2CERA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with phenethyl-substituted glucoimidazole
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cerA00
1V6XA 2ZUWA 2GJXB 5I6SA 3UESA 3VIKA 2E8YA 1CLVA 4U5IA 3VU2A 2D1ZA 3AYRA 5HNNA 1WO2A 3SUWA 3GNRA 5I2UA 2V3GA 4JFUA 4A3HA 3WDJA 2EQDA 3SCUA 1H0GA 1E0WA 4W8AA 4L4PA 5CGTA 1UG6A 1GNXA 1EO7A 4TXEA 4CU7A 4D6JA 5A6AA 5CGMA 2VNCA 3WH6A 4UFJA 2C8NA 3AS2A 3VGFA 4TX8A 3ZSTA 1XYZA 5ABFB 1JD7A 1WCGA 4JIEA 5A2CA 1U33A 2E4TA 1GOQA 4P7LA 3WUFA 2Y5EA 2WAGA 3EBVA 2VVSA 5CPQA 4NRSA 3K8KA 3KE0A 4AEFA 4AIEA 1WZKA 3K8LA 4MADA 2FHCA 3AJ7A 1DWAM 1BLIA 4IPLA 3ZR5A 2JF6A 1WE5A 4RE4A 4MB4A 1NOWA 4MJ2A 3O2LA 2D20A 1RP9A 2V3EA 3VD7A 2CEQA 2VOTA 2XTKA 2Y24A 3AIQA 4W85A 1KXVA 3OLDA 3A3HA 5CLTA 3VIFA 2G3NA 4ZEPA 1QBBA 1CBGA 3WKZA 1V6YA 2BVDA 1QW8A 2NW0A 3WUGA 3AROA 4LGXA 3GH5A 2PI6A 1V02A 1JF5A 1UKSA 2DSKA 1GVIA 2VRQA 3AIBA 4X0NA 5BRQA 4BQ4A 2A3BA 4PCSA 2ZUMA 3NSXA 5GNYA 4Q22A 3MMDA 2CKRA 2XFFA 1E73M 2W66A 1HX0A 4M8UA 2CETA 3WEOA 1J0ZA 1UD5A 2XGBA 1MQQA 5HPCA 3CZGA 3EDEA 1XRVA 3VIMA 1E56A 2ZXDA 3OBAA 4KRUA 3L2LA 3AZRA 3S6TA 1WAWA 3AFBA 3PZ9A 1WZMA 3AI0A 3NIYA 3BSGA 3AS0A 3WBAA 3GH7A 1ODUA 1OIFA 1TCMA 5A6LA 1QNOA 1CGXA 1GZJA 2CNCA 4ZENA 4UNIA 4J28A 2CERA 1MYRA 3PBGA 1XSJA 3WDHA 5A6SA 3AZSA 1HXJA 3UCQA 1H4PA 1LWJA 3U5UA 1VENA 4X0VA 2OLHA 4BF7A 3MV11 2WCAA 1G9HA 2WZEA 3M7SA 3OA5A 3K4AA 5ABEA 1U2YA 3QOMA 4MDOA 2VURA 1E4NA 1XSIA 2O9PA 4LYRA 2NT1A 5FL0A 4XX6A 1B3YA 3F5KA 5CJ5A 2HVMA 4PRWA 4PMUA 3RO8A 1UZ4A 2J77A 1J10A 1K9DA 3APGA 1OT1A 1EXPA 3WNNA 4AXNA 3CBWA 5C70A 1MXGA 4TTGA 3WQ8A 4E4PA 2E9LA 1UWRA 1RD6A 1J0IA 1JF6A 3QHOA 2E9MA 5EFFA 3L4YA 1IT0A 1Q6DA 4P7RA 3CHEA 3MV01 3BAWA 4UQEA 3WQWA 2FDMA 2DIEA 3BH4A 3MANA 4UFKA 7TAAA 3DYMA 1GUVA 3ECQA 1ISVA 4PMQA 3ZR6A 4AZ5A 4BQ5A 2JIWA 4GZIA 3NSMA 1CYGA 2JF7A 4B9ZA 3GNOA 3HU7A 3WNKA 5JBDA 3WNMA 2IXUA 1HJSA 4W84A 1JXKA 1KGUA 1HJQA 1ZS2A 4QCEA 2ZICA 4CN6A 5D8ZA 4AD4A 3GZAA 3VMNA 4OIFA 2WVUA 1B3XA 3U7VA 3GXIA 1B3VA 4IUGA 4MNKA 1DWIM 2X2YA 4JFSA 4GQQA 3WD4A 3W38A 1XYFA 2Y4SA 4PMXA 1AMYA 4JFTA 1BQCA 4XZWA 3VGGA 5HBFA 5M03A 1G94A 3GBDA 1GHSA 3IAQA 4QDMA 1PBGA 5CSUA 1HP5A 3QHNA 2YDQA 5D9OA 1MW3A 4CD8A 2CHOA 3W27A 4CUCA 2WZHA 4PN2A 2FHFA 3ZMRA 1KWKA 3OGSA 5BXPA 4HA1A 1NWRA 1XGZA 1G1YA 5FKYA 2CBIA 1O7AA 4AIOA 1CGWA 1QHZA 1CECA 2GDVA 2EXOA 1IZJA 1FP8A 4R5EA 1C7SA 2GK1A 1I75A 1R87A 4C7DA 3DYPA 4H8VA 2JIEA 3AQUA 4ATWA 1B3ZA 1MW0A 1UQYA 2OYKA 5E09A 2YLAA 2EEXA 3JUGA 4TVDA 1B1YA 1SMAA 1E6ZA 3NSNA 2WMFA 4V28A 4X9YA 1VFOA 1J0HA 4TVUA 1M04A 2WVTA 3A4WA 1BPLB 2PBOA 3WF1A 5E0CA 3UG3A 2VRKA 5DFAA 1Q6CA 1HKKA 1XH1A 1ZJBA 1QI0A 5CSYA 1XH0A 1ZBKA 2VQTA 2E9BA 4LYQA 3TOPA 4HMCA 3VOCA 2VX5A 2Y8VA 3AHTA 1VRXA 4AEEA 2W63A 2XVPA 4RE3A 1HL8A 4AZ7A 4W87A 5D9MA 4CD6A 1GQLA 1M01A 3SCWA 3GM8A 3MU7A 1W9UA 5M17A 5FOOA 4H8UA 1JFHA 1KBKA 1B3WA 3FAWA 3G6LA 1MW2A 2GK1B 1V6VA 4ACZB 5A2BA 3W28A 3FNDA 1FFRA 1UHVA 4IM4A 4AYSA 1CXKA 4HA3A 2BY0A 4P8WA 3I3DA 3T0AA 5A6JA 2CXGA 3GXDA 5A8MA 4PTVA 5A8PA 1M53A 3ARXA 3T2OA 4GQRA 2TAAA 1H2JA 1I1WA 1QVBA 1HN1A 2E8ZA 3WY1A 3SCSA 4AMCA 4MJ4A 1PZ3A 2W5FA 1LL7A 4MDPA 2UY5A 1UR9A 3M46A 4WIWA 4AD5A 1C8XA 2VX6A 1E1FA 2DT3A 1AQHA 2UY3A 3J7HA 2G41A 4JHZA 4AD1A 3IJ9A 1X6NA 4M24A 3OLGA 2FH6A 4JZ5A 1UWQA 1K9FA 3IK2A 1U30A 3CZJA 4PUDA 4KMQA 1Y7VA 4LX4A 1DWGM 1R7OA 1TVPA 4D6IA 5GNZA 3WD1A 3ZT6A 2VR5A 1UKTA 2VZTA 4AZIA 1TVNA 2F2HA 3BAXA 5JBEA 3IJ8A 1ODZA 4E8CA 1J01A 4DUWA 1PX4A 4QAWA 4OUEA 3WNOA 1MFUA 3CHFA 3AMCA 3WF2A 2A3HA 4GI6A 1VEPA 4UFIA 2BHYA 3FHAA 4GKLA 1CEOA 2X0HA 1DHKA 3CUGA 4B15A 3ZIZA 1NP2A 2XGIA 1BF2A 3I3BA 1BYDA 2JALA 2YL5A 1CGVA 2W61A 2NT0A 1ISZA 3W24A 4HU0A 4DM1A 4WSKA 1HP4A 1W9VA 3LPFA 4P7OA 3VD9A 1KGXA 3BC9A 4WSJA 2BHZA 2AOSA 2XYLA 3G6MA 4GPNA 4BA0A 1W1PA 1V3LA 4HOXA 1IV8A 4GZJA 4WKAA 4CU6A 5IFTA 1Q6EA 1MQPA 2WC3A 4J3SA 1TG7A 1K6AA 3A47A 3PZMA 1OINA 3OZPA 2J74A 3QGVA 3VGDA 1ZB5A 2CYGA 2OWWA 1GOIA 3VO0A 1J12A 4CVWA 2XVLA 5I5RA 1GORA 4GO9A 2AAAA 1C8QA 4AWEA 4KGLA 3CO4A 1EDQA 1XV8A 1IZKA 1VEOA 4BQ3A 2VJXA 3EYPA 2ZE0A 1FOBA 1K9TA 1V0LA 1KXTA 3SIMA 4PMDA 3B9AA 3SCOA 1HF6A 2G4FA 4EAMA 1UR1A 2YDSA 1NWUA 1KCLA 1HJWA 4YN5A 2A3AA 1KB3A 3FY1A 1SR0A 1W9BM 2WM0A 4AD3A 2J7DA 2EPNA 4CCCA 1LLOA 3OGVA 4QLKA 1E15A 1HKJA 3AMKA 2PWHA 3AOFA 1V3HA 1LG1A 3WQ5A 4EK7A 3FHQA 1B30A 1KCKA 1SYTA 3CTTA 3KEHA 2O9OA 2VQUA 5FCZA 2VI0A 3SCNA 1PJ9A 4J3XA 4H8HA 3B9EA 4LPCA 2OSXA 3NDYA 5TD4A 4OBRA 3S2CA 3VIPA 1WPCA 1H09A 4UQAA 3LPGA 2Y2WA 5A2AA 5E70A 3AIRA 3TTYA 2ZX6A 2O92A 1YQ2A 1FP9A 4PMNA 3FAXA 3SCRA 5BCAA 3N15A 3AXXA 5EFDA 2IUZA 2WXDM 5A3HA 3ARWA 2X8RA 1FH7A 1JZ3A 1RH9A 2J7FA 4CD7A 2QMKA 1BAGA 3OLEA 3ALFA 2OYLA 3L4XA 4GXPA 1V3JA 2XG9A 1JAEA 4CVUA 4YPJA 2J7EA 1E43A 1VAHA 4YHEA 1R86A 2NSXA 3RM8A 1O6IA 2ZUSA 1CGUA 4J3TA 7A3HA 2Z1KA 3VDHA 4W88A 1E3ZA 1SMDA 2WZIA 3B9DA 3AXHA 2ZXQA 2VCCA 3GYCA 4DM2A 3WBEA 1RPKA 1NH6A 3EMZA 4W8BA 1JZ6A 3CHDA 4XV0A 2ZWYA 1Z32X 1P6WA 1WKYA 2VMFA 1GQIA 4B3LA 2G3IA 1JDDA 5CZKA 3CUIA 2AMGA 3AIWA 5HDRA 4AD2A 1R8LA 4LQ1A 3AYSA 1XSKA 4TVCA 4JFVA 3THDA 1F4HA 4HZ7A 3GXFA 2WW5A 3F5JA 3A4XA 1SFSA 3N04A 5CPSA 1C90A 5HPOA 4D6DA 2WMHA 3AICA 2EBNA 3W6MA 2ZUNA 3T08A 1CIUA 4F8XA 1AVAA 1VEMA 3VIIA 1JNDA 5E0FA 1GOOA 5BROA 1QI3A 4M81A 4ZE4A 1W1TA 4J7RA 1Q4NX 1V6WA 4U3AA 3N13A 2VZUA 3CZ8A 3K1DA 1FH9A 3GXMA 1JG9A 1OIMA 3VX0A 4JL2A 4P7NA 3CUHA 4D6FA 1E5JA 5DT7A 3GDBA 1EOMA 3TTOA 1BG4A 5KEZA 4B9YA 4ZE5A 3F4VA 4W5UA 1EQPA 3VD3A 3NDZA 3ZJ8A 5BYWA 1ECEA 3ALGA 3O9NA 4P8VA 2CITA 4Z2GA 5JBFA 1OWQA 1VFMA 4AW7A 1XHGA 3WMCA 4FLSA 3L4WA 4PTMA 1VJZA 2J78A 2WLYA 2YDRA 4AISA 4JKMA 1CZ1A 1MXDA 2PBGA 2QF8A 1B90A 1PIGA 3GNPA 3I3EA 2ZUVA 2XJ7A 2DH3A 5D4YA 5DEZA 3SUTA 5GQBA 3FXYA 2DEPA 4OOUA 4XB3A 3IAPA 3MMWA 3KWXA 4GI9A 1VBRA 4KWUA 1E4IA 4H2CA 4UFLA 3A4AA 1ZBVA 4GZEA 3ZJ7A 4FLOA 3DHPA 5A6BD 3N17A 4TTUA 1E9LA 4HPHA 2QV4A 2WC4A 1XCWA 5JIPA 2VZOA 4JHOA 3QOKA 4U5KA 1GOWA 3BMVA 2RGMA 1DEDA 1PZ2A 1N82A 2V38A 5GPRA 2D2OA 1UH3A 3WNPA 2D0HA 3AMGA 1J18A 5M3WA 2XUCA 1JDCA 3BCDA 4OKDA 4UQCA 3WFLA 4WF7A 1PIFA 1UD6A 3WH7A 4RL3A 3ZJKA 3VDCA 3WD2A 3CPUA 2VTFA 8CGTA 1ZU8A 3D3AA 1E0VA 3EDJA 1UOKA 3SCTA 3PZUA 1LJYA 3ARRA 4ACYA 4KGJA 3TP4A 2D3LA 4PMYA 4UOJA 2YOCA 1W1YA 1UA3A 5BXRA 3WSUA 1OGSA 1Q6FA 3NUKA 4KH2A 3EMCA 4GI8A 5FIPA 2XWDA 3WUEA 1GJWA 3WL1A 6TAAA 1UD4A 4PMVA 4TOQA 3BLKA 1X1NA 1A3HA 2PWFA 2QLYA 4JKKA 3PTQA 1I1XA 3BGAA 1FHLA 4JL1A 4JAWA 4UQDA 1HIZA 2YL6A 3AISA 1EIBA 3ARZA 3AS1A 1NOUA 1QHOA 1AQ0A 4P8UA 1EA9C 3SUVA 3GTNA 1DTUA 1XD1A 5A8NA 4HMEA 3AS3A 2ZX8A 2E3ZA 4PMZA 3EDFA 4M82A 1VBUA 2ESCA 1E6PA 1W3LA 3CZLA 1BHGA 1NARA 1DWJM 2ZX9A 2D3NA 4IPNB 4OOZA 4YHGA 3MUY1 2ZUTA 2WMIA 5JUVA 2D24A 3L4TA 3F5LA 4C7GA 3NJ3A 1QNPA 6A3HA 2EPKX 3VKKA 1LWHA 4QFUA 4BS0A 2FGZA 1E70M 2CCRA 1VIWA 2MANA 7CGTA 3CMGA 3PZVA 2DSZA 4CN4A 1VF8A 1GJUA 1W9XA 5EBAA 3BAYA 1JD9A 3PZOA 2WNWA 1TFVA 4V27A 3OLIA 4AY1A 1QNQA 1EHNA 2J7BA 3WDPP 4Z2IA 4BCEA 3FN9A 4R27A 1H0IA 1JXJA 3BAJA 2YIHA 1BG9A 3SCPA 4PUEA 1H11A 3BSHA 1CGTA 2VCAA 3RJXA 1KXQA 5DMYA 4HZ8A 3RILA 3VGBA 1ZJAA 3DYOA 3W82A 5JIWA 2O9RA 3CZKA 2CBVA 2YA0A 2VX7A 5CG0A 1V3KA 4GINA 5D9NA 1CXIA 3WF3A 2JEPA 4QLLA 2V3FA 3BXWA 3VMOA 2CPUA 4Z2KA 4HOZA 2WMIB 3EMQA 2WVSA 3PZGA 5A6KA 1M03A 1QW9A 1GONA 3QHMA 5A8OA 3ZSSA 5E6ZA 2J8FA 1CLXA 2OSYA 3CIVA 3KZSA 2BVTA 4UR9A 1TE1A 3W53A 3MS8A 2WCGA 1L8NA 4K68A 4NF7A 3TTSA 3CUFA 4W7VA 2XHYA 2A3CA 2DT1A 4CCEA 3PZIA 1JYXA 4XUYA 3VD4A 4MNLA 2D23A 5C71A 2VZSA 4GIAA 5I24A 3RJYA 3WH8A 2YA2A 3MO4A 1ITXA 3BLPX 3WMBA 1LL4A 1EH9A 1H41A 1NWSA 3WDIA 4MAZA 4DWSD 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V6X A;  2ZUW A;  2GJX B;  5I6S A;  3UES A;  3VIK A;  2E8Y A;  1CLV A;  4U5I A;  3VU2 A;  2D1Z A;  3AYR A;  5HNN A;  1WO2 A;  3SUW A;  3GNR A;  5I2U A;  2V3G A;  4JFU A;  4A3H A;  3WDJ A;  2EQD A;  3SCU A;  1H0G A;  1E0W A;  4W8A A;  4L4P A;  5CGT A;  1UG6 A;  1GNX A;  1EO7 A;  4TXE A;  4CU7 A;  4D6J A;  5A6A A;  5CGM A;  2VNC A;  3WH6 A;  4UFJ A;  2C8N A;  3AS2 A;  3VGF A;  4TX8 A;  3ZST A;  1XYZ A;  5ABF B;  1JD7 A;  1WCG A;  4JIE A;  5A2C A;  1U33 A;  2E4T A;  1GOQ A;  4P7L A;  3WUF A;  2Y5E A;  2WAG A;  3EBV A;  2VVS A;  5CPQ A;  4NRS A;  3K8K A;  3KE0 A;  4AEF A;  4AIE A;  1WZK A;  3K8L A;  4MAD A;  2FHC A;  3AJ7 A;  1DWA M;  1BLI A;  4IPL A;  3ZR5 A;  2JF6 A;  1WE5 A;  4RE4 A;  4MB4 A;  1NOW A;  4MJ2 A;  3O2L A;  2D20 A;  1RP9 A;  2V3E A;  3VD7 A;  2CEQ A;  2VOT A;  2XTK A;  2Y24 A;  3AIQ A;  4W85 A;  1KXV A;  3OLD A;  3A3H A;  5CLT A;  3VIF A;  2G3N A;  4ZEP A;  1QBB A;  1CBG A;  3WKZ A;  1V6Y A;  2BVD A;  1QW8 A;  2NW0 A;  3WUG A;  3ARO A;  4LGX A;  3GH5 A;  2PI6 A;  1V02 A;  1JF5 A;  1UKS A;  2DSK A;  1GVI A;  2VRQ A;  3AIB A;  4X0N A;  5BRQ A;  4BQ4 A;  2A3B A;  4PCS A;  2ZUM A;  3NSX A;  5GNY A;  4Q22 A;  3MMD A;  2CKR A;  2XFF A;  1E73 M;  2W66 A;  1HX0 A;  4M8U A;  2CET A;  3WEO A;  1J0Z A;  1UD5 A;  2XGB A;  1MQQ A;  5HPC A;  3CZG A;  3EDE A;  1XRV A;  3VIM A;  1E56 A;  2ZXD A;  3OBA A;  4KRU A;  3L2L A;  3AZR A;  3S6T A;  1WAW A;  3AFB A;  3PZ9 A;  1WZM A;  3AI0 A;  3NIY A;  3BSG A;  3AS0 A;  3WBA A;  3GH7 A;  1ODU A;  1OIF A;  1TCM A;  5A6L A;  1QNO A;  1CGX A;  1GZJ A;  2CNC A;  4ZEN A;  4UNI A;  4J28 A;  2CER A;  1MYR A;  3PBG A;  1XSJ A;  3WDH A;  5A6S A;  3AZS A;  1HXJ A;  3UCQ A;  1H4P A;  1LWJ A;  3U5U A;  1VEN A;  4X0V A;  2OLH A;  4BF7 A;  3MV1 1;  2WCA A;  1G9H A;  2WZE A;  3M7S A;  3OA5 A;  3K4A A;  5ABE A;  1U2Y A;  3QOM A;  4MDO A;  2VUR A;  1E4N A;  1XSI A;  2O9P A;  4LYR A;  2NT1 A;  5FL0 A;  4XX6 A;  1B3Y A;  3F5K A;  5CJ5 A;  2HVM A;  4PRW A;  4PMU A;  3RO8 A;  1UZ4 A;  2J77 A;  1J10 A;  1K9D A;  3APG A;  1OT1 A;  1EXP A;  3WNN A;  4AXN A;  3CBW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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