2CITA

Structure of the covalent intermediate of a family 26 lichenase
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
LKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHAANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Substrate Distortion by a Lichenase Highlights the Different Conformational Itineraries Harnessed by Related Glycoside Hydrolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 113
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2citA00
1G1YA 1HJVA 3POCA 1XSIA 1PIGA 2CEQA 3G6MA 4GZEA 1X1NA 1FH9A 3QOMA 2YJQA 5DT7A 4WKAA 1EOKA 4HTYA 4J3VA 3OLGA 3SCQA 5HXMA 3KZSA 5A6BD 1UKPA 2WHLA 4CN1A 1H49A 4UQAA 1C8QA 3WDIA 3MMDA 7CGTA 1LF1A 2O92A 3DECA 4P8WA 1GONA 1UKTA 4N0RA 4K68A 1B1YA 4W7WA 1H41A 1W9PA 3GBEA 2W66A 1EHNA 3AHXA 1V0NA 4CU7A 2Y24A 3ZM8A 4UFHA 4DUXA 2VZTA 3T0AA 3BC9A 1HJUA 4MDPA 3OGSA 1VB9A 3VD9A 1HF6A 1B2YA 3B8SA 3GDBA 5LA0A 1V3JA 1I1XA 1B3YA 1GZJA 3L4VA 2J7HA 4BQ4A 2WSPA 4NRRA 2VZOA 1JFHA 2CBIA 4NRSA 1GPFA 4UQBA 1EQPA 4PMUA 1E0WA 1V6WA 3GH7A 4AYSA 1NP2A 1LG1A 3IJ8A 3WIJA 4JKLA 4HMCA 2PBOA 1GNXA 2F8QA 4A3YA 3BLPX 3CUHA 1C7SA 2BY3A 2UY2A 5JBEA 1WZKA 1Q6GA 1B3WA 5IXEA 4AC1X 1NARA 2V3GA 1RP9A 4IPLA 3A4XA 2YDRA 4B3KA 3SUTA 4CCCA 4H8VA 2G3IA 3SCWA 4U3CA 1H11A 3S2CA 4A3HA 3WH6A 3NDZA 2Y2WA 5I78A 4W88A 5EFFA 1C93A 2VCAA 1BYAA 3CZJA 2DT1A 3KL3A 4JFSA 3AXXA 1U33A 2WW5A 3K4DA 1WO2A 3AHZA 1E6ZA 3EDEA 4IISA 3SCSA 1B3XA 1EQCA 3A4WA 2YDQA 1VAHA 2GJXB 2WCSA 1ISYA 2J8GA 4OOUA 3IJ9A 4CCEA 1J9YA 1E1EA 4UNIA 5M5DA 4DM2A 1FH7A 1FP9A 3MUAA 2ZX8A 1OSEA 5I23A 2JEPA 2ZUUA 1UHVA 1WAWA 3W26A 1GJUA 3CLWA 5IDIA 1CTNA 1OT2A 1CWYA 2DGAA 4UFLA 2E40A 2WVUA 3ARRA 2Y8KA 2AMGA 2J7BA 4D1IA 4H04A 1CGUA 1K9DA 4H2CA 4AEFA 2WSKA 3GM8A 3ARVA 3AS0A 3TP4A 4HA3A 4MADA 2EO7A 1PIFA 5JBFA 2W62A 4KGLA 1KGXA 2XVLA 4U5KA 2WMKA 4PMZA 1UYQA 4DWSD 3IJ7A 1MXDA 1XHGA 3WUBA 5LYRA 2WXDM 3BSHA 4JCLA 3F4VA 1BG9A 4AIUA 1UR2A 3GBDA 4YHEA 1JZ4A 1X6LA 4Z2IA 3MSDA 4LYRA 1LJYA 4F9JA 2WCGA 3LPGA 1LQ0A 2X0YA 1N82A 4EK7A 2PF0A 1HJWA 5A95A 4M81A 4CD5A 3U5UA 1AVAA 3M7SA 1DHKA 1VF8A 4P8VA 3AYRA 4CVWA 1EO5A 1ECEA 2GFTA 1WPCA 3SUWA 2VZVA 1UD8A 4JHZA 1Q6FA 1D3CA 2CPUA 3NCOA 3EDDA 3GNRA 2GVYA 2J77A 2WLZA 3PZTA 1XYFA 2UY4A 4AD4A 4PTWA 4FK9A 2OYKA 3PBGA 1H0GA 4JL2A 2YLAA 4NZCA 2BHUA 4D6GA 4PTMA 2J7EA 1QI5A 2CHNA 4AISA 4GPNA 2J7DA 2HVMA 1R87A 4J3XA 2A3AA 2XFRA 1V6VA 2BY1A 1HNYA 3CZEA 2X09A 5D9OA 4CU8A 1PX3A 3L4XA 3MO4A 1E6RA 2XVNA 2ZXAA 3WNNA 3NDYA 4AD5A 3PZGA 1FA2A 1OD8A 4AZCB 2GDUA 4RE2A 3QOKA 2WMJA 2YOCA 3B9DA 2BNJA 3GH5A 5DEZA 4D6FA 2C0HA 2ZXQA 3VD5A 3TTYA 6TAAA 3AMDA 3UR7A 1GHRA 4P8XA 1ODUA 1JXJA 2Q8XA 1KWKA 3AROA 4QLKA 2GJRA 1CLXA 1XD0A 2PBGA 3ARWA 4E8CA 2QPUA 1NWSA 3WH9A 2G3NA 5ABFB 3QGVA 3AS1A 3BAIA 2VI0A 3A6OA 2W5FA 4CCDA 1QNSA 2CIPA 2YA1A 2OSYA 1HT6A 2J25A 4GIAA 4AD2A 2RGLA 3WF4A 8A3HA 1BTCA 4OUEA 5JIWA 2XIBA 2V38A 2E8YA 3T2QA 3AIUA 3ZMRA 1G01A 5C8BB 5HBFA 1TA3B 1LL4A 4WSJA 1LWHA 3AIRA 3W27A 1V0KA 5D9MA 4AD3A 3BAKA 1UWSA 3FAXA 3AI0A 4FF5A 1VRXA 4WKHA 4D6JA 5FD0A 2J7GA 4QLJA 1AQ0A 2VT0A 4D72A 3TTSA 4D6CA 2WHKA 3LPOA 1E5NA 3CUJA 9CGTA 2BVDA 1EGZA 1E6PA 4KRTA 2XIIA 2VQUA 1V6UA 4AIOA 3VIJA 1ESWA 5A2CA 3CUGA 5A2AA 3FY1A 3K8MA 4QP0A 3AICA 1KCLA 1ISWA 3CHDA 5ECUA 1ISZA 1GJWA 4YN5A 2J74A 4MTVA 3CZLA 2FH6A 1E6QM 2XFFA 1HL9A 1UZ4A 1MW0A 1OGGA 5HPOA 5FKYA 3SCTA 1QW9A 3AHVA 1HXJA 1JAKA 2XSAA 2GJPA 2DSKA 1TFVA 4PMYA 3VOCA 2W67A 1JDDA 2VO5A 2XYLA 1GQKA 1JXKA 1JZ6A 2MANA 1MXGA 5E6YA 4FMVA 1VFOA 2DT3A 1J0HA 1ISXA 5BWFA 1O7AA 2O9OA 3WEOA 2W92A 4M1RA 1H2JA 2Z1KA 3UCQA 5ABEA 5CJ5A 4FLSA 1UKOA 2F61A 1V02A 1W9XA 3EBVA 3CO4A 2IUZA 1WDSA 1MQRA 4P7OA 4YPJA 4W87A 2VZSA 1ZJAA 2D20A 3M46A 3A3HA 2OSWA 1NM9A 4RE3A 3ARQA 3VD7A 3IANA 4BQ3A 5C71A 4ATDA 1E4IA 1FOBA 3WQ4A 2YBTA 2XWEA 4X9YA 1M7XA 2ZUWA 4H41A 4MB5A 2OYLA 3VILA 3KL0A 3F5KA 1XH2A 1QHZA 5C70A 4HA1A 2ZUSA 4PMRA 4BCEA 3W6LA 3DHPA 1UKQA 1MQPA 3WD4A 3AMGA 1MWOA 2CHOA 3BMWA 3L4TA 4P7NA 3QHMA 3RM8A 1GCYA 2E9LA 2QF8A 1UWTA 3GNPA 4TVUA 2GJXA 1YHTA 4MB3A 4DUVA 3RJYA 3ZJKA 1E3ZA 2EPMX 2W61A 2G41A 4PMDA 1NWUA 3J7HA 3D5HA 1QI4A 2NT0A 5TD4A 1D7FA 5A3HA 3PZIA 3A4AA 4S3KA 1B3ZA 4UTFA 6CGTA 2WMFA 5AC4A 1FFQA 4U33A 1QI3A 5CQ1A 4PEEA 2WPGA 1KQZA 3PHAA 4C7DA 4AZ6A 1G9HA 4FLRA 2WVVB 1NQ6A 4ZE4A 1M04A 2EPLX 5E09A 1EDGA 1EIBA 1OINA 1QHOA 1F4HA 1JYNA 3WMBA 2FGZA 1W9DM 1UD4A 4F79A 1FFRA 2VTFA 4D71A 3N11A 1KBBA 4NF7A 5A1AA 1BVNP 3ZJ8A 2PWFA 3POHA 1NOWA 1QBAA 4H7VA 4DM1A 2W4XA 3ZT5A 2EXOA 2NT1A 1Z32X 2O9PA 4JFWA 1HL8A 1TVNA 2VMFA 1JF6A 3VGBA 2WVTA 4F9DA 1Q6DA 3BAJA 4EKJA 1WKYA 3GTNA 1ZS2A 4W5ZA 1UR8A 1XD1A 4PCSA 3VVGA 2EEXA 1HVQA 4J3SA 1PX4A 4D6EA 2V3DA 3FAWA 4MNKA 1L8NA 1W91A 1MQQA 4W89A 4AEEA 3ZO9A 3T09A 3WL0A 1XV8A 3BAYA 5AY7A 3CZKA 2D3NA 1E73M 1FH8A 4UQ9A 4KH2A 3W24A 4AZ7A 1HP5A 3QR3A 2B31A 2PWGA 3VD4A 3WH7A 4MJ2A 1WDRA 1JD9A 3VIFA 1XSKA 3VO0A 1E56A 4TOQA 2XWDA 4CD6A 5BROA 2DIJA 4TVCA 2YLLA 4ZENA 4M82A 3F5LA 1ZJBA 4PUEA 5KEZA 1W3HA 2XGIA 4S3JA 2D0HA 1E9LA 3I3BA 4ZFMA 5GNXA 2WMIB 1KBKA 4JHOA 3N13A 4QFUA 1UR1A 3PTQA 3N18A 4HPHA 1KWGA 1Q4NX 1NWTA 1GOQA 1XYZA 3AZRA 1J12A 1JNDA 2XHYA 5I6SA 4B15A 4UOJA 3SCUA 2D2OA 4EANA 4OIFA 2ZWYA 1W2VA 1G94A 4U3AA 1HVXA 3N17A 2WLYA 7A3HA 1UWUA 2E4TA 2D0GA 1PJ9A 3WMCA 5ABFA 3MUY1 4HZ6A 1V0LA 3OLDA 3CH9A 3PZQA 1TCMA 4M80A 4GQRA 4JZ5A 1DWAM 2WCAA 1P6WA 1ZB5A 3F5JA 1EA9C 1QBBA 3WN6A 1ITCA 1JAEA 1TA3A 4B9YA 2WHMA 3W81A 2CBJA 4WIWA 5BCAA 4OBSA 1JIBA 3T0BA 5IFTA 5FIPA 1UA3A 3ALFA 3MU7A 1BGGA 2GUYA 1J0ZA 2XJ7A 1PPIA 4M56A 3ZR6A 2VOTA 4ZE5A 1QOXA 3GH4A 3AMCA 3WD1A 1LLOA 3QHNA 5IFPA 4AZBA 4GZJA 1U30A 5FCZA 4MNMA 5M17A 1GORA 1C91A 4TVDA 3MV01 4X0VA 5HDRA 3VGHA 2J62A 5CGTA 4QAWA 5CXPA 1A3HA 1ZBWA 1XRVA 1GVIA 4W8BA 3HN3A 4TX8A 1CYGA 4IPNB 3RJXA 2Y4SA 1E1FA 5KZ6A 8CGTA 3RPMA 2RGMA 4TUFA 2VVSA 1CLVA 1RP8A 2BVYA 2UY5A 3W25A 1XSJA 2ZICA 2VRQA 4GI8A 2E9BA 1RD6A 3CHCA 3BCFA 4UQEA 4Z2KA 3OGRA 1H1NA 1DEDA 1KQYA 2XG9A 1XC6A 1SR0A 1ISVA 3VIHA 1V3HA 3MANA 4HZ8A 5BXSA 2OWCA 3MMUA 4AW7A 1I75A 3ZQ9A 2V5DA 4ZEPA 5FL1A 2A3HA 3IAQA 3WQ6A 4AXNA 1DP0A 2A3CA 1HP4A 3LMYA 1EO7A 4LXFA 1HX0A 2VZUA 3VNZA 3W37A 3IAPA 1YQ2A 5EFDA 5JBDA 3KL5A 5IHRA 3WEMA 4CD7A 1QPKA 1KGUA 2GDVA 1B9ZA 4URIA 5A6JA 1WB0A 3WF0A 2UWFA 5A8PA 1BF2A 4PBGA 4DWSC 1A47A 5GQBA 5LA2A 1E43A 1R7AA 1BLIA 2YBUA 3WH5A 3JUGA 1CGWA 3LPFA 4XX6A 1E6SM 3DYMA 2WAGA 5GNZA 3RM9A 4GXPA 1O6IA 2WKGA 2X8RA 1SMDA 1H0IA 3VIIA 3VINA 1JZ8A 2G4FA 1BGAA 4AZ5A 3GXDA 1KB3A 1QNPA 2BVTA 1UD5A 1CXLA 3O9NA 3NSNA 3WFZA 2WVSA 1IZKA 3K8KA 1VFMA 3NIYA 2AAAA 1H4PA 4UFJA 3HU7A 4W84A 4OZOA 1WZMA 1OB0A 2WMGA 3AXHA 3ZJ6A 3E1F1 1AMYA 2WVVA 4U2ZA 2IXVA 1GHSA 5EB8A 1R7OA 3UESA 2V3EA 3AS2A 3OA5A 1W9VA 3PZMA 5DO8A 3FNDA 4GO9A 2BY2A 3AZSA 4UFKA 1E6NA 4ZXOA 1W2PA 3T0DA 3PZ9A 4Q7NA 2CYGA 3SCOA 5HOSA 3U57A 4L4OA 1UH3A 1TVPA 3QHOA 3U7VA 5D9NA 1US2A 1V08A 3M6DA 4PN2A 3EDKA 2DT0A 1M53A 4ML4A 3ZIZA 3KE0A 1K9FA 5A6AA 2BFGA 2DH2A 1CDGA 4TTUA 1G5AA 1BHGA 3FHAA 1X6NA 2FHCA 4WK9A 4J3TA 1GQIA 4XZBA 3WF3A 3BAXA 2YIHA 3VIGA 4RE4A 1VBUA 1GOMA 4DWSB 4HMDA 1V6YA 1UQYA 2XTKA 2JFEX 1JF5A 4GQQA 4W93A 1BYCA 2JIEA 3WL1A 5A8OA 4W86A 4Z2GA 1MYRA 3BMVA 1BVZA 2YL9A 1OCQA 3GZAA 1E0XA 3W4RA 4UZSA 3HMCA 3L2LA 3VIPA 4W7UA 2A3BA 1ZL1A 1MVYA 2ZUMA 4JAWA 4KGJA 3AOFA 3THDA 3TONA 4UR9A 4UQCA 2WBGA 1QI0A 3UG4A 2XUCA 1ZBVA 4UFIA 2VCCA 1B30A 3EMZA 1V3KA 4LQ1A 2EPNA 4PRWA 4HOWA 3MS8A 5I79A 3SCVA 1E15A 3PN8A 3VU2A 5E0CA 2DSWA 1JZ3A 5DMYA 5JIPA 4KMQA 3OLIA 2WMIA 2WBKA 4N42A 5HNNA 1WDPA 2PB1A 4D1JA 5A6MA 1WZLA 3W0KA 4GZIA 4TX6A 3MV11 3WD3A 1MW2A 2J75A 4M29A 4CD8A 5EBAA 1BG4A 1LWJA 1ZBKA 1CGYA 2O9TA 3AZTA 1JZ7A 1E55A 1JD7A 3D3AA 4HP5A 2VNCA 1I1WA 1UQZA 4PSPA 2V5CA 4ACZB 1BSIA 2BHYA 2VUYA 4ATWA 4IM4A 3VIKA 4XZWA 4MDOA 4UCFA 1AQHA 2O9RA 3UG5A 1AQMA 2XVGA 3WBEA 2ZUTA 3WENA 2WB5A 1FHDA 2X05A 4KWUA 4AZIA 3VIOA 2F2HA 1BPLB 3EMCA 3GXIA 1CXFA 1M03A 5E70A 1HIZA 3AYSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G1Y A;  1HJV A;  3POC A;  1XSI A;  1PIG A;  2CEQ A;  3G6M A;  4GZE A;  1X1N A;  1FH9 A;  3QOM A;  2YJQ A;  5DT7 A;  4WKA A;  1EOK A;  4HTY A;  4J3V A;  3OLG A;  3SCQ A;  5HXM A;  3KZS A;  5A6B D;  1UKP A;  2WHL A;  4CN1 A;  1H49 A;  4UQA A;  1C8Q A;  3WDI A;  3MMD A;  7CGT A;  1LF1 A;  2O92 A;  3DEC A;  4P8W A;  1GON A;  1UKT A;  4N0R A;  4K68 A;  1B1Y A;  4W7W A;  1H41 A;  1W9P A;  3GBE A;  2W66 A;  1EHN A;  3AHX A;  1V0N A;  4CU7 A;  2Y24 A;  3ZM8 A;  4UFH A;  4DUX A;  2VZT A;  3T0A A;  3BC9 A;  1HJU A;  4MDP A;  3OGS A;  1VB9 A;  3VD9 A;  1HF6 A;  1B2Y A;  3B8S A;  3GDB A;  5LA0 A;  1V3J A;  1I1X A;  1B3Y A;  1GZJ A;  3L4V A;  2J7H A;  4BQ4 A;  2WSP A;  4NRR A;  2VZO A;  1JFH A;  2CBI A;  4NRS A;  1GPF A;  4UQB A;  1EQP A;  4PMU A;  1E0W A;  1V6W A;  3GH7 A;  4AYS A;  1NP2 A;  1LG1 A;  3IJ8 A;  3WIJ A;  4JKL A;  4HMC A;  2PBO A;  1GNX A;  2F8Q A;  4A3Y A;  3BLP X;  3CUH A;  1C7S A;  2BY3 A;  2UY2 A;  5JBE A;  1WZK A;  1Q6G A;  1B3W A;  5IXE A;  4AC1 X;  1NAR A;  2V3G A;  1RP9 A;  4IPL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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