2CZ5 | Genus

Total Genus 75

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
sequence length	208
structure length	208
Chain Sequence	MIVLALDVYEGERAIKIAKSVKDYISMIKVNWPLILGSGVDIIRRLKEETGVEIIADLKLADIPNTNRLIARKVFGAGADYVIVHTFVGRDSVMAVKELGEIIMVVEMSHPGALEFINPLTDRFIEVANEIEPFGVIAPGTRPERIGYIRDRLKEGIKILAPGIGAQGGKAKDAVKAGADYIIVGRAIYNAPNPREAAKAIYDEIRGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of orotidine 5'-phosphate decarboxylase from Pyrococcus horikoshii OT3 rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Pyrococcus horikoshii
molecule keywords	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus	75
structure length	208
sequence length	208
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2005-07-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2cz5A00

1I8JA 3G1XA 2YXGA 1M5WA 4FX6M 1SZNA 3E9AA 3SJ3A 5D2VA 1TYGA 3GXPA 4MUZA 1R2RA 1YDNA 1RQHA 4UIOA 3LTSA 4JX5A 1Q45A 3TUUA 4WX2A 8TIMA 4LW7A 3G0UA 1L9WA 1HO1A 3RLVA 4XQ6A 5D2WA 4EIVA 2Y89A 5GVJA 5KMYA 3TV8A 1IXPA 2ISVA 3L68A 4O1CA 4R34A 3JR2A 3JRKA 3R13A 4C1KA 4ICNA 2BWGA 3EEGA 1XKYA 1F05A 3NQCA 4FNTA 2Z1BA 3QEZA 5EMUA 4JIQA 3M5YA 3DKJA 1G67A 5DELA 3N73A 2E6YA 2R14A 5G5IA 4N6EA 1J5TA 1GVSA 1LBMA 3NO5A 4MJMA 2I14A 4UR7A 1A5CA 2PRLA 1NSJA 1ICPA 2B7QA 2GJNA 2Y62A 3FJLA 2DZXA 5AOUA 3B4UA 1UB3A 3EWZA 1UASA 3GK0A 1Y0EA 3M1ZA 3PF3A 3M47A 4WQ6A 5E93A 5HUPA 2XN0A 2X1RA 3IGXA 3G3DA 4MYXA 1SSGA 2E5BA 3NL5A 3HF3A 4P61A 5AHNA 1H7PA 5AHIA 3S5YA 4LVDA 4Z0JA 1G69A 1FWNA 3MBFA 4MYAA 1OYAA 1ICQA 2Z6IA 4AAJA 2E77A 4QAIA 3MBDA 3DFOA 3L67A 3T4CA 1KFBA 4MZYA 4PTNA 3BG5A 4EVZA 3A23A 3S5NA 4K6AA 4LWWA 2WSRA 2JK2A 3INPA 2I1OA 3L5AA 2BZNA 1M7OA 3MI6A 1KLZA 1WAUA 4JTSA 4UFHA 3QF0A 4YCOA 3HG5A 1JRBA 1F6KA 2GQ9A 4N9BA 3VKJA 1J4EA 3N9RA 4XKYB 3G22A 3G1DA 1P5BA 3L65A 3NZRA 2BTMA 3BPWA 4S2BA 5D2XA 1KA9F 1X8FA 2FFCA 5D09A 4E2BA 5I3HA 1H62A 3M7WA 3NA8A 4MFDA 3UWWA 2NUYA 3SR7A 1N8FA 3O8AA 3TFCA 4UTJA 1XC4A 3G1HA 3TROA 1VRDA 4ZQRA 5CPMA 4XBKA 5AYXA 3TIMA 2C13A 3I7RA 1KLYA 4R53A 1NAL1 4HIBA 1GTHA 3MP4A 5EA9A 1WX0A 3Q94A 2WSYA 2ZA2A 1CI1A 1H5YA 5BMXA 3M5VA 3W7DA 1H61A 3N2MA 4AH7A 3A21A 4XWUA 4GFSA 1X7FA 1RD5A 2QUUA 3KVJA 3FYOA 3IIOA 4FEZA 4GE8A 5DBTA 1YTKA 4C1LA 5KITA 2C19A 3DHDA 3TFXA 1JCMP 4RX0A 1L6WA 4Z1BA 1K7EA 4KKXA 1OK4A 3NM3A 1YTDA 4IMEA 3P7YA 4K36A 4DBDA 3CU2A 3QMRA 3NGJA 4WY0B 1TO3A 3SY5A 2CZEA 2WO5A 4LVAA 3ABRA 3TW6A 3WK0A 4JEQA 4N9CA 5DY3A 3I65A 4N6FA 2Q8LA 1GVFA 2VEIA 4FNPA 1TQXA 1EX5A 3DXIA 4O14A 1GYLA 1O5XA 1TTPA 4NJGA 1OABA 3TH6A 3S1WA 3TW7A 1GQNA 4MZ8A 3VNDA 5MHBA 1OX4A 5EPDA 1TMHA 5D30A 5D38A 3PG8A 3C0JA 1VCVA 1W0MA 1SZFA 2GVJA 2AGKA 3BW4A 3PUOA 1L6YA 3DU0A 4K37A 1G6CA 3W85A 4MY9A 2JKAA 1FCQA 3HIJA 1L6SA 1QPOA 2ZZ1A 1ONRA 3IGSA 4LRTA 4DO5A 3MJYA 3W7OA 2CWNA 4DO6A 4NJKA 1H50A 3PBWA 4A2SA 2OJPA 3H53A 1DL3A 1EUAA 3SGZA 3GR8A 3QPZA 3DI1A 3MYPA 1B4EA 5CPOA 2P1FA 3EB2A 2H8XA 5G4WA 4E2DA 3NDOA 3C2FA 1RQBA 3WK2A 1XCFA 5K9CA 1VLWA 3GYEA 4IOTA 5TQLA 2YSWA 3NVTA 4I9AA 1C8VA 1DJNA 4O18A 4IMFA 4PC8A 5F2MA 2WV8A 3QMTA 4M7SA 3LRMA 5CPLA 5LHFA 2QCDA 1ML1A 3AJXA 1YLVA 1TPDA 2JBMA 4XZ9A 1MO0A 3NM1A 1W3NA 5DXYA 3B0VC 2BLEA 4ADTA 5DCEA 2QKFA 2EHHA 4JD4A 3SIZA 1VS1A 4NX5A 3WK3A 1ZAIA 3F1QA 4DPQA 1UJPA 3EXSA 5HR6A 4UFLA 3QPYA 1QO2A 5CPNA 2ATSA 5BNKA 4O1BA 1JUKA 1OX6A 2W0UA 5DCDA 4DELA 5FI8A 4Q32A 5K7JA 3M6YA 1ZY9A 2PRMA 4Y96A 2VEKA 1ZAHA 4HKPA 4UMCA 3GNDA 3QZEA 4XUGA 2OMAA 3P62A 5I3JA 2YYTA 5HR7A 3S5OA 4UFIA 2R8WA 4TIMA 1ME7A 5AYZA 1HUVA 2Y7FA 1BWLA 3KVKA 4JTHA 2V30A 3MO7A 4GBUA 4OHQA 2JKEA 1HFBA 1YDOA 2E6DA 3CWNA 3THQA 2Y88A 1E51A 3HB9A 3NAVA 4O11A 1B9BA 1XUUA 3N14A 3PBYA 1LDCA 3O06A 3P80A 1MZHA 3C52A 3L66A 4N4QA 3GKAA 3SI9A 2C18A 1OYCA 4O12A 1BWKA 2A0NA 1SR9A 4MLJA 1U83A 4DQWA 4ORIA 3UZJA 2WQPA 1NFBA 4FIRA 5BOOA 5LNUA 4LV9A 1KM6A 2J9XA 2G97A 3W22A 1JJKA 3KAOA 4QQ3A 3O16A 4ZQMA 1R46A 3NQ6A 3A22A 3FFSA 3W1AA 3DI0A 3DFPA 1A5SA 3MHUA 4E0CA 3LX9A 2V2HA 3NQMA 2EGZA 4IX0A 2CLKA 4B5NA 4JYDA 1O94A 4UFKA 1C29A 4N02A 3FA5A 5K9DA 4IQLA 2GVLA 5EKYA 2H3BA 1R47A 4HPJA 2HSAA 4TX9A 3HG4A 4RK8A 4O8RA 2R91A 2QF7A 3KRZA 1G7UA 4I7VA 4JY8A 1VH7A 2DU2A 4LUIA 5D05A 4O4VA 2EPHA 3HGJA 3L9CA 4JIPA 2PC4A 2AQWA 4GNJA 4N4PA 2CZDA 1OVDA 5IBXC 4UFJA 4YXGA 3FKRA 4JYEA 5AC7A 2DORA 1B4KA 2NX9A 3GLCA 2NX3A 1OYBA 1JULA 3TX9A 2J9ZA 3PULA 3DGRA 4Z1DA 1TREA 2DZVA 1A5BA 1MXSA 4IMGA 5DBUA 3DFQA 4GWEA 3ZWTA 1LBLA 4RZ5A 3OG3A 1I45A 3EWYA 1LRNA 1SZEA 4AHPA 2FDSA 5DN1A 3W83A 4ZQNA 1KW1A 2E68A 1EP2A 1XL9A 2QEZA 4PCFA 4QM1A 1K3UA 4MLRA 4NNBA 2GQAA 3A24A 4GC4A 1G4SA 3ATYA 4HN4A 2ZTKA 1FXPA 4J9JA 3GB6A 1KV5A 4RXGA 4Z1AA 3G1FA 5G4EA 1XBVA 4PH6A 2HS6A 4UTTA 3E49A 3WJWA 1H1YA 4M7TA 1YDVA 1VQTA 5AHLA 5D32A 1LOQA 4UTKA 1HG3A 4UCGA 3RU6A 1SFJA 4A29A 3OVRA 4O0ZA 5FEPA 4NXKA 4PFMA 1LYXA 4PL2A 2NXGA 1I2RA 1JRCA 2G96A 3C8FA 2TSYA 4WXYA 4UMBA 1GPWA 2VFGA 1ZHAA 3SSJA 1JCLA 2RH9A 2W79A 1I2PA 1S5WA 3HJZA 1A50A 3I68A 1TRDA 2OT1A 3NPVA 4KWWA 3O07A 4O50A 1GYNA 1SW0A 4R7JA 2DJXA 3W7CA 1TPB1 3W76A 2C1HA 3G1YA 1KM1A 3TE9A 3LCFA 4I7WA 4AVFA 3IIVA 3NOEA 3B03A 3RMJA 3W1MA 2V0TA 1MEIA 4UTWC 3IV3A 3NQEA 3HGOA 2QCGA 4ADUA 1TPVA 3UD6A 2A4AA 4JDBA 1WYIA 3M9YA 5FF4A 4PL1A 2VFDA 3W73A 1JCNA 3VE9A 3CTLA 3ZR4A 4LC8A 4Z1CA 3RNDA 1T0OA 4UTLA 2X1TA 3DH7A 2NUWA 1LRTA 4X22A 3BLIA 1KV8A 3IIXA 3LHZA 2RDTA 2O7SA 4FO4A 1IIGA 1V5XA 4JDYA 3GIYA 1OFPA 4ZQOA 3G1AA 4O1AA 2QDHA 4LTSA 3HOJA 1FX6A 3DFTA 4XBSA 1TTIA 4O57A 4AHQA 1HL2A 3G8EA 5U7SA 4KFOA 3T44A 3W6YA 3A9IA 1UBSA 1TV8A 1BKSA 5G2WA 3JS3A 3OIXA 3R8RA 2WNQA 4QNWA 1BTMA 1WBJA 2BXVA 3EKLA 2Y7GA 2F7FA 2CZFA 5G1YA 4CCCA 3TK7A 4MY8A 5G1TA 2Y7EA 3L2IA 1QDSA 3LCHA 3R5EA 5KZMA 3W1NA 4DF0A 3LV5A 1X1ZA 1ZALA 2G5WA 3TDFA 3KVMA 2QUVA 3O6DA 3ZWSA 4IPJA 4LRSA 4NJJA 3ABSA 5CG7A 3W1UA 1QCWA 4FF7A 1ZNNA 4EWND 1ZFJA 3RF9A 1DBTA 4OV9A 4BF9A 2V5BA 5K2ZA 1LM1A 1ADOA 1H7XA 3FOKA 1NEYA 2JGYA 4Y9AA 4JNMA 3W86A 2QJIA 2FIQA 1O4UA 1RR2A 3TKFA 1XI3A 1UUOA 3EWWA 2QCEA 4XTDA 2ZRYA 3HBLA 2FPTA 1W5OA 3MI2A 1KBJA 4KWVA 3TC7A 3N19B 4HSOA 2YW4A 2TPSA 2XN2A 4H3DA 4WY0F 4ZVJA 1RVGA 3W23A 1TCDA 1JQXA 4UTMA 2BSLA 3IGUA 3S5ZA 3M5XA 3PB2A 4GUIA 4ZZ9A 4IJBA 5FF3A 1GOXA 3DFSA 2H90A 4LNYA 3TNOA 4MOZA 4OE7A 1XXXA 1P1XA 5HINA 3V1PA 2ZZ2A 3UXDA 3O1NA 3NQ7A 4OWGA 3WK1A 3NL2A 4UC5A 4K7VA 3PM6A 2Y7DA 1L2UA 3GAYA 5TBOA 4R33A 2ZQ0A 2BX7A 3GVGA 3PVFA 2QJHA 3C6CA 1F6PA 1F76A 2A21A 3MMTA 4U4MA 2W6RA 1X1OA 4L4LA 1FWWA 3MWAA 1GVOA 2VFIA 2XN1A 4FHAA 4LV4A 5DCBA 3UPWA 3CLMA 2JGQA 4OBTA 2YDAA 3L5MA 3GDTA 3EX3A 1SFLA 3BVJA 2C0AA 3CM4A 4MKNA 5C55A 4N9EA 2G95A 3B8DA 3O05A 3P60A 4LS0A 4U28A 1OFOA 4FNUA 1TSIA 1SO3A 3OBKA 5BW6A 5KTLA 3TSMA 3UNDA 4GUHA 1KBIA 2V8ZA 3PSWA 4GUJA 1Z44A 5I3GA 2V2CA 2B4GA 3ABQA 3WJYA 1OFDA 1W37A 3LCXA 3CHVA 2X30A 2P10A 3IVUA 1JCXA 1K03A 2FPVA 3LRLA 1VGAA 3NXFA 5SWUA 3LXBA 1OK6A 2ZZ4A 2NLIA 2CLLA 4MFEA 4NJHA 2ZZ6A 4S2CA 3MP3A 2VENA 3LHYA 3HO8A 4MVAA 4CCDA 1W3TA 1DQWA 1I2NA 4LT9A 1W54A 3FYPA 3HMJG 4KFPA 1AW1A 3NZ1A 4LU0A 3RFAA 4JTLA 2QCLA 3W72A 3B05A 4IUOA 3ZFHA 3E02A 1G4TA 1FDJA 3W7JA 3C3NA 1GZGA 4JTUA 3GDRA 1SPQA 1OX5A 1Z42A 3TXVA 2ISWA 2GOUA 3GDMA 3O63A 1AMKA 4K8HA 3QQ0A 1IXNA 4IPIA 1UUMA 2A7NA 3MHFA 3KVLA 4K8EA 3W7QA 2NXHA 1DJQA 1P4CA 1FCVA 5HWMA 3LTPA 1SO6A 4QNEA 1KTBA 4OT7A 1V7YA 2PCQA 2RFGA 3NPWA 5FEXA 3BLEA 3TJXA 1O95A 3DENA 2B0MA 3QC3A 1OFQA 5CZ0A 5K9XA 3M43A 2ZCGA 5EYWA 2NUXA 3STCA 3UQNA 1VHCA 3N34A 3W1XA 2V5LA 3W87A 4UTWA 2FTPA 4JN6A 5J5DA 2ISSA 3UPBA 4BI5A 5C5YA 5K4XA 2XFWA 5CZJA 1FDZA 5U4NA 5FF2A 1QFEA 3LOTA 3W1TA 3W2LA 5IM51 3ELFA 3W7EA 1THFD 3EWUA 1OX4B 5G2IA 4JTIA 3W7GA 4ZL1A 3C56A 5D03A 2VEPA 1Q3NA 2HS8A 3M44A 1K7XA 1RV8A 5CSRA 5AC6A 4O28A 3K30A 4HSNA 1VPXA 4QIUA 4UNLA 1QAPA 4Y90A 1PV8A 4LC6A 3QYQA 1YTEA 5D2YA 3C2OA 2A6LA 1J2WA 4JX6A 1XM3A 2A7RA 2X2GA 3TQVA 1M7PA 4CNPA 2V9DA 1W5QA 3NL6A 3LXAA 1K8YA 3T7VA 1OF8A 1P0KA 2J88A 2FLIA 4UTHA 5KZEA 1TPWA 3GDLA 3W71A 3GNNA 2HTMA 3B0PA 3NG3A 3W7HA 2DZSA 1GWJA 3P8IA 4I7UA 3IEBA 3PBVA 3THAA 4IMDA 2C15A 4UMAA 3QJAA 5LHEA 1KM5A 3QQ1A 1VJIA 1IXQA 1WV2A 5EBUA 1YPIA 5F1UA 4HT3A 3I7SA 1EP1A 1JR1A 3SECA 5J5RA 5EL1A 4LS1A 1FY6A 3LB0A 2QCDB 3CQ0A 1PIIA 1W8SA 1JCJA 1QOQA 2E6FA 4JX4A 3HPSA 3LI1A 4S1FA 1DQXA 1B3OA 4JGDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2CZ5A

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