2ZZ2A

Orotidine monophosphate decarboxylase k72a mutant from m. thermoautotrophicum complexed with 6-cyano-ump
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 82
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz2A00
1QPNA 1SW7A 3W7NA 1KFCA 5AB3A 2E6AA 3WFAA 1EP1A 5CPOA 1F05A 3LTYA 2FPVA 3W2JA 1QO2A 2A0NA 3LV5A 3CTLA 2J24A 3M7WA 2FTPA 1LOSA 3FA5A 3PS7A 1DL3A 2OZ0A 3W7LA 1OFQA 1W5NA 1KFKA 2JBMA 5DCEA 4XTIA 3UWVA 3OBKA 4M6QA 4A2SA 3P8JA 3TXVA 2VEMA 4UFJA 3MBFA 3BK0A 1UCWA 1OYAA 4K39A 3O07A 5G1TA 3DENA 4U4MA 3O15A 4ZQMA 5KITA 2OT1A 2VENA 1LDCA 3SGZA 4AEOA 3TAOA 4BI6A 4Q32A 3OA3A 3OG3A 4GUFA 4N4PA 1AW5A 4LUIA 2ZZ1A 3GLCA 4X2RA 2AQWA 4M7SA 1VYSX 4POCA 1BWLA 1PV8A 3G8EA 1FWRA 4MY9A 5DY3A 2VFFA 4CNPA 1SZFA 3GDTA 5G5IA 2W79A 3I7SA 4ZVJA 1G69A 3G1SA 3DHFA 5LNSA 3R89A 5G2WA 1O5KA 4PA8A 1IIHA 3NO5A 4GRSA 4KFNA 5H2ZA 1W1ZA 3FLUA 1KM0A 4PTNA 3NPVA 1HO4A 3C2RA 3Q58A 3W85A 1FQ0A 1B4KA 4ORMA 3NA8A 1DJQA 4IX2A 4CCCA 4ICNA 5CZ0A 3P5YA 4EIVA 2ZRXA 3W2NA 1VS1A 1FCBA 4X9SA 4FX7A 4S1FA 1ZAHA 2V5LA 4H3DA 1JRBA 4O16A 4BR1A 5E1QA 2YX0A 4O57A 1TCDA 5KZDA 4UTUA 3UZ5A 2FJKA 1TYGA 4UTWA 5AYXA 4JR5A 4UMCA 3LLFA 1NEYA 1H62A 4WY0F 5LZLA 3O8AA 3ANYA 3EX2A 5FF0A 1I8JA 4M19A 4UTHA 1OX5A 2Q8ZA 1YTEA 2HS6A 3QZEA 4PFMA 2QAPA 1Y0EA 2Q3OA 1TTQA 4DPPA 4UMBA 1QDSA 3N14A 3TNOA 3TX9A 3NZ1A 3DAQA 1GVRA 1RPXA 1W8SA 3LOTA 3P80A 4NXKA 2I1OA 3S1XA 1VJIA 4JDYA 3Q2DA 1W54A 4MJMA 2ABBA 3LXBA 1TPWA 3PF3A 3PBWA 4RCXA 4QISA 5EA9A 3W73A 1D9EA 2ALDA 1PCKA 5I3GA 3EKLA 2DZUA 3W71A 5LGXA 1LBLA 3C2VA 3KVKA 2J9XA 4DF0A 5D38A 3ABOA 5DN1A 1Z41A 4S2BA 3LXCA 4JYEA 2E6DA 1GT8A 3G22A 1QOPA 3QC3A 3W72A 1DV7A 3R12A 4JTEA 3IIPA 1KA9F 1ZJIA 1O95A 1SO5A 4ML9A 4O14A 1RR2A 2NUXA 3G1DA 3NM3A 5TQLA 2W0UA 5FI8A 2GQ8A 3G0XA 2VEKA 3WJXA 2C13A 4DO5A 5FF4A 4I9AA 2V30A 2ZYFA 3PM6A 3HBLA 3GVGA 1W5PA 1XUUA 1D3GA 1Z44A 4LY8A 3W7QA 4TX9A 3TE9A 1JCMP 2ZZ4A 4DEFA 2V0TA 2FFCA 5D04C 3LLDA 4HSNA 4IUOA 3WK3A 3QSRA 1OFPA 4NJHA 2EKCA 1JCLA 3HPSA 4WY0B 1YDVA 5KZMA 4RR4A 1W5OA 2RFGA 3SW6A 5CKSA 1SQ7A 3TXZA 3LBMA 3HPZA 2ZA2A 3B0UX 4BI5A 3VE9A 2XN2A 2WNQA 4XKYB 3T55A 1A50A 1SPQA 4E38A 2OX1A 2R8WA 4GUIA 2QUVA 3TW7A 3MP3A 4XQ6A 5HJLA 3VCRA 5D33A 4CNNA 2X1TA 2Y7FA 1EWDA 1ICPA 3KOFA 1R30A 2GVLA 5CZJA 2O7QA 5I3FA 3QQ1A 2PRHA 3IIZA 4JTJA 1Q6RA 2V81A 3S1UA 4O12A 3NEVA 1RQHA 1GG0A 2FLIA 2X1RA 1OX4B 2X30A 5F4WA 5FESA 1FDYA 2VOMA 4C1KA 4AF0A 3D0CA 3FYOA 3GB6A 1ME8A 3MP5A 3W6YA 2Z6JA 3AJXA 3P60A 1U5JA 2X16A 3MUXA 3MWAA 2B0MA 3G1YA 1T96A 3LHUA 5C54A 2Z0IA 1TPB1 2GPTA 5A5WA 1R46A 1JULA 2XFWA 4TIMA 5IBXA 4UTTA 3GDMA 2ZFAA 1LORA 3W7JA 4UTMA 4Y8FA 1H7WA 4WOZA 4UNKA 4JS3A 2ABAA 3CT7A 3P8IA 1TB3A 4NZFA 2OMAA 1ADOA 4HN4A 3W2UA 2QJIA 5FEWA 1WQ5A 2J27A 1ZAIA 5K9DA 4NT0A 2Y7EA 3H54A 2CZFA 1VHCA 1MEHA 1PIIA 1JCYA 3FIGA 5G2IA 2ZRUA 3BG5A 4MLRA 1XC4A 3CC1A 2YW3A 4FNSA 5K2ZA 3S8HA 1S3HA 3GDRA 1SUXA 1OFRA 2NWSA 1OABA 5D02A 1IXPA 1VLIA 3THQA 3N9RA 3OVRA 4OQVA 3UWYA 5AHNA 1VC4A 3WK1A 3F4WA 4NJGA 5U4NA 1BWKA 2ZZ5A 2GJNA 1TV5A 1C9DA 1P0NA 4UUIA 4IMEA 5D2TA 4EOUA 4WJEA 3QRHA 4UFHA 1H7OA 2VEIA 1IIGA 1YPIA 3IVSA 2QCDB 3O1NA 1QNVA 5C2XA 2ZRVA 4C1LA 1ICSA 3W1MA 3WJYA 4MLJA 1QPQA 2C1HA 2TPSA 3G0UA 2VKZG 4QITA 1P1XA 5AHMA 1TQJA 1XI3A 2PCQA 1OFBA 2WPBA 2LLEA 3VKJA 4OT7A 5F1UA 3N9SA 3STCA 3NQVA 5CZSA 3PG9A 1KFBA 1G67A 1C29A 2NWRA 3HGOA 2D73A 4ZMGA 3ELFA 1EUAA 1YDNA 1S5WA 2BXVA 5KZEA 2PRMA 5FEXA 5F4XA 3CIXA 2B7QA 3W1PA 1MO0A 1GTHA 3MYOA 3UZJA 4QNEA 3S5OA 2C3ZA 5LNVA 3M43A 4GUGA 2VFGA 1J4EA 4Z0SA 3NL6A 4NVTA 2YYTA 1KLZA 2DORA 4K37A 5HNRA 2A7RA 3JRKA 3C4UA 3TQKA 2A2IA 4N6EA 4QNWA 4CQ9A 4K38A 1X8FA 1KV8A 3STFA 1NFBA 3LI1A 3TSBA 3T44A 4DXVA 2QUTA 1NAL1 4E2BA 1GOXA 5EBUA 1VZWA 2TRSA 3PR2A 2IQTA 1HFBA 3GXTA 1T0OA 3QM3A 4MFEA 3G18A 3LCWA 4PEKA 5I3IA 4LC8A 5TIMA 1ZALA 4LNYA 5EPDA 4LVGA 5KMYA 3YPIA 1OK6A 2A7NA 3TMQA 4RJEA 4RK8A 4R33A 1LTDA 3HG5A 1TPH1 2OJPA 2VFDA 4LS2A 1I2OA 1Q6LA 2VFHA 3C0JA 1MZHA 4PH6A 2VXNA 1XFBA 4FXRA 4YL2A 2JKAA 2CLFA 4MY8A 4WUIA 2E1DA 3GDLA 3W75A 1NF7A 2ZA3A 4HHPA 2KZHA 1K7XA 1W5QA 1WV2A 3ZWTA 4MIMA 3QPZA 4O4WA 3C52A 3DH7A 2YGYA 4R7JA 1N7KA 1QO5A 2DZPA 5SWUA 3LERA 1VRDA 2YFOA 1OYBA 1FDJA 3WJSA 4O53A 2G96A 4B5NA 3GYEA 3NOEA 4AWUA 1O94A 2PRLA 3MYPA 2YCEA 1XBYA 4WD0A 4JD4A 3DU0A 3UWQA 3W1RA 3IVTA 4O52A 4HNNA 5FF2A 5F2IA 1H60A 3B0VC 3LHZA 4WY0A 3G0SA 5L9FA 1FDZA 3EWZA 1J2WA 2QCCA 2W6RA 5EMUA 3TJLA 4XKYA 1AK5A 3SY5A 1A5AA 1H50A 4Z0JA 3RK8A 1KTCA 4MVAA 4XBKA 4WXYA 1CW2A 1E51A 2WJZA 2YDAA 1I2QA 3ABQA 2V8ZA 4PODA 2QCNA 3IIXA 3LHWA 2C6QA 2NX3A 1KM4A 2EF9A 4LVFA 2A5HA 5CPNA 3O6YX 1OX4A 4GJ1A 3HGJA 3W1NA 1GYNA 2GJLA 4LC6A 2GQAA 3E12A 5K9CA 3DKJA 5HR6A 4YCOA 1GVQA 5C55A 3EX6A 2YR1A 3LHYA 2UV8G 1YTDA 3GK0A 1QR7A 2YYUA 3F4NA 4LW7A 4U28A 4ZQOA 1ICQA 1KM5A 3VI2A 4Z1BA 3G3MA 2C14A 4J9JA 4Z1CA 1XXXA 4D2JA 3UXAA 4AXKA 4XZ9A 5HWNA 1HO1A 4Q4KA 2QCGA 5D05A 1RQBA 2RKXA 4RZ5A 1EPXA 1SSGA 4IX0A 4UR7A 1R47A 4Y90A 1Z48A 1P0KA 4UFLA 2TSYA 3E0IA 3LI0A 4NJIA 1EWEA 4K8EA 3SGUA 3P82A 1OK4A 2BLEA 2H90A 1OX6A 3HO8A 3NQGA 5F1VA 3L9CA 2BZNA 1Q6QA 2I14A 2VELA 3GR7A 1V5XA 1W0MA 3DXIA 4DBEA 4WXZA 5CZTA 1YXYA 5IM51 4K36A 1FUYA 3G3DA 4K7VA 1L6SA 1K8ZA 1VHNA 2WSRA 3W7EA 5D03A 2QCDA 1GZGA 3LHTA 4GC4A 1XDLA 3M5XA 3O6CA 1TV7A 3A24A 3KVJA 3P5ZA 2QCEA 3I68A 4M5PA 4MOZA 3STGA 1W31A 2WOQA 4O0KA 4JN6A 4KFPA 4H4IA 4ORIA 1W37A 3M6YA 2CW6A 5AHIA 4BWLA 4MY1A 4L4LA 4UFMA 4NU7A 3DI1A 5J5DA 2ISSA 1FX6A 3MMTA 3NQ8A 2CZEA 3CEUA 4JTLA 4WZHA 1LRQA 4CNOA 2Y70A 1ZENA 2XN0A 6TIMA 4AHPA 3W1UA 1X7FA 1S5TA 3E9AA 4UTKA 1PHWA 4W9TA 3TR2A 2AGKA 1FWNA 3B8DA 3TV8A 3UY8A 4CQ8A 2Y62A 4YWIA 4GWEA 3W1LA 2A85A 3BV4A 1WA3A 4LVAA 5T26A 3OHIA 3I6RA 2CWNA 4LRTA 1C8VA 4N2YA 1DORA 1KFEA 4IMGA 2J88A 3M5ZA 3W7OA 3NPWA 1DQXA 2Z6IA 4A2RA 2NXGA 4LV4A 3TW6A 5DCBA 4S2CA 4E0CA 4DF2A 3TJXA 1DHPA 2CLHA 4O1DA 2CZ5A 3T4CA 4UTTC 3BW3A 4L4MA 1A5CA 2JGYA 3L5AA 1GG1A 1B4EA 2YW4A 1H61A 1WOBA 1HG3A 5LGZA 5CSSA 3ATYA 3KRUA 4IPJA 3EX1A 5D09A 5GVJA 2H3BA 1TJPA 4UXDA 2Y85A 1PE1A 2E5CA 4FX8A 3NQAA 1RQEA 1H51A 3S1WA 3NQ2A 3W7CA 3BG3A 5EL1A 1EEPA 3L0NA 1JQVA 1W3IA 3BGJA 4Z08A 3MO7A 3NZRA 1TPVA 2NZLA 5DLCA 2NV2A 4GUHA 5BOOA 3B06A 3BLEA 1YDOA 3ABRA 5AN7A 3SZ8A 3HGSA 1QPOA 4IMFA 1LZOA 1ONRA 4R34A 4DBDA 2VEPA 3VNDA 3VFLA 4AAJA 2PE4A 1KM3A 1VLWA 2X1SA 4O18A 4QIUA 3UPBA 1XL9A 1SFLA 3R5EA 3FKKA 4FNQA 3PWAA 5CPLA 3PBVA 1QOQA 3LCLA 1I2NA 4JTSA 3MW7A 3BW4A 4GFSA 1JCXA 3WK2A 1RVGA 4LOCA 1KTNA 2Q8LA 5AYZA 5KTLA 2WSYA 2QAFA 2R91A 4TMBA 3F1QA 3DGRA 2C18A 2Y89A 1UASA 3ABSA 1S5VA 1OFOA 4GBUA 3U8GA 3PVFA 4FNUA 4X22A 3L5MA 4XUGA 1MEIA 4JTFA 3W1TA 4UFIA 2QJGA 1VR6A 4ADTA 1I2PA 5C5YA 2OT0A 3T7VA 2V82A 4N6FA 1FWSA 1O4UA 4O17A 2ISVA 3LBCA 3LRLA 3ATZA 4NX5A 3NAVA 2QEZA 3GNDA 2ZRYA 1FCUA 4ZQCA 3B0PA 3W7DA 1T99A 3NL5A 4YMZA 1XM3A 1M7PA 1RD5A 1H7PA 1YADA 2GVGA 3HJZA 3GDKA 3FJLA 1F74A 2V2DA 4TU1A 2BWGA 5DY2A 3UD6A 1ZNNA 1OFEA 5HWJA 3MHGA 2CLMA 3EWXA 4UR8A 2RHGA 4KKXA 5DELA 3QMSA 1VCFA 1L6YA 4A29A 3NQDA 3DFSA 3A5VA 3H55A 2A1YA 5F4SA 5HUOA 4O4VA 5LNUA 2VFEA 4OGZA 4XWUA 4FF7A 3BG9A 3CPRA 1X1ZA 3TUUA 2QF7A 4AH7A 8TIMA 1DBTA 2WV8A 3P61A 2H8ZA 2G97A 3C2FA 4K6AA 2HS8A 4LS0A 2CLOA 4JY8A 3W9ZA 4BFAA 3UWZA 3UY7A 3G8RA 1HUVA 2P10A 3NM1A 1ZCOA 3MHFA 5LNWA 3HG2A 5K7JA 1KFLA 1U83A 1LRNA 2CZDA 1H63A 3IGSA 4O8RA 5EY5A 3BLFA 5I3KA 3PUOA 4FIQA 4HNVA 4Y96A 3T40A 3WJWA 4JTTA 4O28A 1ZY9A 3GNNA 2I9EA 1A5SA 3KXQA 5HINA 5F2GA 1PVNA 3SJ3A 3SFKA 4HKPA 4OV9A 3C56A 4NNAA 1QAPA 5HWMA 3RLUA 5AYYA 1PCWA 4AWTA 3EXSA 1R2SA 1SZNA 3N2MA 3KFTA 3UPWA 4RV8A 1DVJA 1H1ZA 4CCEA 3QMTA 3UWUA 1HTIA 3HF3A 4FO4A 1DOSA 4BF9A 3TCEA 2CLEA 1SR9A 4NX0A 3GXNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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