2ALD | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Crystal structure of human muscle aldolase complexed with fructose 1,6-bisphosphate: mechanistic implications. pubmed rcsb
total genus	138
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1998-10-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2aldA00

2QKFA 4LTSA 1LOLA 2D73A 1FXQA 3FYOA 4O53A 2WO5A 1ZNNA 3LOTA 2A7NA 3G1FA 3P61A 1V7YA 2QJHA 3S1VA 3W1QA 2YCEA 3NGJA 1ZJIA 3GB6A 1PIIA 5DN1A 3W76A 1H60A 4RV8A 3NPWA 4N4PA 3F1QA 3LRMA 3EKLA 3EX6A 2ZTKA 4NNCA 3IIVA 4HNUA 5LNWA 5D03A 3FKRA 1W5NA 3OIXA 2H8XA 1SZEA 3L67A 1XBYA 2C19A 3KAOA 5D05A 4CQAA 3PBVA 2R8WA 2DJXA 4X9SA 2CLMA 4RLIA 4K8HA 4YMZA 5DCBA 3NXFA 2GVJA 1DHPA 1XFBA 1F7BA 3ABQA 1FCBA 3PF3A 4ZL1A 3IRDA 5BMWA 2QUTA 3C2VA 5HULA 3QQ1A 4FNTA 4JTJA 5LSMA 3I7QA 5CPNA 5CZ0A 1XBVA 1IIGA 3TFXA 3DH7A 4QM1A 3ELFA 3FLUA 4A22A 2ZQ0A 1X1OA 1LCOA 2V8ZA 4Z1CA 1FWRA 1W8SA 3UWUA 3E49A 3B03A 1QPQA 3GKAA 5AFDA 2B0MA 4UXDA 5FF4A 2ZZ5A 5HR7A 3A21A 4LVAA 1JR1A 4ONVA 3MI2A 4NXSA 3LHZA 5E1QA 5I3IA 1XL9A 2QJGA 3KRZA 3GR7A 2X2GA 3U8GA 3KOFA 2RH9A 2F7FA 2Y61A 5LGXA 3LCHA 4IUOA 1C8VA 4O1DA 4FNPA 1SO5A 1QOQA 1JUEA 1VS1A 2C15A 3PSVA 3WK2A 3LCXA 3O05A 4LC6A 1R47A 2CW6A 1JCNA 5KZMA 1SU5A 4IGHA 4NVTA 3W2KA 1B57A 1YTKA 1HL2A 4MYXA 3ABSA 4UTUA 2W79A 3S5NA 4GUJA 1R46A 2ZZ6A 3GXNA 5I3KA 3LV6A 3UNDA 4UFIA 1G7VA 3V75A 1IXNA 5AC6A 1TSIA 3CTLA 3W3OA 2YX0A 1BKSA 3QSTA 4AAJA 1UASA 5D02A 3BLEA 3NM3A 4JTTA 3TMLA 1Q6QA 1S3HA 4GRSA 5CPLA 4W9TA 1O5XA 2G96A 5AYYA 1O4UA 3M44A 2WNNA 3YPIA 4HHPA 4Y96A 3B05A 1QDSA 3IEBA 4MUZA 1AK5A 1R2RA 3JS3A 1B4EA 3F4WA 1TPC1 2ZDRA 3QMTA 4N9BA 3NOEA 1QPRA 1PVNA 4POCA 1S5TA 1ZCOA 2G5WA 4JX4A 3T78A 3N2MA 3G0SA 1WYIA 2YYUA 3ATYA 5K9XA 3CPRA 3MUXA 3LBCA 2NV1A 3PUOA 4IMCA 1DJQA 3EB2A 1XUZA 3A5VA 3S5OA 2YGYA 4IXXA 3VE7A 3HG3A 3IVSA 2V2DA 2BSLA 2NZLA 2ZZ2A 1W5QA 4IXHA 2CLKA 1SFJA 4M19A 1IF2A 4AH7A 1KM3A 1OYBA 3C2OA 3G8EA 3MHGA 4GXMA 4XKYA 2GJLA 3FJ6A 2NWRA 3L2IA 4I7VA 5E0KA 1TQXA 3M6YA 1IXQA 1UCWA 3LBMA 3W2JA 3GIYA 4O0ZA 3UXAA 3T4CA 3P60A 1FQ0A 5F2MA 3BW2A 2Y62A 2C18A 4S2CA 4UR7A 4IMDA 1Q6RA 3RF9A 3UZ5A 3N73A 1TB3A 3SZ8A 4H6KA 2NX1A 4JD4A 3W23A 1OF8A 3E0IA 4GC4A 2Q8ZA 1X7FA 2GQ9A 2FQIA 1TPUA 5F2IA 1TQJA 4MYAA 3GLCA 3HPXA 3TKFA 1OFBA 4NNBA 1VYPX 3LTPA 3W1MA 3TSBA 5F1VA 4E2BA 1OYCA 2W6RA 3WJWA 3PG8A 5DCEA 3GX9A 4OWGA 5AHLA 4FX8A 3C61A 1MEWA 3MHFA 2QCDA 2ATMA 3SECA 4RXFA 3UPWA 1GYNA 1SW7A 1AL8A 1H63A 4JTFA 3MJYA 4Q33A 1QWGA 2VFFA 3BK0A 2CLHA 1RV8A 4XWUA 5KZDA 1WX0A 5AHMA 2VXNA 1EB3A 2E6AA 3BGGA 3W70A 2B7QA 1VRDA 4JEQA 2DU2A 5EMUA 3ATZA 3BG3A 1NF0A 4HPJA 3NDOA 3W83A 2X1TA 3CEUA 3W88A 4ML9A 3CM4A 4EF8A 1A5CA 1J2WA 3NQDA 4S2BA 1HUVA 1AW5A 1WA3A 2HTMA 3B8DA 4NJHA 3MW7A 3LXCA 1FDZA 2CLIA 1YPFA 1F2JA 4U4MA 5I3JA 3KHJA 5AN7A 1VHNA 3TC7A 3R5EA 3CC1A 4EOUA 1PL9A 3Q2DA 1EUAA 3I68A 5EKYA 4K38A 4YCOA 4U28A 2CZEA 4YLWA 1Z42A 1G67A 2QAPA 4N6FA 5HINA 3L66A 4KWWA 3W7JA 2Z6JA 4HNTA 2B7PA 2GVLA 3E96A 5HQEA 3GKFA 1RD5A 4O57A 3LXBA 2VELA 3FA5A 3HIJA 5E93A 1PHQA 1KBIA 1G4SA 2VKZG 3ANYA 4FNSA 1IIHA 3H55A 3HG4A 3W7NA 6TIMA 2TPSA 4ORIA 4Z1DA 4UTLA 1G4EA 4AHOA 3G8RA 3DFNA 1GVQA 4QIUA 3UWQA 4R33A 4NJJA 4AEOA 1GT8A 5F2GA 5DBTA 4JIPA 2WPBA 4MJZA 1ONRA 2HS8A 3OVQA 3RK8A 3AJXA 1VZWA 1JCJA 3CQ0A 2CU0A 3THAA 2ABBA 4AMAA 2CZFA 4IQLA 4O28A 3DFSA 2ZRXA 3HOJA 1J4EA 4KFNA 4JR5A 2ISWA 5D09A 1JCYA 1EP1A 5AC8A 3WJYA 4JTSA 1NFBA 4Z0JA 3BW3A 5EA9A 1XBZA 5HUOA 4MZ8A 3ZR4A 5BRBA 3L68A 1NF7A 3BG5A 4WOZA 4LC8A 1JRBA 1W3TA 1OFAA 1KTCA 1LOSA 2JKEA 5F4WA 2YYTA 1L6YA 1S5VA 4K37A 2QJIA 2TMDA 4JIQA 3U6WA 3P5ZA 1TV7A 4OE7A 1OF6A 1XBXA 2H90A 5D38A 5K3VA 1RQBA 3TDFA 1OX5A 1GVFA 4N9DA 4X22A 1WOBA 4MVAA 1N55A 3HPSA 1TPEA 5AYZA 1I2OA 2QUUA 5EBUA 3W84A 3TSDA 4LNYA 1H50A 2YPIA 5LNVA 1ME8A 3NQEA 1G4PA 3ZWSA 4AWUA 2FJKA 4FXSA 4JNMA 1TRDA 2WKJA 3P81A 3TAKA 3EWYA 3LCGA 1NSJA 3G3DA 4CQ8A 4TR9A 4HT3A 3OVRA 4DELA 5C54A 5TBOA 4M6QA 2YFOA 2A7PA 2CLLA 1OK4A 5D32A 4XBSA 1EP3A 3W7PA 4DEFA 1HO4A 2ISSA 4MZYA 3O15A 5CSSA 1TTJA 1NEYA 3PY2A 1TTPA 1ICSA 2FB3A 2H6RA 4M7TA 4JDBA 2W0UA 3G1SA 4TMCA 4HKPA 1EX5A 2A6NA 3G1VA 4FXRA 1TPFA 4O13A 1OFOA 1OX6A 3N9SA 3W7RA 4J9JA 4AXKA 3RLUA 2QCNA 3MMTA 3T7VA 4UTWC 3DHFA 4WD0A 1YXYA 3PB2A 4XBKA 4Y9AA 4O52A 3NQ6A 1Q6LA 3IV3A 4UUIA 3G1YA 4A29A 1TTQA 1OK6A 4O11A 4UTJA 5FF3A 4JS3A 3DU0A 1KLZA 2ZA2A 3D0CA 2NV2A 4Z1AA 1JJKA 2CFFA 4K36A 3QSRA 2OJPA 4NNAA 3BV4A 4UFKA 2X1UA 2QCFA 4N6EA 2X1SA 3PR2A 3W2LA 6ALDA 1I2QA 2WJZA 2FB2A 1IXPA 2Z6IA 1VYRA 3W7KA 3LERA 2QDHA 3LHTA 3DHDA 3G24A 3LDVA 2VFEA 3SIZA 3UXDA 3PULA 3NO5A 5CG7A 4BI7A 3N14A 4LS1A 3T55A 2PE4A 4P2VA 2WSYA 3BVJA 5K4ZA 4QISA 4GFSA 2ZRYA 3B06A 1MZHA 3C3NA 4XZ9A 1Q3NA 3Q37A 4ZQRA 2FIQA 3PWAA 1LRQA 4OBTA 2J9ZA 4ZMGA 3EX3A 3S5YA 2NUWA 3GZ3A 2QAFA 5KINA 3MHUA 4XTIA 3DFOA 1RQHA 5J5DA 3E12A 1WOAA 2VC6A 1HFBA 3EXRA 3NVTA 5LGZA 2H3DA 3JRKA 1DJNA 1A5AA 1AMKA 4B5NA 1KFEA 4UFLA 4GUIA 1JUKA 5K9DA 3P62A 2FPVA 3TK7A 5A8GA 3HBLA 2J9XA 2XN1A 4LT9A 3B0PA 1QNVA 1CW2A 1TMHA 3KX6A 1G6CA 3C4UA 1H5YA 4PFMA 1M5WA 4Z0SA 3RMJA 3W7HA 3PBUA 3T40A 3NQVA 4N9CA 1K02A 1KW1A 1ADOA 1DVJA 3MP3A 2PRHA 4N4QA 1HG3A 1LP6A 3LHYA 2X16A 3GXTA 3L0NA 1KFJA 1QOPA 1A5BA 1QFEA 4H3DA 2DZVA 2P10A 4WZHA 1H1ZA 2WOQA 4TO8A 5AC7A 1FUYA 2BTMA 3CU2A 5EPDA 3EKZA 2QR6A 1XI3A 4WY0B 2OZ0A 1ZALA 3CB8A 1FCVA 5KITA 3L5MA 3TMQA 2KZHA 3M43A 5C55A 3MI3A 1TO3A 3DFQA 3LLFA 5BMXA 3JR2A 4WUIA 4LVDA 1OJXA 1OG0A 1A50A 4JY8A 3OA3A 4LRTA 1WQ5A 5LZLA 2EGZA 1F5ZA 1RZMA 3KRUA 4UMBA 4O50A 4HSNA 2GJNA 4O16A 3PUEA 2NXHA 3N19B 1TREA 3G1HA 4A21A 5EYWA 1W1ZA 3OVPA 4UTIA 4MPQA 1W31A 3N3MA 3DI0A 1U5JA 4R34A 3TXZA 4HIBA 2OT1A 2WNQA 3VFLA 1W3NA 1AW2A 3S8HA 5D2TA 1J5TA 2BWGA 2JGQA 2J88A 2PURA 3EXSA 3DGRA 3HGJA 4XUGA 1G69A 4ZQMA 1L2UA 4ZQPA 2E68A 1GOXA 3W7QA 4IJBA 5D2YA 4K7VA 2Y6ZA 2NLIA 1YTEA 4Y6GA 4UNLA 3W74A 3HB9A 1OFQA 3SGZA 4LV4A 1VCGA 3O06A 3NL3A 1RQEA 3OEXA 2DJLA 2FPYA 2C16A 3NQFA 3W72A 2DP3A 1XDLA 3G0XA 1ZAIA 5G2IA 3O6CA 3TU9A 4FNRA 1LDCA 2R14A 5LHEA 1M6JA 5FEXA 3R89A 1K8XA 3MWAA 3NR0A 3TCEA 5BNKA 1TV5A 4FX6M 2RDWA 1YXDA 4E38A 5T26A 5HUPA 3TQKA 2ZRZA 1I8JA 3FKKA 4UNKA 2O7SA 4FNUA 5GVJA 4LY8A 3GVGA 5D2XA 2E09A 2V5LA 4AF0B 3RU6A 4CNOA 3TV8A 1W0MA 3DXIA 4MFEA 1YDNA 3STGA 4EVZA 3QYQA 3TX9A 4ORMA 1KA9F 2QF7A 3W7GA 2VOMA 1WBJA 1MO0A 3QFEA 2ZZ3A 2G95A 1VPXA 4E2DA 3L0GA 4UTTA 3MP4A 2Y85A 2OT0A 1PCWA 1H7WA 1H7OA 2Y63A 3UPBA 1L9WA 3NNTA 3PG9A 2V2HA 5C5YA 2EPHA 2VEIA 2YW4A 4FIRA 1XC4A 1QPOA 2CZ5A 1X8FA 2C13A 4NJKA 4RCXA 4XKYB 3VNDA 1LZOA 3WK1A 2J6XA 2NX9A 3W86A 4FB7A 3WK0A 2E6DA 3FOKA 5H91A 5L6UA 3A9IA 3TE9A 2GPTA 2FLIA 3NL5A 1Z48A 2IQTA 3KVMA 4KFOA 5F4SA 2TSYA 4LUJA 3EWXA 2YZRA 3TNOA 5C6MA 4FNQA 5CGQA 1I2PA 4JYEA 2AGKA 3W1RA 4C1LA 3LX9A 5KTLA 3G3MA 3DENA 4LS0A 4NX5A 4HSOA 3W1LA 1YTDA 4OT7A 1N8FA 1W3IA 2P1FA 4PH6A 5AHEA 3EX4A 5L9FA 3CT7A 4FO4A 1SW0A 1EP2A 1WAUA 3O07A 3GAKA 1IGSA 4PC8A 4GUGA 4MY9A 3C2RA 1VR6A 3TH6A 5J5RA 2VFGA 4BFAA 1I2NA 2CLFA 4CQ9A 1OX4A 5G2WA 3RNDA 1JCMP 3NEVA 5G1TA 3B0UX 4CLMA 3W2NA 4N9EA 1XKYA 1JVNA 3W87A 2NX3A 4LOCA 1FXPA 3VI2A 4UR8A 3BPWA 2QCDB 2V81A 3CWNA 3EXTA 4IMFA 4DQWA 1SZGA 5IBXC 1GJPA 1T0OA 3IVTA 1N7KA 3NQ7A 3NA8A 1OFPA 1GVRA 1GTEA 3LCLA 2B4GA 1QMLA 4DPQA 1I45A 1OABA 1YDOA 3WFAA 5AHNA 3S5ZA 2B7OA 4JDYA 4RZ4A 3CEPA 5U7SA 3P74A 5LNUA 4E0CA 5BOOA 4UMCA 3WJSA 1WXJA 2Q8LA 2DZXA 2H3BA 4RR4A 3UWVA 3MBFA 4MIMA 3SI9A 1DBTA 3UWYA 2EHHA 1LLWA 4O19A 1HTIA 2ZRWA 1AW1A 4UFJA 4TU1A 2V2CA 1SO6A 3NPVA 1GTHA 3TXVA 5HWMA 1LBMA 4WQ6A 3W07A 1VGAA 3Q58A 5CZJA 5EY5A 4JX6A 3UY8A 1T99A 1GYLA 1XDMA 4ZVJA 4JTHA 3RFAA 1GPWA 2QCMA 3LI0A 4QJ1A 4JICA 1THFD 3NL2A 1KM0A 4JTLA 3HO8A 3W7OA 4AHPA 4G1KA 1DQWA 3BARA 4RZ5A 1LYXA 4Y90A 5BW6A 3OG3A 3C0JA 4MLRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2ALDA

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