2DP3A

Crystal structure of a double mutant (c202a/a198v) of triosephosphate isomerase from giardia lamblia
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
PARRPFIGGNFKCNGSLDFIKSHVAAIAAHKIPDSVDVVIAPSAVHLSTAIAANTSKQLRIAAQNVYLEGNGAWTGETSVEMLQDMGLKHVIVGHSERRRIMGETDEQSAKKAKRALEKGMTVIFCVGETLDERKANRTMEVNIAQLEALGKELGESKMLWKEVVIAYEPVWSIGTGVVATPEQAEEVHVGLRKWFVEKVAAEGAQHIRIIYGGSANGSNCEKLGQCPNIDGFLVGGASLKPEFMTMIDILTKTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Disulfide Bridges in the Mesophilic Triosephosphate Isomerase from Giardia lamblia Are Related to Oligomerization and Activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Giardia intestinalis
total genus 95
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2006-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dp3A00
3DI0A 3OA3A 1GVFA 5CZJA 2H3BA 1WOBA 3W22A 5AHFA 3IGUA 1FDYA 3GX9A 4ZZ9A 1P5BA 4MPQA 2ZA3A 3E0IA 3E9AA 2G5WA 3UZJA 2YSWA 4S1FA 2A7NA 3A21A 2DP3A 3F4NA 5J5RA 1VH7A 1QPNA 3LRKA 3NPUA 3NM1A 5DBTA 3LOTA 5F1VA 3NPWA 4O15A 1S3HA 1WDWA 4UC5A 2B4GA 3GZ3A 2QAPA 4HIBA 3YPIA 1KA9F 1GJPA 1VYPX 2ZRVA 3TJXA 1B4EA 2AAMA 3A5FA 3NL3A 3G24A 3S42A 5BMWA 1OABA 2HMCA 1EWDA 2B7PA 4D2JA 1H7NA 3W7JA 1SQ7A 3SECA 2C3ZA 1FXPA 4LVDA 5U4NA 1H61A 4JN6A 1R2TA 5AB3A 3R12A 1MO0A 1FWWA 3MUXA 4K7VA 1X7FA 1RPXA 2UV8G 3L0NA 1TPH1 4X9SA 3V1PA 5KZEA 4RZ6A 5FF0A 3GNDA 1WYIA 3I68A 1W0MA 5HWNA 3BLFA 2B0MA 4UNKA 2H6RA 4NXKA 1D3HA 3OVRA 4YLWA 3S1UA 3JS3A 3IVSA 2ATSA 3UYCA 4XBKA 5KZDA 1JVNA 1R30A 2ZRWA 4DBEA 3LCIA 2C16A 2B7OA 2QCFA 3C61A 3FYPA 5AFDA 1Q3NA 3KRSA 2OT1A 4UTTC 5GVJA 3TA6A 3BW3A 3LTPA 1S5VA 4UFMA 2WOQA 4XKYA 3IGSA 3HB9A 3GAYA 1TMHA 5DY2A 3W2JA 5F2GA 4WD0A 3HPZA 4HPJA 4O28A 1XFBA 3KXQA 1GYLA 1EP1A 1JQVA 1KV5A 3W76A 4Z0SA 1AW2A 2VFGA 1I45A 3T40A 2QKFA 1TTJA 4ML9A 2X16A 4JTIA 3BG3A 3NDOA 4HNVA 3O1NA 4ADUA 4LV4A 2A5HA 1YDOA 4MZYA 1ONRA 1W37A 5BRBA 3O07A 3PAJA 2D73A 2FB2A 2YZRA 1LOSA 4KKXA 3OHIA 3PUDA 3W9ZA 3MI3A 2ISSA 2V8ZA 4GC4A 5FEWA 2ATMA 4WY0F 5D32A 3FKKA 1Q6OA 3W7OA 2NWRA 1KBIA 2ZA2A 4ALDA 2TYSA 5LNSA 1PVNA 1JULA 3HBLA 1TPFA 3VI2A 1A5BA 5C6MA 3STGA 1C8VA 3KVJA 2J9ZA 4RXGA 5U7SA 2VOMA 3MP5A 4HSOA 2DJXA 1VCGA 3KAOA 1JR1A 4JGDA 2VFDA 4O17A 3HGSA 1XBXA 4QM1A 4QISA 4PL2A 4OT7A 4LUIA 4JY9A 4RR4A 1LTDA 4A29A 3SW6A 2Y62A 5D03A 3S5OA 1R47A 5FI8A 5HUPA 3NPVA 4O19A 5F4XA 1FCVA 3G1DA 1YYAA 1ME9A 1KTBA 3NG3A 1SW3A 3GDTA 4IX0A 5DELA 8TIMA 1W1ZA 2DZXA 5I3JA 1VC4A 3WJSA 3LCFA 4LC8A 3HOJA 4LRTA 4X22A 4N9DA 1H60A 3EX3A 1YADA 3JRKA 2KZHA 4M6PA 5DN1A 1PL9A 1K7FA 4LVBA 4BWLA 2R94A 3W6YA 3TXVA 1FWRA 3G0SA 1J4EA 3PBUA 4AH7A 5TIMA 4HKPA 1EIXA 2CZFA 3WJYA 1JRCA 3UPWA 4DO5A 4AEOA 3IRDA 3LGEA 3SGUA 2Q8ZA 1LCOA 5AHLA 4CNPA 3PR2A 2BTMA 2FPTA 5HMSA 3QSRA 1RZMA 4R34A 3UNDA 3THQA 3ANYA 2QAFA 3NQGA 4MYXA 3W7EA 5G1YA 5ABTA 2YX0A 4UTWC 4KWWA 3WK2A 1IXPA 4O54A 3W84A 4HT3A 1BWKA 3O6CA 2C19A 3L68A 4K6AA 4HNTA 1W54A 2JKEA 3F03K 1HG3A 2HTMA 4TO8A 2RDTA 3BW2A 4UFHA 1TYGA 1XC4A 1ICSA 2J27A 5CSSA 3CB8A 2R14A 4Z1AA 3G1AA 1TV5A 4NQ1A 3C56A 1M5WA 4HPXA 3B0UX 3BGJA 3W7KA 3TAKA 1UASA 5FESA 3VE7A 5CZTA 3SFKA 1G4TA 1YXYA 3C3NA 1KLYA 2ZRYA 3N2XA 4WY0A 4CLMA 3DBPA 2WSRA 5HR7A 1H7RA 5EYWA 3L5AA 2NV1A 3NO5A 2TPSA 4O1AA 4LRSA 2E6DA 4O16A 4QQ3A 1W3TA 2DZWA 4L4MA 1ZAIA 1F05A 3NQAA 2HSAA 4UMBA 3S5YA 3TUUA 2P10A 5D02A 1PV8A 3G22A 3GAKA 1EX5A 5LHFA 2J6XA 5K7JA 3CPRA 2GUUA 1EP3A 2JK2A 2YXGA 3HG4A 1OX6A 1EA0A 1ZJIA 2YFNA 3QF0A 5HUOA 1AL8A 2FJKA 3KRZA 4N02A 2ZZ3A 1O94A 4ZMGA 3HPSA 1WQ5A 2JGYA 4BI7A 1EUAA 3GDRA 4CCEA 3W2MA 3DU0A 3LB0A 2GQ9A 1ZHAA 2G97A 3DFNA 2F7FA 4JTUA 1Z48A 3G1XA 4O1BA 1YTKA 2YW4A 1M7OA 4O8RA 4BFAA 3P60A 2GQ8A 4MFDA 4AB4A 3NQEA 3VKJA 5G2HA 1RV8A 2QCNA 4O11A 3Q37A 4FX7A 1XBVA 2VEIA 2VFIA 2ZZ6A 1W5PA 3LDVA 5LKYA 5D30A 3W7GA 1TPEA 1JCXA 3LCWA 3N3MA 1OF8A 1VHCA 1R2RA 1SO5A 2WPBA 2X1RA 4TU1A 4UTKA 1KW1A 4PODA 3CWOX 3T78A 1GWJA 2CLHA 5E0KA 2XFWA 4N9EA 4Z1DA 3ZWTA 3M41A 4O12A 4LUJA 2A2IA 3W23A 1QOPA 3IIOA 1VGAA 2TRSA 1LLWA 4DELA 2BSLA 4JY8A 3QH2A 3MO7A 4KFNA 3LBMA 5G2WA 4M6VA 3QRHA 2Q3OA 4FNPA 2J9XA 1FUYA 2FPVA 5HR6A 1XDLA 1VCFA 2E77A 4JTHA 2V82A 3HGRA 5AC8A 1NAL1 1QMLA 3MMTA 1K8YA 3TMLA 1D3GA 5AOUA 1LBLA 2BZNA 1EP2A 3FFSA 1G69A 3P5ZA 3NM3A 3W74A 1TQJA 1QPQA 2E1DA 5AYXA 1G7VA 1TJPA 1QR7A 1Q6QA 1F76A 3TNOA 3W1TA 2DZSA 3QC3A 3TQ0A 4JIQA 1PHQA 1DJQA 3S0CA 3W1NA 3R13A 1NFBA 5CKSA 3C2VA 1KM1A 1WAUA 3GB6A 1VS1A 4UFKA 3NEVA 4NNBA 3TIMA 3WK0A 3B06A 3DHFA 4JYFA 1JRBA 4M7TA 3UY8A 3CWNA 3KVLA 2G95A 1UBSA 1K8ZA 4U4MA 5DBUA 4YXGA 1FY6A 2GQAA 3G3MA 4LWWA 1TPVA 1GVSA 3GYEA 3L21A 1EPXA 1QOQA 2ZZ5A 4H3DA 5D2XA 1DOSA 3EX6A 4ZQMA 2XN2A 5D04C 2GVLA 1P1XA 1K3UA 4NJKA 2VEKA 1GPWA 3P81A 5AHMA 4A3UA 4BI5A 4LS2A 1RQEA 2NX9A 3T44A 3LTYA 4JTKA 4AWSA 2C0AA 4MY9A 3PBYA 5F1UA 2NUXA 4P2VA 1H7PA 4K36A 4NNCA 4DO4A 1DJNA 1TRDA 1OYCA 5C5YA 2ZZ1A 3HQ1A 2FPYA 1RQHA 1SPQA 2QJGA 4LY8A 1Z44A 1JUEA 3QJAA 1OFEA 5AN7A 1GG1A 1JCMP 1SO6A 3P84A 4N6EA 1L6SA 3O15A 1O5XA 1SW7A 4EIVA 4KWVA 2PURA 1PIIA 3C52A 3CHVA 4BF9A 3TQKA 4IUOA 2X1UA 3QSTA 4JYEA 3NA8A 2A1YA 1K7XA 2QF7A 3G0UA 3L5MA 4GBUA 1R46A 3PULA 3W1LA 1K7EA 4PEKA 4ZQRA 5BNKA 3MI2A 4UCGA 3W7HA 2NXHA 4NJIA 5KZMA 4KFPA 4JDYA 2LLEA 2WNNA 3B04A 3LLDA 4Z08A 3EWBX 3PUOA 2ZRUA 4C1LA 3GDLA 2V2HA 5CG7A 1SZEA 4MLJA 3PC0A 4LV9A 1H1ZA 1OX4B 3A24A 4L4LA 3TROA 3W3OA 3VNDA 1KM0A 2QJHA 4GWEA 3H55A 2BWGA 3S1VA 3TW6A 1C29A 1LBFA 1LOLA 1GOXA 3M7WA 3RF9A 2QCHA 4JX5A 1IXNA 2GVGA 4PC8A 3GR8A 1QWGA 3U6WA 1J5TA 5KSWA 4GUGA 4N2YA 1JUKA 4O13A 4O14A 1L6YA 2V9DA 3W1AA 2BX7A 3JR2A 3P82A 4MVAA 2TMDA 3GDMA 1G4PA 1A5CA 3EWYA 4K39A 2CLFA 3UWYA 1DHPA 2WKJA 3EEGA 2FQIA 1YXCA 3PUEA 3QFEA 3C2FA 1FWNA 1KV8A 2NXIA 3MBFA 1TB3A 3LBCA 4O53A 1KFKA 4I7WA 3G1FA 3TSDA 1IXQA 3P62A 3SSJA 2QUUA 1PS9A 4HNUA 3ABOA 2Z6JA 1UCWA 5T26A 1FXQA 2QDHA 2JBMA 4K37A 3VCRA 1TV7A 1SR9A 3QMSA 1VYRA 3NAVA 2OCZA 4Y9AA 4NJGA 2GVJA 2RH9A 2C13A 4PL1A 4P61A 5AC6A 1NF7A 2OZ0A 2A6NA 3M44A 1WX0A 3AJXA 2BLEA 1ME8A 1W3NA 2ZA1A 1I2QA 3P7YA 3MBDA 5HNRA 1MSSA 1ADOA 1B57A 4C1KA 5KMYA 2EGZA 3W7NA 4XBSA 2ZZ4A 3G1HA 3PB2A 3W7LA 1LLZA 4QJ1A 1WOAA 1VQTA 2GJLA 4MY8A 4WZHA 3TR2A 2P0OA 3W7CA 4A2RA 1TPWA 3RLVA 1LRTA 3DFSA 2XN1A 3TKFA 4UMCA 4Y90A 1KM2A 3UY7A 1ZCOA 4RKAA 3UWUA 4FNSA 3NXFA 5C2XA 4O57A 2X2GA 2C14A 2XN0A 3QZEA 1WXJA 3GKAA 1LP6A 2Y7FA 3I7RA 1JJKA 3DKLA 3W72A 3STFA 1F6PA 4MUZA 3R2GA 4ORIA 4Z0JA 2OT0A 4YL2A 2E09A 3M1ZA 1KFJA 3SZ8A 2ZBTA 5CPLA 3UXAA 4YWIA 4NUWA 4QSHA 1AMKA 3IIPA 4OBTA 3L65A 4JTSA 4PFMA 3K30A 2YGYA 3P80A 2FLIA 3W70A 4NXSA 4CCCA 2Y7GA 1F5ZA 2Y63A 2GPTA 3HF3A 4RK8A 3NQ6A 3OBKA 5D05A 2NX3A 3OVPA 1WBHA 3DZ1A 1FBAA 4W9TA 4FHAA 4BK9A 2B7QA 3DHDA 1DORA 4RJEA 4TX9A 3U8GA 4GUJA 3NZRA 4FF7A 3OVQA 1DKWA 4E2DA 5LGZA 3NQVA 4K7YA 1OK6A 3LXAA 4UTJA 5CGQA 3UWZA 2QCMA 3EXRA 2B7NA 3EWWA 1PE1A 1KM3A 1HFBA 4IX2A 3DFQA 3M47A 5IBXC 5DXYA 5FEXA 1H63A 2WSYA 3N34A 4DBDA 3W73A 3W86A 5MHBA 5HWMA 3LHYA 2YCEA 3M6YA 4M7SA 4JYDA 3OEXA 1VZWA 2E68A 5FF4A 2A6LA 4S2BA 3MHGA 2NZLA 5DY3A 3TXZA 1UJPA 1R2SA 3HG3A 5EMUA 4RXFA 4ZL1A 1SU5A 3NQFA 4YCPA 3A5VA 1B9BA 1WV2A 1K03A 3ABQA 4CQAA 4FX8A 4IMFA 1VR6A 3RK8A 5I3GA 5HINA 4PA8A 2QCLA 3TC7A 2E5DA 1LRQA 1Q6RA 2DU2A 4X3ZA 3TW7A 2H8ZA 1OJXA 4LS0A 1FCBA 2QCCA 4DF2A 2Y70A 4GXMA 4NVTA 4OQVA 3O06A 3HG5A 4MIMA 3NQMA 1P0NA 3PG8A 2A7RA 3MP4A 3KVKA 3I6RA 2A0NA 3DENA 3MI6A 4JX6A 4E2BA 1EEPA 3E49A 1GVQA 3NL5A 3W71A 4UTTA 5TQLA 2E6YA 3W2NA 3S1WA 3ELFA 5DCDA 3W87A 1LRNA 1VPXA 3LXBA 2VEPA 4OGZA 3EKZA 1TPC1 1SFLA 3TMQA 2YYUA 4BR1A 4LT9A 4Q4KA 1DL3A 3L67A 1O4UA 4UR7A 3TAOA 1TJRA 3W7QA 4LVAA 3GXPA 2ZFAA 3I7SA 1AW5A 3A23A 2QR6A 3CQ0A 1TTIA 2DZTA 5FF7A 4JR5A 1OFDA 2V0TA 3R5EA 3L2IA 4JEQA 3NQ7A 1KFEA 4NZJA 5AYZA 3HJZA 3G3DA 5CPOA 4EF9A 1DVJA 2ZZ7A 2RDUA 1YTEA 4OV4A 4GE8A 4Z1BA 4AXKA 2JKPA 3M5ZA 2VXNA 4Y96A 2RHGA 1N55A 4FIQA 2FFCA 1XXXA 3EXTA 5J5DA 3M0ZA 5AYYA 1LM1A 4AHQA 4JTFA 4JXCA 4GUHA 2OX1A 2V5LA 3W7PA 3NZ1A 3W7RA 3FA5A 2QJIA 4RZ5A 4QIUA 1U5JA 3NQDA 3IGXA 5FF3A 3C2EA 3EB2A 3CEUA 1YLVA 1XDMA 3C4UA 3Q58A 3W1QA 1SZNA 3MHFA 1XCFA 4HHPA 3MJYA 5HQEA 3LCHA 2X1TA 3CT7A 5DXXA 4HN4A 3TSMA 4A2SA 4FNTA 1LBMA 2A4AA 1ZNNA 3PY2A 1GZGA 3IVTA 5CPNA 3TV8A 4OU1A 5D33A 3EX1A 3TCEA 1H7WA 3W7MA 1W5QA 5FEZA 3LCLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1V0L A;  3DI0 A;  4U5K A;  4LAU A;  1GVF A;  4JKK A;  3A3W A;  1S3T C;  5CC5 A;  1NP2 A;  1P5B A;  1DWH M;  2I16 A;  3QLD A;  3UZJ A;  4S1F A;  4IIB A;  3ID7 A;  3CPG A;  5J5R A;  1ITQ A;  1VH7 A;  3PTD A;  1QPN A;  3LRK A;  1OY0 A;  3NPU A;  2ADA A;  4V28 A;  1EJT C;  5I79 A;  3ART A;  8XIA A;  5I0D A;  1MYR A;  2A3E A;  2ZRV A;  4WKF A;  1B4E A;  3BLP X;  3A5F A;  4DX3 A;  1EBG A;  3NL3 A;  3G24 A;  1OAB A;  5HMD A;  1XQK A;  1H7N A;  2I9U A;  3LPG A;  3OGS A;  5U4N A;  1H61 A;  5AB3 A;  5KZ6 A;  4XSL A;  1ZRQ A;  4PUN A;  4BF5 A;  2UV8 G;  1TPH 1;  2VUY A;  1WYI A;  3BMV A;  1PSC A;  4ZOE A;  3KTC A;  3BLF A;  4MJ2 A;  2FGL A;  4EPD C;  3RRX A;  3WLR A;  1V02 A;  4UNI A;  4YLW A;  3OIH A;  4KES A;  4DB7 A;  3UYC A;  4XBK A;  3W27 A;  2G0W A;  4AY7 A;  1J6O A;  1JF6 A;  4Q4S A;  2PWD A;  2ALR A;  1S5V A;  2WOQ A;  3UJS A;  1BF2 A;  1JI1 A;  4HD5 A;  3VYL A;  4W8A A;  1TMH A;  1YBQ B;  4PMU A;  4HPJ A;  4MB4 A;  1XFB A;  3UG3 A;  4MKV A;  4AST A;  1Q66 A;  2VFG A;  4PB5 A;  1UOK A;  4UQ9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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