2CKS | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	305
structure length	305
Chain Sequence	GTPVERYGKVQVCGTQLCDEHGNPVQLRGMSTHGIQWFDHCLTDSSLDALAYDWKADIIRLSMYIQEDGYETNPRGFTDRMHQLIDMATARGLYVIVDWHILTPGDPHYNLDRAKTFFAEIAQRHASKTNVLYEIANEPNGVSWASIKSYAEEVIPVIRQRDPDSVIIVGTRGWSSLGVSEGSGPAEIAANPVNASNIMYAFHFYAASHRDNYLNALREASELFPVFVTEFGTETYTGDGANDFQMADRYIDLMAERKIGWTKWNYSDDFRSGAVFQPGTCASGGPWSGSSLKASGQWVRSKLQS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The Crystal Structure of the Catalytic Domain of Thermobifida Fusca Endoglucanase Cel5A in Complex with Cellotetraose rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE E-5
molecule tags	Hydrolase
source organism	Thermobifida fusca
total genus	132
structure length	305
sequence length	305
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2006-04-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2cksA00

1VENA 1CGXA 1GUVA 4AC1X 4D6HA 4BQ5A 6TAAA 2W5FA 1GPFA 4PEEA 3VGHA 3NSXA 4AIUA 4JL2A 4HOXA 3T2OA 4B9ZA 2JIWA 3PZMA 1R7OA 3BGAA 1H4PA 1CGWA 3UCQA 5CJ5A 1VFMA 3B9AA 5LYRA 2C7FA 2JEPA 4HA3A 1O7AA 1W1TA 4HTYA 3WENA 1JGIA 3MMDA 3AXHA 4P8WA 1XV8A 2GFTA 2JE8A 3FY1A 4YHEA 3VU2A 4V28A 4HA1A 1CDGA 4URIA 3NSMA 1R85A 1GW1A 3VIJA 1MVYA 1JDCA 3VM5A 1XSJA 4Z2IA 3N04A 1BG9A 1NOFA 4FF5A 1E6XM 2BY1A 2PWHA 4JIEA 4EAMA 5HPCA 3VMOA 4R27A 3EDKA 5D9NA 4CD6A 1KXTA 3EMZA 2BVDA 3ZIZA 5E70A 1E6PA 2WWDA 3BAIA 1JNEA 3OB8A 4PMYA 3WD1A 1JXJA 3GXMA 4U33A 2C8NA 3ARXA 3GH5A 2VCAA 4PYSA 1BAGA 3M7SA 4UTFA 5A6BA 4PCSA 1AMYA 2PF0A 3L4VA 1V3IA 1GQIA 2AMGA 5D9MA 3W4RA 1XSKA 4WSKA 1H11A 1RP9A 7A3HA 1GQKA 5A8NA 2Y8VA 1K6AA 3RMEA 1E9LA 2WVVB 1W9DM 1QW9A 1SMAA 4GO8A 3N15A 2G3NA 2XVGA 1E6SM 1JFXA 4M1RA 5AYIA 1ISVA 4ZXLA 5A6MA 3APGA 5I79A 1PIFA 3VGEA 2IUZA 5C70A 5BXPA 3MSDA 1Q6CA 3SUUA 5TD4A 5IHRA 1E6NA 4IUGA 1MW2A 2DT2A 3WKZA 1JF6A 5I6SA 3CBWA 3IAQA 3W25A 3WH5A 2CBIA 2VCBA 1XGZA 4AEEA 4U31A 2WSPA 4S3JA 1VBRA 2ZIDA 1E6ZA 1Q6FA 2X05A 1K9FA 4ZFMA 3UG4A 2EJ1A 2VVNA 2RGLA 1E4MM 4XUYA 3ZM8A 5DMYA 5CPSA 1JZ2A 2A3HA 2YDSA 2VR4A 1UR9A 3BLPX 5ABFA 1I75A 4GIAA 2FDMA 1MWOA 3KZSA 2W62A 3VD9A 2YA0A 3VGGA 1E43A 1QW8A 3LPOA 1BYBA 3AHVA 1W32A 4P7NA 5HNNA 4LPCA 1WE5A 2ZX8A 3CMJA 1WZAA 4N42A 5FD0A 2WSKA 4UFMA 2DSUA 4P8VA 2FHBA 1YHTA 5I5RA 1EO7A 4XZBA 3FNDA 5AC4A 3RPMA 3L4TA 3S2CA 4PMNA 4GQQA 3ARQA 3CHFA 4MDOA 3VDAA 3ARPA 4FLRA 4UQCA 3U7VA 2WVUA 3OG2A 4RL3A 5HOSA 1HP5A 3WQ4A 1KBKA 4D6GA 3BAXA 1BVZA 2VI0A 1U2YA 1QI0A 1VBUA 3AFBA 1HL9A 3U5YA 1NM9A 3SCRA 3T08A 4M82A 3AOFA 1CXFA 4GPNA 5JBFA 4KWUA 1XYZA 3E1F1 1WZLA 1NWUA 4J3VA 3AHZA 2J7FA 3EMCA 3CUGA 3SURA 3WQ8A 1OIMA 1KGUA 1UOKA 1NOWA 4LGXA 3SCQA 1W9VA 5AC5A 3PTKA 1TCMA 3W81A 1MW3A 2PWEA 2EPKX 1GHSA 3QOKA 3GTNA 1E40A 1OD8A 2WC3A 1C93A 5DEZA 4ATLA 2CCRA 3B9EA 4GQRA 4AD3A 5I0DA 2F8QA 2VZVA 5GPRA 1UH3A 1UKQA 2DSWA 2VX4A 2ZUUA 4PSPA 3W38A 3AXXA 1XH1A 4KGLA 1JAKA 1E55A 1GJWA 1TR1A 3AIRA 1WCGA 2YA2A 5CG0A 2XIBA 1B3YA 3N9KA 2JF6A 3ARTA 1WP6A 4Z2HA 1WNOA 1K9DA 1KXQA 5EBAA 5A6SA 2WB5A 5A2AA 3BAKA 1QNRA 3T09A 5A3HA 1JG9A 4P8UA 4UZUA 1P6WA 2XWDA 2D22A 1TZ7A 4B15A 2D0HA 3WQ6A 3FHAA 2UWFA 3WD3A 2WVVA 1BF2A 4PTXA 4BCEA 4LQ1A 3WH7A 3DYPA 6A3HA 2YBTA 1CGUA 1KR1A 3S6TA 5BXRA 4PRWA 3VPLA 1ESWA 2J7GA 3VDCA 4TVUA 2GK1A 3NSNA 3AIWA 5GNYA 3OBAA 3WH6A 2D2OA 4OBSA 4DUVA 2CERA 4W7VA 1NWTA 3N12A 1PX4A 2VX6A 4JKMA 5D8ZA 1BFNA 1W9PA 2XG9A 4QCEA 1GOIA 4W84A 2JFEX 1UWQA 3DECA 4DWSB 1C8QA 1OB0A 1Q6GA 5GQBA 3VIHA 2O9OA 3MS8A 2PBGA 2ZX9A 3WEZA 3WNPA 1PBGA 3AMDA 1E4NA 1H5VA 4EE9A 2VX5A 1J0IA 2ZUNA 5EMYA 1HKJA 3PZGA 3CMGA 5M5DA 4MNJA 1GOWA 2EPOA 3BXWA 3CHDA 4RE4A 3UR7A 4BQ3A 1KWGA 4W89A 5CQ1A 1UD8A 1F4AA 3G6MA 3W0KA 1NH6A 5JUVA 3M6DA 4H7VA 4QCFA 2BXZA 1RD6A 2WZEA 3GNPA 1DEDA 3WELA 3CO4A 3BAWA 1NP2A 1D7FA 4GKLA 1NQ6A 4L4OA 3WIJA 3D3AA 2D0GA 1OGSA 1UA7A 1K9EA 5IHSA 3ALGA 4M29A 1CPUA 1US2A 4KGJA 3FHQA 1HX0A 1XD0A 1CXEA 1E6QM 1NWRA 3LPFA 5IFPA 3T2PA 1GZJA 3WQWA 3D5HA 1KGXA 1M04A 1UH2A 1E6RA 2JF7A 2XVNA 1OINA 3ARZA 4UNIA 5D8WA 4AIOA 3UEQA 2YLAA 1GJUA 3DHUA 2CHOA 2CHNA 4WIWA 1HJSA 1CXLA 2F2HA 4MB1A 3WMCA 2ZX7A 3AQUA 1OGGA 5FIPA 2W67A 1UD2A 1J0JA 2VJXA 1E1EA 1UHVA 4MPKA 3ZO9A 2WHJA 4NI3A 1VB9A 3WUFA 4AW7A 5LA0A 4D1JA 2EPNA 2OWXA 2J7CA 2J74A 3AMCA 4AZGA 1B3ZA 4GI8A 1BG4A 3N1AA 3PBGA 3MV01 4JFWA 3WMSA 4AEFA 1X1NA 1DWFM 3WNMA 4GXPA 4M81A 4PBGA 2XFFA 1QHPA 3T0AA 4AZCB 1ZBCA 1U33A 3K8LA 2ZXDA 1GOMA 5BXSA 4W5UA 1UWTA 1EQPA 3AXIA 3SCOA 3TOPA 1XSIA 2VTFA 4AD5A 4Z2KA 3WY1A 2J79A 3WD4A 3BCFA 2TAAA 1LL4A 1MW0A 4UOJA 1EDGA 2Q8XA 1J9YA 1J0HA 4PTWA 4B16A 1OCQA 3KL3A 1SYTA 4DUXA 1FFQA 1CGVA 3OLDA 3GBDA 3LPPA 1ZU8A 1J18A 3I3DA 2VRKA 3RM8A 2PWFA 5E6ZA 3IJ9A 1EH9A 4A4AA 3AIQA 4KMQA 4RE2A 3EYPA 1FP9A 2WYSA 2XWEA 4B3LA 3MUAA 1CXHA 2CBUA 5FOOA 1XC6A 4LXFA 2WLYA 2FGZA 4GZJA 2DT1A 5A94A 2E3ZA 1HJUA 4WKHA 2WW5A 2BVTA 3OZOA 3PZQA 3AS2A 3GBEA 3WQ5A 5E0FA 2J47A 4BQ4A 2WCSA 1UWSA 3L2LA 1V6YA 6CGTA 1H49A 4D6CA 3WSUA 2AAAA 4NZCA 4AZ7A 2YIHA 1TUXA 1UKTA 1CNVA 3RM4A 4DWSA 3PZIA 2D20A 2PI6A 5BYWA 4ACZB 4OKDA 4U3AA 1JDDA 3SUTA 4QLKA 3NCOA 1E3XA 4P7QA 3KWXA 4HPGA 5HBFA 2A3CA 2DSZA 4F79A 3VIIA 1UG6A 1UR2A 1V0KA 1R7AA 1G5AA 4TVDA 3RJXA 1NWSA 2CKRA 2XVPA 1UQYA 1TE1A 4CN4A 3ZJ8A 5ABHA 3AZRA 5D9OA 3RM9A 2CIPA 5FKYA 3VD5A 4BA0A 4P7RA 4H04A 2QHAA 4E8CA 2XM1A 1PAMA 4E4PA 4J28A 3BSGA 1WZMA 3CLWA 1X6LA 5EB8A 1CEOA 2BV9A 5FL0A 8CGTA 1W2VA 2DDXA 3BSHA 4F8XA 4PMUA 3VTRA 5A2CA 1NP0A 2ZE0A 2XVKA 4Y7EA 3WDQA 1ZBKA 2GSJA 3RJYA 5I2UA 1QOXA 1LG2A 2GJXB 1HJXA 1B3XA 5LA1A 4UFJA 1ZBVA 1W9BM 3WF1A 1GQJA 2WCGA 3VD3A 1LG1A 1WDPA 5C8BB 3WL1A 2XJ7A 1GOOA 5DT7A 2NSXA 3K8KA 1TFVA 4GZIA 1B90A 3WDHA 3SCVA 4BS0A 4UZSA 5A6AA 2DEPA 2EPMX 5GNXA 1PZ3A 4D72A 3IJ7A 2FGLA 4PUEA 4ATDA 4QAWA 1OT2A 4U2ZA 1FHDA 1UR8A 5A8QA 1E5NA 4MTVA 3CZKA 1Z32X 2VC9A 5A8OA 3IANA 3OIHA 5BROA 3U7BA 1C7TA 4R5EA 2A3AA 4AZCA 4UFLA 4IPLA 2DPEA 1UKSA 2IXVA 1ECEA 4M56A 5ECUA 1IZJA 3WD2A 1KQYA 1SR0A 4WKAA 4HZ8A 1BHGA 3WN6A 2WVSA 2QMKA 3OA5A 2O9TA 2VZSA 4J3UA 1QNSA 3KEHA 3VGDA 4CGTA 4XZWA 4F9JA 1JZ8A 3OLGA 4JL1A 1HKIA 3MU7A 2G4FA 2B31A 4UFKA 3PZUA 3W53A 4F66A 3ZT7A 1JD7A 3AIUA 4FLQA 3W29A 2BXYA 2WZIA 3UERA 1VIWA 2W63A 1JAEA 4IPNB 3QR3A 1C7SA 2ZWYA 1J12A 1QNPA 2VZTA 4UQEA 3VNYA 3TTYA 1W3HA 1TA3B 3AI0A 4P7LA 3M07A 4K68A 4JZ5A 3ARVA 4J3WA 5HXMA 2BY3A 4JHZA 1UWIA 1R8LA 2YDQA 2CBJA 4AYSA 2WCAA 2QLYA 4AXNA 1UWUA 1CZ1A 4PMVA 1B2YA 4TX8A 5AY7A 1E56A 1EOMA 2DGAA 1XRVA 1HJVA 2WLZA 2XTKA 4KRTA 2PWGA 3MV11 4TTGA 3FW6A 2YJQA 1Y7VA 2RGMA 5LA2A 1D3CA 1I1WA 4ZEPA 1V0NA 4W87A 3OLEA 2G3MA 4ACZA 1FH8A 2Y5EA 3ARWA 1V08A 1RPKA 1KXHA 3PZ9A 4MAVA 1RP8A 5CGMA 5BXTA 1MQPA 1JYXA 4OBRA 1GQLA 3KE0A 4U5IA 3B8SA 4NF7A 2G8ZA 2ZUSA 4JAWA 1PEZA 5DF0A 1JFHA 4DUWA 2J62A 3QHOA 5FL1A 3WNLA 1SFSA 2VRJA 2VQUA 3L2MA 4WK9A 2Y4SA 2O9PA 3I3EA 1HJQA 1CYGA 3WD0A 1PJ9A 1L0PA 5A6BD 1ISZA 1M53A 3OGSA 4OOZA 1U30A 2XGBA 4HOZA 1QI4A 3AS1A 1BGGA 4B3KA 3ARRA 4HP5A 1TVPA 3GH7A 1B31A 4JFTA 3PN8A 1EA9C 2J7DA 2W61A 1WKYA 3AHTA 1V3JA 1G01A 4AZBA 4OOUA 3AJ7A 2WK2A 4CD7A 3KL0A 2FH8A 3CHCA 3MUIA 3MUZ1 1VFUA 2GJXA 3IK2A 4OZOA 3SCUA 2J78A 3IJ8A 5BRPA 1E15A 2PC8A 2E0PA 4W85A 4ZENA 3A4XA 1KWKA 4YN5A 3OZPA 2C0HA 1GONA 1OWQA 2XYLA 2Y8KA 3CZGA 1BSIA 3A4WA 1D2KA 1V3HA 2DSVA 1E0XA 5JIWA 1PIGA 4UOZA 3WH8A 4CKQA 1FOBA 2QMJA 1UR0A 4DWSC 1JZ6A 4YHGA 2ESCA 3ARUA 3FAWA 1VJZA 1CWYA 1AQ0A 2WC7A 1F4HA 2BNJA 2D24A 3GXDA 4UQBA 1E4IA 2VVSA 2JIEA 1W2PA 4X9YA 1FP8A 1W1YA 3QOMA 3AYRA 1XCXA 1ZJBA 1TG7A 2WMJA 3SCNA 1LL6A 2A3BA 2ZX6A 3W6MA 2VCCA 1FHLA 1UA3A 2VRQA 2YL6A 3L4WA 4F9DA 3RCNA 5E6YA 3U57A 3VIGA 1JI1A 1UKOA 2ZXQA 2EQDA 4TVCA 3AMKA 1C8XA 1ISWA 1E0VA 3WDJA 3ZT6A 3CUFA 2WAGA 4XB3A 1TVNA 4NRSA 4OJYA 5M17A 5IDIA 1DWAM 5BRQA 3FAXA 2YBUA 4LYRA 5DO8A 1QNQA 3F5LA 5A69A 5IFTA 5C71A 3VMPA 1E5JA 1LQ0A 2D1ZA 3W28A 5IXEA 1EOKA 2EPLX 2UY5A 4P8XA 4PSRA 3THCA 4JFSA 1YQ2A 5GNZA 4D1IA 3VVGA 1WAWA 2ZUMA 4JFUA 2OLHA 4JKLA 3WFLA 3VD4A 3WUBA 3WDIA 1TA3A 2V3DA 3W6LA 1BQCA 1UYQA 2Z1SA 2E8ZA 2WMHA 1K9TA 1M01A 1MQRA 4MDPA 3SIMA 1V6VA 1KGWA 2ZUVA 1N82A 2FH6A 3MMWA 4W88A 3UG5A 1QHOA 2WHMA 4AISA 2QPSA 4E8DA 3SCWA 2G3JA 5CGTA 2VOTA 9CGTA 3DHPA 4UOQA 1AQMA 2GVYA 4J7RA 4AZHA 3CTTA 5JBEA 1DTUA 1Q6DA 2BY0A 4J3TA 2XFYA 4MAZA 3LPGA 4HA4A 2XSAA 4AZ5A 4AWEA 1H09A 3DYOA 3T0DA 2ZXAA 4A3YA 1R86A 4PCTA 2CBVA 4ZXOA 3BMVA 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2WHLA 1E1FA 2GJPA 2OSXA 1X6NA 4ATWA 5A8PA 5BWFA 1LF1A 1DWHM 3T2QA 1OD0A 3A47A 3AS0A 1CIUA 4M24A 1GVYA 2WKLA 1C3FA 1CTNA 1W9UA 1C91A 3EDEA 3ZR6A 1MW1A 4A3HA 2IXUA 4TXEA 2OWWA 1UZ1A 2E8YA 2W4XA 1H41A 1E73M 3U5UA 1OGBA 1VEPA 5I23A 4Q22A 2V5DA 3J7HA 3WFZA 4TTUA 2VL4A 2VR5A 4W8BA 3NDZA 5KZ6A 2OSYA 1ZB5A 3AROA 2EXOA 2EBNA 2PB1A 1HNYA 4ZE5A 1LLOA 4H41A 1A3HA 4AY1A 5BCAA 4QLJA 3EDFA 2VZOA 1UH4A 1HXJA 1MQQA 2WVTA 3NUKA 1UZ4A 4W5ZA 4DM1A 1HVQA 2W66A 3CZEA 1O6IA 1CLVA 2BS9A 2J7HA 3K8MA 2X1IA 4TUFA 2UY4A 3VGBA 5F7UA 1V6WA 1WO2A 2WKGA 3VIKA 1B3WA 1HP4A 1EHNA 4IISA 2CYGA 1KCLA 2WMIB 4EK7A 3W26A 2DT3A 5EFDA 4UQ9A 1EGZA 1V03A 1MXDA 4PMZA 4UR9A 3VX1A 4FMVA 2WPGA 1VRXA 1H3GA 5A6JA 4JCLA 3NJ3A 3VIPA 3GH4A 3POHA 3SCPA 1UD6A 3TP4A 3CH9A 3A3HA 4PUDA 4UFHA 1EIBA 4X0NA 3L4UA 1VF8A 3W37A 3N13A 2GJRA 3BMWA 2BHZA 2VURA 1KR0A 2GK1B 3WF2A 2WZHA 1KB3A 4QFUA 1WPCA 5HPOA 3CZ8A 3VNZA 1W3LA 4EKJA 5D4YA 3A4AA 1UQZA 2J8FA 1ZS2A 2YOCA 4AD4A 1W1PA 8A3HA 3WDRA 2D3LA 2XIIA 1EHAA 3NYDA 2DH2A 5A6LA 2DIEA 4ACYA 5EFFA 4MNMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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