2A3HA

Cellobiose complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradherans at 2.0 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Bacillus agaradherans family 5 endoglucanase at 1.6 A and its cellobiose complex at 2.0 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Endoglucanase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 117
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1998-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2a3hA00
4MNJA 1E0XA 3WNPA 3FAWA 3WDHA 1BGGA 3CZJA 2WMGA 4RE2A 4UQBA 3GXDA 1PX4A 4J7RA 3IJ7A 4CU7A 1G1YA 1IV8A 4U3CA 4JFTA 4TX8A 1QNOA 5BXSA 1BVZA 1HKKA 1XRVA 2WVSA 2PWEA 3FW6A 3LPGA 1PJ9A 3WQ4A 3VX1A 4YHGA 4AZIA 3QHNA 2XIBA 4PN2A 2WAGA 2EPMX 1FH9A 4DUWA 2YL9A 4UQAA 3T08A 3VIJA 4GI6A 4M82A 1EQPA 1VBUA 2ZX6A 5D8WA 2ZE0A 3GXFA 4TVUA 2VVNA 1MFVA 4PUEA 1QW8A 1KQZA 4GZIA 2XFFA 2J25A 1DWAM 4H04A 5ABHA 1EA9C 3SUSA 1UH4A 3EDEA 2PWHA 1ISYA 2D24A 1E3XA 3CHFA 4ATWA 3AQUA 2EO7A 4HPHA 2ZWZA 3N15A 1E6QM 3VIMA 4WIWA 3W28A 3DYPA 3EYPA 4UCFA 2WC7A 2CERA 4W85A 4OIFA 3NSNA 4J28A 4PTXA 4UFLA 1UD6A 3HN3A 3LMYA 1QNQA 1BAGA 1BTCA 1QHOA 3VGBA 3EBVA 4GZEA 1LJYA 2PWDA 4HOZA 4W5ZA 1OWQA 5D9MA 4UZSA 2G3IA 4KH2A 1XCXA 2PB1A 5IFTA 2WBKA 3WNKA 5FL0A 1J0HA 2WZIA 4AIEA 2IUZA 3GNPA 1QPKA 2ZXDA 2DEPA 1V0LA 3EDJA 3FN9A 1SYTA 3AIBA 4Z2LA 1HJUA 5D4YA 1VFUA 1HJVA 3ZT6A 4AD2A 5BCAA 2CEQA 1MXGA 4UTFA 1OCQA 3BSGA 1HJQA 1OD8A 2ZIDA 2E9MA 1V08A 1BG9A 4AD1A 2OYKA 3FY1A 3W26A 3WUGA 1E72M 1CECA 2JF6A 2BFGA 5E70A 1IZKA 1KFWA 1G01A 3GH4A 5FKYA 1W9UA 3BXWA 4CD8A 1GOIA 3PZ9A 3PZOA 3AIQA 4EAMA 1JDDA 1UKTA 2GJRA 2V3DA 1J12A 4EK7A 1E9LA 4ZXOA 2O9RA 2WZHA 4AZ5A 1R85A 1XC6A 3APGA 4WSJA 3M6DA 3U5YA 3WDJA 3ECQA 4WKHA 4JCMA 3CZKA 3VIOA 1V3JA 3BCDA 4R5EA 3ARRA 3PN8A 3OLIA 5ABEA 3AS0A 4E8DA 2VR5A 1J0ZA 4PCSA 2VCBA 1RP9A 2G3JA 1CEOA 4FMVA 3HJEA 1VFOA 1R8LA 2JF7A 3AI0A 3CHEA 5DFAA 2CHOA 1MW2A 3L4YA 2XFYA 4R27A 5EB8A 3K4DA 4Z2KA 2ESCA 3WH8A 1US3A 1EXPA 1H41A 5I5RA 2YA0A 3CHDA 5FIPA 3RJXA 2C8NA 3VGHA 1CXIA 4F66A 1P6WA 1V0MA 2YBTA 4OOUA 2WMIB 4TOQA 4AISA 1UZ1A 3MMDA 2VQUA 2W67A 5LA1A 1IT0A 3CUJA 4U31A 2ZX8A 4ZEPA 4N42A 1GOQA 4D6CA 2VT0A 4WF7A 2X1IA 2WMKA 4P7LA 2D0HA 3UG5A 1JYXA 3ZM8A 1X1NA 1KXHA 2VR4A 3T2PA 3W37A 3QHMA 1SMAA 5I3DA 1UWUA 2DIEA 2CYGA 4J3TA 2O9PA 1CPUA 1V0KA 1GJUA 1FFQA 5LA0A 3WUFA 5M3WA 1C90A 1CXFA 3L4WA 3PZGA 2UY2A 2ZXQA 1JZ2A 2G3NA 4Z2IA 2VVSA 2Y8KA 3WUEA 5I77A 4UOJA 5A8MA 2BXYA 2WVUA 1MYRA 3WMBA 1AMYA 1JZ7A 4WSKA 3NSMA 1VENA 1XD1A 1G5AA 1EH9A 2J7BA 2CHNA 2DSWA 2CKSA 4M81A 1HNYA 2E9LA 3AS2A 4HA1A 1MQPA 3VIPA 2X09A 2BHZA 1EHNA 5E0CA 3EMZA 3L4UA 4RE4A 3FHQA 3W82A 2Y5EA 5GNXA 4BQ5A 5C8BB 1OD0A 2WKLA 3A4WA 2G41A 1HIZA 2XIIA 3VVGA 1HL9A 3MMUA 1JL8A 3VGGA 2J77A 2VZTA 2O92A 4EE9A 5HNNA 2G3MA 3B9AA 1R86A 3GTNA 2FHFA 5DT7A 1V6XA 4ZE4A 2YDRA 3UETA 1UZ4A 3EMQA 3SUWA 5FL1A 3POHA 1H5VA 4BZYA 3CIVA 7CGTA 4HOWA 3GBDA 1BF2A 1BVNP 2HVMA 1MW1A 3T0DA 4AZ7A 1WPCA 3WEMA 4C7GA 1GQJA 4X9YA 3BGAA 1M01A 1KGWA 4AWEA 3II1A 1LG2A 4RE3A 1BYCA 4U2ZA 3TTOA 1K9FA 3ZR5A 1UHVA 1ITCA 1WCGA 2C0HA 2XSAA 4P7RA 3ZMRA 4F9JA 3ZO9A 1CDGA 3WF1A 3A6OA 1JFHA 5JUVA 4B9YA 3VGFA 2WWCA 2VCAA 3BAKA 1WDQA 4W7VA 6A3HA 1KR0A 4PMOA 4OBRA 1VRXA 2UWFA 5CQ1A 1CXEA 2X05A 1E5NA 1E4LA 3WDRA 5A1AA 2WMIA 4JFWA 4D6IA 1E6PA 4GQQA 3IK2A 2UY3A 3S6TA 1JNEA 1XD0A 2GDUA 5AC4A 4TUFA 2F61A 4S3JA 3CZGA 4IPLA 5CG0A 1ZBWA 1DWHM 4AEFA 4P8UA 3T2QA 2YBUA 4DWSB 4BCEA 1Q6EA 1HJWA 1K9EA 1J10A 3WH6A 1WDRA 1KCKA 3VIGA 3WQ8A 1LL7A 1KXVA 1UR0A 3MU7A 3IAPA 2DT3A 2E9BA 3GM8A 2EXOA 2J74A 4GZJA 4FLQA 1EDTA 3DYMA 4OBSA 3WH5A 2J4GA 5I0DA 3WEZA 1JYNA 3VPLA 3OGRA 1JG9A 4B3LA 2WLZA 3MUIA 4QLLA 1UYQA 1UR1A 2QMJA 3UG4A 1GORA 3IJ8A 3QOKA 4U33A 3VM7A 3SCSA 1VBRA 4GIAA 3AXIA 4U2YA 4HZ7A 3AMKA 5JBDA 4DM1A 3SCWA 3WEOA 5A6SA 3SCQA 4H8VA 2W62A 2J7EA 2QPSA 2W63A 3GZAA 4L4PA 4P8WA 1E70M 4TX6A 3ARTA 3ZIZA 1C7SA 1E0WA 3L4VA 1KQYA 1TA3B 4MNKA 3IANA 1OGBA 3SCVA 3NJ3A 1E71M 2XVLA 2VMFA 3W25A 5DEZA 3W0KA 1E4NA 1WZMA 1UD8A 4IISA 1QHPA 2XGBA 4D72A 5CSUA 3W24A 1B0IA 2XM1A 4AZBA 1UOKA 1J01A 4ZE5A 1ZBCA 4AY1A 5HXMA 4D6HA 4FLSA 4W87A 1C8QA 1B3ZA 5FD0A 1ZJAA 5A6AA 4TXEA 2J7GA 1FFRA 1GCYA 1FP9A 1PAMA 2FH6A 3CZ8A 1VFMA 4NF7A 3L4TA 1RP8A 2J75A 4J3UA 1HF6A 5AC5A 3PZVA 3SUUA 2IXVA 4YN5A 4AZGA 1C3FA 5E6YA 4V2XA 3AICA 4D6EA 1N82A 3NCOA 1LLOA 5A69A 1I1XA 1K6AA 2NT0A 3L2MA 4B16A 2Y8VA 4W8AA 1DWIM 5C70A 4A4AA 3WF0A 4B9ZA 3WMCA 1NWSA 1IZJA 2ZX7A 2E40A 3WENA 1VB9A 4DWSA 1V3IA 5GNZA 1J0KA 1W3KA 3ARWA 1H1NA 5A6MA 3ARUA 1B1YA 4BS0A 4D1IA 2EPLX 5CLWA 1EDQA 1HJXA 1GOOA 3ZT5A 1JNDA 3RDKA 5I6SA 3TA9A 1GUVA 3AZRA 2A3AA 3ZJ7A 2J62A 2V5CA 3UESA 1UWSA 1WDPA 3I3BA 3F5KA 1JDAA 3DHUA 5EMYA 2XJ7A 3K1DA 4PTVA 2QMKA 4PUDA 1GZJA 3QHOA 4HTYA 4H7VA 3CHCA 1K9TA 3VDAA 4CD5A 4WK9A 1VF8A 1HKIA 2Y4SA 4OKDA 4UFHA 1PZ3A 3L4ZA 4OJYA 3VKKA 2VUYA 2DT0A 4QLJA 4DWSD 2VX7A 1VEPA 4MB1A 1ZU8A 1LL4A 3OLEA 5A8QA 4PEEA 1Q6CA 3WH7A 4ACZB 3I3EA 1DWFM 2ZOXA 1UA3A 2WLYA 2A3HA 5A8NA 2YKKA 2VOTA 3K46A 4HPGA 1VJZA 5M03A 2DDXA 1TA3A 2J7HA 4XB3A 1VAHA 4HMEA 3WBAA 3VIFA 2Y2WA 1OINA 2YJQA 3RM4A 5FOOA 3VMPA 5DO8A 4F79A 3BH4A 1HP5A 3W53A 2PBOA 2VURA 4MNLA 4W5UA 1KGUA 3N13A 1JZ8A 3OZOA 1HX0A 2W61A 4AIUA 4E2OA 1ZBVA 3KL5A 4MB4A 1JXKA 4W8LA 5DT5A 3LPFA 1QNSA 1EOMA 3AIRA 2WMHA 3VILA 2D23A 1UR8A 1A3HA 3ARXA 1MWOA 4Z2GA 1W2PA 3K4AA 3U7VA 4NRRA 3OB8A 1XYZA 1JF6A 1VFFA 3CO4A 4DM2A 1NOUA 2J78A 2WPGA 1NM9A 1RH9A 2YDSA 1E56A 1HVXA 2IXUA 3VD9A 4FK9A 4D6DA 7TAAA 3VDCA 5D9NA 2BVYA 5AYIA 4AD4A 4AZ6A 4D6FA 4OOZA 3M7SA 1OB0A 4X0VA 1TUXA 2OYLA 2VI0A 3PZNA 4LX4A 2WVTA 3MUAA 3A47A 1B3VA 1W3LA 1JYWA 4CN1A 1ISWA 2WNWA 3AMGA 4GO9A 1ITXA 3VOCA 1AVAA 4FLOA 2W66A 2XWEA 3BAXA 3W29A 4LYQA 1GOKA 1OM0A 2GSJA 4PYSA 1W1YA 2DT2A 5TD4A 4MJ4A 1HVQA 3AOFA 3B9EA 3I3DA 4ACYA 2GK1A 3IJ9A 3RIKA 3JUGA 1UR2A 3VGDA 4P7OA 3THDA 3WIJA 1NP2A 3WNOA 1ISZA 4CVWA 1UH2A 2V5DA 1W91A 3VNZA 2J7DA 4UNIA 3QOMA 1GW1A 2CNCA 1Q6DA 3S2CA 1UR9A 1HKJA 3DC0A 1H3GA 5CPTA 3W38A 4UQDA 2E4TA 5EFDA 1E55A 4E4PA 2WWDA 3MUY1 3WD3A 2WKGA 1JI2A 2XTKA 1BSIA 5GNYA 3RM8A 2GDVA 2X8RA 1JZ3A 2XG9A 3SCNA 1UKPA 4M56A 4W86A 3WN6A 4BQ2A 1KXTA 2ZUSA 2BS9A 4PMNA 1NWTA 1ODZA 3BSHA 1MW3A 1V3KA 4JFUA 2GUYA 4HOXA 3TONA 5JIPA 1NH6A 4B3KA 5I78A 2PBGA 4PCTA 3CZLA 2JE8A 4DUXA 1TVPA 5HPOA 4W7WA 3EDFA 3CUGA 1L0PA 2FGLA 3VTRA 4H8HA 2VC9A 1HT6A 3F5LA 3KL3A 1V3MA 3MUZ1 1ISXA 2PWFA 3IAQA 1HP4A 2CKRA 4UFKA 2VZSA 3N9KA 3WQ5A 1PX8A 3CTTA 2D2OA 2JEQA 4ZENA 1KWKA 3K8LA 4LYRA 1E1FA 2PI6A 2OSWA 3BAJA 1PZ2A 1I1WA 5CPSA 3VNYA 1H0GA 5I24A 2JALA 4D6GA 1XYFA 3AHTA 3B9DA 3AROA 2AOSA 4N0RA 4QAWA 4QFUA 4LPCA 2Z1KA 4YPJA 1UWRA 2TAAA 2OSYA 4WJXA 1QBBA 1M7XA 1B3YA 3GNRA 3WNNA 2VNCA 2DH3A 2MANA 1NOWA 4U5IA 1NWUA 3EDDA 1FOBA 2VX6A 1H0IA 5HDRA 1CENA 4ATDA 1E15A 1NP0A 3ALGA 2CPUA 4KGJA 1JD9A 1E4MM 4CVUA 2EPNA 1BYBA 3AMDA 3CGTA 2WSKA 3BLKA 3PZTA 2JFEX 4GI9A 1UR4A 2BVTA 1R87A 2WZEA 3ARVA 6CGTA 4GINA 3AXXA 2DH2A 3GH7A 4JFVA 1JZ6A 3ZSTA 3RPMA 4M80A 2DIJA 5A8OA 1CZ1A 4JKMA 3VIHA 4LYPA 4UR9A 3ARYA 3UR7A 5BXPA 8CGTA 1H4PA 1TE1A 2G8ZA 1C93A 4RL3A 1PIFA 3AIWA 3ZOAA 3AFBA 4P7QA 4MADA 2RGMA 3BAWA 4XZWA 3ZJ8A 4D71A 3VDBA 3KL0A 5I2UA 5BYWA 1LF1A 1V6WA 1AQMA 1LL6A 4W89A 4EKJA 4UOQA 3T2OA 4JHOA 1X6LA 1EHAA 3WL1A 3WL0A 1HXJA 2D0GA 3NDZA 5A95A 2JEPA 1V3LA 2F8QA 2J7CA 1XV8A 4CKQA 1RD6A 4JIEA 2CIPA 3WQ6A 1XCWA 2XVKA 1JI1A 1BYAA 2Y24A 1D3CA 3ZJ6A 4FF5A 1XSKA 5A94A 3DHPA 2WMJA 3SUVA 3AZSA 1V0NA 3LPPA 3WBEA 2XWDA 2E0PA 4PRWA 3ZR6A 5F7UA 3RO8A 4TTUA 1CGVA 1E6NA 5BXRA 1CGUA 2OWCA 3MANA 2YLAA 1WDSA 3KE0A 4V27A 2DSZA 4JCLA 3PZIA 3PTQA 4JL2A 2BY3A 4EANA 1OSEA 4LQ1A 1KWGA 1G0CA 5M5DA 1J0JA 1WB0A 4HU0A 1Q6FA 3CUFA 2G4FA 1SR0A 1NQ6A 3B8SA 1W9VA 1FP8A 3D5HA 2VX5A 3PHAA 1GQKA 4DWSC 4NRSA 3VIKA 3ZQ9A 1DHKA 1KB3A 1QI2A 2D20A 2Z1SA 3AS1A 4K68A 1WAWA 1KBKA 1E43A 1V3HA 3WQWA 3F5JA 3ARPA 1WNOA 4XUYA 1JXJA 1S46A 2GVYA 2ZUWA 4V28A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MNJ A;  1E0X A;  3WNP A;  3FAW A;  3WDH A;  1BGG A;  3CZJ A;  2WMG A;  4RE2 A;  4UQB A;  3GXD A;  1PX4 A;  4J7R A;  3IJ7 A;  4CU7 A;  1G1Y A;  1IV8 A;  4U3C A;  4JFT A;  4TX8 A;  1QNO A;  5BXS A;  1BVZ A;  1HKK A;  1XRV A;  2WVS A;  2PWE A;  3FW6 A;  3LPG A;  1PJ9 A;  3WQ4 A;  3VX1 A;  4YHG A;  4AZI A;  3QHN A;  2XIB A;  4PN2 A;  2WAG A;  2EPM X;  1FH9 A;  4DUW A;  2YL9 A;  4UQA A;  3T08 A;  3VIJ A;  4GI6 A;  4M82 A;  1EQP A;  1VBU A;  2ZX6 A;  5D8W A;  2ZE0 A;  3GXF A;  4TVU A;  2VVN A;  1MFV A;  4PUE A;  1QW8 A;  1KQZ A;  4GZI A;  2XFF A;  2J25 A;  1DWA M;  4H04 A;  5ABH A;  1EA9 C;  3SUS A;  1UH4 A;  3EDE A;  2PWH A;  1ISY A;  2D24 A;  1E3X A;  3CHF A;  4ATW A;  3AQU A;  2EO7 A;  4HPH A;  2ZWZ A;  3N15 A;  1E6Q M;  3VIM A;  4WIW A;  3W28 A;  3DYP A;  3EYP A;  4UCF A;  2WC7 A;  2CER A;  4W85 A;  4OIF A;  3NSN A;  4J28 A;  4PTX A;  4UFL A;  1UD6 A;  3HN3 A;  3LMY A;  1QNQ A;  1BAG A;  1BTC A;  1QHO A;  3VGB A;  3EBV A;  4GZE A;  1LJY A;  2PWD A;  4HOZ A;  4W5Z A;  1OWQ A;  5D9M A;  4UZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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