2CLEA

Tryptophan synthase in complex with n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2- amino-1-ethylphosphate (f6) - lowf6 complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
266
structure length
251
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 251
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cleA00
3L5AA 4I9AA 2ZCGA 1SPQA 3TSDA 3DHFA 3WJYA 1LROA 1ZAJA 2JKPA 4UTWC 4NX0A 2Y7FA 4M7TA 2JGYA 4MYAA 4FB7A 3KRSA 4LWWA 2C18A 4FIRA 1OFDA 1KBJA 3TDFA 1KBIA 1LOSA 1M6JA 3GAYA 4K36A 3VI2A 3W2KA 3LM7A 3LHVA 5HWJA 3STCA 1W5QA 4OE7A 1EUNA 1KM5A 2X2GA 3P82A 4JYFA 3GXPA 1DBTA 3PSWA 3IV3A 4O1BA 1QAPA 3R12A 3EXRA 4JTGA 4K39A 4AB4A 3ABQA 2WKJA 1FDYA 2G5WA 5G1YA 4IXXA 1XCFA 4A22A 1SFJA 1W56A 3Q37A 1A5CA 2Q3OA 3UY8A 3F4WA 4GUJA 4RXFA 4WXZA 5HWMA 2FB2A 3A24A 5I3GA 3W1TA 1R47A 4O15A 1J5TA 1DORA 2ZRVA 5KTLA 3RFAA 1OYBA 3E96A 4UFHA 3TIMA 4L4MA 4JX5A 2CZFA 1PL9A 3L5LA 3C0JA 3DAQA 4UTWA 1PVNA 3W7GA 2CLKA 4TR9A 2WNQA 1W3IA 3EKZA 3G1XA 3L65A 1H7WA 2X16A 2H3BA 1OABA 4NJKA 5DCEA 3TNOA 3ZFHA 2H8ZA 4JTJA 2WNNA 3Q94A 3A23A 4MJZA 2VFGA 4RKAA 2R14A 3F4NA 4XKYB 1EPXA 1VR6A 4RR4A 3IVSA 1S5VA 1TB3A 3W71A 3TCEA 1NVMA 2YZRA 1B4EA 3FJLA 4UIOA 5I3HA 3E0IA 5LNSA 1SW7A 4DEFA 1M7PA 2QF7A 1LBFA 4HNVA 1JCXA 1T8XA 2CZ5A 1GG0A 5HULA 1C29A 3LHWA 3TKFA 4U28A 5AFDA 3BLEA 2VELA 1QOPA 2Y63A 4MUZA 4ONVA 3O6YX 3TV8A 3FKRA 2E6YA 3I65A 3HGJA 5HUOA 1MEIA 4X9SA 1ME7A 1QO5A 5CKSA 1EP2A 1I8JA 2NXGA 1R2TA 1IGSA 1LDCA 4A29A 3JRKA 1I2RA 3NNTA 5HQEA 2AGKA 1EA0A 4MY9A 3VFLA 1XKYA 4S1FA 3GYEA 2OT1A 2J9ZA 5BW6A 3QJAA 5J5RA 1G69A 4OV4A 3QZEA 2YW3A 3W75A 3W87A 1XUZA 5C6MA 1ZFJA 4NX5A 1OFRA 2RDTA 1O5XA 1IXOA 5D2YA 1VC4A 1SUXA 3CHVA 2NLIA 3JR2A 4MFDA 3L21A 1JQXA 5DBTA 1H61A 1SO4A 3G1FA 2VFIA 2Z6IA 5J5DA 2VFDA 3TQKA 2PURA 4FXSA 2QUUA 4WOZA 3EWWA 4AWUA 1SZGA 5HR6A 2B7PA 3M0ZA 4LC6A 4LVFA 1NF7A 3RF9A 4WY0A 5CPMA 4DO4A 1TYGA 1YPFA 3LCWA 4NJJA 5LGXA 3TH6A 3WK0A 4IMEA 2EPHA 5DN1A 1QO2A 1QDSA 4QJ1A 4EIVA 3EWYA 3M1ZA 3E02A 4OT7A 4O18A 2QCHA 2DZXA 3M43A 1XBVA 4IGHA 3MP5A 4LW7A 4A3UA 5LNVA 1EWDA 1HL2A 1ZJIA 3NO5A 3USBA 2GJNA 1IXPA 4HNUA 1ALDA 1DQXA 1XI3A 1OFEA 2Q8ZA 4LS1A 5LKYA 1QFEA 2H8XA 4UTUA 3G1SA 1YXYA 4E0CA 2ZRXA 4TMBA 1UB3A 3O6DA 4CNPA 3G0UA 1G4PA 3W1AA 2IQTA 3DZ1A 4IPJA 4PTNA 3PSVA 5G2IA 2B7OA 4HKPA 5GVJA 4NNBA 5KZMA 2WSRA 2RDUA 3B03A 1M5WA 5A8GA 2ISSA 1KM6A 4LUJA 5LGZA 3I6RA 2DJLA 1B57A 3Q58A 5CSRA 2BXVA 4I7UA 4Z08A 4JN6A 3STGA 5D04C 4MOZA 4N4PA 3BVJA 4N9DA 3DKJA 2A7RA 1V5XA 1PIIA 4FHAA 3CC1A 3HB9A 1N7KA 1PHWA 1Q6OA 1ZY9A 1NSJA 4IX0A 4JY9A 2FFCA 2KZHA 5LHFA 4NU7A 4C1LA 1GZGA 2XFWA 4RZ4A 3O07A 4H3DA 1FCQA 3QSTA 1WOBA 5LNUA 1OF6A 3W7DA 1FXQA 2Q8LA 3V75A 1FCVA 1T99A 3LRLA 4HPJA 2E5BA 1XBYA 4HT3A 4JDYA 2Y7GA 3UD6A 2PE4A 3GAKA 1A5SA 4JGDA 2GVLA 4TU1A 3U8GA 4FNPA 1ICPA 4CQ9A 1K8YA 3LLDA 5C54A 3LTPA 4AWSA 4AWTA 4RV8A 4NQ1A 3BGGA 2OCZA 1JRCA 3HPSA 3FEMA 4KWVA 3BW3A 4GFSA 1VQTA 2A7NA 3PY2A 3SGZA 1YTKA 5LNWA 6ALDA 1GG1A 4E38A 1VPXA 4AHQA 1M7OA 1RQBA 3HGSA 1P5BA 3S1WA 3H54A 1QNVA 3P81A 3LCLA 3AO0A 5G2WA 2NV1A 3PC0A 4KFPA 3KVJA 3N2XA 3NL6A 1UCWA 3W83A 1W31A 3E9AA 3EB2A 2FJKA 4N02A 1DOSA 1LORA 4JTLA 2Y7EA 4A21A 1TV5A 2J27A 3W7EA 5C2XA 3KVKA 3UWZA 1FBAA 2QCEA 4LS0A 3PBWA 1NF0A 4WQ6A 4BK9A 5U7SA 2ZA3A 4ZMGA 4JTKA 1K3UA 5AC6A 1TPFA 4ML9A 4O8RA 2A7PA 4CQ8A 1MXSA 1H1YA 1KFKA 5LHEA 3A5VA 2ZRYA 1EIXA 4AEOA 4AH7A 4RZ5A 4P2VA 2UV8G 2ZBTA 2ZZ3A 2W0UA 4N9CA 3NZRA 1QOQA 4HNNA 3NYZA 3P5YA 4UR8A 1DVJA 3BG3A 2BZNA 3VNDA 1JUEA 3C2VA 3OIXA 4PC8A 4MLRA 1Z42A 4J9JA 1G7UA 1RD5A 1WV2A 2E68A 3LLFA 3BARA 2WOQA 1R2RA 2EHHA 3QFEA 2VEPA 4EVZA 1VCGA 4WZHA 3MJYA 4PH6A 5D2VA 1Q6RA 1BEUA 3QF0A 3D0CA 3C56A 4UTHA 3W2LA 4H4IA 3PG9A 2VEMA 1JCYA 1QR7A 1AL7A 4UFMA 5L6UA 2OJPA 3GDTA 3MHFA 3NQ2A 3UXDA 3OVPA 1VHCA 1RQEA 2V81A 1VLWA 1KM2A 1F5ZA 1THFD 1QPQA 4UNKA 3NQDA 2DJXA 2PRLA 1F76A 3B8DA 4OGZA 2E6DA 5FEZA 3N9RA 3SY5A 3IIPA 1ICQA 3G22A 3L5MA 4N9BA 5DY3A 4GRSA 1LYXA 5BMXA 2B0MA 3NEVA 3C2OA 3SIZA 2NXIA 1LBMA 1OX4A 3LERA 4NNAA 1CI1A 2A2IA 1K8ZA 4HNTA 5C55A 5C5YA 3C4UA 1KFBA 4O4VA 3CM4A 5CZTA 4UTMA 1KV8A 3DFQA 1YTEA 4NNCA 1OF8A 4BF9A 2AAMA 3ZWSA 3WJZA 1D3HA 2AQWA 2V2HA 3LCIA 4DBDA 5L9FA 3O05A 4G1KA 4LUIA 3M7WA 5K4ZA 3TA6A 5CSSA 3S8HA 3TE9A 4ZVJA 2FB3A 4GE8A 1P0NA 2FDSA 1VYPX 4OQVA 3UWVA 4N6EA 1FY6A 3G3MA 3SJ3A 4K6AA 4JTTA 2CLFA 1H7PA 1L9WA 3GVGA 4O19A 4O28A 1ZAIA 1HTIA 4GUGA 4H6KA 1OG0A 2WQPA 3IGUA 1NAL1 1X7FA 3S1XA 5TBOA 5I3FA 1BTMA 1KTCA 3U2OA 3HIJA 3IVTA 2YX0A 1EWEA 1MZHA 3W7MA 2HMCA 1XC4A 1KM4A 4BI6A 2NWSA 1R46A 4JX6A 5K9CA 4LT9A 3PR2A 3GZ3A 3MI2A 2VC6A 4QQ3A 2YW4A 3W7IA 2YFNA 3IIXA 4O52A 4DO6A 1QPRA 3R89A 2Y62A 3THQA 3T4CA 1RQHA 3ABSA 4UTJA 4ZZ9A 4JEQA 5HMSA 3N2MA 3CWOX 3NXFA 2GQ9A 3UZJA 2RKXA 2QCCA 3NQCA 1F05A 1GVSA 3NQAA 1O60A 4AXKA 4ORIA 3GDRA 2X1RA 3RU6A 3GDLA 5SWUA 4UTIA 1I4NA 2Y85A 3I7QA 3P8JA 1SSGA 1MEWA 3QMRA 3LDVA 3KRZA 2PRMA 1XUUA 3YPIA 1GTHA 3W2MA 5BRBA 1I2QA 3DFSA 4Y9AA 3C2RA 3HGOA 1YDOA 1F6KA 3E12A 2E09A 5AC7A 1QWGA 4JY8A 5AHMA 2J6XA 1ICSA 2P0OA 5EY5A 2QCFA 4X2RA 1GQNA 3OVRA 3CIXA 5F4WA 3I7RA 1DL3A 4HPXA 1DJNA 4AVFA 1KLZA 4M6PA 2HTMA 1C8VA 2QEZA 2ZQ0A 3LX9A 4OHQA 2ABBA 2XN1A 4RCXA 1QMLA 4YXGA 1WXJA 2Z0IA 1AW1A 5D03A 1K03A 1VGAA 3TSMA 4MIMA 5AB3A 1AMKA 4NJHA 1D3GA 3M47A 3TW6A 7TIMA 1RV8A 1YXDA 3SSJA 1MSSA 2ZZ2A 1X1OA 3S1VA 3MBDA 1FWTA 3P61A 5D38A 2C14A 1L6YA 1L2UA 1TO3A 4TX9A 4Y90A 4QAIA 4TO8A 3WJSA 4I7WA 1S5TA 4XZ9A 3WK3A 1WBJA 3SFKA 1LRQA 3LXBA 1X6UA 4QITA 5KITA 4PL1A 3BG9A 3N14A 4IOTA 3O06A 3I68A 1Y0EA 4Z1CA 4LNYA 3NAVA 3QW3A 2ZFAA 3EWUA 3LBCA 3QMTA 1TQXA 4DXVA 3MHUA 4N6FA 3O6CA 4IXHA 3W7PA 3F03K 1K02A 3C8FA 3K30A 1V7YA 2A6NA 3KVMA 5DXYA 3HO8A 1R30A 3W23A 3CIWA 5D33A 5E1QA 4CNNA 1GEQA 2A6LA 2ZA2A 4X3ZA 1GJPA 5HR7A 1XXXA 3S5YA 3NQ8A 1TTQA 3WK1A 3W73A 3NQMA 3G24A 5F4SA 5EPDA 4FNRA 5U4NA 4AAJA 5E0KA 4XBKA 3O63A 1UJPA 1KM0A 3EX2A 1RZMA 4IUOA 4IJBA 3T40A 5K9DA 2NX9A 4JS3A 1LLZA 1PV8A 5D30A 1MEHA 3C6CA 4HHPA 5FESA 3W6YA 3W7QA 1UUOA 1FXPA 1BKSA 1JULA 4NZFA 4JTIA 3STFA 1LRNA 1XBXA 3NOEA 4WY0B 4IWWA 4O0KA 3FLUA 4LU0A 5HUPA 1YADA 4RLIA 3MWAA 3O1NA 4ADUA 1EUAA 4U4MA 1K7XA 2NWRA 2O7SA 1N8FA 1O4UA 1YDVA 4UNLA 2HSAA 1K8XA 1WA3A 1B4KA 2BTMA 4GXMA 2YXGA 3NR0A 3W7JA 1W3TA 1F6PA 4IMGA 4K8EA 2V30A 3C3NA 3BV4A 3F1QA 1DJQA 1A50A 2P10A 1DV7A 2E5DA 3R2GA 2I9EA 2QCLA 2ABAA 3WJXA 1XM3A 2Q3RA 1YXCA 2C6QA 3FKKA 2ZTKA 2R91A 3E49A 3LCXA 4WUIA 3M5XA 1SFLA 4RX0A 3GR7A 3PB0A 1SQ7A 4UR7A 2OMAA 3S5NA 2P1FA 3UWUA 4X22A 4XBSA 2QJHA 4XTIA 4R33A 3ZWTA 4JDBA 3PULA 4FX6M 1WBHA 5KZEA 3TQVA 1J2WA 3HG3A 4FX8A 5CG7A 2JK2A 3G1AA 3P67A 3PS7A 1I2NA 3TK7A 2DZPA 3W7NA 4TMCA 1OFPA 4NT0A 3TFXA 2WJZA 4FNTA 1ZHAA 2DZVA 5HJLA 3QSRA 4BI5A 4E2BA 5K2ZA 2BLEA 2BX7A 3MW7A 3QH2A 3DFOA 4FEZA 3DHDA 1YYAA 1BWKA 5AHLA 4PEKA 3W85A 2E5CA 3MI3A 1G67A 3IRDA 4DBEA 1CW2A 4ZQNA 3A22A 3P5ZA 3WK2A 4JIQA 4DQWA 3B0VC 3FJ6A 2WO5A 2J9YA 3R5EA 3CQ0A 1GVOA 3TJLA 3MI6A 3RNDA 4P61A 3A5FA 1C9DA 3H53A 4UFLA 3NQGA 4RJEA 2WNZA 1H51A 4PCFA 1AW2A 4JR5A 4Z1DA 5ABTA 2ZZ5A 3CLMA 3MYPA 5CZJA 1D9EA 3G1YA 4YWIA 1W5OA 3DXIA 3UNDA 1SO5A 2VENA 2VXNA 2PRHA 2WV8A 3BW2A 3UWYA 4ZQOA 4LVDA 2ZRUA 1UASA 3W2JA 4OU1A 1OX6A 4JIPA 3G1VA 1ME9A 1TJRA 3Q2DA 3HG4A 4NXKA 4XWUA 3PM6A 3LHTA 5F2MA 3I7SA 4Z0JA 1ZCOA 1PHQA 4GUFA 1MO0A 3BO9A 4PFMA 4Q4KA 1AL8A 3IGXA 1LCOA 5EKYA 4Y96A 4M7SA 4N9EA 2R8WA 4XQ6A 3KVLA 1PCKA 3QQ1A 1HFBA 1W5MA 1QPOA 4ZQRA 1ONRA 3LTYA 4NJIA 3NL3A 4UMAA 5FF3A 3TC6A 3TSBA 1L6SA 4JTSA 2LLEA 3L9CA 4BWLA 3PBVA 5DELA 1WOAA 5F4XA 4FX7A 4A2SA 3NVTA 4POCA 4XTDA 4WD0A 1Z41A 3RLUA 1B3OA 4LRTA 3BLFA 5FF0A 4UTKA 1KTBA 2DU2A 5FF4A 1Z44A 3TFCA 3VE9A 3OEXA 3TAOA 3TXZA 2DP3A 2X1SA 4K8HA 3GKAA 4JTEA 3SGUA 3LGEA 3M5VA 3P62A 3MP4A 1KLYA 2V8ZA 3NM3A 3HQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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