2ZZ5A

Orotidine monophosphate deacarboxylase d70a/k72a double mutant from m. thermoautotrophicum complexed with 6- cyano-ump
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
MDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIAAFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV4 (182-185)S1 (15-19)S2 (40-44)AH2 (45-51)TI2 (35-38)AH3 (53-63)AH4 (77-90)S3 (66-73)S4 (94-98)TI4 (99-102)AH6 (139-149)TI3 (98-101)AH5 (103-116)S6 (153-155)S5 (119-123)S7 (176-179)3H2 (129-132)3H3 (136-138)TIV1 (132-135)TI6 (172-175)AH8 (189-194)TI5 (157-160)AH7 (161-171)TIV3 (181-184)TI7 (183-186)TVIII2 (196-199)S8 (198-201)AH9 (203-207)AH10 (211-220)TI1 (34-37)AH1 (24-34)TVIII3 (208-211)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 82
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz5A00
1YXCA 3BLFA 5FI8A 1T96A 3FKRA 2Q3RA 2B7OA 2QUVA 1ZALA 3UWVA 4JDBA 3G1HA 1H60A 4N9EA 2NV2A 1KTNA 3LDVA 4OGZA 1KFLA 3TU9A 4WXZA 3QSRA 3FOKA 3UZJA 3S5NA 3PBVA 1SO4A 3P7YA 3LHVA 2I1OA 2DZPA 4K38A 3HIJA 2AGKA 3W1TA 5AFDA 3LRKA 1F6PA 1T8XA 4QJ1A 3VNDA 4KWWA 3W22A 3M5VA 4JYEA 3D0CA 4DO4A 5AHFA 4DQWA 1LLZA 3SR7A 1EWDA 5IBXC 4WZHA 3KHJA 4NJJA 1V5XA 1I2PA 1Q45A 3NDOA 1IXNA 1XBZA 4GE8A 1KW1A 1FXQA 2OMAA 2CZDA 2YW4A 3W72A 4FX8A 4FXRA 3IV3A 1LYXA 3C8FA 1ZCOA 1IXPA 3ABSA 4RZ6A 3SIZA 4UTWA 3PS7A 4JNMA 2VEIA 3E96A 1SU5A 5T26A 4ADSA 2F84A 3P8JA 2V2HA 3IIXA 1N55A 1TV7A 3CU2A 1KM4A 4BI5A 4Q4KA 1QWGA 5A8GA 1FCVA 1K8YA 1YDOA 2BTMA 3QQ1A 3WJYA 3W1RA 5DELA 3HGJA 3LLDA 1FCQA 3UQNA 3W71A 3GKFA 3W7IA 3I7SA 4HNVA 1AW5A 3QM3A 2ZZ6A 3NQEA 3TA6A 3CWOX 3MHGA 3LM7A 3B4UA 3QPZA 1MO0A 1PV8A 4MKNA 3WJWA 1ME9A 1FQ0A 3S8HA 5HR6A 1JCLA 3EXRA 5HR7A 5DN1A 2TMDA 4K39A 2GVGA 5LNWA 3KRZA 3GR7A 2Z0IA 4Z1AA 1TV5A 3R12A 4JS3A 3TQKA 3KVJA 1G6CA 3T4CA 4IGHA 2V30A 4O15A 2NUXA 1YYAA 4MFEA 1H63A 1FCUA 4OV4A 5F1UA 3SGUA 1KFBA 1H5YA 5E1QA 3KVMA 3BGGA 1GVOA 3TH6A 4K7VA 3SW6A 3CIWA 3W1LA 2GOUA 3N73A 4JTUA 1TV8A 3ZWTA 1G4PA 4NXSA 1VYSX 2E5DA 4UTTC 3SI9A 3QQ0A 4QIUA 3L9CA 5HJLA 1JCMP 1H7WA 3UXDA 4QISA 1H51A 2ISSA 3G3DA 5K9CA 2HMCA 3G3MA 2VELA 1TQJA 3AO0A 3W2UA 1OFDA 4YXGA 3LCFA 4N6FA 4IXXA 3LHYA 1SSDA 2O7SA 4HIBA 4UFLA 2XN0A 4B5NA 1FBAA 4BR1A 3PM6A 4FNQA 3NQ7A 2X1SA 1FXPA 1XBVA 1W3NA 5K4XA 1LORA 1VYPX 3G24A 4JDYA 2QCGA 1R2TA 3PWAA 4ML9A 1LROA 2NZLA 5LGZA 5TBOA 3TK7A 3TNOA 4FNSA 3C2OA 3PY2A 2PE4A 4YCOA 1OVDA 2VEMA 4OT7A 1FWWA 4PCFA 1ICQA 1BEUA 2G5WA 5C54A 4N4PA 4OQVA 4N9CA 2YZRA 3NA8A 4NNAA 1VCGA 2E6DA 5F1VA 3NEVA 4GJ1A 4N02A 3IIOA 4LV9A 3TW6A 3WJXA 5F4WA 1YXYA 1A5AA 2GJLA 3EWYA 3FYOA 1ZJIA 1KLYA 4CLMA 2NXGA 3FS2A 1B4KA 4POCA 2E68A 2WPBA 4CCCA 1TTIA 3OVPA 1B3OA 2Z6IA 3IVSA 4EOUA 1XDLA 4DF0A 4OBTA 2X1TA 4IMEA 5J5RA 3DKLA 4IMCA 4CCDA 5D2VA 3EX3A 3VCRA 3TFXA 4CQAA 4FNUA 3KVKA 3FEMA 2NV1A 3S5YA 1XKYA 1VCVA 2V5LA 1OABA 1J5TA 2EF9A 3IRDA 3LHZA 1W3IA 3TC6A 5SWUA 2NX9A 2WSRA 1LOSA 2QCDB 1QOPA 5EA9A 3W2KA 5DCBA 3B03A 3W3OA 2J6XA 2ZZ2A 4DBDA 5BMXA 4GUIA 3NG3A 3S0CA 2QDHA 5C6MA 1QFEA 4YMZA 1ZY9A 2A1YA 1GT8A 4FX6M 2JKPA 4TMBA 5FEWA 3W1PA 3H53A 4AHPA 4NJHA 3WK1A 4PTNA 5DXYA 1KA9F 1W56A 1L6SA 1NF7A 2BZNA 2NWSA 2OZ0A 3UY7A 4RK8A 1JCJA 5LNRA 4Z08A 3BG9A 4YLWA 4BWLC 2ZYFA 1C29A 1W5QA 5EBUA 4Y8FA 4ORMA 1JUKA 1OK4A 4DPPA 3WK2A 3L0GA 4O50A 3PBWA 4UR8A 2E1DA 1OYBA 3LB0A 3P82A 2F7FA 3NOEA 4Y9AA 1OF8A 1Q6OA 4JTEA 3LHTA 4NXKA 3W88A 1RPXA 3HG3A 3O63A 2ZZ7A 5LNVA 1WXJA 2OJPA 2V9DA 3C2RA 5D33A 4R33A 1H7PA 3S5OA 4KFOA 4FIRA 3CWNA 5EYWA 2QKFA 3QJAA 2E5CA 5G1YA 2ZDRA 5D38A 4CNPA 1G7VA 2GJNA 5I3JA 2B0MA 3T40A 1MSSA 1CX9A 4O28A 4H3DA 1EPXA 3UNDA 4IMGA 1A5BA 4UNLA 1UBSA 3N2MA 3RLVA 4O17A 5F2IA 2VXNA 3HQ1A 3PVFA 3S1WA 3W6YA 4UC5A 3QH2A 3BPWA 3ZR4A 5LZLA 3CT7A 5D2TA 3KOFA 3ANYA 4MJZA 1GOXA 1I2RA 4CQ8A 2E77A 3FFSA 1K7FA 3G1SA 3DBPA 4IMFA 1N8FA 4N9BA 3PC0A 3NVTA 1P5BA 1JRBA 1TYGA 2V5BA 3TCEA 4WY0A 3M41A 1H61A 5L6UA 1R2RA 1SW7A 4FNRA 4FEZA 4JGDA 2TSYA 1SZEA 3LV5A 2EKCA 1QO2A 3LX9A 4HNNA 1CW2A 3ZWSA 3HMJG 2JKEA 1A5CA 1SQ7A 3TW7A 3MYPA 1ZAIA 2A4AA 3EXSA 4K7YA 1HFBA 1P0NA 4RX0A 2FPTA 3EEGA 3TE9A 1VRDA 2ZZ4A 3N34A 4YCPA 2WSQA 1A50A 1G4SA 2DZWA 4N9DA 3C2VA 4OHQA 4JY8A 1JR1A 4RCXA 3E9AA 3L68A 1IF2A 3LTYA 1Z44A 4PH6A 1JUEA 2Y70A 1XBYA 2E6AA 1KM0A 3NZRA 5CZSA 1FUYA 3LXBA 1G67A 4FHAA 3SFKA 2ZZ5A 2EHHA 1IIHA 3W7GA 3GXTA 3LRLA 1QOQA 4UIOA 1ADOA 4PA8A 2YX0A 3M9YA 2XFWA 3JR2A 3O06A 2J88A 3M6YA 5KSWA 1XCFA 2YYUA 5HUOA 4JYFA 3OA3A 2J27A 1IXQA 1DJQA 3G0UA 1UCWA 4XWUA 1W5OA 1W0MA 3GYEA 4JTTA 2I14A 3W23A 4NJKA 5D04C 4TMCA 2JK2A 3TR2A 3E0IA 3STFA 1KLZA 5AC7A 4NZJA 2JKAA 3G1AA 3BW2A 3DFTA 5AHLA 3LCLA 3QMRA 3I68A 3W1AA 1PCKA 1VCFA 2QCCA 2FIQA 5I3IA 4WJEA 1OG0A 2J9XA 3MP5A 1LRNA 1H7OA 2QJHA 4TU1A 1THFD 4IJBA 2QCLA 3FA5A 5J5DA 3P5YA 3L5LA 3N14A 1RZMA 4MZYA 3PUEA 3A5VA 3GIYA 1GJPA 4UFMA 3VFLA 5FEZA 5D03A 1EP3A 3W7HA 3HGRA 4W9TA 3PR2A 4JX5A 4ZMGA 2C15A 3L65A 3M5ZA 1XC4A 1TJRA 3Q37A 2A6LA 3T44A 4UTHA 2E6FA 1SO5A 3C2FA 2B7QA 3GLCA 4HSNA 3OEXA 2EGZA 3W84A 1SFJA 4H6KA 1TTJA 3NPXA 2C19A 3CLMA 1LOLA 4Z0SA 1MXSA 4UFKA 2JGYA 1WDWA 2X2GA 3DAQA 3G1FA 2DJXA 4IWWA 5CZJA 5AHMA 1IIGA 3L2IA 3W83A 2ZRWA 1KFCA 4AMAA 2HSAA 4UTUA 5L9FA 2QCHA 2FPVA 1GVSA 1EUNA 3NQVA 2P0OA 3G1YA 4G1KA 5HWJA 1M7PA 1XUZA 2BX7A 4P2VA 3S6DA 4NT0A 2QR6A 2HS8A 3EKZA 1VJIA 3S9YA 3M43A 4O1BA 5D32A 1SFLA 2BWGA 1M5WA 3TAKA 4DO5A 1IGSA 3QPYA 4WY0F 2P1FA 3P8IA 5LNUA 4LVBA 1WBHA 4MYXA 2ATMA 3UD6A 3I65A 2BSLA 1FY6A 1A53A 1QPRA 3B05A 1OYCA 1EUAA 3PUOA 1L2UA 2DORA 4HSOA 3TJLA 3GX9A 3RFAA 1SSGA 4NJGA 2BLEA 1VR6A 1WQ5A 4MY9A 1X7FA 4IOTA 1GVRA 1LLWA 4MFDA 3TDFA 1VH7A 3DHFA 2DZTA 1P4CA 3EX2A 5HQEA 5AC8A 3IGSA 5I3FA 4M6QA 4L4MA 4MYAA 2Y6ZA 4L4LA 2DZUA 4GUFA 4LWWA 1S3HA 4BF9A 1XBXA 1XXXA 4S1FA 3P81A 3ATYA 4PFMA 3GNDA 1NFBA 1LBMA 1SR9A 3I7RA 4AB4A 1PL9A 4ADTA 2FB3A 1QNVA 1U83A 2CLOA 3H55A 3HGOA 1FCBA 3GDTA 4O11A 4LV4A 1TPUA 2W79A 2ZA2A 2QCDA 2HTMA 3R89A 3CTLA 1X8FA 3S1UA 4UMAA 3C4UA 3W7CA 1LM1A 2V81A 1W1ZA 4S2BA 1ICSA 3VE9A 4TR9A 4A21A 2Y7EA 3LERA 1QAPA 3O15A 4JXCA 4NVTA 3RK8A 3W7JA 4IPJA 3PSVA 1QCWA 2RHGA 1WOBA 3PSWA 5DBUA 5K9XA 3WK0A 2WSYA 1OFBA 4LS0A 4LY8A 4BFAA 1H7NA 1ZAHA 3UWZA 1JQXA 4UTMA 3UY8A 4ZQNA 4MOZA 2ZFAA 4WOZA 3W7OA 3LXAA 5EMUA 1TTQA 1O94A 4A22A 2QAPA 5ABTA 1RD5A 2NLIA 2NUWA 1DHPA 2PRHA 3TMLA 3B06A 1K7XA 1I45A 3M44A 2CW6A 3TJXA 2J9YA 4GRSA 4JTIA 1Z48A 3Q94A 5AHEA 3T7VA 1KBJA 5K4ZA 1ZHAA 1DKWA 3W1QA 3O16A 5FF0A 4MPQA 5F4XA 1JUBA 1PS9A 4DELA 1W54A 4AWTA 2C6QA 2AAMA 1ALDA 3UPBA 3RLUA 3L21A 3ATZA 3DHDA 3P67A 1NF0A 2YPIA 4O14A 2ZRUA 3NAVA 4EWND 3GB6A 3R2GA 2C14A 4ONVA 3PUDA 4UNKA 2YR1A 3B0VC 4GXMA 2NXIA 4RR4A 1FDJA 3DI0A 3FLUA 2NX3A 3R8RA 3DI1A 1TSIA 1SO3A 1W5NA 3WK3A 1BWKA 3W2LA 3EWWA 3LI1A 5U4NA 4RV8A 2G95A 5G2WA 1SZGA 1C8VA 3TXVA 2FB2A 3BV4A 4LUIA 3L5AA 1JCXA 4M6VA 2A7PA 5CZ0A 2ZRZA 2X1RA 4ZQMA 3B04A 4OV9A 1QMLA 2A7NA 3W07A 1I2NA 2Y61A 2YYTA 5CPOA 4A2RA 2O7QA 3DU0A 1XL9A 3PBUA 4ZQRA 4UTWC 1JVNA 2ZRVA 1K8ZA 1OJXA 1MEHA 4P61A 4O1AA 2PURA 4MZ1A 3W1XA 3TQVA 4QQ3A 3N9SA 3GXPA 3BLIA 2BXVA 1DOSA 3C56A 1W3TA 1KTBA 5K7JA 2C16A 2X1UA 3T78A 3MP4A 2DU2A 1ML1A 4K6AA 2E6YA 3SY5A 3OBKA 3A23A 4GNJA 1VPXA 2ZQ0A 4RZ5A 5D37A 3GVGA 1OHLA 2GQ8A 1PE1A 3UZ5A 2A6NA 5KTLA 1BTMA 2GUUA 2V2CA 3L5MA 3DFOA 3TXZA 3A24A 3E12A 2X30A 3HPXA 1X1OA 4RKAA 3TMQA 4EF9A 5H2ZA 2C3ZA 2WQPA 3DXIA 1GG1A 1OF6A 3IGXA 3G8EA 3JS3A 1KV5A 3R5EA 3LRMA 1RR2A 2QJGA 3GDKA 4A3UA 4TIMA 1PCWA 1HL2A 2WV8A 4NUWA 5AYXA 2C1HA 1SW3A 3BO9A 4HHPA 5G2HA 3W7DA 4PL2A 3RU6A 1ZFJA 5CSRA 1K7EA 1F2JA 3PB0A 3KXQA 3QMSA 4ZVJA 3NQGA 4JTKA 1DQXA 1EWEA 5E0KA 1BWLA 5D05A 1W37A 3P62A 4O0ZA 5U7SA 3O6YX 3W76A 4PL1A 4I9AA 1TMHA 2VFFA 2QCMA 3VKJA 4JR5A 1GPWA 3NQCA 4DBEA 1QPNA 2Y89A 4GUGA 3CIXA 3PG9A 4AXKA 1H7RA 4NJIA 3W2MA 1OFRA 5DY2A 3A9IA 4AF0B 5BOOA 2CZ5A 2XN1A 1H1YA 2QF7A 1AL8A 5I3GA 1EB3A 1OFPA 3M5YA 2ZRYA 8TIMA 1HO4A 4K8EA 4LC8A 1FDZA 2RH9A 4CNOA 2A85A 1SZFA 3P84A 2G97A 1TPFA 1S5VA 1ME8A 4QNWA 4RXGA 5DCEA 3W2NA 4ICNA 1GG0A 1AL7A 3LCGA 2H6RA 2ALDA 3W87A 2R91A 1P0KA 2PC4A 3MBFA 2Z1BA 4AH7A 1AW2A 2FFCA 5FEPA 1TPVA 5TQLA 3WFAA 1RQEA 2RDWA 3I6RA 1TPB1 4BK9A 1FWNA 2OT1A 1VQTA 3UWYA 4OU1A 4ALDA 3L66A 1JCNA 1HTIA 1DL3A 5H91A 4IQLA 2V2DA 3G18A 3DZ1A 3FJ6A 4ZQOA 4AHQA 1PVNA 2Z2UA 5LHEA 4U28A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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