2CEQA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with glucoimidazole
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 203
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ceqA00
4RE4A 1TCMA 3WKZA 2CERA 2DGAA 2WPGA 2ZXBA 2MANA 4CU7A 4LX4A 1E9LA 2Q8XA 4M8UA 3WIJA 3GTNA 1WDPA 2DEPA 4W5UA 2YJQA 1KXQA 4D1IA 1OT2A 3AYSA 2NSXA 1QHPA 1QW8A 3ZIZA 3WDRA 4UCFA 1H41A 2VT0A 1EHAA 1QNPA 2UY5A 1NH6A 3WF0A 5KEZA 4OOZA 3SCTA 1MYRA 2UY2A 1JYNA 3ZJ7A 4HMDA 4JL1A 3VM7A 3SEPA 2ZX6A 4FLQA 3DC0A 3T09A 4PTVA 3W82A 4MTVA 2DSUA 4TX8A 5TD4A 4CCDA 4KRUA 3WF2A 4W87A 4C7FA 3GBEA 1FA2A 1DWGM 4JCMA 3AZRA 4IPLA 2QPSA 2BV9A 1W3LA 3VDAA 4JFWA 3DYMA 5A8QA 5I23A 1E6XM 4AZCA 2WMIA 5FL1A 4QLLA 3TTOA 1BFNA 4OIFA 1HKMA 2WVVA 1BSIA 4P7LA 4W85A 1BQCA 4PTMA 3AMGA 4HA3A 3ZOAA 4DWSB 4V27A 3W25A 3CHFA 4MDPA 1FH8A 2OLHA 1HJWA 1HJVA 3SIMA 1PX8A 1OIMA 5A2BA 2OSWA 1HP5A 3WMCA 3SUVA 2GVYA 1ISVA 2BVYA 1UD6A 2WHJA 4W8BA 5ABHA 3ARPA 3BLPX 1CXKA 2EPNA 4P8XA 3CTTA 1WKYA 1PAMA 3W28A 5I78A 1ZJBA 5DMYA 3SCSA 3AOFA 3AFBA 1OCQA 1V0NA 1K9DA 1XD0A 2VO5A 3VM5A 4JAWA 2WM0A 1KGUA 4H8VA 3EMZA 2PF0A 2WC7A 1C90A 1RH9A 2DH2A 1NWTA 1W3KA 4B9ZA 7CGTA 4OOUA 4PN2A 4W8AA 1HL9A 3SCOA 3RCNA 1GZJA 1KWKA 4YPJA 3A4WA 3AHYA 3MV11 1CGWA 3N1AA 4UZUA 2IUZA 1V03A 3WUEA 5A6BD 3U7VA 3AROA 4CD7A 2QV4A 4J3UA 4R27A 3GXFA 4GZEA 2WC3A 2YL5A 2Y2WA 1JZ2A 2DT2A 2E9MA 2WHLA 3SCVA 3AI0A 4WF7A 5LA0A 2XGIA 5CSYA 2J8FA 3MUY1 4WSJA 1QNRA 5DF0A 3VGGA 3PZQA 1X6LA 1Y7VA 1OBAA 1W3JA 2J25A 3VGFA 1H0IA 3PTKA 1ZBVA 2G8ZA 2J79A 3WELA 3MV01 1J11A 1E43A 3VMOA 1QW9A 2CBIA 1HJUA 1US3A 4WKAA 5A8MA 3ZT7A 1Z32X 5EB8A 1QBAA 3AZSA 3GDBA 5CG0A 2JF7A 1W2PA 1JIBA 1HVXA 4W88A 3CHDA 3FAXA 4F8XA 2ZICA 4URIA 4HA1A 3N9KA 1UKOA 3QOMA 2ZIDA 2ZWZA 1KQYA 4PMZA 2VOTA 1HJSA 2EPLX 2EXOA 1V0KA 2X0HA 4W7WA 2XWDA 3AMDA 1XCWA 2QLYA 4AMCA 3FHAA 3FN9A 1UA7A 2ZUWA 1DEDA 2B31A 2XVGA 3DHUA 4MPKA 2J47A 1E0WA 2G41A 2XYLA 4B3LA 2WMKA 4WK9A 1E1EA 2PBGA 3WD2A 1UD3A 2WHKA 2DPEA 4U3AA 1LL7A 1V6WA 3WH7A 1BG9A 4V28A 2J7CA 2ZUVA 1BGGA 1LLOA 2GJXB 2C8NA 1CGTA 5A6BA 4W86A 3RM8A 2J74A 2D22A 2WC4A 3WBEA 2J77A 1ESWA 3GNOA 2V3EA 4X0NA 4PMUA 1JZ7A 2PC8A 1OD0A 2W63A 3CUIA 5D4YA 2WANA 3VDBA 2ZUNA 2WXDM 3ARZA 3PZGA 3W24A 4WIWA 4WJXA 5M17A 2FHFA 2GUYA 3WEZA 2JE8A 3LPFA 3OGRA 1GQJA 2EO7A 1W2VA 5D9PA 1A47A 5FOOA 3POHA 2D23A 1KWGA 4LXFA 4CKQA 1V3JA 1PZ3A 3MKKA 2IXVA 3B8SA 4XB3A 4F9JA 4TUFA 1R85A 1U33A 2W91A 3CGTA 3ARXA 1E5NA 1XH0A 2ZUUA 5ABFA 2WMJA 1LL6A 5CQ1A 3GXMA 1W9PA 3M46A 4GI8A 5A95A 1FH7A 1QVBA 2V3FA 2VX5A 1HN1A 4XZWA 3SUSA 4X0VA 3SUWA 3F5KA 3S2CA 4MNLA 1FP8A 3ALFA 5E09A 4HU0A 3WFLA 3EBVA 1V6UA 2WK2A 1OGGA 3W81A 1V3HA 2X2YA 3ZR5A 2BHZA 1UKQA 5LA1A 1J18A 2EPMX 1E3XA 2ZX7A 2CXGA 3FW6A 2DH3A 2WBGA 4TOQA 2A3EA 4CN4A 1QBBA 1UWIA 2QHAA 2VI0A 4PSPA 2G3IA 2FHCA 3PN8A 2ZWYA 4YHGA 3GBDA 4GO8A 3L4XA 1UH3A 4WSKA 4HPHA 3ZJKA 1E6ZA 1C93A 3CIVA 3QHNA 4JKKA 1GQIA 4NZCA 3K1DA 1SFSA 2DIJA 2YA0A 5IHRA 3OA5A 2AOSA 4ZEPA 2ZUMA 4P7QA 5A6KA 2BVDA 1UD4A 4DUWA 5A6SA 4CD6A 4ZE5A 3BMWA 5JBEA 1E4LA 4GQRA 3OGVA 1US2A 1JFXA 1N82A 2ZUSA 3W37A 3CZGA 4UOJA 1HF6A 2CITA 4W89A 4PYSA 1KXHA 1JDCA 1C3FA 1W9VA 2HVMA 2J7BA 3BC9A 3WQ4A 3I3BA 5ABGA 3WDJA 1QHZA 2GDVA 1B90A 2J8GA 3SUUA 3B9DA 4EE9A 5ECUA 1LG1A 1WAWA 3VIIA 3HN3A 2D0HA 3NSNA 4MB3A 4P7RA 2VRQA 1X1NA 1W1PA 4HZ8A 4BF7A 1ODUA 1R86A 5D9OA 4H8UA 4UQ9A 3T0AA 5BXTA 1MW2A 3EDKA 4E8DA 3VIGA 4PRWA 1V6YA 4D6CA 1EGZA 3RIKA 4MNMA 1CLVA 1E15A 3TTSA 5D9MA 3CUGA 1S46A 3VMPA 4GPNA 4B16A 3M07A 4F79A 1GOQA 1PBGA 1NQ6A 1WPCA 4LGXA 2CBUA 1C7SA 2WBKA 1GONA 2VR5A 1KXTA 3GH5A 4UR9A 4QAWA 5IFTA 1D2KA 3PTMA 4IISA 3A4XA 1J0KA 1QPKA 1B3WA 2V3GA 1I1WA 4ATLA 4J3VA 4OUEA 1IV8A 4KH2A 3GXDA 1ODZA 2WLYA 4M29A 3AJ7A 1E70M 1XH1A 2GJXA 1BYAA 1HKKA 1GORA 1JXKA 4IM4A 4HOXA 4MB5A 2WCSA 3AXXA 3M6DA 4GZJA 4NF7A 1GOMA 3WH6A 1XYZA 2VNCA 1GOIA 5JBDA 1H09A 2BS9A 3O6AA 4BQ2A 2YDSA 1H1NA 3DYOA 1J12A 2E9LA 2E8ZA 1R7AA 3UR8A 1ZU8A 5CJ5A 2OWWA 3IJ9A 3W29A 1D7FA 1NOFA 4FMVA 3PZTA 5A2AA 4JFTA 3WEOA 1B3XA 3RJYA 1VBRA 3CZKA 1W9BM 3FY1A 2IXUA 2XSAA 2EPOA 4ZXLA 4U3CA 2WMHA 1B2YA 1WDSA 3UG4A 4M1RA 5M03A 3WNPA 2JALA 1V02E 2CKRA 1KCKA 3WNKA 4N42A 5A69A 1PX3A 4PMOA 4Q22A 1IZKA 1V3IA 3RDKA 2A3HA 2ZX9A 3IK2A 2XFFA 1JYWA 4YHEA 5A8OA 2A3BA 1VEPA 2ZXDA 3AHZA 1TE1A 1CNVA 3LPPA 4OJYA 5HNNA 2E9BA 1BGAA 3KL3A 4IUGA 4ZENA 3VD7A 5CGTA 1FP9A 2F61A 4WKHA 6CGTA 1BAGA 4HZ6A 3DHPA 2QPUA 2WMGA 5AC5A 2HISA 5I6SA 3QHMA 4KGLA 4CN6A 1FHLA 2WW5A 1KFWA 3ARYA 1VFOA 3WDHA 1XCXA 4JFVA 4AIEA 4TTGA 2XFRA 1B3VA 1JFHA 2WAGA 4ACYA 7TAAA 1UR8A 4CVUA 1NARA 3VU2A 4ACZB 4U33A 1M01A 3GYCA 1E71M 4D6EA 1KBBA 2Z1KA 1CTNA 3T2PA 3VILA 1ISZA 5D9NA 2W92A 4J3TA 1GHRA 4AIOA 5LYRA 1H3GA 1ISWA 5EFDA 3SCPA 2EEXA 2E8YA 5JIPA 4J28A 1E6RA 2NW0A 3W0KA 4D6HA 1J9YA 3AMKA 1W1VA 4KGJA 1UZ1A 1E4MM 3O2LA 2D0GA 2RGLA 3CHEA 4W8LA 2YBUA 1BVNP 2W61A 3T0BA 2YIHA 1V3LA 2V3DA 1EA9C 3W26A 1O7AA 6A3HA 2UY4A 3VDHA 3QGVA 1KGWA 2O92A 1UR1A 2D1ZA 2DSVA 1E0XA 3N18A 4W7UA 3MS8A 2BXYA 3N11A 3EDEA 2X8RA 5BYWA 3VD5A 1DHKA 1E6PA 3BAXA 1FH9A 3I3DA 3OGSA 3BCFA 2BXZA 5E6YA 5FD0A 2BVTA 3WUFA 3VD4A 5JUVA 4N0RA 3TTYA 2PB1A 2CPUA 3LPOA 5A3HA 3FXYA 4AZBA 1G9HA 2CETA 5I3DA 1C8YA 3WH5A 1VIWA 2VZUA 3ZO9A 3A4AA 2FHBA 1WDRA 2CHNA 2VX7A 4JKMA 3W6MA 3ZR6A 2XVLA 5GNXA 1LF1A 2JIEA 1W1YA 3VTRA 1NP0A 3WH9A 4RL3A 2DQXA 2WSKA 4UFKA 1ZBWA 3L2MA 2VTFA 1EQCA 3A47A 3UETA 4B3KA 1EO7A 1HP4A 1LQ0A 5A6MA 3BGAA 3PZNA 1EH9A 2VRKA 3EDFA 4UQEA 1FHDA 2VL4A 2XVPA 3WNLA 4JL2A 1CXFA 1QI5A 1WNOA 5E0CA 3AS0A 1AMYA 1MXGA 3CO4A 1UWTA 3CUFA 1M7XA 3WL0A 1I75A 1TVNA 3AHXA 3VUPA 3ZQ9A 1H49A 4MAVA 2G3NA 3TA9A 3BLKA 3FNDA 4L4PA 4UOZA 3K46A 3HJEA 2E3ZA 2VX4A 1UA3A 2E4TA 2FH8A 4EKJA 5IHSA 1J0ZA 1OIFA 4MB4A 4JCLA 3UESA 2JEPA 2WVUA 1X6NA 4W7VA 4UFIA 4DWSD 1VFFA 4PUDA 1UWQA 5I79A 1K6AA 2X0YA 1CWYA 1C92A 5I2UA 3VDCA 1V02A 3BAIA 1W1TA 1ZJAA 2XFYA 5M3WA 2YOCA 4AZ5A 4EAMA 5DT7A 4D72A 5CLWA 1YHTA 1HT6A 3MU7A 4X9YA 3WNNA 2X05A 4NSBA 1GHSA 1V6XA 3SCNA 5CXPA 5CZKA 3CUJA 5GQBA 1KCLA 2TAAA 4TX6A 1UWSA 1OM0A 5FL0A 3KL0A 1PJ9A 3AQUA 1D3CA 2QF8A 5BXSA 3MUIA 1G0CA 1NP2A 1XSIA 3BAWA 2D3NA 4PTXA 1WZKA 2JF6A 1AVAA 3JUGA 4CCCA 4AIUA 2D2OA 2CYGA 1WZMA 3MO4A 1GPFA 1UR0A 4GI9A 3HU7A 4C7DA 3RM9A 4MDOA 3GNRA 2VZVA 4ML4A 3WBAA 4QCEA 3GNPA 4U2ZA 3VNYA 3AMLA 2V38A 2Z1SA 1CEOA 2GJRA 2WVSA 9CGTA 1UD8A 5EFFA 3RILA 3ZT5A 3VIJA 3N12A 3WD4A 3L4TA 3NYDA 1JZ4A 3VD3A 1E6QM 3SCWA 1UHVA 1MQRA 3WDIA 4TTUA 2UWFA 1TA3B 3M7SA 5I5RA 3K8MA 3DYPA 2YL6A 4OBSA 4H04A 2PI6A 3NSXA 2VCBA 4XV0A 3L4ZA 3ARVA 4CVWA 4DWSA 3K8KA 5BROA 2GDUA 1NM9A 2WLZA 1E4NA 5BRQA 2J7GA 5DFAA 2VZSA 3O9NA 3KWXA 3OG2A 1O6IA 1QI0A 4S3JA 1G94A 5GNYA 1EDGA 3MSDA 1CENA 3BCDA 1OSEA 1SMAA 1E0VA 1J0JA 2C7FA 4Y7EA 1JI1A 1P6WA 1EDQA 1WE5A 2D3LA 3VMNA 5I0DA 2O9OA 2GSJA 1RPKA 2FGLA 2VR4A 2PWEA 1HL8A 4HOZA 1PEZA 4GIAA 1V3MA 3B9EA 5JBFA 3SURA 2BFGA 2D0FA 1UYQA 4HZ7A 1OT1A 1WZAA 2CNCA 2DSZA 3WQ6A 1BF2A 1H11A 3UG5A 5CPSA 1CGYA 4M81A 2XVKA 1WB0A 4CD4A 4NRSA 1LWJA 1V0LA 1VBUA 2XWEA 4TVUA 5A1AA 2DSKA 3W27A 1JG9A 1MWOA 2J75A 4LPCA 3ARUA 4FLRA 1JAKA 3U5UA 2YLLA 3CZ8A 2WZEA 4PMYA 3IAPA 2J7EA 1AQ0A 4GKLA 4E2OA 1LL4A 4AZ7A 1NWRA 3APGA 3AIBA 5GNZA 3WMSA 4DUXA 4OBRA 3UR7A 2PWGA 1CLXA 1PPIA 1E6NA 1MW0A 2W4XA 4AZCB 2WMIB 4BQ3A 3QR3A 4MNJA 3MMUA 2EJ1A 3OLEA 1KB3A 3UCQA 1M53A 3TP4A 2DSWA 4BCEA 5A6JA 2XIBA 2WVVB 4PTWA 4XUYA 5DT5A 3SCUA 4AZ6A 3CHCA 3A6OA 4R5EA 2GK1B 2AMGA 5ABEA 2WYSA 3IJ8A 2J7DA 1KBKA 4AD5A 4CUCA 3GH7A 3L4YA 4FLOA 3II1A 1DWFM 1ZBCA 3LMYA 3WN6A 3ZSSA 8CGTA 5E0FA 3W38A 3WF4A 5F7UA 3PZ9A 1HJQA 2VURA 4NI3A 4CD5A 1H0GA 2DT3A 2VQTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RE4 A;  1TCM A;  3WKZ A;  2CER A;  2DGA A;  2WPG A;  2ZXB A;  2MAN A;  4CU7 A;  4LX4 A;  1E9L A;  2Q8X A;  4M8U A;  3WIJ A;  3GTN A;  1WDP A;  2DEP A;  4W5U A;  2YJQ A;  1KXQ A;  4D1I A;  1OT2 A;  3AYS A;  2NSX A;  1QHP A;  1QW8 A;  3ZIZ A;  3WDR A;  4UCF A;  1H41 A;  2VT0 A;  1EHA A;  1QNP A;  2UY5 A;  1NH6 A;  3WF0 A;  5KEZ A;  4OOZ A;  3SCT A;  1MYR A;  2UY2 A;  1JYN A;  3ZJ7 A;  4HMD A;  4JL1 A;  3VM7 A;  3SEP A;  2ZX6 A;  4FLQ A;  3DC0 A;  3T09 A;  4PTV A;  3W82 A;  4MTV A;  2DSU A;  4TX8 A;  5TD4 A;  4CCD A;  4KRU A;  3WF2 A;  4W87 A;  4C7F A;  3GBE A;  1FA2 A;  1DWG M;  4JCM A;  3AZR A;  4IPL A;  2QPS A;  2BV9 A;  1W3L A;  3VDA A;  4JFW A;  3DYM A;  5A8Q A;  5I23 A;  1E6X M;  4AZC A;  2WMI A;  5FL1 A;  4QLL A;  3TTO A;  1BFN A;  4OIF A;  1HKM A;  2WVV A;  1BSI A;  4P7L A;  4W85 A;  1BQC A;  4PTM A;  3AMG A;  4HA3 A;  3ZOA A;  4DWS B;  4V27 A;  3W25 A;  3CHF A;  4MDP A;  1FH8 A;  2OLH A;  1HJW A;  1HJV A;  3SIM A;  1PX8 A;  1OIM A;  5A2B A;  2OSW A;  1HP5 A;  3WMC A;  3SUV A;  2GVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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