2CIPA

Structure of the michaelis complex of a family 26 lichenase
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
276
structure length
273
Chain Sequence
SGLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAQFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Substrate Distortion by a Lichenase Highlights the Different Conformational Itineraries Harnessed by Related Glycoside Hydrolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 110
structure length 273
sequence length 276
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cipA00
1C7SA 1W9UA 1WDQA 5FKYA 1YQ2A 1RD6A 1WB0A 5FL0A 1WO2A 1M53A 4GXPA 3AZTA 4HU0A 1V3LA 1QNSA 3CLWA 2QPUA 5EFFA 2E0PA 3OZOA 4E2OA 4U33A 3AMKA 3POHA 4PTWA 1A47A 4J3VA 4WKHA 4Q7NA 4PMOA 2PBOA 4QCEA 3BMVA 5FL1A 3VU2A 3UEQA 1XH2A 1G9HA 1CXIA 3GH7A 4XZBA 3BAWA 5F7UA 1HKIA 5BXPA 2CBUA 2V5DA 2YDSA 5CJ5A 2VURA 5DO8A 4ZE4A 1LWHA 3RDKA 3BH4A 3PZIA 2ZUNA 3WDPP 3AS3A 3W24A 2GFTA 2YBUA 4U5KA 4PSPA 2WMKA 3AJ7A 5AY7A 3WEMA 2BXZA 2G3IA 3EMQA 2W63A 4MDOA 1CIUA 1JFXA 1GUVA 1F4HA 5AC4A 3RM9A 3NDYA 3OGSA 3VDHA 5CGTA 3SUUA 4HPGA 4HOWA 3EBVA 1K9FA 2E3ZA 5CZKA 2OSWA 3O9NA 2RGLA 3F4VA 1J12A 1K9DA 1QNRA 1ZBWA 2VRKA 4C7DA 2Y5EA 1V3JA 1DWHM 2J25A 2O9RA 3PZQA 1E3XA 4H7VA 3UG4A 1AVAA 2WMIB 1VB9A 2XGIA 3FAWA 2VRQA 1NQ6A 2Y24A 2BHZA 2J4GA 3BAYA 4JCMA 4AEEA 3K4DA 2VCCA 4HTYA 3WF3A 6A3HA 3SCVA 1BQCA 4ACZA 4DWSD 1Q6FA 3NSNA 1PBGA 4QFUA 3VMNA 5CQ1A 3TP4A 2FHFA 1FHDA 2BY1A 3OIHA 2PWGA 4GI6A 5BXRA 3WBAA 4AY1A 2WVSA 2DSUA 3SUSA 3QHNA 4MTVA 1HKMA 3ZJ8A 1BLIA 3JUGA 1EIBA 1E70M 4DWSA 1E43A 3WELA 5GNZA 2WVVA 3WDIA 4W5UA 5I77A 3AMGA 1UR2A 1X6NA 5A8QA 5LA1A 3N13A 4DUVA 2E9LA 3VUPA 3FXYA 2ZUWA 4OIFA 1XH1A 1P6WA 5TD4A 3CMGA 4EANA 3BLPX 2A3AA 2BS9A 3THDA 4J3TA 3RJYA 1KXQA 2VUYA 1CENA 2QMJA 1JXJA 1E0XA 1GHSA 2OLHA 5HDRA 4EAMA 1MW1A 3CO4A 1XC6A 2X8RA 4CN6A 2E40A 3HN3A 1ISWA 1FP9A 1XD1A 1ITCA 2C7FA 3WF1A 2BV9A 2UY4A 4UQAA 3UESA 3UG5A 3QHOA 5HBFA 2J8GA 3GNRA 2GDUA 1MW2A 1CXKA 3ARZA 8CGTA 1E56A 2WMFA 1KGXA 3UG3A 2XG9A 5E0CA 2OWWA 4PMNA 5CLTA 4OJYA 4J3XA 1SFSA 3B9AA 1E6SM 1UQZA 1E40A 1HKJA 2J47A 3E1F1 3W27A 3EDJA 1JZ4A 1QNPA 4EE9A 1J0JA 1Q6EA 3WQVA 2CKSA 4UQBA 1ISZA 3SCPA 4UNIA 1RPKA 3BSGA 1J11A 1OGGA 3MO4A 2W61A 2XJ7A 4BQ3A 3TTYA 1K9TA 3W0KA 2XYLA 1JI2A 1ITXA 3WBEA 4H41A 3N17A 4WKFA 1BHGA 3PZNA 1EDGA 1C7TA 1UD2A 3WMBA 4GI8A 2NSXA 5GPRA 3CZ8A 4W8BA 3OLDA 1JAKA 2NT0A 3IK2A 5GNXA 1V3IA 4AEFA 1V0NA 2GJXB 4P8UA 5KZ6A 4D71A 1VJZA 3LPFA 4PMDA 2J75A 3SCWA 4UOZA 2IXUA 2XHYA 5LA2A 2EPMX 1JFHA 3W81A 5JBEA 2WC4A 3GTNA 1WZMA 1VIWA 3AROA 2CESA 1R85A 4M29A 4UQ9A 1ZBKA 1UQYA 2NW0A 1JAEA 5A6KA 2PWHA 4AMCA 2VTFA 8A3HA 1GVIA 3T09A 1VENA 3OZPA 3EMCA 4QLJA 3U7VA 4J3SA 1UYQA 4R27A 3KL3A 3KEHA 4W8LA 1WDPA 5BXTA 5A6AA 3T0AA 2WWDA 2XIBA 3NDZA 1Q6DA 4UCFA 3K1DA 1B0IA 4ZXLA 1WNOA 2DT3A 2J78A 4UZUA 4AISA 2ZXQA 5EB8A 5D9PA 4MB4A 1W3KA 4UZSA 3T2QA 1BYDA 1NOUA 2QHAA 2GUYA 5LYRA 4KMQA 3BXWA 1IZKA 3PTMA 1B3ZA 1J0ZA 4P8VA 4X0NA 3G6LA 4D1JA 2DSZA 2E9MA 3GYCA 4FLSA 3WQ8A 4V28A 1EO7A 2Y4SA 3MV11 3MUIA 3VNZA 4AD4A 1BGGA 5JIPA 3AHYA 2DSVA 3MSGA 5D9NA 3CUFA 1CXFA 1LQ0A 3ALFA 1UR0A 3EMZA 4N42A 4R5EA 1KXTA 1V6WA 1VBRA 2XWDA 1NWTA 4KRUA 2X05A 1PPIA 3AS0A 1V0MA 1JZ7A 2WWCA 4P7LA 3CUGA 4BF7A 4PCTA 3T2PA 2G4FA 2DSKA 1TA3A 2XM2A 1J0IA 3SCQA 1FFRA 4ATLA 4K68A 1I1WA 3K46A 1IV8A 2HVMA 1UR9A 1OSEA 1E4NA 4E8CA 2YBTA 1C3FA 2OYMA 1E6XM 4WIWA 1K9EA 2HISA 4L4PA 1LL4A 1PJ9A 1WDSA 4BQ5A 1AMYA 3GXDA 4MNMA 1LG1A 5BYWA 3BCDA 3PZVA 4AXNA 3AIUA 4DUWA 1OD8A 4GKLA 1GNXA 4QLKA 2WYSA 3CBWA 1GZJA 3AMCA 3QGVA 1UD6A 3UR7A 3ZOAA 3D5HA 5CGMA 4M56A 1NOFA 1H0GA 1JYXA 5HXMA 4QCFA 4D6HA 3GM8A 2V3DA 4AZIA 5BRPA 4P7RA 3WDHA 2VRJA 1FH7A 2YKKA 2C0HA 5EMYA 1DWGM 2CCRA 2ZXAA 2J79A 1W1YA 1GOWA 3NJ3A 7A3HA 4JCLA 3F5KA 2WCSA 4LXFA 3QOKA 2VT0A 5M03A 5GNYA 3HMCA 1H41A 1ODZA 2F8QA 3WH5A 1W1PA 5D9MA 3AYRA 3VKKA 1OINA 3ZSSA 5E09A 1HP4A 2ZICA 4PMUA 3AIQA 1W9VA 4RE4A 4CGTA 1A3HA 5M3WA 1UWUA 2FHCA 3RILA 2V38A 3PZOA 1GHRA 2EPLX 2WCGA 1E0VA 3ZT5A 3IAQA 3PZ9A 3PBGA 5A2AA 1E6QM 2EBNA 3BC9A 4HZ6A 3THCA 1C8QA 1QI2A 1MQPA 1GQJA 5M17A 2D3NA 2XM1A 1HVXA 3BAXA 3CUIA 1E72M 1N82A 3ZT6A 4AC1X 4OKDA 1W2PA 4CD5A 3CHDA 4B15A 1HXJA 3AHXA 1CECA 4CKQA 5ABFB 2VNCA 3KWXA 1H09A 2D24A 1B30A 3RJXA 1JG9A 4B9YA 4HOZA 3VIHA 4OUEA 1GCYA 2XFRA 3DHUA 1DWAM 2W92A 2WK2A 4CD7A 4IISA 4Y7EA 5FIPA 4AIOA 2BY3A 2DH3A 4AZ5A 3GH5A 4ML4A 2VX7A 2RGMA 1DWIM 1W1VA 3VMPA 1CXLA 2ZUVA 2DGAA 4TXEA 2GSJA 2BY0A 5EBAA 2GJPA 1C91A 2PWEA 1H1NA 4J28A 2CYGA 4BCEA 1V3MA 1BGAA 2JEPA 3AIBA 2WC7A 1ZS2A 2JFEX 3BAJA 4IUGA 4UFMA 3NYDA 4NRSA 5BROA 2WNWA 1X1NA 4PTVA 1U2YA 3WNPA 1JYNA 4JIEA 1C8YA 3MMDA 4AW7A 3AI0A 1NARA 4PBGA 2FGZA 3ZMRA 4AYSA 2YL6A 2A3HA 2DSWA 2DH2A 3W25A 5I79A 2BHYA 3I3EA 1E0WA 1HJVA 1B3VA 3AISA 3WMSA 4RE3A 3KZSA 4PCSA 3WENA 3ARUA 1E4MM 4PMXA 2WMHA 3SCNA 1JZ2A 4YHGA 1VJSA 1FH8A 3MANA 5DFAA 4GQRA 5IHSA 1XCXA 1NM9A 3VDBA 3CGTA 3AMDA 4L4OA 1HP5A 3DYOA 2DPEA 5JBFA 5JBDA 1OIMA 1HL8A 1W3JA 3KL0A 3WNLA 4Z2GA 4X0VA 1UD8A 5ABHA 1H11A 3CZKA 3CHEA 1HT6A 3F5LA 3CIVA 3WQ5A 3L4UA 2ESCA 1EOMA 1WE5A 1TCMA 4OBSA 4CD4A 2OYLA 4NZCA 1WCGA 1U33A 2WLZA 4NI3A 1C90A 4AD3A 1KXHA 4GI9A 2XUCA 4D72A 4WF7A 3AIVA 2WMJA 1PX4A 5A3HA 4W7UA 3AHZA 4GO8A 4ZE5A 5BRQA 1BTCA 1WAWA 1HVQA 5A8MA 1VF8A 1E4LA 1MQRA 3M6DA 3ARWA 3W28A 3WN6A 3K4AA 4DWSC 4AD2A 1G5AA 5FOOA 4UOQA 1KWGA 1B1YA 1UR4A 1GOIA 2A3CA 1B3WA 4LX4A 3VIPA 3IJ7A 4KGLA 4FF5A 3GNOA 1QNOA 3VM7A 4QAWA 1XSIA 4HMDA 4KGJA 4DUXA 1M04A 3CHFA 4WJXA 1ZU8A 2A3EA 3AYSA 3BSHA 3N18A 3SCTA 5JUVA 2D3LA 1XCWA 3VIKA 3ZQ9A 1UUQA 3VGFA 3HJEA 3WEZA 1M7XA 1DHKA 3WF0A 4TOQA 4U31A 4MJ4A 1ZBVA 1C8XA 2MANA 2XVLA 4HMCA 4UOJA 4W84A 1GOOA 2WKGA 1V02E 4UQEA 4XZWA 3S2CA 3ECQA 2VVSA 4PUEA 1UWRA 3GBDA 2FGLA 2TAAA 1XRVA 1OBAA 1ESWA 2V5CA 1VRXA 1MFVA 3B9DA 3WDJA 3BLKA 3OLEA 4B3KA 3I3BA 2ZXDA 1JZ8A 1OGSA 4OOZA 3U5UA 3EDKA 2JALA 2X0HA 3FHQA 2Y8KA 1JIBA 1BYCA 1TFVA 2V3GA 3VINA 4EK7A 4JFSA 5DT7A 3WQ6A 5CXPA 3WNNA 1GQIA 3FY1A 4W85A 5DT5A 1QW8A 1L0PA 3AXHA 3A4AA 1QVBA 3WDQA 2WXDM 1UH3A 4CN4A 3DECA 1X6LA 4RE2A 4AZGA 3PHAA 1E55A 4KH2A 4BQ2A 3T08A 3WFZA 5I24A 4U3AA 4J3UA 4M1RA 4PMVA 2VO5A 2PB1A 1JGIA 4MADA 3ZIZA 4JFVA 5C8BB 3SUTA 4FLQA 4ATWA 2GK1B 4W8AA 1PIFA 3BAKA 2ZUTA 1CGUA 2WHLA 4V27A 3MKKA 1G0CA 1E1EA 1UKOA 4CD8A 5IDIA 4GZIA 3W26A 4W7VA 2W66A 1LLOA 2PI6A 2ZX6A 3CZLA 3W38A 2CPUA 2DIJA 1BPLB 3VX0A 4BQ4A 2XVNA 1OIFA 3NSMA 2YL8A 2E9BA 3PTKA 2WHKA 2VMFA 1CLXA 5IHRA 1EO5A 3QOMA 1B31A 4EKJA 1JYWA 2WZEA 2OSXA 4JKLA 5A6BD 1E9LA 1YHTA 2XGBA 1NWRA 1XHGA 4JKMA 3GXFA 2ZX7A 3WD1A 4TTGA 3RO8A 2VL4A 4MNKA 4GZEA 1TVNA 2VCBA 1ZJAA 4X9YA 4U5IA 4ZXOA 1KXVA 1KQYA 1E5NA 1JXKA 5BXSA 1BYBA 1OB0A 3WNKA 1CBGA 5A6SA 4GO9A 4H04A 5A6BA 4YN5A 3A4WA 1PX8A 4A3YA 2FHBA 4PTXA 3VIFA 1LL7A 5D4YA 3VIJA 1I75A 4BA0A 2D20A 1GJWA 1CGWA 3J7HA 3WD4A 5ABFA 4Z2HA 5KEZA 4OBRA 2WMGA 3EDEA 1SR0A 3GZAA 1JL8A 3VM5A 3II1A 2EEXA 3IAPA 4Q22A 1JF6A 1JZ6A 5A1AA 4TVDA 5HPCA 5E9AA 3A4XA 4GZJA 2EO7A 1BYAA 4FMVA 5IFTA 3AICA 3VIGA 1TZ7A 1QBBA 3VGEA 3CZEA 1J0YA 1ODUA 3AOFA 1EQCA 2CHNA 2YLLA 1BF2A 3B8SA 4WLCA 1ZBCA 3U5YA 1BSIA 4PMZA 6TAAA 5I3DA 1ZL1A 2DT0A 1GQLA 4WSJA 2VX6A 2WBGA 3SCOA 1E15A 4WSKA 4D6EA 2VX5A 4JKKA 2EPOA 1V6XA 2BHUA 4BZYA 5A8OA 4AD0A 3T2OA 1J0HA 1KB3A 1CGXA 4IPLA 3RPMA 4HA3A 2J7HA 4MJ2A 2J74A 3LPGA 5E6YA 1EA9C 1XH0A 2CHOA 3WDRA 1V08A 6CGTA 2WZHA 3N11A 1XYZA 2XWEA 1SMDA 3VGGA 2WCAA 1WP6A 5LA0A 3OB8A 1QPKA 2V3EA 4XB3A 3WL1A 2VR4A 1R87A 5I6SA 1AQMA 1NWSA 3ZSTA 1MYRA 2VVNA 5ABEA 4AD1A 2Z1KA 3CUHA 1BAGA 5CPQA 1XGZA 5A2BA 3GH4A 1LL6A 1V02A 1KR0A 1GPFA 5CPSA 4PUDA 3AHVA 4DWSB 2PC8A 2WVVB 1ISXA 5E6ZA 4D6GA 1GOQA 3UCQA 2J62A 3RM8A 5C70A 3ZM8A 1B9ZA 1CGTA 2Y8VA 1VEOA 4JZ5A 1TE1A 4NF7A 4H8UA 1VEMA 4DM1A 1QHOA 4Z2LA 3AIWA 2YL5A 3WNOA 3VOCA 3ARTA 5D8WA 2XSBA 3M46A 4GQQA 1B3XA 1ISYA 3WY1A 4AZHA 5HPOA 1CEOA 3POCA 1HN1A 4AZ7A 3SUWA 1CTNA 1R7OA 4URIA 2VCAA 5D9OA 2ZE0A 4Z2IA 3CHCA 3T0DA 4AWEA 3L4XA 1RP9A 3ZJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1C7S A;  1W9U A;  1WDQ A;  5FKY A;  1YQ2 A;  1RD6 A;  1WB0 A;  5FL0 A;  1WO2 A;  1M53 A;  4GXP A;  3AZT A;  4HU0 A;  1V3L A;  1QNS A;  3CLW A;  2QPU A;  5EFF A;  2E0P A;  3OZO A;  4E2O A;  4U33 A;  3AMK A;  3POH A;  4PTW A;  1A47 A;  4J3V A;  4WKH A;  4Q7N A;  4PMO A;  2PBO A;  4QCE A;  3BMV A;  5FL1 A;  3VU2 A;  3UEQ A;  1XH2 A;  1G9H A;  1CXI A;  3GH7 A;  4XZB A;  3BAW A;  5F7U A;  1HKI A;  5BXP A;  2CBU A;  2V5D A;  2YDS A;  5CJ5 A;  2VUR A;  5DO8 A;  4ZE4 A;  1LWH A;  3RDK A;  3BH4 A;  3PZI A;  2ZUN A;  3WDP P;  3AS3 A;  3W24 A;  2GFT A;  2YBU A;  4U5K A;  4PSP A;  2WMK A;  3AJ7 A;  5AY7 A;  3WEM A;  2BXZ A;  2G3I A;  3EMQ A;  2W63 A;  4MDO A;  1CIU A;  1JFX A;  1GUV A;  1F4H A;  5AC4 A;  3RM9 A;  3NDY A;  3OGS A;  3VDH A;  5CGT A;  3SUU A;  4HPG A;  4HOW A;  3EBV A;  1K9F A;  2E3Z A;  5CZK A;  2OSW A;  3O9N A;  2RGL A;  3F4V A;  1J12 A;  1K9D A;  1QNR A;  1ZBW A;  2VRK A;  4C7D A;  2Y5E A;  1V3J A;  1DWH M;  2J25 A;  2O9R A;  3PZQ A;  1E3X A;  4H7V A;  3UG4 A;  1AVA A;  2WMI B;  1VB9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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