2ZZ3A

Covalent complex of orotidine monophosphate decarboxylase d70a mutant from m. thermoautotrophicus with 6-cyano-ump
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIAAFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 85
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz3A00
4O17A 2EHHA 5HINA 5K4ZA 3NYZA 5I3IA 3YPIA 5F1VA 4O57A 4ADSA 2WSYA 1G4SA 4EIVA 2WQPA 1H7XA 4ML9A 3LXAA 1SUXA 4RR4A 3UPBA 1RZMA 2RHGA 2A0NA 3DFSA 3QZEA 2B7QA 5F4XA 2Z6JA 3I7RA 4O14A 4FNTA 3D0CA 1N8FA 4O11A 5DCBA 3HF3A 4MJZA 3QPYA 4UFJA 5LNWA 3DHDA 2C1HA 1JQVA 1Q6LA 3W2JA 4IX2A 3QQ0A 3EWUA 3CHVA 4IX0A 4XKYA 4IMFA 3W1AA 1TV8A 2BXVA 1W31A 3SR7A 3A5FA 1DOSA 4NNCA 5AYZA 1MEHA 1XBVA 3IIPA 2X1UA 3GDLA 3PWAA 1JCLA 1THFD 1M5WA 5IBXC 1OFRA 1OFAA 5TQLA 3IRDA 4FX7A 2YR1A 2VC6A 4XUGA 4OWGA 3R8RA 1LP6A 1RVGA 3TW6A 4RKAA 3N34A 2NUWA 3PUDA 1HFBA 3DI0A 1ZALA 3PB0A 2YGYA 3FJLA 2J6XA 3NPWA 4W9TA 3B04A 1TV7A 3P8IA 3MHFA 1QOPA 1XC4A 1K03A 4O0ZA 1LTDA 3W23A 1FWTA 1AK5A 1W0MA 4BF9A 1I45A 3JR2A 5A5WA 3LXBA 1TB3A 2V30A 3UWVA 2J9YA 1MEIA 3CPRA 4UMCA 3R2GA 5HR6A 4FNRA 1OF8A 3G1AA 3TE9A 4ZQNA 5AHMA 4IMEA 5K3VA 1FCUA 4M6VA 5LGZA 3F4WA 3L0GA 2GJLA 3LRKA 3W1LA 3TNOA 4UTHA 3M16A 1UB3A 2OT0A 3DFNA 3UXDA 4UNLA 3W1NA 3C6CA 3NL2A 3T44A 3DI1A 3MP3A 3IIVA 2B4GA 1FWWA 3SJ3A 2FDSA 1VGAA 1SW7A 3DFPA 4ADUA 4NJKA 4UTKA 2ATMA 1DJNA 3EX3A 1NVMA 1OFOA 3PG8A 3N2MA 1WOAA 2Y7EA 3EXSA 4K37A 1F2JA 1GTHA 1OX6A 1SU5A 3SW6A 4XZ9A 4NJJA 4WX2A 3W1QA 3OG3A 4YL2A 2RDUA 1X7FA 3ABSA 4IOTA 2QCDB 5FEZA 1G4PA 5I3HA 3HOJA 4O18A 4MJMA 1EIXA 3NQFA 4DQWA 5IBXA 3QYQA 4JTSA 3G0XA 1VZWA 1JCMP 2PRMA 4FNSA 5FF0A 3L5AA 3EB2A 3CWNA 3FKRA 2FTPA 1W5PA 3W07A 1XUUA 4ZQPA 2CW6A 3H54A 4K36A 1W5NA 5AHFA 2E6DA 3MMTA 3F4NA 1C9DA 1GTEA 5CZSA 2G5WA 1OHLA 2Y70A 3O07A 5HNRA 4OV9A 1LORA 2TPSA 4EF8A 4ZL1A 5CPLA 4JX6A 4O8RA 3MYPA 3F1QA 3W7PA 3G1XA 4LS0A 1KM2A 4WXZA 3MI3A 3W1XA 1O5XA 5C2XA 1G6CA 3OVPA 1QNVA 1L9WA 3LLFA 3S5NA 3ZS4A 3VCRA 1FXPA 1ADOA 3NQVA 2J27A 1GVSA 4TIMA 1QO5A 3NL3A 4LOCA 1DHPA 3CEPA 2JKEA 4E2DA 2FPYA 3FYPA 4I7VA 5BMXA 3NA8A 1A5SA 4JNMA 2CLOA 4NT0A 4X22A 2PCQA 3DAQA 2R94A 3ZR4A 4MOZA 3NL6A 1DKWA 3O16A 1QFEA 3NQCA 4UXDA 1P0KA 4IQLA 4NU7A 3GR8A 5EY5A 5A8GA 4FIRA 4I7WA 1LOSA 1HO1A 4TMBA 3P7YA 1XUZA 4O16A 2VEMA 2BX7A 4LT9A 4QQ3A 3LXCA 4X9SA 1FQ0A 1KLYA 2FPVA 3MI2A 4NZJA 3W75A 1OVDA 1L2UA 4FNUA 1VC4A 4MZ8A 3EEGA 1GVFA 3DFOA 2ISSA 4OBTA 1OFPA 3MHUA 4MKNA 4QIUA 1L6YA 3P8JA 4K39A 4JIQA 3GXPA 3KOFA 4ORIA 3B0UX 3W7RA 4HN4A 1KFKA 4ZMGA 2ZYFA 4FNQA 4OHQA 4N9CA 2B0MA 2WOQA 4JXCA 4WJEA 2I9EA 5CPNA 2FJKA 4BFAA 2WNNA 1NF0A 4DEFA 4KFOA 4S1FA 4WQ6A 4UTTA 4HT3A 5CZTA 1G7VA 4JTGA 1LYXA 1RD5A 3A5VA 3IVSA 5HQEA 3HO8A 3G22A 3W88A 4PC8A 5AHLA 1VS1A 5AC6A 3NQEA 1GQNA 1TMHA 3TXVA 1WBHA 3GAKA 1Q6OA 3I65A 3N14A 3WJWA 3SGUA 1LBLA 5LKYA 3LHTA 4UTLA 3STCA 1J2WA 1K7FA 3S42A 3C2FA 4O12A 1AG1O 3EWWA 4XTDA 6TIMA 1GPWA 1SO5A 4K7YA 7TIMA 1YPIA 4ALDA 4AF0B 1VR6A 3W87A 5I3FA 3PY2A 1FWSA 3NG3A 4CNPA 3CU2A 1XDMA 2WNZA 4EWND 1FCVA 3CEUA 2YYTA 3GX9A 4QSHA 4KFPA 1JR1A 1H50A 4CLMA 5F2MA 2VFEA 5ABTA 3W2MA 2HS6A 4M7TA 4RCXA 3C2OA 5BRBA 1TYGA 2QCDA 3B8DA 5D2TA 4M5PA 5U7SA 1RQBA 4HHPA 2R8WA 2ZTJA 3KRUA 4MLJA 4Q33A 2W79A 5FI8A 4HSOA 2QCFA 3W7GA 4Z1BA 5D30A 1R46A 1ZAIA 2VFGA 1HTIA 2I1OA 1WA3A 1VCFA 1KTCA 2X1TA 4NXKA 1O4UA 5AC8A 2DJLA 3GDTA 3LCLA 1VYPX 1JRCA 3ZWTA 2QCEA 2RH9A 3DXIA 2Q8ZA 1F05A 2Y61A 4XQ6A 3ZWSA 1SW3A 1QDSA 2WSQA 3EKLA 3O63A 3W7JA 3EXTA 4U4MA 2P10A 4H4IA 2Q3RA 3KXQA 3S1WA 3G8EA 5EYWA 2Z1BA 1GG0A 3EKZA 5D09A 3GAYA 4AVFA 2QF7A 5FF2A 3GR7A 4UMAA 1A53A 1M6JA 1IXPA 2J9ZA 5DN1A 4GFSA 1SZNA 4P2VA 3TSDA 3L67A 2CZDA 1ZHAA 2G96A 3GB6A 4GXMA 3LERA 1B4EA 2A6LA 5KZEA 3S5ZA 3LRLA 2ZFAA 2QR6A 5F2LA 2ZZ1A 5CSSA 3LTYA 4FX8A 3RLVA 4DELA 1OABA 1PVNA 5C5YA 3PS7A 4LNYA 2ZRYA 3BK0A 5LHFA 2GVJA 1OK4A 3LI1A 4JR5A 1KA9F 3TDFA 3GIYA 1GT8A 3LCHA 1HUVA 4QAIA 2TMDA 1XKYA 1IF2A 4E38A 4JTFA 1TQJA 1TPH1 4MLRA 4YLWA 1MO0A 4LC6A 4TU1A 3MBDA 3O05A 5KINA 3WJSA 4PA8A 4JDYA 4LU0A 4WOZA 4TO8A 1C8VA 4MY1A 5DLCA 1E51A 2ATSA 1KTNA 4JX5A 2GQ9A 3TQVA 3W1PA 1KBJA 4PL2A 2PE4A 3LBMA 3PBWA 3STFA 3NQMA 2W0UA 4ZQCA 4Y8FA 4CCEA 1A5BA 1FX6A 1PS9A 3QEZA 3EWBX 3C0JA 1JUKA 3O8AA 3PVFA 3SSJA 4LS2A 3BG9A 5I3JA 3LHVA 1F6PA 3ABOA 3LCIA 3TKFA 4BI6A 4MYAA 4RJEA 3CIXA 3Q2DA 1XBZA 3CWOX 1ZNNA 4Z0SA 3G3MA 3E12A 1SFLA 3A9IA 4M19A 4PTNA 3V75A 3NL5A 4LTSA 5L9FA 1F73A 5C6MA 3SFKA 3G18A 4N9EA 3N3MA 1M7PA 4GUIA 3F03K 2V2HA 2YFOA 5LNRA 5SWUA 3W2NA 4GUJA 3BLFA 2Y85A 3HPXA 1FWRA 1DV7A 3CIWA 3R89A 2Z2UA 3QFEA 3STEA 3PR2A 4O0KA 4KWWA 1TPFA 4CQ9A 1TPWA 1SPQA 4M7SA 4WD0A 1PV8A 4AF0A 1AW5A 1TPDA 4AXKA 4N02A 4BWLC 4Z0JA 3L68A 1H7OA 4OV4A 5FESA 3M7WA 1S5TA 4LVGA 4WUIA 2GVGA 1OYBA 1H1ZA 3KX6A 1OX5A 2H3BA 2YX0A 3W7MA 4FHAA 5F2IA 3KVLA 1DL3A 3BARA 2FFCA 5DCEA 4X2RA 3M1ZA 2YZRA 1VHNA 3B4UA 5GVJA 3QMSA 4DF2A 3NQ6A 3BGGA 5MHBA 2FB2A 2E68A 5EPDA 1H62A 5DY2A 1IIHA 2ISWA 5KZDA 3Q58A 3QW3A 1AW1A 2YDAA 2WJZA 4OE7A 3NQ8A 4S2CA 4Z08A 3NDOA 4JIPA 2C3ZA 3OA3A 4DO6A 4QISA 3LM7A 3LDVA 1LROA 5BW6A 1GG1A 1TO3A 3TROA 2DZUA 2C16A 3W74A 3G1DA 3PBYA 3W70A 2V82A 1T8XA 2H8ZA 2CLEA 3KHJA 5LGXA 2VXNA 3HG3A 4K8HA 3QH2A 3L0KA 3BLIA 4IWWA 4EOUA 1H51A 2NX3A 2P0OA 1GWJA 1WAUA 4JGDA 2TSYA 3OVRA 3S1VA 3UY7A 3PULA 4BK9A 3PM6A 3DKJA 4HNTA 3E49A 3TR2A 3TX9A 2V8ZA 3LCXA 1XCFA 3DFTA 5D2XA 4GWEA 2BWGA 3RU6A 2NZLA 4JICA 4GUGA 2ZCGA 1KM4A 3USBA 5CGQA 3WK1A 1BKSA 5AC7A 5D38A 2Z6IA 5CZ0A 3GNNA 2DZSA 1H7NA 2IQTA 3TAOA 3N73A 4AHQA 1KM5A 1YLVA 5CSRA 5G5IA 1JCNA 4I9AA 4PCFA 3BV4A 4L4LA 5L6UA 1QR7A 2Y7GA 1TTPA 1OK6A 3EX4A 3FS2A 5CKSA 3Q94A 3PBVA 1VPXA 4BWLA 1NAL1 2DJXA 1SO3A 3HG4A 4NUWA 3TMLA 4Y90A 1K7EA 1WYIA 4Q32A 4DF0A 4Y96A 2PRLA 4M6QA 4PODA 3NR0A 2KZHA 3STGA 2YXGA 3W1MA 1I2OA 2OMAA 3UXAA 3NEVA 5CG7A 1G7UA 3P60A 3FFSA 4LV4A 3W7IA 3B0PA 2CLLA 2A6NA 1W3TA 2EGZA 4P61A 1OYCA 3NQAA 4DF1A 4JX4A 4ORMA 3GDMA 4Z1DA 1G67A 1LZOA 3EWXA 3LOTA 1VYRA 3HGJA 3C2RA 3P5YA 1L6WA 4JTLA 4O4WA 1JQXA 1X6UA 4UIOA 1I2RA 1T99A 3BO9A 1DBTA 4RZ5A 2C14A 2V81A 5AYYA 1KW1A 3I7SA 4RV8A 3MJYA 2ISVA 3I7QA 4UTTC 2A7NA 2X1RA 1EP2A 1NFBA 4HNUA 1GYLA 4UC5A 1K3UA 4AEOA 4QM1A 2NV2A 4S2BA 2X16A 3C2EA 3S1XA 4JYDA 3R12A 3L9CA 1CX9A 4UFKA 4G1KA 3FJ6A 3A24A 1Z48A 2ZA3A 5DBUA 2J88A 2NXIA 3PSVA 4JN6A 4MZ1A 1QAPA 2QDGA 1MXSA 3GKAA 1EX5A 1GEQA 3S0CA 2A1YA 1D3HA 3W1RA 3VKJA 2QDHA 2NUYA 3NPXA 4IUOA 4AAJA 4N6EA 1VLWA 3W83A 3INPA 3M43A 1UASA 5HMSA 1DQWA 1W5QA 4JD4A 3NPVA 3NO5A 1X1OA 1TPVA 4O54A 4UTJA 2CFFA 3PSWA 5BOOA 3BGJA 4UFHA 1SZEA 3G1YA 2ZBTA 3LX9A 1SW0A 1YDOA 3P74A 3O15A 1ICSA 4O1CA 1N7KA 4M6PA 4FXSA 4UFIA 1VHCA 4U28A 5AN7A 3DHFA 1ONRA 4UR7A 1QCWA 1YADA 3MUXA 3A23A 3IIOA 2H3DA 3IGSA 3GK0A 3TV8A 2CZFA 2AGKA 1Q3NA 3K30A 1MEWA 1XBXA 1WOBA 1KLZA 5D33A 5T26A 4EVZA 2Y89A 4JTHA 2ZRUA 4K6AA 2GJNA 2XN0A 2JGYA 3A22A 4FIQA 1KFEA 3ABRA 3TSMA 4RXGA 5AHIA 2Z0IA 5KSWA 2NLIA 3SY5A 1W5MA 3NXFA 4FEZA 3FLUA 3NQDA 3W7NA 5U4NA 2E6YA 3CM4A 3SGZA 4HIBA 2A85A 3EXRA 3DU0A 3CC1A 2BZNA 3S5YA 1IIGA 3U6WA 5HWNA 4JS3A 4NNBA 1GZGA 1YPFA 2VFFA 1FXQA 4IXHA 3KRSA 3P80A 1JULA 2QUVA 3OEXA 2QAPA 2R91A 3G0UA 4O52A 4JY9A 1ZY9A 3LHYA 3W2KA 3T40A 3L5MA 4H6KA 4UUIA 3T4CA 4DO5A 2CLMA 5DCDA 1BEUA 1YTEA 2Y7DA 1H5YA 4RZ4A 1P5BA 2VFIA 1P1XA 1LRTA 2BSLA 2Y88A 1Z41A 3OHIA 3PAJA 3QMTA 3TIMA 3QC3A 2CZ5A 4XBSA 5E0KA 4NJIA 2DZVA 3IEBA 1VCGA 5C55A 4UTIA 5G2HA 3G1HA 1J4EA 1QO2A 4ZQOA 3LV5A 4C1LA 4WY0B 3GDKA 4O15A 5CZJA 4MFEA 3UY8A 1H63A 4D2JA 4NJGA 5HR7A 1LRQA 4KWVA 1FCQA 2JKPA 2QCLA 3G1FA 3BPWA 2C0AA 4C1KA 1G4EA 1LOQA 3W7LA 5LNUA 2QEZA 3Q37A 1NF7A 4N9DA 3BW4A 1AMKA 4CQ8A 3W7OA 1LM1A 1YDNA 3DH7A 1KM3A 3MP5A 3NZ1A 3FYOA 1YTDA 4MY9A 4GRSA 3QM3A 5AHEA 2A2IA 3TW7A 1KFLA 1VJIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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