2CLIA

Tryptophan synthase in complex with n-(4'- trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9)
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
268
structure length
258
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 101
structure length 258
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cliA00
4GUIA 3S5OA 5AFDA 1GQNA 1RV8A 2YXGA 3M5YA 4NJIA 3E02A 3O63A 1W0MA 1VHCA 3LHTA 3QMRA 1F5ZA 4UFLA 3S0CA 3KVLA 4HHPA 4DEFA 1HTIA 1A5AA 4NXSA 4FXRA 1HUVA 1K02A 2PRHA 3A24A 4WXZA 2QCLA 3TNOA 3W7LA 5MHBA 1K8ZA 1SW0A 2VEMA 2NUYA 1B9BA 5KZMA 1W3TA 2R14A 1AL8A 3QF0A 2G5WA 4IGHA 1F05A 1G4SA 3C52A 1LOQA 2OT1A 2QKFA 3DXIA 1SO5A 3SFKA 5EPDA 1ME8A 4Y90A 3G1HA 1MSSA 5FF2A 3UWVA 2WSQA 3NPWA 2C0AA 3SIZA 3GK0A 1XKYA 4UIOA 3LTPA 4GXMA 3MI3A 5FF7A 1G6CA 4UFMA 2C14A 1TTQA 2JGQA 1JUKA 3NQ2A 1FWSA 4MVAA 2NXIA 5AYXA 3W7OA 3PUOA 4GC4A 4LW7A 5FF4A 4UC5A 1BKSA 1YDOA 2H6RA 3NA8A 1GOXA 3M5ZA 3PBUA 1WV2A 1JVNA 4FO4A 1HG3A 1MEWA 1XBYA 4YL2A 3NAVA 3MBFA 4I9AA 5FI8A 3IV3A 3G1AA 5D04C 3O07A 1OYBA 1XI3A 3P62A 1KM2A 1TYGA 5LNUA 4A21A 3TFXA 1F2JA 4RZ4A 3UXDA 2CWNA 4ML9A 3NVTA 2GUUA 3TMLA 1J5TA 4JN6A 1CX9A 1G4TA 2A7RA 3V1PA 1SSGA 1OFQA 2NUWA 1O4UA 2Q8LA 1GVQA 1KFLA 4N9BA 3P74A 1XDLA 3W7CA 5AYZA 3CC1A 2VFFA 5D32A 4G1KA 1N55A 4PL1A 4IJBA 1FXQA 3KRZA 3G18A 3W87A 2J9ZA 1GT8A 3TA6A 3U2OA 3CM4A 2D73A 4LVFA 2V2CA 4GE8A 3W1TA 1GEQA 4QISA 1HFBA 2P1FA 2DZPA 1YDNA 2ZZ5A 1AL7A 3EX1A 4UTHA 4O0KA 1O94A 3C4UA 4UXDA 3TMQA 3L5LA 3ATYA 2W0UA 5CPMA 4Y9AA 1A5BA 3W1RA 2A21A 4LRTA 1MEHA 2VKZG 3VCRA 3FKRA 4IWWA 4JX5A 3IEBA 4Z1BA 4JDYA 5K4ZA 1DV7A 2QEZA 2DZXA 2QCFA 4MOZA 3EWZA 1EP1A 2R8WA 1QFEA 2YCEA 1Q6OA 3LLFA 3UXAA 4O1BA 5AC6A 3M5VA 5FEPA 1FDYA 1MEIA 3EWYA 2FTPA 4DBEA 1FBAA 3U8GA 1M5WA 4D2JA 1D9EA 1ML1A 4RK8A 1OFPA 2R91A 3LTYA 3QW3A 2YW4A 1YPIA 4R7JA 3IVSA 1B57A 2HMCA 4YCPA 1UUMA 2BTMA 4Y8FA 1TV7A 4KFPA 5LHEA 2EAWA 3NQAA 1QPRA 3HBLA 2DJXA 4DO5A 4X9SA 4FNSA 3SSJA 1I2RA 2X1UA 1QWGA 1H63A 4IX0A 2KZHA 3E96A 2VFEA 4UTWA 2RDUA 3A21A 2PRMA 3RMJA 1EB3A 1V7YA 3P80A 2Y70A 3QH2A 3IRDA 3ZR4A 3ABQA 3CEUA 2ZA1A 4PC8A 1I45A 4Z0SA 1JCXA 3EKZA 2QDGA 4JTIA 2NLIA 3QPYA 3O16A 3U6WA 3Q94A 1LRTA 3TR2A 1R47A 4YWIA 1R2SA 2ZCGA 3BW2A 4AMAA 1OG0A 4UTKA 2ZRUA 1IGSA 3BGGA 2BZNA 4AAJA 5DBTA 4TMCA 4JY8A 4O1AA 5I3IA 1KLYA 3BVJA 3TAOA 3W1QA 4N6FA 4OQVA 4UFIA 4MPQA 1VH7A 3W2KA 1QNVA 3NM1A 3DI0A 2XFWA 4CQ9A 1VCVA 3HQ1A 4RXGA 3W83A 1RVGA 5C2XA 1AK5A 5DN1A 2WO5A 1W5MA 1ZAJA 5J5DA 4IPIA 5AHLA 1SU5A 2PURA 1XM3A 3LI0A 2CLHA 4HNNA 3NO5A 4TX9A 4Z1CA 4O52A 4RJEA 1K03A 3WJSA 4DF1A 4EOUA 1Q3NA 1SW7A 4IXHA 4YCOA 1JQVA 2A6NA 4JS3A 2PC4A 1N7KA 3CWOX 4JDBA 4O14A 3MP4A 1RD5A 5KITA 3L5MA 2E6DA 5AHFA 2A7NA 1H5YA 3TX9A 1B4KA 3WJZA 1A5SA 1WYIA 1U83A 2F84A 1YDVA 1W5PA 1GVFA 3T40A 5K9XA 3UZ5A 4PEKA 4BR1A 5F4XA 3LV6A 2V5BA 4CNPA 1WX0A 4I7VA 3GXTA 4BI5A 4WY0F 3EWXA 4UTTA 1VHNA 3C6CA 3B05A 2E09A 4UMAA 2Y7DA 4N9EA 2A1YA 4CQ8A 2WQPA 1J2WA 2VENA 2GVJA 3P5YA 4K39A 4O15A 3QPZA 5BOOA 2V2HA 2QCNA 1BWLA 2VEKA 3UPWA 5G2HA 1TSIA 2E5CA 3OG3A 3LBCA 1W1ZA 3L9CA 5LNRA 2HS6A 4JR5A 3SW6A 4KKXA 4NXKA 4UCGA 1H7NA 4IMCA 1PIIA 5E0KA 4DELA 5CGQA 3STGA 1H7OA 5K9CA 5HUOA 5ABTA 4O50A 1QAPA 4N4QA 1VS1A 5F1VA 1ZHAA 1H7XA 1ZCOA 2B7OA 3PF3A 3DKLA 5AOUA 4LVAA 1BTMA 4LC8A 4RZ6A 1VCGA 1OF6A 1YXCA 2CZFA 2P10A 4JTGA 1TB3A 1JCLA 3ABSA 5KZDA 1IIHA 3PB2A 3W2JA 3TSBA 4K6AA 1JUEA 2TRSA 1KM1A 4BF9A 3BW3A 3FS2A 4K7YA 1DHPA 3D0CA 1JCNA 1TJRA 5CZ0A 3B06A 1D3GA 4N6EA 3N2MA 3VFLA 4XQ6A 1H1ZA 3MYPA 2ISWA 3HG4A 4LUJA 2DJLA 3JRKA 3NOEA 3QRHA 4UUIA 2AGKA 3ZFHA 3BARA 2Q3RA 3M7WA 3G3MA 3TAKA 3F4WA 2ISSA 1FQ0A 3G1DA 4H6KA 3DHDA 5G2WA 3OVQA 1XC4A 3NXFA 4HIBA 3CU2A 3E0IA 2BLEA 4UTTC 1KM3A 3MP3A 4GNJA 1OJXA 2RKXA 3FOKA 1SSDA 3BGJA 3W1AA 3W7GA 1HO1A 3W7KA 3W7EA 1UBSA 4ZL1A 2V82A 3I7QA 1TTIA 2YDAA 2B0MA 3UY8A 4M19A 3MYOA 3FA5A 1OYAA 3HG2A 4IMEA 2NXHA 4QQ3A 2QAPA 3G1FA 4RCXA 4E0CA 2FJKA 4AWUA 1FX6A 2NX1A 1YTDA 3L68A 3RU6A 1FWNA 1NF0A 2E5DA 3DBPA 4K37A 3TQ0A 1PE1A 4IUOA 2NV1A 1AG1O 3W7PA 2ZFAA 1MO0A 3L2IA 4EIVA 3T78A 4MLJA 4MZYA 4WJEA 1LOLA 1QCWA 2BX7A 3I6RA 4LU0A 2ZRYA 1KM5A 3M0ZA 3MHGA 3W88A 4WQ6A 1PL9A 1TRIA 3MMTA 2B7NA 3R89A 3TXVA 3EWWA 1IXPA 5K2ZA 3C2FA 3E49A 4QSHA 4PL2A 3O1NA 2ZYFA 3TJXA 4MY1A 4HPXA 5CPLA 3S5ZA 4DBDA 3LXAA 5K4XA 2E5BA 4O12A 2GQAA 3LRLA 2NZLA 3MI2A 4B5NA 2Z0IA 1YYAA 1J4EA 2W79A 3I68A 4A3UA 5LKYA 4N02A 3T55A 3H53A 1O5KA 3F4NA 3LCFA 1R46A 1EUNA 4RLIA 3VKJA 3N2XA 2ZZ1A 1LRQA 3L0NA 2B7PA 1TTPA 1EX5A 3O05A 4DF2A 3P67A 1AMKA 1O5XA 4MYXA 3G3DA 3PSVA 2DZUA 5D37A 3WK2A 1AW5A 4N9CA 1GVSA 3E9AA 3TE9A 4DF0A 3HGJA 1OFDA 2YYUA 1M7OA 1R30A 1ZJIA 2CZ5A 5J5RA 2DZWA 3P7YA 2NXGA 3LLDA 4XTIA 4BFAA 1WBHA 3NZ1A 4FB7A 3UWYA 3ATZA 3PB0A 1SZGA 2Q8ZA 3P82A 2QUTA 3HOJA 2BSLA 3TIMA 4LS1A 4DQWA 1F7BA 4WD0A 1S5VA 1FUYA 4JEQA 3QZEA 3M16A 4M6PA 1VYPX 4FEZA 3GXNA 4GUFA 4LNYA 3PUDA 3MJYA 4WY0B 3T44A 2NV2A 3C0JA 4IMDA 3TCEA 3KOFA 3MO7A 2OJPA 4HNVA 3G1XA 3FYOA 4OV9A 2J27A 3EB2A 3FJLA 3HG5A 5AC7A 3ANYA 2YYTA 5I3HA 1T0OA 1K7EA 3NQMA 1QMLA 5U4NA 1FCQA 5G1YA 2PCQA 1ICPA 2V2DA 3M1ZA 3GNNA 1IIGA 1QO5A 3W1LA 4CQAA 5HULA 5BW6A 3BLEA 4NJJA 4LY8A 2H3BA 4NVTA 3LHVA 4PTNA 3IVUA 2JKPA 4O11A 2BXVA 5LHFA 5CPNA 2CLMA 3TSMA 4O4WA 3PAJA 3CEPA 2Y62A 3DI1A 1KTNA 3BG5A 3G8EA 4LS2A 3ELFA 1TPC1 3A23A 5LNSA 2QCHA 3OA3A 4WUIA 4HSOA 5LZLA 1Z48A 1OFBA 1A53A 3EWUA 2C3ZA 5E1QA 1I8JA 2GOUA 1ADOA 4O28A 3N9RA 1QDSA 1F6KA 2H8ZA 3L65A 4NX5A 4OHQA 3M5XA 1QPNA 1LBFA 1LOSA 2J9XA 3LBMA 4H4IA 2OZ0A 4K36A 1SR9A 2VEPA 2EKCA 1SQ7A 3E12A 4BI7A 1W3IA 3BG9A 2C16A 4LV4A 2X1TA 3CHVA 2YFNA 1TV5A 1VJIA 1OFOA 3NQ6A 1LLWA 2Y61A 4MY8A 5KINA 4WY0A 2ZZ6A 5T26A 4K38A 2XN1A 4O1DA 1SO6A 3PVFA 1KBJA 5HJLA 5D38A 3GKFA 1W31A 3STCA 5K9DA 2Z6JA 3G1SA 3QQ0A 4Q32A 1VRDA 4TIMA 1OVDA 3GAKA 3QMTA 3UWQA 3S1VA 3B0PA 4FNTA 2Y7EA 2QCMA 1ONRA 3P84A 4FIRA 1O95A 5CZSA 1FDJA 2HTMA 4IOTA 3W7JA 1EEPA 1LTDA 4LUIA 2WJZA 2EPHA 3TQVA 1EWDA 1X1ZA 1FCVA 3TK7A 2PRLA 1GTEA 4UFHA 3TROA 4K8EA 5DCBA 3EWBX 4OBTA 5L9FA 3EKLA 2WSRA 3W6YA 1F73A 3W22A 3T4CA 1TREA 4O13A 4ZQPA 1KLZA 4JTEA 3QSTA 3ABOA 1QPQA 3GKAA 3I65A 3KAOA 4WOZA 3KX6A 4OV4A 3H55A 1VZWA 4IX2A 3W7DA 4N4PA 1VC4A 5D2VA 4S2BA 5DBUA 3TQKA 3GZ3A 5I3GA 2WKJA 4KWWA 1G4PA 1KM4A 2W6RA 3A5FA 5FF0A 2J6XA 4ZQMA 1EP2A 2DZTA 1LORA 1XCFA 1JCYA 3SJ3A 3P8JA 1RQHA 3LV5A 2WV8A 4UFKA 3NQVA 1E51A 1Y0EA 2YR1A 2O7QA 2GQ8A 2VFGA 2X30A 3NL2A 1W5NA 5EBUA 3M43A 2B7QA 2C13A 3W2MA 5I3JA 3VE7A 4FX7A 4HN4A 4KWVA 5C5YA 3IGSA 3W1PA 1SZNA 1FCUA 2CLEA 3IVTA 5D05A 1WBJA 2DP3A 5SWUA 4MJZA 3GLCA 1LYXA 4MLRA 3HJZA 4R34A 4ZVJA 2VXNA 4WZHA 5DXXA 2VOMA 5K7JA 3G22A 1P5BA 3TUUA 1DBTA 4PH6A 3WK0A 4BWLC 3F03K 3DGRA 3C56A 3OIXA 4PA8A 4E2BA 3P8IA 4LS0A 1QOPA 5LNWA 3HPXA 4PODA 4ZQNA 3FIGA 1Q6QA 3PR2A 5GVJA 1S5TA 5FEWA 5FF3A 4TMBA 4XBSA 3IIVA 4RKAA 3A5VA 5CSRA 1UJPA 1EA0A 3O15A 3IIZA 1FCBA 2TMDA 3W07A 1PCWA 4O4VA 1YPFA 1F6PA 2F7FA 2JK2A 2ZZ7A 1KFKA 4J9JA 3TFCA 4A22A 1FXPA 5LGZA 4M7TA 3NR0A 3PUEA 3NEVA 4JIQA 4O8RA 5TBOA 2ZRVA 1BEUA 2R94A 3NNTA 1GG0A 2TSYA 5DLCA 1WA3A 4I7WA 5D2YA 4MZ8A 5HNRA 2C6QA 4QM1A 3G8RA 4ZQCA 1GJPA 4DO4A 1G69A 4GWEA 2E68A 1EPXA 3FLUA 3W73A 2QCGA 3UNDA 5AC8A 3UWWA 1X8FA 4AB4A 3F1QA 1QPOA 4JD4A 4LTSA 3L66A 3QC3A 5EA9A 3LCXA 2CU0A 1XFBA 2ZRXA 5EKYA 3W1MA 2AQWA 2ZZ2A 2UV8G 4JICA 2Y85A 3EXSA 1TMHA 2J24A 3HMJG 1ME7A 1TQJA 4A2SA 2V30A 1NSJA 5CZJA 1KA9F 4FNPA 5EY5A 4GUHA 1IXNA 1XBZA 2FPVA 1W8SA 3DKJA 3GB6A 2V0TA 1VCFA 3G0SA 3KFTA 3FFSA 5BNKA 2ZZ4A 4LRSA 4NUWA 2ZZ3A 4ONVA 3GDKA 4JGDA 2ZRWA 3PBVA 3KRSA 8TIMA 3NQDA 2P0OA 3NM3A 3W2NA 1OX6A 3THQA 1TPEA 1HO4A 1VYSX 2GPTA 3MHUA 4AHQA 1Q6RA 3GAYA 3MWAA 2QCEA 4BI6A 3R5EA 1M6JA 1OF8A 2ISVA 3BLFA 3Q58A 3DFNA 3Q2DA 3W84A 1H7WA 1KV8A 4UMCA 4JTJA 1YXDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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