2CEQA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with glucoimidazole
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 203
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ceqA00
4UCFA 3WELA 1EQPA 1LF1A 3ZR5A 3TOPA 3D5HA 3ZJ8A 2V3GA 1X1NA 2E8ZA 3GZAA 2VL4A 3SUTA 3TA9A 3LPGA 5CPTA 1JL8A 4HOXA 3AIVA 1VEOA 4P7QA 1O6IA 3PZGA 1MFUA 1RD6A 2J7CA 3HMCA 3OG2A 4R5EA 1C3FA 3VIGA 4IUGA 3WMSA 1EOKA 1JD7A 4PRWA 3U5UA 3MMWA 2BS9A 2QV4A 2ZXBA 1K9EA 4B16A 2OWCA 3CZEA 4RE3A 3N04A 4TVUA 2VURA 3AICA 2W92A 3L4WA 4Y7EA 2D0FA 2QF8A 1TR1A 4WLCA 4JHZA 3TTYA 3FW6A 4YHEA 1G01A 4E8CA 3AS0A 1HKKA 3FHQA 1KFWA 1JZ2A 1V3KA 1JI2A 4OZOA 1FP8A 2BY0A 3BXWA 1A47A 2CESA 3WBEA 1GPFA 1D7FA 4UNIA 3QHMA 3GH7A 1GQLA 1JXJA 3VIIA 3CBWA 4ZEPA 3VOCA 3BAXA 3VIOA 2V38A 1E5JA 4F79A 3AZSA 3KL3A 1KQZA 4TVDA 1NOFA 3RM4A 4M24A 3WH7A 1UD2A 5D8ZA 4NZCA 2CCRA 1PZ2A 4GPNA 2W63A 5LA1A 1CXLA 1EQCA 3VD5A 4W84A 5JUVA 2D1ZA 5CJ5A 2E4TA 1JAKA 2FGLA 2D3NA 3OLIA 4AZIA 1EXPA 4B3LA 1QNRA 4F9JA 4PSPA 2J75A 2YL8A 1UOKA 5IHRA 3BAJA 1MW1A 4PMQA 5A6JA 3EDDA 4GXPA 1GONA 1BTCA 2VCAA 3ZR6A 2J7GA 2Y8KA 4ZE4A 1W91A 4V27A 1H11A 1US2A 3O6AA 1HKIA 1FH9A 4PEEA 2XG9A 5A8QA 3CZJA 3RDKA 3ARTA 1KWKA 1CGVA 4AD2A 1OT2A 1F4HA 1C8QA 3UERA 4GI6A 1UD3A 1UWQA 1JYNA 3W6LA 4AIEA 1JZ8A 1QI5A 1XSJA 3OLGA 2CETA 4ATWA 3VVGA 3WIJA 1ISZA 1LLOA 4S3JA 1ZL1A 1NP0A 1XCWA 4Q7NA 4HOWA 3WUEA 5A6KA 4E2OA 3WNPA 2VTFA 4LPCA 1W3KA 2X2YA 1ZBWA 4CGTA 3VMPA 4WKHA 1QNOA 3DYMA 1BSIA 3ZT6A 3AFBA 5TD4A 2JALA 1UR4A 1CXFA 3ZT5A 4D6GA 3WD0A 4ACZB 1UR9A 3VINA 1WNOA 2WKGA 4OBSA 3AS3A 4QP0A 1E70M 2ZX9A 1GZJA 1KGUA 5BRPA 3VMOA 2DDXA 4BCEA 1H5VA 3VD3A 3LMYA 3II1A 3W38A 1WDSA 4W85A 3AIRA 3VGFA 1QBBA 1VBUA 3VIJA 4B3KA 1ITCA 1E3XA 2ZXDA 3GNOA 2IXVA 2BXZA 1OINA 4PYSA 2ZUSA 5IFPA 5KEZA 2ZUTA 1QHPA 2ZUVA 1TE1A 2ZX6A 5M03A 3ZQ9A 1C8XA 5A8NA 3O2LA 3WQ5A 1HKJA 3B9EA 4IPNB 2VRKA 2GJRA 2ZOXA 4WIWA 1GOWA 1UD6A 2YKKA 3ZOAA 1AMYA 5DO8A 4EANA 3AIUA 4UQBA 5ECUA 1W32A 4MJ4A 1U2YA 5IHSA 2YLLA 2BY3A 4PMOA 2CBUA 1B3XA 2XYLA 3WDRA 5A8MA 1CWYA 5D9PA 4UFMA 1MQQA 1EDGA 1LL4A 4FLRA 3WD1A 2WANA 2ZICA 2YDRA 1D3CA 4OOUA 2FHFA 1K9TA 3BSGA 4DUWA 2D20A 4XV0A 2XIIA 4CUCA 1Q4NX 1FA2A 4M8UA 2VRQA 3VO0A 1V0MA 1OD8A 1E73M 4BZYA 3T0BA 2ZIDA 3WDIA 1CPUA 3APGA 1KR0A 3ARRA 5M17A 2YL6A 1VBRA 4PTWA 3CHEA 3CO4A 2XFFA 3IANA 4AEFA 2DEPA 5CLTA 4AZHA 3LPPA 3ARWA 4MJ2A 1JDAA 1CGUA 2J7BA 5EB8A 1FFRA 4QDMA 4Z2LA 3N17A 1E4MM 5JBFA 2WC4A 1N82A 2VZUA 1QI0A 4U2YA 5A69A 3PTQA 1E3ZA 2UY2A 3BAIA 3EMQA 4EKJA 1UKSA 4J3WA 4PCTA 1AVAA 1SYTA 3MO4A 2DSVA 1UA3A 1XD1A 2ZXQA 1GHSA 4FK9A 1RP9A 1X6NA 1CDGA 4BQ3A 2XVNA 1PIGA 2D0HA 5FL1A 1HKMA 2CBIA 1B1YA 1PEZA 3WDQA 4FLOA 1R87A 3FHAA 4CD8A 4CN1A 3WFZA 1UD8A 3TTOA 1TCMA 2CXGA 3TP4A 1FHDA 3MUIA 3UETA 3DHUA 5GNYA 2YOCA 2XVLA 4YPJA 4LYPA 4WF7A 5DFAA 1CBGA 1RH9A 4ATLA 3WUFA 4GIAA 2CYGA 4U2ZA 3HN3A 4HMEA 1XGZA 2GDUA 2V5DA 4B9YA 1UR8A 5DMYA 1GORA 3WSUA 4AXNA 4NI3A 1QNQA 4LYRA 1CTNA 1JDDA 4A3HA 2DH2A 2YBTA 4JFSA 5EMYA 4W8LA 2J79A 3F5JA 4NSBA 3FN9A 1V0NA 2VVNA 3BMWA 3UEQA 4ACYA 1OGGA 4W86A 4TOQA 3CZLA 3WD3A 2WBKA 3RO8A 1FOBA 2E9MA 4QLLA 3A47A 4Q22A 4H04A 1UR2A 2EPMX 3VDHA 2WCAA 5D9OA 2W61A 3GXFA 4RE4A 4MNLA 5BRQA 5CXPA 1QI4A 3AMCA 3K8KA 1UH2A 3WBAA 1QVBA 2GFTA 2DT1A 2W66A 4H2CA 1MW2A 1K9FA 1KR1A 3VM7A 2JFEX 1UKTA 3A3HA 2EXOA 6CGTA 4OJYA 4UFLA 1H4PA 1XC6A 3SCRA 2Z1KA 3GDBA 2CBVA 3WNKA 2QHAA 1JAEA 3L4ZA 1XH2A 4JFTA 3WNOA 5JIWA 1UWTA 1JDCA 2WMHA 3BAKA 3SUWA 1KXVA 5E09A 4ZXOA 1UA7A 3BGAA 4AMCA 3BH4A 1H09A 1OWQA 2IUZA 1C92A 1Z32X 1KWGA 3OGSA 1I75A 1O7AA 4H41A 2EEXA 1CGYA 2VC9A 1J01A 2CKRA 1VAHA 2XIBA 1XSIA 2ZUWA 1V3JA 2J4GA 4GO8A 3BAYA 2UWFA 4AD0A 1JNDA 1IZKA 2C0HA 4W7UA 3IAPA 3W53A 2XSBA 3T09A 1CIUA 5A94A 5EFFA 5E70A 4HU8A 1QNSA 2FDMA 3VU2A 1HIZA 4IPLA 1QI2A 1PZ3A 3UG4A 1ZBCA 5CSUA 2Y5EA 4AY1A 1H2JA 3EDEA 1B90A 1J0IA 1GJWA 4GKLA 2BVDA 1W1VA 4JCLA 3NSMA 1NOUA 3SIMA 3CGTA 3ARVA 2D2OA 2EJ1A 1UKQA 1V6VA 1OSEA 1M7XA 1WDQA 4UQAA 1XSKA 2ZUMA 2VZOA 3CUIA 4AZ7A 5HBFA 1K6AA 3CIVA 2X0YA 2ZE0A 3I3BA 3WD2A 1NWUA 4KRTA 1ZS2A 3SCSA 4UQEA 1SR0A 4EAMA 4FLSA 2X05A 2FH8A 3KL0A 4R27A 2ZX8A 3S6TA 3U7VA 4UQCA 3VKKA 3AHZA 3MMUA 2WWDA 1MQRA 3AHTA 2QMKA 1QW8A 1DWAM 4KRUA 5LA0A 2DSZA 4PMRA 1IV8A 5JIPA 4ZXLA 3NDYA 4DWSD 1CXIA 5A6SA 2E40A 4UFIA 4DWSB 2A3HA 1FHLA 1TUXA 3PZ9A 2YA0A 4UQDA 5CG0A 7A3HA 3A4XA 1W9UA 3AS1A 3SCWA 2VNCA 1V6XA 2DSKA 1DP0A 3FAWA 4F9DA 5IDIA 4AZBA 2J25A 3I3DA 3CZ8A 2OSXA 2OSYA 3L4VA 4X0NA 1W2PA 2XFRA 3GM8A 4BQ4A 1V6UA 3SCPA 1Q6FA 4F8XA 2YDQA 3MS8A 3PZUA 1DTUA 1JGIA 1R8LA 3WEZA 1E6PA 3CTTA 4J3SA 3WUGA 3T2OA 3VUPA 3PZIA 1CXEA 3UR8A 1W3HA 4LX4A 3PTMA 4OKDA 2WMIB 3WUBA 2O9PA 1TVNA 3CH9A 5DF0A 4MNJA 4P7OA 1GQIA 1ODZA 5GNZA 1H49A 4TX8A 1JF6A 4MPKA 3W25A 5D4YA 4AISA 2RGLA 1W2VA 1LQ0A 1E9LA 3VIKA 4V2XA 1KB3A 3AIQA 2CERA 3PHAA 1SMAA 3MV11 1YHTA 2RGMA 4ATDA 4IISA 2VQUA 4MNKA 3T08A 3GYCA 1QHZA 4JFWA 1C7SA 1QPKA 1BG9A 1JIBA 3HU7A 1W1TA 1E1EA 3OGRA 2YDSA 2PC8A 5BROA 3WQ4A 4XUYA 1DEDA 1RPKA 1VFMA 1TG7A 4GINA 1NOWA 3N15A 2J7EA 1PJ9A 3POHA 1Q6DA 4AIOA 3VGGA 2QPUA 2CPUA 1NP2A 2XFYA 4QFUA 2DPEA 3QHNA 3N12A 2EPLX 1Q6GA 6A3HA 2GUYA 5CSYA 1HVXA 3GH5A 4BF7A 4AW7A 4IM4A 3QGVA 3EMZA 3EMCA 3AOFA 4XX6A 1U30A 2JEQA 5E0CA 4OBRA 4HZ7A 3VNZA 3WQ6A 1UZ1A 1GHRA 1BVZA 1DWHM 1HX0A 4UOQA 2XSAA 2WC3A 3W4RA 1V03A 4J3XA 4URIA 2MANA 2PWGA 1V3IA 2ZUNA 4UTFA 1EGZA 4JFUA 3TTSA 4C7GA 3SUUA 3DHPA 4QAWA 5EBAA 1J0JA 1BFNA 2X09A 1WO2A 4FMVA 2A3AA 2WB5A 4LQ1A 1QNPA 1JYVA 1EHAA 4NRSA 4U33A 2WPGA 1J0YA 1LL6A 2XWEA 1V02A 4ZENA 3ZJKA 1E1FA 1K9DA 4JIEA 5I2UA 3ECQA 5BXSA 4PTVA 2WHKA 2WVVB 5D8WA 2PF0A 3K46A 2VX6A 3RM9A 4KMQA 2JIEA 3SCNA 1E0WA 3W24A 3BLPX 2CEQA 4PCSA 3B8SA 5A2CA 5AC5A 3QOKA 4JKMA 1BGAA 1EIBA 2JF7A 1XV8A 2E9LA 2BY1A 3L4TA 5FIPA 3W27A 1BGGA 2YA1A 4LXFA 2XVPA 3WL0A 1TA3B 3VD4A 5I24A 3T2PA 1D2KA 3VGEA 1HVQA 4PMYA 2PBOA 3AYSA 3K1DA 2G4FA 1OB0A 2F2HA 3TTQA 1E0VA 2WM0A 5HDRA 4AZCB 2J77A 3OGVA 1WP6A 1XD0A 5HPCA 1HXJA 3TONA 1W1YA 1OD0A 4D6IA 2Y24A 4MTVA 5CGMA 5IFTA 4HU0A 5LA2A 1JZ4A 1DWFM 3BCDA 4H8VA 3ZT7A 1UHVA 4WKFA 3W81A 3IJ7A 3UG3A 1C8YA 4H8HA 2CITA 4CN6A 1OT1A 2OWXA 3THCA 4M82A 4JZ5A 3VDAA 2G3NA 3WH8A 4W5UA 1NQ6A 2J8FA 4Z2JA 4Z2KA 4MNMA 3DC0A 3GH4A 2ZWZA 2A3EA 4CN4A 1VENA 3ARXA 2VOTA 1F4AA 2VCCA 4NF7A 2W91A 3GXDA 2GK1A 2G3IA 3CMJA 1BLIA 2WHJA 4WJXA 3ZO9A 5A6MA 4JFVA 3BAWA 4QCFA 1TFVA 2GJXA 3GBDA 2NT0A 1UH3A 4ZFMA 1GJUA 1XHGA 4U5IA 2VZSA 1VRXA 2X0HA 1R7AA 1JZ5A 1LG1A 4AIUA 3RCNA 2E3ZA 4KH2A 5ABHA 4L4OA 1MW0A 3PBGA 1JZ7A 1J11A 2J47A 4F66A 1MWOA 5BXPA 5ABFA 5ABEA 4V28A 5LYRA 1W9XA 2VMFA 5A6BD 1J0ZA 1CYGA 1CENA 3WNMA 1RP8A 4U5KA 1WCGA 3T0AA 5DEZA 2JE8A 1GOIA 2JF6A 1CLVA 1BHGA 2WZEA 2YA2A 1ZJBA 3L2MA 3NIYA 5I6SA 1ESWA 2WMKA 1C90A 2BY2A 3QOMA 5BWFA 1J0KA 1MYRA 2QLYA 4FF5A 1KXQA 4P7LA 2IXUA 3SCVA 2NT1A 3K4DA 4JAWA 4PTMA 3WQVA 3OIHA 3QR3A 1VJSA 3VNYA 1KXHA 3ARPA 4CU7A 3F5KA 1LWHA 1XH1A 3T2QA 1XYFA 4N42A 4GI8A 2XGBA 1E6RA 5IXEA 1TVPA 2E8YA 5AC4A 5BXRA 5I5RA 1OCQA 1ZBVA 1H1NA 3ARYA 1HJQA 1QBAA 1KXTA 2E9BA 3LPFA 4TX6A 2FHBA 1KBBA 3BLKA 1BAGA 2XVKA 4AWEA 3IJ8A 3U57A 3AIEA 3G6MA 3VGBA 1CECA 4QCEA 3PZOA 2B31A 1V0KA 1VFOA 2VT0A 3HJEA 4GZEA 4U3AA 5ABGA 5DT5A 3WMCA 2WLYA 4J3TA 1G1YA 2AAAA 4CU6A 1DWGM 2WVSA 3FY1A 3PN8A 5CPQA 1E56A 2ZWYA 9CGTA 1CXKA 2BV9A 2CHOA 2DIJA 1WB0A 5JBDA 3M07A 1WZAA 2TAAA 3CLWA 4W8AA 1WAWA 4YN5A 2VRJA 2J62A 1PAMA 1E4IA 3WH9A 4PTXA 1EDTA 1E43A 1P6WA 4WSJA 3ZMRA 2G41A 1G5AA 1B3ZA 4D6FA 3W6MA 1UWSA 3MANA 5CQ1A 5A2AA 1PBGA 1B9ZA 3GTNA 4HTYA 3WFLA 4D72A 1HL8A 1EH9A 5A6AA 4W93A 5DT7A 3VDBA 4MDPA 4HZ6A 4MADA 3AMDA 3AZTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UCF A;  3WEL A;  1EQP A;  1LF1 A;  3ZR5 A;  3TOP A;  3D5H A;  3ZJ8 A;  2V3G A;  1X1N A;  2E8Z A;  3GZA A;  2VL4 A;  3SUT A;  3TA9 A;  3LPG A;  5CPT A;  1JL8 A;  4HOX A;  3AIV A;  1VEO A;  4P7Q A;  1O6I A;  3PZG A;  1MFU A;  1RD6 A;  2J7C A;  3HMC A;  3OG2 A;  4R5E A;  1C3F A;  3VIG A;  4IUG A;  3WMS A;  1EOK A;  1JD7 A;  4PRW A;  3U5U A;  3MMW A;  2BS9 A;  2QV4 A;  2ZXB A;  1K9E A;  4B16 A;  2OWC A;  3CZE A;  4RE3 A;  3N04 A;  4TVU A;  2VUR A;  3AIC A;  2W92 A;  3L4W A;  4Y7E A;  2D0F A;  2QF8 A;  1TR1 A;  4WLC A;  4JHZ A;  3TTY A;  3FW6 A;  4YHE A;  1G01 A;  4E8C A;  3AS0 A;  1HKK A;  3FHQ A;  1KFW A;  1JZ2 A;  1V3K A;  1JI2 A;  4OZO A;  1FP8 A;  2BY0 A;  3BXW A;  1A47 A;  2CES A;  3WBE A;  1GPF A;  1D7F A;  4UNI A;  3QHM A;  3GH7 A;  1GQL A;  1JXJ A;  3VII A;  3CBW A;  4ZEP A;  3VOC A;  3BAX A;  3VIO A;  2V38 A;  1E5J A;  4F79 A;  3AZS A;  3KL3 A;  1KQZ A;  4TVD A;  1NOF A;  3RM4 A;  4M24 A;  3WH7 A;  1UD2 A;  5D8Z A;  4NZC A;  2CCR A;  1PZ2 A;  4GPN A;  2W63 A;  5LA1 A;  1CXL A;  1EQC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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