXSA 3M41A 4N02A 3W23A 3N3MA 2OJPA 1KM0A 2NWRA 3TH6A 5DN1A 4HPJA 4UTJA 4IPJA 1GOXA 4XUGA 4IX2A 3TQVA 4OHQA 1YXDA 3AJXA 2ZRVA 5BNKA 1SW7A 1YTKA 5CKSA 4XBKA 3M16A 4X3ZA 5EA9A 4N6EA 4JDBA 1JUKA 4Z1BA 4NJKA 5KTLA 4RK8A 1W3TA 4JXCA 4O4VA 1OYCA 3CTLA 3VE7A 1B4EA 5DELA 1EP3A 2QJGA 4O54A 3FS2A 4JYDA 3VCRA 1XM3A 2ZZ4A 4NQ1A 1LOSA 4CCCA 4RXGA 1SO3A 4ORMA 3GZ3A 4A22A 3W7GA 5DCEA 1RV8A 3W07A 4LT9A 4I7VA 1K7EA 3L67A 1EUNA 1SU5A 4I7WA 3T4CA 3M5XA 1RZMA 3T55A 5F2GA 2X1TA 3NQ6A 1XL9A 1O95A 1KM2A 1WYIA 5IBXA 3P62A 1U83A 3NQ8A 4JTEA 3JR2A 1LZOA 3HIJA 2Y6ZA 1SZFA 5F1VA 4A21A 5U7SA 1O60A 3SGZA 2GOUA 3GR7A 1H7XA 3M5ZA 3FYOA 3GDRA 4WY0F 5K9CA 1OJXA 5G4WA 5KZMA 4WQ6A 4N4PA 3JRKA 1H51A 2WSQA 3C52A 1OFBA 3TSBA 3QPZA 3F03K 5E1QA 2BX7A 1CI1A 1OX4A 4GRSA 1EB3A 3S1WA 3GK0A 3LV6A 1ZCOA 1H61A 3B04A 1PCWA 3RLUA 1F7BA 3UWWA 2QCDA 1LOQA 1W5QA 3PVFA 2Q3OA 4AB4A 3GAYA 2VXNA 5D37A 4ADUA 3KHJA 4NUWA 1EP2A 3QZEA 1M5WA 1GTHA 1I8JA 3LXAA 1H5YA 3TSMA 3P7YA 2CFFA 1SSDA 1DV7A 1G4EA 2NXIA 3W73A 4LWWA 4AWTA 6TIMA 2NLIA 4DF2A 3W1LA 1LRNA 4A2RA 3ATYA 1OYBA 4JGDA 5CSRA 1K02A 1I4NA 4N6FA 1I45A 2FPYA 1ZENA 2ZZ6A 4PA8A 3W7CA 3S5YA 5KZEA 4DPPA 4BF9A 1TPFA 2ISVA 4X9SA 3QJAA 1YXYA 2HS8A 4FEZA 3P5YA 5CZTA 3M5YA 4U28A 4O16A 1I2PA 2VOMA 3M1ZA 1SQ7A 1K3UA 4AAJA 1AK5A 3EX6A 1VHNA 1QDSA 4OQVA 4IXHA 4N9CA 5AOUA 4K8HA 4UCGA 1IXNA 4AH7A 4IWWA 1DKWA 3D0CA 4FNTA 3WJYA 2D73A 4RJEA 3DI1A 4POCA 1A50A 4PODA 4LRTA 3BK0A 2CZEA 4OWGA 1JCXA 1DQWA 1OFAA 4FNSA 5I3IA 4LC6A 3BW2A 5LHFA 1FDYA 3A24A 3S8HA 4FO4A 3TMQA 4QJ1A 4NJJA 3SIZA 1VYSX 3LX9A 3PULA 1SO6A 3HPSA 3W7IA 1R2SA 4OV9A 1L6SA 3MHGA 1J4EA 4UFIA 2V2CA 3LI1A 4MJMA 1LDCA 1SPQA 3JS3A 4JTHA 3STCA 3W7OA 3LCWA 3MUXA 1G69A 4OV4A 2E6FA 5A5WA 2PURA 3WJSA 2YPIA 3NYZA 4FIQA 4UUIA 1JJKA 1MZHA 4JY9A 2JKPA 3LBMA 4LS2A 4I7UA 3HGJA 1VCGA 2YXGA 3OVQA 5AC7A 5FF3A 3L9CA 4S1FA 3LXCA 4PL2A 3DKLA 1G7UA 1OABA 2FB2A 1KFJA 1MO0A 4LVBA 4ZQPA 3G8EA 3U6WA 4E38A 3KRSA 3HG2A 3P84A 5LNSA 1FXQA 3LHVA 1SZEA 3IVUA 3W7LA 3NG3A 3GDMA 5E93A 2ABBA 1NSJA 4O52A 2RHGA 1VQTA 3NAVA 3WJXA 4DBEA 5U4NA 3P74A 1KLYA 4MPQA 4HNNA 2CWNA 3W1QA 3KRUA 2I1OA 3W7PA 5LSMA 5K2ZA 4XQ6A 5DBUA 3PF3A 4LC8A 5I3GA 2FFCA 1XFBA 5LKYA 1M6JA 1O5KA 4JX5A 1C8VA 1LP6A 3P8IA 1Q6OA 3MP4A 4UTMA 4H3DA 3AO0A 2WNZA 4LVDA 1TSIA 3SJ3A 1GZGA 1AG1O 4N2YA 4NJHA 5CZ0A 2PRLA 2TPSA 2JKEA 3QM3A 1RR2A 4ZQCA 3A21A 1O4UA 3DHDA 2FQIA 4OGZA 3QSRA 1J5TA 1AMKA 1JCLA 5F2MA 1GVOA 4A2SA 4GUHA 4JTJA 4O0KA 1P1XA 5G1TA 1Z44A 4UTTA 3T78A 2QDGA 1YTDA 1YADA 3IIZA 1VLIA 2CLEA 2JGYA 2QDHA 4S2BA 1NF0A 4WUIA 3KRZA 2WQPA 1H63A 3SR7A 3OVPA 1Q3NA 3M47A 1T0OA 4LY8A 5HR7A 2ZRXA 4UNLA 1OX4B 2GJLA 3NPUA 3MHFA 4ADSA 3LCXA 1UUMA 4O57A 1TPB1 1RVGA 2DJXA 2ZZ5A 4LS0A 1ALDA 2QCDB 3MYPA 3OEXA 3OBKA 3P80A 1W0MA 5DY3A 1BEUA 2Y61A 3DFTA 3PY2A 3FYPA 4H4IA 3GAKA 3LHWA 3PUOA 3LDVA 6ALDA 1K7FA 1OK6A 2NX3A 3IEBA 1ICSA 1OF8A 2CLMA 1XBVA 3TX9A 5AYXA 4QAIA 3DFPA 1H7WA 3EXTA 3G0UA 1EWEA 3W3OA 3BG3A 1KTCA 5SWUA 3W7JA 4FF7A 2WPBA 4B5NA 1TTQA 1G4TA 3BW3A 3A5FA 3LXBA 1KA9F 2NXHA 4X22A 3G1VA 2A7RA 3ABSA 4QSHA 3PG8A 1ZY9A 3HG3A 1CW2A 1XC4A 4IGHA 5D02A 1E51A 1WA3A 1PHQA 3F4WA 5CPLA 3CEPA 4O50A 2QCMA 3M6YA 3LTPA 1XDLA 5KMYA 3A23A 3HPXA 5H2ZA 3R2GA 3B0PA 3BVJA 3PSVA 5BOOA 1VHCA 2PRMA 4JS3A 3V75A 3BLEA 4BFAA 2ABAA 3M43A 5EMUA 2WJZA 1PIIA 4ALDA 1G4PA 1B57A 3GB6A 4UTUA 4KFOA 3G18A 3NQ7A 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 1ICQ A;  1ME8 A;  2Z1B A;  3N14 A;  4Z0J A;  4YCP A;  1TRI A;  4XTD A;  5T26 A;  4NZF A;  3C4U A;  4LW7 A;  3G1S A;  1GVF A;  3IGS A;  3L66 A;  1GYL A;  1FBA A;  1L6Y A;  2Z2U A;  3UPW A;  1C29 A;  1BTM A;  4CCD A;  2QCL A;  1V5X A;  1X1O A;  3MJY A;  4HN4 A;  1IIG A;  1BWK A;  2JGQ A;  3DFO A;  3GDT A;  1TO3 A;  3A5V A;  4MFD A;  3TDF A;  1F73 A;  3EXS A;  3NOE A;  4XZ9 A;  4NJG A;  1I2Q A;  3W2M A;  2CLH A;  3W2K A;  3QEZ A;  4GWE A;  2GQA A;  1TMH A;  4MYA A;  3NM1 A;  2ZZ3 A;  4NVT A;  3H54 A;  3W1U A;  1AL7 A;  1R46 A;  2R14 A;  5F2I A;  3HB9 A;  1VZW A;  5EL1 A;  3RMJ A;  1F74 A;  2A7N A;  4O19 A;  4H6K A;  5CGQ A;  2CLF A;  3RND A;  4PC8 A;  5I3F A;  1LYX A;  3CU2 A;  4BR1 A;  4JX4 A;  3W88 A;  3ZWT A;  1TJR A;  1HFB A;  3I7S A;  3G3M A;  3QFE A;  1TQJ A;  2VEI A;  1SZN A;  2R94 A;  4PFM A;  2AAM A;  3DH7 A;  4O10 A;  1K8Z A;  3PS7 A;  1M7O A;  3RU6 A;  1X1Z A;  1HO4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZVH B;  3JUG A;  4H9M A;  4JYF A;  3R13 A;  1DJY A;  3S1V A;  3CO4 A;  3PG9 A;  3P8J A;  4E2B A;  5HNR A;  3WK3 A;  3EX1 A;  4R9O A;  4Q8M A;  2YCJ A;  1HKK A;  4GYK A;  5J8L A;  2GJX A;  2WHJ A;  4GY7 A;  2DUA A;  3G1Y A;  4LYR A;  4TR9 A;  4IM4 A;  3KHD A;  3C3U A;  1S1R A;  2DZP A;  4JDY A;  3LPG A;  4RNJ A;  2YZR A;  1FCB A;  3CC1 A;  3GIP A;  3N4E A;  3CK5 A;  4QJ3 B;  4X9Y A;  2V5B A;  4JR5 A;  1R2R A;  3GVR A;  2TOD A;  3SRK A;  3HUR A;  5C9Z A;  2DH3 A;  5HQL A;  2Q71 A;  3DIP A;  3WQW A;  1XGE A;  3IV3 A;  4H2H A;  5FL0 A;  2V3D A;  3QH2 A;  1GG0 A;  4NZ5 A;  4HPH A;  5HBF A;  4RE3 A;  3Q65 A;  1GOO A;  3GVV A;  1CX9 A;  5CBI A;  1FWA C;  2E1D A;  2QCC A;  3IVS A;  4JQ2 A;  2I14 A;  1POK A;  4R7J A;  2BXZ A;  3AXK A;  3CQI A;  4MLJ A;  4G7E A;  4YXG A;  2ZX7 A;  1F3T A;  3OVG A;  2VX4 A;  4DBW A;  3EOL A;  1ITQ A;  5IRP A;  1P5B A;  1JPI A;  2F7F A;  2FTP A;  4H6Q A;  2WKJ A;  4XAY A;  4A6G A;  3SQL A;  3BUR A;  1KTB A;  1FP8 A;  5KSW A;  3E5P A;  1B1Y A;  4Q6X A;  3PFM A;  4Z2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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